Result of FASTA (omim) for
pFN21AB8478
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8478, 847 aa
1>>>pF1KB8478 847 - 847 aa - 847 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.9585+/-0.000525; mu= -18.3983+/- 0.033
mean_var=953.4837+/-199.710, 0's: 0 Z-trim(125.2): 748 B-trim: 0 in 0/62
Lambda= 0.041535
statistics sampled from 47229 (48337) to 47229 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.82), E-opt: 0.2 (0.567), width: 16
Scan time: 13.190
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002410 (OMIM: 600050) mitogen-activated protein ( 847) 5932 371.6 8.2e-102
NP_002437 (OMIM: 600137) mitogen-activated protein ( 954) 2383 159.0 9.3e-38
XP_005267740 (OMIM: 600136) PREDICTED: mitogen-act (1081) 2155 145.4 1.3e-33
XP_011525284 (OMIM: 600137) PREDICTED: mitogen-act ( 860) 2134 144.0 2.7e-33
XP_011525283 (OMIM: 600137) PREDICTED: mitogen-act ( 962) 2134 144.1 2.9e-33
NP_149132 (OMIM: 600136) mitogen-activated protein (1118) 2136 144.3 2.9e-33
NP_001271159 (OMIM: 600136) mitogen-activated prot (1104) 2109 142.7 8.9e-33
XP_011535090 (OMIM: 600136) PREDICTED: mitogen-act (1166) 2040 138.6 1.6e-31
XP_011542607 (OMIM: 614793) PREDICTED: mitogen-act ( 905) 1737 120.3 4e-26
NP_115811 (OMIM: 614793) mitogen-activated protein (1036) 1737 120.4 4.4e-26
NP_001271160 (OMIM: 600136) mitogen-activated prot ( 880) 1320 95.3 1.3e-18
NP_001271161 (OMIM: 600136) mitogen-activated prot ( 837) 1164 85.9 8.3e-16
XP_011535094 (OMIM: 600136) PREDICTED: mitogen-act ( 860) 1164 85.9 8.5e-16
XP_011535096 (OMIM: 600136) PREDICTED: mitogen-act ( 804) 819 65.2 1.4e-09
XP_006723285 (OMIM: 600137) PREDICTED: mitogen-act ( 620) 808 64.4 1.8e-09
XP_005246697 (OMIM: 609479,616890) PREDICTED: mito ( 800) 693 57.7 2.5e-07
NP_057737 (OMIM: 609479,616890) mitogen-activated ( 800) 693 57.7 2.5e-07
XP_016859812 (OMIM: 609479,616890) PREDICTED: mito ( 455) 682 56.7 2.8e-07
NP_598407 (OMIM: 609479,616890) mitogen-activated ( 455) 682 56.7 2.8e-07
XP_016859813 (OMIM: 609479,616890) PREDICTED: mito ( 455) 682 56.7 2.8e-07
NP_006292 (OMIM: 600447) mitogen-activated protein ( 859) 648 55.0 1.7e-06
XP_016875445 (OMIM: 600447) PREDICTED: mitogen-act ( 859) 648 55.0 1.7e-06
XP_011537027 (OMIM: 600447) PREDICTED: mitogen-act ( 892) 648 55.0 1.8e-06
NP_001180440 (OMIM: 600447) mitogen-activated prot ( 892) 648 55.0 1.8e-06
XP_005269195 (OMIM: 600447) PREDICTED: mitogen-act ( 892) 648 55.0 1.8e-06
XP_006719651 (OMIM: 600447) PREDICTED: mitogen-act ( 892) 648 55.0 1.8e-06
XP_016862948 (OMIM: 604915) PREDICTED: mitogen-act ( 734) 600 52.0 1.1e-05
XP_016862947 (OMIM: 604915) PREDICTED: mitogen-act ( 734) 600 52.0 1.1e-05
NP_001229246 (OMIM: 604915) mitogen-activated prot ( 759) 600 52.1 1.2e-05
XP_016862946 (OMIM: 604915) PREDICTED: mitogen-act ( 817) 600 52.1 1.2e-05
NP_001229243 (OMIM: 604915) mitogen-activated prot ( 966) 600 52.2 1.4e-05
