FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3875, 352 aa 1>>>pF1KE3875 352 - 352 aa - 352 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4037+/-0.00103; mu= 15.9616+/- 0.062 mean_var=67.3414+/-13.510, 0's: 0 Z-trim(103.3): 21 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.156291 statistics sampled from 7428 (7436) to 7428 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16 Scan time: 1.090 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS9099.1 CHST11 gene_id:50515|Hs109|chr12 ( 352) 2372 544.0 7.1e-155 CCDS55878.1 CHST11 gene_id:50515|Hs109|chr12 ( 347) 2314 530.9 6.1e-151 CCDS3039.1 CHST13 gene_id:166012|Hs109|chr3 ( 341) 1092 255.4 5.3e-68 CCDS12433.1 CHST8 gene_id:64377|Hs109|chr19 ( 424) 737 175.4 7.9e-44 CCDS42422.1 CHST9 gene_id:83539|Hs109|chr18 ( 443) 723 172.2 7.3e-43 CCDS2047.1 CHST10 gene_id:9486|Hs109|chr2 ( 356) 573 138.4 9.2e-33 CCDS5333.1 CHST12 gene_id:55501|Hs109|chr7 ( 414) 524 127.4 2.2e-29 CCDS10059.1 CHST14 gene_id:113189|Hs109|chr15 ( 376) 482 117.9 1.5e-26 >>CCDS9099.1 CHST11 gene_id:50515|Hs109|chr12 (352 aa) initn: 2372 init1: 2372 opt: 2372 Z-score: 2894.2 bits: 544.0 E(33420): 7.1e-155 Smith-Waterman score: 2372; 100.0% identity (100.0% similar) in 352 aa overlap (1-352:1-352) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MKPALLEVMRMNRICRMVLATCLGSFILVIFYFQSMLHPVMRRNPFGVDICCRKGSRSPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 MKPALLEVMRMNRICRMVLATCLGSFILVIFYFQSMLHPVMRRNPFGVDICCRKGSRSPL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QELYNPIQLELSNTAVLHQMRRDQVTDTCRANSATSRKRRVLTPNDLKHLVVDEDHELIY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 QELYNPIQLELSNTAVLHQMRRDQVTDTCRANSATSRKRRVLTPNDLKHLVVDEDHELIY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 CYVPKVACTNWKRLMMVLTGRGKYSDPMEIPANEAHVSANLKTLNQYSIPEINHRLKSYM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 CYVPKVACTNWKRLMMVLTGRGKYSDPMEIPANEAHVSANLKTLNQYSIPEINHRLKSYM 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 KFLFVREPFERLVSAYRNKFTQKYNISFHKRYGTKIIKRQRKNATQEALRKGDDVKFEEF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 KFLFVREPFERLVSAYRNKFTQKYNISFHKRYGTKIIKRQRKNATQEALRKGDDVKFEEF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 VAYLIDPHTQREEPFNEHWQTVYSLCHPCHIHYDLVGKYETLEEDSNYVLQLAGVGSYLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 VAYLIDPHTQREEPFNEHWQTVYSLCHPCHIHYDLVGKYETLEEDSNYVLQLAGVGSYLK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 FPTYAKSTRTTDEMTTEFFQNISSEHQTQLYEVYKLDFLMFNYSVPSYLKLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 FPTYAKSTRTTDEMTTEFFQNISSEHQTQLYEVYKLDFLMFNYSVPSYLKLE 310 320 330 340 350 >>CCDS55878.1 CHST11 gene_id:50515|Hs109|chr12 (347 aa) initn: 2108 init1: 2108 opt: 2314 Z-score: 2823.6 bits: 530.9 E(33420): 