FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1796, 313 aa 1>>>pF1KE1796 313 - 313 aa - 313 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7733+/-0.000872; mu= 8.4939+/- 0.053 mean_var=226.3845+/-45.739, 0's: 0 Z-trim(115.0): 144 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.085241 statistics sampled from 15404 (15553) to 15404 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.78), E-opt: 0.2 (0.478), width: 16 Scan time: 2.840 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6983.1 FCN2 gene_id:2220|Hs108|chr9 ( 313) 2226 285.7 3.2e-77 CCDS6985.1 FCN1 gene_id:2219|Hs108|chr9 ( 326) 1422 186.8 1.9e-47 CCDS300.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 299) 1021 137.5 1.3e-32 CCDS301.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 288) 956 129.5 3.1e-30 CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9 ( 461) 802 110.8 2.1e-24 CCDS11208.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 255) 758 105.1 6.2e-23 CCDS56023.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 279) 758 105.1 6.5e-23 CCDS1318.1 TNR gene_id:7143|Hs108|chr1 (1358) 726 101.9 2.9e-21 CCDS4736.1 TNXB gene_id:7148|Hs108|chr6 ( 673) 681 96.1 8.3e-20 CCDS30943.1 TNN gene_id:63923|Hs108|chr1 (1299) 681 96.4 1.3e-19 CCDS6868.1 ANGPTL2 gene_id:23452|Hs108|chr9 ( 493) 670 94.6 1.7e-19 CCDS128.1 ANGPTL7 gene_id:10218|Hs108|chr1 ( 346) 659 93.0 3.5e-19 CCDS6811.1 TNC gene_id:3371|Hs108|chr9 (2201) 667 94.9 6e-19 CCDS1327.1 ANGPTL1 gene_id:9068|Hs108|chr1 ( 491) 652 92.3 8e-19 CCDS83313.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 298) 620 88.2 8.8e-18 CCDS56551.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 497) 620 88.4 1.2e-17 CCDS6306.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 498) 620 88.4 1.2e-17 CCDS12224.1 ANGPTL6 gene_id:83854|Hs108|chr19 ( 470) 604 86.4 4.6e-17 CCDS47761.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 444) 569 82.1 8.8e-16 CCDS47762.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 495) 569 82.1 9.5e-16 CCDS5958.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 496) 569 82.1 9.5e-16 CCDS13009.1 ANGPT4 gene_id:51378|Hs108|chr20 ( 503) 566 81.8 1.2e-15 CCDS5591.1 FGL2 gene_id:10875|Hs108|chr7 ( 439) 538 78.3 1.2e-14 CCDS12200.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 ( 406) 533 77.6 1.8e-14 CCDS42493.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 ( 368) 464 69.1 6e-12 CCDS6004.1 FGL1 gene_id:2267|Hs108|chr8 ( 312) 445 66.7 2.7e-11 CCDS622.1 ANGPTL3 gene_id:27329|Hs108|chr1 ( 460) 448 67.2 2.7e-11 >>CCDS6983.1 FCN2 gene_id:2220|Hs108|chr9 (313 aa) initn: 2226 init1: 2226 opt: 2226 Z-score: 1499.9 bits: 285.7 E(32554): 3.2e-77 Smith-Waterman score: 2226; 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CCDS30 MDLLWILPSLWLLLLGGPACLKTQEHPSCPGPRE--LEAS-KVVLLPSCPGAPGS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 PGPKGEAGTNGKRGERGPPGPPGKAGPPGPNGAPGEPQPCLTGPRTCKDLLDRGHFLSGW :: :: : .:::::::: :: : :: :::.:..::..: :::: CCDS30 PGEKGAPGP------QGPPGPPGKMGPKG------EP-----GPRNCRELLSQGATLSGW 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 HTIYLPDCRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRVDGSVDFYRDWATYKQGFGSRLGEFWLGND . . ::. : : :.:::::.:::: ::::: ::::::.:.:..:. :::.. .::::::. CCDS30 YHLCLPEGRALPVFCDMDTEGGGWLVFQRRQDGSVDFFRSWSSYRAGFGNQESEFWLGNE 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 NIHALTAQGTSELRVDLVDFEDNYQFAKYRSFKVADEAEKYNLVLGAFVEGSAGDSLTFH :.: :: ::. ::::.: ::. : ::.: .:.. :...:.:.:: : ::.:::::..: CCDS30 NLHQLTLQGNWELRVELEDFNGNRTFAHYATFRLLGEVDHYQLALGKFSEGTAGDSLSLH 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 NNQSFSTKDQDNDLNTGNCAVMFQGAWWYKNCHVSNLNGRYLRGTHGSFANGINWKSGKG ... :.: : :.: ...::::. .::::: .:. ::::::: . .. ::.: ::.: CCDS30 SGRPFTTYDADHDSSNSNCAVIVHGAWWYASCYRSNLNGRYAVSEAAAHKYGIDWASGRG 220 230 240 250 260 270 300 310 pF1KE1 YNYSYKVSEMKVRPA .. :. .: .: CCDS30 VGHPYRRVRMMLR 280 >>CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9 (461 aa) initn: 787 init1: 391 opt: 802 Z-score: 551.5 bits: 110.8 E(32554): 2.1e-24 Smith-Waterman score: 802; 48.6% identity (71.9% similar) in 249 aa overlap (73-312:210-456) 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 SDKLTILRGCPGLPGAPGPKGEAGTNGKRGERGPPGPPGKAGPPGPNGAPGEPQPCLTG- .:: : .:: . .:. : :: CCDS69 GRLIQLLSESQGHMAHLVNSVSDILDALQRDRGLGRPRNKADLQRAPARGTRPRGCATGS 180 190 200 210 220 230 110 120 130 140 150 pF1KE1 -PRTCKDLLDRGHFLSGWHTIYLPDCRP--LTVLCDMDTDGGGWTVFQRRVDGSVDFYRD :: : :.: :. .: .... : : . : ::: :::::::::::: ::::.:.: CCDS69 RPRDCLDVLLSGQQDDGVYSVF-PTHYPAGFQVYCDMRTDGGGWTVFQRREDGSVNFFRG 240 250 260 270 280 290 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 WATYKQGFGSRLGEFWLGNDNIHALTAQGTSELRVDLVDFEDNYQFAKYRSFKVA----- : .:..::: :: ::: :::::.:.. ::.::: :::.. .:.: :: :. 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