XP_016862945 (OMIM: 604915) PREDICTED: mitogen-act ( 966) 600 52.2 1.4e-05
NP_004712 (OMIM: 604915) mitogen-activated protein ( 966) 600 52.2 1.4e-05
XP_011511612 (OMIM: 604915) PREDICTED: mitogen-act ( 966) 600 52.2 1.4e-05
XP_005269197 (OMIM: 600447) PREDICTED: mitogen-act ( 453) 572 50.1 2.7e-05
NP_005148 (OMIM: 189980) tyrosine-protein kinase A (1130) 528 48.0 0.0003
NP_009297 (OMIM: 189980) tyrosine-protein kinase A (1149) 528 48.0 0.0003
XP_016877497 (OMIM: 190030) PREDICTED: tyrosine-pr ( 694) 516 47.0 0.00036
NP_001137257 (OMIM: 190030) tyrosine-protein kinas ( 694) 516 47.0 0.00036
NP_001137256 (OMIM: 190030) tyrosine-protein kinas ( 752) 516 47.0 0.00038
XP_016877496 (OMIM: 190030) PREDICTED: tyrosine-pr ( 752) 516 47.0 0.00038
XP_005254939 (OMIM: 190030) PREDICTED: tyrosine-pr ( 752) 516 47.0 0.00038
XP_016877499 (OMIM: 190030) PREDICTED: tyrosine-pr ( 764) 516 47.0 0.00038
NP_001137255 (OMIM: 190030) tyrosine-protein kinas ( 764) 516 47.0 0.00038
XP_005254937 (OMIM: 190030) PREDICTED: tyrosine-pr ( 764) 516 47.0 0.00038
XP_016877495 (OMIM: 190030) PREDICTED: tyrosine-pr ( 764) 516 47.0 0.00038
XP_016877494 (OMIM: 190030) PREDICTED: tyrosine-pr ( 822) 516 47.1 0.0004
XP_016877498 (OMIM: 190030) PREDICTED: tyrosine-pr ( 822) 516 47.1 0.0004
NP_001996 (OMIM: 190030) tyrosine-protein kinase F ( 822) 516 47.1 0.0004
XP_011533958 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 392) 492 45.2 0.00069
>>NP_002410 (OMIM: 600050) mitogen-activated protein kin (847 aa)
initn: 5932 init1: 5932 opt: 5932 Z-score: 1948.8 bits: 371.6 E(85289): 8.2e-102
Smith-Waterman score: 5932; 100.0% identity (100.0% similar) in 847 aa overlap (1-847:1-847)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEPLKSLFLKSPLGSWNGSGSGGGGGGGGGRPEGSPKAAGYANPVWTALFDYEPSGQDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MEPLKSLFLKSPLGSWNGSGSGGGGGGGGGRPEGSPKAAGYANPVWTALFDYEPSGQDEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ALRKGDRVEVLSRDAAISGDEGWWAGQVGGQVGIFPSNYVSRGGGPPPCEVASFQELRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ALRKGDRVEVLSRDAAISGDEGWWAGQVGGQVGIFPSNYVSRGGGPPPCEVASFQELRLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 EVIGIGGFGKVYRGSWRGELVAVKAARQDPDEDISVTAESVRQEARLFAMLAHPNIIALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EVIGIGGFGKVYRGSWRGELVAVKAARQDPDEDISVTAESVRQEARLFAMLAHPNIIALK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 AVCLEEPNLCLVMEYAAGGPLSRALAGRRVPPHVLVNWAVQIARGMHYLHCEALVPVIHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AVCLEEPNLCLVMEYAAGGPLSRALAGRRVPPHVLVNWAVQIARGMHYLHCEALVPVIHR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 