FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9551, 340 aa 1>>>pF1KE9551 340 - 340 aa - 340 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5160+/-0.000528; mu= 20.5402+/- 0.033 mean_var=91.2588+/-22.111, 0's: 0 Z-trim(108.4): 690 B-trim: 950 in 1/48 Lambda= 0.134257 statistics sampled from 15698 (16473) to 15698 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16 Scan time: 7.220 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001035269 (OMIM: 606111) melanin-concentrating ( 340) 2294 455.3 8.8e-128 NP_115892 (OMIM: 606111) melanin-concentrating hor ( 340) 2294 455.3 8.8e-128 NP_005288 (OMIM: 601751) melanin-concentrating hor ( 422) 733 153.0 1e-36 XP_005261778 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 599 127.1 6.7e-29 NP_001265616 (OMIM: 182453) somatostatin receptor ( 418) 599 127.1 6.7e-29 XP_016884412 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 599 127.1 6.7e-29 NP_001042 (OMIM: 182453) somatostatin receptor typ ( 418) 599 127.1 6.7e-29 XP_006724374 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 599 127.1 6.7e-29 XP_011528651 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 599 127.1 6.7e-29 XP_016884413 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostati ( 418) 599 127.1 6.7e-29 NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 588 124.9 2.7e-28 NP_001040 (OMIM: 182451) somatostatin receptor typ ( 391) 576 122.6 1.4e-27 NP_001043 (OMIM: 182454) somatostatin receptor typ ( 388) 534 114.5 4e-25 NP_001044 (OMIM: 182455) somatostatin receptor typ ( 364) 528 113.3 8.5e-25 NP_001166031 (OMIM: 182455) somatostatin receptor ( 364) 528 113.3 8.5e-25 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 527 113.1 1e-24 NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 527 113.1 1e-24 NP_000902 (OMIM: 165195) delta-type opioid recepto ( 372) 524 112.5 1.5e-24 NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 517 111.2 3.9e-24 NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 517 111.2 3.9e-24 NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 517 111.2 3.9e-24 NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 517 111.2 4e-24 NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 517 111.2 4e-24 NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 517 111.2 4e-24 NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 517 111.2 4e-24 NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 517 111.2 4.1e-24 NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 517 111.2 4.1e-24 NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 517 111.2 4.2e-24 NP_001272453 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 517 111.3 4.5e-24 NP_001138751 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 517 111.3 4.5e-24 NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 475 103.0 1.1e-21 XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 475 103.0 1.1e-21 NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 475 103.0 1.1e-21 NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 475 103.0 1.1e-21 XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 475 103.0 1.1e-21 XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 475 103.0 1.1e-21 XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 475 103.0 1.1e-21 NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 475 103.0 1.1e-21 NP_005277 (OMIM: 600731) neuropeptides B/W recepto ( 333) 473 102.6 1.3e-21 NP_005276 (OMIM: 600730) neuropeptides B/W recepto ( 328) 468 101.6 2.5e-21 NP_001269833 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 291) 455 99.0 1.3e-20 NP_001305783 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 365) 452 98.5 2.3e-20 XP_016883344 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 365) 452 98.5 2.3e-20 NP_001138753 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 319) 437 95.6 1.6e-19 NP_001272456 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 292) 434 94.9 2.3e-19 XP_016866395 (OMIM: 600018) PREDICTED: mu-type opi ( 300) 434 94.9 2.3e-19 NP_001138752 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 300) 434 94.9 2.3e-19 NP_001138759 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 300) 434 94.9 2.3e-19 NP_001272455 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 300) 434 94.9 2.3e-19 NP_001272457 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 314) 434 95.0 2.4e-19 >>NP_001035269 (OMIM: 606111) melanin-concentrating horm (340 aa) initn: 2294 init1: 2294 opt: 2294 Z-score: 2415.1 bits: 455.3 E(85289): 8.8e-128 Smith-Waterman score: 2294; 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NP_005 RSI-RLRTKRVTRTAIAICLVFFVCWAPYYVLQLTQLSISRPTLTFVYLYNAAISLGYAN 320 330 340 350 360 370 300 310 320 330 340 pF1KE9 SSINPFLYILLSGNFQKRLPQIQRRATEKEINNMGNTLKSHF : .:::.::.: .:.::: . :.. .. ..: NP_005 SCLNPFVYIVLCETFRKRLVLSVKPAAQGQLRAVSNAQTADEERTESKGT 380 390 400 410 420 >>XP_005261778 (OMIM: 182453) PREDICTED: somatostatin re (418 aa) initn: 421 init1: 227 opt: 599 Z-score: 639.8 bits: 127.1 E(85289): 6.7e-29 Smith-Waterman score: 600; 32.3% identity (62.5% similar) in 344 aa overlap (1-327:1-334) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MNPFHASCWNTSAELLNKS--WNKEFAYQTASV--------VDTVILPSMIGIICSTGLV :. .: : .:..: : : : . . ..:. :. :..: . ..: .::. XP_005 MDMLHPSSVSTTSEPENASSAWPPDATLGNVSAGPSPAGLAVSGVLIPLVYLVVCVVGLL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE9 GNILIVFTIIR-SRKKTVPDIYICNLAVADLVHIVGMPFLIHQWARGGEWVFGGPLCTII :: :......: . . .: ..:: :::.:: . ..:.::: : : . : ::. .: .. 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