FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2290, 358 aa 1>>>pF1KE2290 358 - 358 aa - 358 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6923+/-0.00077; mu= 20.2156+/- 0.046 mean_var=91.9611+/-25.739, 0's: 0 Z-trim(109.2): 87 B-trim: 1356 in 2/49 Lambda= 0.133743 statistics sampled from 10565 (10743) to 10565 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16 Scan time: 2.410 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9708.1 PTGER2 gene_id:5732|Hs108|chr14 ( 358) 2367 466.9 1.2e-131 CCDS12686.1 PTGIR gene_id:5739|Hs108|chr19 ( 386) 787 162.1 7.3e-40 CCDS9707.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 ( 359) 773 159.3 4.6e-39 CCDS61454.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 ( 296) 759 156.5 2.6e-38 CCDS3930.1 PTGER4 gene_id:5734|Hs108|chr5 ( 488) 403 88.1 1.7e-17 CCDS657.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 390) 380 83.5 3.2e-16 CCDS656.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 390) 380 83.5 3.2e-16 CCDS655.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 418) 379 83.4 3.9e-16 CCDS658.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 388) 373 82.2 8.2e-16 CCDS42467.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 ( 343) 371 81.7 9.9e-16 CCDS54198.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 ( 407) 366 80.9 2.2e-15 CCDS652.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 374) 365 80.6 2.3e-15 CCDS44160.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 365) 364 80.4 2.6e-15 CCDS12309.1 PTGER1 gene_id:5731|Hs108|chr19 ( 402) 329 73.7 3e-13 CCDS14735.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX ( 371) 291 66.3 4.6e-11 >>CCDS9708.1 PTGER2 gene_id:5732|Hs108|chr14 (358 aa) initn: 2367 init1: 2367 opt: 2367 Z-score: 2477.1 bits: 466.9 E(32554): 1.2e-131 Smith-Waterman score: 2367; 100.0% identity (100.0% similar) in 358 aa overlap (1-358:1-358) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MGNASNDSQSEDCETRQWLPPGESPAISSVMFSAGVLGNLIALALLARRWRGDVGCSAGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 MGNASNDSQSEDCETRQWLPPGESPAISSVMFSAGVLGNLIALALLARRWRGDVGCSAGR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 RSSLSLFHVLVTELVFTDLLGTCLISPVVLASYARNQTLVALAPESRACTYFAFAMTFFS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 RSSLSLFHVLVTELVFTDLLGTCLISPVVLASYARNQTLVALAPESRACTYFAFAMTFFS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LATMLMLFAMALERYLSIGHPYFYQRRVSRSGGLAVLPVIYAVSLLFCSLPLLDYGQYVQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 LATMLMLFAMALERYLSIGHPYFYQRRVSRSGGLAVLPVIYAVSLLFCSLPLLDYGQYVQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 YCPGTWCFIRHGRTAYLQLYATLLLLLIVSVLACNFSVILNLIRMHRRSRRSRCGPSLGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 YCPGTWCFIRHGRTAYLQLYATLLLLLIVSVLACNFSVILNLIRMHRRSRRSRCGPSLGS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 