FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6736, 1575 aa 1>>>pF1KE6736 1575 - 1575 aa - 1575 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8297+/-0.00142; mu= 9.0619+/- 0.085 mean_var=320.7116+/-62.802, 0's: 0 Z-trim(111.0): 130 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.071617 statistics sampled from 11900 (12020) to 11900 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.369), width: 16 Scan time: 4.800 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs108|chr9 (1575) 11207 1173.8 0 CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1 (1609) 4544 485.4 6.4e-136 CCDS44285.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1 (1111) 2061 228.6 8.6e-59 CCDS1352.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1 (1193) 2061 228.7 9e-59 CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs108|chr17 ( 604) 1376 157.5 1.2e-37 CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs108|chr3 (1798) 1153 135.1 2e-30 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CCDS13 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPEFVNAAFN 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 RLAQASHTCGSPPEDFCPHVGAAGAGAHCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQS . :..:::.:::..: ..:..:. :. :::..:. .:.:..:::...: ..::::: CCDS13 VTVVATNTCGTPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQHGAAFLTDYNNQADTTWWQS 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 PSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSA .: :::::.:.:.::.::::..:::::::::::::::::::::.: :::: :::.::. CCDS13 QTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQYYSG 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 SCQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEESPGL ::..::.. . ..: : ::. :.::.::::::::.::::::::::::::::::..:: : CCDS13 SCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFDNSPVL 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 QEWVTSTELLISLDRLNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGPDVA :::::.:.. ..:.:::::::..:.:::::.:::::.:::.:::::::::::::: . CCDS13 QEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCNGHASECMKNEF 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 GQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRS .:.: :.::: :.:::.:::::.:::: :.:::.: :::::.:.:::.:: :: ::.:: CCDS13 DKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRS 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 TGHGGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQCDDTGTCACKP :::::.: .:.:.: : :::::.:::.. :. : :. .::: :::. : :.::: CCDS13 TGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLSTQCDSYGRCSCKP 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 TVTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPG : : ::::: ::::::.:.:::::.:.:.::.: :. ..::: ::.:::: :.::.:: CCDS13 GVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDECNIETGRCVCKDNVEGFNCERCKPG 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 TFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQW :::. :: ::. :::.:::.::.... ..:. : : :. .:: :.. ::: .: CCDS13 FFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSISSTFQIDEDGWRAEQRDGSEASLEW 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 SPN----GVLLSPEDEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPVQ-LRLEGT : . .:. . . . :: :::: : .:::: : ..::: :. : .. : :::. CCDS13 SSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVDRRDTRLSAEDLVLEGA 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 pF1KE6 GLALSLRHSSLSGPQDAGHPREVELR--FHLQETSE-DVAPPLPPFHFQRLLANLTSLRL :: .:. . : ..: :. .. :.:.:... : : ::.::.:: ::::... CCDS13 GLRVSVPLIA----QGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALTPFEFQKLLNNLTSIKI 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 pF1KE6 RVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARPGLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKREMPQ : . . :: .: .: :.::::: . ::.::: :.::.:: ::::: : ::.:: :. CCDS13 RGTYSERSAG--YLDDVTLASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQFCEMCLSGYRRETPN 660 670 680 690 700 710 700 710 720 730 740 750 pF1KE6 GGPYASCVPCTCNQHG-TCDPNTGICVCSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCP :::. :: :.:: :. ::::.::.: : .: :: ::.: :.::. :: ..:::::: CCDS13 LGPYSPCVLCACNGHSETCDPETGVCNCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCP 720 730 740 750 760 770 760 770 780 790 800 810 pF1KE6 CPGQSACTTIPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNV ::: :.:...:...:::::.:: : :.:::.::::.:::::: : . :. :::: :. CCDS13 CPGGSSCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNI 780 790 800 810 820 830 820 830 840 850 860 870 pF1KE6 DPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSE ::::::::. :.:.::.:..::.: .:..:..::.:. ::: ::::: :.:. :.... CCDS13 DPNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNLYGTMKQ 840 850 860 870 880 890 880 890 900 910 920 930 pF1KE6 QMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQC : :.:::::: ::::::..::. : :::..:: :.::. : :: ::: . :: .:::: CCDS13 QSSCNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIRTGQC 900 910 920 930 940 950 940 950 960 970 980 990 pF1KE6 TCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHENGTCVCRPGFEGYKCDR :.::.::: :.::... :::. .::. : : : :. : ::...: : :: :: : .::. CCDS13 ECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGRCECREGFVGNRCDQ 960 970 980 990 1000 1010 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE6 CHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALVKEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPW---GPLDIL :..:.: . . ::.::.:: :::...: ...: :. . . :. .. CCDS13 CEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLGTGDEMVTDQAFEDR 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE6 LGEAPRG--DVYQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQRLNKGARCAQAGSQKT : :: : :. . . . . . ...... ....... .:: . . . . .... CCDS13 LKEAEREVMDLLREAQDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQA 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE6 CTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIPQ-EGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTA ... . : ..: . .:. .: . :.. . : :. ..:.. . :: ::: ::. :.. : CCDS13 RAHVENTERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEA 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE6 TKIAATAWRALLASNTSYALLWNLLEG--RVALETQRDLEDRYQEVQAAQKALRTAVAEV :. .: : .:. .: :: : : ..:.: . .:. .:.... .. :. .:.: CCDS13 DDIVRVAKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIE-ELNRKYEQAKNISQDLEKQAARV 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE6 LPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALPQKSRAEDLGLKAKALEKTV----ASWQH ::. . . .. :..: :. : : ...:... ..:. ::. . ... CCDS13 HEEAKRAGDKAVEIYASVAQ-LSPLDSE---TLENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYED 1260 1270 1280 1290 1300 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE6 MATEAARTLQTAAQATLRQ--TEPLT--KLHQEARAALTQASSSVQAATVTVMGARTLLA . : : . .. :.. :: : .: .: :: . : ... . :.. : .: CCDS13 