Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4441
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4441, 458 aa
1>>>pF1KE4441 458 - 458 aa - 458 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7460+/-0.00044; mu= 21.2155+/- 0.027
mean_var=70.4847+/-14.492, 0's: 0 Z-trim(110.2): 170 B-trim: 137 in 1/51
Lambda= 0.152766
statistics sampled from 18307 (18486) to 18307 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 6.390
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000740 (OMIM: 118508) neuronal acetylcholine re ( 458) 3044 680.5 2.5e-195
XP_011542692 (OMIM: 118508) PREDICTED: neuronal ac ( 329) 2166 486.9 3.5e-137
NP_000736 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetylcho ( 468) 1809 408.3 2.2e-113
XP_011542690 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 1423 323.3 9.7e-88
XP_006716345 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 1423 323.3 9.7e-88
NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcho ( 529) 1423 323.3 9.7e-88
NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ac ( 627) 1399 318.1 4.3e-86
NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine re ( 494) 1303 296.8 8.5e-80
NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetyl ( 489) 1291 294.2 5.3e-79
NP_000734 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylcho ( 505) 1291 294.2 5.4e-79
XP_016858746 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 464) 1275 290.6 5.8e-78
NP_000070 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) acet ( 457) 1265 288.4 2.7e-77
NP_001269384 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetyl ( 514) 1254 286.1 1.6e-76
XP_006720445 (OMIM: 118503,612052) PREDICTED: neur ( 438) 1205 275.2 2.5e-73
XP_016883113 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 546) 1192 272.4 2.1e-72
XP_016877378 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 449) 1190 271.9 2.5e-72
XP_016877377 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 462) 1190 271.9 2.5e-72
XP_016877376 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 463) 1190 271.9 2.5e-72
NP_000741 (OMIM: 118509) neuronal acetylcholine re ( 498) 1190 271.9 2.7e-72
XP_011519488 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 1189 271.7 3.1e-72
XP_011519489 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 1189 271.7 3.1e-72
XP_016877375 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 1179 269.5 1.4e-71
XP_016877374 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 1179 269.5 1.4e-71
NP_000739 (OMIM: 118507,605375) neuronal acetylcho ( 502) 1157 264.7 4.2e-70
NP_001186208 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine ( 479) 1132 259.1 1.8e-68
NP_001034612 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) a ( 482) 1106 253.4 9.8e-67
XP_016858745 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 489) 1106 253.4 9.9e-67
XP_011519493 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 1094 250.7 5.6e-66
XP_011519492 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 1094 250.7 5.6e-66
XP_016877370 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 245) 1057 242.3 1.1e-63
XP_005254199 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 243) 1044 239.5 7.7e-63
NP_065135 (OMIM: 606372) neuronal acetylcholine re ( 450) 967 222.7 1.6e-57
XP_011526826 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 556) 957 220.6 8.3e-57
NP_000737 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetylcho ( 502) 949 218.8 2.6e-56
NP_001177384 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetyl ( 531) 949 218.8 2.7e-56
XP_005273454 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370) 917 211.6 2.8e-54
XP_016868492 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370) 917 211.6 2.8e-54
NP_060051 (OMIM: 605116) neuronal acetylcholine re ( 479) 884 204.5 5.2e-52
XP_011519478 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 486) 863 199.9 1.3e-50
XP_011519480 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 380) 853 197.6 5e-50
XP_016883114 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 451) 740 172.7 1.8e-42
NP_001243502 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ( 451) 740 172.7 1.8e-42
NP_000860 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine recep ( 484) 734 171.4 4.7e-42
NP_001155244 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine re ( 463) 726 169.6 1.5e-41
XP_016868493 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331) 721 168.4 2.6e-41
XP_011542691 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331) 721 168.4 2.6e-41
XP_016855669 (OMIM: 118507,605375) PREDICTED: neur ( 332) 653 153.4 8.5e-37
XP_011519479 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 401) 642 151.1 5.2e-36
NP_647536 (OMIM: 609756) CHRNA7-FAM7A fusion prote ( 412) 640 150.6 7.2e-36
XP_011520455 (OMIM: 609756) PREDICTED: CHRNA7-FAM7 ( 412) 640 150.6 7.2e-36
>>NP_000740 (OMIM: 118508) neuronal acetylcholine recept (458 aa)
initn: 3044 init1: 3044 opt: 3044 Z-score: 3627.8 bits: 680.5 E(85289): 2.5e-195
