FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3989, 380 aa 1>>>pF1KE3989 380 - 380 aa - 380 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3047+/-0.000883; mu= 16.4439+/- 0.053 mean_var=74.8602+/-14.873, 0's: 0 Z-trim(106.8): 83 B-trim: 153 in 1/50 Lambda= 0.148234 statistics sampled from 9101 (9193) to 9101 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16 Scan time: 2.280 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11261.1 ADAP2 gene_id:55803|Hs108|chr17 ( 381) 2603 566.2 1.7e-161 CCDS5318.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 ( 374) 1553 341.7 6.6e-94 CCDS64577.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 ( 385) 1467 323.3 2.3e-88 CCDS64576.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 ( 302) 1206 267.4 1.2e-71 CCDS75558.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 ( 279) 1098 244.3 1e-64 CCDS451.1 SMAP2 gene_id:64744|Hs108|chr1 ( 429) 333 80.8 2.5e-15 CCDS64459.1 SMAP1 gene_id:60682|Hs108|chr6 ( 436) 325 79.1 8.4e-15 CCDS4973.1 SMAP1 gene_id:60682|Hs108|chr6 ( 440) 325 79.1 8.5e-15 CCDS43478.1 SMAP1 gene_id:60682|Hs108|chr6 ( 467) 314 76.8 4.5e-14 CCDS64802.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 580) 303 74.5 2.7e-13 CCDS43681.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 911) 303 74.6 3.9e-13 CCDS11101.1 ACAP1 gene_id:9744|Hs108|chr17 ( 740) 298 73.5 7e-13 CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 804) 298 73.5 7.4e-13 CCDS33408.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 857) 298 73.5 7.8e-13 CCDS33924.1 ACAP2 gene_id:23527|Hs108|chr3 ( 778) 290 71.8 2.4e-12 CCDS19.2 ACAP3 gene_id:116983|Hs108|chr1 ( 834) 288 71.4 3.4e-12 CCDS55592.1 SMAP2 gene_id:64744|Hs108|chr1 ( 399) 280 69.4 6.2e-12 CCDS72763.1 SMAP2 gene_id:64744|Hs108|chr1 ( 424) 280 69.5 6.5e-12 CCDS8951.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 ( 836) 280 69.7 1.1e-11 CCDS44932.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 (1192) 280 69.8 1.5e-11 CCDS73125.1 AGAP9 gene_id:642517|Hs108|chr10 ( 658) 275 68.5 1.9e-11 CCDS7215.1 AGAP4 gene_id:119016|Hs108|chr10 ( 663) 269 67.2 4.7e-11 CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10 ( 686) 269 67.3 4.8e-11 >>CCDS11261.1 ADAP2 gene_id:55803|Hs108|chr17 (381 aa) initn: 1852 init1: 1852 opt: 2603 Z-score: 3012.9 bits: 566.2 E(32554): 1.7e-161 Smith-Waterman score: 2603; 99.7% identity (99.7% similar) in 381 aa overlap (1-380:1-381) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCGVHRNFPDISR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCGVHRNFPDISR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 VKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLKEQWIRAKYERR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 VKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLKEQWIRAKYERR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 EFMADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKEQGKSPKAVISI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 EFMADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKEQGKSPKAVISI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 KDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALRAARLQYLKMAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 KDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALRAARLQYLKMAF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PELPESELVPFLTRNYLKQGFMEKTGPK-KEPFKKRWFALDCHERRLLYYKNPLDAFEQG :::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 PELPESELVPFLTRNYLKQGFMEKTGPKQKEPFKKRWFALDCHERRLLYYKNPLDAFEQG 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 QVFLGNKEQGYEAYEDLPKGIRGNRWKAGLTIVTPERRFVLTCPSEKEQQEWLESLRGVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 QVFLGNKEQGYEAYEDLPKGIRGNRWKAGLTIVTPERRFVLTCPSEKEQQEWLESLRGVL 310 320 330 340 350 360 360 370 380 pF1KE3 SSPLTPLNRLTASTESGRSSR ::::::::::::::::::::: CCDS11 SSPLTPLNRLTASTESGRSSR 370 380 >>CCDS5318.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 (374 aa) initn: 1336 init1: 673 opt: 1553 Z-score: 1799.5 bits: 341.7 E(32554): 6.6e-94 Smith-Waterman score: 1553; 58.5% identity (84.1% similar) in 364 aa overlap (4-365:3-361) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCGVHRNFPDISR .:: .. .::::. : :::.:::::: ::::::: ::.::::.: :.:::.:..:. CCDS53 MAKER-RRAVLELLQRP--GNARCADCGAPDPDWASYTLGVFICLSCSGIHRNIPQVSK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 VKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLKEQWIRAKYERR ::::::: :... :::: .:: ..:.::..::.::: : .:: .:.::::::::::. CCDS53 VKSVRLDAWEEAQVEFMASHGNDAARARFESKVPSFYYRPTPSDCQLLREQWIRAKYERQ 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE3 EFM-ADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKEQGKSPKAVIS ::. . . : ::::::::::::.::: ::::: ::: ::::.....: ::::.. CCDS53 EFIYPEKQEPYSAGYREGFLWKRGRDNGQFLSRKFVLTEREGALKYFNRNDAKEPKAVMK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 IKDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALRAARLQYLKMA :. :::::: :::::::::.:: .:. :::.:.:::.:::::::::::::::..::..: CCDS53 IEHLNATFQPAKIGHPHGLQVTYLKDNSTRNIFIYHEDGKEIVDWFNALRAARFHYLQVA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 FPELPESELVPFLTRNYLKQGFMEKTGPKK-EPFKKRWFALDCHERRLLYYKNPLDAFEQ :: ...::: :.:::::.:.:::::::. : :.::::..: .:::.:.:.::::: . CCDS53 FPGAGDADLVPKLSRNYLKEGYMEKTGPKQTEGFRKRWFTMD--DRRLMYFKDPLDAFAR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 GQVFLGNKEQGYEAYEDLPKGIRGNRWKAGLTIVTPERRFVLTCPSEKEQQEWLESLRGV :.::.:.::.:: . . .: . .:..: :.:::::.:.:...: .:..:.::. ... . CCDS53 GEVFIGSKESGYTVLHGFPPSTQGHHWPHGITIVTPDRKFLFACETESDQREWVAAFQKA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 LSSPLTPLNRLTASTESGRSSR .. :. : CCDS53 VDRPMLPQEYAVEAHFKHKP 360 370 >>CCDS64577.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 (385 aa) initn: 1265 init1: 673 opt: 1467 Z-score: 1699.9 bits: 323.3 E(32554): 2.3e-88 Smith-Waterman score: 1467; 57.9% identity (83.3% similar) in 347 aa overlap (25-365:28-372) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAA----DPDWASYKLGIFICLNCCGVHR ::. : : ::::::: ::.::::.: :.:: CCDS64 MFQFVFSRVYCINPARRKWKEFEKMLGCAEEGHASLGRDPDWASYTLGVFICLSCSGIHR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 NFPDISRVKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLKEQWI :.:..:.::::::: :... :::: .:: ..:.::..::.::: : .:: .:.:::: CCDS64 