FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5373, 299 aa 1>>>pF1KE5373 299 - 299 aa - 299 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1519+/-0.00123; mu= 16.3718+/- 0.074 mean_var=66.7986+/-14.474, 0's: 0 Z-trim(100.6): 67 B-trim: 392 in 1/47 Lambda= 0.156924 statistics sampled from 6126 (6173) to 6126 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16 Scan time: 1.920 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 1912 442.2 2.2e-124 CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 1366 318.6 3.7e-87 CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 1351 315.2 3.9e-86 CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 1324 309.1 2.8e-84 CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 1310 305.9 2.5e-83 CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 1306 305.0 4.6e-83 CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 1258 294.1 8.4e-80 CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 858 203.6 1.5e-52 CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 764 182.3 4.1e-46 CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 678 162.8 3e-40 CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 650 156.5 2.4e-38 CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 623 150.4 1.6e-36 CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 565 137.2 1.4e-32 CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 528 128.9 4.9e-30 CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 524 128.0 9.2e-30 CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 409 101.9 6.1e-22 CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 402 100.3 1.8e-21 CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 383 96.0 3.7e-20 CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 367 92.4 4.9e-19 CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 353 89.3 4.2e-18 CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 320 81.8 7.1e-16 CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 319 81.6 9e-16 CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 300 77.2 1.6e-14 CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 293 75.7 5.1e-14 >>CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 (299 aa) initn: 1912 init1: 1912 opt: 1912 Z-score: 2346.4 bits: 442.2 E(32554): 2.2e-124 Smith-Waterman score: 1912; 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CCDS53 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR ::: :. :.:.. . ..: :...:... . :::.: :::: :..:::::::::: :. CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW 250 260 270 280 290 300 CCDS53 VKGEKPSSP >>CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 (299 aa) initn: 1266 init1: 1246 opt: 1258 Z-score: 1546.2 bits: 294.1 E(32554): 8.4e-80 Smith-Waterman score: 1258; 65.3% identity (86.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW :. :: :. :::.. ::::: ::::::::: ::::. .:::::.::::::.:::::::: CCDS86 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH ..:. :: ::.: :.:..:.::.. :::.:::::::::::.:::: ::::::::::. :: CCDS86 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT ::.:..::.:::::: :.::.:.: : .::: .:..:::::.: :.::::..::: :::: CCDS86 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI :: ..:::::::: ::.::::::::::::.::..:::: :::::::::::. :::.: :: CCDS86 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR .:: .:.:.:. : .. :... ..:. .: .: ::::: ..:::.::: .: :. 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CCDS86 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LHLKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRN--AIHLSS :.:: :...:.:.:::: ::::. :: :.: . : .:: :.::.... . .. .: CCDS86 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LTVTTLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLM . :. .: :::...: ::::: :: :::.::.:. :: .:: :::: .::. : :::. 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CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRII-DFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LHLKKRIKSVVLVILLGPLVFLIC-NLAV---ITMDERVWTK-EYEGNVTWKIKLRNAIH : .: :: :. :::: .:. . .: . .. : : .: . . :.::. .. .. : CCDS86 LWMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQH 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LSSLTVTTLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTS :. .::.:.:: . :. :.::: :: .:...:.: . : .::::..:..::..: : CCDS86 ASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVIS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FLMLFAIYFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSV ::.:: :.: .. .: . ...:.... ...:..::: ::::::.:. ::... :.: CCDS86 FLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKV 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LWQMTR .:.. CCDS86 IWKVMSILKGRKFQQHKQI 300 310 299 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 00:10:49 2016 done: Tue Nov 8 00:10:49 2016 Total Scan time: 1.920 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]