Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1703
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1703, 208 aa
  1>>>pF1KE1703 208 - 208 aa - 208 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1561+/-0.000691; mu= 14.1613+/- 0.042
 mean_var=62.4006+/-12.425, 0's: 0 Z-trim(109.2): 37  B-trim: 29 in 1/51
 Lambda= 0.162360
 statistics sampled from 10709 (10746) to 10709 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.33), width:  16
 Scan time:  2.170

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9298.1 FGF9 gene_id:2254|Hs108|chr13           ( 208) 1417 340.0 6.4e-94
CCDS5998.1 FGF20 gene_id:26281|Hs108|chr8          ( 211)  995 241.1 3.7e-64
CCDS75996.1 FGF16 gene_id:8823|Hs108|chrX          ( 207)  992 240.4 5.9e-64
CCDS3950.1 FGF10 gene_id:2255|Hs108|chr5           ( 208)  422 106.9 9.2e-24
CCDS9500.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13          ( 252)  419 106.3 1.8e-23
CCDS9501.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13          ( 247)  411 104.4 6.3e-23
CCDS12037.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19        ( 170)  409 103.8 6.4e-23
CCDS34021.1 FGF5 gene_id:2250|Hs108|chr4           ( 268)  402 102.3 2.9e-22
CCDS14664.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX          ( 192)  391 99.6 1.3e-21
CCDS55512.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX          ( 199)  391 99.6 1.4e-21
CCDS55511.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX          ( 226)  391 99.7 1.5e-21
CCDS14665.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX          ( 245)  391 99.7 1.6e-21
CCDS55513.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX          ( 255)  391 99.7 1.7e-21
CCDS46983.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3          ( 181)  385 98.2 3.3e-21
CCDS3301.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3           ( 243)  385 98.3 4.3e-21
CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15          ( 194)  383 97.8 4.9e-21
CCDS11105.1 FGF11 gene_id:2256|Hs108|chr17         ( 225)  380 97.1   9e-21
CCDS8527.1 FGF6 gene_id:2251|Hs108|chr12           ( 208)  350 90.1 1.1e-18
CCDS8194.1 FGF4 gene_id:2249|Hs108|chr11           ( 206)  346 89.1 2.1e-18
CCDS8195.1 FGF3 gene_id:2248|Hs108|chr11           ( 239)  332 85.9 2.3e-17
CCDS4275.1 FGF1 gene_id:2246|Hs108|chr5            ( 155)  329 85.1 2.6e-17
CCDS34059.1 FGF2 gene_id:2247|Hs108|chr4           ( 288)  272 71.9 4.6e-13
CCDS7517.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10           ( 233)  257 68.3 4.4e-12
CCDS7518.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10           ( 204)  255 67.8 5.4e-12
CCDS7515.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10           ( 215)  255 67.8 5.6e-12
CCDS7516.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10           ( 244)  255 67.8 6.3e-12
CCDS74241.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19        ( 165)  242 64.7 3.7e-11


>>CCDS9298.1 FGF9 gene_id:2254|Hs108|chr13                (208 aa)
 initn: 1417 init1: 1417 opt: 1417  Z-score: 1799.7  bits: 340.0 E(32554): 6.4e-94
Smith-Waterman score: 1417; 100.0% identity (100.0% similar) in 208 aa overlap (1-208:1-208)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAPLGEVGNYFGVQDAVPFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDLDHLKGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MAPLGEVGNYFGVQDAVPFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDLDHLKGI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 LRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 KGELYGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 KGELYGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKR
              130       140       150       160       170       180

              190       200        
pF1KE1 HQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 HQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS
              190       200        

>>CCDS5998.1 FGF20 gene_id:26281|Hs108|chr8               (211 aa)
 initn: 996 init1: 951 opt: 995  Z-score: 1265.4  bits: 241.1 E(32554): 3.7e-64
Smith-Waterman score: 995; 70.3% identity (89.5% similar) in 209 aa overlap (1-205:1-208)

               10          20          30        40        50      
pF1KE1 MAPLGEVGNYFGVQDAV--PFGNVPVLPV--DSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDLDH
       ::::.:::...:  ...    :.  .::   . : ::... . .: ..   ::....: :
CCDS59 MAPLAEVGGFLGGLEGLGQQVGSHFLLPPAGERPPLLGERRSAAERSARG-GPGAAQLAH
               10        20        30        40        50          

