FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3305, 796 aa 1>>>pF1KE3305 796 - 796 aa - 796 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7543+/-0.00061; mu= 13.3884+/- 0.037 mean_var=127.8539+/-28.086, 0's: 0 Z-trim(107.8): 291 B-trim: 602 in 1/53 Lambda= 0.113427 statistics sampled from 15577 (15911) to 15577 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.508), E-opt: 0.2 (0.187), width: 16 Scan time: 11.210 The best scores are: opt bits E(85289) XP_011511916 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796) 5261 873.9 0 XP_011511914 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796) 5261 873.9 0 NP_006059 (OMIM: 605403) toll-like receptor 6 prec ( 796) 5261 873.9 0 XP_005262694 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796) 5261 873.9 0 XP_011511915 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796) 5261 873.9 0 XP_011512047 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 3649 610.1 1.2e-173 XP_016864060 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 3649 610.1 1.2e-173 XP_016864061 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 3649 610.1 1.2e-173 NP_003254 (OMIM: 601194,613223) toll-like receptor ( 786) 3649 610.1 1.2e-173 XP_005262719 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 3649 610.1 1.2e-173 XP_011512045 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 3649 610.1 1.2e-173 XP_011512046 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 3649 610.1 1.2e-173 XP_011512044 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 3649 610.1 1.2e-173 XP_011512064 (OMIM: 606270) PREDICTED: toll-like r ( 811) 2475 418.0 8.3e-116 NP_001017388 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10 ( 811) 2475 418.0 8.3e-116 NP_112218 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10 iso ( 811) 2475 418.0 8.3e-116 NP_001182036 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10 ( 811) 2475 418.0 8.3e-116 NP_001182035 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10 ( 811) 2475 418.0 8.3e-116 XP_011512063 (OMIM: 606270) PREDICTED: toll-like r ( 811) 2475 418.0 8.3e-116 NP_001182037 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10 ( 797) 2459 415.3 5e-115 XP_011512062 (OMIM: 606270) PREDICTED: toll-like r ( 797) 2459 415.3 5e-115 NP_001305719 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 1174 205.1 9.9e-52 XP_016864063 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 1174 205.1 9.9e-52 XP_016864064 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 1174 205.1 9.9e-52 NP_001305720 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 1174 205.1 9.9e-52 XP_016864062 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 1174 205.1 9.9e-52 NP_003255 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-like r ( 784) 1174 205.1 9.9e-52 XP_016864065 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 1174 205.1 9.9e-52 XP_011530517 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 1174 205.1 9.9e-52 NP_001305725 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 1174 205.1 9.9e-52 NP_001305724 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 1174 205.1 9.9e-52 NP_001305716 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 1174 205.1 9.9e-52 NP_001305722 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 1174 205.1 9.9e-52 XP_011530518 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 1174 205.1 9.9e-52 NP_001305718 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 1174 205.1 9.9e-52 NP_619542 (OMIM: 300366) toll-like receptor 8 isof (1041) 487 92.7 8.6e-18 XP_011543832 (OMIM: 300366) PREDICTED: toll-like r (1059) 487 92.7 8.7e-18 NP_057694 (OMIM: 300366) toll-like receptor 8 isof (1059) 487 92.7 8.7e-18 XP_011543831 (OMIM: 300366) PREDICTED: toll-like r (1059) 487 92.7 8.7e-18 NP_057646 (OMIM: 300365) toll-like receptor 7 prec (1049) 443 85.5 1.3e-15 NP_003257 (OMIM: 603030,611488) toll-like receptor ( 799) 425 82.5 7.9e-15 NP_612564 (OMIM: 603030,611488) toll-like receptor ( 839) 425 82.5 8.2e-15 XP_016864066 (OMIM: 603029,609423) PREDICTED: toll ( 627) 414 80.6 2.3e-14 XP_016857697 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 406 79.4 7.2e-14 XP_005273299 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 406 79.4 7.2e-14 XP_005273298 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 406 79.4 7.2e-14 XP_005273300 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 406 79.4 7.2e-14 XP_006711568 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 406 79.4 7.2e-14 XP_006711569 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 406 79.4 7.2e-14 XP_006711567 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 406 79.4 7.2e-14 >>XP_011511916 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like recep (796 aa) initn: 5261 init1: 5261 opt: 5261 Z-score: 4664.1 bits: 873.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5261; 99.9% identity (99.9% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-796) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 FLSELTRGPTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYS :::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 FLSELTRGSTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 KTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNF 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 TQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRH 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 KENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNV 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 AFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 AFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREF 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 VKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAV 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 TVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSEL 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 VPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAH 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 HNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 HNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAA 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 FNMKLTLVTENNDVKS :::::::::::::::: XP_011 FNMKLTLVTENNDVKS 790 >>XP_011511914 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like recep (796 aa) initn: 5261 init1: 5261 opt: 5261 Z-score: 4664.1 bits: 873.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5261; 99.9% identity (99.9% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-796) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 FLSELTRGPTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYS :::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 FLSELTRGSTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 KTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNF 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 TQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRH 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 KENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNV 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 AFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 AFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREF 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 VKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAV 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 TVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSEL 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 VPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAH 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 HNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 HNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAA 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 FNMKLTLVTENNDVKS :::::::::::::::: XP_011 FNMKLTLVTENNDVKS 790 >>NP_006059 (OMIM: 605403) toll-like receptor 6 precurso (796 aa) initn: 5261 init1: 5261 opt: 5261 Z-score: 4664.1 bits: 873.