NIPQVSKVKSVRLDAWEEAQVEFMASHGNDAARARFESKVPSFYYRPTPSDCQLLREQWI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 RAKYERREFM-ADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKEQGK ::::::.::. . . : ::::::::::::.::: ::::: ::: ::::.....: CCDS64 RAKYERQEFIYPEKQEPYSAGYREGFLWKRGRDNGQFLSRKFVLTEREGALKYFNRNDAK 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 SPKAVISIKDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALRAAR ::::..:. :::::: :::::::::.:: .:. :::.:.:::.::::::::::::::: CCDS64 EPKAVMKIEHLNATFQPAKIGHPHGLQVTYLKDNSTRNIFIYHEDGKEIVDWFNALRAAR 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 LQYLKMAFPELPESELVPFLTRNYLKQGFMEKTGPKK-EPFKKRWFALDCHERRLLYYKN ..::..::: ...::: :.:::::.:.:::::::. : :.::::..: .:::.:.:. CCDS64 FHYLQVAFPGAGDADLVPKLSRNYLKEGYMEKTGPKQTEGFRKRWFTMD--DRRLMYFKD 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 PLDAFEQGQVFLGNKEQGYEAYEDLPKGIRGNRWKAGLTIVTPERRFVLTCPSEKEQQEW ::::: .:.::.:.::.:: . . .: . .:..: :.:::::.:.:...: .:..:.:: CCDS64 PLDAFARGEVFIGSKESGYTVLHGFPPSTQGHHWPHGITIVTPDRKFLFACETESDQREW 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 LESLRGVLSSPLTPLNRLTASTESGRSSR . ... ... :. : CCDS64 VAAFQKAVDRPMLPQEYAVEAHFKHKP 360 370 380 >>CCDS64576.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 (302 aa) initn: 1008 init1: 673 opt: 1206 Z-score: 1399.7 bits: 267.4 E(32554): 1.2e-71 Smith-Waterman score: 1206; 57.0% identity (83.5% similar) in 291 aa overlap (77-365:1-289) 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 NCCGVHRNFPDISRVKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCL : .:: ..:.::..::.::: : .:: CCDS64 MASHGNDAARARFESKVPSFYYRPTPSDCQ 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 VLKEQWIRAKYERREFM-ADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKY .:.::::::::::.::. . . : ::::::::::::.::: ::::: ::: ::: CCDS64 LLREQWIRAKYERQEFIYPEKQEPYSAGYREGFLWKRGRDNGQFLSRKFVLTEREGALKY 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 FTKEQGKSPKAVISIKDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWF :.....: ::::..:. :::::: :::::::::.:: .:. :::.:.:::.:::::::: CCDS64 FNRNDAKEPKAVMKIEHLNATFQPAKIGHPHGLQVTYLKDNSTRNIFIYHEDGKEIVDWF 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 NALRAARLQYLKMAFPELPESELVPFLTRNYLKQGFMEKTGPKK-EPFKKRWFALDCHER :::::::..::..::: ...::: :.:::::.:.:::::::. : :.::::..: .: CCDS64 NALRAARFHYLQVAFPGAGDADLVPKLSRNYLKEGYMEKTGPKQTEGFRKRWFTMD--DR 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 RLLYYKNPLDAFEQGQVFLGNKEQGYEAYEDLPKGIRGNRWKAGLTIVTPERRFVLTCPS ::.:.:.::::: .:.::.:.::.:: . . .: . .:..: :.:::::.:.:...: . CCDS64 RLMYFKDPLDAFARGEVFIGSKESGYTVLHGFPPSTQGHHWPHGITIVTPDRKFLFACET 210 220 230 240 250 260 350 360 370 380 pF1KE3 EKEQQEWLESLRGVLSSPLTPLNRLTASTESGRSSR :..:.::. ... ... :. : CCDS64 ESDQREWVAAFQKAVDRPMLPQEYAVEAHFKHKP 270 280 290 300 >>CCDS75558.