FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9555, 1180 aa 1>>>pF1KE9555 1180 - 1180 aa - 1180 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9681+/-0.00123; mu= 7.6233+/- 0.073 mean_var=247.1487+/-51.288, 0's: 0 Z-trim(109.8): 35 B-trim: 368 in 1/52 Lambda= 0.081582 statistics sampled from 11094 (11121) to 11094 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.342), width: 16 Scan time: 5.510 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8283.1 GRM5 gene_id:2915|Hs108|chr11 (1180) 7901 944.4 0 CCDS44694.1 GRM5 gene_id:2915|Hs108|chr11 (1212) 5912 710.3 7.2e-204 CCDS5209.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 (1194) 4721 570.1 1.1e-161 CCDS64548.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 ( 908) 4306 521.1 4.6e-147 CCDS47497.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 ( 906) 4304 520.9 5.4e-147 CCDS5600.1 GRM3 gene_id:2913|Hs108|chr7 ( 879) 2352 291.1 7.7e-78 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CCDS52 HAVLAGPGGPGNGLRS-LYPPPPPPQHLQMLPLQLSTFGEELVSP-PADDDDDSERFKLL 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE9 AQAAGDAARESPAAGPEAAAAKPDLE---ELV-----ALTPPSPFRDSVDSGSTTPNSPV . . . ::. . : . ::. .:. :::::::::::: :::..:.::: CCDS52 QEYVYEHEREGNTEEDELEEEEEDLQAASKLTPDDSPALTPPSPFRDSVASGSSVPSSPV 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1160 1170 1180 pF1KE9 SESALCIPSSPKYDTLIIRDYTQSSSSL :::.:: : . .: ..:.::: ::::.: CCDS52 SESVLCTPPNVSYASVILRDYKQSSSTL 1170 1180 1190 >>CCDS64548.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 (908 aa) initn: 4289 init1: 3730 opt: 4306 Z-score: 2753.7 bits: 521.1 E(32554): 4.6e-147 Smith-Waterman score: 4306; 72.4% identity (89.0% similar) in 871 aa overlap (20-887:30-893) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MVLLLILSVLLLKEDVRGSAQSSERRVVAHMPGDIIIGALFSVHHQPTVD : .: .: ::.: ::.:::::::::::: .. CCDS64 MVGLLLFFFPAIFLEVSLLPRSPGRKVLLAGASSQRSVARMDGDVIIGALFSVHHQPPAE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 KVHERKCGAVREQYGIQRVEAMLHTLERINSDPTLLPNITLGCEIRDSCWHSAVALEQSI :: ::::: .::::::::::::.:::..::.::.:::::::: :::::::::.::::::: CCDS64 KVPERKCGEIREQYGIQRVEAMFHTLDKINADPVLLPNITLGSEIRDSCWHSSVALEQSI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE9 EFIRDSLIS-SEEEEGLVRCV-DGSS-SSFRSKKPIVGVIGPGSSSVAIQVQNLLQLFNI ::::::::: .:..:. ::. ::.: :.::::.:::::::::::::::::::::.: CCDS64 EFIRDSLISIRDEKDGINRCLPDGQSLPPGRTKKPIAGVIGPGSSSVAIQVQNLLQLFDI 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 PQIAYSATSMDLSDKTLFKYFMRVVPSDAQQARAMVDIVKRYNWTYVSAVHTEGNYGESG :::::::::.:::::::.:::.::::::. :::::.:::::::::::::::::::::::: CCDS64 PQIAYSATSIDLSDKTLYKYFLRVVPSDTLQARAMLDIVKRYNWTYVSAVHTEGNYGESG 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 MEAFKDMSAKEGICIAHSYKIYSNAGEQSFDKLLKKLTSHLPKARVVACFCEGMTVRGLL :.:::...:.::.::::: ::::::::.:::.::.:: .:::::::.:::::::::::: CCDS64 MDAFKELAAQEGLCIAHSDKIYSNAGEKSFDRLLRKLRERLPKARVVVCFCEGMTVRGLL 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 MAMRRLGLAGEFLLLGSDGWADRYDVTDGYQREAVGGITIKLQSPDVKWFDDYYLKLRPE ::::::..::: :.:::::::: .: .::. :: ::::::::::.:. ::::.:::: . 