FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5420, 315 aa 1>>>pF1KE5420 315 - 315 aa - 315 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5900+/-0.000905; mu= 13.9682+/- 0.054 mean_var=68.6326+/-13.338, 0's: 0 Z-trim(105.6): 46 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.154814 statistics sampled from 8450 (8487) to 8450 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.261), width: 16 Scan time: 2.150 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10620.1 CACNG3 gene_id:10368|Hs108|chr16 ( 315) 2092 476.3 1.3e-134 CCDS13931.1 CACNG2 gene_id:10369|Hs108|chr22 ( 323) 1592 364.6 5.6e-101 CCDS11667.1 CACNG4 gene_id:27092|Hs108|chr17 ( 327) 1061 246.0 2.9e-65 CCDS33104.1 CACNG8 gene_id:59283|Hs108|chr19 ( 425) 761 179.1 5.3e-45 CCDS11665.1 CACNG5 gene_id:27091|Hs108|chr17 ( 275) 410 100.6 1.5e-21 CCDS12868.1 CACNG7 gene_id:59284|Hs108|chr19 ( 275) 374 92.6 3.8e-19 >>CCDS10620.1 CACNG3 gene_id:10368|Hs108|chr16 (315 aa) initn: 2092 init1: 2092 opt: 2092 Z-score: 2530.0 bits: 476.3 E(32554): 1.3e-134 Smith-Waterman score: 2092; 100.0% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MRMCDRGIQMLITTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCRTKSTSDNETSRKNEEVMTH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 MRMCDRGIQMLITTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCRTKSTSDNETSRKNEEVMTH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 SGLWRTCCLEGAFRGVCKKIDHFPEDADYEQDTAEYLLRAVRASSVFPILSVTLLFFGGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 SGLWRTCCLEGAFRGVCKKIDHFPEDADYEQDTAEYLLRAVRASSVFPILSVTLLFFGGL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 CVAASEFHRSRHNVILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPGQRDSKKSYSYGWSFY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 CVAASEFHRSRHNVILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPGQRDSKKSYSYGWSFY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 FGAFSFIIAEIVGVVAVHIYIEKHQQLRAKSHSEFLKKSTFARLPPYRYRFRRRSSSRST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 FGAFSFIIAEIVGVVAVHIYIEKHQQLRAKSHSEFLKKSTFARLPPYRYRFRRRSSSRST 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 EPRSRDLSPISKGFHTIPSTDISMFTLSRDPSKITMGTLLNSDRDHAFLQFHNSTPKEFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 EPRSRDLSPISKGFHTIPSTDISMFTLSRDPSKITMGTLLNSDRDHAFLQFHNSTPKEFK 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 ESLHNNPANRRTTPV ::::::::::::::: CCDS10 ESLHNNPANRRTTPV 310 >>CCDS13931.1 CACNG2 gene_id:10369|Hs108|chr22 (323 aa) initn: 1322 init1: 1002 opt: 1592 Z-score: 1926.3 bits: 364.6 E(32554): 5.6e-101 Smith-Waterman score: 1592; 74.6% identity (90.7% similar) in 323 aa overlap (1-315:1-323) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MRMCDRGIQMLITTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCRTKSTSDNETSRKNEEVMTH : . :::.:::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.:.::::.:::::::: CCDS13 MGLFDRGVQMLLTTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCKTKSVSENETSKKNEEVMTH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 SGLWRTCCLEGAFRGVCKKIDHFPEDADYEQDTAEYLLRAVRASSVFPILSVTLLFFGGL ::::::::::: :.:.::.::::::::::: :::::.::::::::.:::::: :::.::: CCDS13 SGLWRTCCLEGNFKGLCKQIDHFPEDADYEADTAEYFLRAVRASSIFPILSVILLFMGGL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 CVAASEFHRSRHNVILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPGQRDSKK-SYSYGWSF :.:::::...:::.::::::::::::::::::::::::::::::.. :::: :::::::: CCDS13 CIAASEFYKTRHNIILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPSKSDSKKNSYSYGWSF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 YFGAFSFIIAEIVGVVAVHIYIEKHQQLRAKSH-SEFLKKSTFARLPPYRYRFRRRS--S ::::.::::::.:::.:::..:..:.:::: .. ...:. :...:.: ::::..::: : CCDS13 YFGALSFIIAEMVGVLAVHMFIDRHKQLRATARATDYLQASAITRIPSYRYRYQRRSRSS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 SRSTEP-RSRDLSPIS-KGFHTIPSTDISMFTLSRDPSKI--TMGTLLNSDRDHAFLQFH :::::: .::: ::.. :::.:.:::.:::.:::::: : : . :::::..::: : CCDS13 SRSTEPSHSRDASPVGIKGFNTLPSTEISMYTLSRDPLKAATTPTATYNSDRDNSFLQVH 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 NSTPKEFKESLHNNPANRRTTPV : :: :.:::.: :::::::: CCDS13 NCIQKENKDSLHSNTANRRTTPV 310 320 >>CCDS11667.1 CACNG4 gene_id:27092|Hs108|chr17 (327 aa) initn: 1202 init1: 529 opt: 1061 Z-score: 1285.3 bits: 246.0 E(32554): 2.9e-65 Smith-Waterman score: 1221; 57.2% identity (81.7% similar) in 327 aa overlap (1-315:1-327) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MRMCDRGIQMLITTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRG-VCRTKSTS--DNETSRKNEEV : ::::.:::.::.:::::::::.::.:::::::: . .: . . :. :. . 