GRGGPGARRRGERVSMAEETDHLILLAIMTITFAVCSLPFTIFAYMNETSSRKEKWDLQA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 GRGGPGARRRGERVSMAEETDHLILLAIMTITFAVCSLPFTIFAYMNETSSRKEKWDLQA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 LRFLSINSIIDPWVFAILRPPVLRLMRSVLCCRISLRTQDATQTSCSTQSDASKQADL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 LRFLSINSIIDPWVFAILRPPVLRLMRSVLCCRISLRTQDATQTSCSTQSDASKQADL 310 320 330 340 350 >>CCDS12686.1 PTGIR gene_id:5739|Hs108|chr19 (386 aa) initn: 783 init1: 346 opt: 787 Z-score: 829.1 bits: 162.1 E(32554): 7.3e-40 Smith-Waterman score: 848; 46.1% identity (69.6% similar) in 332 aa overlap (10-332:2-309) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MGNASNDSQSEDCETRQWLPPGESPAISSVMFSAGVLGNLIALALLARRWRGDVGCSAGR ...:.. .. . .:: :..:: :::.:: .::..: :: : CCDS12 MADSCRNLTYVRGSVGPATSTLMFVAGVVGNGLALGIL----------SARR 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE2 RSSLSLFHVLVTELVFTDLLGTCLISPVVLASYARNQTLVALAPESRA-CTYFAFAMTFF . : : :::: :. :::::: ..::.:...::::..:..:: . : : :::::::: CCDS12 PARPSAFAVLVTGLAATDLLGTSFLSPAVFVAYARNSSLLGLARGGPALCDAFAFAMTFF 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 SLATMLMLFAMALERYLSIGHPYFY-QRRVSRSGGLAVLPVIYAVSLLFCSLPLLDYGQY .::.::.:::::.:: :...:::.: : : . :: ::.::: .:::.:::: ::. 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CCDS12 QQYCPGSWCFLRMRWAQPGGAAFSLAYAGLVALLVAAIFLCNGSVTLSLCRMYRQQKRHQ 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 CGPSLGSGRGGPGARRRGERVSMAEETDHLILLAIMTITFAVCSLPFTI--FAYMNETSS : :: : :: .:.:::::::.::...::::::.:: :. .: CCDS12 -------GSLGPRPRT-GE-----DEVDHLILLALMTVVMAVCSLPLTIRCFTQAVAPDS 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 RKEKWDLQALRFLSINSIIDPWVFAILRPPVLRLMRSVLCCRISLRTQDATQTSCSTQSD .: :: :.:: ..: :.::::: ..: :.. .. .:: CCDS12 SSEMGDLLAFRFYAFNPILDPWVFILFRKAVFQRLKLWVCCLCLGPAHGDSQTPLSQLAS 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 ASKQADL CCDS12 GRRDPRAPSAPVGKEGSCVPLSAWGEGQVEPLPPTQQSSGSAVGTSSKAEASVACSLC 330 340 350 360 370 380 >>CCDS9707.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 (359 aa) initn: 916 init1: 345 opt: 773 Z-score: 814.9 bits: 159.3 E(32554): 4.6e-39 Smith-Waterman score: 895; 44.4% identity (68.5% similar) in 356 aa overlap (13-350:8-357) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MGNASNDSQSEDCETRQWLPPGESPAISSVMFSAGVLGNLIALALLARRWRGDVGCSAGR :.. . :.: ....:.::.:.::::.::.:::: : :: CCDS97 MKSPFYRCQNTTSVEKGNSAVMGGVLFSTGLLGNLLALGLLARSGLG--WCSRRP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE2 RSSL-SLFHVLVTELVFTDLLGTCLISPVVLASYARNQTLVALAP--ESRACTYFAFAMT : :.:..:: :. ::::: ::.::::::.::.:..: .::: .. : ::: :. CCDS97 LRPLPSVFYMLVCGLTVTDLLGKCLLSPVVLAAYAQNRSLRVLAPALDNSLCQAFAFFMS 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 FFSLATMLMLFAMALERYLSIGHPYFYQRRVSRSGGLAVLPVIYAVSLLFCSLPLLDYGQ ::.:.. :.:.::::: .::.:::.::.:... : : ::. : :: ::.::.. .:. CCDS97 