Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5468
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5468, 316 aa
1>>>pF1KE5468 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5580+/-0.00107; mu= 14.3520+/- 0.063
mean_var=70.3103+/-15.317, 0's: 0 Z-trim(103.1): 40 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.152955
statistics sampled from 7234 (7268) to 7234 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 1.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 2070 466.2 1.5e-131
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 844 195.6 4.2e-50
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 809 187.9 8.7e-48
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 793 184.4 1e-46
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 647 152.1 5.1e-37
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 642 151.0 1.1e-36
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 592 140.0 2.2e-33
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 585 138.5 6.6e-33
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 581 137.6 1.2e-32
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 572 135.6 4.8e-32
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 571 135.4 5.8e-32
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 550 130.7 1.4e-30
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 549 130.5 1.7e-30
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 524 125.0 7.3e-29
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 522 124.6 1e-28
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 521 124.3 1.1e-28
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 520 124.1 1.3e-28
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 496 118.8 5.8e-27
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 471 113.3 2.6e-25
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 458 110.4 1.9e-24
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 448 108.3 9e-24
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 444 107.3 1.5e-23
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 427 103.6 2e-22
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 356 87.9 1e-17
>>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 2070 init1: 2070 opt: 2070 Z-score: 2475.1 bits: 466.2 E(32554): 1.5e-131
Smith-Waterman score: 2070; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
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CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVMLR
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CCDS58 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVMLR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 CESGHLKPGSKGPIFS
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CCDS58 CESGHLKPGSKGPIFS
310
>>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa)
initn: 824 init1: 476 opt: 844 Z-score: 1012.9 bits: 195.6 E(32554): 4.2e-50
Smith-Waterman score: 844; 44.6% identity (74.7% similar) in 296 aa overlap (1-293:1-294)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
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CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
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CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFR-GIEATR--NVTEHFRKKRSE
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CCDS86 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSV--FISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQ
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIIL
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CCDS86 HASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVV
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CCDS86 SFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 MLRCESGHLKPGSKGPIFS
CCDS86 VIWKVMSILKGRKFQQHKQI
300 310
>>CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 864 init1: 410 opt: 809 Z-score: 971.4 bits: 187.9 E(32554): 8.7e-48
Smith-Waterman score: 809; 41.0% identity (75.1% similar) in 305 aa overlap (1-301:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
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CCDS86 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
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CCDS86 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLG----ALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRS
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CCDS86 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKH---KRNITEMFHVSKI
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EYYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRII
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CCDS86 PYFEPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LSFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFV
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CCDS86 TSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VMLRCESGHLKPGSKGPIFS
:: :
CCDS86 RMLTCRKIACMI
300
>>CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 783 init1: 429 opt: 793 Z-score: 952.2 bits: 184.4 E(32554): 1e-46
Smith-Waterman score: 793; 38.9% identity (74.9% similar) in 311 aa overlap (1-308:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
: . :....:: . ..:.:: : :: ::: .:.: . .:: :.:. .::. :: :::
CCDS86 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
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CCDS86 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
::: ....::. .:::..:.: .. :. : .:. . .:.: .:. .. .
CCDS86 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPK-NDDMWYHLFK-VSHEENITWKFKVSKIPGTF
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF
.. .: . :.:. : :. ::.::: :::.:. ..:. :::.:::: :::. .. :.
CCDS86 KQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIFL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVMLR
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CCDS86 LLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKMLR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 ---CESGHLKPGSKGPIFS
: . ::
CCDS86 FVKCFLRRRKPFVP
300 310
>>CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 (314 aa)
initn: 606 init1: 586 opt: 647 Z-score: 778.1 bits: 152.1 E(32554): 5.1e-37
Smith-Waterman score: 647; 38.1% identity (69.0% similar) in 310 aa overlap (8-313:8-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
.::::. ..: ...: : :: ::: : .:.... .:::.: ::. : :
CCDS31 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
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CCDS31 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
::.::.. ..: .:. .:.: ::. :. . .. .: :.: .. .... :
CCDS31 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLI--FDSLVLEI-FIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDK
130 140 150 160 170
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pF1KE5 IHVLGTLWYLP---PLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIIL
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CCDS31 LSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SFFFLFLLYFLAFLIASFGNF-LPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFV
::.:::...:... .:.. : : ..: :.. ... : :. ::::::::::::.:: :
CCDS31 SFLFLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAF-PSCHSFILILGNSKLQQTAV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VMLRCESGHLKPGSKGPIFS
.: ::. .: :
CCDS31 RLL----WHLRNYTKTPNPLPL
300 310
>>CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 (307 aa)
initn: 634 init1: 316 opt: 642 Z-score: 772.3 bits: 151.0 E(32554): 1.1e-36
Smith-Waterman score: 642; 39.5% identity (70.4% similar) in 304 aa overlap (1-301:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
:. ..::.:... .. ..:.: : :: ::: . :.: .: ::.: ::. ::.:.
CCDS86 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNK-LSTIGFILTGLAISRIFLIW
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
::.::.:. :::: . :: ... :. :.. :. :.:.:: :...: ::::.::. ::
CCDS86 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
::: :.. :. .:.. ::.: ::.: . ... .. ... . .:::..
CCDS86 WLKSRTNMVLPFMIV-FLLIS-----SLLNFAYIAKILNDYKTKNDTVWDLNMYKSEYFI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF
..: .: . . .:: . .::.:: ::.::: .: :. :: .:::: .:.....::.
CCDS86 KQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISFI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE5 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQ-TFVVM-
.::.:::... : . ..:. :.: . : .:: ::::::::::::::: .. :.
CCDS86 ILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVLQ
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 -LRCESGHLKPGSKGPIFS
:.:
CCDS86 QLKCCEKRKNLRVT
300
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
initn: 528 init1: 295 opt: 592 Z-score: 712.7 bits: 140.0 E(32554): 2.2e-33
Smith-Waterman score: 592; 35.7% identity (66.3% similar) in 300 aa overlap (1-298:1-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
: . ..: .. ..: .: : : :: :.: .: . ...: : .. ::. :: :.
CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
::.. :: :: ..:. :: .::...:::: ....: ::::::: :.::
CCDS86 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
.:::::..:.. .:::.:.. . .. ..: . . : ::.: .: . : .
CCDS86 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDW--LDRYE--RNTTWNFSMSDFETFS
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 IHV--LGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILS
. : :.. : :. :.. :. :::::: .: ..: : . ::: :..: :..:..:
CCDS86 VSVKFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVIS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVM
:.... .:: :: :. . : .. . :. :.. .: :..:::.:::::.::.:.:...
CCDS86 FLLFYASFFLCVLI-SWISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LRCESGHLKPGSKGPIFS
CCDS86 AAKVWAKR
300
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]