FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5672, 545 aa 1>>>pF1KE5672 545 - 545 aa - 545 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9420+/-0.000855; mu= 15.8142+/- 0.052 mean_var=95.0751+/-18.456, 0's: 0 Z-trim(108.7): 98 B-trim: 61 in 1/50 Lambda= 0.131535 statistics sampled from 10256 (10363) to 10256 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.318), width: 16 Scan time: 3.560 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 3683 709.5 2.6e-204 CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 1017 203.5 4.7e-52 CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 989 198.2 1.8e-50 CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 926 186.3 7.7e-47 CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 904 182.1 1.4e-45 CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 829 167.8 2.3e-41 CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 806 163.4 4.9e-40 CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 750 152.9 8.6e-37 CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 726 148.3 1.9e-35 CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 682 140.1 1.1e-32 CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 676 139.0 2.2e-32 CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 633 130.6 4.1e-30 CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 606 125.5 1.4e-28 CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 585 121.6 2.3e-27 CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 565 117.7 3e-26 CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 553 115.5 1.7e-25 CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 553 115.6 1.9e-25 CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 535 112.1 1.7e-24 CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 534 111.9 2.2e-24 CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 523 109.8 8e-24 CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 417 89.7 1.1e-17 CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 417 89.7 1.1e-17 CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 408 88.1 4.1e-17 CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 404 87.2 5.5e-17 CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 404 87.2 5.6e-17 CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 404 87.3 5.9e-17 CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 404 87.3 5.9e-17 CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 404 87.3 6e-17 CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 404 87.3 6.1e-17 CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 400 86.5 8.8e-17 CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 392 84.9 2.5e-16 CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 392 85.0 2.7e-16 CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 376 82.0 2.4e-15 CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 368 80.4 6.9e-15 CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 368 80.5 7e-15 CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 364 79.7 1.2e-14 >>CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 (545 aa) initn: 3683 init1: 3683 opt: 3683 Z-score: 3781.5 bits: 709.5 E(32554): 2.6e-204 Smith-Waterman score: 3683; 100.0% identity (100.0% similar) in 545 aa overlap (1-545:1-545) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLKQSERRRSWSYRPWNTTENEGSQHRRSICSLGARSGSQASIHGWTEGNYNYYIEEDED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 MLKQSERRRSWSYRPWNTTENEGSQHRRSICSLGARSGSQASIHGWTEGNYNYYIEEDED 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 GEEEDQWKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 GEEEDQWKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 TRLGRLATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPRR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 TRLGRLATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPRR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 FLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQVEEAEELFRDMRFYG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 FLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQVEEAEELFRDMRFYG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 PQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 PQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLRP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 ILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEGH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 ILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEGH 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 QRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIAM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 QRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIAM 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 GIFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCIAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 GIFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCIAF 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 GIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 GIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQLT 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 PRQEN ::::: CCDS64 PRQEN >>CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 (491 aa) initn: 1025 init1: 496 opt: 1017 Z-score: 1048.0 bits: 203.5 E(32554): 4.7e-52 