6.1e-151 Smith-Waterman score: 2314; 98.3% identity (98.6% similar) in 352 aa overlap (1-352:1-347) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MKPALLEVMRMNRICRMVLATCLGSFILVIFYFQSMLHPVMRRNPFGVDICCRKGSRSPL :::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::::: CCDS55 MKPALLEVMRMNRICRMVLATCLGSFILVIFYFQ-----IMRRNPFGVDICCRKGSRSPL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QELYNPIQLELSNTAVLHQMRRDQVTDTCRANSATSRKRRVLTPNDLKHLVVDEDHELIY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 QELYNPIQLELSNTAVLHQMRRDQVTDTCRANSATSRKRRVLTPNDLKHLVVDEDHELIY 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 CYVPKVACTNWKRLMMVLTGRGKYSDPMEIPANEAHVSANLKTLNQYSIPEINHRLKSYM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 CYVPKVACTNWKRLMMVLTGRGKYSDPMEIPANEAHVSANLKTLNQYSIPEINHRLKSYM 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 KFLFVREPFERLVSAYRNKFTQKYNISFHKRYGTKIIKRQRKNATQEALRKGDDVKFEEF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 KFLFVREPFERLVSAYRNKFTQKYNISFHKRYGTKIIKRQRKNATQEALRKGDDVKFEEF 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 VAYLIDPHTQREEPFNEHWQTVYSLCHPCHIHYDLVGKYETLEEDSNYVLQLAGVGSYLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 VAYLIDPHTQREEPFNEHWQTVYSLCHPCHIHYDLVGKYETLEEDSNYVLQLAGVGSYLK 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 pF1KE3 FPTYAKSTRTTDEMTTEFFQNISSEHQTQLYEVYKLDFLMFNYSVPSYLKLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 FPTYAKSTRTTDEMTTEFFQNISSEHQTQLYEVYKLDFLMFNYSVPSYLKLE 300 310 320 330 340 >>CCDS3039.1 CHST13 gene_id:166012|Hs109|chr3 (341 aa) initn: 856 init1: 612 opt: 1092 Z-score: 1334.6 bits: 255.4 E(33420): 5.3e-68 Smith-Waterman score: 1092; 47.1% identity (78.0% similar) in 346 aa overlap (11-351:1-340) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MKPALLEVMRMNRIC---RMVLATCLGSFILVIFYFQSMLHPVMRRNPFGVDICCRKGSR :.: : :.. :.:::. .:.. :.:.. .: . . .: CCDS30 MGRRCCRRRVLAAACLGAALLLLCAAPRSLRPAFGNRALGSSWLGGE-KR 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 SPLQELYNPIQLELSNTAVLHQMRRDQVTDTCRANSATSRKRRVLTPNDLKHLVVDEDHE ::::.::. : :. : .:..::: ....: : ::..:.: :.::.:..::. : CCDS30 SPLQKLYDLDQDPRSTLAKVHRQRRDLLNSAC---SRHSRRQRLLQPEDLRHVLVDDAHG 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 LIYCYVPKVACTNWKRLMMVLTGRGKYSDPMEIPANEAHVSANLKTLNQYSIPEINHRLK :.::::::::::::::....:.:... .:: : :.:::. . : .: ..: :::.::. CCDS30 LLYCYVPKVACTNWKRVLLALSGQAR-GDPRAISAQEAHAPGRLPSLADFSPAEINRRLR 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 SYMKFLFVREPFERLVSAYRNKFTQKYNISFHKRYGTKIIKRQRKNATQEALRKGDDVKF .:. :::::::::::.::::::... :. .:..:::..:..: : : .: .: ::.: CCDS30 AYLAFLFVREPFERLASAYRNKLARPYSAAFQRRYGARIVQRLRPRALPDARARGHDVRF 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 EEFVAYLIDPHTQREEPFNEHWQTVYSLCHPCHIHYDLVGKYETLEEDSNYVLQLAGVGS ::.:::.::.:.:::::::::. ...:::::...::.:::.::: ::. .:: :::. : CCDS30 AEFLAYLLDPRTRREEPFNEHWERAHALCHPCRLRYDVVGKFETLAEDAAFVLGLAGA-S 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 YLKFP--TYAKSTRTTDEMTTEFFQNISSEHQTQLYEVYKLDFLMFNYSVPSYLKLE :.:: ... .. ......:..:: .: .:...::.:::.::::.::::.: CCDS30 DLSFPGPPRPRGAAASRDLAARLFRDISPFYQRRLFDLYKMDFLLFNYSAPSYLRLL 290 300 310 320 330 340 >>CCDS12433.1 CHST8 gene_id:64377|Hs109|chr19 (424 aa) initn: 682 init1: 181 opt: 737 Z-score: 900.5 bits: 175.4 E(33420): 7.9e-44 Smith-Waterman score: 737; 41.8% identity (70.3% similar) in 273 aa overlap (78-346:153-419) 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 VDICCRKGSRSPLQELYNPIQLELSNTAVLHQMRRDQVTDTCRANSATSRKRRVLTPNDL .: :. . ..: :.: .::..:: . CCDS12 ATIPANSSDAPFIRPGPGTLDGRWVSLHRSQQERKRVMQEACAKYRASS-SRRAVTPRHV 130 140 150 160 170 180 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 KHLVVDEDHELIYCYVPKVACTNWKRLMMVLTGRGKYSDPMEIPANEAHVSANLKTLNQY ... :.. :...:: :::..:.::::..:::.: . :. .: : .: .. :: :. . CCDS12 SRIFVEDRHRVLYCEVPKAGCSNWKRVLMVLAGLA--SSTADIQHNTVHYGSALKRLDTF 190 200 210 220 230 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 SIPEINHRLKSYMKFLFVREPFERLVSAYRNKFTQKYNISFHKRYGTKIIKRQRKNATQE . : :::..: :.:::::::::::::.:.:: .. : .: .: :. : : ::..: CCDS12 DRQGILHRLSTYTKMLFVREPFERLVSAFRDKF-EHPNSYYHPVFGKAILARYRANASRE 240 250 260 270 280 290 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 ALRKGDDVKFEEFVAYLIDPHTQREEPFNEHWQTVYSLCHPCHIHYDLVGKYETLEEDSN ::: :. :.: ::: ::.: : : .. ::. : :: :: : ::.:::.:..:.:.: CCDS12 ALRTGSGVRFPEFVQYLLDVH--RPVGMDIHWDHVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMEDDAN 300 310 320 330 340 350 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 YVLQLAGVGSYLKFPTY----AKSTRTTDEMTTEFFQNISSEHQTQLYEVYKLDFLMFNY . :.: . : :: . .. .::: ... ..: ..:. .. . :. : .:.::::: CCDS12 FFLSLIRAPRNLTFPRFKDRHSQEARTTARIAHQYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLMFNY 360 370 380 390 400 410 350 pF1KE3 SVPSYLKLE : : CCDS12 SKPFADLY 420 >>CCDS42422.1 CHST9 gene_id:83539|Hs109|chr18 (443 aa) initn: 627 init1: 217 opt: 723 Z-score: 883.2 bits: 172.2 E(33420): 7.3e-43 Smith-Waterman score: 723; 40.5% identity (73.7% similar) in 274 aa overlap (78-346:175-441) 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 VDICCRKGSRSPLQELYNPIQLELSNTAVLHQMRRDQVTDTCRANSATSRKRRVLTPNDL .. ::. . . :. ...:... : . . CCDS42 KFSNMNWPVDIHPLNKSLVKDNKWKKTEETQEKRRSFLQEFCKKYGGVSHHQSHLF-HTV 150 160 170 180 190 200 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 KHLVVDEDHELIYCYVPKVACTNWKRLMMVLTGRGKYSDPMEIPANEAHVSANLKTLNQY ... :.. :...:: :::..:.::::..:::.: . :. ..: : .: . .:: :... CCDS42 SRIYVEDKHKILYCEVPKAGCSNWKRILMVLNGLA--SSAYNISHNAVHYGKHLKKLDSF 210 220 230 240 250 260 