Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9419
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9419, 469 aa
1>>>pF1KE9419 469 - 469 aa - 469 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8284+/-0.000704; mu= 22.5130+/- 0.043
mean_var=106.4125+/-25.560, 0's: 0 Z-trim(111.9): 218 B-trim: 669 in 1/50
Lambda= 0.124331
statistics sampled from 12452 (12717) to 12452 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.732), E-opt: 0.2 (0.391), width: 16
Scan time: 3.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3900.1 RXFP3 gene_id:51289|Hs108|chr5 ( 469) 3159 577.2 1.3e-164
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 364 75.7 9.1e-14
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 332 70.1 5.2e-12
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 325 68.7 1.1e-11
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 321 68.0 1.9e-11
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 321 68.0 2e-11
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 321 68.0 2e-11
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 314 66.8 4.5e-11
>>CCDS3900.1 RXFP3 gene_id:51289|Hs108|chr5 (469 aa)
initn: 3159 init1: 3159 opt: 3159 Z-score: 3069.1 bits: 577.2 E(32554): 1.3e-164
Smith-Waterman score: 3159; 100.0% identity (100.0% similar) in 469 aa overlap (1-469:1-469)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MQMADAATIATMNKAAGGDKLAELFSLVPDLLEAANTSGNASLQLPDLWWELGLELPDGA
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CCDS39 MQMADAATIATMNKAAGGDKLAELFSLVPDLLEAANTSGNASLQLPDLWWELGLELPDGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PPGHPPGSGGAESADTEARVRILISVVYWVVCALGLAGNLLVLYLMKSMQGWRKSSINLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 PPGHPPGSGGAESADTEARVRILISVVYWVVCALGLAGNLLVLYLMKSMQGWRKSSINLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VTNLALTDFQFVLTLPFWAVENALDFKWPFGKAMCKIVSMVTSMNMYASVFFLTAMSVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 VTNLALTDFQFVLTLPFWAVENALDFKWPFGKAMCKIVSMVTSMNMYASVFFLTAMSVTR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 YHSVASALKSHRTRGHGRGDCCGRSLGDSCCFSAKALCVWIWALAALASLPSAIFSTTVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 YHSVASALKSHRTRGHGRGDCCGRSLGDSCCFSAKALCVWIWALAALASLPSAIFSTTVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 VMGEELCLVRFPDKLLGRDRQFWLGLYHSQKVLLGFVLPLGIIILCYLLLVRFIADRRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 VMGEELCLVRFPDKLLGRDRQFWLGLYHSQKVLLGFVLPLGIIILCYLLLVRFIADRRAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 GTKGGAAVAGGRPTGASARRLSKVTKSVTIVVLSFFLCWLPNQALTTWSILIKFNAVPFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 GTKGGAAVAGGRPTGASARRLSKVTKSVTIVVLSFFLCWLPNQALTTWSILIKFNAVPFS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 QEYFLCQVYAFPVSVCLAHSNSCLNPVLYCLVRREFRKALKSLLWRIASPSITSMRPFTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 QEYFLCQVYAFPVSVCLAHSNSCLNPVLYCLVRREFRKALKSLLWRIASPSITSMRPFTA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE9 TTKPEHEDQGLQAPAPPHAAAEPDLLYYPPGVVVYSGGRYDLLPSSSAY
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CCDS39 TTKPEHEDQGLQAPAPPHAAAEPDLLYYPPGVVVYSGGRYDLLPSSSAY
430 440 450 460
>>CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 (374 aa)
initn: 793 init1: 364 opt: 364 Z-score: 360.6 bits: 75.7 E(32554): 9.1e-14
Smith-Waterman score: 857; 41.8% identity (67.0% similar) in 361 aa overlap (56-400:1-320)
30 40 50 60 70
pF1KE9 SLVPDLLEAANTSGNASLQLPDLWWELGLELPDGAPPGHPP------GSGG----AESAD
.: . :: .::: :..:
CCDS11 MPTLNTSASPPTFFWANASGGSVLSADDAP
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KE9 TEAR---VRILISVVYWVVCALGLAGNLLVLYLMKSMQGWRKSS---INLFVTNLALTDF
.. .:......: .: :.:: ::: ::..... :.. . :: ::::.:.
