FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9420, 337 aa 1>>>pF1KE9420 337 - 337 aa - 337 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1731+/-0.00105; mu= 16.9313+/- 0.062 mean_var=175.8025+/-63.959, 0's: 0 Z-trim(104.8): 363 B-trim: 1018 in 2/47 Lambda= 0.096730 statistics sampled from 7463 (8101) to 7463 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16 Scan time: 2.450 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 ( 337) 2286 332.1 4e-91 CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 1052 159.9 2.8e-39 CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 1025 156.1 3.8e-38 CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 ( 342) 1019 155.3 6.8e-38 CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 351) 973 148.9 5.9e-36 CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 306) 923 141.8 6.9e-34 CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 561 91.4 1.2e-18 CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 538 88.2 1.1e-17 CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 538 88.3 1.2e-17 CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 398 68.8 9.6e-12 CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 395 68.2 1.1e-11 CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 395 68.3 1.2e-11 CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 395 68.3 1.2e-11 CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 395 68.3 1.2e-11 CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 395 68.3 1.2e-11 CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 395 68.4 1.2e-11 >>CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 (337 aa) initn: 2286 init1: 2286 opt: 2286 Z-score: 1749.5 bits: 332.1 E(32554): 4e-91 Smith-Waterman score: 2286; 100.0% identity (100.0% similar) in 337 aa overlap (1-337:1-337) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS51 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAVS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 YFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS51 YFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCLT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 SIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS51 SIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRLS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 QWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTLSKSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS51 QWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTLSKSL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 AGAAKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFIWFAYFNSAC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS51 AGAAKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFIWFAYFNSAC 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 NPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS51 NPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE 310 320 330 >>CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 (348 aa) initn: 1100 init1: 690 opt: 1052 Z-score: 818.7 bits: 159.9 E(32554): 2.8e-39 Smith-Waterman score: 1052; 46.2% identity (75.5% similar) in 331 aa overlap (16-337:13-343) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQ-VNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV .::. :: :: .: .. : . ..: . . : .. ..::..: .:. CCDS75 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL .:: ::::::::. ::: ::...:. :.:.::.:::::::.::: :..:: .:: ::. CCDS75 LHFKQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRL .:.:::: ::.::. :. ::: ::.:::: :. :. .: ..:. ..:: . : . CCDS75 ASLFHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 SQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQI-TTLSK . . . :::.:: ::. : : : :::.: . :. .: :::.:: .::..: .: :. CCDS75 EELVVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLLFFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 SLAGA-------AKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFI . ... ::.:::::::::::.. .:. :::. .:...:. ..::::: :..:.. CCDS75 AQSSSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 WFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE : .:.::: ::.::.: :::: ::.:: .: ::. .. :..:..: CCDS75 WCVYYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD 300 310 320 330 340 >>CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 (345 aa) initn: 1037 init1: 699 opt: 1025 Z-score: 798.3 bits: 156.1 E(32554): 3.8e-38 Smith-Waterman score: 1025; 43.8% identity (74.9% similar) in 331 aa overlap (16-337:13-343) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MRAVFIQGAEEHPAAFCY-QVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV .:: .::::: . . : ....:.. . : .. :.::..: ... CCDS51 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL .:: ::.:::::. ::: ::...:. :.:.: .:.:::::.:: .: .:: :. :: CCDS51 LHFKQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRL .:.::::::::::. :. :::.::.:::: :. : ..: .: :.. .:: : . : CCDS51 SSLFHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 SQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQI-TTLSK . . . :.:.:: ..:. : .: ::.: .::: :: .::.:: :::..: .: :: CCDS51 EELSDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 SLAGA-------AKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFI . ... :..:::::::::..: ... :::..::...:... :::: ...: CCDS51 TESSSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICC 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 WFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE : ::.::: ::.::.. : :::::.:. .. .:.. .. :..:..: CCDS51 WCAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI 300 310 320 330 340 >>CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 (342 aa) initn: 1063 init1: 690 opt: 1019 Z-score: 793.8 bits: 155.3 E(32554): 6.8e-38 Smith-Waterman score: 1019; 44.1% identity (73.7% similar) in 331 aa overlap (16-337:12-342) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQ-VNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV .::. ::::: .: .. : ....: : . : :. :.::..: .: CCDS51 MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL .:: ::.:::::. ::: ::...:. :. .: .:.:::::.:: .: ::. :. :: CCDS51 LHFKQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRL .:..::::: :::. .. :::.: .:::: :. : ..: .: .:.. .:: : . : CCDS51 SSVLHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 SQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTLSKS . . . :::.::..... : ..: :::.: :.:: :: :::..: .:: .: : :.. CCDS51 EELVSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 LAGA--------AKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFI . .. ::.:::::::::..: ... :::.:.: ..:... :.:: ...: CCDS51 VESSSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICC 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 WFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE : ::.::: ::.::.. : :::::.:: :: :.. .. :..:. : CCDS51 WSAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE 300 310 320 330 340 >>CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (351 aa) initn: 976 init1: 566 opt: 973 Z-score: 759.0 bits: 148.9 E(32554): 5.9e-36 Smith-Waterman score: 973; 43.3% identity (75.6% similar) in 307 aa overlap (21-326:30-336) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLG : :::.. ..::.....: :....: ..: CCDS34 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 NVFVAFAVSYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHT :. . ...:::: ::::::::.::.:..:..::. ..: : :::::.::.:: .:... CCDS34 NLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 YLDTLFCLTSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLY .: .. .::::::: ..::: ::: :::: .:.:. : : .: :.::.:.. .. CCDS34 SFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 TDVVETRLSQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPL-FFVPCLIMISLYVKIFVVATRQA ... . . . : .:: ...::.:: : ::.: .:...: :::.:. ..: CCDS34 SEAYADGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHA 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 QQITTLSKSLAGAAKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIF . :..: .. . .:...::::::::..:..::::.: . ..: .:.: :: ..:: . CCDS34 HAINNLRENQNNQVKKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFSTPVVLFDAL 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 pF1KE9 IWFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE ::.::::.:::.:: : : :::.::: : :.:: CCDS34 TWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE 310 320 330 340 350 >>CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (306 aa) initn: 924 init1: 514 opt: 923 Z-score: 721.9 bits: 141.8 E(32554): 6.9e-34 Smith-Waterman score: 923; 43.6% identity (74.9% similar) in 291 aa overlap (37-326:1-291) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 QGAEEHPAAFCYQVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAVSYFKALH .: :....: ..::. . ...:::: :: CCDS51 MYSFMAGSIFITIFGNLAMIISISYFKQLH 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 TPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCLTSIFHLC ::::::.::.:..:..::. ..: : :::::.::.:: .:... .: .. .::::::: CCDS51 TPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYYSFDLMLSITSIFHLC 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 FISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRLSQWLEEM ..::: ::: :::: .:.:. : : .: :.::.:.. ..... . . . CCDS51 SVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVFSEAYADGIEGYDILV 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 PCVGSCQLLLNKFWGWLNFPL-FFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTLSKSLAGAAK : .:: ...::.:: : ::.: .:...: :::.:. ..:. :..: .. . .: CCDS51 ACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHAHAINNLRENQNNQVK 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 HERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFIWFAYFNSACNPIIY ...::::::::..:..::::.: . ..: .:.: :: ..:: . ::.::::.:::.:: CCDS51 KDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFSTPVVLFDALTWFGYFNSTCNPLIY 220 230 240 250 260 270 310 320 330 pF1KE9 VFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE : : :::.::: : :.:: CCDS51 GFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE 280 290 300 >>CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 (339 aa) initn: 762 init1: 440 opt: 561 Z-score: 448.5 bits: 91.4 E(32554): 1.2e-18 Smith-Waterman score: 893; 39.0% identity (71.5% similar) in 333 aa overlap (16-337:4-336) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQV-NGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV ::... : :: .. . .. .: . .: ..::..: .. CCDS51 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSI 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL :.:: ::::::.:. :.: .:..:: ::.: : .::.: ::.::. .:..:: : .. CCDS51 SHFKQLHTPTNWLIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSS 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRL .::::: ::::::. :.:::: : .:... : .:. .:.:::... ... .. CCDS51 ASIFHLSFISIDRYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGA 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 SQ-WLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPL-FFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTLS . . ... : :.:.....:. : :.: :..: ::. .: .:...: .::. :. . CCDS51 EEIYYKHVHCRGGCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLISDAN 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 pF1KE9 KSLA-------GAAK-HERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDI ..: : .. .::::.:::::..:..:.:: :: : :..: .::.: :: . :. CCDS51 QKLQIGLEMKNGISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLNDV 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 FIWFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE .:::.:.::. ::..:.: : :::::::. : :.:. .. :. : CCDS51 LIWFGYLNSTFNPMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS 290 300 310 320 330 >>CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 (359 aa) initn: 432 init1: 321 opt: 538 Z-score: 430.9 bits: 88.2 E(32554): 1.1e-17 Smith-Waterman score: 538; 35.7% identity (66.4% similar) in 283 aa overlap (34-313:18-296) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 VFIQGAEEHPAAFCYQVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAVSYFK ...: .. :. .:: : ::: : .::. . CCDS43 MAPNGTASSFCLDSTACKITITVVLAVLILITVAGNVVVCLAVGLNR 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 ALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCLTSIF :.. :: ...:::..:..:::::::.:.: .. : :: .: ..: ::...: .::. CCDS43 RLRNLTNCFIVSLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASIL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 HLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFT-VRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRLSQW .: .::.::.::. ::: :: : ::::. .: : . . : :: . . .. 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