FFGLSSTLQLLAMALECWLSLGHPFFYRRHITLRLGALVAPVVSAFSLAFCALPFMGFGK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 YVQYCPGTWCFIR--H--GRTAYLQ---LYATLLLLLIVSVLACNFSVILNLIRMHRRSR .:::::::::::. : : . : ::..:. ::..... ::.... :: :::: . CCDS97 FVQYCPGTWCFIQMVHEEGSLSVLGYSVLYSSLMALLVLATVLCNLGAMRNLYAMHRRLQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 RSRCGP-SLGSGRGGPGARRRGERVSMAEETDHLILLAIMTITFAVCSLPFTIFAYMNET : : : . : : : . :: :::.:::.::. :..:::: ::.. CCDS97 RH---PRSCTRDCAEPRADGREASPQPLEELDHLLLLALMTVLFTMCSLPVIYRAYYGAF 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 SSRKEK-------WDLQALRFLSINSIIDPWVFAILRPPVLRLMRSVLCCRISLRTQDAT .. ::: ::.::::::. ::.:::.: :.: ::.:.. . : :: .. CCDS97 KDVKEKNRTSEEAEDLRALRFLSVISIVDPWIFIIFRSPVFRIFFHKIFIR-PLRYRSRC 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QTSCSTQSDASKQADL ..: . .: CCDS97 SNSTNMESSL 350 >>CCDS61454.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 (296 aa) initn: 771 init1: 345 opt: 759 Z-score: 801.2 bits: 156.5 E(32554): 2.6e-38 Smith-Waterman score: 759; 46.1% identity (69.9% similar) in 282 aa overlap (13-283:8-284) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MGNASNDSQSEDCETRQWLPPGESPAISSVMFSAGVLGNLIALALLARRWRGDVGCSAGR :.. . :.: ....:.::.:.::::.::.:::: : :: CCDS61 MKSPFYRCQNTTSVEKGNSAVMGGVLFSTGLLGNLLALGLLARSGLG--WCSRRP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE2 RSSL-SLFHVLVTELVFTDLLGTCLISPVVLASYARNQTLVALAP--ESRACTYFAFAMT : :.:..:: :. ::::: ::.::::::.::.:..: .::: .. : ::: :. CCDS61 LRPLPSVFYMLVCGLTVTDLLGKCLLSPVVLAAYAQNRSLRVLAPALDNSLCQAFAFFMS 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 FFSLATMLMLFAMALERYLSIGHPYFYQRRVSRSGGLAVLPVIYAVSLLFCSLPLLDYGQ ::.:.. :.:.::::: .::.:::.::.:... : : ::. : :: ::.::.. .:. CCDS61 FFGLSSTLQLLAMALECWLSLGHPFFYRRHITLRLGALVAPVVSAFSLAFCALPFMGFGK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 YVQYCPGTWCFIR--H--GRTAYLQ---LYATLLLLLIVSVLACNFSVILNLIRMHRRSR .:::::::::::. : : . : ::..:. ::..... ::.... :: :::: . CCDS61 FVQYCPGTWCFIQMVHEEGSLSVLGYSVLYSSLMALLVLATVLCNLGAMRNLYAMHRRLQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 RSRCGP-SLGSGRGGPGARRRGERVSMAEETDHLILLAIMTITFAVCSLPFTIFAYMNET : : : . : : : . :: :::.:::.::. :..:::: : CCDS61 RH---PRSCTRDCAEPRADGREASPQPLEELDHLLLLALMTVLFTMCSLPVIAFVPGVPA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 SSRKEKWDLQALRFLSINSIIDPWVFAILRPPVLRLMRSVLCCRISLRTQDATQTSCSTQ CCDS61 KTPGSR >>CCDS3930.1 PTGER4 gene_id:5734|Hs108|chr5 (488 aa) initn: 613 init1: 237 opt: 403 Z-score: 427.5 bits: 88.1 E(32554): 1.7e-17 Smith-Waterman score: 615; 35.0% identity (63.1% similar) in 369 aa overlap (24-353:19-370) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MGNASNDSQSEDCETRQWLPPGESPA-ISSVMFSAGVLGNLIALALLARRWRGDVGCSAG ::. : .::: ::.:::.:...: :.. CCDS39 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVL---------CKSR 