DLKSNNILLLQPIESDDMEHKTLKITDFGLAREWHKTTQMSAAGTYAWMAPEVIKASTFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DLKSNNILLLQPIESDDMEHKTLKITDFGLAREWHKTTQMSAAGTYAWMAPEVIKASTFS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KGSDVWSFGVLLWELLTGEVPYRGIDCLAVAYGVAVNKLTLPIPSTCPEPFAQLMADCWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KGSDVWSFGVLLWELLTGEVPYRGIDCLAVAYGVAVNKLTLPIPSTCPEPFAQLMADCWA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QDPHRRPDFASILQQLEALEAQVLREMPRDSFHSMQEGWKREIQGLFDELRAKEKELLSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QDPHRRPDFASILQQLEALEAQVLREMPRDSFHSMQEGWKREIQGLFDELRAKEKELLSR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 EEELTRAAREQRSQAEQLRRREHLLAQWELEVFERELTLLLQQVDRERPHVRRRRGTFKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EEELTRAAREQRSQAEQLRRREHLLAQWELEVFERELTLLLQQVDRERPHVRRRRGTFKR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 SKLRARDGGERISMPLDFKHRITVQASPGLDRRRNVFEVGPGDSPTFPRFRAIQLEPAEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SKLRARDGGERISMPLDFKHRITVQASPGLDRRRNVFEVGPGDSPTFPRFRAIQLEPAEP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 GQAWGRQSPRRLEDSSNGERRACWAWGPSSPKPGEAQNGRRRSRMDEATWYLDSDDSSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GQAWGRQSPRRLEDSSNGERRACWAWGPSSPKPGEAQNGRRRSRMDEATWYLDSDDSSPL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 GSPSTPPALNGNPPRPSLEPEEPKRPVPAERGSSSGTPKLIQRALLRGTALLASLGLGRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GSPSTPPALNGNPPRPSLEPEEPKRPVPAERGSSSGTPKLIQRALLRGTALLASLGLGRD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 LQPPGGPGRERGESPTTPPTPTPAPCPTEPPPSPLICFSLKTPDSPPTPAPLLLDLGIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LQPPGGPGRERGESPTTPPTPTPAPCPTEPPPSPLICFSLKTPDSPPTPAPLLLDLGIPV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 GQRSAKSPRREEEPRGGTVSPPPGTSRSAPGTPGTPRSPPLGLISRPRPSPLRSRIDPWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GQRSAKSPRREEEPRGGTVSPPPGTSRSAPGTPGTPRSPPLGLISRPRPSPLRSRIDPWS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 FVSAGPRPSPLPSPQPAPRRAPWTLFPDSDPFWDSPPANPFQGGPQDCRAQTKDMGAQAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FVSAGPRPSPLPSPQPAPRRAPWTLFPDSDPFWDSPPANPFQGGPQDCRAQTKDMGAQAP
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 WVPEAGP
:::::::
NP_002 WVPEAGP
>>NP_002437 (OMIM: 600137) mitogen-activated protein kin (954 aa)
initn: 2339 init1: 1821 opt: 2383 Z-score: 798.9 bits: 159.0 E(85289): 9.3e-38
Smith-Waterman score: 2450; 50.1% identity (69.7% similar) in 826 aa overlap (42-802:17-839)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 PLGSWNGSGSGGGGGGGGGRPEGSPKAAGYANPVWTALFDYEPSGQDELALRKGDRVEVL
:.:::::.:::: .:..::.::.::::.::
NP_002 MEEEEGAVAKEWGTTPAGPVWTAVFDYEAAGDEELTLRRGDRVQVL
10 20 30 40
80 90 100 110 120
pF1KB8 SRDAAISGDEGWWAGQV-GGQVGIFPSNYVSRGGGPPPC-----EVASFQELRLEEVIGI
:.: :.:::::::.::. .:.::.::::::. :. : . :.::.:::.::.
NP_002 SQDCAVSGDEGWWTGQLPSGRVGVFPSNYVAPGAPAAPAGLQLPQEIPFHELQLEEIIGV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GGFGKVYRGSWRGELVAVKAARQDPDEDISVTAESVRQEARLFAMLAHPNIIALKAVCLE
::::::::. :::: ::::::: ::..: .::::.: ::::::. : :::::::...::.
