FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5357, 309 aa 1>>>pF1KE5357 309 - 309 aa - 309 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2636+/-0.00126; mu= 16.1233+/- 0.075 mean_var=69.9918+/-15.330, 0's: 0 Z-trim(101.0): 64 B-trim: 808 in 2/46 Lambda= 0.153303 statistics sampled from 6273 (6328) to 6273 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.529), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16 Scan time: 1.990 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 2021 456.5 1.2e-128 CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 1421 323.8 1.1e-88 CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 1385 315.8 2.6e-86 CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 1354 309.0 3.1e-84 CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 1351 308.3 4.7e-84 CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 1311 299.5 2.2e-81 CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 1264 289.0 2.9e-78 CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 882 204.6 8e-53 CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 750 175.4 5.1e-44 CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 690 162.1 5.1e-40 CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 678 159.5 3.1e-39 CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 618 146.2 3.1e-35 CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 602 142.6 3.6e-34 CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 581 138.0 9.1e-33 CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 573 136.2 3.1e-32 CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 462 111.7 7.3e-25 CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 432 105.0 7.4e-23 CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 418 101.9 6.2e-22 CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 398 97.5 1.4e-20 CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 377 92.9 3.7e-19 CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 374 92.2 5.3e-19 CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 341 84.9 8.7e-17 CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 338 84.3 1.4e-16 CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 329 82.2 5.1e-16 >>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 2021 init1: 2021 opt: 2021 Z-score: 2423.1 bits: 456.5 E(32554): 1.2e-128 Smith-Waterman score: 2021; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 AKGQNQSTP ::::::::: CCDS86 AKGQNQSTP >>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 1449 init1: 1410 opt: 1421 Z-score: 1705.9 bits: 323.8 E(32554): 1.1e-88 Smith-Waterman score: 1421; 69.5% identity (87.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW :..:: :.::::.::.:..::::::::::.: : : :::::: ::::..::::::::::: CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH :..:.::.: :::. ....: : :.::: :::: ::::::::::::::.::: ::: : CCDS53 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA :::..:::::::.:: :.:::::: . . .::.: :::.:::::::.::.::: ::. 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CCDS53 VKGEKPSSS >>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 1400 init1: 1374 opt: 1385 Z-score: 1662.9 bits: 315.8 E(32554): 2.6e-86 Smith-Waterman score: 1385; 67.0% identity (86.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW :..:: :.:: ::::.:..::::::::::.: : : :::::: ::::..::::::::::: CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH :.::.::::::::. ....: : ::: :::: ::::.:::::::::.::: .:: : CCDS53 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA :::..:::.::..:: :.::.::: . . : :.: :::.::::::..::..::.::. CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI :.:::.::::::.::.::: ::::::::::::::::::::::.:::::::: :::.: :: CCDS53 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW ::: ..:: :.: .. :.:.:.:. . :::.: :::::::: ::::::::.::. : CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 AKGQNQSTP .::.. :.: CCDS53 VKGEKTSSP >>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 (319 aa) initn: 1363 init1: 1343 opt: 1354 Z-score: 1625.7 bits: 309.0 E(32554): 3.1e-84 Smith-Waterman score: 1354; 69.2% identity (85.6% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW :..:: :.::::.:: :..::::::::::.: : :::::::: .:::..::::::::::: CCDS53 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH :.:::::.: :::. ...: : :.:::::::: :::::::.::::.:.::: ::: . CCDS53 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA .::..:::::::.:: :.:::::: . . .:::.: :::::::::::.::. ::.:.. CCDS53 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI ::::..:.::::::::::: ::::::::::::::::::::::.::::::::::::.: :: CCDS53 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW ::: .::: :: :. :.:.:::. . ::: : :::: ::: ::: ::::: .: : CCDS53 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 AKGQNQSTP .: .. CCDS53 VKDRSLRLHRFTRGALCVF 310 >>CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 (299 aa) initn: 1351 init1: 1351 opt: 1351 Z-score: 1622.5 bits: 308.3 E(32554): 4.7e-84 Smith-Waterman score: 1351; 69.8% identity (86.9% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW :: :: :. ::::: ::.::: :::::::.: : ::. .:::::.::..::.:::.:::: CCDS86 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH :.:. ::.::.: . .:.: : :::::::::::.:::.::::: ::::.::: :: : CCDS86 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA ::.. :::::::.:: : ::.:.:.. :::.: :::::::::::::.:::.:::. 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CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI :.::.::::::. ::::: ::::::::::::::::::::::.:::::::: ::.: :. CCDS53 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW ::: ..:: :.: .. :.:.:.:. . :::.: :::::::: ::::::::: :: : CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 AKGQNQSTP .::.. :.: CCDS53 VKGEKPSSP >>CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 (299 aa) initn: 1283 init1: 1235 opt: 1264 Z-score: 1518.5 bits: 289.0 E(32554): 2.9e-78 Smith-Waterman score: 1264; 64.2% identity (86.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW :..::.: ::::..: :.:::::::::::.::: ::::.::::::::..::::::.:::: CCDS86 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH ..::.:: :::::. .... : :::.::::::.:::..:::::::::.::: :.: : CCDS86 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA :::...::.:::.::.:.::::::.. . ..:.:: :::.: :.::::..::: :::. 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