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5261; 99.9% identity (99.9% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-796) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 FLSELTRGPTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYS :::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 FLSELTRGSTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 KTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 KTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNF 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 TQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 TQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRH 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 KENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 KENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNV 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 AFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 AFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREF 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 VKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 VKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAV 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 TVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 TVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSEL 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 VPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 VPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAH 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 HNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 HNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAA 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 FNMKLTLVTENNDVKS :::::::::::::::: NP_006 FNMKLTLVTENNDVKS 790 >>XP_005262694 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like recep (796 aa) initn: 5261 init1: 5261 opt: 5261 Z-score: 4664.1 bits: 873.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5261; 99.9% identity (99.9% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-796) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 FLSELTRGPTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYS :::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 FLSELTRGSTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 KTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 KTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNF 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 TQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 TQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRH 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 KENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 KENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNV 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 AFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 AFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREF 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 VKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 VKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAV 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 TVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 TVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSEL 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 VPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 VPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAH 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 HNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 HNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAA 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 FNMKLTLVTENNDVKS :::::::::::::::: XP_005 FNMKLTLVTENNDVKS 790 >>XP_011511915 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like recep (796 aa) initn: 5261 init1: 5261 opt: 5261 Z-score: 4664.1 bits: 873.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5261; 99.9% identity (99.9% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-796) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 FLSELTRGPTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYS :::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 FLSELTRGSTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 KTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNF 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 TQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRH 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 KENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNV 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 AFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 AFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREF 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 VKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAV 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 TVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSEL 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 VPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAH 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 HNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 HNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAA 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 FNMKLTLVTENNDVKS :::::::::::::::: XP_011 FNMKLTLVTENNDVKS 790 >>XP_011512047 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll-lik (786 aa) initn: 3649 init1: 2832 opt: 3649 Z-score: 3238.6 bits: 610.1 E(85289): 1.2e-173 Smith-Waterman score: 3649; 69.6% identity (88.3% similar) in 777 aa overlap (12-786:5-781) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS :::. ....:. :::.:. .:: ::.:: ::::::::: :: .:..: XP_011 MTSIFHFAIIFMLILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNIS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI ::::.:: .::. ::.: .: .:::::: ::.:::::::.:::::::::.: :::::: XP_011 QNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISCHPT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN :...::::::: : ::::::::::.:::.:::::. .:.: ..::::::..: .:: : . XP_011 VNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTHLEKSSVLPIAHLNISKVLLVLGE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE3 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIK--LNDDNCQVF : .... :.:: .:...::.:: .. : . ...::.:.. :.:.::: :.:..:. : XP_011 TYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCVLEDNKCSYF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 IKFLSELTRGPTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFT ...:..: .: : :.:::.:::::. ..:..:..: : :..: :. . .. .:: XP_011 LSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTTVWYFSISNVKLQGQLDFRDFD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 YSKTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFL :: :.::::.:......:: : :. .: .::.::: .:.: : ..::::: : : : XP_011 YSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNFTVSGTRMVHMLCPSKISPFLHL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 NFTQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESG .:..:..::..::.:. :..::::::: : ::.: :.. :: .: ::. ::.: ::. XP_011 DFSNNLLTDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 RHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQEL ..: .:.:..:.. ::.:::.:::..::::::::::::::::::::.::::::::::::: XP_011 EKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSIPKQVVKLEALQEL 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELG 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVL :::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::: :::::: XP_011 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELSCNITLLIVTIVATMLVL 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 AVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKS :::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::. XP_011 AVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSFWVKN 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 ELVPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF ::.: :::: .::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: XP_011 ELLPNLEKEGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 AHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIR :::::::::::.::::::::::: :::..:::::.::..::::.::::::::::::::.: XP_011 AHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLR 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 AAFNMKLTLVTENNDVKS ::.:.::: XP_011 AAINIKLTEQAKK 780 >>XP_016864060 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll-lik (786 aa) initn: 3649 init1: 2832 opt: 3649 Z-score: 3238.6 bits: 610.1 E(85289): 1.2e-173 Smith-Waterman score: 3649; 69.6% identity (88.3% similar) in 777 aa overlap (12-786:5-781) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS :::. ....:. :::.:. .:: ::.:: ::::::::: :: .:..: XP_016 MTSIFHFAIIFMLILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNIS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI ::::.:: .::. ::.: .: .:::::: ::.:::::::.:::::::::.: :::::: XP_016 QNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISCHPT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN :...::::::: : ::::::::::.:::.:::::. .:.: ..::::::..: .:: : . XP_016 VNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTHLEKSSVLPIAHLNISKVLLVLGE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE3 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIK--LNDDNCQVF : .... :.:: .:...::.:: .. : . ...::.:.. :.:.::: :.:..:. : XP_016 TYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCVLEDNKCSYF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 IKFLSELTRGPTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFT ...:..: .: : :.:::.:::::. ..:..:..: : :..: :. . .. .:: XP_016 LSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTTVWYFSISNVKLQGQLDFRDFD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 YSKTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFL :: :.::::.:......:: : :. .: .::.::: .:.: : ..::::: : : : XP_016 YSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNFTVSGTRMVHMLCPSKISPFLHL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 NFTQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESG .:..:..::..::.:. :..::::::: : ::.: :.. :: .: ::. ::.: ::. XP_016 DFSNNLLTDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 RHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQEL ..: .:.:..:.. ::.:::.:::..::::::::::::::::::::.::::::::::::: XP_016 EKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSIPKQVVKLEALQEL 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELG 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVL :::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::: :::::: XP_016 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELSCNITLLIVTIVATMLVL 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 AVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKS :::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::. XP_016 AVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSFWVKN 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 ELVPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF ::.: :::: .::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: XP_016 ELLPNLEKEGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 AHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIR :::::::::::.::::::::::: :::..:::::.::..::::.::::::::::::::.: XP_016 AHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLR 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 AAFNMKLTLVTENNDVKS ::.:.::: XP_016 AAINIKLTEQAKK 780 >>XP_016864061 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll-lik (786 aa) initn: 3649 init1: 2832 opt: 3649 Z-score: 3238.6 bits: 610.1 E(85289): 1.2e-173 Smith-Waterman score: 3649; 69.6% identity (88.3% similar) in 777 aa overlap (12-786:5-781) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS :::. ....:. :::.:. .:: ::.:: ::::::::: :: .:..: XP_016 MTSIFHFAIIFMLILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNIS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI ::::.:: .::. ::.: .: .:::::: ::.:::::::.:::::::::.: :::::: XP_016 QNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISCHPT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN :...::::::: : ::::::::::.:::.:::::. .:.: ..::::::..: .:: : . XP_016 VNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTHLEKSSVLPIAHLNISKVLLVLGE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE3 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIK--LNDDNCQVF : .... :.:: .:...::.:: .. : . ...::.:.. :.:.::: :.:..:. : XP_016 TYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCVLEDNKCSYF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 IKFLSELTRGPTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFT ...:..: .: : :.:::.:::::. ..:..:..: : :..: :. . .. .:: XP_016 LSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTTVWYFSISNVKLQGQLDFRDFD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 YSKTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFL :: :.::::.:......:: : :. .: .::.::: .:.: : ..::::: : : : XP_016 YSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNFTVSGTRMVHMLCPSKISPFLHL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 NFTQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESG .:..:..::..::.:. :..::::::: : ::.: :.. :: .: ::. ::.: ::. XP_016 DFSNNLLTDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 RHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQEL ..: .:.:..:.. ::.:::.:::..::::::::::::::::::::.::::::::::::: XP_016 EKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSIPKQVVKLEALQEL 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELG 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVL :::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::: :::::: XP_016 