L-REDMRGKELEVKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILN 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KE6 DLEGMKLQFPRPKDQA--ALQRKADSVSDRLLADTRKKTKQAERMLGNAAPLSSSAKKKG .:. . . : : :: :: .. .. .... .::..:.. ::.:: .. ::.:. CCDS13 NLKDFDRRVNDNKTAAEEAL-RKIPAI-NQTITEANEKTREAQQALGSAAADATEAKNKA 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KE6 REAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQATLQQASQQVLASEARRQELEEAE .::: .:. : : . : ... ... : .... :.: :.. :.:. . . CCDS13 HEAERIASAVQKNATSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQL-QEAEKELKRKQDDADQD 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KE6 RVGAGLS-----EMEQQIRESRISLEKDIETLSELLARLGSLDTHQAPAQALNETQWALE . ::.. : : . :... :. . . ...:: .::.::: . . ::: . .:. CCDS13 MMMAGMASQAAQEAEINARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDT--VDLNKLNEIEGTLN 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1520 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KE6 RLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDLAEIRADKQNLEAILHSLPENCAS . . .. . ..:.::.: ::.:...:: :. .. :. :: : .::: : ..:: .: CCDS13 KAKDEM-KVSDLDRKVSDLENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIRKTLPSGCFN 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KE6 WQ CCDS13 TPSIEKP >>CCDS44285.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1 (1111 aa) initn: 1188 init1: 711 opt: 2061 Z-score: 1169.0 bits: 228.6 E(32554): 8.6e-59 Smith-Waterman score: 2156; 32.7% identity (57.8% similar) in 1234 aa overlap (304-1493:9-1110) 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 NGHASECGPDVAGQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRS :: : : ::.:.. .: :.:.:.: CCDS44 MPALWLGCCLCFSLLLPAARATSR--REV--CDCNGKS 10 20 30 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 EECTFDRELFRSTGHGGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHL ..: ::::: :.::.: :: .: :.: : :::.:...::. : : ::.:.: ::: CCDS44 RQCIFDRELHRQTGNGFRCLNCNDNTDGIHCEKCKNGFYRHRERDRCLPCNCNSKGSLSA 40 50 60 70 80 90 400 410 420 430 440 pF1KE6 QCDDTGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRP--------CTCNPAGSLDTCDPRS .::..: :.::: ::: .::::::::: :...:: : :.::: :: . CCDS44 RCDNSGRCSCKPGVTGARCDRCLPGFHMLTDAGCTQDQRLLDSKCDCDPAGIAGPCD--A 100 110 120 130 140 150 450 460 470 480 490 500 pF1KE6 GRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFH ::: :: : :. ::::: : .::. :: ::..::::::: : :.:...::.: : :: CCDS44 GRCVCKPAVTGERCDRCRSGYYNLDGGNPEGCTQCFCYGHSASCRSSAEYSVHKITSTFH 160 170 180 190 200 210 510 520 530 540 550 560 pF1KE6 QGAEGWWARSVGGSEHPPQWSP--NGVLLSPE--DEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLILT : ..:: : . .:: ::: . :. : . : ..:: ::::.:. :::: : . CCDS44 QDVDGWKAVQRNGSPAKLQWSQRHQDVFSSAQRLDPVYFVAPAKFLGNQQVSYGQSLSFD 220 230 240 250 260 270 570 580 590 600 610 620 pF1KE6 FRVPPGDS-PLPVQLRLEGTGLALSLRHSSLSGPQDAGHPREVELRFHLQETSEDVAPPL .:: : : .. :::.:: .. :. : . .:.. .. :.. .: : CCDS44 YRVDRGGRHPSAHDVILEGAGLRITAPLMPLGKTLPCGLTKTYTFRLN-EHPSNNWSPQL 280 290 300 310 320 330 630 640 650 660 670 680 pF1KE6 PPFHFQRLLANLTSLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARPGLSPPASWVEICSCPTGYT :...::: :::.::.:.. : .: .. .: : :::: . :: ::: : ::.:: CCDS44 SYFEYRRLLRNLTALRIRATYGEYSTG--YIDNVTLISARPVSGAPAPWVEQCICPVGYK 340 350 360 370 380 690 700 710 720 730 740 pF1KE6 GQFCESCAPGYKREMPQGGPYASCVPCTCNQHGTCDPNTGICVCSHHTEGPSCERCLPGF ::::..:: ::::. . ::...:.::.:. :.:::.:: : . .. : : :: CCDS44 GQFCQDCASGYKRDSARLGPFGTCIPCNCQGGGACDPDTGDCYSGDENPDIECADCPIGF 390 400 410 420 430 440 750 760 770 780 790 800 pF1KE6 YGNPFAGQADDCQPCPCPGQSACTTIPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGL :..: .. :.:::: . .:...::..::::..:::: : :::.: ::.::::.: CCDS44 YNDPHDPRS--CKPCPCHNGFSCSVMPETEEVVCNNCPPGVTGARCELCADGYFGDPFGE 450 460 470 480 490 500 810 820 830 840 850 860 pF1KE6 FGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPA : .::. :::..::::.: :::: :.:.::.:.:::.: .:..:. :..:. ::: :: CCDS44 HGPVRPCQPCQCNNNVDPSASGNCDRLTGRCLKCIHNTAGIYCDQCKAGYFGDPLAPNPA 510 520 530 540 550 560 870 880 890 900 910 920 pF1KE6 DKCMPCSCHPQGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCH ::: :.:.:.:: .:: :::: CCDS44 DKCRACNCNPMGS-------EPV-----------------------------GCRS---- 570 580 930 940 950 960 970 980 pF1KE6 PLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHEN . CCDS44 -----------------------------------------------------------D 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE6 GTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALVKEEAAKLKARLTLTEGWL-- :::::.::: : .:. : : .::.:: :: . .. .: :. . CCDS44 GTCVCKPGFGGPNCE--HGAF----------SCPACYNQVKIQMDQFMQQLQRMEALISK 590 600 610 620 630 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE6 -QGSDCGSPWGPLDILLGEAPRG--DVYQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQ ::.: : :. . .: .. :. . .. :: ... :. .... .. . .:. CCDS44 AQGGDGVVPDTELEGRMQQAEQALQDILRDAQISEGASRSLGLQLAKVRSQENSYQSRLD 640 650 660 670 680 690 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE6 RLNKGARCAQA-GSQKTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIP-QEGPSQPTKWS :. .. ..: ::: ... : . .. . . . .. : :.. .:: .. :. .. CCDS44 DLKMTVERVRALGSQYQ-NRVRDTHRLITQMQLSLAESEASLGNTNIPASDHYVGPNGFK 700 710 720 730 740 750 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE6 HLATEARALARSHRDTATKIAATAWRALLASNTSYALLWNLL-EGRVALETQRD------ :: :: ::.:: ..:... . .. :. . .:. . : :: . . : CCDS44 SLAQEATRLAESHVESASNMEQLTRETEDYSKQALSLVRKALHEGVGSGSGSPDGAVVQG 760 770 780 790 800 810 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE6 LEDRYQEVQA-AQKALRTAVAEVLPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALPQKSRA : .. ..... ::. : :. . .: ... . :.. : ... . : .: CCDS44 LVEKLEKTKSLAQQLTREATQAEIEADRSYQHSLRLL--DSVSRLQGVSDQSF--QVEEA 820 830 840 850 860 870 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE6 EDLGLKAKALEKTVASWQHMATEAARTLQT------AAQATLRQ----TEPLTKLHQEAR . . :: .: . :. .:: : :: .. :: :.. : .: ..: CCDS44 KRIKQKADSLSSLVT--RHM-DEFKRTQKNLGNWKEEAQQLLQNGKSGREKSDQLLSRAN 880 890 900 910 920 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE6 AALTQASSSVQAATVTVMGARTLLADLEGMKLQFPRPKDQAALQRKADSVSDRLLADTRK : ..:. ... ...: . ....: .:. . :: : .: : : .. ..:. CCDS44 LAKSRAQEALSMGNATFYEVESILKNLREFDLQVDNRKAEAEEAMKRLSYISQKVSDASD 930 940 950 960 970 980 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE6 KTKQAERMLGNAAPLSSSAKKKGREAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQA ::.:::: ::.:: .. ::. . :: .... . .: : . . : . . : CCDS44 KTQQAERALGSAAADAQRAKNGAGEALEISSEIEQEIGSLNLEANVTADGALAME-KGLA 990 1000 1010 1020 1030 1040 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KE6 TLQQASQQVLASEARRQELE---EAERVGAGLSEMEQ---QIRESRISLEKDIETLSELL .:.. ..: .: .:.::: . . : ..: .. . ... .... ..::. :: CCDS44 SLKSEMREV-EGELERKELEFDTNMDAVQMVITEAQKVDTRAKNAGVTIQDTLNTLDGLL 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KE6 ARLGSLDTHQAPAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESD .: CCDS44 HLMGM 1110 >>CCDS1352.