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE1 LKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYL
       :.::::::::::::::::.:.:.:..::::.::: ::::::::.::::::::::::::::
CCDS59 LHGILRRRQLYCRTGFHLQILPDGSVQGTRQDHSLFGILEFISVAVGLVSIRGVDSGLYL
      60        70        80        90       100       110         

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE1 GMNEKGELYGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGT
       :::.:::::::::::.::.::::::::::::::::.::: ::::::.::::::::::.:.
CCDS59 GMNDKGELYGSEKLTSECIFREQFEENWYNTYSSNIYKHGDTGRRYFVALNKDGTPRDGA
     120       130       140       150       160       170         

        180       190       200        
pF1KE1 RTKRHQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS
       :.::::::::::::::::..:::::::.:   
CCDS59 RSKRHQKFTHFLPRPVDPERVPELYKDLLMYT
     180       190       200       210 

>>CCDS75996.1 FGF16 gene_id:8823|Hs108|chrX               (207 aa)
 initn: 969 init1: 915 opt: 992  Z-score: 1261.7  bits: 240.4 E(32554): 5.9e-64
Smith-Waterman score: 992; 71.6% identity (87.5% similar) in 208 aa overlap (4-205:1-204)

               10              20        30        40        50    
pF1KE1 MAPLGEVGNYFGVQD------AVPFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDL
          ..:::. :.  :      .  .::::.  .::: .:...::: : : : :: . ::.
CCDS75    MAEVGGVFASLDWDLHGFSSSLGNVPL--ADSPGFLNERLGQIE-GKLQRG-SPTDF
                  10        20          30        40          50   

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE1 DHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGL
        ::::::::::::::::::::::::::..:::.::::::::::::.::::.:::::::::
CCDS75 AHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGL
            60        70        80        90       100       110   

          120       130       140       150       160       170    
pF1KE1 YLGMNEKGELYGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPRE
       ::::::.::::::.:::.::::::::::::::::.:.:::: :. :.:::::::::.:::
CCDS75 YLGMNERGELYGSKKLTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPRE
           120       130       140       150       160       170   

          180       190       200        
pF1KE1 GTRTKRHQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS
       : ::::::::::::::::::.:.: . .:..   
CCDS75 GYRTKRHQKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRDLFHYR
           180       190       200       

>>CCDS3950.1 FGF10 gene_id:2255|Hs108|chr5                (208 aa)
 initn: 419 init1: 311 opt: 422  Z-score: 540.1  bits: 106.9 E(32554): 9.2e-24
Smith-Waterman score: 422; 43.0% identity (79.6% similar) in 142 aa overlap (48-189:64-203)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KE1 PFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDLDHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIF
                                     :  : . .::.: .: :.:.  : . :.: 
CCDS39 PVTCQALGQDMVSPEATNSSSSSFSSPSSAGRHVRSYNHLQGDVRWRKLFSFTKYFLKIE
            40        50        60        70        80        90   

        80        90       100       110       120       130       
pF1KE1 PNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNEKGELYGSEKLTQECVFR
        :: ..::.:..  ..:::. :. .:.:......:. ::.::.::.::::......: ..
CCDS39 KNGKVSGTKKENCPYSILEITSVEIGVVAVKAINSNYYLAMNKKGKLYGSKEFNNDCKLK
           100       110       120       130       140       150   

       140       150       160       170       180       190       
pF1KE1 EQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKRHQKFTHFLPRPVDPDKV
       :..::: ::::.:  ..:  .::..:::::  :.::.: .:.:..  .::::        
CCDS39 ERIEENGYNTYASFNWQH--NGRQMYVALNGKGAPRRGQKTRRKNTSAHFLPMVVHS   
           160       170         180       190       200           

       200        
pF1KE1 PELYKDILSQS

>>CCDS9500.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13               (252 aa)
 initn: 430 init1: 392 opt: 419  Z-score: 535.0  bits: 106.3 E(32554): 1.8e-23
Smith-Waterman score: 419; 40.3% identity (73.0% similar) in 159 aa overlap (36-193:52-207)

          10        20        30        40         50        60    
pF1KE1 EVGNYFGVQDAVPFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAG-GLPRGPAVTDLDHLKGILRRR
                                     :. :   : .: ..   ::  .::::. : 
CCDS95 DLFFLRVSKLLDCFSPKSMWFLWNIFSKGTHMLQCLCGKSLKKNKNPTD-PQLKGIVTR-
              30        40        50        60        70           