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELSCNITLLIVTIVATMLVL 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 AVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKS :::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::. XP_016 AVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSFWVKN 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 ELVPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF ::.: :::: .::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: XP_016 ELLPNLEKEGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 AHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIR :::::::::::.::::::::::: :::..:::::.::..::::.::::::::::::::.: XP_016 AHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLR 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 AAFNMKLTLVTENNDVKS ::.:.::: XP_016 AAINIKLTEQAKK 780 >>NP_003254 (OMIM: 601194,613223) toll-like receptor 1 p (786 aa) initn: 3649 init1: 2832 opt: 3649 Z-score: 3238.6 bits: 610.1 E(85289): 1.2e-173 Smith-Waterman score: 3649; 69.6% identity (88.3% similar) in 777 aa overlap (12-786:5-781) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS :::. ....:. :::.:. .:: ::.:: ::::::::: :: .:..: NP_003 MTSIFHFAIIFMLILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNIS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI ::::.:: .::. ::.: .: .:::::: ::.:::::::.:::::::::.: :::::: NP_003 QNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISCHPT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN :...::::::: : ::::::::::.:::.:::::. .:.: ..::::::..: .:: : . NP_003 VNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTHLEKSSVLPIAHLNISKVLLVLGE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE3 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIK--LNDDNCQVF : .... :.:: .:...::.:: .. : . ...::.:.. :.:.::: :.:..:. : NP_003 TYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCVLEDNKCSYF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 IKFLSELTRGPTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFT ...:..: .: : :.:::.:::::. ..:..:..: : :..: :. . .. .:: NP_003 LSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTTVWYFSISNVKLQGQLDFRDFD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 YSKTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFL :: :.::::.:......:: : :. .: .::.::: .:.: : ..::::: : : : NP_003 YSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNFTVSGTRMVHMLCPSKISPFLHL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 NFTQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESG .:..:..::..::.:. :..::::::: : ::.: :.. :: .: ::. ::.: ::. NP_003 DFSNNLLTDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 RHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQEL ..: .:.:..:.. ::.:::.:::..::::::::::::::::::::.::::::::::::: NP_003 EKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSIPKQVVKLEALQEL 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_003 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELG 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVL :::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::: :::::: NP_003 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELSCNITLLIVTIVATMLVL 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 AVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKS :::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::. NP_003 AVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSFWVKN 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 ELVPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF ::.: :::: .::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: NP_003 ELLPNLEKEGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 AHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIR :::::::::::.::::::::::: :::..:::::.::..::::.::::::::::::::.: NP_003 AHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLR 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 AAFNMKLTLVTENNDVKS ::.:.::: NP_003 AAINIKLTEQAKK 780 >>XP_005262719 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll-lik (786 aa) initn: 3649 init1: 2832 opt: 3649 Z-score: 3238.6 bits: 610.1 E(85289): 1.2e-173 Smith-Waterman score: 3649; 69.6% identity (88.3% similar) in 777 aa overlap (12-786:5-781) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS :::. ....:. :::.:. .:: ::.:: ::::::::: :: .:..: XP_005 MTSIFHFAIIFMLILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNIS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI ::::.:: .::. ::.: .: .:::::: ::.:::::::.:::::::::.: :::::: XP_005 QNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISCHPT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN :...::::::: : ::::::::::.:::.:::::. .:.: ..::::::..: .:: : . XP_005 VNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTHLEKSSVLPIAHLNISKVLLVLGE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE3 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIK--LNDDNCQVF : .... :.:: .:...::.:: .. : . ...::.:.. :.:.::: :.:..:. : XP_005 TYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCVLEDNKCSYF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 IKFLSELTRGPTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFT ...:..: .: : :.:::.:::::. ..:..:..: : :..: :. . .. .:: XP_005 LSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTTVWYFSISNVKLQGQLDFRDFD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 YSKTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFL :: :.::::.:......:: : :. .: .::.::: .:.: : ..::::: : : : XP_005 YSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNFTVSGTRMVHMLCPSKISPFLHL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 NFTQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESG .:..:..::..::.:. :..::::::: : ::.: :.. :: .: ::. ::.: ::. XP_005 DFSNNLLTDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 RHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQEL ..: .:.:..:.. ::.:::.:::..::::::::::::::::::::.::::::::::::: XP_005 EKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSIPKQVVKLEALQEL 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELG 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVL :::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::: :::::: XP_005 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELSCNITLLIVTIVATMLVL 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 AVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKS :::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::. XP_005 AVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSFWVKN 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 ELVPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF ::.: :::: .::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: XP_005 ELLPNLEKEGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 AHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIR :::::::::::.::::::::::: :::..:::::.::..::::.::::::::::::::.: XP_005 AHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLR 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 AAFNMKLTLVTENNDVKS ::.:.::: XP_005 AAINIKLTEQAKK 780 796 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 17:31:22 2016 done: Sun Nov 6 17:31:24 2016 Total Scan time: 11.210 Total Display time: 0.260 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]