Smith-Waterman score: 1102; 42.3% identity (70.5% similar) in 414 aa overlap (99-504:17-417) 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 DDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPKTRLGRLAT .:.:::: . ..: : ::.::::.: : CCDS16 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLT 10 20 30 40 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 STSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPRRFLEELGYW :. : ::::: ::.:::.:..:. : ::: .: : :.. :: : .:. :: CCDS16 CHSEEAILELCDDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYW 50 60 70 80 90 100 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 GVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQ--HELRAQAQVEEAE------ELFRDMRFYG :. . :: ..::..: :. : :.. .... ::. : : .:: : CCDS16 GINELFIDSCCSNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRF-G 110 120 130 140 150 160 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 PQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLRP :...: ::.: ..:: :...: . ::.:.::. .... :.:...:. . : CCDS16 QLRKKIWIRMENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNEDGEVDD-----P 170 180 190 200 210 220 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 ILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEGH .:: ::. :...:: : .:::..: ..: .. ::..:.:.:.:.: : .. : : CCDS16 VLEGVEIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVD--TKE-- 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 QRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIAM .... . ..::: :.: :::::::::::::::.:::..: :::. :..:: ::::... CCDS16 EESEDIENMGKVVQIL---RLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSV 280 290 300 310 320 330 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 GIFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCIAF :: ::. .::::.: ....:.:: ::::..:..:::::: .: : :...: :: CCDS16 GISIFSVLIYSVEKDDHTSSLTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIIC 340 350 360 370 380 390 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 GIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQLT ::.. ..::.:..:::: ::.: : CCDS16 GILVVALPITIIFNKFSKYYQKQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFIT 400 410 420 430 440 450 >>CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 (477 aa) initn: 1008 init1: 301 opt: 989 Z-score: 1019.4 bits: 198.2 E(32554): 1.8e-50 Smith-Waterman score: 989; 38.9% identity (67.5% similar) in 416 aa overlap (99-507:19-424) 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 DDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPKTRLGRLAT . .:::: . .: : ::.:::::: CCDS62 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL 10 20 30 40 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 STSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPRRFLEELGYW :: : :::::.. :..:::.: .: : .:: .: : :. :: : .:. :: CCDS62 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW 50 60 70 80 90 100 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 GVRLKYTPRCCRICFEERRDE-LSERLKIQHELRAQ-AQVEEAEELFRDM-RFYGPQ--- :. . :: .. :. : .:. : . .. .. .: .. : .: : CCDS62 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGN 110 120 130 140 150 160 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 -RRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLRPI ::.:: ...: :: ...... : :. :.... ::.. ..: ..::. : : : CCDS62 FRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGED--PR 170 180 190 200 210 220 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 LEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEGHQ .: :: . ...::.: . :.: .::. .: ..::::.::..:.:.:. :... . . CCDS62 FEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVV----E 230 240 250 260 270 280 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 RGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIAMG :....:.:.:::: ::::::::::::::::::..: ::. :..:: :::....: CCDS62 STPTLANLGRVAQVLR---LMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVG 290 300 310 320 330 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 IFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCIAFG : ::...:..:.. . ...::: ::::.::..::::::. : : :.. : :: : CCDS62 ISIFSVVAYTIEKE-ENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAG 340 350 360 370 380 390 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 IILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQLTP :.. .::....:::: .: . : : CCDS62 ILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMAS 400 410 420 430 440 450 >>CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 (513 aa) initn: 594 init1: 594 opt: 926 Z-score: 954.4 bits: 186.3 E(32554): 7.7e-47 Smith-Waterman score: 926; 34.6% identity (66.0% similar) in 465 aa overlap (85-545:51-513) 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 IEEDEDGEEEDQWKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCE .:. .: . .:::: .:.: . CCDS13 DASFHPAFLPQRQAIKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTT 30 40 50 60 70 80 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LAGFPKTRLGRLATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLD : :: ::::.: . :. . :..::::. .:.::::.:..: . .: .: : .: CCDS13 LDEFPLTRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLR 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 GLCPRRFLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRA-QAQVEEAEELF .: : ::: :::. . ::. . .. .:..: .. ..: : ... ...: CCDS13 EMCALSFQEELLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDSEGPA 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 RDMRFYGPQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGE . : ::: ...:.: :.. .:... : :: :..: :...:. .... ::. CCDS13 EGEGRLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGH 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 GGPDLRPILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLE . . .. :: .:.:.:.::.:::: ..:. : :: :.:.::::::: :. ::.. CCDS13 CSQMCHNVFI-VESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVD 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 CFTGEGHQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGC .. .. : . . ::: ::::.: .::. ...::::: ::...:.: :.: .. : CCDS13 GAAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGL 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 LLLFIAMGIFTFSAAVYSVEHDVP-STNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRF ::::. ..: :. .: .:... : .::.:: .:::.....::::::: :.. :. CCDS13 LLLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQV 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 FAFLCIAFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKA-YEYTTIRRERGEVNFM-QRARKKIAE :. : ::.: ..:.. ... :: : .:: : . .:: . .. : . .. .. CCDS13 VALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSD 440 450 460 470 480 490 540 pF1KE5 CLLGSNPQLTPRQEN :.:: . : :..: CCDS13 ILFGSASSDT-RDNN 500 510 >>CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 (519 aa) initn: 654 init1: 344 opt: 904 Z-score: 931.7 bits: 182.1 E(32554): 1.4e-45 Smith-Waterman score: 904; 34.4% identity (65.8% similar) in 456 aa overlap (90-544:52-499) 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 DGEEEDQWKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFP ..: : . . .::::. : : . : :: CCDS10 PWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFP 30 40 50 60 70 80 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 KTRLGRLATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPR .::..: : . ..:::::.:...:.::::.:..: .. .: .: :..:. .: CCDS10 LSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMCAL 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 RFLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQVEEAEELFRDMRFY : :::.:::.. . ::: . .. .:: : :...: . : : . .. : . CCDS10 SFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHREDVLRQQRETRRPASHSSR-W 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 GPQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLR : :: ...:.: :.. .:... : :: ...:.: ..:. ... . ::: . CCDS10 GLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEEDQGECSRKCY 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 PILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEG :. :: .:...:.::. ::.... : .: .. ::..:..:: : :..: . : CCDS10 YIFI-VETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEPPED 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 HQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIA .: . . . ::: ::::.: .::. ...::::: ::...:.:.:.: .. : ::::.: CCDS10 GERPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLLFLA 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 MGIFTFSAAVYSVEHDVPST-NFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCI ..: :: :: .:.. . .::.:: :.::: .:..::::::: :.. :.. :. : CCDS10 VAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPRSVPGQMVALSSI 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 AFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQ ::.. ..: . ... :: : .:: . : : .: . .:: : .:. CCDS10 LSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLR----HLQNT-GPASECEL-LDPH 440 450 460 470 480 490 540 pF1KE5 LTPRQEN .. ..: CCDS10 VASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM 500 510 >>CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (425 aa) initn: 582 init1: 229 opt: 829 Z-score: 856.0 bits: 167.8 E(32554): 2.3e-41 Smith-Waterman score: 829; 35.2% identity (65.1% similar) in 421 aa overlap (97-504:9-409) 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 WKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPKTRLGRL ... .:::: :.:. : :: :..:: CCDS42 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRL 10 20 30 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 ATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLS-GVLLVLDGLCPRRFLEEL :. : .::::... .:::::: .: .. . . : : .: : .:. CCDS42 HGCRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEM 40 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 GYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQVEEAEELFRDMRFYG----- :::.. . :: .:: :..:.. . . . ..: : :: : CCDS42 IYWGLEGAHLEYCC-----QRR--LDDRMSDTYTFYS---ADEPGVLGRDEARPGGAEAA 100 110 120 130 140 250 260 270 280 290 pF1KE5 PQRR---RLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPD :.:: :. .:.: ::.::. .. .: .::.::.:.: .:. . .. ...... : CCDS42 PSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDD 150 160 170 180 190 200 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 LRPILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTG : .: .:.:.:: : ..:. . . .:.. ::..::.:: : :...:. ::: CCDS42 RSRI---IEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTG 210 220 230 240 250 260 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 EGHQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLF :. : . ..: .:::.:.:::: ..::::: ::...:.::..::... ::.: CCDS42 ENSQ-------LQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVF 270 280 290 300 310 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 IAMGIFTFSAAVYSVEH--DVPSTN--FTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFF : ... ::: .:: :. ..: ::.:: . ::. .:..::::::::: : ::.. CCDS42 ICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRIL 320 330 340 350 360 370 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 AFLCIAFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLL . .:.. ::.: ..::...:..: . : .:: CCDS42 GGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN 380 390 400 410 420 540 pF1KE5 GSNPQLTPRQEN >>CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (436 aa) initn: 460 init1: 229 opt: 806 Z-score: 832.3 bits: 163.4 E(32554): 4.9e-40 Smith-Waterman score: 818; 34.7% identity (64.2% similar) in 430 aa overlap (97-504:9-420) 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 WKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPKTRLGRL ... .:::: :.:. : :: :..:: CCDS18 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRL 10 20 30 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 ATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLS-GVLLVLDGLCPRRFLEEL :. : .::::... .:::::: .: .. . . : : .: : .:. CCDS18 HGCRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEM 40 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 GYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQVEEAEELFRDMRFYG----- :::.. . :: .:: :..:.. . . . ..: : :: : CCDS18 IYWGLEGAHLEYCC-----QRR--LDDRMSDTYTFYS---ADEPGVLGRDEARPGGAEAA 100 110 120 130 140 250 260 270 280 290 pF1KE5 PQRR---RLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEG--- :.:: :. .:.: ::.::. .. .: .::.::.:.: .:. . .. ...... CCDS18 PSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDD 150 160 170 180 190 200 300 310 320 330 340 pF1KE5 ------GPDLRPILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYL :: .: .: .:.:.:: : ..:. . . .:.. ::..::.:: : :. CCDS18 RSRYSAGPGREPS-GIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYI 210 220 230 240 250 260 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 QLLLECFTGEGHQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCY ..:. ::::. : . ..: .:::.:.:::: ..::::: ::...:.::..:: CCDS18 SVLMTVFTGENSQ-------LQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCY 270 280 290 300 310 320 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 QQVGCLLLFIAMGIFTFSAAVYSVEH--DVPSTN--FTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMY ... ::.:: ... ::: .:: :. ..: ::.:: . ::. .:..:::::::: CCDS18 REMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMY 330 340 350 360 370 380 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 PETHLGRFFAFLCIAFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRA : : ::... .:.. ::.: ..::...:..: . : .:: CCDS18 PITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN 390 400 410 420 430 530 540 pF1KE5 RKKIAECLLGSNPQLTPRQEN >>CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 (500 aa) initn: 1142 init1: 521 opt: 750 Z-score: 774.0 bits: 152.9 E(32554): 8.6e-37 Smith-Waterman score: 1097; 41.3% identity (69.8% similar) in 441 aa overlap (87-514:29-449) 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 EDEDGEEEDQWKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELA :: ..: :: . ..::::: . :. :. CCDS63 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLDSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALS 10 20 30 40 50 120 130 140 150 160 pF1KE5 GFPKTRLGRLATSTSRSRQ----------LSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYL ::.::::.::. .. :. : :::: . .::::::. .:. : ..: CCDS63 CFPHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYR 60 70 80 90 100 110 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 SGVLLVLDGLCPRRFLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQV .: : :.. :: ::.:. :::. ::: . :: :::: : .... . : . CCDS63 TGRLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYF-RRKELSETLDFKKDTEDQESQ 120 130 140 150 160 170 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 EEAEELFRDMRFYGPQ---RRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVE .:.:. : . :: :..:::..::: ::.::. .:: : ::.::.. .:: ..: CCDS63 HESEQDFSQ----GPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMSAE 180 190 200 210 220 230 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 EMQQHSGQGEGGPDLRPILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAI ::. .:: .:..:...:: :..::. . : :: :.. :..::.:: CCDS63 LSWL---------DLQ-LLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAI 240 250 260 270 280 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 LPLYLQLLLECFTGEGHQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFT ::.:. ::.: ..: .::. . .::....:.::.: .:.:::.:::::::..:.: CCDS63 LPFYITLLVESLSG-----SQTTQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMT 290 300 310 320 330 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 LRQCYQQVGCLLLFIAMGIFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDM . :::..:: ::::...:: ::.. : .:...:.:.::..: .::::..:..::::::. CCDS63 ITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFSTVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDI 340 350 360 370 380 390 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 YPETHLGRFFAFLCIAFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQR :.: :.. ::.:: ::.. ..::.:. ..:: : :: : .. .:: CCDS63 RPDTTTGKIVAFMCILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNI 400 410 420 430 440 450 530 540 pF1KE5 ARKKIAECLLGSNPQLTPRQEN CCDS63 ATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF 460 470 480 490 500 >>CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 (466 aa) initn: 706 init1: 270 opt: 726 Z-score: 749.8 bits: 148.3 E(32554): 1.9e-35 Smith-Waterman score: 863; 35.6% identity (67.7% similar) in 405 aa overlap (101-504:21-416) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 LAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPKTRLGRLATST .:::: .: . :: : .:: :: . CCDS12 MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERLRACR 10 20 30 40 50 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 SRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPRRFLEELGYWGV ... : .::::. . ::.::::.: .:. . . .: : .: : : : .::.:::. CCDS12 GHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELAYWGI 60 70 80 90 100 110 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 RLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQVEEAEELFRDMRFYGPQRRRLWNLM ::: ...:..: .: : ::.. :. : :. :::: ... CCDS12 DEARLERCCLRRLRRREEEAAEARAGPTERGAQGS--PARALGPRGRLQRG-RRRLRDVV 120 130 140 150 160 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 EKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLRPILEHVEMLCM ..: :..:.: .. .: .:: :..:.: :.:. ... . .:: .: : .. .: .:. CCDS12 DNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFV-LETVCV 170 180 190 200 210 220 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 GFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEGHQRGQTVGSVG ..:..:.::: .. . : :. ::..:..:.::.:..::: .: : : . . CCDS12 AWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPG---GTKL--LE 230 240 250 260 270 280 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 KVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIAMGIFTFSAAVY ..: :::..: .:.. ...::::: :::..:.:.:.: .. : ::::. ... :. :. CCDS12 RAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVH 290 300 310 320 330 340 440 450 460 470 480 pF1KE5 SVEHDVPST-NFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCIAFGIILNGMPI .:... . .:...: :.:::..:..::::::: :.. :. :. : ::.: ..:. CCDS12 LAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPV 350 360 370 380 390 400 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 SILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQLTPRQEN . ... :: ::.:: CCDS12 TSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALW 410 420 430 440 450 460 >>CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 (911 aa) initn: 1141 init1: 507 opt: 682 Z-score: 700.6 bits: 140.1 E(32554): 1.1e-32 Smith-Waterman score: 1124; 38.7% identity (71.2% similar) in 455 aa overlap (75-526:10-445) 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 GWTEGNYNYYIEEDEDGEEEDQWKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSD---PPALLSTLNV ...... : . : : : . ... CCDS62 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKI 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 NVGGHSYQLDYCELAGFPKTRLGRLATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLV :::: .... . : .:.::::.: ... : .::::. . .:::::: :..: . CCDS62 NVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSI 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 YNFYLSGVLLVLDGLCPRRFLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELR ::: .: : ... .: : .:: :::. : ::. .........:.:. . : CCDS62 LNFYRTGKLHMMEEMCALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETM 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 AQAQVEEAEELFRDMRFYGPQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNT . .:.::. : .:..::.:.::: :::::: ....: :...:..::.::: CCDS62 RE---REGEEF--DNTCCPDKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNT 160 170 180 190 200 210 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 VEEMQQHSGQGEGGPDLRPILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLV . :.:. . :. . : : : ::: .:...::.:::::. :.:. .: .. ::..::. CCDS62 LPELQETDEFGQLN-DNRQ-LAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLL 220 230 240 250 260 270 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 AILPLYLQLLLECFTGEGHQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFG :::: :. ..: . ...: . .: .:....:.:::.::::::::::::...: CCDS62 AILPYYVTIFLT-------ESNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLG 280 290 300 310 320 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 FTLRQCYQQVGCLLLFIAMGIFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYG ::::. :...: :.::.::::. ::. :. .:.: .:.::.:: :.:::.....::::: CCDS62 FTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYG 330 340 350 360 370 380 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 DMYPETHLGRFFAFLCIAFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFM :.::.: ::.. . :: :... ..:: :. :.::..:.. : : . ::: . CCDS62 DIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREA-----L 390 400 410 420 430 440 530 540 pF1KE5 QRARKKIAECLLGSNPQLTPRQEN .::.. CCDS62 ERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALS 450 460 470 480 490 500 545 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 05:43:37 2016 done: Tue Nov 8 05:43:38 2016 Total Scan time: 3.560 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]