Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9573
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9573, 474 aa
1>>>pF1KE9573 474 - 474 aa - 474 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8412+/-0.000998; mu= 14.6471+/- 0.060
mean_var=69.1308+/-14.418, 0's: 0 Z-trim(104.4): 83 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.154255
statistics sampled from 7923 (8007) to 7923 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 1.340
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS5631.1 CALCR gene_id:799|Hs109|chr7 ( 474) 3309 745.8 2.3e-215
CCDS55125.1 CALCR gene_id:799|Hs109|chr7 ( 508) 2048 465.2 7.5e-131
CCDS2293.1 CALCRL gene_id:10203|Hs109|chr2 ( 461) 1872 426.0 4.2e-119
CCDS56478.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs109|chr7 ( 438) 784 183.9 3.1e-46
CCDS5429.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs109|chr7 ( 411) 772 181.2 1.9e-45
CCDS56477.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs109|chr7 ( 397) 771 181.0 2.1e-45
CCDS2698.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs109|chr3 ( 457) 766 179.9 5.2e-45
CCDS58828.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs109|chr3 ( 416) 764 179.4 6.5e-45
CCDS58827.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs109|chr3 ( 409) 757 177.8 1.9e-44
CCDS75576.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs109|chr7 ( 387) 748 175.8 7.2e-44
CCDS56481.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs109|chr7 ( 447) 745 175.2 1.3e-43
CCDS42350.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs109|chr17 ( 415) 716 168.7 1.1e-41
CCDS2127.1 SCTR gene_id:6344|Hs109|chr2 ( 440) 684 161.6 1.6e-39
CCDS45714.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs109|chr17 ( 375) 652 154.5 1.9e-37
CCDS5433.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs109|chr7 ( 468) 645 152.9 6.8e-37
CCDS77049.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs109|chr17 ( 314) 632 150.0 3.5e-36
CCDS12671.1 GIPR gene_id:2696|Hs109|chr19 ( 466) 629 149.4 7.9e-36
CCDS5432.1 GHRHR gene_id:2692|Hs109|chr7 ( 423) 606 144.2 2.5e-34
CCDS45713.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs109|chr17 ( 401) 600 142.9 6.1e-34
CCDS5950.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs109|chr7 ( 438) 600 142.9 6.6e-34
CCDS45712.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs109|chr17 ( 444) 571 136.5 5.8e-32
CCDS2747.1 PTH1R gene_id:5745|Hs109|chr3 ( 593) 570 136.3 8.9e-32
CCDS82367.1 GIPR gene_id:2696|Hs109|chr19 ( 430) 563 134.7 2e-31
CCDS58556.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs109|chr17 ( 240) 531 127.5 1.6e-29
CCDS82565.1 PTH2R gene_id:5746|Hs109|chr2 ( 439) 526 126.4 6e-29
CCDS2383.1 PTH2R gene_id:5746|Hs109|chr2 ( 550) 526 126.5 7.3e-29
CCDS78295.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs109|chr7 ( 422) 523 125.8 9.2e-29
CCDS4839.1 GLP1R gene_id:2740|Hs109|chr6 ( 463) 468 113.5 4.8e-25
CCDS54177.1 GCGR gene_id:2642|Hs109|chr17 ( 477) 465 112.9 7.9e-25
CCDS56480.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs109|chr7 ( 496) 445 108.4 1.8e-23
CCDS11150.1 GLP2R gene_id:9340|Hs109|chr17 ( 553) 435 106.2 9.2e-23
CCDS58829.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs109|chr3 ( 247) 376 93.0 4e-19
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs109|chr12 ( 874) 383 94.7 4.2e-19
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs109|chr12 ( 906) 383 94.7 4.4e-19
CCDS12307.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs109|chr19 (1469) 313 79.2 3.3e-14
CCDS32928.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs109|chr19 (1474) 313 79.2 3.3e-14
CCDS58643.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs109|chr19 ( 709) 293 74.7 3.7e-13
CCDS58646.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs109|chr19 ( 745) 293 74.7 3.9e-13
CCDS12175.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs109|chr19 ( 886) 293 74.7 4.6e-13