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 SIPEINHRLKSYMKFLFVREPFERLVSAYRNKFTQKYNISFHKRYGTKIIKRQRKNATQE .. : ::..: : .:::.:.::::::.:.:: .. : .: .: :::. : :: .: CCDS42 DLKGIYTRLNTYTKAVFVRDPMERLVSAFRDKF-EHPNSYYHPVFGKAIIKKYRPNACEE 270 280 290 300 310 320 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 ALRKGDDVKFEEFVAYLIDPHTQREEPFNEHWQTVYSLCHPCHIHYDLVGKYETLEEDSN :: .:. :::.::. ::.: : : .. ::. : .::.:: :.::.:::.::::::.: CCDS42 ALINGSGVKFKEFIHYLLDSH--RPVGMDIHWEKVSKLCYPCLINYDFVGKFETLEEDAN 330 340 350 360 370 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 YVLQLAGVGSYLKFPTYAKSTRTTDEMTT-----EFFQNISSEHQTQLYEVYKLDFLMFN : ::. :. . ::::.. :. ...:: :. ....... .. .:. : ::.:::: CCDS42 YFLQMIGAPKELKFPNF-KDRHSSDERTNAQVVRQYLKDLTRTERQLIYDFYYLDYLMFN 380 390 400 410 420 430 350 pF1KE3 YSVPSYLKLE :..: CCDS42 YTTPFL 440 >>CCDS2047.1 CHST10 gene_id:9486|Hs109|chr2 (356 aa) initn: 516 init1: 268 opt: 573 Z-score: 701.8 bits: 138.4 E(33420): 9.2e-33 Smith-Waterman score: 573; 32.0% identity (66.7% similar) in 303 aa overlap (60-349:59-354) 30 40 50 60 70 80 pF1KE3 IFYFQSMLHPVMRRNPFGVDICCRKGSRSPLQELYNPIQLELSNTAVLHQM----RRDQV . : .: :: .. ... . : . . CCDS20 FKDPDVYSAKQEFLFLTTMPEVRKLPEEKHIPEELKPTGKELPDSQLVQPLVYMERLELI 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 TDTCRANSATSRKRRVLTPNDLKHLVVDEDHELIYCYVPKVACTNWKRLMMVLTGRGKYS ..:: .. . .. .. : .. : . :....: .:::. :.::....::.: .: CCDS20 RNVCRDDALKNLSHTPVSKFVLDRIFVCDKHKILFCQTPKVGNTQWKKVLIVLNG--AFS 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 DPMEIPAN--EAHVSANLKTLNQYSIPEINHRLKSYMKFLFVREPFERLVSAYRNKFTQ- . ::: : . : . .: :...: ::..:::.:.::..::.:::::.::...::.. CCDS20 SIEEIPENVVHDHEKNGLPRLSSFSDAEIQKRLKTYFKFFIVRDPFERLISAFKDKFVHN 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 -KYNISFHKRYGTKIIKRQRKNATQEALRKGDDVKFEEFVAYLIDP-HTQREEPFNEH-- ... .... . ::.. :.: :. .: ..::.:: :: :: : . :..: CCDS20 PRFEPWYRHEIAPGIIRKYRRNRTET---RG--IQFEDFVRYLGDPNHRWLDLQFGDHII 210 220 230 240 250 260 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 -WQTVYSLCHPCHIHYDLVGKYETLEEDSNYVLQLAGVGSYLKFPTYAKSTRTTDEMTTE : : :: ::.: :...:..::::.:. :.:. ::. ...:: . . .. .: CCDS20 HWVTYVELCAPCEIMYSVIGHHETLEDDAPYILKEAGIDHLVSYPTIPPGITVYNRTKVE 270 280 290 300 310 320 320 330 340 350 pF1KE3 -FFQNISSEHQTQLYEVYKLDFLMFNYSVPSYLKLE .: .::.. .:: .. :: .:.:. :..: CCDS20 HYFLGISKRDIRRLYARFEGDFKLFGYQKPDFLLN 330 340 350 >>CCDS5333.1 CHST12 gene_id:55501|Hs109|chr7 (414 aa) initn: 725 init1: 327 opt: 524 Z-score: 641.1 bits: 127.4 E(33420): 2.2e-29 Smith-Waterman score: 746; 43.0% identity (68.0% similar) in 291 aa overlap (81-349:124-411) 60 70 80 90 100 pF1KE3 CCRKGSRSPLQELYNPIQLELSNTAVLHQMRRDQVTDTCRANS--ATSRKRRVLT--PN- ::. . : ::: : :.:.. :: CCDS53 PGSMEESVRGYDWSPRDARRSPDQGRQQAERRSVLRGFC-ANSSLAFPTKERAFDDIPNS 100 