Smith-Waterman score: 3044; 100.0% identity (100.0% similar) in 458 aa overlap (1-458:1-458)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWVRPVLHSNDTIKVYFGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWVRPVLHSNDTIKVYFGL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 KISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIKVPSESLWLPDIVLFEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIKVPSESLWLPDIVLFEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDRQNCSMKFGSWTYDGTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDRQNCSMKFGSWTYDGTM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYSYPFITYSFVLRRLPLFYTLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYSYPFITYSFVLRRLPLFYTLFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 IIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVIEEIIPSSSKVIPLIGEYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVIEEIIPSSSKVIPLIGEYL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQKLPKLLCMKDHVDRYSSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQKLPKLLCMKDHVDRYSSPE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 KEESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYISRHVKKEHFISQVVQDWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KEESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYISRHVKKEHFISQVVQDWK
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE4 FVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH
430 440 450
>>XP_011542692 (OMIM: 118508) PREDICTED: neuronal acetyl (329 aa)
initn: 2166 init1: 2166 opt: 2166 Z-score: 2583.8 bits: 486.9 E(85289): 3.5e-137
Smith-Waterman score: 2166; 100.0% identity (100.0% similar) in 329 aa overlap (130-458:1-329)
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 IHSIKVPSESLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTF
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTF
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 FPFDRQNCSMKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FPFDRQNCSMKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 YPFITYSFVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YPFITYSFVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFL
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 LVIEEIIPSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LVIEEIIPSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLF
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 LQKLPKLLCMKDHVDRYSSPEKEESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LQKLPKLLCMKDHVDRYSSPEKEESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSI
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 RYISRHVKKEHFISQVVQDWKFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RYISRHVKKEHFISQVVQDWKFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH
280 290 300 310 320
>>NP_000736 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetylcholine (468 aa)
initn: 2051 init1: 1221 opt: 1809 Z-score: 2156.6 bits: 408.3 E(85289): 2.2e-113
Smith-Waterman score: 2029; 67.6% identity (84.7% similar) in 444 aa overlap (13-453:28-454)
10 20 30 40
pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFN---SIAENEDALLRHLFQGYQK
: ..: :.. :::..::.::. ::: :..
NP_000 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 WVRPVLHSNDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHS
::::: : :: ::. ::: :::::::::::::::::::::::: : ::::::::::::.
NP_000 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 IKVPSESLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPF
:.:::.:.: ::::::.::::::::. ::.... ::::.:::::.::::::.:::::::
NP_000 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGT-STKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPF
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 DRQNCSMKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYSYPF
: ::::::::::::::..::.:: ...::..::::::::::..: : :::: :. ::.
NP_000 DLQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWYPY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 ITYSFVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVI
.:::::..::::::::::::::.::::::::::::::.::::. : ::::::::::::::
NP_000 VTYSFVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 EEIIPSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQK
::::::::::::::::::.: ::::::::.::::.::.:::::::.. ::: :...::.
NP_000 EEIIPSSSKVIPLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 LPKLLCMKDHVDRYSSPEKEESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYI
:::::::..::::: . .:::.. ..: : :: : ::::::
NP_000 LPKLLCMRSHVDRYFT-QKEETES---------------GSGPKSSRNTLEAALDSIRYI
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KE4 SRHVKKEHFISQVVQDWKFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH
.::. ::. . .::.::::.::::::.::: ::.::..::. .:.:.. :
NP_000 TRHIMKENDVREVVEDWKFIAQVLDRMFLWTFLFVSIVGSLGLFVPVIYKWANILIPVHI
410 420 430 440 450 460
NP_000 GNANK
>>XP_011542690 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neuronal (529 aa)
initn: 1579 init1: 860 opt: 1423 Z-score: 1696.2 bits: 323.3 E(85289): 9.7e-88
Smith-Waterman score: 1558; 52.4% identity (74.0% similar) in 477 aa overlap (15-446:46-520)
10 20 30 40
pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWV
:.. : .: .:.:: :..:::.::..:.
XP_011 LWWLLLTPAGGEEAKRPPPRAPGDPLSSPSPTALPQG-GSHTETEDRLFKHLFRGYNRWA
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 RPVLHSNDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIK
::: ...:.. : :::.:.::.:::::::.:::::::::::.:.:::::: :.:.: :..