CCDS74296.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs109|chr19 ( 526) 286 73.1 8.4e-13
CCDS74297.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs109|chr19 ( 600) 286 73.1 9.5e-13
CCDS12315.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs109|chr19 ( 652) 286 73.1 1e-12
CCDS76174.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs109|chr1 (1123) 288 73.6 1.2e-12
CCDS72811.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs109|chr1 (1177) 288 73.6 1.3e-12
CCDS689.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs109|chr1 (1403) 288 73.7 1.5e-12
CCDS81345.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs109|chr1 (1416) 288 73.7 1.5e-12
CCDS82926.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs109|chr4 (1240) 287 73.4 1.6e-12
CCDS54768.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs109|chr4 (1469) 287 73.4 1.8e-12
CCDS32931.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs109|chr19 ( 742) 273 70.2 8.5e-12
CCDS32930.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs109|chr19 ( 786) 273 70.2 9e-12
>>CCDS5631.1 CALCR gene_id:799|Hs109|chr7 (474 aa)
initn: 3309 init1: 3309 opt: 3309 Z-score: 3980.0 bits: 745.8 E(33420): 2.3e-215
Smith-Waterman score: 3309; 100.0% identity (100.0% similar) in 474 aa overlap (1-474:1-474)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MRFTFTSRCLALFLLLNHPTPILPAFSNQTYPTIEPKPFLYVVGRKKMMDAQYKCYDRMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MRFTFTSRCLALFLLLNHPTPILPAFSNQTYPTIEPKPFLYVVGRKKMMDAQYKCYDRMQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 QLPAYQGEGPYCNRTWDGWLCWDDTPAGVLSYQFCPDYFPDFDPSEKVTKYCDEKGVWFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QLPAYQGEGPYCNRTWDGWLCWDDTPAGVLSYQFCPDYFPDFDPSEKVTKYCDEKGVWFK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 HPENNRTWSNYTMCNAFTPEKLKNAYVLYYLAIVGHSLSIFTLVISLGIFVFFRSLGCQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HPENNRTWSNYTMCNAFTPEKLKNAYVLYYLAIVGHSLSIFTLVISLGIFVFFRSLGCQR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VTLHKNMFLTYILNSMIIIIHLVEVVPNGELVRRDPVSCKILHFFHQYMMACNYFWMLCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VTLHKNMFLTYILNSMIIIIHLVEVVPNGELVRRDPVSCKILHFFHQYMMACNYFWMLCE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 GIYLHTLIVVAVFTEKQRLRWYYLLGWGFPLVPTTIHAITRAVYFNDNCWLSVETHLLYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GIYLHTLIVVAVFTEKQRLRWYYLLGWGFPLVPTTIHAITRAVYFNDNCWLSVETHLLYI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 IHGPVMAALVVNFFFLLNIVRVLVTKMRETHEAESHMYLKAVKATMILVPLLGIQFVVFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IHGPVMAALVVNFFFLLNIVRVLVTKMRETHEAESHMYLKAVKATMILVPLLGIQFVVFP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 WRPSNKMLGKIYDYVMHSLIHFQGFFVATIYCFCNNEVQTTVKRQWAQFKIQWNQRWGRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 WRPSNKMLGKIYDYVMHSLIHFQGFFVATIYCFCNNEVQTTVKRQWAQFKIQWNQRWGRR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE9 PSNRSARAAAAAAEAGDIPIYICHQELRNEPANNQGEESAEIIPLNIIEQESSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PSNRSARAAAAAAEAGDIPIYICHQELRNEPANNQGEESAEIIPLNIIEQESSA
430 440 450 460 470
>>CCDS55125.1 CALCR gene_id:799|Hs109|chr7 (508 aa)
initn: 2048 init1: 2048 opt: 2048 Z-score: 2462.9 bits: 465.2 E(33420): 7.5e-131
Smith-Waterman score: 3267; 96.7% identity (96.7% similar) in 490 aa overlap (1-474:19-508)
10 20 30 40
pF1KE9 MRFTFTSRCLALFLLLNHPTPILPAFSNQTYPTIEPKPFLYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MQFSGEKISGQRDLQKSKMRFTFTSRCLALFLLLNHPTPILPAFSNQTYPTIEPKPFLYV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 VGRKKMMDAQYKCYDRMQQLPAYQGEGPYCNRTWDGWLCWDDTPAGVLSYQFCPDYFPDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VGRKKMMDAQYKCYDRMQQLPAYQGEGPYCNRTWDGWLCWDDTPAGVLSYQFCPDYFPDF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 DPSEKVTKYCDEKGVWFKHPENNRTWSNYTMCNAFTPEKLKNAYVLYYLAIVGHSLSIFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DPSEKVTKYCDEKGVWFKHPENNRTWSNYTMCNAFTPEKLKNAYVLYYLAIVGHSLSIFT
