FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6147, 596 aa 1>>>pF1KB6147 596 - 596 aa - 596 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.3429+/-0.000465; mu= -13.9720+/- 0.028 mean_var=431.8784+/-91.904, 0's: 0 Z-trim(120.7): 57 B-trim: 533 in 2/56 Lambda= 0.061715 statistics sampled from 36111 (36178) to 36111 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.748), E-opt: 0.2 (0.424), width: 16 Scan time: 12.690 The best scores are: opt bits E(85289) XP_011542685 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 3894 361.4 4.8e-99 XP_011542688 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 3894 361.4 4.8e-99 XP_011542687 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 3894 361.4 4.8e-99 NP_066300 (OMIM: 133239,606551) leucine zipper put ( 596) 3894 361.4 4.8e-99 XP_005273451 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 3894 361.4 4.8e-99 XP_011542686 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 3894 361.4 4.8e-99 NP_001305029 (OMIM: 610454) leucine zipper putativ ( 669) 673 74.7 1.1e-12 NP_115805 (OMIM: 610454) leucine zipper putative t ( 669) 673 74.7 1.1e-12 NP_001305028 (OMIM: 610454) leucine zipper putativ ( 669) 673 74.7 1.1e-12 XP_016872269 (OMIM: 610454) PREDICTED: leucine zip ( 669) 673 74.7 1.1e-12 XP_005270279 (OMIM: 610454) PREDICTED: leucine zip ( 669) 673 74.7 1.1e-12 XP_011527709 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 682) 604 68.6 8e-11 NP_001305030 (OMIM: 610454) leucine zipper putativ ( 449) 579 66.2 2.7e-10 XP_016872270 (OMIM: 610454) PREDICTED: leucine zip ( 449) 579 66.2 2.7e-10 XP_005260949 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 673) 562 64.8 1.1e-09 XP_005260950 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 673) 562 64.8 1.1e-09 XP_011527710 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 703) 562 64.8 1.1e-09 XP_005260947 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 703) 562 64.8 1.1e-09 XP_011527711 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 703) 562 64.8 1.1e-09 NP_001269462 (OMIM: 610484) leucine zipper putativ ( 627) 351 46.0 0.00045 >>XP_011542685 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leucine (596 aa) initn: 3894 init1: 3894 opt: 3894 Z-score: 1899.2 bits: 361.4 E(85289): 4.8e-99 Smith-Waterman score: 3894; 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100.0% identity (100.0% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-596) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MGSVSSLISGHSFHSKHCRASQYKLRKSSHLKKLNRYSDGLLRFGFSQDSGHGKSSSKMG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 MGSVSSLISGHSFHSKHCRASQYKLRKSSHLKKLNRYSDGLLRFGFSQDSGHGKSSSKMG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 KSEDFFYIKVSQKARGSHHPDYTALSSGDLGGQAGVDFDPSTPPKLMPFSNQLEMGSEKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 KSEDFFYIKVSQKARGSHHPDYTALSSGDLGGQAGVDFDPSTPPKLMPFSNQLEMGSEKG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 AVRPTAFKPVLPRSGAILHSSPESASHQLHPAPPDKPKEQELKPGLCSGALSDSGRNSMS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 AVRPTAFKPVLPRSGAILHSSPESASHQLHPAPPDKPKEQELKPGLCSGALSDSGRNSMS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 SLPTHSTSSSYQLDPLVTPVGPTSRFGGSAHNITQGIVLQDSNMMSLKALSFSDGGSKLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 