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CCDS47 MVGLLLFFFPAIFLEVSLLPRSPGRKVLLAGASSQRSVARMDGDVIIGALFSVHHQPPAE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 KVHERKCGAVREQYGIQRVEAMLHTLERINSDPTLLPNITLGCEIRDSCWHSAVALEQSI :: ::::: .::::::::::::.:::..::.::.:::::::: :::::::::.::::::: CCDS47 KVPERKCGEIREQYGIQRVEAMFHTLDKINADPVLLPNITLGSEIRDSCWHSSVALEQSI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE9 EFIRDSLIS-SEEEEGLVRCV-DGSS-SSFRSKKPIVGVIGPGSSSVAIQVQNLLQLFNI ::::::::: .:..:. ::. ::.: :.::::.:::::::::::::::::::::.: CCDS47 EFIRDSLISIRDEKDGINRCLPDGQSLPPGRTKKPIAGVIGPGSSSVAIQVQNLLQLFDI 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 PQIAYSATSMDLSDKTLFKYFMRVVPSDAQQARAMVDIVKRYNWTYVSAVHTEGNYGESG :::::::::.:::::::.:::.::::::. :::::.:::::::::::::::::::::::: CCDS47 PQIAYSATSIDLSDKTLYKYFLRVVPSDTLQARAMLDIVKRYNWTYVSAVHTEGNYGESG 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 MEAFKDMSAKEGICIAHSYKIYSNAGEQSFDKLLKKLTSHLPKARVVACFCEGMTVRGLL :.:::...:.::.::::: ::::::::.:::.::.:: .:::::::.:::::::::::: CCDS47 MDAFKELAAQEGLCIAHSDKIYSNAGEKSFDRLLRKLRERLPKARVVVCFCEGMTVRGLL 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 MAMRRLGLAGEFLLLGSDGWADRYDVTDGYQREAVGGITIKLQSPDVKWFDDYYLKLRPE ::::::..::: :.:::::::: .: .::. :: ::::::::::.:. ::::.:::: . 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CCDS47 RLLVGLSSAMCYSALVTKTNRIARILAGSKKKICTRKPRFMSAWAQVIIASILISVQLTL 670 680 690 700 710 720 710 720 730 740 750 760 pF1KE9 IVALFIMEPPDIMHDYPSIREVYLICNTTNLGVVTPLGYNGLLILSCTFYAFKTRNVPAN .:.:.::::: . .::::.::::::::.:::::.:::::::::.:::.::::::::::: CCDS47 VVTLIIMEPPMPILSYPSIKEVYLICNTSNLGVVAPLGYNGLLIMSCTYYAFKTRNVPAN 730 740 750 760 770 780 770 780 790 800 810 820 pF1KE9 FNEAKYIAFTMYTTCIIWLAFVPIYFGSNYKIITMCFSVSLSATVALGCMFVPKVYIILA :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::.::::::::.::.:::.: CCDS47 FNEAKYIAFTMYTTCIIWLAFVPIYFGSNYKIITTCFAVSLSVTVALGCMFTPKMYIIIA 790 800 810 820 830 840 830 840 850 860 870 880 pF1KE9 KPERNVRSAFTTSTVVRMHVGDGKSSSAASRSSSLVNLWKRRGSSGETLSSNGKSVTWAQ ::::::::::::: :::::::::: ::....:...:. CCDS47 KPERNVRSAFTTSDVVRMHVGDGK---LPCRSNTFLNIFRRKKAGAGNAKKRQPEFSPTS 850 860 870 880 890 890 900 910 920 930 940 pF1KE9 NEKSSRGQHLWQRLSIHINKKENPNQTAVIKPFPKSTESRGLGAGAGAGGSAGGVGATGG CCDS47 QCPSAHVQL 900 >>CCDS5600.1 GRM3 gene_id:2913|Hs108|chr7 (879 aa) initn: 1838 init1: 809 opt: 2352 Z-score: 1510.9 bits: 291.1 E(32554): 7.7e-78 Smith-Waterman score: 2352; 44.1% identity (73.1% similar) in 854 aa overlap (25-860:30-860) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MVLLLILSVLLLKEDVRGSAQSSERRVVAHMPGDIIIGALFSVHHQPTVDKVHER :: . .. ::...:.:: .... : . CCDS56 MKMLTRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREI-KIEGDLVLGGLFPINEKGT----GTE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 KCGAVREQYGIQRVEAMLHTLERINSDPTLLPNITLGCEIRDSCWHSAVALEQSIEFIRD .:: . :. ::::.:::: ....::.: :::.. :: .: :.: ... :::::.::.: CCDS56 ECGRINEDRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEFVRA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 SLISSEEEEGLVRCVDGSSSSFRSKKP--IVGVIGPGSSSVAIQVQNLLQLFNIPQIAYS :: . .: : . : ::: . .. . : :.:::: . :::.::: :::.::.::::.:. CCDS56 