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1 (1193 aa) initn: 1188 init1: 711 opt: 2061 Z-score: 1168.6 bits: 228.7 E(32554): 9e-59 Smith-Waterman score: 2238; 32.2% identity (58.0% similar) in 1315 aa overlap (304-1575:9-1188) 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 NGHASECGPDVAGQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRS :: : : ::.:.. .: :.:.:.: CCDS13 MPALWLGCCLCFSLLLPAARATSR--REV--CDCNGKS 10 20 30 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 EECTFDRELFRSTGHGGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHL ..: ::::: :.::.: :: .: :.: : :::.:...::. : : ::.:.: ::: CCDS13 RQCIFDRELHRQTGNGFRCLNCNDNTDGIHCEKCKNGFYRHRERDRCLPCNCNSKGSLSA 40 50 60 70 80 90 400 410 420 430 440 pF1KE6 QCDDTGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRP--------CTCNPAGSLDTCDPRS .::..: :.::: ::: .::::::::: :...:: : :.::: :: . CCDS13 RCDNSGRCSCKPGVTGARCDRCLPGFHMLTDAGCTQDQRLLDSKCDCDPAGIAGPCD--A 100 110 120 130 140 150 450 460 470 480 490 500 pF1KE6 GRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFH ::: :: : :. ::::: : .::. :: ::..::::::: : :.:...::.: : :: CCDS13 GRCVCKPAVTGERCDRCRSGYYNLDGGNPEGCTQCFCYGHSASCRSSAEYSVHKITSTFH 160 170 180 190 200 210 510 520 530 540 550 560 pF1KE6 QGAEGWWARSVGGSEHPPQWSP--NGVLLSPE--DEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLILT : ..:: : . .:: ::: . :. : . : ..:: ::::.:. :::: : . CCDS13 QDVDGWKAVQRNGSPAKLQWSQRHQDVFSSAQRLDPVYFVAPAKFLGNQQVSYGQSLSFD 220 230 240 250 260 270 570 580 590 600 610 620 pF1KE6 FRVPPGDS-PLPVQLRLEGTGLALSLRHSSLSGPQDAGHPREVELRFHLQETSEDVAPPL .:: : : .. :::.:: .. :. : . .:.. .. :.. .: : CCDS13 YRVDRGGRHPSAHDVILEGAGLRITAPLMPLGKTLPCGLTKTYTFRLN-EHPSNNWSPQL 280 290 300 310 320 330 630 640 650 660 670 680 pF1KE6 PPFHFQRLLANLTSLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARPGLSPPASWVEICSCPTGYT :...::: :::.::.:.. : .: .. .: : :::: . :: ::: : ::.:: CCDS13 SYFEYRRLLRNLTALRIRATYGEYSTG--YIDNVTLISARPVSGAPAPWVEQCICPVGYK 340 350 360 370 380 690 700 710 720 730 740 pF1KE6 GQFCESCAPGYKREMPQGGPYASCVPCTCNQHGTCDPNTGICVCSHHTEGPSCERCLPGF ::::..:: ::::. . ::...:.::.:. :.:::.:: : . .. : : :: CCDS13 GQFCQDCASGYKRDSARLGPFGTCIPCNCQGGGACDPDTGDCYSGDENPDIECADCPIGF 390 400 410 420 430 440 750 760 770 780 790 800 pF1KE6 YGNPFAGQADDCQPCPCPGQSACTTIPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGL :..: .. :.:::: . .:...::..::::..:::: : :::.: ::.::::.: CCDS13 YNDPHDPRS--CKPCPCHNGFSCSVMPETEEVVCNNCPPGVTGARCELCADGYFGDPFGE 450 460 470 480 490 500 810 820 830 840 850 860 pF1KE6 FGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPA : .::. :::..::::.: :::: :.:.::.:.:::.: .:..:. :..:. ::: :: CCDS13 HGPVRPCQPCQCNNNVDPSASGNCDRLTGRCLKCIHNTAGIYCDQCKAGYFGDPLAPNPA 510 520 530 540 550 560 870 880 890 900 910 920 pF1KE6 DKCMPCSCHPQGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCH ::: :.:.:.:: .:: :::: CCDS13 DKCRACNCNPMGS-------EPV-----------------------------GCRS---- 570 580 930 940 950 960 970 980 pF1KE6 PLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHEN . CCDS13 -----------------------------------------------------------D 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE6 GTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALVKEEAAKLKARLTLTEGWL-- :::::.::: : .:. : : .::.:: :: . .. .: :. . CCDS13 GTCVCKPGFGGPNCE--HGAF----------SCPACYNQVKIQMDQFMQQLQRMEALISK 590 600 610 620 630 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE6 -QGSDCGSPWGPLDILLGEAPRG--DVYQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQ ::.: : :. . .: .. :. . .. :: ... :. .... .. . .:. CCDS13 AQGGDGVVPDTELEGRMQQAEQALQDILRDAQISEGASRSLGLQLAKVRSQENSYQSRLD 640 650 660 670 680 690 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE6 RLNKGARCAQAGSQKTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIP-QEGPSQPTKWSH :. .. ..: ... ... : . .. . . . .. : :.. .:: .. :. .. CCDS13 DLKMTVERVRALGSQYQNRVRDTHRLITQMQLSLAESEASLGNTNIPASDHYVGPNGFKS 700 710 720 730 740 750 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE6 LATEARALARSHRDTATKIAATAWRALLASNTSYALLWNLL-EGRVALETQRD------L :: :: ::.:: ..:... . .. :. . .:. . : :: . . : : CCDS13 LAQEATRLAESHVESASNMEQLTRETEDYSKQALSLVRKALHEGVGSGSGSPDGAVVQGL 760 770 780 790 800 810 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE6 EDRYQEVQA-AQKALRTAVAEVLPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALPQKSRAE .. ..... ::. : :. . .: ... . :.. : ... . : .:. CCDS13 VEKLEKTKSLAQQLTREATQAEIEADRSYQHSLRLL--DSVSRLQGVSDQSF--QVEEAK 820 830 840 850 860 870 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE6 DLGLKAKALEKTVASWQHMATEAARTLQT------AAQATLRQ----TEPLTKLHQEARA . :: .: . :. .:: : :: .. :: :.. : .: ..: CCDS13 RIKQKADSLSSLVT--RHM-DEFKRTQKNLGNWKEEAQQLLQNGKSGREKSDQLLSRANL 880 890 900 910 920 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE6 ALTQASSSVQAATVTVMGARTLLADLEGMKLQFPRPKDQAALQRKADSVSDRLLADTRKK : ..:. ... ...: . ....: .:. . :: : .: : : .. ..:. : CCDS13 AKSRAQEALSMGNATFYEVESILKNLREFDLQVDNRKAEAEEAMKRLSYISQKVSDASDK 930 940 950 960 970 980 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE6 TKQAERMLGNAAPLSSSAKKKGREAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQAT :.:::: ::.:: .. ::. . :: .... . .: : . . : . . :. CCDS13 TQQAERALGSAAADAQRAKNGAGEALEISSEIEQEIGSLNLEANVTADGALAME-KGLAS 990 1000 1010 1020 1030 1040 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KE6 LQQASQQVLASEARRQELE---EAERVGAGLSEMEQ---QIRESRISLEKDIETLSELLA :.. ..: .: .:.::: . . : ..: .. . ... .... ..::. :: CCDS13 LKSEMREV-EGELERKELEFDTNMDAVQMVITEAQKVDTRAKNAGVTIQDTLNTLDGLLH 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KE6 RLGSLDTHQAPAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDL . . .. ..: . : : . :..: .:. .: ::....::. ... .:... CCDS13 LMD--QPLSVDEEGLVLLEQKLSRAKTQINS--QLRPMMSELEERARQQRGHLHLLETSI 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1560 1570 pF1KE6 AEIRADKQNLEAILHSLPENCASWQ : :: .::: : .:: .: . : CCDS13 DGILADVKNLENIRDNLPPGCYNTQALEQQ 1170 1180 1190 >>CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs108|chr17 (604 aa) initn: 1018 init1: 540 opt: 1376 Z-score: 789.5 bits: 157.5 E(32554): 1.2e-37 Smith-Waterman score: 1383; 39.9% identity (65.7% similar) in 542 aa overlap (9-527:27-551) 10 20 30 40 pF1KE6 MAAAALLLGLALLAPRAAGAGMGACYDGAGRPQRCLPVFENA ::...: .:: : : :.:.::.: : :: CCDS11 MMRAVWEALAALAAVACLVGAVRGGPGLSMFAGQAAQP--DPCSDENGHPRRCIPDFVNA 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 AFGRLAQASHTCGSPPEDFCPHVGAAGAGA--HCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDES :::. ...: ::: :: .: :. : :. :.:.::.. : ..:::... . CCDS11 AFGKDVRVSSTCGRPPARYCV-VSERGEERLRSCHLCNASDPKKAHPPAFLTDLNNPHNL 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 TWWQSPSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPY : ::: .. .:.: .:..:: ::: .:.::: :.: . ::::.:::: : :. CCDS11 TCWQSENY---LQFPHNVTLTLSLGKKFEVTYVSLQFCSPRPESMAIYKSMDYGRTWVPF 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 QFYSASCQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFE ::::..:.: :.::. . ..:. : ::. .:. ::::: .:::::.:::::..:. CCDS11 QFYSTQCRKMYNRPHRAPITK-QNEQEAVCTDSHTDMRPLSGGLIAFSTLDGRPSAHDFD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE6 