CCDS11 MPVKFLALRLMVALAYGLVGAIGLLGNLAVLWVLSNCA--RRAPGPPSDTFVFNLALADL
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 QFVLTLPFWAVENALDFKWPFGKAMCKIVSMVTSMNMYASVFFLTAMSVTRYHSVASALK
..:::::::.:.::::.:::: :.::.: .: .:.:::.:..::.::.:: :: :
CCDS11 GLALTLPFWAAESALDFHWPFGGALCKMVLTATVLNVYASIFLITALSVARYWVVAMAA-
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 SHRTRGHGRGDCCGRSLGDSCCFSAKALCVWIWALAALASLPSAIFSTTVKVMGEELCLV
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CCDS11 -----GPGTH----LSL-----FWARIATLAVWAAAALVTVPTAVFGVEGEVCGVRLCLL
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 RFPDKLLGRDRQFWLGLYHSQKVLLGFVLPLGIIILCYLLLVRFIADRRAAGTKGGAAVA
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CCDS11 RFPSR-------YWLGAYQLQRVVLAFMVPLGVITTSYLLLLAFL-QRRQRRRQDSRVVA
200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 GGRPTGASARRLSKVTKSVTIVVLSFFLCWLPNQALTTWSILIKFNAVPFSQEYFLCQVY
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CCDS11 ----------------RSVRILVASFFLCWFPNHVVTLWGVLVKFDLVPWNSTFYTIQTY
250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 AFPVSVCLAHSNSCLNPVLYCLVRREFRKALKSLLWRIASPSITSMRPFTATTKPEHEDQ
.:::..::::::::::::::::.::: :.::
CCDS11 VFPVTTCLAHSNSCLNPVLYCLLRREPRQALAGTFRDLRLRLWPQGGGWVQQVALKQVGR
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460
pF1KE9 GLQAPAPPHAAAEPDLLYYPPGVVVYSGGRYDLLPSSSAY
CCDS11 RWVASNPRESRPSTLLTNLDRGTPG
350 360 370
>>CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 (418 aa)
initn: 502 init1: 156 opt: 332 Z-score: 329.1 bits: 70.1 E(32554): 5.2e-12
Smith-Waterman score: 564; 32.5% identity (58.0% similar) in 381 aa overlap (57-429:15-353)
30 40 50 60 70 80
pF1KE9 LVPDLLEAANTSGNASLQLPDLWWELGLELPDGAPPGHPPGS--GGAESADTEARVRI--
:..: . :: . :.. .. . : . .
CCDS13 MDMLHPSSVSTTSEPENASSAWPPDATLGNVSAGPSPAGLAVSG
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 -LISVVYWVVCALGLAGNLLVLYLMKSMQGWRKSSINLFVTNLALTDFQFVLTLPFWAVE
:: .:: :::..:: :: ::.:.. . : :... ::::.: :.: ::: :..
CCDS13 VLIPLVYLVVCVVGLLGNSLVIYVVLRHTA-SPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQ
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 NALDFKWPFGKAMCKIVSMVTSMNMYASVFFLTAMSVTRYHSVASALKSHRTRGHGRGDC
:::.. ::::. ::..: : ..:...:.: ::.::: :: .:. .: : :
CCDS13 NALSY-WPFGSLMCRLVMAVDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAP----
110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 CGRSLGDSCCFSAKALCVWIWALAALASLPSAIFSTTVKVMGEELCLVRFPDKLLGRDRQ
:... . .:. .:.. :: ..:: . . : : ...:. .
CCDS13 -----------VARTVSAAVWVASAVVVLPVVVFSGVPR--GMSTCHMQWPEPAAA----
160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 FWLGLYHSQKVLLGFVLPLGIIILCYLLLVRFIADRRAAGTKGGAAVAGGRPTGASARRL
: . . . ::: :: .: :::::.: . :.:: . : :. ::
CCDS13 -WRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIVVKV---RSAGRRVWA------PSCQRRRRS
210 220 230 240 250
330 340 350 360 370
pF1KE9 SK-VTKSVTIVVLSFFLCWLPNQALTTWSILIKFNAVP-FSQEYFLCQVYAFPVSVCLAH
. ::. :. :: : :::.: .:. ... . : : ::: : :.: .
CCDS13 ERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPEEPAFFGLYFL--VVALP------Y
260 270 280 290 300
380 390 400 410 420 430
pF1KE9 SNSCLNPVLYCLVRREFRKALKSLLWRIASPSITSMRPFTATT-KPEHEDQGLQAPAPPH
.::: ::.:: .. .:..... .: : : . :..: .. : :.::.