SLTKVDEAEYM--CPDGSYA-IQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYA 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 ATSMDLSDKTLFKYFMRVVPSDAQQARAMVDIVKRYNWTYVSAVHTEGNYGESGMEAFKD .:: ::::. . :: :.:: : ::.::..:.. .::::::.: .::.:::.:.:::.. CCDS56 STSAKLSDKSRYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 MSAKEGICIAHSYKIYSNAGEQSFDKLLKKLTSHLPKARVVACFCEGMTVRGLLMAMRRL . ..:::: . :. . ..:.:.....: .. :.::::. : .. : :. : : CCDS56 EARLRNICIATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQK-PNARVVVLFMRSDDSRELIAAASRA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 GLAGEFLLLGSDGWADRYDVTDGYQREAVGGITIKLQSPDVKWFDDYYLKLRPETNHRNP . . : ..::::. . .. : .. : :.::..: : :. :: :. .: : .::::: CCDS56 NAS--FTWVASDGWGAQESIIKGSEHVAYGAITLELASQPVRQFDRYFQSLNPYNNHRNP 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 WFQEFWQHRFQCRLEGFPQENSKYNKTCNSSLTL-KTHHVQDSKMGFVINAIYSMAYGLH ::..::...::: : :.. .. ..:.. :.. .... :.::. ::.::.:.::..:: CCDS56 WFRDFWEQKFQCSL----QNKRNHRRVCDKHLAIDSSNYEQESKIMFVVNAVYAMAHALH 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KE9 NMQMSLCPGYAGLCDAMKPIDGRKLLES-LMKTNFTGV-----SGDTIL-FDENGDSPGR .:: .:::. . :::::: .::.:: .. :.: :::. ..:.:. :: ::. :: CCDS56 KMQRTLCPNTTKLCDAMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPNKDADSIVKFDTFGDGMGR 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE9 YEIMNFKEMGKDYFDYINVGSWDNGELKMDDDEV-WSKKSNIIRSVCSEPCEKGQIKVIR :...::...: : .:..:: : . :..: . . ::..: . : ::.:: ...: .. CCDS56 YNVFNFQNVGGKY-SYLKVGHWAE-TLSLDVNSIHWSRNS-VPTSQCSDPCAPNEMKNMQ 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KE9 KGEVSCCWTCTPCKENEYVFDEYTCKACQLGSWPTDDLTGCDLIPVQYLRWGDPEPIAAV :.: ::: : ::. ::. ::.:: : :.::: ::::: .: .:.:: : :. : CCDS56 PGDV-CCWICIPCEPYEYLADEFTCMDCGSGQWPTADLTGCYDLPEDYIRWEDAWAIGPV 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KE9 VFACLGLLATLFVTVVFIIYRDTPVVKSSSRELCYIILAGICLGYLCTFCLIAKPKQIYC ..::::.. : .:..::: . .::.::.:.::::::.: :. :.: :: .::::. . : CCDS56 TIACLGFMCTCMVVTVFIKHNNTPLVKASGRELCYILLFGVGLSYCMTFFFIAKPSPVIC 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE9 YLQRIGIGLSPAMSYSALVTKTNRIARILAGSKKKICTKKPRFMSACAQLVIAFILICIQ :.:.:.: : :. ::::.:::: ::::. : :. ...:.:.: .:. : . :: .: CCDS56 ALRRLGLGSSFAICYSALLTKTNCIARIFDGVKNG--AQRPKFISPSSQVFICLGLILVQ 650 660 670 680 690 710 720 730 740 750 760 pF1KE9 LGIIVALFIMEPPDIM-HDYPSIRE-VYLICNTTNLGVVTPLGYNGLLILSCTFYAFKTR . .. . .:.: : . :: : : ::. . ... : :. .:.. :: :::::: CCDS56 IVMVSVWLILEAPGTRRYTLAEKRETVILKCNVKDSSMLISLTYDVILVILCTVYAFKTR 700 710 720 730 740 750 770 780 790 800 810 pF1KE9 NVPANFNEAKYIAFTMYTTCIIWLAFVPIYF--GSNYKI--ITMCFSVSLSATVALGCMF . : ::::::.:.:::::::::::::.::.. .:.:.. :::.:::::. :.:::.: CCDS56 KCPENFNEAKFIGFTMYTTCIIWLAFLPIFYVTSSDYRVQTTTMCISVSLSGFVVLGCLF 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 pF1KE9 VPKVYIILAKPERNVRSAFTTSTVVRMHV-GDGKSSSAASRSSSLVNLWKRRGSSGETLS .:::.::: .:..:: . . :. : : : . : .: :. CCDS56 APKVHIILFQPQKNVVTHRLH--LNRFSVSGTGTTYSQSSASTYVPTVCNGREVLDSTTS 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 pF1KE9 SNGKSVTWAQNEKSSRGQHLWQRLSIHINKKENPNQTAVIKPFPKSTESRGLGAGAGAGG