ESPGLQEWVTSTELLISLDRLNTFGDDIFKDPKVLQ-SYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASE .:: ::.:::.:.. ....::.::::. : .. . ::.:::::..:::::::::::.. CCDS11 NSPVLQDWVTATDIRVAFSRLHTFGDENEDDSELARDSYFYAVSDLQVGGRCKCNGHAAR 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 CGPDVAGQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFD : : .:.: :.:::.: .:.:: :: :::: :.::. :.::. :::. ....: :. CCDS11 CVRDRDDSLVCDCRHNTAGPECDRCKPFHYDRPWQRATAREANECVACNCNLHARRCRFN 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 RELFRSTGH--GGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYH--WDP---RMPCQPCDCQSAGSLH ::.. .:. :: : .:: .::: ::. :.:..:. : : :. :::. .:. CCDS11 MELYKLSGRKSGGVCLNCRHNTAGRHCHYCKEGYYRDMGKPITHRKACKACDCHPVGAAG 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE6 LQCDDT-GTCACKPTVTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCK :..: : : :: ::: :.:: :... :.. :: :.. : .. . CCDS11 KTCNQTTGQCPCKDGVTGITCNRCAKGYQQ-SRSPIAPCIKIPVAP-----PTTAASSVE 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 pF1KE6 ENVEGNLCDR-CRPGTFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTA----QFQVHHILSDFHQ : . :: :. . .:. . :.. . . :. : .: :. :.: ..: CCDS11 EPED---CDSYCKASKGKLKINMKKYCKKDYAVQIHILKADKAGDWWKFTVN-IISVYKQ 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 pF1KE6 GA-------EGWWARSVGGSEHPPQWSPNGVLLSPEDEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLI :. .. : :: . . :. .: CCDS11 GTSRIRRGDQSLWIRSRDIACKCPKIKPLKKYLLLGNAEDSPDQSGIVADKSSLVIQWRD 530 540 550 560 570 580 >>CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs108|chr3 (1798 aa) initn: 893 init1: 379 opt: 1153 Z-score: 659.6 bits: 135.1 E(32554): 2e-30 Smith-Waterman score: 1897; 28.8% identity (50.1% similar) in 1682 aa overlap (135-1570:150-1762) 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 SPSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYS . :.: :: .. . . . :. :...: CCDS27 RAAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWHVYRYFS 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 ASCQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGR---PSAYNFEE .: . : : : : . . : :..:.: : . :.: . .:. :. : CCDS27 YDCGADF--P-GVPLAPPRHWDDVVCESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPIPDPY---- 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE6 SPGLQEWVTSTELLISLDRLNTFGDDIFKDPK--VLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASE : .:. . :.: ..: ::.:.::... ::. . ..::::. .. : : : : ::::: CCDS27 SSRIQNLLKITNLRVNLTRLHTLGDNLL-DPRREIREKYYYALYELVVRGNCFCYGHASE 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 CGP------DVAGQL--ACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSG :.: . :.. :: :.::: : .::.: :..: :: . .: : :.: : CCDS27 CAPAPGAPAHAEGMVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHACRKCECHG 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 pF1KE6 RSEECTFDRELFRSTGH--GGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDP----RMP--CQPC ... : :: .. ..:. :: : :. .::: ::: :. ::. :: : : :. : CCDS27 HTHSCHFDMAVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYR-DPTKDLRDPAVCRSC 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 pF1KE6 DCQSAGSLHL-QCDD---------TGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFHSLSEG---GCRPC ::. :: .::. .: : :: :.: .:..: :: .:: . ::: : CCDS27 DCDPMGSQDGGRCDSHDDPALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLSISDRLGCRRC 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 pF1KE6 TCNPAGSLD---TCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQPHNPAGCSSCFC-YGHS :: :.. ::: :: : ::. : : :::: :: ..:. :. :: : : : . CCDS27 QCNARGTVPGSTPCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLS-HDLLGCRPCDCDVGGA 480 490 500 510 520 490 500 510 520 pF1KE6 --KVC-ASTAQFQV--HHILSDFHQGAEG----------WWARSVGGSE----------- : .:.: . : . .: : : :... :. CCDS27 LDPQCDEGTGQCHCRQHMVGRRCEQVQPGYFRPFLDHLIWEAEDTRGQVLDVVERLVTPG 530 540 550 560 570 580 530 540 550 560 pF1KE6 HPPQWSPNGVLLSPEDE--EELTA--PEKFLGDQRFSYGQPLI------LTFRVP-PGDS . :.:. .: . : . : :.: :. . : . .: . : . : :: CCDS27 ETPSWTGSGFVRLQEGQTLEFLVASVPKAMDYDLLLRL-EPQVPEQWAELELIVQRPGPV 590 600 610 620 630 640 570 580 590 600 610 620 pF1KE6 P--------LPVQLRLEGTGLALSLRHSSLSGPQDAGHPREVELRFHLQET-SEDVAPPL : .: . :..:: : :. : :. . . ..::. . . : : CCDS27 PAHSLCGHLVPKDDRIQGT-LQPHARY--LIFPNPVCLEPGISYKLHLKLVRTGGSAQPE 650 660 670 680 690 700 630 640 pF1KE6 PPFHFQRLLANLTSLRLRV------SPG----------------------PSPAGP---- :. :: . : :: : : :: ..: CCDS27 TPYSGPGLLIDSLVLLPRVLVLEMFSGGDAAALERQATFERYQCHEEGLVPSKTSPSEAC 710 720 730 740 750 760 650 660 670 680 690 pF1KE6 ----VFLTEVRLTSARP-GLSPPASWVEICS-------CPTGYTGQFCESCAPGYKREMP . :. . ..: : .: .: :. : : .:. :. ::::: : CCDS27 APLLISLSTLIYNGALPCQCNPQGSLSSECNPHGGQCLCKPGVVGRRCDLCAPGYYGFGP 770 780 790 800 810 820 700 710 pF1KE6 QG---------------------------GPYA--------------SCVPCTCNQHGT- : : .. :: ::.:: :. CCDS27 TGCQACQCSHEGALSSLCEKTSGQCLCRTGAFGLRCDRCQRGQWGFPSCRPCVCNGHADE 830 840 850 860 870 880 720 730 740 750 760 pF1KE6 CDPNTGICV-CSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCPCP---GQ-----SACTT :. .:: :. : :: : ::::. ::.:.: . .:.::::: :. ..: CCDS27 CNTHTGACLGCRDHTGGEHCERCIAGFHGDPRLPYGGQCRPCPCPEGPGSQRHFATSCHQ 890 900 910 920 930 940 770 780 790 800 810 820 pF1KE6 IPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCD :...:: :: : : :::.: : :::: :. :. :.::::.:: :: CCDS27 DEYSQQIVC-HCRAGYTGLRCEACAPGHFGDPSRPGGR---CQLCECSGNIDPMDPDACD 950 960 970 980 990 1000 830 840 850 860 870 pF1KE6 PLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSEQMP------ : .:.::::::.: : :: ::. ::.:.: ..: :.:. :. .: : CCDS27 PHTGQCLRCLHHTEGPHCAHCKPGFHGQA----ARQSCHRCTCNLLGTNPQQCPSPDQCH 1010 1020 1030 1040 1050 880 890 900 910 920 930 pF1KE6 CDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQCTCR ::: .::: :::.: . .:.:: :.:..: :.::. : ::: .. :. :::: :: CCDS27 CDPSSGQCPCLPNVQGPSCDRCAPNFWNLTSGHGCQPCACHPSRARGPTCNEFTGQCHCR 1060 1070 1080 1090 1100 1110 940 950 960 970 980 990 pF1KE6 PGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHE-NGTCVCRPGFEGYKCDRCH : :..:..:: .: :.:: :. : . :::. .: : :::: : .::.: CCDS27 AGFGGRTCSECQELHWGDPGLQCHACDCDSRGIDTPQCHRFTGHCSCRPGVSGVRCDQCA 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE6 DNFFLTADGTHCQQCPSCYA----LVKEEAAKLKARLTLTEGWLQ-----GSDCGSPWGP .: .. :. : .:.. .:.. ::. . :: :: :. .: : CCDS27 RGF--SGIFPACHPCHACFGDWDRVVQDLAARTQ-RLEQRAQELQQTGVLGAFESSFWH- 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE6 LDILLGEAPRGDVYQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQRLNKGARCAQAGSQ .. :: . :: . :::.. . .: :.:. :.:.: . : CCDS27 MQEKLG------IVQG---IVGARNTSAASTAQL---VEAT-EELRR--------EIG-- 1240 1250 1260 1270 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE6 KTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIPQEGPSQPTKW--SHLATEARALARSHR .. .:..::: : . ..: ..: :..:: . . . . .:: .. . CCDS27 EATEHLTQLEADLTDVQDENFNANHALSGLERDRLALNLTLRQLDQHLDLLKHSNFLGAY 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE6 