SLPTHSTSSSYQLDPLVTPVGPTSRFGGSAHNITQGIVLQDSNMMSLKALSFSDGGSKLG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 HSNKADKGPSCVRSPISTDECSIQELEQKLLEREGALQKLQRSFEEKELASSLAYEERPR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 HSNKADKGPSCVRSPISTDECSIQELEQKLLEREGALQKLQRSFEEKELASSLAYEERPR 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 RCRDELEGPEPKGGNKLKQASQKSQRAQQVLHLQVLQLQQEKRQLRQELESLMKEQDLLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 RCRDELEGPEPKGGNKLKQASQKSQRAQQVLHLQVLQLQQEKRQLRQELESLMKEQDLLE 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 TKLRSYEREKTSFGPALEETQWEVCQKSGEISLLKQQLKESQTEVNAKASEILGLKAQLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 TKLRSYEREKTSFGPALEETQWEVCQKSGEISLLKQQLKESQTEVNAKASEILGLKAQLK 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 DTRGKLEGLELRTQDLEGALRTKGLELEVCENELQRKKNEAELLREKVNLLEQELQELRA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 DTRGKLEGLELRTQDLEGALRTKGLELEVCENELQRKKNEAELLREKVNLLEQELQELRA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 QAALARDMGPPTFPEDVPALQRELERLRAELREERQGHDQMSSGFQHERLVWKEEKEKVI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 QAALARDMGPPTFPEDVPALQRELERLRAELREERQGHDQMSSGFQHERLVWKEEKEKVI 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB6 QYQKQLQQSYVAMYQRNQRLEKALQQLARGDSAGEPLEVDLEGADIPYEDIIATEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 QYQKQLQQSYVAMYQRNQRLEKALQQLARGDSAGEPLEVDLEGADIPYEDIIATEI 550 560 570 580 590 >>XP_011542686 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leucine (596 aa) initn: 3894 init1: 3894 opt: 3894 Z-score: 1899.2 bits: 361.4 E(85289): 4.8e-99 Smith-Waterman score: 3894; 100.0% identity (100.0% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-596) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MGSVSSLISGHSFHSKHCRASQYKLRKSSHLKKLNRYSDGLLRFGFSQDSGHGKSSSKMG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MGSVSSLISGHSFHSKHCRASQYKLRKSSHLKKLNRYSDGLLRFGFSQDSGHGKSSSKMG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 KSEDFFYIKVSQKARGSHHPDYTALSSGDLGGQAGVDFDPSTPPKLMPFSNQLEMGSEKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KSEDFFYIKVSQKARGSHHPDYTALSSGDLGGQAGVDFDPSTPPKLMPFSNQLEMGSEKG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 AVRPTAFKPVLPRSGAILHSSPESASHQLHPAPPDKPKEQELKPGLCSGALSDSGRNSMS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 AVRPTAFKPVLPRSGAILHSSPESASHQLHPAPPDKPKEQELKPGLCSGALSDSGRNSMS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 SLPTHSTSSSYQLDPLVTPVGPTSRFGGSAHNITQGIVLQDSNMMSLKALSFSDGGSKLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SLPTHSTSSSYQLDPLVTPVGPTSRFGGSAHNITQGIVLQDSNMMSLKALSFSDGGSKLG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 HSNKADKGPSCVRSPISTDECSIQELEQKLLEREGALQKLQRSFEEKELASSLAYEERPR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 HSNKADKGPSCVRSPISTDECSIQELEQKLLEREGALQKLQRSFEEKELASSLAYEERPR 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 RCRDELEGPEPKGGNKLKQASQKSQRAQQVLHLQVLQLQQEKRQLRQELESLMKEQDLLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 RCRDELEGPEPKGGNKLKQASQKSQRAQQVLHLQVLQLQQEKRQLRQELESLMKEQDLLE 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 TKLRSYEREKTSFGPALEETQWEVCQKSGEISLLKQQLKESQTEVNAKASEILGLKAQLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TKLRSYEREKTSFGPALEETQWEVCQKSGEISLLKQQLKESQTEVNAKASEILGLKAQLK 