CCDS56 SL >>CCDS2834.1 GRM2 gene_id:2912|Hs108|chr3 (872 aa) initn: 2165 init1: 814 opt: 2283 Z-score: 1467.1 bits: 283.0 E(32554): 2.1e-75 Smith-Waterman score: 2344; 43.9% identity (70.6% similar) in 900 aa overlap (3-883:4-864) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MVLLLILSVLLLKEDVRGSAQSSERRVVAHMPGDIIIGALFSVHHQ--PTVDKVHERKC :: .:..::: : :.. ..:.. . ::...:.:: ::.. :. : : CCDS28 MGSLLALLALLLLWGAV---AEGPAKKVLT-LEGDLVLGGLFPVHQKGGPAED------C 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 GAVREQYGIQRVEAMLHTLERINSDPTLLPNITLGCEIRDSCWHSAVALEQSIEFIRDSL : : :. ::::.:::: .:.::: :: :::.. :: .: ::: ... ::::...:.: :: CCDS28 GPVNEHRGIQRLEAMLFALDRINRDPHLLPGVRLGAHILDSCSKDTHALEQALDFVRASL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 ISSEEEEGLVR-CVDGSSSSF-RSKKPIVGVIGPGSSSVAIQVQNLLQLFNIPQIAYSAT :. .: . : ::: .. . :.:::: . :.:.::: :::.::.::::.:..: CCDS28 --SRGADGSRHICPDGSYATHGDAPTAITGVIGGSYSDVSIQVANLLRLFQIPQISYAST 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 SMDLSDKTLFKYFMRVVPSDAQQARAMVDIVKRYNWTYVSAVHTEGNYGESGMEAFKDMS : ::::. . :: :.:: : ::.::..:.. .::::::.: .::.:::.:.:::. . CCDS28 SAKLSDKSRYDYFARTVPPDFFQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFELEA 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 AKEGICIAHSYKIYSNAGEQSFDKLLKKLTSHLPKARVVACFCEGMTVRGLLMAMRRLGL ..::.: : :. .. .:. ... : .. :.:::.. : .. .: :: : .::. CCDS28 RARNICVATSEKVGRAMSRAAFEGVVRALLQK-PSARVAVLFTRSEDARELLAASQRLN- 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 AGEFLLLGSDGWADRYDVTDGYQREAVGGITIKLQSPDVKWFDDYYLKLRPETNHRNPWF . : ..::::. .:. : . : :.:::.: : .. : .:. .: : .: ::::: CCDS28 -ASFTWVASDGWGALESVVAGSEGAAEGAITIELASYPISDFASYFQSLDPWNNSRNPWF 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 QEFWQHRFQCRLEGFPQENSKYNKTCNSSLTLKTHHVQDSKMGFVINAIYSMAYGLHNMQ .:::..::.: .: :.. : . . :.::. ::.::.:.::..::::. CCDS28 REFWEQRFRC---SFRQRD------CAAHSLRAVPFEQESKIMFVVNAVYAMAHALHNMH 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 pF1KE9 MSLCPGYAGLCDAMKPIDGRKLLESL-MKTNFTGV--SGDT---ILFDENGDSPGRYEIM .:::. . :::::.:..::.: ... ....: . .:: . ::. ::. :::.:. CCDS28 RALCPNTTRLCDAMRPVNGRRLYKDFVLNVKFDAPFRPADTHNEVRFDRFGDGIGRYNIF 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KE9 NFKEMGKDYFDYINVGSWDNGELKMDDDEV-WSKKSN--IIRSVCSEPCEKGQIKVIRKG .. . :. . : .:: : .: : .: . . :.. : . : ::::: ....: .. : CCDS28 TYLRAGSGRYRYQKVGYWAEG-LTLDTSLIPWASPSAGPLPASRCSEPCLQNEVKSVQPG 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 pF1KE9 EVSCCWTCTPCKENEYVFDEYTCKACQLGSWPTDDLTGCDLIPVQYLRWGDPEPIAAVVF :: ::: : ::. :: .::.:: : :: ::. .:::: .: .:.:::: .. :.. CCDS28 EV-CCWLCIPCQPYEYRLDEFTCADCGLGYWPNASLTGCFELPQEYIRWGDAWAVGPVTI 520 530 540 550 560 570 590 600 610 620 630 640 pF1KE9 ACLGLLATLFVTVVFIIYRDTPVVKSSSRELCYIILAGICLGYLCTFCLIAKPKQIYCYL :::: :::::: ::. . :::::.:.::::::.:.:. : : :: .::::. : : CCDS28 ACLGALATLFVLGVFVRHNATPVVKASGRELCYILLGGVFLCYCMTFIFIAKPSTAVCTL 580 590 600 610 620 630 650 660 670 680 690 700 pF1KE9 QRIGIGLSPAMSYSALVTKTNRIARILAGSKKKICTKKPRFMSACAQLVIAFILICIQLG .:.:.: . .. ::::.:::::::::..:... ...:::.: .:..: . :: :: CCDS28 