Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1703
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1703, 208 aa
1>>>pF1KE1703 208 - 208 aa - 208 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1561+/-0.000691; mu= 14.1613+/- 0.042
mean_var=62.4006+/-12.425, 0's: 0 Z-trim(109.2): 37 B-trim: 29 in 1/51
Lambda= 0.162360
statistics sampled from 10709 (10746) to 10709 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16
Scan time: 2.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9298.1 FGF9 gene_id:2254|Hs108|chr13 ( 208) 1417 340.0 6.4e-94
CCDS5998.1 FGF20 gene_id:26281|Hs108|chr8 ( 211) 995 241.1 3.7e-64
CCDS75996.1 FGF16 gene_id:8823|Hs108|chrX ( 207) 992 240.4 5.9e-64
CCDS3950.1 FGF10 gene_id:2255|Hs108|chr5 ( 208) 422 106.9 9.2e-24
CCDS9500.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 ( 252) 419 106.3 1.8e-23
CCDS9501.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 ( 247) 411 104.4 6.3e-23
CCDS12037.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19 ( 170) 409 103.8 6.4e-23
CCDS34021.1 FGF5 gene_id:2250|Hs108|chr4 ( 268) 402 102.3 2.9e-22
CCDS14664.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 192) 391 99.6 1.3e-21
CCDS55512.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 199) 391 99.6 1.4e-21
CCDS55511.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 226) 391 99.7 1.5e-21
CCDS14665.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 245) 391 99.7 1.6e-21
CCDS55513.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 255) 391 99.7 1.7e-21
CCDS46983.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3 ( 181) 385 98.2 3.3e-21
CCDS3301.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3 ( 243) 385 98.3 4.3e-21
CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15 ( 194) 383 97.8 4.9e-21
CCDS11105.1 FGF11 gene_id:2256|Hs108|chr17 ( 225) 380 97.1 9e-21
CCDS8527.1 FGF6 gene_id:2251|Hs108|chr12 ( 208) 350 90.1 1.1e-18
CCDS8194.1 FGF4 gene_id:2249|Hs108|chr11 ( 206) 346 89.1 2.1e-18
CCDS8195.1 FGF3 gene_id:2248|Hs108|chr11 ( 239) 332 85.9 2.3e-17
CCDS4275.1 FGF1 gene_id:2246|Hs108|chr5 ( 155) 329 85.1 2.6e-17
CCDS34059.1 FGF2 gene_id:2247|Hs108|chr4 ( 288) 272 71.9 4.6e-13
CCDS7517.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 233) 257 68.3 4.4e-12
CCDS7518.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 204) 255 67.8 5.4e-12
CCDS7515.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 215) 255 67.8 5.6e-12
CCDS7516.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 244) 255 67.8 6.3e-12
CCDS74241.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19 ( 165) 242 64.7 3.7e-11
>>CCDS9298.1 FGF9 gene_id:2254|Hs108|chr13 (208 aa)
initn: 1417 init1: 1417 opt: 1417 Z-score: 1799.7 bits: 340.0 E(32554): 6.4e-94
Smith-Waterman score: 1417; 100.0% identity (100.0% similar) in 208 aa overlap (1-208:1-208)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAPLGEVGNYFGVQDAVPFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDLDHLKGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MAPLGEVGNYFGVQDAVPFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDLDHLKGI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KGELYGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 KGELYGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKR
130 140 150 160 170 180
190 200
pF1KE1 HQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 HQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS
190 200
>>CCDS5998.1 FGF20 gene_id:26281|Hs108|chr8 (211 aa)
initn: 996 init1: 951 opt: 995 Z-score: 1265.4 bits: 241.1 E(32554): 3.7e-64
Smith-Waterman score: 995; 70.3% identity (89.5% similar) in 209 aa overlap (1-205:1-208)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAPLGEVGNYFGVQDAV--PFGNVPVLPV--DSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDLDH
::::.:::...: ... :. .:: . : ::... . .: .. ::....: :
CCDS59 MAPLAEVGGFLGGLEGLGQQVGSHFLLPPAGERPPLLGERRSAAERSARG-GPGAAQLAH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYL
:.::::::::::::::::.:.:.:..::::.::: ::::::::.::::::::::::::::
CCDS59 LHGILRRRQLYCRTGFHLQILPDGSVQGTRQDHSLFGILEFISVAVGLVSIRGVDSGLYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GMNEKGELYGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGT
:::.:::::::::::.::.::::::::::::::::.::: ::::::.::::::::::.:.
CCDS59 GMNDKGELYGSEKLTSECIFREQFEENWYNTYSSNIYKHGDTGRRYFVALNKDGTPRDGA
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KE1 RTKRHQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS
:.::::::::::::::::..:::::::.:
CCDS59 RSKRHQKFTHFLPRPVDPERVPELYKDLLMYT
180 190 200 210
>>CCDS75996.1 FGF16 gene_id:8823|Hs108|chrX (207 aa)
initn: 969 init1: 915 opt: 992 Z-score: 1261.7 bits: 240.4 E(32554): 5.9e-64
Smith-Waterman score: 992; 71.6% identity (87.5% similar) in 208 aa overlap (4-205:1-204)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAPLGEVGNYFGVQD------AVPFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDL
..:::. :. : . .::::. .::: .:...::: : : : :: . ::.