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CCDS33 MESLKRWNEERGLWCEKGVQVLLTTVGAFAAFGLMTIAISTDYWLYTRALICNTTNLTAG 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 pF1KE5 -DNETS---------RKNEEVMTHSGLWRTCCLEGAFRGVCKKIDHFPEDADYEQDTAEY :. : .:. .::::::: ::::: :::: ::.:::::.::..:.::: CCDS33 GDDGTPHRGGGGASEKKDPGGLTHSGLWRICCLEGLKRGVCVKINHFPEDTDYDHDSAEY 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 LLRAVRASSVFPILSVTLLFFGGLCVAASEFHRSRHNVILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVY :::.:::::.:::::. ::..::.:::::. ..:..:.::.:::.::.::::::::.::: CCDS33 LLRVVRASSIFPILSAILLLLGGVCVAASRVYKSKRNIILGAGILFVAAGLSNIIGVIVY 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 ISANAGDPG-QRDSKKS--YSYGWSFYFGAFSFIIAEIVGVVAVHIYIEKHQQLRAKSHS ::::::.:: .:: .:. ::::::::::..:::.::..::.::.::::. .. . .:.: CCDS33 ISANAGEPGPKRDEEKKNHYSYGWSFYFGGLSFILAEVIGVLAVNIYIERSREAHCQSRS 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 pF1KE5 EFLKK------------STFARLPPYRYRFRRRS--SSRSTEPR-SRDLSPISKGFHTIP ..:: :.. ::: ::.:.:::: ::::.:: ::: :: . : . CCDS33 DLLKAGGGAGGSGGSGPSAILRLPSYRFRYRRRSRSSSRSSEPSPSRDASPGGPGGPGFA 250 260 270 280 290 300 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 STDISMFTLSRDPSKITMGTLLNSDRDHAFLQFHNSTPKEFKESLHNNPANRRTTPV ::::::.:::::::: CCDS33 STDISMYTLSRDPSKGSVAAGLAGAGGGGGGAVGAFGGAAGGAGGGGGGGGGAGAERDRG 310 320 330 340 350 360 >>CCDS11665.1 CACNG5 gene_id:27091|Hs108|chr17 (275 aa) initn: 390 init1: 141 opt: 410 Z-score: 500.6 bits: 100.6 E(32554): 1.5e-21 Smith-Waterman score: 410; 32.4% identity (69.0% similar) in 210 aa overlap (1-204:1-204) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MRMCDRGIQMLITTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLY-SRGVCRTKSTSDNETSRKNEEVMT : : : :...: : ...:. :::.:::::: .:: . .:.... .. CCDS11 MSACGRKALTLLSSVFAVCGLGLLGIAVSTDYWLYLEEGVI----VPQNQSTEI--KMSL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 HSGLWRTCCLEGAFRGVCKKIDH-FPEDADYEQDTAEYLLRAVRASSVFPILSVTLLFFG ::::::.: : : :: : :.. .: ... .... .:. .:... ::..:. ..:.: CCDS11 HSGLWRVCFLAGEERGRCFTIEYVMPMNTQLTSESTVNVLKMIRSATPFPLVSLFFMFIG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 GLCVAASEFHRSRHNVILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPGQR--DSKK--SYS . .... : . . .::::. .::: ..:...:::. . .: :.. .:. CCDS11 FILNNIGHIRPHRTILAFVSGIFFILSGLSLVVGLVLYISSINDEMLNRTKDAETYFNYK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 YGWSFYFGAFSFIIAEIVGVVAVHIYIEKHQQLRAKSHSEFLKKSTFARLPPYRYRFRRR ::::: :.:.::...: .::..:....... CCDS11 YGWSFAFAAISFLLTESAGVMSVYLFMKRYTAEDMYRPHPGFYRPRLSNCSDYSGQFLHP 180 190 200 210 220 230 >>CCDS12868.1 CACNG7 gene_id:59284|Hs108|chr19 (275 aa) initn: 331 init1: 147 opt: 374 Z-score: 457.2 bits: 92.6 E(32554): 3.8e-19 Smith-Waterman score: 374; 30.4% identity (64.7% similar) in 224 aa overlap (1-217:1-218) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MRMCD-RGIQMLITTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCRTKSTSDNETSRKNEEVMT : :. :.. .: .. :: .. :. :::.:::::: . . .:.:.. .. CCDS12 MSHCSSRALTLLSSVFGA-CGLLLVGIAVSTDYWLYME---EGTVLPQNQTTE--VKMAL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 HSGLWRTCCLEGAFRGVCKKIDHFPE-DADYEQDTAEYLLRAVRASSVFPILSVTLLFFG :.::::.: . : .: : ..: : . . ...: .:..::... ::..:. :.: . CCDS12 HAGLWRVCFFAGREKGRCVASEYFLEPEINLVTENTENILKTVRTATPFPMVSLFLVFTA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 GLCVAASEFHRSRHNVILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPGQRDSKKS----YS . .... .: . . .::::. .::: ..:...:::. . .: :.. : CCDS12 FVISNIGHIRPQRTILAFVSGIFFILSGLSLVVGLVLYISSINDEVMNRPSSSEQYFHYR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 YGWSFYFGAFSFIIAEIVGVVAVHIYIEKHQQLRA-KSHSEFLKKSTFARLPPYRYRFRR ::::: :.: ::.. : .::..:... ... . . . : : . CCDS12 YGWSFAFAASSFLLKEGAGVMSVYLFTKRYAEEEMYRPHPAFYRPRLSDCSDYSGQFLQP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 RSSSRSTEPRSRDLSPISKGFHTIPSTDISMFTLSRDPSKITMGTLLNSDRDHAFLQFHN CCDS12 EAWRRGRSPSDISSDVSIQMTQNYPPAIKYPDHLHISTSPC 240 250 260 270 315 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 00:35:09 2016 done: Tue Nov 8 00:35:09 2016 Total Scan time: 2.150 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]