NP_002 GGFGKVYRALWRGEEVAVKAARLDPEKDPAVTAEQVCQEARLFGALQHPNIIALRGACLN
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EPNLCLVMEYAAGGPLSRALAGRRVPPHVLVNWAVQIARGMHYLHCEALVPVIHRDLKSN
:.:::::::: :: :::.:::::::::::::::::.::::.::: .: ::.:::::::
NP_002 PPHLCLVMEYARGGALSRVLAGRRVPPHVLVNWAVQVARGMNYLHNDAPVPIIHRDLKSI
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 NILLLQPIESDDMEHKTLKITDFGLAREWHKTTQMSAAGTYAWMAPEVIKASTFSKGSDV
:::.:. ::. .. .::::::::::::::::.:::::::::::::::. : :::.:::
NP_002 NILILEAIENHNLADTVLKITDFGLAREWHKTTKMSAAGTYAWMAPEVIRLSLFSKSSDV
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 WSFGVLLWELLTGEVPYRGIDCLAVAYGVAVNKLTLPIPSTCPEPFAQLMADCWAQDPHR
:::::::::::::::::: :: ::::::::.::::::::::::::::.:. .:: :::
NP_002 WSFGVLLWELLTGEVPYREIDALAVAYGVAMNKLTLPIPSTCPEPFARLLEECWDPDPHG
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 RPDFASILQQLEALEAQVLREMPRDSFHSMQEGWKREIQGLFDELRAKEKELLSREEELT
::::.:::..::..: ..: .:: .::::.:: :: ::: .::.::.::::: ::::::
NP_002 RPDFGSILKRLEVIEQSALFQMPLESFHSLQEDWKLEIQHMFDDLRTKEKELRSREEELL
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 RAAREQRSQAEQLRRREHLLAQWELEVFERELTLLLQQVDRERPHVRRRRGTFKRSKL-R
:::.::: : :::::::. ::. :... :::: ::. :...:.:.::.:.:.::::.: .
NP_002 RAAQEQRFQEEQLRRREQELAEREMDIVERELHLLMCQLSQEKPRVRKRKGNFKRSRLLK
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 ARDGGERISMPLDFKHRITVQASPGLDRRRNVFEVGPGDSPTF-PRFRAIQLEPAEPGQA
:.:: .::.: :.:.::::::: ::.:.. ..: ::.. ::.:::.: :.. : .
NP_002 LREGGSHISLPSGFEHKITVQASPTLDKRKGSDGASPPASPSIIPRLRAIRLTPVDCGGS
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580
pF1KB8 -----------WGRQSPRRLEDSSNGERRACWAWGPSSPKPGEAQNGRRRSR-MDEAT--
:.: .: . :. .:.... .::::: : .:..: . . :..
NP_002 SSGSSSGGSGTWSRGGPPKKEELVGGKKKG-RTWGPSSTLQKERVGGEERLKGLGEGSKQ
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620
pF1KB8 WYLDSDD--SSPLGSPSTP------------PALNGN---PPRPSLEPEE-----PKRPV
: .. . .:: .: .: : .:. :: : : : .:
NP_002 WSSSAPNLGKSPKHTPIAPGFASLNEMEEFAEAEDGGSSVPPSPYSTPSYLSVPLPAEPS
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670
pF1KB8 PAERGSSSGTPKL--------IQR----ALLRGTALLASLGLGRDL---QPPGGPGRERG
:. :. ::. .: ::: ..::...::: :. . : ..:
NP_002 PGARAPWEPTPSAPPARWGHGARRRCDLALLGCATLLGAVGLGADVAEARAADGEEQRRW
650 660 670 680 690 700
680 690 700 710 720 730
pF1KB8 ESPTTPPTPTPAPCPTEPPPSPLICFSLKTPDSPPTPAPLLLDLGIPVGQRSAKSPRREE
. : : :: : : .:. :..:. :..: : .