DTATKIAATAWRALLASNTSYAL-----LWNLLEGRVALETQRDL--EDRYQEVQAAQKA :. . . . .: .::: :: . : .: :. : :: .. .: :.: CCDS27 DSIRHAHSQSAEAERRANTS-ALAVPSPVSNSASARHRTEALMDAQKEDFNSKHMANQRA 1340 1350 1360 1370 1380 1230 1240 1250 1260 pF1KE6 LR-----------TAVAEVLPEA--ESVLATVQQVGA-----DTAPYLALLASPGALPQK : : . :.. : .. :: :: : : . :. :: CCDS27 LGKLSAHTHTLSLTDINELVCGAPGDAPCATSPCGGAGCRDEDGQPRCGGLSCNGAAATA 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE6 SRAEDLGLKAKA-LEKTVASWQHMATEAARTLQTAAQATLRQTEPLTKLHQEARAALTQA . : . ...: :....: . ...:.: . :..: : : : . .:. . :: CCDS27 DLALGRARHTQAELQRALAEGGSILSRVAETRRQASEAQQRAQAALDKANA-SRGQVEQA 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1330 1340 1350 1360 pF1KE6 SSSVQAATVTVM------GARTLLADLEGMK-LQFPRPKDQAALQRKADSVSDR------ .. .: .: :: .. . . :.. : . .:. : ....: CCDS27 NQELQELIQSVKDFLNQEGADPDSIEMVATRVLELSIPASAEQIQHLAGAIAERVRSLAD 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KE6 ---LLADTRKKTKQAERMLGNAAPLSSSAKKKGREAEVL--AKDSAKLAKALLRERKQAH .:: : ...::..: .: : :. . ..::.. : . :. :... . : CCDS27 VDAILARTVGDVRRAEQLLQDARRARSWAEDEKQKAETVQAALEEAQRAQGIA---QGAI 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KE6 RRASRLTSQTQATLQQASQQVLASEARRQELEEAERVGAGLSEMEQQIRESRISLEKDIE : : : .:. :: :. :. .:. ::: .:: .. :. :: CCDS27 RGAVADTRDTEQTLYQV-QERMAG---------AER---ALSSAGERARQLDALLEA--L 1630 1640 1650 1660 1670 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE6 TLSELLARLGSLDTHQAPAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQE----SQQQ :.. :.. .... ..: ...: : . :: ::. . . :. . . .: . CCDS27 KLKRAGNSLAASTAEETAGSAQGRAQEAEQLLRGPLGDQYQTVKALAERKAQGVLAAQAR 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1540 1550 1560 1570 pF1KE6 ELQIQGFESDLAEIRADK-QNLEAILHSLPENCASWQ :.. :: . :: : :. . . :: CCDS27 AEQLRDEARDLLQAAQDKLQRLQELEGTYEENERALESKAAQLDGLEARMRSVLQAINLQ 1740 1750 1760 1770 1780 1790 CCDS27 VQIYNTCQ >>CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7 (1786 aa) initn: 998 init1: 361 opt: 1144 Z-score: 654.6 bits: 134.1 E(32554): 3.9e-30 Smith-Waterman score: 1810; 27.1% identity (52.1% similar) in 1658 aa overlap (135-1566:138-1724) 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 SPSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYS . :.: :: .. : . : : :.... CCDS57 LKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFA 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 ASCQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEE--S .:. .. : : : . .: :..::: : . :.: : .:. : :...:. : CCDS57 YDCEASF--P-GISTGPMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALD--P-AFKIEDPYS 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 PGLQEWVTSTELLISLDRLNTFGDDIFKDP-KVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECG : .:. . :.: :.. .:.:.::... . .. ..::::: :. : : : : ::::::. CCDS57 PRIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECA 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 P------DVAGQLA--CRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRS : .: :.. : :.::: : .:: :. :..: :: . .. .. : :::. .: CCDS57 PVDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHS 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 pF1KE6 EECTFDRELFRSTGH--GGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDP----RMP--CQPCDC : :: .. .::. :: : :. .: : .::.:. ::. : : : :. : : CCDS57 ISCHFDMAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKP-FYYQHPERDIRDPNFCERCTC 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 pF1KE6 QSAGSLHLQ-CDD---------TGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFHSLSEG---GCRPCTC . ::: . ::. .: : :: .: : .:: : ::..:: ::. :.: CCDS57 DPAGSQNEGICDSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCAC 410 420 430 440 450 460 440 450 460 470 pF1KE6 NPAGSL---DTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRP---GTFN-LQPHNPAGC-------S :: :.. . :: ..:.: ::. : :. ::.: : : : :. : : . CCDS57 NPLGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNN 470 480 490 500 510 520 480 490 500 510 520 pF1KE6 SCF-------CYGH--SKVCASTAQFQVHHILSDF-HQGAEGWWARSVGGSEHP------ ::: : : .. : . :. . ... :. . .:. :. CCDS57 SCFAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRI 530 540 550 560 570 580 530 540 550 560 pF1KE6 PQWSPNGVLLSPEDEE-EL---TAPEKFLGDQRFSYGQPL-------ILTF----RVP-- :.:. : . :: :. . : .. : . : : ..: :.: CCDS57 PSWTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTS 590 600 610 620 630 640 570 580 590 600 pF1KE6 -------PGD-------SP------LPVQLRLE-GTGLALSLRHSSL-SGPQDAGHPR-- : : :: :: . .: ::. .. :. . :. .:. : CCDS57 SRCGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTL 650 660 670 680 690 700 610 620 pF1KE6 -------------------------------EVELRFHLQETSEDVAP-PLPP------F :. :.. :.:..:. :. : CCDS57 IDSLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIF 710 720 730 740 750 760 630 640 650 660 pF1KE6 HFQRLLANLTSLRLRVSPGPS------PAG------P--VFLTEVRLTSARPGLSPPASW .. :: . :.: . .: : : : : : : : . . :..: : CCDS57 SISALL-HQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGP--SG 770 780 790 800 810 670 680 690 700 710 pF1KE6 VEICSCPT-GYTGQFCES------CAPG-YKRE----MPQGGPYASCVPCTCNQHGT-CD . : : : .. ::. : : : :. .: . :: :: :: :. :: CCDS57 CKPCECHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCD 820 830 840 850 860 870 720 730 740 750 760 pF1KE6 PNTGICV-CSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCPCP-----GQS---ACTTIP : :: :. :. .: : .::::: :.::.:. :..: :.::::: :.. .: : CCDS57 PVTGECLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDP 880 890 900 910 920 930 770 780 790 800 810 820 pF1KE6 ESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCDPL . ...:. : :: : ::. : .:.::.: . : :. ::: .:.: . :: CCDS57 VTLQLACV-CDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGG---SCQPCQCHNNIDTTDPEACDKE 940 950 960 970 980 990 830 840 850 860 870 880 pF1KE6 SGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSEQM-----PCDP .:.::.::..: :.::. :. :.::.:: . : : :. :.:.:. :: CCDS57 TGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDALQ----QDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDK 1000 1010 1020 1030 1040 890 900 910 920 930 940 pF1KE6 VTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGV .:::: :::.: ...:.:: :. ..: : :: :.:. : .:. :::: : :: CCDS57 ATGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGF 1050 1060 1070 1080 1090 1100 950 960 970 980 990 1000 pF1KE6 TGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHEN-GTCVCRPGFEGYKCDRCHDNF :..:..:: :.: :::: :.: : . :: .. : ::: : :: .::.: .. CCDS57 GGRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGY 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE6 FLTADGTHCQQCPSCYALVKEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPWGPLDILLGEAPRGD .. : : .:.:: : :....: CCDS57 --SGVFPDCTPCHQCFAL-----------------W-------------DVIIAELTN-- 1170 1180 1190 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE6 VYQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQRLN-KGARCAQAGSQKTCTQ-LADLE . :..: :. ... :.. :: .. .. : .. . .:. .. : .. CCDS57 --RTHRFLEKAKA------LKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEPLKNIG 1200 1210 1220 1230 1240 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE6 AVLESSEEEILHAAAILASLEIP-----QEGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTATK-- ..: .:. : .. ..:..:. ... : . . : :::..: . .. : . CCDS57 NLFEEAEKLIKDVTEMMAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKELAEQLE 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1180 1190 1200 1210 pF1KE6 -IAATAWRALLASNTSYALLWNLLEGRVALET------------QRD-LEDRYQEVQAAQ : . :. : : :.: . : :: : .:: .:: ..: .. CCDS57 FIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMMERESQF 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE6 KALRTAVAEVLPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALPQKSRAEDLGLKAKALEKT : . :..: : . . .:.. ..: .. . ::: .... . .. :. CCDS57 KEKQEEQARLLDE---LAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGERK 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE6 --------VASWQHMATEAARTLQTAAQATLRQTEPLTKLHQEARAALTQASSSVQAATV ... : : . : :. . ..: ..: :.:. .::. .:..:.. . CCDS57 CGGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILL 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE6 TVMGARTLL----ADLEGMKLQFPR--PKDQAALQRKADSVSDRLLADTRKKTKQAERML . ... . .:... :. .:.: :. . ..:....: .: : . : CCDS57 KTNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLD-SIEAVANEVLKMEMPSTPQQLQNL 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE6 GNAAPLSSSAKKKGREAEVLAKDSAKLAKA--LLRERKQAHRRAS--RLTSQ-TQATLQQ . . ... .. .: ...: .:.: ::.: :.: . :. ..:.. .. .:.. CCDS57 --TEDIRERVESLSQVEVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEE 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KE6 ASQ-QVLASEARRQELEEAERVGAGLSEMEQQIRESRISLEKDIETLSELLARLGSLDTH : . :: : .: .: :. . . :. .:.. :. .: . . .::: . : . CCDS57 AEKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEEL--K 1610 1620 1630 1640 1650 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KE6 QAPAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDLAEIRADKQ . :: .:... .:.. . . . .: :. : ... ..... . .: :: . CCDS57 RKAAQNSGEAEY-IEKVVYTVKQSAEDVKKT--LDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADAR 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1560 1570 pF1KE6 NLEAILHSLPENCASWQ .:.. CCDS57 RKAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDIS 1720 1730 1740 1750 1760 1770 >>CCDS45838.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3277 aa) initn: 386 init1: 245 opt: 1112 Z-score: 633.7 bits: 131.1 E(32554): 5.6e-29 Smith-Waterman score: 1173; 30.0% identity (53.9% similar) in 786 aa overlap (105-846:1097-1822) 80 90 100 110 120 pF1KE6 QRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQSPSMAF--GVQYPTSVN-ITLR-----LGK :::. :: . : .::: ::. CCDS45 CVSLAHETPPTALILDVLSGRPFPHLPQQSSPSVDVLPGVTLKAPQNQVTLRGRVPHLGR 1070 1080 1090 1100 1110 1120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 AYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPW-EPYQFYSASCQKTYGRPEGQYLRPGEDE . . : . : . .. :: : . .:... : .. : . : . :. 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CCDS45 SFYLDPQTASRFCKNSARSLVAFYHKGALPCECHPTGATGPHCSPE-GGQ--CPCQPNVI 1240 1250 1260 1270 1280 1290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 GTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGR-SEECTFDRELFRSTGHGGRCHHCR : .: :: : .: ::.:. : :: : :.:. : CCDS45 GRQCTRCATGHYGFP----------RCKPCSCGRRLCEEMT------------GQCR-CP 1300 1310 1320 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 DHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHL---QCD-DTGTCACKPTVTGWKC .:. :.:: :. . . . : :. :.:. :... .:: :.: : ::: .:: .: CCDS45 PRTVRPQCEVCETHSFSFHPMAGCEGCNCSRRGTIEAAMPECDRDSGQCRCKPRITGRQC 1330 1340 1350 1360 1370 1380 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 DRCLPGFHSLSEGGCRPCTCNPAGSLD-TCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQP ::: ::. . : : ::.:: :. .::: .: : :::::::. :. :: :.:.:.: CCDS45 DRCASGFYRFPE--CVPCNCNRDGTEPGVCDPGTGACLCKENVEGTECNVCREGSFHLDP 1390 1400 1410 1420 1430 1440 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 HNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQWSPNGVL : ::.::::.: .. : :. . ... . :. :: ... . : ...:.. CCDS45 ANLKGCTSCFCFGVNNQCHSSHKRRTKFV--DML----GWHLETADRVDIPVSFNPGSNS 1450 1460 1470 1480 1490 1500 540 550 560 570 580 pF1KE6 LSPEDEEEL---------TAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPVQLRLEGTGL . : .:: .:: ..:::. ::: ::... : . : . . CCDS45 MVA-DLQELPATIHSASWVAPTSYLGDKVSSYGG--YLTYQAKSFGLPGDMVLLEKKPDV 1510 1520 1530 1540 1550 590 600 610 620 630 pF1KE6 ALSLRHSSLSGPQDAGHPREVEL---RFHLQETSEDVAPPLPPFHFQRLLANLTSLR-LR :. .: :. .... :: .: : :. : . : : ..:.. :. : .: CCDS45 QLTGQHMSIIY-EETNTPRPDRLHHGRVHVVEGNFRHASSRAPVSREELMTVLSRLADVR 1560 1570 1580 1590 1600 1610 640 650 660 670 680 690 pF1KE6 VSPGP-SPAGPVFLTEVRLTSARP-GLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKREMP .. . . . :.:: : : : . : ::::.:: .:.:. :..:.::: :. CCDS45 IQGLYFTETQRLTLSEVGLEEASDTGSGRIALAVEICACPPAYAGDSCQGCSPGYYRDH- 1620 1630 1640 1650 1660 1670 700 710 720 730 740 750 pF1KE6 QGGPYASCVPCTCNQHGT-CDPNTGICV-CSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQP .: . ::::.:: :.. :. ..:::: :.:.: : :::: :.::: : .:. CCDS45 KGLYTGRCVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYGNAVHG---SCRA 1680 1690 1700 1710 1720 1730 760 770 780 790 800 810 pF1KE6 CPCPGQSACTT--IPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQC :::: .. .: . .. .: :. : : : .:: : :.::.: . : ::: .:. CCDS45 CPCPHTNSFATGCVVNGGDVRCS-CKAGYTGTQCERCAPGYFGNPQKFGGSCQPC-SCNS 1740 1750 1760 1770 1780 1790 820 830 840 850 860 870 pF1KE6 SGNVDPNAVGNCDPLSGHCLRCL--HNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHP .:.. :.: ::.: :. .. ...:. : CCDS45 NGQL-----GSCHPLTGDCINQEPKDSSPAEECDDCDSCVMTLLNDLATMGEQLRLVKSQ 1800 1810 1820 1830 1840 880 890 900 910 920 930 pF1KE6 QGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCH CCDS45 LQGLSASAGLLEQMRHMETQAKDLRNQLLNYRSAISNHGSKIEGLERELTDLNQEFETLQ 1850 1860 1870 1880 1890 1900 >>CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3333 aa) initn: 386 init1: 245 opt: 1112 Z-score: 633.7 bits: 131.2 E(32554): 5.7e-29 Smith-Waterman score: 1173; 30.0% identity (53.9% similar) in 786 aa overlap (105-846:1097-1822) 80 90 100 110 120 pF1KE6 QRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQSPSMAF--GVQYPTSVN-ITLR-----LGK :::. :: . : .::: ::. CCDS42 CVSLAHETPPTALILDVLSGRPFPHLPQQSSPSVDVLPGVTLKAPQNQVTLRGRVPHLGR 1070 1080 1090 1100 1110 1120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 AYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPW-EPYQFYSASCQKTYGRPEGQYLRPGEDE . . : . : . .. :: : . .:... : .. : . : . :. CCDS42 YVFVIHFYQAAHPTFPAQVSV------DGGWPRAGSFHASFCPHVLGCRD-QVIAEGQ-- 1130 1140 1150 1160 1170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 RVAFCTSE---FSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEESPGLQEWVTSTELLISLDRLN . : :: . .. : .... . : : :.. . .. . .. .:. : CCDS42 -IEFDISEPEVAATVKVPEGKSLVLVRVLVVP-AENYDYQILHKKSMDKSLEFITNCGKN 