Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0806
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0806, 363 aa
1>>>pF1KE0806 363 - 363 aa - 363 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6275+/-0.000998; mu= 14.5578+/- 0.059
mean_var=102.0135+/-27.002, 0's: 0 Z-trim(105.6): 264 B-trim: 1074 in 2/48
Lambda= 0.126983
statistics sampled from 8076 (8487) to 8076 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.621), E-opt: 0.2 (0.261), width: 16
Scan time: 2.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 ( 363) 2501 469.2 2.4e-132
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 2378 446.7 1.5e-125
CCDS9236.1 HCAR1 gene_id:27198|Hs108|chr12 ( 346) 1191 229.2 4.1e-60
CCDS1810.1 OXER1 gene_id:165140|Hs108|chr2 ( 423) 751 148.7 8.7e-36
CCDS5299.1 GPR31 gene_id:2853|Hs108|chr6 ( 319) 667 133.2 3.1e-31
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 538 109.6 4.5e-24
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 495 101.7 9.9e-22
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 490 100.8 2e-21
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 490 100.8 2e-21
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 459 95.1 9.4e-20
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 455 94.4 1.6e-19
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 453 94.0 2e-19
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 451 93.7 2.8e-19
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 448 93.1 4.1e-19
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 442 92.0 9.2e-19
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 438 91.2 1.3e-18
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 434 90.6 2.4e-18
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 426 89.1 6.8e-18
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 426 89.1 7.3e-18
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 423 88.5 9.5e-18
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 418 87.6 1.9e-17
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 418 87.7 2e-17
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 413 86.7 3.4e-17
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 411 86.3 4.4e-17
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 411 86.4 4.8e-17
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 409 86.0 6e-17
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 409 86.0 6e-17
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 409 86.0 6.1e-17
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 409 86.0 6.1e-17
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 409 86.0 6.2e-17
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 409 86.0 6.3e-17
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 409 86.0 6.6e-17
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 408 85.8 6.6e-17
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 409 86.1 7.1e-17
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 406 85.4 8.3e-17
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 404 85.0 1.1e-16
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 401 84.5 1.6e-16
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 400 84.3 1.7e-16
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 400 84.3 1.8e-16
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 399 84.1 2e-16
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 396 83.5 2.8e-16
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 393 83.0 4e-16
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 392 82.9 4.9e-16
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 389 82.3 7.1e-16
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 387 81.9 9e-16
CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3 ( 342) 384 81.4 1.3e-15
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 384 81.4 1.3e-15
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 383 81.2 1.6e-15
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 383 81.2 1.6e-15
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 381 80.9 2.1e-15
>>CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 (363 aa)
initn: 2501 init1: 2501 opt: 2501 Z-score: 2489.4 bits: 469.2 E(32554): 2.4e-132
Smith-Waterman score: 2501; 99.7% identity (100.0% similar) in 363 aa overlap (1-363:1-363)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIVKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIVKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFLMDNYVRRWDWKFGDIPCRLMLFMLAMNRQGSIIFLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFLMDNYVRRWDWKFGDIPCRLMLFMLAMNRQGSIIFLTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNRTAAIISCLLWGITIGLTVHLLKKKMPIQNGGANLCSSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNRTAAIISCLLWGITIGLTVHLLKKKMPIQNGGANLCSSF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SICHTFQWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDRHAKIKRAITFIMVVAIVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SICHTFQWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDRHAKIKRAITFIMVVAIVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 VICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FPNFFSTLINRCLQRKITGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEALMANSGEPWSPSYLGP
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 FPNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEALMANSGEPWSPSYLGP
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TSP
:::
CCDS92 TSP
>>CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 (387 aa)
initn: 2378 init1: 2378 opt: 2378 Z-score: 2367.3 bits: 446.7 E(32554): 1.5e-125
Smith-Waterman score: 2378; 95.6% identity (98.3% similar) in 362 aa overlap (1-362:1-362)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIVKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFLMDNYVRRWDWKFGDIPCRLMLFMLAMNRQGSIIFLTV
::::::::::::::::::::::.:: :::: :::::::::::.:::.:::::::::::::
CCDS53 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMFAMNRQGSIIFLTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNRTAAIISCLLWGITIGLTVHLLKKKMPIQNGGANLCSSF
::::::::::::::::::::: :::::::::::::.::::::::::. :::: ::.: ::
CCDS53 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNWTAAIISCLLWGITVGLTVHLLKKKLLIQNGTANVCISF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SICHTFQWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDRHAKIKRAITFIMVVAIVF
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SICHTFRWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDRHAKIKRAITFIMVVAIVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSPS
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VICFLPSVVVRIHIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FPNFFSTLINRCLQRKITGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEALMANSGEPWSPSYLGP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS53 FPNFFSTLINRCLQRKITGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEALIANSGEPWSPSYLGP
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TSP
::
CCDS53 TSNNHSKKGHCHQEPASLEKQLGCCIE
370 380
>>CCDS9236.1 HCAR1 gene_id:27198|Hs108|chr12 (346 aa)
initn: 1140 init1: 853 opt: 1191 Z-score: 1192.7 bits: 229.2 E(32554): 4.1e-60
Smith-Waterman score: 1191; 52.6% identity (76.6% similar) in 342 aa overlap (17-355:5-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIVKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
.:: .. : : .:.::.: . :..: ::::.:: ::::.:.::
CCDS92 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVAFVLGALGNGVALCGFCFHMKTWK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFLMDNYVRRWDWKFGDIPCRLMLFMLAMNRQGSIIFLTV
: ..:::::::::::.::::: : :.:: : :::::::. :: ::::: :::.::::
CCDS92 PSTVYLFNLAVADFLLMICLPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLFTLAMNRAGSIVFLTV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE0 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNRTAAIISCLLWGITIGLTVHLL-KKKMPIQNGGANLCSS
::.::::.:::::::.: ::.:.:: : : ::...: ::.:: .... .:. ... : :
CCDS92 VAADRYFKVVHPHHAVNTISTRVAAGIVCTLWALVILGTVYLLLENHLCVQETAVS-CES
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FSICHTFQWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQ-MDRHAKIKRAITFIMVVAI
: . . ::. :: ::::.::::::::: .:.::::.:: . :.:..:.: :::::::
CCDS92 FIMESANGWHDIMFQLEFFMPLGIILFCSFKIVWSLRRRQQLARQARMKKATRFIMVVAI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VFVICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVVYYFSS
::. :.:::: .:. ..: . .:. :. :: :. ::::::::::::::.::::::
CCDS92 VFITCYLPSVSARLYFLWTVPSSA---CDP--SVHGALHITLSFTYMNSMLDPLVYYFSS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PSFPNFFSTLINRCLQRKITGEPDNNRSTSVELTGDPNKTR-GAPEALMANSGEPWSPSY
::::.:.. : :. : :. ..: . ... .. .. ......: :.:
CCDS92 PSFPKFYNKLKICSLKPKQPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISVANSFQSQSDGQWDPHI
290 300 310 320 330 340
360
pF1KE0 LGPTSP
CCDS92 VEWH
>>CCDS1810.1 OXER1 gene_id:165140|Hs108|chr2 (423 aa)
initn: 743 init1: 451 opt: 751 Z-score: 755.9 bits: 148.7 E(32554): 8.7e-36
Smith-Waterman score: 751; 41.7% identity (69.5% similar) in 295 aa overlap (18-301:83-362)
10 20 30 40
pF1KE0 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIVKVLPPVLGLEFIFGLLGNGL
: .... : :.:.:::..::.::.:
CCDS18 SSSVLPPSFSPSPSSAPSAFTTVGGSSGGPCHPTSSSLVSAFLAPILALEFVLGLVGNSL
60 70 80 90 100 110
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 ALWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLAVADFLLIICLPFLMDNYVRRWDWKFGDIPCRLMLFML
::.:::.: . : :. .:: .:..:::::: ::. .: :. . :.:: :.. ::::
CCDS18 ALFIFCIHTRPWTSNTVFLVSLVAADFLLISNLPLRVDYYLLHETWRFGAAACKVNLFML
120 130 140 150 160 170
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 AMNRQGSIIFLTVVAVDRYFRVVHPHHALNKISNRTAAIISCLLW-GITIGLTVHLLKKK
. :: .:..:::..:..::..::.:::.:.. : .:: .. :: :: . :. :::
CCDS18 STNRTASVVFLTAIALNRYLKVVQPHHVLSRASVGAAARVAGGLWVGILL-LNGHLL---
180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 MPIQNGGANLCSSFSI----CHTFQWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDR
. .: . : :. . ...::.:..::::::::..::: . : ..:.: .