NP_002 LDGLFFPRAGRFPRGLSPPARPHGRREDVGPGLGLAPSATLVSLSSVSDCNSTRSLLRSD
710 720 730 740 750 760
740 750 760 770 780
pF1KB8 EPRGGTVSPPPGTSRSAPGTPGTPRSPPL------GLISRPRPSPLRSRIDPWSFVSAGP
... ..: : : :: .: . :: .. . :: : ... :: :
NP_002 SDEAAPAAPSPPPSPPAPTPTPSPSTNPLVDLELESFKKDPRQSLTPTHVTAACAVSRGH
770 780 790 800 810 820
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 RPSPLPSPQPAPRRAPWTLFPDSDPFWDSPPANPFQGGPQDCRAQTKDMGAQAPWVPEAG
: .: : .:.:
NP_002 RRTP--SDGALGQRGPPEPAGHGPGPRDLLDFPRLPDPQALFPARRRPPEFPGRPTTLTF
830 840 850 860 870 880
>>XP_005267740 (OMIM: 600136) PREDICTED: mitogen-activat (1081 aa)
initn: 2392 init1: 1861 opt: 2155 Z-score: 724.4 bits: 145.4 E(85289): 1.3e-33
Smith-Waterman score: 2428; 53.6% identity (75.1% similar) in 728 aa overlap (1-688:1-713)
10 20 30 40
pF1KB8 MEPLKSLF--LKSPLGSWNGSGSGGGGGGGGGRPEGSPKAAGYANP----------VWTA
::: ..:. : : .. : :.:.:. . : .::. ..: :::
XP_005 MEPSRALLGCLASAAAA-APPGEDGAGAGAEEEEEEEEEAAAAVGPGELGCDAPLPYWTA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 LFDYEPSGQDELALRKGDRVEVLSRDAAISGDEGWWAGQVGGQVGIFPSNYV-------S
.:.:: .:.:::.:: :: :::::.:. .:::::::.::.. .::::::::: :
XP_005 VFEYEAAGEDELTLRLGDVVEVLSKDSQVSGDEGWWTGQLNQRVGIFPSNYVTPRSAFSS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB8 R---GGGPPPC-------EVASFQELRLEEVIGIGGFGKVYRGSWRGELVAVKAARQDPD
: :: : : :. .: :: :::.:::::::::::. : :. :::::::.:::
XP_005 RCQPGGEDPSCYPPIQLLEI-DFAELTLEEIIGIGGFGKVYRAFWIGDEVAVKAARHDPD
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 EDISVTAESVRQEARLFAMLAHPNIIALKAVCLEEPNLCLVMEYAAGGPLSRALAGRRVP
:::: : :.:::::.::::: :::::::..:::.:::::::::.: ::::.:.:.:.:.:
XP_005 EDISQTIENVRQEAKLFAMLKHPNIIALRGVCLKEPNLCLVMEFARGGPLNRVLSGKRIP
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
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: .::::::::::::.::: ::.::.:::::::.:::.:: .:. :. .: :::::::::
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::::.::.:::::::::::::::.:: :::::::::.:::::::::::::.:::: ::::
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::::.:::.::::::::::::.:: ::: ::: ::.:..::.:: ..: . . :::.::
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:: .:..::.::: .::.:::::::: . :::::::: .:..: : :::::. ::. :..
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..::::.....:. .:.:.:..:.: :..:.:. .::. :::.: ::.:..:::::: .:
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.:..... .: :::. ::.::::: :.: ...:::.: :.. . :.::
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.:::.. : .: . .: .: : . ..:.: . .: . ::: : .:
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:. . : .:: .: . . : . :.: . :.. : .. .:.. :
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:: ::
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. :.. : .. . .:: .: .: : .:. :: : :
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: ..: . : : :: : : .:. :..:. :
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.:::.. : .: . : : ..:. :.. . :: . ..: : :.
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: : :: : .: :.. ::: ... .. . . .: . : : :. : . ::.
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: : . :: :: . : .: :
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:: .:..::.::: .::.:::::::: . :::::::: .:..: : :::::. ::. :..
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..::::.....:. .:.:.:..:.: :..:.:. .::. :::.: ::.:..:::::: .:
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.:..... .: :::. ::.::::: :.: ...:::.: :.. . :.::
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pF1KB8 EEEPRGG----------TVSPP---PGTSRSAPGTPGTPRSPPLGLISRPRPSPLRSRID
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pF1KB8 PWSFVSAGPRPSPLPSPQPAPRRAPWTLFPDSDPFWDSPPANPFQGGPQDCRAQTKDMGA
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pF1KB8 HVLVNWAVQIARGMHYLHCEALVPVIHRDLKSNNILLLQPIESDDMEHKTLKITDFGLAR
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NP_115 HVLVNWAVQIARGMLYLHEEAFVPILHRDLKSSNILLLEKIEHDDICNKTLKITDFGLAR
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NP_115 RRSLNSSSSSPPSSPTMMPRLRAIQLTSDESNKTWGRNTVFRQEEFEDVKRNFKKKGC-T
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:::.: . . . ..: : :: .:: :: : . : :: ..:
NP_115 WGPNSIQMKDRTDCKERIRPL-------SDGNSPW---STILIKNQKTMPLASLFVDQPG
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