CCDS75 MAEVGGVFASLDWDLHGFSSSLGNVPL--ADSPGFLNERLGQIE-GKLQRG-SPTDF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 DHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGL
::::::::::::::::::::::::::..:::.::::::::::::.::::.:::::::::
CCDS75 AHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 YLGMNEKGELYGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPRE
::::::.::::::.:::.::::::::::::::::.:.:::: :. :.:::::::::.:::
CCDS75 YLGMNERGELYGSKKLTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPRE
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KE1 GTRTKRHQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS
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CCDS75 GYRTKRHQKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRDLFHYR
180 190 200
>>CCDS3950.1 FGF10 gene_id:2255|Hs108|chr5 (208 aa)
initn: 419 init1: 311 opt: 422 Z-score: 540.1 bits: 106.9 E(32554): 9.2e-24
Smith-Waterman score: 422; 43.0% identity (79.6% similar) in 142 aa overlap (48-189:64-203)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 PFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDLDHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIF
: : . .::.: .: :.:. : . :.:
CCDS39 PVTCQALGQDMVSPEATNSSSSSFSSPSSAGRHVRSYNHLQGDVRWRKLFSFTKYFLKIE
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 PNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNEKGELYGSEKLTQECVFR
:: ..::.:.. ..:::. :. .:.:......:. ::.::.::.::::......: ..
CCDS39 KNGKVSGTKKENCPYSILEITSVEIGVVAVKAINSNYYLAMNKKGKLYGSKEFNNDCKLK
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 EQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKRHQKFTHFLPRPVDPDKV
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CCDS39 ERIEENGYNTYASFNWQH--NGRQMYVALNGKGAPRRGQKTRRKNTSAHFLPMVVHS
160 170 180 190 200
200
pF1KE1 PELYKDILSQS
>>CCDS9500.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 (252 aa)
initn: 430 init1: 392 opt: 419 Z-score: 535.0 bits: 106.3 E(32554): 1.8e-23
Smith-Waterman score: 419; 40.3% identity (73.0% similar) in 159 aa overlap (36-193:52-207)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 EVGNYFGVQDAVPFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAG-GLPRGPAVTDLDHLKGILRRR
:. : : .: .. :: .::::. :
CCDS95 DLFFLRVSKLLDCFSPKSMWFLWNIFSKGTHMLQCLCGKSLKKNKNPTD-PQLKGIVTR-
30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QLYCRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNEKGEL
:::: :..:.. :.:...::. : . ....: ... .:.:.:: .:::..:: .: :
CCDS95 -LYCRQGYYLQMHPDGALDGTKDDSTNSTLFNLIPVGLRVVAIQGVKTGLYIAMNGEGYL
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKRHQKF
: :: .: :: :.:. ::.: ::: ::.. ..:: ....:::.: .:.:.:. .
CCDS95 YPSELFTPECKFKESVFENYYVIYSSMLYRQQESGRAWFLGLNKEGQAMKGNRVKKTKPA
140 150 160 170 180 190
190 200
pF1KE1 THFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS
.::::.:..
CCDS95 AHFLPKPLEVAMYREPSLHDVGETVPKPGVTPSKSTSASAIMNGGKPVNKSKTT
200 210 220 230 240 250
>>CCDS9501.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 (247 aa)
initn: 431 init1: 392 opt: 411 Z-score: 525.0 bits: 104.4 E(32554): 6.3e-23
Smith-Waterman score: 411; 38.5% identity (72.0% similar) in 161 aa overlap (33-193:44-202)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 PLGEVGNYFGVQDAVPFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDLDHLKGILR
: : ... . :: . . .::::.
CCDS95 RQAREQHWDRPSASRRRSSPSKNRGLCNGNLVDIFSKVRIFGLKKRRLRRQDPQLKGIVT
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 RRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNEKG
: :::: :..:.. :.:...::. : . ....: ... .:.:.:: .:::..:: .:
CCDS95 R--LYCRQGYYLQMHPDGALDGTKDDSTNSTLFNLIPVGLRVVAIQGVKTGLYIAMNGEG
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 ELYGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKRHQ
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CCDS95 YLYPSELFTPECKFKESVFENYYVIYSSMLYRQQESGRAWFLGLNKEGQAMKGNRVKKTK
140 150 160 170 180 190
190 200
pF1KE1 KFTHFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS
.::::.:..
CCDS95 PAAHFLPKPLEVAMYREPSLHDVGETVPKPGVTPSKSTSASAIMNGGKPVNKSKTT
200 210 220 230 240
>>CCDS12037.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19 (170 aa)
initn: 394 init1: 304 opt: 409 Z-score: 525.0 bits: 103.8 E(32554): 6.4e-23
Smith-Waterman score: 409; 44.1% identity (74.3% similar) in 152 aa overlap (41-189:19-166)
20 30 40 50 60
pF1KE1 FGVQDAVPFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAGGLP---RGPAVTDLDHLKGILRRRQLY
.:.: : ::: . ::.: .: :.:.