CCDS18 LSTFSGPS--CLSYRVGTKPSASLRWHQALYLLEFFLPLALILFAIVSIGLTIRNRGLGG
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270
pF1KE0 HAKIKRAITFIMVVAIVFVICFLPSVV---VRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLA---F
.: .::. . .:. :..::::::.. . . ::: . : ::.:: :
CCDS18 QAGPQRAMRVLAMVVAVYTICFLPSIIFGMASMVAFWL------SAC---RSLDLCTQLF
290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 FITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSPSFPNFFSTLINRCLQRKITGEPDNNRSTSVELTGDPN
.:.:::.::.::::.: ::::.:
CCDS18 HGSLAFTYLNSVLDPVLYCFSSPNFLHQSRALLGLTRGRQGPVSDESSYQPSRQWRYREA
340 350 360 370 380 390
>>CCDS5299.1 GPR31 gene_id:2853|Hs108|chr6 (319 aa)
initn: 624 init1: 385 opt: 667 Z-score: 674.3 bits: 133.2 E(32554): 3.1e-31
Smith-Waterman score: 667; 35.6% identity (67.0% similar) in 312 aa overlap (19-323:6-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIVKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
: . .. .. .:::: .:::::..::: : :... ::
CCDS52 MPFPNCSAPSTVVATAVGVLLGLECGLGLLGNAVALWTFLFRVRVWK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFLMDNYVRRWDWKFGDIPCRLMLFMLAMNRQGSIIFLTV
..:.:::.::.:: ::::: :. :..: . : . :.: ..:. .. ::..
CCDS52 PYAVYLLNLALADLLLAACLPFLAAFYLSLQAWHLGRVGCWALHFLLDLSRSVGMAFLAA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNRTAAIISCLLWGITIGLTVHLLKKKMPIQNGGANLCSSF
::.:::.:::::. .: .: ..: .: :.: . ..:: : . :: .. : ::
CCDS52 VALDRYLRVVHPRLKVNLLSPQAALGVSGLVWLLMVALTCPGLLISEAAQN--STRCHSF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE0 ----SICHTFQWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSL--RQRQMDRHAKIKRAITFIM
. .. :.::. :.: ::.:.:.::.: :: .: : :. ... :..:: ...
CCDS52 YSRADGSFSIIWQEALSCLQFVLPFGLIVFCNAGIIRALQKRLREPEKQPKLQRAQALVT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VVAIVFVICFLPSVVVRIRIFWLLHT-SGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVV
.:...:..:::: ..:. :.: .. .:.. .: . .: :.::..:.:.:::
CCDS52 LVVVLFALCFLPCFLARV----LMHIFQNLGSCRALCAVAHTSDVTGSLTYLHSVLNPVV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 YYFSSPSFPNFFSTLINRCLQRKITGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEALMANSGEPW
: ::::.: . . ... . ..:: .
CCDS52 YCFSSPTFRSSYRRVFHTLRGKGQAAEPPDFNPRDSYS
290 300 310
>>CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 (373 aa)
initn: 446 init1: 403 opt: 538 Z-score: 545.7 bits: 109.6 E(32554): 4.5e-24
Smith-Waterman score: 538; 29.3% identity (61.2% similar) in 304 aa overlap (18-315:42-345)
10 20 30 40
pF1KE0 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIVKVLPPVLGLEFIFGLLGNGL
: . . : :: : : ::.:.:::..