XP_011 RPVPNTSDVVIVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWLKQEWSDYKLRWNPTDFGNITSLR
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 VPSESLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDR
:::: .:.:::::..::::.: . :::. . :.::: :.::: :::::..::::::::.
XP_011 VPSEMIWIPDIVLYNNADGEFAVTHMTKAHLFSTGTVHWVPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQ
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 QNCSMKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS--YPF
:::.::::::::: . .:: ....:: ::....::: :.:: : .... . ::
XP_011 QNCKMKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPD
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 ITYSFVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVI
.::.::.::::::::. :::::: .: ::::::::::: :::..: :::.:::::::.:
XP_011 VTYAFVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSLTVFLLLI
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 EEIIPSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQK
:::::.: ::::::::::: ::::::::..::::.:::::: :: : : ::. .:
XP_011 TEIIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPST-HTMPHWVRGALLGC
320 330 340 350 360 370
350 360 370
pF1KE4 LPKLLCMKD--------HVDRYS-SP---------EKEESQPVVK--------GKVLEK-
.:. : :. : : . :: . :: . ::. :.: .
XP_011 VPRWLLMNRPPPPVELCHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVVVEEEDRWACAGHVAPSV
380 390 400 410 420 430
380 390 400 410
pF1KE4 ----------------KKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYISRHVKKEHFISQVVQDW
: . :..:: .: ..:: ....::. :...: :.: .::
XP_011 GTLCSHGHLHSGASGPKAEALLQEGELLLSPHMQKALEGVHYIADHLRSEDADSSVKEDW
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450
pF1KE4 KFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH
:.::.:.::::::::.:: :.. .:
XP_011 KYVAMVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFLPPFLAGMI
500 510 520
>>XP_006716345 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neuronal (529 aa)
initn: 1579 init1: 860 opt: 1423 Z-score: 1696.2 bits: 323.3 E(85289): 9.7e-88
Smith-Waterman score: 1558; 52.4% identity (74.0% similar) in 477 aa overlap (15-446:46-520)
10 20 30 40
pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWV
:.. : .: .:.:: :..:::.::..:.
XP_006 LWWLLLTPAGGEEAKRPPPRAPGDPLSSPSPTALPQG-GSHTETEDRLFKHLFRGYNRWA
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50 60 70 80 90 100
pF1KE4 RPVLHSNDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIK
::: ...:.. : :::.:.::.:::::::.:::::::::::.:.:::::: :.:.: :..
XP_006 RPVPNTSDVVIVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWLKQEWSDYKLRWNPTDFGNITSLR
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110 120 130 140 150 160
pF1KE4 VPSESLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDR
:::: .:.:::::..::::.: . :::. . :.::: :.::: :::::..::::::::.
XP_006 VPSEMIWIPDIVLYNNADGEFAVTHMTKAHLFSTGTVHWVPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQ
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 QNCSMKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS--YPF
:::.::::::::: . .:: ....:: ::....::: :.:: : .... . ::
XP_006 QNCKMKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPD
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 ITYSFVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVI
.::.::.::::::::. :::::: .: ::::::::::: :::..: :::.:::::::.:
XP_006 VTYAFVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSLTVFLLLI
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 EEIIPSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQK
:::::.: ::::::::::: ::::::::..::::.:::::: :: : : ::. .:
XP_006 TEIIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPST-HTMPHWVRGALLGC
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350 360 370
pF1KE4 LPKLLCMKD--------HVDRYS-SP---------EKEESQPVVK--------GKVLEK-
.:. : :. : : . :: . :: . ::. :.: .
XP_006 VPRWLLMNRPPPPVELCHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVVVEEEDRWACAGHVAPSV
380 390 400 410 420 430
380 390 400 410
pF1KE4 ----------------KKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYISRHVKKEHFISQVVQDW
: . :..:: .: ..:: ....::. :...: :.: .::
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440 450 460 470 480 490
420 430 440 450
pF1KE4 KFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH
:.::.:.::::::::.:: :.. .:
XP_006 KYVAMVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFLPPFLAGMI
500 510 520
>>NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcholine (529 aa)
initn: 1579 init1: 860 opt: 1423 Z-score: 1696.2 bits: 323.3 E(85289): 9.7e-88
Smith-Waterman score: 1558; 52.4% identity (74.0% similar) in 477 aa overlap (15-446:46-520)
10 20 30 40
pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWV
:.. : .: .:.:: :..:::.::..:.