1180 1190 1200 1210 1220 1230 250 260 270 280 290 pF1KE6 TFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHAS-----ECGPDVAGQLACRCQHNTT .: : . .. .. : : :. : . .:.:. .:: : :: :. CCDS42 SFYLDPQTASRFCKNSARSLVAFYHKGALPCECHPTGATGPHCSPE-GGQ--CPCQPNVI 1240 1250 1260 1270 1280 1290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 GTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGR-SEECTFDRELFRSTGHGGRCHHCR : .: :: : .: ::.:. : :: : :.:. : CCDS42 GRQCTRCATGHYGFP----------RCKPCSCGRRLCEEMT------------GQCR-CP 1300 1310 1320 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 DHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHL---QCD-DTGTCACKPTVTGWKC .:. :.:: :. . . . : :. :.:. :... .:: :.: : ::: .:: .: CCDS42 PRTVRPQCEVCETHSFSFHPMAGCEGCNCSRRGTIEAAMPECDRDSGQCRCKPRITGRQC 1330 1340 1350 1360 1370 1380 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 DRCLPGFHSLSEGGCRPCTCNPAGSLD-TCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQP ::: ::. . : : ::.:: :. .::: .: : :::::::. :. :: :.:.:.: CCDS42 DRCASGFYRFPE--CVPCNCNRDGTEPGVCDPGTGACLCKENVEGTECNVCREGSFHLDP 1390 1400 1410 1420 1430 1440 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 HNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQWSPNGVL : ::.::::.: .. : :. . ... . :. :: ... . : ...:.. CCDS42 ANLKGCTSCFCFGVNNQCHSSHKRRTKFV--DML----GWHLETADRVDIPVSFNPGSNS 1450 1460 1470 1480 1490 1500 540 550 560 570 580 pF1KE6 LSPEDEEEL---------TAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPVQLRLEGTGL . : .:: .:: ..:::. ::: ::... : . : . . CCDS42 MVA-DLQELPATIHSASWVAPTSYLGDKVSSYGG--YLTYQAKSFGLPGDMVLLEKKPDV 1510 1520 1530 1540 1550 590 600 610 620 630 pF1KE6 ALSLRHSSLSGPQDAGHPREVEL---RFHLQETSEDVAPPLPPFHFQRLLANLTSLR-LR :. .: :. .... :: .: : :. : . : : ..:.. :. : .: CCDS42 QLTGQHMSIIY-EETNTPRPDRLHHGRVHVVEGNFRHASSRAPVSREELMTVLSRLADVR 1560 1570 1580 1590 1600 1610 640 650 660 670 680 690 pF1KE6 VSPGP-SPAGPVFLTEVRLTSARP-GLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKREMP .. . . . :.:: : : : . : ::::.:: .:.:. :..:.::: :. CCDS42 IQGLYFTETQRLTLSEVGLEEASDTGSGRIALAVEICACPPAYAGDSCQGCSPGYYRDH- 1620 1630 1640 1650 1660 1670 700 710 720 730 740 750 pF1KE6 QGGPYASCVPCTCNQHGT-CDPNTGICV-CSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQP .: . ::::.:: :.. :. ..:::: :.:.: : :::: :.::: : .:. CCDS42 KGLYTGRCVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYGNAVHG---SCRA 1680 1690 1700 1710 1720 1730 760 770 780 790 800 810 pF1KE6 CPCPGQSACTT--IPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQC :::: .. .: . .. .: :. : : : .:: : :.::.: . : ::: .:. CCDS42 CPCPHTNSFATGCVVNGGDVRCS-CKAGYTGTQCERCAPGYFGNPQKFGGSCQPC-SCNS 1740 1750 1760 1770 1780 1790 820 830 840 850 860 870 pF1KE6 SGNVDPNAVGNCDPLSGHCLRCL--HNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHP .:.. :.: ::.: :. .. ...:. : CCDS42 NGQL-----GSCHPLTGDCINQEPKDSSPAEECDDCDSCVMTLLNDLATMGEQLRLVKSQ 1800 1810 1820 1830 1840 880 890 900 910 920 930 pF1KE6 QGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCH CCDS42 LQGLSASAGLLEQMRHMETQAKDLRNQLLNYRSAISNHGSKIEGLERELTDLNQEFETLQ 1850 1860 1870 1880 1890 1900 >>CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs108|chr20 (3695 aa) initn: 873 init1: 246 opt: 1109 Z-score: 631.5 bits: 130.9 E(32554): 7.5e-29 Smith-Waterman score: 1901; 30.7% identity (55.4% similar) in 1373 aa overlap (265-1569:1431-2692) 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 LISLDRLNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGR-CKCN---GHASECGPDVAGQLAC .. :.: : :. . . : : .:: : CCDS33 ISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGCHEVGATGPTCEP-FGGQ--C 1410 1420 1430 1440 1450 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 RCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRSTGHGG :. .. : :: :: . : .: ::.:..: : :: : CCDS33 PCHAHVIGRDCSRCATGYWGFP----------NCRPCDCGAR--LCD---ELT------G 1460 1470 1480 1490 360 370 380 390 400 pF1KE6 RCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQ---CD-DTGTCACKPT .: : .: : : :: . . : . :. :.:.. : .: :: :.: : :.:. CCDS33 QCI-CPPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQCKCRPN 1500 1510 1520 1530 1540 1550 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 VTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRPCTCNPAGSLD-TCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPG ::: .:: : ::::. . :::: :. ::. .::: .:.: :::::.: ::.: : CCDS33 VTGRRCDTCSPGFHGYPR--CRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQCSLG 1560 1570 1580 1590 1600 1610 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 TFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQW ::.:. :: ::. :::.: .. : :.. . . . :. ::: :. . : . CCDS33 TFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFV--DM----EGWVLLSTDRQVVPHER 1620 1630 1640 1650 1660 530 540 550 560 570 pF1KE6 SPNGVLLS----------PEDEEEL--TAPEKFLGDQRFSYGQPLI--LTFRVPPGDSPL .:. .: :: :: :: ..:::. ::: : : .. :: . CCDS33 QPGTEMLRADLRHVPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFV 1670 1680 1690 1700 1710 1720 580 590 600 610 620 pF1KE6 PVQLR----LEGTGLALSLRHSSLSGPQDA--GHPREVELRFHLQETSEDVAPPLPPFHF :.. : :.:. ..... . . : . :. . :: :. :: . :. .. CCDS33 PMESRPDVVLQGNQMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSRE----EL 1730 1740 1750 1760 1770 1780 630 640 650 660 670 680 pF1KE6 QRLLANLTSLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARP-GLSPPASWVEICSCPTGYTGQFC . .::.: .:..:. . . .. ::: .: : : : : . :: ::.: ::..: :. : CCDS33 MMVLASLEQLQIRALFS-QISSAVFLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSC 1790 1800 1810 1820 1830 1840 690 700 710 720 730 740 pF1KE6 ESCAPGYKREMPQGGPYASCVPCTCNQHGT-CDPNTGICV-CSHHTEGPSCERCLPGFYG . ::::. :.. .: . :::: :. :. : :..:.:: :.:.::: :::: :: . 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CCDS33 CACGP-AAEGSECHPQSGQCHCRPGTMGPQCRECAPGYWGLPEQGCRRCQC-PGG----R 2070 2080 2090 2100 2110 2120 980 990 1000 1010 1020 pF1KE6 CHEN-GTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFFLTADG------THCQQCPSCYALVKEEAAKLKA : . : : : ::. : .:: : .. . . : ::. : : .:. .. . : CCDS33 CDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQVPVPGGPVGHSIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGA 2130 2140 2150 2160 2170 2180 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE6 RLTLTEGWLQGSDCGS-PWGPLDILLGEAPRGDVYQGHHLLP-GAREAFLEQMMSLEGAV : . :.: . .: :. : : .: .:. :.. : : :. .:. :: CCDS33 LLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRL--NASIADL-QSQLRSPLGPRHETAQQLEVLEQQS 2190 2200 2210 2220 2230 2240 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE6 KAAREQLQRLNKGARCAQAGSQKTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIPQEGPS . .. .::. : .:.. .:: : ..: . :: ..::... . CCDS33 TSLGQDARRLGGQA----VGTRDQASQL------LAGTEATLGHAKTLLAAIR------A 2250 2260 2270 2280 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE6 QPTKWSHLATEARALARSHRDTATKIAATAWRALLASNTSYALLWNLLEGRVALETQRDL :.: ... .: :. : .. . : . :::.. ..: : CCDS33 VDRTLSELMSQT-----GHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEM-RARDLGAPQAAA 