RRLGLGTAFSVCYSALLTKTNRIARIFGGAREG--AQRPRFISPASQVAICLALISGQLL 640 650 660 670 680 690 710 720 730 740 750 760 pF1KE9 IIVALFIMEPPDIMHDY-PSIREVYLI-CNTTNLGVVTPLGYNGLLILSCTFYAFKTRNV :.:: ...: : .. : ::: . :: . ... :.:: ::: ::.::::::. CCDS28 IVVAWLVVEAPGTGKETAPERREVVTLRCNHRDASMLGSLAYNVLLIALCTLYAFKTRKC 700 710 720 730 740 750 770 780 790 800 810 820 pF1KE9 PANFNEAKYIAFTMYTTCIIWLAFVPIYF--GSNYKI--ITMCFSVSLSATVALGCMFVP : ::::::.:.:::::::::::::.::.. .:.:.. ::: :::::..:.:::.:.: CCDS28 PENFNEAKFIGFTMYTTCIIWLAFLPIFYVTSSDYRVQTTTMCVSVSLSGSVVLGCLFAP 760 770 780 790 800 810 830 840 850 860 870 880 pF1KE9 KVYIILAKPERNVRSAFTTSTVVRMHVGDGKSSSAASRSSSLVNLWKRRGSSGETLSSNG :..::: .:..:: : . .. . .:::.:.:: .: . ::. :: CCDS28 KLHIILFQPQKNVVSHRAPTS---------RFGSAAARASS--SLGQGSGSQFVPTVCNG 820 830 840 850 860 890 900 910 920 930 940 pF1KE9 KSVTWAQNEKSSRGQHLWQRLSIHINKKENPNQTAVIKPFPKSTESRGLGAGAGAGGSAG . : CCDS28 REVVDSTTSSL 870 >>CCDS47696.1 GRM8 gene_id:2918|Hs108|chr7 (908 aa) initn: 1546 init1: 942 opt: 2155 Z-score: 1385.5 bits: 268.0 E(32554): 7.5e-71 Smith-Waterman score: 2252; 43.6% identity (70.7% similar) in 840 aa overlap (21-834:29-850) 10 20 30 40 pF1KE9 MVLLLILSVLLLKEDVRGSAQSSERRVVAH---MPGDIIIGALFSVHHQPTV : .. . :: . ::::.:.:: :: . CCDS47 MVCEGKRSASCPCFFLLTAKFYWILTMMQRTHSQEYAHSIRVDGDIILGGLFPVHAKG-- 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 DKVHER--KCGAVREQYGIQRVEAMLHTLERINSDPTLLPNITLGCEIRDSCWHSAVALE :: :: .... ::.:.::::.....::.:: :: ::::: .: :.: ... ::: CCDS47 ----ERGVPCGELKKEKGIHRLEAMLYAIDQINKDPDLLSNITLGVRILDTCSRDTYALE 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 QSIEFIRDSLISSEEEEGLVRCVDGSSSSFRSKKPIVGVIGPGSSSVAIQVQNLLQLFNI ::. :.. .:: :.. . :.:..:. : . : :::: ..:::.:.: :.:.::.: CCDS47 QSLTFVQ-ALI--EKDASDVKCANGDPPIFTKPDKISGVIGAAASSVSIMVANILRLFKI 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 PQIAYSATSMDLSDKTLFKYFMRVVPSDAQQARAMVDIVKRYNWTYVSAVHTEGNYGESG :::.:..:. .:::.: . .: :::: :. ::.:::::: .:.:::.. .:::::::: CCDS47 PQISYASTAPELSDNTRYDFFSRVVPPDSYQAQAMVDIVTALGWNYVSTLASEGNYGESG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 MEAFKDMSAK-EGICIAHSYKIYSNAGEQSFDKLLKKLTSHLPKARVVACFCEGMTVRGL .::: ..: . :.:::.: :: . :.:..:.: . :.::.: : . .: . CCDS47 VEAFTQISREIGGVCIAQSQKIPREPRPGEFEKIIKRLL-ETPNARAVIMFANEDDIRRI 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 LMAMRRLGLAGEFLLLGSDGWADRYDVTDGYQREAV--GGITIKLQSPDVKWFDDYYLKL : : ..:. .:.:: .:::.:... .. ::.: . :..:: . .. :: :. . CCDS47 LEAAKKLNQSGHFLWIGSDSWGSK--IAPVYQQEEIAEGAVTILPKRASIDGFDRYFRSR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE9 RPETNHRNPWFQEFWQHRFQCRLEGFPQENSKYNKTCNS--SLTLKTHHVQDSKMGFVIN .:.:: :: :::.. : :.: . ..::. .: :.. .. . . :..:. :::. CCDS47 TLANNRRNVWFAEFWEENFGCKLGSHGKRNSHIKK-CTGLERIARDSSYEQEGKVQFVID 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE9 AIYSMAYGLHNMQMSLCPGYAGLCDAMKPIDGRKLLESLMKTNFTGVSGDTILFDENGDS :.:::::.::::. .::::: ::: :. :::..:: . .::.: .: . :.::::. CCDS47 AVYSMAYALHNMHKDLCPGYIGLCPRMSTIDGKELLGYIRAVNFNGSAGTPVTFNENGDA 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE9 PGRYEIMNFKEMGKDYFDYINVGSWDNG-ELKMDDDEVWSKKSNI-IRSVCSEPCEKGQI ::::.:.... .:. .: .: : : .::..: . :... . :::: ::. :. CCDS47 PGRYDIFQYQITNKST-EYKVIGHWTNQLHLKVEDMQ-WAHREHTHPASVCSLPCKPGER 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KE9 KVIRKGEVSCCWTCTPCKENEYVFDEYTCKACQLGSWPTDDLTGCDLIPVQYLRWGDPEP : :: : ::: : :. .: :: .:. : : . :. . :::.:::. :.: .: CCDS47 KKTVKG-VPCCWHCERCEGYNYQVDELSCELCPLDQRPNMNRTGCQLIPIIKLEWHSPWA 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KE9 IAAVVFACLGLLATLFVTVVFIIYRDTPVVKSSSRELCYIILAGICLGYLCTFCLIAKPK .. : : ::..:: :: :.:. : :::.:..:.::: :..:.:: : : :: .:: : CCDS47 VVPVFVAILGIIATTFVIVTFVRYNDTPIVRASGRELSYVLLTGIFLCYSITFLMIAAPD 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE9 QIYCYLQRIGIGLSPAMSYSALVTKTNRIARILAGSKKKICTKKPRFMSACAQLVIAFIL : : ..:. .::. .::.::.:::::: ::. .::.. . :.:.: .::::.: : CCDS47 TIICSFRRVFLGLGMCFSYAALLTKTNRIHRIFEQGKKSVTA--PKFISPASQLVITFSL 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KE9 ICIQLGIIVALFIMEPPDIMHDYPSIREV-------YLICNTTNLGVVTPLGYNGLLILS : .:: . . :...:: :. :: : . : :. ..:... :::. ::... CCDS47 ISVQLLGVFVWFVVDPPHIIIDYGEQRTLDPEKARGVLKCDISDLSLICSLGYSILLMVT 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 pF1KE9 CTFYAFKTRNVPANFNEAKYIAFTMYTTCIIWLAFVPIYFGSNY-------KIITMCFSV :: ::.:::.:: .::::: :.:::::::::::::.::.::. . :. :. CCDS47 CTVYAIKTRGVPETFNEAKPIGFTMYTTCIIWLAFIPIFFGTAQSAEKMYIQTTTLTVSM 770 780 790 800 810 820 810 820 830 840 850 860 pF1KE9 SLSATVALGCMFVPKVYIILAKPERNVRSAFTTSTVVRMHVGDGKSSSAASRSSSLVNLW ::::.:.:: ...::::::. .::.::. CCDS47 SLSASVSLGMLYMPKVYIIIFHPEQNVQKRKRSFKAVVTAATMQSKLIQKGNDRPNGEVK 830 840 850 860 870 880 >>CCDS5794.1 GRM8 gene_id:2918|Hs108|chr7 (908 aa) initn: 1904 init1: 935 opt: 2155 Z-score: 1385.5 bits: 268.0 E(32554): 7.5e-71 Smith-Waterman score: 2252; 43.6% identity (70.7% similar) in 840 aa overlap (21-834:29-850) 10 20 30 40 pF1KE9 MVLLLILSVLLLKEDVRGSAQSSERRVVAH---MPGDIIIGALFSVHHQPTV : .. . :: . ::::.:.:: :: . CCDS57 MVCEGKRSASCPCFFLLTAKFYWILTMMQRTHSQEYAHSIRVDGDIILGGLFPVHAKG-- 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 DKVHER--KCGAVREQYGIQRVEAMLHTLERINSDPTLLPNITLGCEIRDSCWHSAVALE :: :: .... ::.:.::::.....::.:: :: ::::: .: :.: ... ::: CCDS57 ----ERGVPCGELKKEKGIHRLEAMLYAIDQINKDPDLLSNITLGVRILDTCSRDTYALE 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 QSIEFIRDSLISSEEEEGLVRCVDGSSSSFRSKKPIVGVIGPGSSSVAIQVQNLLQLFNI ::. :.. .:: :.. . :.:..:. : . : :::: ..:::.:.: :.:.::.: CCDS57 QSLTFVQ-ALI--EKDASDVKCANGDPPIFTKPDKISGVIGAAASSVSIMVANILRLFKI 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 PQIAYSATSMDLSDKTLFKYFMRVVPSDAQQARAMVDIVKRYNWTYVSAVHTEGNYGESG :::.:..:. .:::.: . .: :::: :. ::.:::::: .:.:::.. .:::::::: CCDS57 PQISYASTAPELSDNTRYDFFSRVVPPDSYQAQAMVDIVTALGWNYVSTLASEGNYGESG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 MEAFKDMSAK-EGICIAHSYKIYSNAGEQSFDKLLKKLTSHLPKARVVACFCEGMTVRGL .::: ..: . :.:::.: :: . :.:..:.: . :.::.: : . .: . CCDS57 VEAFTQISREIGGVCIAQSQKIPREPRPGEFEKIIKRLL-ETPNARAVIMFANEDDIRRI 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 LMAMRRLGLAGEFLLLGSDGWADRYDVTDGYQREAV--GGITIKLQSPDVKWFDDYYLKL : : ..:. .:.:: .:::.:... .. ::.: . :..:: . .. :: :. . CCDS57 