NP_000 LWWLLLTPAGGEEAKRPPPRAPGDPLSSPSPTALPQG-GSHTETEDRLFKHLFRGYNRWA
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 RPVLHSNDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIK
::: ...:.. : :::.:.::.:::::::.:::::::::::.:.:::::: :.:.: :..
NP_000 RPVPNTSDVVIVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWLKQEWSDYKLRWNPTDFGNITSLR
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110 120 130 140 150 160
pF1KE4 VPSESLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDR
:::: .:.:::::..::::.: . :::. . :.::: :.::: :::::..::::::::.
NP_000 VPSEMIWIPDIVLYNNADGEFAVTHMTKAHLFSTGTVHWVPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQ
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 QNCSMKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS--YPF
:::.::::::::: . .:: ....:: ::....::: :.:: : .... . ::
NP_000 QNCKMKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPD
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230 240 250 260 270 280
pF1KE4 ITYSFVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVI
.::.::.::::::::. :::::: .: ::::::::::: :::..: :::.:::::::.:
NP_000 VTYAFVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSLTVFLLLI
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 EEIIPSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQK
:::::.: ::::::::::: ::::::::..::::.:::::: :: : : ::. .:
NP_000 TEIIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPST-HTMPHWVRGALLGC
320 330 340 350 360 370
350 360 370
pF1KE4 LPKLLCMKD--------HVDRYS-SP---------EKEESQPVVK--------GKVLEK-
.:. : :. : : . :: . :: . ::. :.: .
NP_000 VPRWLLMNRPPPPVELCHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVVVEEEDRWACAGHVAPSV
380 390 400 410 420 430
380 390 400 410
pF1KE4 ----------------KKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYISRHVKKEHFISQVVQDW
: . :..:: .: ..:: ....::. :...: :.: .::
NP_000 GTLCSHGHLHSGASGPKAEALLQEGELLLSPHMQKALEGVHYIADHLRSEDADSSVKEDW
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450
pF1KE4 KFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH
:.::.:.::::::::.:: :.. .:
NP_000 KYVAMVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFLPPFLAGMI
500 510 520
>>NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal acetyl (627 aa)
initn: 1472 init1: 801 opt: 1399 Z-score: 1666.6 bits: 318.1 E(85289): 4.3e-86
Smith-Waterman score: 1399; 59.7% identity (81.0% similar) in 352 aa overlap (1-350:11-359)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWVRPVLHS
.:: .:.:. :. :.. .. :. :. ::..::.::.:: ::: .
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10 20 30 40 50
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pF1KE4 NDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIKVPSESL
.:.. : :::.:.::.:::::::.::::::.:::: :.::::.: :: .. ::..::: .
NP_000 SDVVLVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWVKQEWHDYKLRWDPADYENVTSIRIPSELI
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pF1KE4 WLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDRQNCSMK
: :::::..:::: : . .::. . .: : ::::: :::::..::::::::.:::.::
NP_000 WRPDIVLYNNADGDFAVTHLTKAHLFHDGRVQWTPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQQNCTMK
120 130 140 150 160 170
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pF1KE4 FGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS--YPFITYSFV
::::::: . .::. .. ::. ::...::: :..: : ..:. . :: :::.::
NP_000 FGSWTYDKAKIDLVNMHSRVDQLDFWESGEWVIVDAVGTYNTRKYECCAEIYPDITYAFV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 LRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVIEEIIPS
.::::::::. :::::: .: ::::::::::. :::..: :::.:::::::.: :::::
NP_000 IRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSECGEKITLCISVLLSLTVFLLLITEIIPS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 SSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQKLPKLLC
.: ::::::::::: ::::::::..::::.:::::: : : : ::.:.::. .:.::
NP_000 TSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPRT-HTMPTWVRRVFLDIVPRLLL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 MKDHVDRYSSPEKEESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYISRHVKK
::
NP_000 MKRPSVVKDNCRRLIESMHKMASAPRFWPEPEGEPPATSGTQSLHPPSPSFCVPLDVPAE
360 370 380 390 400 410
>--
initn: 210 init1: 178 opt: 200 Z-score: 238.5 bits: 53.8 E(85289): 1.5e-06
Smith-Waterman score: 200; 46.0% identity (74.6% similar) in 63 aa overlap (392-454:564-623)
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 EESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYISRHVKKEHFISQVVQDWKF
: .:.....::. :.: : .: .:::.