           70        80        90       100       110       120    
pF1KE1 QLYCRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNEKGEL
        :::: :..:.. :.:...::. : .   ....: ... .:.:.:: .:::..:: .: :
CCDS95 -LYCRQGYYLQMHPDGALDGTKDDSTNSTLFNLIPVGLRVVAIQGVKTGLYIAMNGEGYL
       80        90       100       110       120       130        

          130       140       150       160       170       180    
pF1KE1 YGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKRHQKF
       : :: .: :: :.:.  ::.:  ::: ::.. ..:: ....:::.:   .:.:.:. .  
CCDS95 YPSELFTPECKFKESVFENYYVIYSSMLYRQQESGRAWFLGLNKEGQAMKGNRVKKTKPA
      140       150       160       170       180       190        

          190       200                                      
pF1KE1 THFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS                              
       .::::.:..                                             
CCDS95 AHFLPKPLEVAMYREPSLHDVGETVPKPGVTPSKSTSASAIMNGGKPVNKSKTT
      200       210       220       230       240       250  

>>CCDS9501.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13               (247 aa)
 initn: 431 init1: 392 opt: 411  Z-score: 525.0  bits: 104.4 E(32554): 6.3e-23
Smith-Waterman score: 411; 38.5% identity (72.0% similar) in 161 aa overlap (33-193:44-202)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KE1 PLGEVGNYFGVQDAVPFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDLDHLKGILR
                                     : : ... .  :: .     .  .::::. 
CCDS95 RQAREQHWDRPSASRRRSSPSKNRGLCNGNLVDIFSKVRIFGLKKRRLRRQDPQLKGIVT
            20        30        40        50        60        70   

             70        80        90       100       110       120  
pF1KE1 RRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNEKG
       :  :::: :..:.. :.:...::. : .   ....: ... .:.:.:: .:::..:: .:
CCDS95 R--LYCRQGYYLQMHPDGALDGTKDDSTNSTLFNLIPVGLRVVAIQGVKTGLYIAMNGEG
              80        90       100       110       120       130 

            130       140       150       160       170       180  
pF1KE1 ELYGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKRHQ
        :: :: .: :: :.:.  ::.:  ::: ::.. ..:: ....:::.:   .:.:.:. .
CCDS95 YLYPSELFTPECKFKESVFENYYVIYSSMLYRQQESGRAWFLGLNKEGQAMKGNRVKKTK
             140       150       160       170       180       190 

            190       200                                      
pF1KE1 KFTHFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS                              
         .::::.:..                                             
CCDS95 PAAHFLPKPLEVAMYREPSLHDVGETVPKPGVTPSKSTSASAIMNGGKPVNKSKTT
             200       210       220       230       240       

>>CCDS12037.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19             (170 aa)
 initn: 394 init1: 304 opt: 409  Z-score: 525.0  bits: 103.8 E(32554): 6.4e-23
Smith-Waterman score: 409; 44.1% identity (74.3% similar) in 152 aa overlap (41-189:19-166)

               20        30        40           50        60       
pF1KE1 FGVQDAVPFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAGGLP---RGPAVTDLDHLKGILRRRQLY
                                     .:.: :   :::   .  ::.: .: :.:.
CCDS12             MRRRLWLGLAWLLLARAPDAAGTPSASRGP--RSYPHLEGDVRWRRLF
                           10        20        30          40      

        70        80        90       100       110       120       
pF1KE1 CRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNEKGELYGS
         : : :.. :.: .::::  :.. .:::. :. ::.: :..:.::.:..::..:.::::
CCDS12 SSTHFFLRVDPGGRVQGTRWRHGQDSILEIRSVHVGVVVIKAVSSGFYVAMNRRGRLYGS
         50        60        70        80        90       100      

       130       140       150       160       170       180       
pF1KE1 EKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKRHQKFTHF
       .  : .: :::..::: .:::.:. ...   :. ...::.. : :: : ::.:..  .::
CCDS12 RLYTVDCRFRERIEENGHNTYASQRWRR--RGQPMFLALDRRGGPRPGGRTRRYHLSAHF
        110       120       130         140       150       160    

       190       200        
pF1KE1 LPRPVDPDKVPELYKDILSQS
       ::                   
CCDS12 LPVLVS               
          170               

>>CCDS34021.1 FGF5 gene_id:2250|Hs108|chr4                (268 aa)
 initn: 410 init1: 267 opt: 402  Z-score: 513.1  bits: 102.3 E(32554): 2.9e-22
Smith-Waterman score: 402; 37.7% identity (70.0% similar) in 207 aa overlap (1-200:26-227)