CCDS13 ANSCANPILYGFLSYRFKQGFRRVLLR-PSRRVRSQEPTVGPPEKTEEEDEEEEDGEESR
310 320 330 340 350 360
440 450 460
pF1KE9 AAAEPDLLYYPPGVVVYSGGRYDLLPSSSAY
CCDS13 EGGKGKEMNGRVSQITQPGTSGQERPPSRVASKEQQLLPQEASTGEKSSTMRISYL
370 380 390 400 410
>>CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 (364 aa)
initn: 490 init1: 152 opt: 325 Z-score: 323.0 bits: 68.7 E(32554): 1.1e-11
Smith-Waterman score: 552; 33.2% identity (56.5% similar) in 395 aa overlap (58-446:13-359)
30 40 50 60 70 80
pF1KE9 VPDLLEAANTSGNASLQLPDLWWELGLELPDGAPPGHPPGSGGAES----ADTEARVRIL
... :: :.: .. : . . .:
CCDS10 MEPLFPASTPSWNASSPGAASGGGDNRTLVGPAPSAGARAVL
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 ISVVYWVVCALGLAGNLLVLYLMKSMQGWRKSSINLFVTNLALTDFQFVLTLPFWAVENA
. :.: .::: ::.:: ::.:.. . :. :... :::..: ..: ::: :..::
CCDS10 VPVLYLLVCAAGLGGNTLVIYVVLRFAKM-KTVTNIYILNLAVADVLYMLGLPFLATQNA
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 LDFKWPFGKAMCKIVSMVTSMNMYASVFFLTAMSVTRYHSVASALKSHRTRGHGRGDCCG
.: :::: ..:..: . ..:...::: ::.::: :: .:. :.: : : . :
CCDS10 ASF-WPFGPVLCRLVMTLDGVNQFTSVFCLTVMSVDRYLAVVHPLSSARWR-RPR-----
110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 RSLGDSCCFSAKALCVWIWALAALASLPSAIFSTTVKVMGEELCLVRFPDKLLGRDRQFW
:: . :.:. ::: .:. :. : : . .:. . : .:
CCDS10 ---------VAKLASAAAWVLSLCMSLPLLVFAD-VQEGG--TCNASWPEPV-G----LW
160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 LGLYHSQKVLLGFVLPLGIIILCYLLLVRFIADRRAAGTKGGAAVAGGRPTGASARRLSK
... ..::: :: .: :::::.: . ::::.. : . : :
CCDS10 GAVFIIYTAVLGFFAPLLVICLCYLLIVVKV---RAAGVRVGCV---------RRRSERK
200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 VTKSVTIVVLSFFLCWLPNQALTTWSILIKFNAVPFSQEYFLCQVYAFPVSVCLAHSNSC
::. : .::: : :::: ... : :: . :: .: : : :...:::
CCDS10 VTRMVLVVVLVFAGCWLP-----FFTVNIVNLAVALPQEPASAGLYFF--VVILSYANSC
250 260 270 280 290
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 LNPVLYCLVRREFRKALKSLL-WRIASPSITSMRPFTATT-KPEHEDQGLQAPAPPHAAA
::::: .. .::......: : .: . . :: .:.. : .: : : ::
CCDS10 ANPVLYGFLSDNFRQSFQKVLCLRKGSGA----KDADATEPRPDRIRQQQEATPPAHRAA
300 310 320 330 340 350
450 460
pF1KE9 EPDLLYYPPGVVVYSGGRYDLLPSSSAY
:.
CCDS10 ANGLMQTSKL
360
>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa)
initn: 516 init1: 285 opt: 321 Z-score: 319.1 bits: 68.0 E(32554): 1.9e-11
Smith-Waterman score: 574; 30.0% identity (61.4% similar) in 370 aa overlap (74-436:21-354)
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 QLPDLWWELGLELPDGAPPGHPPGSGGAESADTEARVRILISVVYWVVCALGLAGNLLVL
: . . ..: ..: .. ..:. :: ::.
CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVV
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 YLMKSMQGWRKSSINLFVTNLALTDFQFVLTLPFWAVENALDFKWPFGKAMCKIVSMVTS
.. .. :. ..:. ::::.:. :.::::.::: .:....::::. .:::.: .:
CCDS31 IVIYFYMKL-KTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVS
60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 MNMYASVFFLTAMSVTRYHSVASALKSHRTRGHGRGDCCGRSLGDSCCFSAKALCVWIWA
.:.:::::.:: .:. :: ... .:: : : :.. . ::. :. ::
CCDS31 FNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKS-RLR---------RTM-----LVAKVTCIIIWL
110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 LAALASLPSAIFSTTVKVMGEELCLVRFPDKLLGRDRQFWLGLYHSQKVLLGFVLPLGII
::.:::::. : .. . . .. . : . . . ::: : .:::..:. ::
CCDS31 LAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGL---TKNILGFLFPFLII
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 ILCYLLLVRFIADRRAAGTKGGAAVAGGRPTGASARRLSKVTKSVTIVVLSFFLCWLPNQ
. : :. . . : . . ..: : . . : . .:: ::. :.:.:
CCDS31 LTSYTLIWKAL--------KKAYEIQKNKP------RNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQ
220 230 240 250
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 ALTTWSILIKFNAVPFSQEYFLCQVY--AFPVSVCLAHSNSCLNPVLYCLVRREFRKALK
.: ..::... . .. . .. :.:...:.:. :.::::..: .. ..:.. .
CCDS31 IFTFLDVLIQLGII---RDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFL
260 270 280 290 300 310
410 420 430 440 450
pF1KE9 SLLWRIA----SPSITSMRPFTATTKP-EHEDQGLQAPAPPHAAAEPDLLYYPPGVVVYS
.:: : : : : . : . .: .. ... . :::
CCDS31 QLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
320 330 340 350
460
pF1KE9 GGRYDLLPSSSAY
>>CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (388 aa)
initn: 516 init1: 285 opt: 321 Z-score: 318.8 bits: 68.0 E(32554): 2e-11
Smith-Waterman score: 574; 30.0% identity (61.4% similar) in 370 aa overlap (74-436:50-383)
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 QLPDLWWELGLELPDGAPPGHPPGSGGAESADTEARVRILISVVYWVVCALGLAGNLLVL
: . . ..: ..: .. ..:. :: ::.
CCDS82 FATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVV
20 30 40 50 60 70
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 YLMKSMQGWRKSSINLFVTNLALTDFQFVLTLPFWAVENALDFKWPFGKAMCKIVSMVTS
.. .. :. ..:. ::::.:. :.::::.::: .:....::::. .:::.: .:
CCDS82 IVIYFYMKL-KTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVS
80 90 100 110 120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 MNMYASVFFLTAMSVTRYHSVASALKSHRTRGHGRGDCCGRSLGDSCCFSAKALCVWIWA
.:.:::::.:: .:. :: ... .:: : : :.. . ::. :. ::
CCDS82 FNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKS-RLR---------RTM-----LVAKVTCIIIWL
140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 LAALASLPSAIFSTTVKVMGEELCLVRFPDKLLGRDRQFWLGLYHSQKVLLGFVLPLGII
::.:::::. : .. . . .. . : . . . ::: : .:::..:. ::
CCDS82 LAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGL---TKNILGFLFPFLII
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 ILCYLLLVRFIADRRAAGTKGGAAVAGGRPTGASARRLSKVTKSVTIVVLSFFLCWLPNQ
. : :. . . : . . ..: : . . : . .:: ::. :.:.:
CCDS82 LTSYTLIWKAL--------KKAYEIQKNKP------RNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQ
250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 ALTTWSILIKFNAVPFSQEYFLCQVY--AFPVSVCLAHSNSCLNPVLYCLVRREFRKALK
.: ..::... . .. . .. :.:...:.:. :.::::..: .. ..:.. .
CCDS82 IFTFLDVLIQLGII---RDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFL
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450
pF1KE9 SLLWRIA----SPSITSMRPFTATTKP-EHEDQGLQAPAPPHAAAEPDLLYYPPGVVVYS
.:: : : : : . : . .: .. ... . :::
CCDS82 QLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
350 360 370 380
460
pF1KE9 GGRYDLLPSSSAY
>>CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (394 aa)
initn: 516 init1: 285 opt: 321 Z-score: 318.7 bits: 68.0 E(32554): 2e-11
Smith-Waterman score: 574; 30.0% identity (61.4% similar) in 370 aa overlap (74-436:56-389)
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 QLPDLWWELGLELPDGAPPGHPPGSGGAESADTEARVRILISVVYWVVCALGLAGNLLVL
: . . ..: ..: .. ..:. :: ::.
CCDS82 FATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVV
30 40 50 60 70 80
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 YLMKSMQGWRKSSINLFVTNLALTDFQFVLTLPFWAVENALDFKWPFGKAMCKIVSMVTS
.. .. :. ..:. ::::.:. :.::::.::: .:....::::. .:::.: .:
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