FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5383, 307 aa 1>>>pF1KE5383 307 - 307 aa - 307 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5573+/-0.00124; mu= 13.8099+/- 0.073 mean_var=66.6596+/-14.874, 0's: 0 Z-trim(99.8): 73 B-trim: 349 in 1/46 Lambda= 0.157088 statistics sampled from 5816 (5883) to 5816 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.503), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16 Scan time: 1.710 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 1981 458.4 3e-129 CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 794 189.4 3e-48 CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 752 179.9 2.2e-45 CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 705 169.3 3.5e-42 CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 656 158.2 7.8e-39 CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 645 155.7 4.3e-38 CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 641 154.8 8.2e-38 CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 631 152.5 3.8e-37 CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 618 149.5 3e-36 CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 610 147.7 1e-35 CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 601 145.7 4.3e-35 CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 588 142.7 3.4e-34 CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 578 140.5 1.6e-33 CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 567 138.0 8.7e-33 CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 524 128.2 7.5e-30 CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 485 119.4 3.4e-27 CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 470 116.0 3.6e-26 CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 444 110.1 2.3e-24 CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 432 107.4 1.6e-23 CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 387 97.2 1.7e-20 CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 384 96.5 2.7e-20 CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 333 85.0 8.5e-17 CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 293 75.9 4.2e-14 >>CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 (307 aa) initn: 1981 init1: 1981 opt: 1981 Z-score: 2433.8 bits: 458.4 E(32554): 3e-129 Smith-Waterman score: 1981; 99.7% identity (99.7% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIWI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIWI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 IITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFLW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 IITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFLW 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILNDYKMKNDTVWDLNMYKSEYFIKQILLNL ::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::: CCDS86 LKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILNDYKTKNDTVWDLNMYKSEYFIKQILLNL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 GVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISFIILFILYF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 GVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISFIILFILYF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 IGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVLQQLKCCEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 IGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVLQQLKCCEK 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 RKNLRVT ::::::: CCDS86 RKNLRVT >>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa) initn: 738 init1: 362 opt: 794 Z-score: 979.7 bits: 189.4 E(32554): 3e-48 Smith-Waterman score: 794; 41.1% identity (75.9% similar) in 299 aa overlap (5-295:5-303) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCID-CAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIW :. ..:..:.: :.:::.:::::::.: : :...: .:::.:::::: :. 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CCDS86 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI 250 260 270 280 290 300 300 pF1KE5 QQLKCCEKRKNLRVT .. CCDS86 WKVMSILKGRKFQQHKQI 310 >>CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 (312 aa) initn: 758 init1: 368 opt: 752 Z-score: 928.4 bits: 179.9 E(32554): 2.2e-45 Smith-Waterman score: 752; 41.2% identity (74.6% similar) in 311 aa overlap (1-302:1-307) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNK-LSTIGFILTGLAISRIFLIW : ..:.:.:.....: ..:. ::::: :::::: : . .: : .:: .:::::: :. CCDS86 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL .: :::.... :. :... :. .. :...:.::.::.. :::::.:::::.:. .:. CCDS86 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILND------YKMKNDT--VWDLNMYKSEY ::: . : : :...:: : :... :. :: .:.... .: ... : CCDS86 WLKLKINKV---MLAILLGSFLISLI-ISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 FIKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLIS .::. :::::. : : ::. ..:..:: ::..:.. ..::.:: .::::..:.:..: CCDS86 TFKQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVII 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FIILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRV :..:.:.:. . . : . ..::.::.: .:.:.: .::::::.:::::..: :.. CCDS86 FLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKM 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 LQQLKCCEKRKNLRVT :. .:: .:. CCDS86 LRFVKCFLRRRKPFVP 300 310 >>CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 