Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6172
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6172, 604 aa
1>>>pF1KB6172 604 - 604 aa - 604 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7668+/-0.000952; mu= 17.5399+/- 0.057
mean_var=93.5738+/-19.552, 0's: 0 Z-trim(107.0): 86 B-trim: 985 in 2/50
Lambda= 0.132586
statistics sampled from 9330 (9421) to 9330 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 1.670
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS8315.1 BIRC3 gene_id:330|Hs109|chr11 ( 604) 4083 791.7 0
CCDS8316.1 BIRC2 gene_id:329|Hs109|chr11 ( 618) 3045 593.2 3.4e-169
CCDS58169.1 BIRC2 gene_id:329|Hs109|chr11 ( 569) 2951 575.2 8.3e-164
CCDS13512.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs109|chr20 ( 280) 389 84.9 1.6e-16
CCDS13513.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs109|chr20 ( 298) 389 84.9 1.7e-16
CCDS14606.1 XIAP gene_id:331|Hs109|chrX ( 497) 344 76.5 9.7e-14
CCDS12863.1 BIRC8 gene_id:112401|Hs109|chr19 ( 236) 320 71.6 1.3e-12
CCDS4009.1 NAIP gene_id:4671|Hs109|chr5 (1403) 321 72.4 4.5e-12
>>CCDS8315.1 BIRC3 gene_id:330|Hs109|chr11 (604 aa)
initn: 4083 init1: 4083 opt: 4083 Z-score: 4224.4 bits: 791.7 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 4083; 100.0% identity (100.0% similar) in 604 aa overlap (1-604:1-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQTWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQTWP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 CWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 CWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 IIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 VIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 DLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVR
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 TFLS
::::
CCDS83 TFLS
>>CCDS8316.1 BIRC2 gene_id:329|Hs109|chr11 (618 aa)
initn: 2444 init1: 1945 opt: 3045 Z-score: 3151.3 bits: 593.2 E(33420): 3.4e-169
Smith-Waterman score: 3045; 72.8% identity (89.2% similar) in 604 aa overlap (2-604:20-618)
10 20 30 40
pF1KB6 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAG
.:.:.: .::. .: : ..:::.::::::::::::::::
CCDS83 MHKTASQRLFPGPSYQNIKSIMEDSTILSDWTNS-NKQKMKYDFSCELYRMSTYSTFPAG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 VPVSERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::: .:::.::::: :.:.: :.
CCDS83 VPVSERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 NNLEATSQPTFPSSVTNS-THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSS
. : .::. : : . :: .::: : :.:. : ::::. ::.:::: .:.:. .
CCDS83 S-LGSTSKNTSP--MRNSFAHSLSPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 YHCAMNNENARLLTFQTWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNA
: ::..:.::.::.. ::::::::..::.::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS83 YSYAMSTEEARFLTYHMWPLTFLSPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 MSEHLRHFPKCPFIENQLQDTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGF
:::: ::::.:::.::.:. : :...:::::::::::..::. ::::: :.:::::::::
CCDS83 MSEHRRHFPNCPFLENSLE-TLRFSISNLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGF
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 YYVGNSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHL
:::: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::. ..:. ::::
CCDS83 YYVGRNDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYPHL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 LEQLLSTSDSPGDENAESSIIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQR
:::::::::. :.:::. :::: :::. ::::.::::::...:.::::.:.:::::::
CCDS83 LEQLLSTSDTTGEENADPPIIHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 KILATGENYRLVNDLVLDLLNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCV
:::.:::::. :::.: ::::::: ::::.:. .:: :.:: :::::::::::.::::
CCDS83 KILTTGENYKTVNDIVSALLNAEDEKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 IPILDSLLTAGIINEQEHDVIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVL
.::::.:: :..::.::::.:::::: ::::::::::::::: ::..:.: :.: ...:
CCDS83 LPILDNLLKANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTL
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 YEHLFVQQDIKYIPTEDVSDLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDC
:..:::....::::::::: : .::::::::::::::::::::::.:::::::::::..:
CCDS83 YKNLFVDKNMKYIPTEDVSGLSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQEC
540 550 560 570 580 590
590 600
pF1KB6 APSLRKCPICRSTIKGTVRTFLS
:::::::::::. ::::::::::
CCDS83 APSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS
600 610
>>CCDS58169.1 BIRC2 gene_id:329|Hs109|chr11 (569 aa)
initn: 2373 init1: 1945 opt: 2951 Z-score: 3054.6 bits: 575.2 E(33420): 8.3e-164
Smith-Waterman score: 2951; 74.0% identity (89.7% similar) in 573 aa overlap (33-604:1-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 IVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGVND
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGVND
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS-T
::::::::::::::: :::: .:::.::::: :.:.: :.. : .::. : : . :: .
CCDS58 KVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSAS-LGSTSKNTSP--MRNSFA
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 HSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQTWPL
::: : :.:. : ::::. ::.:::: .:.:. . : ::..:.::.::.. :::
CCDS58 HSLSPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNPYSYAMSTEEARFLTYHMWPL
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQD
:::::..::.::::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::.:::.::.:.
CCDS58 TFLSPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEHRRHFPNCPFLENSLE-
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 TSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLRC
: :...:::::::::::..::. ::::: :.::::::::::::: .::::::::::::::
CCDS58 TLRFSISNLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGFYYVGRNDDVKCFCCDGGLRC
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 WESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESSI
:::::::::.:::::::::.:::.:::::. ..:. :::::::::::::. :.:::. :
CCDS58 WESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYPHLLEQLLSTSDTTGEENADPPI
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 IHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDLL
::: :::. ::::.::::::...:.::::.:.::::::: :::.:::::. :::.: ::
CCDS58 IHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQSKILTTGENYKTVNDIVSALL
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHDV
::::: ::::.:. .:: :.:: :::::::::::.::::.::::.:: :..::.::::.