NP_000 KKEPSSVSPSATVKTRSTKAPPPHLPLSPALTRAVEGVQYIADHLKAEDTDFSVKEDWKY
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pF1KE4 VAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH
::.:.::::::.:.:: . :.: .: : ::
NP_000 VAMVIDRIFLWMFIIVCLLGTVGLFLPP---WLAGMI
600 610 620
>>NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine recept (494 aa)
initn: 1431 init1: 735 opt: 1303 Z-score: 1553.6 bits: 296.8 E(85289): 8.5e-80
Smith-Waterman score: 1403; 47.6% identity (75.0% similar) in 456 aa overlap (29-450:34-487)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWVRPVLHSNDTIKVYF
:. :...::. :....::: . .: . :.:
NP_004 SKGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLFSHYNQFIRPVENVSDPVTVHF
10 20 30 40 50 60
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pF1KE4 GLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIKVPSESLWLPDIVLF
. :.::..::: ::.: ::.::.. :.:.::::.: .: ::....::....: :::::.
NP_004 EVAITQLANVDEVNQIMETNLWLRHIWNDYKLRWDPMEYDGIETLRVPADKIWKPDIVLY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE4 ENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDRQNCSMKFGSWTYDG
.:: : :. ::...: :: ..::::: .:::: ::.::::::.::::.::::::::
NP_004 NNAVGDFQVEGKTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQNCSLKFGSWTYDK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 TMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS--YPFITYSFVLRRLPLFY
. .::..:. .:: .::..:.::::..:.:.: . . . : ::::: .::::.::
NP_004 AEIDLLIIGSKVDMNDFWENSEWEIIDASGYKHDIKYNCCEEIYTDITYSFYIRRLPMFY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 TLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVIEEIIPSSSKVIPLI
:. :::::: .::::::::::::: :::..: :::.::::::::: : :::.: :.::.
NP_004 TINLIIPCLFISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVVPLV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 GEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQKLPKLLCMKDHVDRY
:::::: ::::::::.:::::.:.:.:. .: : : ::: .::. ::..: :. .:.
NP_004 GEYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTT-HTMPRWVKTVFLKLLPQVLLMRWPLDKT
310 320 330 340 350 360
360 370 380
pF1KE4 SS------PEKEESQPVVKGKV------------LEKKKQKQLSDGEKVLV---------
. :. .:. :::. .. .:...:. ... :
NP_004 RGTGSDAVPRGLARRPA-KGKLASHGEPRHLKECFHCHKSNELATSKRRLSHQPLQWVVE
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 -----AFLEKAADSIRYISRHVKKEHFISQVVQDWKFVAQVLDRIFLWLFLIVSVTGSVL
.: . .:...:....:... ..: .:::.::.:.::.:::.:.:: : :..
NP_004 NSEHSPEVEDVINSVQFIAENMKSHNETKEVEDDWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTAG
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450
pF1KE4 IFTPALKMWLHSYH
.: :
NP_004 LFLQPLLGNTGKS
490
>>NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylchol (489 aa)
initn: 1300 init1: 722 opt: 1291 Z-score: 1539.4 bits: 294.2 E(85289): 5.3e-79
Smith-Waterman score: 1291; 53.0% identity (77.9% similar) in 366 aa overlap (3-366:15-369)
10 20 30 40
pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWVRPVL
: ..:.:.. .: . .. : : :...::. :.. .:::
NP_001 MGSGPLSLPLALSPPRLLLLLLLSLLPVARAS------EAEHRLFERLFEDYNEIIRPVA
10 20 30 40 50
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pF1KE4 HSNDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIKVPSE
. .: . ..: ...:::: ::: ::.: ::.:::: :.:.::.:::.:::: . ..::..
NP_001 NVSDPVIIHFEVSMSQLVKVDEVNQIMETNLWLKQIWNDYKLKWNPSDYGGAEFMRVPAQ
60 70 80 90 100 110
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pF1KE4 SLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDRQNCS
..: :::::..:: : :. . ::...: .: :.: ::: .:::: .:::.:::: :::.