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 RRSSLSLFHVLVTELVFTDLLGTCLISPVVLASYARNQTLVALAPESRA-CTYFAFAMTF .... . :..:: :. :::::: :.:::..:.: ..: : .. : : .: . : CCDS39 KEQKETTFYTLVCGLAVTDLLGTLLVSPVTIATYMKGQW-----PGGQPLCEYSTFILLF 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 FSLATMLMLFAMALERYLSIGHPYFYQRRVS-RSGGLAVLPVIYAVSLLFCSLPLLDYGQ :::. . .. ::..::::.:.: :::.. :. : .::... ..:: ..:::.:: . :. CCDS39 FSLSGLSIICAMSVERYLAINHAYFYSHYVDKRLAGLTLF-AVYASNVLFCALPNMGLGS 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 -YVQYCPGTWCFIR-----HGRTAYLQLYATLLLLLIVSVLACNFSVILNLIRMHRR-SR .:: : ::::: ...:: .:: . .::.... :: : :.::::. : CCDS39 SRLQY-PDTWCFIDWTTNVTAHAAYSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMHRQFMR 170 180 190 200 210 240 250 260 270 pF1KE2 RSRCGP---------SLGSGRGGPGA-----------RRRGERVSMAEETDHLILLAIMT :. : :..: :: :.: :::. : . : . .::: . CCDS39 RTSLGTEQHHAAAAASVAS-RGHPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQMVILLIATS 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 ITFAVCSLPFTIFAYMNET---SSRKE---KWDLQALRFLSINSIIDPWVFAILRPPVL- .. .::.:... ...:. : ..: . ::::.:. :.: :.:::.. .:: :: CCDS39 LVVLICSIPLVVRVFVNQLYQPSLEREVSKNPDLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLS 280 290 300 310 320 330 330 340 350 pF1KE2 RLMRSVLC--CRISLRTQDATQTSCSTQSDASKQADL . .... : :::. .. . :: .. .: CCDS39 KAIEKIKCLFCRIGGSRRERSGQHCSDSQRTSSAMSGHSRSFISRELKEISSTSQTLLPD 340 350 360 370 380 390 CCDS39 LSLPDLSENGLGGRNLLPGVPGMGLAQEDTTSLRTLRISETSDSSQGQDSESVLLVDEAG 400 410 420 430 440 450 >>CCDS657.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 (390 aa) initn: 429 init1: 306 opt: 380 Z-score: 404.6 bits: 83.5 E(32554): 3.2e-16 Smith-Waterman score: 451; 31.0% identity (57.6% similar) in 368 aa overlap (20-353:40-379) 10 20 30 40 pF1KE2 MGNASNDSQSEDCETRQWLPPGESPAISSV-------MFSAGVLGNLIA ::: . .:: :. .: .:: .: CCDS65 DAPFCTRLNHSYTGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLLTGFVGNALA 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 LALLARRWRGDVGCSAGRRSSLSLFHVLVTELVFTDLLGTCLISPVVLASYARNQTLVAL . :..: .: . :..: : . . :..:::.: : .:::.. : .: . CCDS65 MLLVSRSYRRR---ESKRKKS---FLLCIGWLALTDLVGQLLTTPVVIVVYLSKQRWEHI 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 APESRACTYFAFAMTFFSLATMLMLFAMALERYLSIGHPYFYQRRVSRSGGLAVLPVIYA : .: ::.:...:: :.:..... :::.:: :.: :..: ... . ::: .. CCDS65 DPSGRLCTFFGLTMTVFGLSSLFIASAMAVERALAIRAPHWYASHMKTRATRAVLLGVWL 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 pF1KE2 VSLLFCSLPLLDYGQYVQYCPGTWCFIRHGRTA-------------YLQLYATLLLLLIV . : : ::.: :::. ::::::: :: . . . .: : :: .. CCDS65 AVLAFALLPVLGVGQYTVQWPGTWCFISTGRGGNGTSSSHNWGNLFFASAFAFLGLLALT 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 SVLACNFSVILNLIRMHRRSR-RSRCGPSLGSGRGGPGARRRGERVSMAEETDHLILLAI ...::...: :. :: :.. : .:.. : :.. :: . :..: CCDS65 VTFSCNLATIKALV-----SRCRAKATASQSSAQWG--------RITT--ETA-IQLMGI 