LEAAKKLNQSGHFLWIGSDSWGSK--IAPVYQQEEIAEGAVTILPKRASIDGFDRYFRSR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE9 RPETNHRNPWFQEFWQHRFQCRLEGFPQENSKYNKTCNS--SLTLKTHHVQDSKMGFVIN .:.:: :: :::.. : :.: . ..::. .: :.. .. . . :..:. :::. CCDS57 TLANNRRNVWFAEFWEENFGCKLGSHGKRNSHIKK-CTGLERIARDSSYEQEGKVQFVID 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE9 AIYSMAYGLHNMQMSLCPGYAGLCDAMKPIDGRKLLESLMKTNFTGVSGDTILFDENGDS :.:::::.::::. .::::: ::: :. :::..:: . .::.: .: . :.::::. CCDS57 AVYSMAYALHNMHKDLCPGYIGLCPRMSTIDGKELLGYIRAVNFNGSAGTPVTFNENGDA 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE9 PGRYEIMNFKEMGKDYFDYINVGSWDNG-ELKMDDDEVWSKKSNI-IRSVCSEPCEKGQI ::::.:.... .:. .: .: : : .::..: . :... . :::: ::. :. CCDS57 PGRYDIFQYQITNKST-EYKVIGHWTNQLHLKVEDMQ-WAHREHTHPASVCSLPCKPGER 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KE9 KVIRKGEVSCCWTCTPCKENEYVFDEYTCKACQLGSWPTDDLTGCDLIPVQYLRWGDPEP : :: : ::: : :. .: :: .:. : : . :. . :::.:::. :.: .: CCDS57 KKTVKG-VPCCWHCERCEGYNYQVDELSCELCPLDQRPNMNRTGCQLIPIIKLEWHSPWA 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KE9 IAAVVFACLGLLATLFVTVVFIIYRDTPVVKSSSRELCYIILAGICLGYLCTFCLIAKPK .. : : ::..:: :: :.:. : :::.:..:.::: :..:.:: : : :: .:: : CCDS57 VVPVFVAILGIIATTFVIVTFVRYNDTPIVRASGRELSYVLLTGIFLCYSITFLMIAAPD 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE9 QIYCYLQRIGIGLSPAMSYSALVTKTNRIARILAGSKKKICTKKPRFMSACAQLVIAFIL : : ..:. .::. .::.::.:::::: ::. .::.. . :.:.: .::::.: : CCDS57 TIICSFRRVFLGLGMCFSYAALLTKTNRIHRIFEQGKKSVTA--PKFISPASQLVITFSL 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KE9 ICIQLGIIVALFIMEPPDIMHDYPSIREV-------YLICNTTNLGVVTPLGYNGLLILS : .:: . . :...:: :. :: : . : :. ..:... :::. ::... CCDS57 ISVQLLGVFVWFVVDPPHIIIDYGEQRTLDPEKARGVLKCDISDLSLICSLGYSILLMVT 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 pF1KE9 CTFYAFKTRNVPANFNEAKYIAFTMYTTCIIWLAFVPIYFGSNY-------KIITMCFSV :: ::.:::.:: .::::: :.:::::::::::::.::.::. . :. :. CCDS57 CTVYAIKTRGVPETFNEAKPIGFTMYTTCIIWLAFIPIFFGTAQSAEKMYIQTTTLTVSM 770 780 790 800 810 820 810 820 830 840 850 860 pF1KE9 SLSATVALGCMFVPKVYIILAKPERNVRSAFTTSTVVRMHVGDGKSSSAASRSSSLVNLW ::::.:.:: ...::::::. .::.::. CCDS57 SLSASVSLGMLYMPKVYIIIFHPEQNVQKRKRSFKAVVTAATMQSKLIQKGNDRPNGEVK 830 840 850 860 870 880 >>CCDS4787.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 (912 aa) initn: 2049 init1: 576 opt: 2154 Z-score: 1384.8 bits: 267.9 E(32554): 8.2e-71 Smith-Waterman score: 2257; 43.2% identity (71.6% similar) in 821 aa overlap (31-833:45-853) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MVLLLILSVLLLKEDVRGSAQSSERRVVAHMPGDIIIGALFSVHHQPTVDKVHERKCGAV . ::: .:.:: :: . . : :: . CCDS47 PLCLLLSLYGPWMPSSLGKPKGHPHMNSIRIDGDITLGGLFPVHGRGSEGK----PCGEL 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 REQYGIQRVEAMLHTLERINSDPTLLPNITLGCEIRDSCWHSAVALEQSIEFIRDSLISS ... ::.:.:::: .:.:::.:: :::::::: .: :.: ... :::::. :.. .:: . CCDS47 KKEKGIHRLEAMLFALDRINNDPDLLPNITLGARILDTCSRDTHALEQSLTFVQ-ALIEK 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 EEEEGLVRCVDGSSSSFRSKKPIVGVIGPGSSSVAIQVQNLLQLFNIPQIAYSATSMDLS . : ::: .:. . . . .::::: ..:::.:.: :.:.::.::::.:..:. ::: CCDS47 