NP_001 KIWKPDIVLYNNAVGDFQVDDKTKALLKYTGEVTWIPPAIFKSSCKIDVTYFPFDYQNCT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 MKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS--YPFITYS
::::::.:: . .::.::. ... ::....::: :..: :.: . . . :: ::::
NP_001 MKFGSWSYDKAKIDLVLIGSSMNLKDYWESGEWAIIKAPGYKHDIKYNCCEEIYPDITYS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 FVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVIEEII
. .::::::::. :::::: .::::::::::::: :::..: :::.::::::::: : :
NP_001 LYIRRLPLFYTINLIIPCLLISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETI
240 250 260 270 280 290
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pF1KE4 PSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQKLPKL
::.: ::::::::::: ::::::::..::::.:::.:. .: : : ::: .::. ::..
NP_001 PSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHYRTPTT-HTMPSWVKTVFLNLLPRV
300 310 320 330 340 350
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pF1KE4 LCMKDHVDRYSSPEKEESQPVVKGKVLEKKKQKQLSDGEKVLVAFLEKAADSIRYISRHV
. : : .: : . ..:
NP_001 MFMT----RPTSNEGNAQKPRPLYGAELSNLNCFSRAESKGCKEGYPCQDGMCGYCHHRR
360 370 380 390 400
>>NP_000734 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylcholine (505 aa)
initn: 1442 init1: 722 opt: 1291 Z-score: 1539.2 bits: 294.2 E(85289): 5.4e-79
Smith-Waterman score: 1380; 45.3% identity (71.7% similar) in 488 aa overlap (3-446:15-495)
10 20 30 40
pF1KE4 MLPDFMLVLIVLGIPSSATTGFNSIAENEDALLRHLFQGYQKWVRPVL
: ..:.:.. .: . .. : : :...::. :.. .:::
NP_000 MGSGPLSLPLALSPPRLLLLLLLSLLPVARAS------EAEHRLFERLFEDYNEIIRPVA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 HSNDTIKVYFGLKISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWTDHKLRWNPDDYGGIHSIKVPSE
. .: . ..: ...:::: ::: ::.: ::.:::: :.:.::.:::.:::: . ..::..
NP_000 NVSDPVIIHFEVSMSQLVKVDEVNQIMETNLWLKQIWNDYKLKWNPSDYGGAEFMRVPAQ
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 SLWLPDIVLFENADGRFEGSLMTKVIVKSNGTVVWTPPASYKSSCTMDVTFFPFDRQNCS
..: :::::..:: : :. . ::...: .: :.: ::: .:::: .:::.:::: :::.
NP_000 KIWKPDIVLYNNAVGDFQVDDKTKALLKYTGEVTWIPPAIFKSSCKIDVTYFPFDYQNCT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 MKFGSWTYDGTMVDLILINENVDRKDFFDNGEWEILNAKGMKGNRRDGVYS--YPFITYS
::::::.:: . .::.::. ... ::....::: :..: :.: . . . :: ::::
NP_000 MKFGSWSYDKAKIDLVLIGSSMNLKDYWESGEWAIIKAPGYKHDIKYNCCEEIYPDITYS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 FVLRRLPLFYTLFLIIPCLGLSFLTVLVFYLPSDEGEKLSLSTSVLVSLTVFLLVIEEII
. .::::::::. :::::: .::::::::::::: :::..: :::.::::::::: : :
NP_000 LYIRRLPLFYTINLIIPCLLISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 PSSSKVIPLIGEYLLFIMIFVTLSIIVTVFVINVHHRSSSTYHPMAPWVKRLFLQKLPKL
::.: ::::::::::: ::::::::..::::.:::.:. .: : : ::: .::. ::..
NP_000 PSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHYRTPTT-HTMPSWVKTVFLNLLPRV
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KE4 LCMK--------------------DHVDRYSSPEKE---ESQPVVKG----------KV-
. : .... .: :.. :. : : :.
NP_000 MFMTRPTSNEGNAQKPRPLYGAELSNLNCFSRAESKGCKEGYPCQDGMCGYCHHRRIKIS
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420
pF1KE4 -----LEKKKQKQLSDGEKVLVAF---LEKAADSIRYISRHVKKEHFISQVVQDWKFVAQ
: ...... :. : :. ...: .:..::....: .. ... .:::.::.
NP_000 NFSANLTRSSSSESVDAVLSLSALSPEIKEAIQSVKYIAENMKAQNEAKEIQDDWKYVAM
420 430 440 450 460 470
430 440 450
pF1KE4 VLDRIFLWLFLIVSVTGSVLIFTPALKMWLHSYH
:.::::::.: .: . :.. .:
NP_000 VIDRIFLWVFTLVCILGTAGLFLQPLMAREDA
480 490 500
458 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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