CCDS31 GTDAAFLAGPGSSWGNSTVASTAAVSSSFKCALTKTGFQFYYLPAVYILVFIIGFLGNSV
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 ALWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLAVADFLLIICLPFLMDNYVRRWDWKFGDIPCRLMLFML
:.:.: ::.: :.. ...::::.:::: .. :: :. : . :: ::: :.:. :..
CCDS31 AIWMFVFHMKPWSGISVYMFNLALADFLYVLTLPALIFYYFNKTDWIFGDAMCKLQRFIF
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 AMNRQGSIIFLTVVAVDRYFRVVHPHHALNKISNRTAAIISCLLWGITI-GLTVHLLKKK
.: :::.::: ... :: ::.: ..:.......: :: :.: :.. ... :. .
CCDS31 HVNLYGSILFLTCISAHRYSGVVYPLKSLGRLKKKNAICISVLVWLIVVVAISPILFYSG
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 MPIQNGGANLC----SSFSICHTFQWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDR
.... . : :. . : . . : .:: .:: : . :. .: ...:
CCDS31 TGVRKNKTITCYDTTSDEYLRSYFIYSMCTTVAMFCVPLVLILGCYGLIVRALIYKDLDN
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 HAKIKRAITFIMVVAIVFVICFLPSVVVR-IRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLS
...: ....: ::.. ..: :.. . . : . : : .. .: .
CCDS31 SPLRRKSIYLVIIVLTVFAVSYIPFHVMKTMNLRARLDFQTPAMCAFNDRVYATYQVTRG
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 FTYMNSMLDPVVYYFSSPSFPNFFSTLINRCLQRKITGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGA
.. .:: .::..:.... .: .: . .:
CCDS31 LASLNSCVDPILYFLAGDTFRRRLSRATRKASRRSEANLQSKSEDMTLNILPEFKQNGDT
320 330 340 350 360 370
350 360
pF1KE0 PEALMANSGEPWSPSYLGPTSP
CCDS31 SL
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Smith-Waterman score: 495; 28.8% identity (61.7% similar) in 326 aa overlap (10-329:23-333)
10 20 30 40
pF1KE0 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIVKVLPPVLGLEFIFGLLGNGL
: . ...:: . ..: . .: : . :..:.:::::
CCDS94 MERKFMSLQPSISVSEMEPNGTFSNNNSRNCTI--ENFKREFFPIVYLIIFFWGVLGNGL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 ALWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLAVADFLLIICLPFLMDNYVRRWDWKFGDIPCRLMLFML
....: :. : .:..:::..:.:.: ::: : :.: .: :::. ::.: . :
CCDS94 SIYVFLQPYKKSTSVNVFMLNLAISDLLFISTLPFRADYYLRGSNWIFGDLACRIMSYSL
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110 120 130 140 150 160
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.: .:: ::::..: :.. .::: . :. : :.: :. ..: . .. .. :: .
CCDS94 YVNMYSSIYFLTVLSVVRFLAMVHPFRLLHVTSIRSAWILCGIIWILIMASSIMLLDSGS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 PIQNGGANLC---SSFSICHTFQWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDRHA
:::... : . ..: . . ... .::. . .: :: : . .. . .
CCDS94 E-QNGSVTSCLELNLYKIAKLQTMNYIALVVGCLLPFFTLSICYLLIIRVLLKVEVPESG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 -KI--KRAITFIMVVAIVFVICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLS
.. ..:.: :... :.: .:::: ..: .: . . . :. :::.