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 DTRGKLEGLELRTQDLEGALRTKGLELEVCENELQRKKNEAELLREKVNLLEQELQELRA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 DTRGKLEGLELRTQDLEGALRTKGLELEVCENELQRKKNEAELLREKVNLLEQELQELRA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 QAALARDMGPPTFPEDVPALQRELERLRAELREERQGHDQMSSGFQHERLVWKEEKEKVI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 QAALARDMGPPTFPEDVPALQRELERLRAELREERQGHDQMSSGFQHERLVWKEEKEKVI 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB6 QYQKQLQQSYVAMYQRNQRLEKALQQLARGDSAGEPLEVDLEGADIPYEDIIATEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 QYQKQLQQSYVAMYQRNQRLEKALQQLARGDSAGEPLEVDLEGADIPYEDIIATEI 550 560 570 580 590 >>NP_001305029 (OMIM: 610454) leucine zipper putative tu (669 aa) initn: 1122 init1: 541 opt: 673 Z-score: 348.6 bits: 74.7 E(85289): 1.1e-12 Smith-Waterman score: 1080; 39.3% identity (62.1% similar) in 657 aa overlap (3-596:28-669) 10 20 30 pF1KB6 MGSVSSLISGHSFHSKHCRASQYKLRKSSHL-KKL :::::::: . : .. :. . . NP_001 MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISG-----RPCPGGPAPPRHHGPPGPTF 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 pF1KB6 NRYSDGLLRFGF-SQDS-GHGKSSSKMGKSEDFFYIKVSQKARGSHHPDYTALSSGDLGG : .::::: :. .:. . : .: ::. . .... :. . .. . . NP_001 FRQQDGLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRA 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 pF1KB6 QAGVDFDPSTPPKLMPFSNQLEMGSEKGAVRPTAFKPVLPR------------------S . . : ::::.: :..:: . :: .::::::::::. : NP_001 HNAHLRGP--PPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLS 120 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 pF1KB6 GAI-----LHSSPESASHQLHPAPP-DKPKEQELKPGLC-SGALSDSGRNSMSSLPTHST :. : ..: :.: . . ::: . : ::.::::::::.:::::.:: NP_001 GSQGSLTQLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYST 180 190 200 210 220 230 190 200 210 220 230 pF1KB6 SSSYQLDPLVTPVG---PTSRFG-----GSAHNITQGIVLQDSNMMSLKALSFSDGG--- ... .: .. : :. : : :... : .::. : . . : :: NP_001 GGA---EPTTSSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVA 240 250 260 270 280 290 240 250 260 270 280 pF1KB6 -SKLGHSNKADK-GPSC-VRSPIS-----TDECSIQE-LEQKLLEREGALQKLQRSFEEK . :: ...:. . :: ::: .:: .. :: :: .::. ::.:. :..:. NP_001 GGLLGSGTRASPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDEN 300 310 320 330 340 350 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 ELASSLAYEERPRRCRDELEGPEPKGGNKLKQASQKSQRAQQVLHLQVLQLQQEKRQLRQ : . ::::: :. . : :. . . :: :..:::::.:.:::.:::::::::.. NP_001 EATMCQAYEERQRHWQREREALRE---DCAAQA-QRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQD 360 370 380 390 400 350 360 370 380 390 400 pF1KB6 ELESLMKEQDLLETKLRSYEREKTSFGPALEETQWEVCQKSGEISLLKQQLKESQTEVNA .. .:..:.. :: . . :::. .:: ::::.:::::::::::::::::::::.:. NP_001 DFAQLLQEREQLERRCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQ 410 420 430 440 450 460 410 420 430 440 450 460 pF1KB6 KASEILGLKAQLKDTRGKLEGLELRTQDLEGALRTKGLELEVCENELQRKKNEAELLREK :.::...:.. :...:. :. : :.. :. : :.. ::::.: .::::...::: :::: NP_001 KGSELVALRVALREARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREK 470 480 490 500 510 520 470 480 490 500 510 pF1KB6 VNLLEQELQELRAQAALARDMGPPTFPE-DVPALQR-----------ELERLRAEL-REE .. :. : :: . : . : : .:: ..::::.:: ::. 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