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 DLKHLVVDEDHELIYCYVPKVACTNWKRLMMVLTG----RGK-YSDPMEIPANEAHVSAN .:.::.::. : :::::::::::::::.:.::.: :: : ::..:: ...: .. CCDS53 ELSHLIVDDRHGAIYCYVPKVACTNWKRVMIVLSGSLLHRGAPYRDPLRIPREHVHNASA 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 pF1KE3 LKTLNQY-------SIPEINHRLKSYMKFLFVREPFERLVSAYRNKFTQKYNISFHKRYG :.:.. : .. .::.: ::::::.:: ::.::.:.:: . : :..... CCDS53 HLTFNKFWRRYGKLSRHLMKVKLKKYTKFLFVRDPFVRLISAFRSKFELE-NEEFYRKFA 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 pF1KE3 TKIIKRQRKNAT-----QEALRKGDDVKFEEFVAYLIDPHTQREEPFNEHWQTVYSLCHP . ... .... .::.: : :.: .:. ::.::::.. ::::::. :: :::: CCDS53 VPMLRLYANHTSLPASAREAFRAGLKVSFANFIQYLLDPHTEKLAPFNEHWRQVYRLCHP 280 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 CHIHYDLVGKYETLEEDSNYVLQLAGVGSYLKFPTYAKSTRTTDEMTTEFFQNISSEHQT :.: ::.::: :::.::. .::: : :.:: .. ::.. ..: .: . CCDS53 CQIDYDFVGKLETLDEDAAQLLQLLQVDRQLRFPPSYRN-RTASSWEEDWFAKIPLAWRQ 340 350 360 370 380 390 330 340 350 pF1KE3 QLYEVYKLDFLMFNYSVPSYLKLE :::..:. ::..:.: : : CCDS53 QLYKLYEADFVLFGYPKPENLLRD 400 410 >>CCDS10059.1 CHST14 gene_id:113189|Hs109|chr15 (376 aa) initn: 462 init1: 202 opt: 482 Z-score: 590.6 bits: 117.9 E(33420): 1.5e-26 Smith-Waterman score: 630; 41.4% identity (66.8% similar) in 256 aa overlap (98-350:133-371) 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QLELSNTAVLHQMRRDQVTDTCRANSATSRKRRVLTPNDLKHLVVDEDHELIYCYVPKVA .::.: :.:..:.. ....:::::::: CCDS10 QVRQDVRNRTLRAVCGQPGMPRDPWDLPVGQRRTL----LRHILVSDRYRFLYCYVPKVA 110 120 130 140 150 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 CTNWKRLMMVLTGRGKYSDPMEIPANEAHVSANLKTLNQYSIPEINHRLKSYMKFLFVRE :.::::.: ::.: : ... . : : .: : . :: .::. :.::::::: CCDS10 CSNWKRVMKVLAG---VLDSVDVRLKMDHRS-DLVFLADLRPEEIRYRLQHYFKFLFVRE 160 170 180 190 200 210 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 PFERLVSAYRNKFTQKYNISFHKRYGTKIIKRQRKNATQEALRKGDDVKFEEFVAYLIDP :.:::.::::::: . . ...:::..:..: : .: :::: : ::. ::.: CCDS10 PLERLLSAYRNKFGEIRE--YQQRYGAEIVRRYRAGAGPSP--AGDDVTFPEFLRYLVDE 220 230 240 250 260 270 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 HTQREEPFNEHWQTVYSLCHPCHIHYDLVGKYETLEEDSNYVLQLAGVGSYLKFPTYAKS .: .::::. :: ::.:: .:::.::.:: :: :.: ::. . . ...::. CCDS10 DPER---MNEHWMPVYHLCQPCAVHYDFVGSYERLEADANQVLEWVRAPPHVRFPARQAW 280 290 300 310 320 310 320 330 340 350 pF1KE3 TRTTDEMTTEFFQNISSEHQTQLYEV---YKLDFLMFNYSVPSYLKLE : .. . .. .. : .. : .: : ::: .: : .:. : CCDS10 YRPASPESLHY--HLCSAPRALLQDVLPKYILDFSLFAYPLPNVTKEACQQ 330 340 350 360 370 352 residues in 1 query sequences 18921897 residues in 33420 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Wed Aug 4 20:35:08 2021 done: Wed Aug 4 20:35:08 2021 Total Scan time: 1.090 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]