2290 2300 2310 2320 2330 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE6 EDRYQEVQAAQKALRTAVAEV--LPEAESVLATV--QQVGADTAPYLALL-ASPGALPQK : :. :::. : . .. : : ...::: .... : . : : :. CCDS33 E---AELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREALNRAVDAT 2340 2350 2360 2370 2380 2390 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE6 SRAEDLGLKAKA-LEKTVASWQHMATEAARTLQT---AAQATLRQTEPLTKLHQEARAAL .:..:. . . ::... :... . : :::. ::. :: .. : . ..:. : CCDS33 REAQELNSRNQERLEEALQRKQELSRDNA-TLQATLHAARDTLASVFRLLHSLDQAKEEL 2400 2410 2420 2430 2440 2450 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE6 TQASSSVQAATVTVMGARTLLADLEGMKLQFPRPKDQAALQ--RKADSVSDRLLADTRKK . ..:...: . .. : . : ::.. . . : : . : ..:. .: :. . CCDS33 ERLAASLDGARTPLL-QRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSIIL-DVNQ- 2460 2470 2480 2490 2500 2510 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE6 TKQAERMLGNAAPLSSSAKKKGREAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQAT .:. : .:.: .. .: :.:.: ..:: .:: . . .. : CCDS33 ----DRLTQRAIE-ASNAYSRILQAVQAAEDAA--GQAL----QQADHTWATVVRQ---G 2520 2530 2540 2550 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KE6 LQQASQQVLASEARRQE--LEEAERVG---AGLSEMEQQIRESRIS---LEKDIETLSEL : . .::.::. . .: :.: .:.: :.:. . :.:. : . :: :.. . . CCDS33 LVDRAQQLLANSTALEEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAM 2560 2570 2580 2590 2600 2610 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KE6 LARLGSLDTHQAPAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFES :: .:: .. . . : : . .: .:. .... .. . : .:... CCDS33 LA----MDTDETSKKIAHAKAVAAE----AQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRG 2620 2630 2640 2650 2660 1550 1560 1570 pF1KE6 -DLAEIRADK-QNLEAILHSLPENCASWQ ::.. : ... .. ..::. CCDS33 QDLGQAVLDAGHSVSTLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGA 2670 2680 2690 2700 2710 2720 >-- initn: 907 init1: 235 opt: 1237 Z-score: 702.9 bits: 144.1 E(32554): 7.8e-33 Smith-Waterman score: 1527; 30.5% identity (47.7% similar) in 1087 aa overlap (3-1003:20-868) 10 20 30 40 pF1KE6 MAAAALLLGLALLAPRAAGAGMGACYDGAGRPQRCLPVFENAA : ::.::::: ::. . :.: . : . : : CCDS33 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALL-----GAARAREEAGGGFSLH--PPYFNLA 10 20 30 40 50 50 60 70 80 pF1KE6 FGRLAQASHTCGS---------PPED-FCPHVGA--AGA-------GAHCQRCDAADPQR : :: ::: : :: .: ::. ::. : .:. : ::. .. CCDS33 EGARIAASATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNK 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 HHNASYLTDFHSQDESTWWQSPSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTS-RPE : :: : ::::: .. :..: . ::.:: ::......:: .:: .: ::. CCDS33 AHPASNAID----GTERWWQSPPLSRGLEY-NEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPD 120 130 140 150 160 150 160 170 180 190 pF1KE6 SFAIYKRSRADG-PWEPYQFYSAS---CQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISP . . .:: : ..:.::...: : . .: : : :. . .:.::.:.: : : CCDS33 LW-VLERSMDFGRTYQPWQFFASSKRDCLERFG-P--QTLERITRDDAAICTTEYSRIVP 170 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 LSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEESPGLQEWVTSTELLISLDRLNTFGDDI----FKDPKVL : .:... : ..:::.:.:: :: :.:.. .:.. . . : ::. . ..:: : CCDS33 LENGEIVVSLVNGRPGAMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVT 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 QSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECG---PDVAGQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRP . :::...:.:.:::: :.:::. : : .: : ::::: : :.:: : :...: CCDS33 RRYYYSIKDISIGGRCVCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQP 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 pF1KE6 WARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRSTGH---------GGRCHHCRDHTAGPH : .::..:.:: ::: :.. .: .: :. : . :: : :. ::.: . CCDS33 WKPATANSANECQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVN 350 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 pF1KE6 CERCQENFYHWDPRMP------CQPCDCQSAGSLHLQCDD-TGTCACKPTVTGWKCDRCL :::: .::. .: : :. :.:.: . :.: :: : :.:. .: .:: : CCDS33 CERCLPGFYR-SPNHPLDSPHVCRRCNCESDFT-DGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCA 410 420 430 440 450 460 420 430 440 450 pF1KE6 PGFHSLSEGGCRP--------------------CTCNPAGSL-DTC--DPRSGRCPCKEN :: .. .: : : :. ::. ..: ::: ::: :: : CCDS33 EGFTGFP--SCYPTPSSSNDTREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPN 470 480 490 500 510 520 460 470 480 490 500 510 pF1KE6 VEGNLCDRCRPGTFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWA .:. :. : :: .. : ::. : : CCDS33 FQGTHCELCAPGFYG-----P-GCQPCQCS------------------------------ 530 540 520 530 540 550 560 570 pF1KE6 RSVGGSEHPPQWSPNGVLLSPEDEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPV :: :: :. : : CCDS33 ------------SP-GV----ADD-------------------------RCDP------- 550 580 590 600 610 620 630 pF1KE6 QLRLEGTGLALSLRHSSLSGPQDAGHPREVELRFHLQETSEDVAPPLPPFHFQRLLANLT :.:. CCDS33 ----------------------DTGQ---------------------------------- 640 650 660 670 680 690 pF1KE6 SLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARPGLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKR : : .:. : :. ::::: . CCDS33 ---------------------------------------CRCRVGFEGATCDRCAPGYFH 560 570 580 700 710 720 730 740 pF1KE6 EMPQGGPYASCVPCTCNQHGT----CDPNTGICVCSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQA . : : :. :: :: ..: :.:. . :: :.:: ::..: : CCDS33 -------FPLCQLCGCSPAGTLPEGCD-EAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFP----- 590 600 610 620 750 760 770 780 790 800 pF1KE6 DDCQPCPCPGQSACTTIPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQ .:: : : ..: . . .: .: :: : :. :. :: : : : CCDS33 -NCQACTCDPRGALDQL-CGAGGLC-RCRPGYTGTACQECSPGFHGFP--------SCVP 630 640 650 660 670 810 820 830 840 850 860 pF1KE6 CQCSGNVDPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCH :.::.. . .:. ::: ::.: : .:: .:. : : :. : : ::: CCDS33 CHCSAEGSLHAA--CDPRSGQC-SCRPRVTGLRCDTCVPGAYNF---PY----CEAGSCH 680 690 700 710 720 870 880 890 900 910 920 pF1KE6 PQGSVSEQMPCDPVTGQ----CSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPG--RGCRSCKCHPLG : : . : ::. . : : :: . .:.:: :::. :.:. .:: :.: : CCDS33 PAGLA----PVDPALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRCKPGFWGLSPSNPEGCTRCSCDLRG 730 740 750 760 770 780 930 940 950 960 970 pF1KE6 SQED--QCHPKTGQCTCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIK---GCRACRCSPLGAASAQCH . .:.: :::: :.: : :::: :. ::::.. :::.:::. :: . .:. CCDS33 TLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCRSCRCDIGGALGQSCE 790 800 810 820 830 840 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE6 -ENGTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALVKEEAAKLKARLTLTEGW ..:.: :::. .: :.. . .: CCDS33 PRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHAVRFGFNPLEFENFS 850 860 870 880 890 900 1575 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 15:51:37 2016 done: Tue Nov 8 15:51:38 2016 Total Scan time: 4.800 Total Display time: 0.750 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]