CCDS58 NAEDEKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILDNLLKANVINKQEHDI
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 IKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVSD
:::::: ::::::::::::::: ::..:.: :.: ...::..:::....:::::::::
CCDS58 IKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTLYKNLFVDKNMKYIPTEDVSG
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 LPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVRT
: .::::::::::::::::::::::.:::::::::::..::::::::::::. :::::::
CCDS58 LSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQECAPSLRKCPICRGIIKGTVRT
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 FLS
:::
CCDS58 FLS
>>CCDS13512.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs109|chr20 (280 aa)
initn: 617 init1: 380 opt: 389 Z-score: 410.3 bits: 84.9 E(33420): 1.6e-16
Smith-Waterman score: 436; 29.4% identity (45.2% similar) in 394 aa overlap (215-604:48-280)
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQDTSR
:. :. . .:: :. :.. .. .
CCDS13 HWAAGDGPTQERCGPRSLGSPVLGLDTCRAWDHVDGQILGQLR-----PLTEEEEEEGAG
20 30 40 50 60 70
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 YTVSNL----SMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLR
:.: .: .. :. .:..:: .. : :: ::.:::...:..: :.:: : :::.
CCDS13 ATLSRGPAFPGMGSEELRLASFYDWPLTAEVPPELLAAAGFFHTGHQDKVRCFFCYGGLQ
80 90 100 110 120 130
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 CWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESS
:. :::::..:::::: :..:.: ::..:...:: .. :::.. : : .:
CCDS13 SWKRGDDPWTEHAKWFPSCQFLLRSKGRDFVHSVQETHS----QLLGSWD-PWEE-----
140 150 160 170 180
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 IIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDL
: ::: .:: .. :.
CCDS13 -----P-----EDA----APVAPSVPASGYP-----------------------------
190
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHD
:. .:: .:
CCDS13 -----ELPTPRREVQSE-------------------------------------------
200 210
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 VIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVS
: :: : .:
CCDS13 --------------------------------SAQEPGA---------RD----------
220
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 DLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVR
:: ::::::::::::::.:. :::::.:::::: : .:::.:. :::::. ... ::
CCDS13 ---VEAQLRRLQEERTCKVCLDRAVSIVFVPCGHLV-CAECAPGLQLCPICRAPVRSRVR
230 240 250 260 270
pF1KB6 TFLS
::::
CCDS13 TFLS
280
>>CCDS13513.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs109|chr20 (298 aa)
initn: 617 init1: 380 opt: 389 Z-score: 409.9 bits: 84.9 E(33420): 1.7e-16
Smith-Waterman score: 472; 31.0% identity (47.5% similar) in 394 aa overlap (215-604:48-298)
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQDTSR
:. :. . .:: :. :.. .. .
CCDS13 HWAAGDGPTQERCGPRSLGSPVLGLDTCRAWDHVDGQILGQLR-----PLTEEEEEEGAG
20 30 40 50 60 70
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 YTVSNL----SMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLR
:.: .: .. :. .:..:: .. : :: ::.:::...:..: :.:: : :::.
CCDS13 ATLSRGPAFPGMGSEELRLASFYDWPLTAEVPPELLAAAGFFHTGHQDKVRCFFCYGGLQ
80 90 100 110 120 130
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 CWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESS
:. :::::..:::::: :..:.: ::..:...:: .. :::.. : : .:
CCDS13 SWKRGDDPWTEHAKWFPSCQFLLRSKGRDFVHSVQETHS----QLLGSWD-PWEE-----
140 150 160 170 180
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 IIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDL
: ::: .:: .. :. . : : .
CCDS13 -----P-----EDA----APVAPSVPASGYPE-----------LPTPR------------
190 200
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHD
:: . : : : : : .. :
CCDS13 -------REVQSESAQE-------------------------P--------GGVSPAEA-
210 220
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 VIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVS
:.: :: : .
CCDS13 ----------------------------------QRAWWVL---------------EPPG
230
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 DLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVR
:: ::::::::::::::.:. :::::.:::::: : .:::.:. :::::. ... ::
CCDS13 ARDVEAQLRRLQEERTCKVCLDRAVSIVFVPCGHLV-CAECAPGLQLCPICRAPVRSRVR
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 TFLS
::::
CCDS13 TFLS
>>CCDS14606.1 XIAP gene_id:331|Hs109|chrX (497 aa)
initn: 1195 init1: 302 opt: 344 Z-score: 360.3 bits: 76.5 E(33420): 9.7e-14
Smith-Waterman score: 1075; 34.7% identity (55.9% similar) in 594 aa overlap (29-604:26-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGV
:. :..:...::.: ::: .:::::: :::
CCDS14 MTFNSFEGSKTCVPADINKEEEFVEEFNRLKTFANFPSGSPVSASTLARAGFLYTGE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS
.: :.:: : .: :. ::: . .:.:. :.:::.... :: .. . :.. :.
CCDS14 GDTVRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFY----LENSATQSTNSGIQNG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB6 THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQ--DFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQT
... . .: . . :..: :.: . . :: .:.::: .::.
CCDS14 QYKVENYLGSRDHFALDRPSETHADYLLRTGQVVDISDTIYPR-NPAMYSEEARLKSFQN
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