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 (279 aa) initn: 998 init1: 673 opt: 1098 Z-score: 1275.4 bits: 244.3 E(32554): 1e-64 Smith-Waterman score: 1098; 58.2% identity (84.7% similar) in 261 aa overlap (107-365:8-266) 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 MIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLKEQWIRAKYERREFM-ADGETISLPGNR .:.::::::::::.::. . . : : CCDS75 MVLASLELLREQWIRAKYERQEFIYPEKQEPYSAGYR 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 EGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKEQGKSPKAVISIKDLNATFQTEKIGHP :::::::::::.::: ::::: ::: ::::.....: ::::..:. :::::: ::::: CCDS75 EGFLWKRGRDNGQFLSRKFVLTEREGALKYFNRNDAKEPKAVMKIEHLNATFQPAKIGHP 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 HGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALRAARLQYLKMAFPELPESELVPFLTRN ::::.:: .:. :::.:.:::.:::::::::::::::..::..::: ...::: :.:: CCDS75 HGLQVTYLKDNSTRNIFIYHEDGKEIVDWFNALRAARFHYLQVAFPGAGDADLVPKLSRN 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 YLKQGFMEKTGPKK-EPFKKRWFALDCHERRLLYYKNPLDAFEQGQVFLGNKEQGYEAYE :::.:.:::::::. : :.::::..: .:::.:.:.::::: .:.::.:.::.:: . . CCDS75 YLKEGYMEKTGPKQTEGFRKRWFTMD--DRRLMYFKDPLDAFARGEVFIGSKESGYTVLH 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 DLPKGIRGNRWKAGLTIVTPERRFVLTCPSEKEQQEWLESLRGVLSSPLTPLNRLTASTE .: . .:..: :.:::::.:.:...: .:..:.::. ... ... :. : CCDS75 GFPPSTQGHHWPHGITIVTPDRKFLFACETESDQREWVAAFQKAVDRPMLPQEYAVEAHF 220 230 240 250 260 270 380 pF1KE3 SGRSSR CCDS75 KHKP >>CCDS451.1 SMAP2 gene_id:64744|Hs108|chr1 (429 aa) initn: 314 init1: 166 opt: 333 Z-score: 388.6 bits: 80.8 E(32554): 2.5e-15 Smith-Waterman score: 333; 33.0% identity (57.3% similar) in 185 aa overlap (3-183:8-187) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCGVHRNF : .: . : .:: : : :::: . : :::...:.:::. : :.:::. CCDS45 MTGKSVKDVDRYQAVLANLLLEED--NKFCADCQSKGPRWASWNIGVFICIRCAGIHRNL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 P-DISRVKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLKEQWIR ::::::: :: : . .. : . :: ... .:: .: . :: . . : .:: CCDS45 GVHISRVKSVNLDQWTQEQIQCMQEMGNGKANRLYEAYLPETFRRPQIDPAV---EGFIR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 AKYERREFMADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKEQ---G :::....: . :. ... :::: . . . :.. . . . : CCDS45 DKYEKKKYMDRSLDINAFRKEKDDKWKRGSEPVPEKKLEPVVFEKVKMPQKKEDPQLPRK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 KSPKAVISIKDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALRAA .:::.. . :: CCDS45 SSPKSTAPVMDLLGLDAPVACSIANSKTSNTLEKDLDLLASVPSPSSSGSRKVVGSMPTA 180 190 200 210 220 230 >>CCDS64459.1 SMAP1 gene_id:60682|Hs108|chr6 (436 aa) initn: 297 init1: 172 opt: 325 Z-score: 379.2 bits: 79.1 E(32554): 8.4e-15 Smith-Waterman score: 325; 36.0% identity (59.6% similar) in 178 aa overlap (5-181:15-182) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCG :... : .::: : : .:::: : : :::...:.:::. : : CCDS64 MATRSCREKAQKLNEQHQLILSKLLREED--NKYCADCEAKGPRWASWNIGVFICIRCAG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 VHRNFP-DISRVKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLK .:::. ::::::: :: : .. : :: ... .:: .: . ::... . CCDS64 IHRNLGVHISRVKSVNLDQWTAEQIQCMQDMGNTKARLLYEANLPENFRRPQTDQAV--- 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 EQWIRAKYERREFMADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKE : .:: :::..... : ..:.. :.: :. . . .. :. : : : :. CCDS64 EFFIRDKYEKKKYY-DKNAIAIT-NKEKEKKKEEKKREKEPEKPAKPLTAEKLQK---KD 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 QGKSPKAVISIKDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALR : :: : : CCDS64 QQLEPKKSTSPKKAAEPTVDLLGLDGPAVAPVTNGNTTVPPLNDDLDIFGPMISNPLPAT 180 190 200 210 220 230 >>CCDS4973.1 SMAP1 gene_id:60682|Hs108|chr6 (440 aa) initn: 297 init1: 172 opt: 325 Z-score: 379.2 bits: 79.1 E(32554): 8.5e-15 Smith-Waterman score: 325; 36.0% identity (59.6% similar) in 178 aa overlap (5-181:15-182) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCG :... : .::: : : .:::: : : :::...:.:::. : : CCDS49 MATRSCREKAQKLNEQHQLILSKLLREED--NKYCADCEAKGPRWASWNIGVFICIRCAG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 VHRNFP-DISRVKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLK .:::. ::::::: :: : .. : :: ... .:: .: . ::... . CCDS49 IHRNLGVHISRVKSVNLDQWTAEQIQCMQDMGNTKARLLYEANLPENFRRPQTDQAV--- 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 EQWIRAKYERREFMADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKE : .:: :::..... : ..:.. :.: :. . . .. :. : : : :. CCDS49 EFFIRDKYEKKKYY-DKNAIAIT-NKEKEKKKEEKKREKEPEKPAKPLTAEKLQK---KD 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 QGKSPKAVISIKDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALR : :: : : CCDS49 QQLEPKKSTSPKKAAEPTVDLLGLDGPAVAPVTNGNTTVPPLNDDLDIFGPMISNPLPAT 180 190 200 210 220 230 >>CCDS43478.1 SMAP1 gene_id:60682|Hs108|chr6 (467 aa) initn: 314 init1: 164 opt: 314 Z-score: 366.1 bits: 76.8 E(32554): 4.5e-14 Smith-Waterman score: 314; 39.8% identity (66.4% similar) in 128 aa overlap (5-131:15-136) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCG :... : .::: : : .:::: : : :::...:.:::. : : CCDS43 MATRSCREKAQKLNEQHQLILSKLLREED--NKYCADCEAKGPRWASWNIGVFICIRCAG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 VHRNFP-DISRVKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLK .:::. ::::::: :: : .. : :: ... .:: .: . ::... . CCDS43 IHRNLGVHISRVKSVNLDQWTAEQIQCMQDMGNTKARLLYEANLPENFRRPQTDQAV--- 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 EQWIRAKYERREFMADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKE : .:: :::..... : ..:.. CCDS43 EFFIRDKYEKKKYY-DKNAIAITNISSSDAPLQPLVSSPSLQAAVDKNKLEKEKEKKKEE 120 130 140 150 160 170 >>CCDS64802.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 (580 aa) initn: 218 init1: 168 opt: 303 Z-score: 352.0 bits: 74.5 E(32554): 2.7e-13 Smith-Waterman score: 303; 38.9% identity (65.5% similar) in 113 aa overlap (21-132:342-453) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCG ::. : :: : .::::: .:: ..:..: : CCDS64 SLQGCRSAKDKTRLGNQNAALAVQAVRTVRGNSFCIDCDAPNPDWASLNLGALMCIECSG 320 330 340 350 360 370 60 70 80 90 100 pF1KE3 VHRNF-PDISRVKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLK .::.. .:::.:. :: : .. : :: ... .:. . . : : . : : CCDS64 IHRHLGAHLSRVRSLDLDDWPPELLAVMTAMGNALANSVWEGALGG-YSKPGPDACREEK 380 390 400 410 420 430 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 EQWIRAKYERREFMADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKE :.:::::::.. :.: . ..: CCDS64 ERWIRAKYEQKLFLAPLPSSDVPLGQQLLRAVVEDDLRLLVMLLAHGSKEEVNETYGDGD 440 450 460 470 480 490 380 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 19:08:52 2016 done: Mon Nov 7 19:08:53 2016 Total Scan time: 2.280 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]