250 260 270 280 270 280 290 300 310 pF1KE2 MTITFAVCSLPFTIFAY---MNETS-------SRKEK---WDLQALRFLSINSIIDPWVF : . ..:: :. :. .:.:: ..:.: . : :.:. :.:.:.::::. CCDS65 MCV-LSVCWSPLLIMMLKMIFNQTSVEHCKTHTEKQKECNFFLIAVRLASLNQILDPWVY 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 pF1KE2 AILRPPVLRLMRSVLCCRISLRTQDATQTSCSTQSDASKQADL .:: .:: . :.: .:.. ...: : . : CCDS65 LLLRKILLRKF-----CQIRYHTNNYASSSTSLPCQCSSTLMWSDHLER 350 360 370 380 390 >>CCDS656.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 (390 aa) initn: 429 init1: 306 opt: 380 Z-score: 404.6 bits: 83.5 E(32554): 3.2e-16 Smith-Waterman score: 451; 31.0% identity (57.6% similar) in 368 aa overlap (20-353:40-379) 10 20 30 40 pF1KE2 MGNASNDSQSEDCETRQWLPPGESPAISSV-------MFSAGVLGNLIA ::: . .:: :. .: .:: .: CCDS65 DAPFCTRLNHSYTGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLLTGFVGNALA 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 LALLARRWRGDVGCSAGRRSSLSLFHVLVTELVFTDLLGTCLISPVVLASYARNQTLVAL . :..: .: . :..: : . . :..:::.: : .:::.. : .: . CCDS65 MLLVSRSYRRR---ESKRKKS---FLLCIGWLALTDLVGQLLTTPVVIVVYLSKQRWEHI 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 APESRACTYFAFAMTFFSLATMLMLFAMALERYLSIGHPYFYQRRVSRSGGLAVLPVIYA : .: ::.:...:: :.:..... :::.:: :.: :..: ... . ::: .. CCDS65 DPSGRLCTFFGLTMTVFGLSSLFIASAMAVERALAIRAPHWYASHMKTRATRAVLLGVWL 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 pF1KE2 VSLLFCSLPLLDYGQYVQYCPGTWCFIRHGRTA-------------YLQLYATLLLLLIV . : : ::.: :::. ::::::: :: . . . .: : :: .. CCDS65 AVLAFALLPVLGVGQYTVQWPGTWCFISTGRGGNGTSSSHNWGNLFFASAFAFLGLLALT 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 SVLACNFSVILNLIRMHRRSR-RSRCGPSLGSGRGGPGARRRGERVSMAEETDHLILLAI ...::...: :. :: :.. : .:.. : :.. :: . :..: CCDS65 VTFSCNLATIKALV-----SRCRAKATASQSSAQWG--------RITT--ETA-IQLMGI 250 260 270 280 270 280 290 300 310 pF1KE2 MTITFAVCSLPFTIFAY---MNETS-------SRKEK---WDLQALRFLSINSIIDPWVF : . ..:: :. :. .:.:: ..:.: . : :.:. :.:.:.::::. CCDS65 MCV-LSVCWSPLLIMMLKMIFNQTSVEHCKTHTEKQKECNFFLIAVRLASLNQILDPWVY 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 pF1KE2 AILRPPVLRLMRSVLCCRISLRTQDATQTSCSTQSDASKQADL .:: .:: . :.: .:.. ...: : . : CCDS65 LLLRKILLRKF-----CQIRYHTNNYASSSTSLPCQCSSTLMWSDHLER 350 360 370 380 390 >>CCDS655.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 (418 aa) initn: 429 init1: 306 opt: 379 Z-score: 403.2 bits: 83.4 E(32554): 3.9e-16 Smith-Waterman score: 450; 31.0% identity (56.9% similar) in 371 aa overlap (20-356:40-381) 10 20 30 40 pF1KE2 MGNASNDSQSEDCETRQWLPPGESPAISSV-------MFSAGVLGNLIA ::: . .:: :. .: .:: .: CCDS65 DAPFCTRLNHSYTGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLLTGFVGNALA 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 LALLARRWRGDVGCSAGRRSSLSLFHVLVTELVFTDLLGTCLISPVVLASYARNQTLVAL . :..: .: . :..: : . . :..:::.: : .:::.. : .: . 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