CCDS12 MRRRLWLGLAWLLLARAPDAAGTPSASRGP--RSYPHLEGDVRWRRLF
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 CRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNEKGELYGS
: : :.. :.: .:::: :.. .:::. :. ::.: :..:.::.:..::..:.::::
CCDS12 SSTHFFLRVDPGGRVQGTRWRHGQDSILEIRSVHVGVVVIKAVSSGFYVAMNRRGRLYGS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKRHQKFTHF
. : .: :::..::: .:::.:. ... :. ...::.. : :: : ::.:.. .::
CCDS12 RLYTVDCRFRERIEENGHNTYASQRWRR--RGQPMFLALDRRGGPRPGGRTRRYHLSAHF
110 120 130 140 150 160
190 200
pF1KE1 LPRPVDPDKVPELYKDILSQS
::
CCDS12 LPVLVS
170
>>CCDS34021.1 FGF5 gene_id:2250|Hs108|chr4 (268 aa)
initn: 410 init1: 267 opt: 402 Z-score: 513.1 bits: 102.3 E(32554): 2.9e-22
Smith-Waterman score: 402; 37.7% identity (70.0% similar) in 207 aa overlap (1-200:26-227)
10 20 30
pF1KE1 MAPLGEVGNYFGVQDAVPFGNVPVLPVDSPVLLSD
.:: :. : .. : : :. .: .. :.
CCDS34 MSLSFLLLLFFSHLILSAWAHGEKRLAPKGQPGP--AATDRNPRGSSSR-QSSSSAMSSS
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 HLGQSEAGGL-PRGPAVTDLDHLKGILRRR--QLYCRTG--FHLEIFPNGTIQGTRKDHS
..: :..: .: .. . . . :: .::::.: :::.:.:.: ..:.. . .
CCDS34 SASSSPAASLGSQGSGLEQSSFQWSPSGRRTGSLYCRVGIGFHLQIYPDGKVNGSH-EAN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 RFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNEKGELYGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSS
...::..... :.:.:::: :. .:.:..::.:..: :.:..: :::.:.:: ::::.:
CCDS34 MLSVLEIFAVSQGIVGIRGVFSNKFLAMSKKGKLHASAKFTDDCKFRERFQENSYNTYAS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KE1 NLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGT--RTKRHQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS
... :::..:::::: : ..: :.: .. :::::: . .. :::
CCDS34 AIHRTEKTGREWYVALNKRGKAKRGCSPRVKPQHISTHFLPRFKQSEQ-PELSFTVTVPE
180 190 200 210 220 230
CCDS34 KKKPPSPIKPKIPLSAPRKNTNSVKYRLKFRFG
240 250 260
>>CCDS14664.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX (192 aa)
initn: 411 init1: 376 opt: 391 Z-score: 501.4 bits: 99.6 E(32554): 1.3e-21
Smith-Waterman score: 391; 41.9% identity (75.7% similar) in 148 aa overlap (56-203:12-153)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 PVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDLDHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGT
.::::. . :: : :.::.. .:::.::
CCDS14 MALLRKSYSEPQLKGIVTK--LYSRQGYHLQLQADGTIDGT
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 RKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNEKGELYGSEKLTQECVFREQFEENWY
. . : . ....: ... .:.:.::.. :::.:: .: :: :: .: :: :.:. ::.:
CCDS14 KDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQGVQTKLYLAMNSEGYLYTSELFTPECKFKESVFENYY
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 NTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKRHQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDIL
:::: .:.. ..:: .:..:::.: .:...:... .::::.:. :: .::.
CCDS14 VTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKEGEIMKGNHVKKNKPAAHFLPKPL---KVA-MYKEPS
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 SQS
CCDS14 LHDLTEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGGKSMSHNEST
160 170 180 190
>>CCDS55512.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX (199 aa)
initn: 411 init1: 376 opt: 391 Z-score: 501.1 bits: 99.6 E(32554): 1.4e-21
Smith-Waterman score: 391; 41.9% identity (75.7% similar) in 148 aa overlap (56-203:19-160)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 PVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDLDHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGT
.::::. . :: : :.::.. .:::.::
CCDS55 MSGKVTKPKEEKDASKEPQLKGIVTK--LYSRQGYHLQLQADGTIDGT
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 RKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNEKGELYGSEKLTQECVFREQFEENWY
. . : . ....: ... .:.:.::.. :::.:: .: :: :: .: :: :.:. ::.:
CCDS55 KDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQGVQTKLYLAMNSEGYLYTSELFTPECKFKESVFENYY
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 NTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKRHQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDIL
:::: .:.. ..:: .:..:::.: .:...:... .::::.:. :: .::.
CCDS55 VTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKEGEIMKGNHVKKNKPAAHFLPKPL---KVA-MYKEPS
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 SQS
CCDS55 LHDLTEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGGKSMSHNEST
170 180 190
208 residues in 1 query sequences
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