DGTE--VRCGSGGPPIITKPERVVGVIGASGSSVSIMVANILRLFKIPQISYASTAPDLS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 DKTLFKYFMRVVPSDAQQARAMVDIVKRYNWTYVSAVHTEGNYGESGMEAFKDMSAKEG- :.. . .: ::::::. ::.::::::. .:.:::.: .::.:::::.::: . : ..: CCDS47 DNSRYDFFSRVVPSDTYQAQAMVDIVRALKWNYVSTVASEGSYGESGVEAFIQKSREDGG 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 ICIAHSYKIYSNAGEQSFDKLLKKLTSHLPKARVVACFCEGMTVRGLLMAMRRLGLAGEF .:::.: :: . :::....: . .::.: : . .: .: : :: . .:.: CCDS47 VCIAQSVKIPREPKAGEFDKIIRRLL-ETSNARAVIIFANEDDIRRVLEAARRANQTGHF 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 LLLGSDGWADRYDVTDGYQREAVGGITIKLQSPDVKWFDDYYLKLRPETNHRNPWFQEFW . .:::.:... . .. : :..:: . .:. :: :. . ..:.:: :: ::: CCDS47 FWMGSDSWGSKIAPVLHLEEVAEGAVTILPKRMSVRGFDRYFSSRTLDNNRRNIWFAEFW 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 QHRFQCRLEGFPQENSKYNKTCNSSLTL--KTHHVQDSKMGFVINAIYSMAYGLHNMQMS . :.:.: ..... : :.. . . . :..:. :::.:.:.:...:: :. . CCDS47 EDNFHCKLSRHALKKGSHVKKCTNRERIGQDSAYEQEGKVQFVIDAVYAMGHALHAMHRD 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE9 LCPGYAGLCDAMKPIDGRKLLESLMKTNFTGVSGDTILFDENGDSPGRYEIMNFKEMGKD :::: .::: : :.:: .::. . ..::.:..:. . :.::::.::::.:.... . .: CCDS47 LCPGRVGLCPRMDPVDGTQLLKYIRNVNFSGIAGNPVTFNENGDAPGRYDIYQYQ-LRND 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 YFDYINVGSW-DNGELKMDDDEVWSKKSNIIRSVCSEPCEKGQIKVIRKGEVSCCWTCTP .: .::: :. .:... . .. ... ::.:: ::. :. : :: . ::: : : CCDS47 SAEYKVIGSWTDHLHLRIERMHWPGSGQQLPRSICSLPCQPGERKKTVKG-MPCCWHCEP 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KE9 CKENEYVFDEYTCKACQLGSWPTDDLTGCDLIPVQYLRWGDPEPIAAVVFACLGLLATLF : .: :.::::.: ::.. ::: ::. :.::.: . . .: .:. :::: CCDS47 CTGYQYQVDRYTCKTCPYDMRPTENRTGCRPIPIIKLEWGSPWAVLPLFLAVVGIAATLF 550 560 570 580 590 600 600 610 620 630 640 650 pF1KE9 VTVVFIIYRDTPVVKSSSRELCYIILAGICLGYLCTFCLIAKPKQIYCYLQRIGIGLSPA :...:. : :::.::.:.::: :..:::: : : :: .::.: : :.:: .::. . CCDS47 VVITFVRYNDTPIVKASGRELSYVLLAGIFLCYATTFLMIAEPDLGTCSLRRIFLGLGMS 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 710 pF1KE9 MSYSALVTKTNRIARILAGSKKKICTKKPRFMSACAQLVIAFILICIQLGIIVALFIMEP .::.::.:::::: ::. .:... . :::.: .::.:.: :: .:: : . :...: CCDS47 ISYAALLTKTNRIYRIFEQGKRSVSA--PRFISPASQLAITFSLISLQLLGICVWFVVDP 670 680 690 700 710 720 720 730 740 750 760 pF1KE9 PDIMHDYPSIREV-------YLICNTTNLGVVTPLGYNGLLILSCTFYAFKTRNVPANFN . :. . : . : :. ..:... :::. ::...:: ::.:::.:: .:: CCDS47 SHSVVDFQDQRTLDPRFARGVLKCDISDLSLICLLGYSMLLMVTCTVYAIKTRGVPETFN 730 740 750 760 770 780 770 780 790 800 810 820 pF1KE9 EAKYIAFTMYTTCIIWLAFVPIYFGSNY-------KIITMCFSVSLSATVALGCMFVPKV ::: :.::::::::.::::.::.::.. . :. ::::::.:.:: ...::: CCDS47 EAKPIGFTMYTTCIVWLAFIPIFFGTSQSADKLYIQTTTLTVSVSLSASVSLGMLYMPKV 790 800 810 820 830 840 830 840 850 860 870 880 pF1KE9 YIILAKPERNVRSAFTTSTVVRMHVGDGKSSSAASRSSSLVNLWKRRGSSGETLSSNGKS :::: .::.:: CCDS47 YIILFHPEQNVPKRKRSLKAVVTAATMSNKFTQKGNFRPNGEAKSELCENLEAPALATKQ 850 860 870 880 890 900 1180 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 19:06:27 2016 done: Sat Nov 5 19:06:27 2016 Total Scan time: 5.510 Total Display time: 0.490 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]