CCDS94 LRVSHRKALTTIIITLIIFFLCFLPYHTLRT-----VHLTTWKVGLCKDRLHKALVITLA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 FTYMNSMLDPVVYYFSSPSFPNFFSTLINRCLQRKITGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGA
.. :. ..:..:::.. .: . ... . :: :.:.. .. :
CCDS94 LAAANACFNPLLYYFAGENFKDRLKSAL-----RK--GHPQKAKTKCVFPVSVWLRKETR
300 310 320 330 340
350 360
pF1KE0 PEALMANSGEPWSPSYLGPTSP
CCDS94 V
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Smith-Waterman score: 490; 32.8% identity (61.0% similar) in 290 aa overlap (36-321:68-349)
10 20 30 40 50 60
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:.::..:.:: ::::.: :: . .:
CCDS21 GLITNFSLATAEQCGQETPLENMLFASFYLLDFILALVGNTLALWLFIRDHKSGTPANVF
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
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:..:::::. .. :: . . : ::.: ::: :.. .: .:: ::: ...::
CCDS21 LMHLAVADLSCVLVLPTRLVYHFSGNHWPFGEIACRLTGFLFYLNMYASIYFLTCISADR
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YFRVVHPHHALNKISNRTAAIISC-LLWGITIGLTVHLLKKKMPIQNGGANLCSSFSICH
.. .::: ..: :. : ..: .:: .. . :: . . .:.. . .: ... .
CCDS21 FLAIVHPVKSL-KLRRPLYAHLACAFLWVVVAVAMAPLLVSPQTVQTNHTVVC--LQLYR
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TFQWHEAMFLLE--FFLPLGIILFCSARIIWSLRQR-QMDRHAKIKRAITFIMVVAIVFV
:.:. : : .:. . : :: :::: ..... : : :. .: .: .:.
CCDS21 EKASHHALVSLAVAFTFPFITTVTCYLLIIRSLRQGLRVEKRLKTK-AVRMIAIVLAIFL
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSPSF
.::.: : : .. : . : .: . : . :: :: .: .:. :::..:.: . .:
CCDS21 VCFVPYHVNR-SVYVLHYRSHGASCATQRILALANRITSCLTSLNGALDPIMYFFVAEKF
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 PNFFSTLINRCLQRKITGEPDNNRSTSVELTGDPNKTRGAPEALMANSGEPWSPSYLGPT
. . .:. : .: . : :
CCDS21 RHALCNLL--CGKR-LKGPPPSFEGKTNESSLSAKSEL
340 350 360
>>CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX (370 aa)
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Smith-Waterman score: 490; 29.5% identity (64.4% similar) in 298 aa overlap (17-305:29-322)
10 20 30 40
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: :. :.: .. : .. ::.::. :...
CCDS14 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSVS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 LWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLAVADFLLIICLPF-LMDNYVRRWDWKFGDIPCRLMLFML
:..:::..: . . ::. ::::.:.:.. ::: .. :. :.: ::: :.. .
CCDS14 LFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFNRHWP--FGDTLCKISGTAF
70 80 90 100 110
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: ::..::: ..:::.. .:.: .. . . :..::. .: ... :... :..
CCDS14 LTNIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFST
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 KMPIQNGGANLCSSFS--ICHTFQWHEAMFL--LEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMD
..:. .. .:: . .:. . ..:. . :..:: . . ::. .. .::.
CCDS14 TN-VNNATTTCFEGFSKRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRKPATL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE0 RH--AKIKRAITFIMVVAIVFVICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFIT
. .. :... .: : :::.::.: : . .. :..... :: . : . . . ::
CCDS14 SQIGTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSV-LFLYALVRSQAITNCFLERFAKIMYPIT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
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: .. .: .:: .:::. :: . :
CCDS14 LCLATLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEEVSDQ
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>>CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX (337 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIVKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIF--CFHLKS
: ... .: ::: .: . .. . :..:::..:... .: ::
CCDS14 MDETGNLTVSSATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGFVLYVLIKTYHKKS
10 20 30 40 50
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CCDS14 --AFQVYMINLAVADLLCVCTLPLRVVYYVHKGIWLFGDFLCRLSTYALYVNLYCSIFFM
60 70 80 90 100 110
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CCDS14 TAMSFFRCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSPFLMAK-PQKDEKNNTKC
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CCDS14 FEPPQDNQTKNHVLVLHYVSLFVGFIIPFVIIIVCYTMIILTLLKKSMKKNLSSHKKAIG
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CCDS14 MIMVVTAAFLVSFMPYHIQRTIHLHFLHNE-TKPCDSVLRMQKSVVITLSLAASNCCFDP
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CCDS14 LLYFFSGGNFRKRLSTFRKHSLS-SVTYVPRKKASLPEKGEEICKV
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]