FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5324, 299 aa 1>>>pF1KE5324 299 - 299 aa - 299 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3557+/-0.000984; mu= 15.0294+/- 0.059 mean_var=73.8423+/-16.773, 0's: 0 Z-trim(104.9): 55 B-trim: 456 in 1/50 Lambda= 0.149253 statistics sampled from 8063 (8116) to 8063 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16 Scan time: 2.110 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 2031 446.8 9.2e-126 CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 484 113.7 1.8e-25 CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 469 110.5 1.6e-24 CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 462 109.0 4.7e-24 CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 442 104.7 9.4e-23 CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 427 101.4 8.8e-22 CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 416 99.1 4.4e-21 CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 415 98.9 5.4e-21 CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 412 98.2 8.1e-21 CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 403 96.3 3.2e-20 CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 402 96.0 3.6e-20 CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 399 95.4 5.9e-20 CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 398 95.2 6.4e-20 CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 395 94.5 1e-19 CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 356 86.1 3.6e-17 CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 353 85.5 5.5e-17 CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 329 80.3 1.9e-15 CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 314 77.1 1.9e-14 CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 307 75.6 5.7e-14 CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 264 66.3 3.2e-11 CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 263 66.1 3.9e-11 >>CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 (299 aa) initn: 2031 init1: 2031 opt: 2031 Z-score: 2371.3 bits: 446.8 E(32554): 9.2e-126 Smith-Waterman score: 2031; 100.0% identity (100.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LIILDLSLFPLFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYLWLKQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 LIILDLSLFPLFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYLWLKQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RAYNLSLWCLLGYFIINLLLTVQIGLTFYHPPQGNSSIRYPFESWQYLYAFQLNSGSYLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 RAYNLSLWCLLGYFIINLLLTVQIGLTFYHPPQGNSSIRYPFESWQYLYAFQLNSGSYLP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLLHLVYIMASPF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 LVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLLHLVYIMASPF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 SITSKTYPPDLTSVFIWETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILWKTVCARRCWGP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 SITSKTYPPDLTSVFIWETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILWKTVCARRCWGP 250 260 270 280 290 >>CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 (307 aa) initn: 455 init1: 222 opt: 484 Z-score: 570.9 bits: 113.7 E(32554): 1.8e-25 Smith-Waterman score: 484; 30.8% identity (64.9% similar) in 302 aa overlap (1-295:1-300) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW :: . :....:.: : ..:..::: . . . . : . :. ..:. ::: :..: : CCDS86 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCID-CAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIW 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE5 LIILD--LSLF-P-LFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYL .:: : ...: : .. :. ..:.: :::. .:.:.:::: ::.:: ::..:. .: CCDS86 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKQRAYNLSLWCLLGYFIINLLLT-VQIGLTFYHPPQGNSSIR--YPFESWQYLYAFQL :::.:. :. : .. ...:. ::. . :. . :... ..: .. . : CCDS86 WLKSRT-NMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILNDYKTKNDTVWDLNMYKSEYFIKQILL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 NSGSYLPLVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLLHLV : : . ... :.. .::.::. :...:. . .: :: ..::. :.: : :..: .. CCDS86 NLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISFIILFIL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 YIMASPFSITSKTYPPDLTSVFIWETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILWKTVCA :... . :. : . ... : : :: ::.:::.: ..::. ..: . : CCDS86 YFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVLQQLKCC 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 RRCWGP .. CCDS86 EKRKNLRVT 300 >>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa) initn: 453 init1: 176 opt: 469 Z-score: 553.5 bits: 110.5 E(32554): 1.6e-24 Smith-Waterman score: 469; 31.7% identity (62.4% similar) in 306 aa overlap (1-295:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW : :: ... :: ..::.:: ..:: .:. . .:. : . :: . ... :: :. : : CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LII----LDLSLFPLFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYL :. : : . .: :. :: . . :.. .. .::.::..:.:: ::..:. ::.: CCDS86 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKQRAYNLSLWCLLGYFIINLLLTVQIGL---TFYHPPQGNSSIRYP---FESWQYLYA .:: :. .. : ::: ... .: .::.. . . :.. . ::... CCDS86 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSVK 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 FQLNSGSYLPLVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLL : .. : :..: ..: .:: :: : .::... :.:: :.:.: .::: . :::. CCDS86 FTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLLF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 pF1KE5 HLVYIMASPFSITSKTYPPDLTSVFIW-ETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILWK . ... .: :. : : ... ::. . :: ::..::.: ...:. . : CCDS86 YASFFLCVLISWISELYQN--TVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAK 250 260 270 280 290 290 pF1KE5 TVCARRCWGP : :.: CCDS86 -VWAKR 300 >>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 424 init1: 224 opt: 462 Z-score: 545.2 bits: 109.0 E(32554): 4.7e-24 Smith-Waterman score: 462; 29.4% identity (63.5% similar) in 299 aa overlap (1-292:1-299) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW :.: .. ...:: :..: ..:: ... .: :... . :: . :: .:: : : : CCDS86 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LIIL---DLSLFPLFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYLW .:.: . : : .. . . ..: :..... :.:.:: ::.:: ::..:.: . CCDS86 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LKQRAYNLSLWCLLG--YFIINLLLTVQIGLTFYHPP-QGNSSIRYPFESWQYLYAFQLN ::..: .. : .:: .:.. :. . .. . .:: . . ... ..: . . CCDS86 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 S-GSYLPLVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLLHLV .. .:... :.: .:: :: : :::..:. : .: .: :: ::... ::.: . CCDS86 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 YIMASPFSITSKTYPPDLTSVFIWETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILWKTVCA :.. .:. . . : ... ... :::.::.::: : .::: ..::...: CCDS86 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 RRCWGP CCDS86 AKGQNQSTP >>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 379 init1: 213 opt: 442 Z-score: 522.0 bits: 104.7 E(32554): 9.4e-23 Smith-Waterman score: 442; 31.8% identity (62.3% similar) in 302 aa overlap (8-297:8-300) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW .. .. :: :.:: ..:: ... . ::... . : . :. .:: : : : CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LIILD---LSLFPLFQSSRWLRYLSI-FWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYL ...:. : : :.: . .: . :..... : :.:: ::.:: ::..:. .: CCDS53 VLVLNWYATELNPAFNSIE-VRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 WLKQRAYNLSLWCLLG--YFIINLLLTVQIG-LTFYHPPQGNSSIRYPFESWQYLYAFQL ::.:. .. : ::: :.. :...... . . . .:: . . ..: .:: . CCDS53 HLKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 NS-GSYLPLVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLLHL . .. .:... :.: .:: :: : :::..:. : .: :.:: ::... :::: CCDS53 TILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 VY---IMASPFSITSKTYPPDLTSVFIW-ETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILW .: :. : .:. : : ::.. :.. .::: : .::: : ..::: ..:: CCDS53 IYFLSIIMSVWSFESLENKP----VFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLW 240 250 260 270 280 290 290 pF1KE5 KTVCARRCWGP .. : : CCDS53 HV----RYWVKGEKPSSS 300 >>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 386 init1: 203 opt: 427 Z-score: 504.5 bits: 101.4 E(32554): 8.8e-22 Smith-Waterman score: 427; 31.5% identity (63.3% similar) in 289 aa overlap (12-289:12-296) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW ..:: :.:: ..:: ... . ::... . : . :. .:: : : : CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LIILD---LSLFPLFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYLW ...:. : : :.: . .:..... : :.:: ::.:: ::..:. .: CCDS53 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LKQRAYNLSLWCLLG--YFIINLLLTVQIG-LTFYHPPQGNSSIRYPFESWQYLYAFQLN ::.:. .. : ::: :. :...... .. . .:: . . ..: .:. . .. CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 S-GSYLPLVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLLHLV .. .:... :.: .:: :: : :::..:. : .: .:.:: ::... :::: . CCDS53 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 pF1KE5 Y---IMASPFSITSKTYPPDLTSVFIW-ETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILWK : :: : .:. : : ::.. ... .:::.: .::: : ..::: ...:. CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKP----VFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQ 250 260 270 280 290 290 pF1KE5 TVCARRCWGP CCDS53 MRYWVKGEKTSSP 300 >>CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 (299 aa) initn: 436 init1: 236 opt: 416 Z-score: 491.9 bits: 99.1 E(32554): 4.4e-21 Smith-Waterman score: 416; 29.0% identity (60.0% similar) in 300 aa overlap (1-292:1-297) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW :: . : . .:.::..::.:.. :: .:: . . :.. . . .:.. :: :..:: CCDS38 MLESHLIIYFLLAVIQFLLGIFTNGIIVVVNGIDLIKHRKMAPLDLLLSCLAVSRIFLQL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LIILDLSLFPLFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYLWLKQ .:. . .: . ..... ::.::.:.:::: :... .: ..:::. CCDS38 FIFYVNVIVIFFIEFIMCSANCAILLFINELELWLATWLGVFYCAKVASVRHPLFIWLKM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 RAYNLSLWCLLGYFI-INLLLTVQIGLTFYHPP-------QGNSSIRYPFESWQYLYAFQ : .: : .:: .. .... . . . . : . :..:. :. . :. CCDS38 RISKLVPWMILGSLLYVSMICVFHSKYAGFMVPYFLRKFFSQNATIQK--EDTLAIQIFS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LNSGSYLPLVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLLHL . . .::..:: . .:: :: : ..:. :: : : :.:: :. ::.:.. 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