637 init1: 328 opt: 705 Z-score: 870.9 bits: 169.3 E(32554): 3.5e-42 Smith-Waterman score: 705; 38.4% identity (72.3% similar) in 307 aa overlap (1-297:1-307) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCID-CAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIW :. ...:::.....: ..:.::::.:.::: :: :.:.::. .:::.:.:.:: :: CCDS86 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL .....:.. ...:..:.... : ::...: .::..: :..:::::::. :. .:: CCDS86 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILN-DY------KMKNDTVWDLNMYKSEYF ::: . .::. .... . ::: : .:. :: : : . . ... : :: CCDS86 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF :.:: .: : .:::. ..:. :::::..:.. .:: :: .::.::.:.:.. :: CCDS86 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL :..:.::.:. . . . . :: . :: .. .:: :::.:::. :.::.:. .:.: CCDS86 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML 250 260 270 280 290 300 300 pF1KE5 --QQLKCCEKRKNLRVT ... : CCDS86 TCRKIACMI >>CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 (317 aa) initn: 577 init1: 293 opt: 656 Z-score: 810.7 bits: 158.2 E(32554): 7.8e-39 Smith-Waterman score: 656; 39.5% identity (72.0% similar) in 304 aa overlap (4-296:4-299) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKN-KLSTIGFILTGLAISRIFLIW :...:: ::.. : ..: :::.::.:::::: .:. :.:.. :::.:::::: :.: CCDS86 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL .:. . ...: : ..:. ....... .:.. :. :.:.::.:. ::::::::::: ::: CCDS86 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKI-------LNDYKMKNDTVWDLNMYKSEYF .:: :.. :. .:.::..:.. : :: : .: :. .. : . . : CCDS86 YLKWRVKKVV---LVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTR--F 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 IKQILLNLGVIFF--FTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLI . :.:. :..: ::::: ..::.:.:.: ..:: .: :..:.:: ...: .: CCDS86 SSLIVLTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 SFIILFILYFIGMAIEI-SCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASL .:..:. .. ... : . . ..:: :...... :: :: .:::::.::.:::: CCDS86 TFFLLYAIFSLSFFISVWTSERLEEN--LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASL 240 250 260 270 280 290 290 300 pF1KE5 RVLQQLKCCEKRKNLRVT :: :. CCDS86 SVLLWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS 300 310 >>CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 (314 aa) initn: 622 init1: 309 opt: 645 Z-score: 797.3 bits: 155.7 E(32554): 4.3e-38 Smith-Waterman score: 645; 39.2% identity (68.5% similar) in 311 aa overlap (1-303:1-310) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKN-KLSTIGFILTGLAISRIFLIW : .. ::......: ....::: ::::::: . :: :. . :::: :::: : . CCDS31 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL .:. :.:. .. ..:.. : . . ..: . :. . :.:: ::::::.:::.: . .:: CCDS31 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKSRTN-MVLPFMIV--FLLI-SSLLNFAYIAKILNDYKMKNDTVWDLNMYKSEY---F ::. : : :.. ..:. :::: .::. .: :: .: :.. :. :. : CCDS31 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLY-LDESKTLYDKLS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF : . ::.: .. :.: : . .::..:: ::.:... . : :::.:::: .:::...:: CCDS31 ILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL ..:::..:... . : . :. . : : . .: ::::::::::::.:...:.: CCDS31 LFLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLQQTAVRLL 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 QQLKCCEKRKNLRVT .:. : : CCDS31 WHLRNYTKTPNPLPL 300 310 >>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa) initn: 634 init1: 316 opt: 641 Z-score: 792.4 bits: 154.8 E(32554): 8.2e-38 Smith-Waterman score: 641; 39.4% identity (70.0% similar) in 307 aa overlap (1-297:1-301) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNK-LSTIGFILTGLAISRIFLIW :. ..::.:... .. ..:.: : :: ::: . :.: .: ::.: ::. ::.:. CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL ::.::.:. :::: . :: ... :. :.. :. :.:.:: :...: ::::.::. :: CCDS58 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILNDYKMKN---------DTVWDLNMYKSE ::: :.. :. .: :: . ::. . :...:..:. . ... . .:: CCDS58 WLKWRVSRVMVWM---LLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 YFIKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLI :.. ..: .: . . .:: . .::.:: ::.::: .: :. :: .:::: .:..... CCDS58 YYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIIL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 SFIILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLR ::..::.:::... : . ..:. :.: . : .:: ::::::::::::::: .. CCDS58 SFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQ-TFV 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 VLQQLKCCEKRKNLRVT :. :.: CCDS58 VM--LRCESGHLKPGSKGPIFS 300 310 >>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa) initn: 629 init1: 260 opt: 631 Z-score: 780.4 bits: 152.5 E(32554): 3.8e-37 Smith-Waterman score: 631; 36.7% identity (71.4% similar) in 297 aa overlap (1-291:1-295) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCID-CAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIW : .. .:: .:...: ..: :.:::: :.:::: .: .::.. .: :::::: ::: CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL :... :. . :..::. .. . . :...:. ..:.:: .::::.::::.::. :: CCDS86 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILNDY--KMKNDTVWDLNMYKSEYFIKQIL .:: :.: :. .... :. .::. : ..:. ... .:.:...: : : .. 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