FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3272, 675 aa 1>>>pF1KE3272 675 - 675 aa - 675 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3610+/-0.000313; mu= 15.4873+/- 0.020 mean_var=100.5109+/-21.064, 0's: 0 Z-trim(117.9): 57 B-trim: 1789 in 1/53 Lambda= 0.127929 statistics sampled from 30269 (30327) to 30269 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.704), E-opt: 0.2 (0.356), width: 16 Scan time: 11.600 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001139110 (OMIM: 609491) G-protein-signaling mo ( 675) 4554 851.1 0 XP_011516800 (OMIM: 609491) PREDICTED: G-protein-s ( 707) 4400 822.7 0 XP_016870087 (OMIM: 609491) PREDICTED: G-protein-s ( 681) 3069 577.0 7.7e-164 NP_056412 (OMIM: 609491) G-protein-signaling modul ( 457) 2652 500.0 8.2e-141 XP_011539604 (OMIM: 604213,609245) PREDICTED: G-pr ( 684) 2399 453.4 1.3e-126 NP_001307968 (OMIM: 604213,609245) G-protein-signa ( 684) 2399 453.4 1.3e-126 NP_001307967 (OMIM: 604213,609245) G-protein-signa ( 684) 2399 453.4 1.3e-126 XP_016856587 (OMIM: 604213,609245) PREDICTED: G-pr ( 684) 2399 453.4 1.3e-126 XP_011539603 (OMIM: 604213,609245) PREDICTED: G-pr ( 684) 2399 453.4 1.3e-126 XP_016856586 (OMIM: 604213,609245) PREDICTED: G-pr ( 684) 2399 453.4 1.3e-126 NP_037428 (OMIM: 604213,609245) G-protein-signalin ( 684) 2399 453.4 1.3e-126 XP_006710652 (OMIM: 604213,609245) PREDICTED: G-pr ( 665) 2392 452.1 3.1e-126 XP_011539605 (OMIM: 604213,609245) PREDICTED: G-pr ( 458) 1844 350.8 6.4e-96 XP_016870088 (OMIM: 609491) PREDICTED: G-protein-s ( 166) 1162 224.7 2.2e-58 NP_001186932 (OMIM: 609491) G-protein-signaling mo ( 166) 1162 224.7 2.2e-58 NP_001139111 (OMIM: 609491) G-protein-signaling mo ( 166) 1162 224.7 2.2e-58 XP_011528324 (OMIM: 615098) PREDICTED: tetratricop (1390) 454 94.6 2.7e-18 XP_011528323 (OMIM: 615098) PREDICTED: tetratricop (1390) 454 94.6 2.7e-18 XP_011528322 (OMIM: 615098) PREDICTED: tetratricop (1400) 454 94.6 2.7e-18 XP_011528321 (OMIM: 615098) PREDICTED: tetratricop (1412) 454 94.6 2.7e-18 XP_006724234 (OMIM: 615098) PREDICTED: tetratricop (2363) 454 94.7 4.1e-18 XP_016884162 (OMIM: 615098) PREDICTED: tetratricop (2451) 454 94.8 4.2e-18 XP_011528320 (OMIM: 615098) PREDICTED: tetratricop (2455) 454 94.8 4.2e-18 XP_005261462 (OMIM: 615098) PREDICTED: tetratricop (2473) 454 94.8 4.3e-18 NP_001138890 (OMIM: 615098) tetratricopeptide repe (2481) 454 94.8 4.3e-18 XP_005253100 (OMIM: 208150,601592,616326) PREDICTE ( 371) 198 47.0 0.00015 XP_005253099 (OMIM: 208150,601592,616326) PREDICTE ( 394) 195 46.5 0.00023 NP_005046 (OMIM: 208150,601592,616326) 43 kDa rece ( 412) 195 46.5 0.00024 XP_011518554 (OMIM: 208150,601592,616326) PREDICTE ( 503) 195 46.5 0.00029 NP_116034 (OMIM: 208150,601592,616326) 43 kDa rece ( 353) 188 45.1 0.00052 >>NP_001139110 (OMIM: 609491) G-protein-signaling modula (675 aa) initn: 4554 init1: 4554 opt: 4554 Z-score: 4543.7 bits: 851.1 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4554; 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