FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5455, 310 aa 1>>>pF1KE5455 310 - 310 aa - 310 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1455+/-0.00119; mu= 10.8434+/- 0.069 mean_var=157.9685+/-52.373, 0's: 0 Z-trim(103.6): 377 B-trim: 449 in 1/48 Lambda= 0.102044 statistics sampled from 6992 (7468) to 6992 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16 Scan time: 2.000 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5149.1 OR2A4 gene_id:79541|Hs108|chr6 ( 310) 2052 314.8 5.3e-86 CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 ( 310) 2027 311.1 6.8e-85 CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 1610 249.7 2.1e-66 CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 1429 223.1 2.2e-58 CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 1429 223.1 2.2e-58 CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 1314 206.2 2.7e-53 CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 1264 198.8 4.5e-51 CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 1252 197.1 1.5e-50 CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 1232 194.1 1.2e-49 CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 899 145.1 6.7e-35 CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 871 141.0 1.2e-33 CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 870 140.9 1.4e-33 CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 868 140.6 1.7e-33 CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 866 140.2 1.9e-33 CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 857 138.9 4.8e-33 CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 857 138.9 5e-33 CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 856 138.7 5.4e-33 CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 855 138.6 6e-33 CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 854 138.5 6.6e-33 CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 854 138.5 6.6e-33 CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 854 138.5 6.7e-33 CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 852 138.2 8.2e-33 CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 851 138.0 9.1e-33 CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 849 137.7 1.1e-32 CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 848 137.6 1.2e-32 CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 843 136.8 2e-32 CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 842 136.7 2.3e-32 CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 841 136.5 2.5e-32 CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 840 136.4 2.8e-32 CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 839 136.2 3.1e-32 CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 838 136.1 3.4e-32 CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 836 135.8 4.2e-32 CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 835 135.6 4.6e-32 CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 835 135.7 4.7e-32 CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 834 135.5 5.1e-32 CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 833 135.4 5.7e-32 CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 833 135.4 5.7e-32 CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs108|chr9 ( 312) 829 134.8 8.5e-32 CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 829 134.8 8.7e-32 CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 828 134.6 9.6e-32 CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 827 134.5 1e-31 CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 826 134.3 1.2e-31 CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 825 134.2 1.3e-31 CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 825 134.2 1.3e-31 CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 824 134.0 1.4e-31 CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 823 133.9 1.6e-31 CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 822 133.8 1.8e-31 CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 821 133.6 1.9e-31 CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 821 133.6 2e-31 CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 821 133.6 2e-31 >>CCDS5149.1 OR2A4 gene_id:79541|Hs108|chr6 (310 aa) initn: 2052 init1: 2052 opt: 2052 Z-score: 1657.4 bits: 314.8 E(32554): 5.3e-86 Smith-Waterman score: 2052; 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CCDS10 FFLSNLSSLDLAFATSSVPQMLINLWGPGKTISYGGCITQLYVFLWLGATECILLVVMAF 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DLYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCE : :::.:.:::: :::. ..: ::: . :. :.:. .. : ::.: ... :.:: CCDS10 DRYVAVCRPLRYTAIMNPQLCWLLAVIACLGGLGNSVIQSTFTLQLPLCGHRRVEGFLCE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 ILAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVG-PLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFR . :..::::.:: .:. :: :. . ... ::: ::.:: : :.:.:.: : .:::: CCDS10 VPAMIKLACGDTSLNQA-VLNGVCTFFTAVPLSIIVISYCLIAQAVLKIRSAEGRRKAFN 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCFSHLCVIGLVYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKN ::.::: :. : ::.: :. : .. ..: :.. ::.:: .::.:::: .::: :::. CCDS10 TCLSHLLVVFLFYGSASYGYLLPAKNSKQDQGKFISLFYSLVTPMVNPLIYTLRNMEVKG 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 TLKRVLGVERAL .:.:.:: : CCDS10 ALRRLLGKGREVG 300 310 310 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 00:56:18 2016 done: Tue Nov 8 00:56:18 2016 Total Scan time: 2.000 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]