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200
pF1KE9 LVISLGIFVFFR----------------SLGCQRVTLHKNMFLTYILNSMIIIIHLVEVV
:::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LVISLGIFVFFRKLTTIFPLNWKYRKALSLGCQRVTLHKNMFLTYILNSMIIIIHLVEVV
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 PNGELVRRDPVSCKILHFFHQYMMACNYFWMLCEGIYLHTLIVVAVFTEKQRLRWYYLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PNGELVRRDPVSCKILHFFHQYMMACNYFWMLCEGIYLHTLIVVAVFTEKQRLRWYYLLG
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 WGFPLVPTTIHAITRAVYFNDNCWLSVETHLLYIIHGPVMAALVVNFFFLLNIVRVLVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 WGFPLVPTTIHAITRAVYFNDNCWLSVETHLLYIIHGPVMAALVVNFFFLLNIVRVLVTK
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 MRETHEAESHMYLKAVKATMILVPLLGIQFVVFPWRPSNKMLGKIYDYVMHSLIHFQGFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRETHEAESHMYLKAVKATMILVPLLGIQFVVFPWRPSNKMLGKIYDYVMHSLIHFQGFF
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 VATIYCFCNNEVQTTVKRQWAQFKIQWNQRWGRRPSNRSARAAAAAAEAGDIPIYICHQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VATIYCFCNNEVQTTVKRQWAQFKIQWNQRWGRRPSNRSARAAAAAAEAGDIPIYICHQE
430 440 450 460 470 480
450 460 470
pF1KE9 LRNEPANNQGEESAEIIPLNIIEQESSA
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LRNEPANNQGEESAEIIPLNIIEQESSA
490 500
>>CCDS2293.1 CALCRL gene_id:10203|Hs109|chr2 (461 aa)
initn: 1851 init1: 1851 opt: 1872 Z-score: 2251.9 bits: 426.0 E(33420): 4.2e-119
Smith-Waterman score: 1872; 57.8% identity (81.6% similar) in 445 aa overlap (8-449:4-442)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MRFTFTSRCLALFLLLNHPTPILPAFSNQTYPTIEPKPFLYV---VGRKKMMDAQYKCYD
.: ::.: :: : . .: .: . : :.:.: :::.::.
CCDS22 MEKKCTLYFLVL------LPFFMILVTAELEESPEDSIQLGVTRNKIMTAQYECYQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 RMQQLPAYQGEGPYCNRTWDGWLCWDDTPAGVLSYQFCPDYFPDFDPSEKVTKYCDEKGV
...: : :.:: ::::::::::::.:. ::. :.:.::::: :::::::::: ::. :
CCDS22 KIMQDPIQQAEGVYCNRTWDGWLCWNDVAAGTESMQLCPDYFQDFDPSEKVTKICDQDGN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 WFKHPENNRTWSNYTMCNAFTPEKLKNAYVLYYLAIVGHSLSIFTLVISLGIFVFFRSLG
::.:: .::::.:::.::. : ::.:.: :.::.:.::.::: .:.:::::: .:.::.
CCDS22 WFRHPASNRTWTNYTQCNVNTHEKVKTALNLFYLTIIGHGLSIASLLISLGIFFYFKSLS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 CQRVTLHKNMFLTYILNSMIIIIHLVEVVPNGELVRRDPVSCKILHFFHQYMMACNYFWM
:::.:::::.:.... ::.. ::::. :. : :: .:::::. .:.: :.:.::::::
CCDS22 CQRITLHKNLFFSFVCNSVVTIIHLTAVANNQALVATNPVSCKVSQFIHLYLMGCNYFWM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 LCEGIYLHTLIVVAVFTEKQRLRWYYLLGWGFPLVPTTIHAITRAVYFNDNCWLSVETHL
::::::::::::::::.:::.: :::.:::::::.:. ::::.:..:.:::::.: .:::
CCDS22 LCEGIYLHTLIVVAVFAEKQHLMWYYFLGWGFPLIPACIHAIARSLYYNDNCWISSDTHL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 LYIIHGPVMAALVVNFFFLLNIVRVLVTKMRETHEAESHMYLKAVKATMILVPLLGIQFV
:::::::. :::.::.::::::::::.::.. ::.:::..:.:::.::.::::::::.::
CCDS22 LYIIHGPICAALLVNLFFLLNIVRVLITKLKVTHQAESNLYMKAVRATLILVPLLGIEFV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 VFPWRPSNKMLGKIYDYVMHSLIHFQGFFVATIYCFCNNEVQTTVKRQWAQFKIQWNQRW
..:::: .:. ..:::.:: :.::::..:.::.:: :.:::. ..:.: :.:::... .
CCDS22 LIPWRPEGKIAEEVYDYIMHILMHFQGLLVSTIFCFFNGEVQAILRRNWNQYKIQFGNSF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 GRRPSNRSARAAAAAAEAGDIPIYICHQELRNEPANNQGEESAEIIPLNIIEQESSA
. . ::: .... : . : .: :
CCDS22 SNSEALRSASYTVSTISDGPGYSHDCPSEHLNGKSIHDIENVLLKPENLYN
420 430 440 450 460
>>CCDS56478.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs109|chr7 (438 aa)
initn: 661 init1: 227 opt: 784 Z-score: 943.7 bits: 183.9 E(33420): 3.1e-46
Smith-Waterman score: 787; 33.0% identity (62.2% similar) in 436 aa overlap (36-452:25-437)
10 20 30 40 50
pF1KE9 TSRCLALFLLLNHPTPILPAFSNQTYPTIEPKPFLYVVGRKKM--------MDAQYKCYD
: :. :..:...: . :: :.
