FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5373, 299 aa 1>>>pF1KE5373 299 - 299 aa - 299 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0499+/-0.000547; mu= 17.0882+/- 0.033 mean_var=67.6592+/-14.886, 0's: 0 Z-trim(106.4): 85 B-trim: 555 in 1/48 Lambda= 0.155923 statistics sampled from 14414 (14479) to 14414 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.492), E-opt: 0.2 (0.17), width: 16 Scan time: 4.990 The best scores are: opt bits E(85289) NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 1912 439.6 3.5e-123 NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 1366 316.8 3.4e-86 NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 1351 313.4 3.5e-85 NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 1324 307.4 2.4e-83 NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 1310 304.2 2.1e-82 NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 1306 303.3 3.9e-82 NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 1305 303.1 4.4e-82 XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1305 303.1 4.4e-82 XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1305 303.1 4.4e-82 NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 1258 292.5 6.7e-79 NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 858 202.5 8.3e-52 NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 764 181.4 2e-45 NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 678 162.1 1.3e-39 NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 650 155.8 1e-37 NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 623 149.7 6.9e-36 NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 565 136.6 5.8e-32 NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 528 128.3 1.9e-29 NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 524 127.4 3.6e-29 NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 409 101.5 2.1e-21 NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 402 99.9 6.2e-21 NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 383 95.7 1.2e-19 NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 353 89.0 1.4e-17 NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 320 81.5 2.2e-15 NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 319 81.3 2.8e-15 NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 300 77.0 4.9e-14 NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 293 75.4 1.6e-13 NP_065110 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene rec ( 346) 149 43.1 0.00095 NP_001295394 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 149 43.1 0.00095 NP_001295399 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 149 43.1 0.00095 NP_001295405 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 149 43.1 0.00095 NP_001295396 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 149 43.1 0.00095 NP_001295398 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 149 43.1 0.00095 NP_001295397 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 149 43.1 0.00095 NP_001295400 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 149 43.1 0.00095 NP_001158194 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 134 39.7 0.0097 NP_001158195 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 134 39.7 0.0097 NP_001158193 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 134 39.7 0.0097 NP_000943 (OMIM: 173393) platelet-activating facto ( 342) 134 39.7 0.0097 >>NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 member (299 aa) initn: 1912 init1: 1912 opt: 1912 Z-score: 2332.5 bits: 439.6 E(85289): 3.5e-123 Smith-Waterman score: 1912; 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NP_795 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW 250 260 270 280 290 300 NP_795 VKGEKPSSS >>NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 1351 init1: 1351 opt: 1351 Z-score: 1650.3 bits: 313.4 E(85289): 3.5e-85 Smith-Waterman score: 1351; 69.8% identity (86.9% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW :: :: :. ::::: ::.::: :::::::.: : ::. .:::::.::..::.:::.:::: NP_795 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH :.:. ::.::.: . .:.: : :::::::::::.:::.::::: ::::.::: :: : NP_795 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT ::.. :::::::.:: : ::.:.:.. :::.: :::::::::::::.:::.:::. NP_795 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI :::::::::.:: ::::: :::::::::.::.:::::::::.::::::::::::.:.:: NP_795 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR ::::.: : ::.. . ...::.:::. .:.:::::::::: :.. :::::::::::.: NP_795 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW 250 260 270 280 290 300 NP_795 AKGQNQSTP >>NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 memb (319 aa) initn: 1324 init1: 1324 opt: 1324 Z-score: 1617.3 bits: 307.4 E(85289): 2.4e-83 Smith-Waterman score: 1324; 69.0% identity (88.4% similar) in 294 aa overlap (1-294:1-294) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW :. :: :: :::.: ::.:: ::::::::: :.::. .::: ..::::::.:::.:::: NP_001 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH :.:. :::: .: :.:..::::.: :.:::::::: :::.:::.: ::.:::::::: :. 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NP_795 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR ::: :. :.:.. . ..: :...:... . :::.: :::: :..:::::::::: :. NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW 250 260 270 280 290 300 NP_795 VKGEKPSSP >>NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 member (299 aa) initn: 1305 init1: 1305 opt: 1305 Z-score: 1594.6 bits: 303.1 E(85289): 4.4e-82 Smith-Waterman score: 1305; 66.0% identity (87.5% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW :. :: :: ::::: .::.:: ::::::::: .::. .::: :.::.:::.:::.:::: NP_795 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH :.:. ::.::.: :.:..:.: .: : ::::.::: : :.::::: ::::::::::: :. 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XP_003 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT ::.:.:::.::.:::::.:: :.: :..:.. :::::::::.::::::: :..::. ::: XP_003 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI ::::.:::..:: ::::.::::::::::.::.:::::::::::::.:::: ::..: :: XP_003 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR ::. .: :.:.... ..: :...::.... : : :::: :..:::::.::::::: XP_003 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY 250 260 270 280 290 >>XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste receptor (299 aa) initn: 1305 init1: 1305 opt: 1305 Z-score: 1594.6 bits: 303.1 E(85289): 4.4e-82 Smith-Waterman score: 1305; 66.0% identity (87.5% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW :. :: :: ::::: .::.:: ::::::::: .::. .::: :.::.:::.:::.:::: XP_006 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH :.:. ::.::.: :.:..:.: .: : ::::.::: : :.::::: ::::::::::: :. XP_006 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT ::.:.:::.::.:::::.:: :.: :..:.. :::::::::.::::::: :..::. ::: XP_006 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI ::::.:::..:: ::::.::::::::::.::.:::::::::::::.:::: ::..: :: XP_006 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR ::. .: :.:.... ..: :...::.... : : :::: :..:::::.::::::: XP_006 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY 250 260 270 280 290 >>NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 member (299 aa) initn: 1266 init1: 1246 opt: 1258 Z-score: 1537.4 bits: 292.5 E(85289): 6.7e-79 Smith-Waterman score: 1258; 65.3% identity (86.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW :. :: :. :::.. ::::: ::::::::: ::::. .:::::.::::::.:::::::: NP_795 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH ..:. :: ::.: :.:..:.::.. :::.:::::::::::.:::: ::::::::::. :: NP_795 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT ::.:..::.:::::: :.::.:.: : .::: .:..:::::.: :.::::..::: :::: NP_795 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI :: ..:::::::: ::.::::::::::::.::..:::: :::::::::::. :::.: :: NP_795 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR .:: .:.:.:. : .. :... ..:. .: .: ::::: ..:::.::: .: :. NP_795 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC 250 260 270 280 290 299 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 00:10:49 2016 done: Tue Nov 8 00:10:50 2016 Total Scan time: 4.990 Total Display time: -0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]