                                        10        20        30     
pF1KE1                          MAPLGEVGNYFGVQDAVPFGNVPVLPVDSPVLLSD
                                .:: :. :   .. :  : :.      .: .. :.
CCDS34 MSLSFLLLLFFSHLILSAWAHGEKRLAPKGQPGP--AATDRNPRGSSSR-QSSSSAMSSS
               10        20        30          40         50       

          40         50        60          70          80        90
pF1KE1 HLGQSEAGGL-PRGPAVTDLDHLKGILRRR--QLYCRTG--FHLEIFPNGTIQGTRKDHS
         ..: :..:  .: .. . .   .   ::  .::::.:  :::.:.:.: ..:.. . .
CCDS34 SASSSPAASLGSQGSGLEQSSFQWSPSGRRTGSLYCRVGIGFHLQIYPDGKVNGSH-EAN
        60        70        80        90       100       110       

              100       110       120       130       140       150
pF1KE1 RFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNEKGELYGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSS
        ...::..... :.:.:::: :. .:.:..::.:..: :.:..: :::.:.:: ::::.:
CCDS34 MLSVLEIFAVSQGIVGIRGVFSNKFLAMSKKGKLHASAKFTDDCKFRERFQENSYNTYAS
        120       130       140       150       160       170      

              160       170         180       190       200        
pF1KE1 NLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGT--RTKRHQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS
        ...   :::..:::::: :  ..:   :.: ..  ::::::  . .. :::        
CCDS34 AIHRTEKTGREWYVALNKRGKAKRGCSPRVKPQHISTHFLPRFKQSEQ-PELSFTVTVPE
        180       190       200       210       220        230     

CCDS34 KKKPPSPIKPKIPLSAPRKNTNSVKYRLKFRFG
         240       250       260        

>>CCDS14664.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX               (192 aa)
 initn: 411 init1: 376 opt: 391  Z-score: 501.4  bits: 99.6 E(32554): 1.3e-21
Smith-Waterman score: 391; 41.9% identity (75.7% similar) in 148 aa overlap (56-203:12-153)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KE1 PVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDLDHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGT
                                     .::::. .  :: : :.::..  .:::.::
CCDS14                    MALLRKSYSEPQLKGIVTK--LYSRQGYHLQLQADGTIDGT
                                  10          20        30         

          90       100       110       120       130       140     
pF1KE1 RKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNEKGELYGSEKLTQECVFREQFEENWY
       . . : . ....: ... .:.:.::.. :::.:: .: :: :: .: :: :.:.  ::.:
CCDS14 KDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQGVQTKLYLAMNSEGYLYTSELFTPECKFKESVFENYY
      40        50        60        70        80        90         

         150       160       170       180       190       200     
pF1KE1 NTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKRHQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDIL
        :::: .:.. ..:: .:..:::.:   .:...:...  .::::.:.   ::  .::.  
CCDS14 VTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKEGEIMKGNHVKKNKPAAHFLPKPL---KVA-MYKEPS
     100       110       120       130       140           150     

                                            
pF1KE1 SQS                                  
                                            
CCDS14 LHDLTEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGGKSMSHNEST
         160       170       180       190  

>>CCDS55512.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX               (199 aa)
 initn: 411 init1: 376 opt: 391  Z-score: 501.1  bits: 99.6 E(32554): 1.4e-21
Smith-Waterman score: 391; 41.9% identity (75.7% similar) in 148 aa overlap (56-203:19-160)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KE1 PVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDLDHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGT
                                     .::::. .  :: : :.::..  .:::.::
CCDS55             MSGKVTKPKEEKDASKEPQLKGIVTK--LYSRQGYHLQLQADGTIDGT
                           10        20          30        40      

          90       100       110       120       130       140     
pF1KE1 RKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGLYLGMNEKGELYGSEKLTQECVFREQFEENWY
       . . : . ....: ... .:.:.::.. :::.:: .: :: :: .: :: :.:.  ::.:
CCDS55 KDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQGVQTKLYLAMNSEGYLYTSELFTPECKFKESVFENYY
         50        60        70        80        90       100      

         150       160       170       180       190       200     
pF1KE1 NTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPREGTRTKRHQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDIL
        :::: .:.. ..:: .:..:::.:   .:...:...  .::::.:.   ::  .::.  
CCDS55 VTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKEGEIMKGNHVKKNKPAAHFLPKPL---KVA-MYKEPS
        110       120       130       140       150           160  

                                            
pF1KE1 SQS                                  
                                            
CCDS55 LHDLTEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGGKSMSHNEST
            170       180       190         




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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