CCDS56 MRGPSGPPGLLYVPHLLLCLLCLLPPPLQYAAGQSQMPKDQPLWALLEQY-CHT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 RMQQLPAYQGEGPYCNRTWDGW-LCWDDTPAGVLSYQFCPDYFPD--FDPSEKVTKYCDE
: : .: ::: : : :: . ::.: . ::.:: .. .... . : :
CCDS56 IMT-LTNLSGPYSYCNTTLDQIGTCWPRSAAGALVERPCPEYFNGVKYNTTRNAYRECLE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 KGVWFKHPENNRTWSNYTMCNAFTPEKLKNAYVLYYLAIV----GHSLSIFTLVISLGIF
.:.: . ::..:. . .: .. . : .:.: :: .:. .:: .. .:
CCDS56 NGTW-------ASKINYSQCEPILDDKQRKYDLHYRIALVVNYLGHCVSVAALVAAFLLF
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KE9 VFFRSLGCQRVTLHKNMFLTYIL-NSMIIIIHLVEVVPNGELVRRDPVSCKILHFFHQYM
. .::. : : ..: :.. :.:: : : ....::. :. . . : :. . . .:.
CCDS56 LALRSIRCLRNVIHWNLITTFILRNVMWFLLQLVD----HEVHESNEVWCRCITTIFNYF
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 MACNYFWMLCEGIYLHTLIVVAVFTEKQRLRWYYLLGWGFPLVPTTIHAITRAVYFNDNC
.. :.:::. :: :::: ::.. ::. : . ..:: .:. . :: . : :..:
CCDS56 VVTNFFWMFVEGCYLHTAIVMTYSTERLRKCLFLFIGWCIPFPIIVAWAIGKLYYENEQC
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 WLSVETHLL--YIIHGPVMAALVVNFFFLLNIVRVLVTKMRETHEAESHMYLKAVKATMI
:.. : : :: .::.. .:..:: ::.::::.:.::.: . .:. .: ::::::..
CCDS56 WFGKEPGDLVDYIYQGPIILVLLINFVFLFNIVRILMTKLRASTTSETIQYRKAVKATLV
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 LVPLLGIQFVVFPWRPSNKMLGKIYDYVMHSLIH-FQGFFVATIYCFCNNEVQTTVKRQW
:.::::: ...: :.. :..:. ..:... ::::::...::: :.::...:...:
CCDS56 LLPLLGITYMLFFVNPGEDDLSQIMFIYFNSFLQSFQGFFVSVFYCFFNGEVRSAVRKRW
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 AQFKIQWNQRWGRRPSNRSARAAAAAAEAGDIPIYICHQELRNEPANNQGEESAEIIPLN
.:: . : : : : . .. : : . ... :
CCDS56 --------HRWQDHHSLRVPMARAMSIPTS--PTRISFHSIKQTAAV
410 420 430
470
pF1KE9 IIEQESSA
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40 50 60 70 80
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: . ::.:: .. .... . : :.:.: .. ::..:. . .: .. .
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: .:.: :: .:. .:: .. .:. .::. : : ..: :.. :.:: : : ....:
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..:: .:. . :: . : :..::.. : : :: .::.. .:..:: ::.:::
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:.:.::.: . .:. .: ::::::..:.::::: ...: :.. :..:. ..:..
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. ::::::...::: :.::...:...: .:: . : : : : . .. :
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: . ... :
CCDS54 TRISFHSIKQTAAV
400 410
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....::. :. . . : :. . . .:... :.:::. :: :::: ::.. ::.
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: . ..:: .:. . :: . : :..::.. : : :: .::.. .:..::
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CCDS56 FLFNIVRILMTKLRASTTSETIQYRKAVKATLVLLPLLGITYMLFFVNPGEDDLSQIMFI
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..:... ::::::...::: :.::...:...: .:: . : : : : .
CCDS56 YFNSFLQSFQGFFVSVFYCFFNGEVRSAVRKRW--------HRWQDHHSLRVPMARAMSI
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.. : : . ... :
CCDS56 PTS--PTRISFHSIKQTAAV
380 390
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:......:::.... :.:.:. :.: . ....: : . ...:..:.::.:.....: .
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:.: . ... :. : :::: :: .::: :.:::. ..:.: ....: ::
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.. :.::. : :
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.. . .: . ...: .. .:..::. ::... .:. .::.: : : .: ..
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......:::.... :.:.:. :.: . ....: : . ...:..:.::.:.....: .
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. :.::. : :
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