FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3305, 796 aa 1>>>pF1KE3305 796 - 796 aa - 796 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6288+/-0.00146; mu= 14.3629+/- 0.087 mean_var=126.2343+/-26.563, 0's: 0 Z-trim(100.8): 142 B-trim: 50 in 1/50 Lambda= 0.114153 statistics sampled from 6125 (6270) to 6125 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.526), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16 Scan time: 3.610 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4 ( 796) 5261 879.2 0 CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4 ( 786) 3649 613.8 3.5e-175 CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs108|chr4 ( 811) 2475 420.4 5.8e-117 CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 ( 784) 1174 206.2 1.8e-52 CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1041) 487 93.1 2.5e-18 CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1059) 487 93.1 2.5e-18 CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs108|chrX (1049) 443 85.9 3.8e-16 CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs108|chr9 ( 839) 425 82.8 2.5e-15 CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs108|chr1 ( 858) 406 79.7 2.2e-14 >>CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4 (796 aa) initn: 5261 init1: 5261 opt: 5261 Z-score: 4693.2 bits: 879.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5261; 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CCDS33 VNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTHLEKSSVLPIAHLNISKVLLVLGE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE3 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIK--LNDDNCQVF : .... :.:: .:...::.:: .. : . ...::.:.. :.:.::: :.:..:. : CCDS33 TYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCVLEDNKCSYF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 IKFLSELTRGPTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFT ...:..: .: : :.:::.:::::. ..:..:..: : :..: :. . .. .:: CCDS33 LSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTTVWYFSISNVKLQGQLDFRDFD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 YSKTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFL :: :.::::.:......:: : :. .: .::.::: .:.: : ..::::: : : : CCDS33 YSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNFTVSGTRMVHMLCPSKISPFLHL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 NFTQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESG .:..:..::..::.:. :..::::::: : ::.: :.. :: .: ::. ::.: ::. CCDS33 DFSNNLLTDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 RHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQEL ..: .:.:..:.. ::.:::.:::..::::::::::::::::::::.::::::::::::: CCDS33 EKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSIPKQVVKLEALQEL 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELG 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVL :::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::: :::::: CCDS33 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELSCNITLLIVTIVATMLVL 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 AVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKS :::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::. CCDS33 AVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSFWVKN 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 ELVPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF ::.: :::: .::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 ELLPNLEKEGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 AHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIR :::::::::::.::::::::::: :::..:::::.::..::::.::::::::::::::.: CCDS33 AHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLR 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 AAFNMKLTLVTENNDVKS ::.:.::: CCDS33 AAINIKLTEQAKK 780 >>CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs108|chr4 (811 aa) initn: 2342 init1: 590 opt: 2475 Z-score: 2213.4 bits: 420.4 E(32554): 5.8e-117 Smith-Waterman score: 2475; 47.9% identity (76.3% similar) in 799 aa overlap (8-796:3-790) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIV-GTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDM ....... : ... . : .. . :. .. :. .: .:: :: : .::. CCDS34 MRLIRNIYIFCSIVMTAEGDAPELPEERELMTNCSNMSLRKVPADLTPATTTLDL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 SQNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHP : : . .:: ::. .:.: :: : ::::: :::..:.::..:.:::::.:.:.... . CCDS34 SYNLLFQLQSSDFHSVSKLRVLILCHNRIQQLDLKTFEFNKELRYLDLSNNRLKSVTWYL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 IVSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLR ....:.:::::::: ..:::.: ::.:.:..::::. :.:: :. ::::::. ..: .: CCDS34 LAGLRYLDLSFNDFDTMPICEEAGNMSHLEILGLSGAKIQKSDFQKIAHLHLNTVFLGFR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 NYYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFI . . . : :: :::. ::.:. . : . . ...: :..::: : . : :. CCDS34 T--LPHYEEGSLPILNTTKLHIVLPMDTNFWVLLRDGIKTSKILEMTNI---DGKSQ-FV 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 KFLSELTRGPTLLN-----FTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTI--IESI .. :. :. .: : . ::... : : ..::.: ::...: :.:. . CCDS34 SY--EMQRNLSLENAKTSVLLLNKVDLLWDDLFLILQFVWHTSVEHFQIRNVTFGGKAYL 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 REEDFTYSKTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAP ...: ::.:..... .::. .:: ..: .: ....:.: ::::.. . ::: :. : CCDS34 DHNSFDYSNTVMRTIKLEHVHFRVFYIQQDKIYLLLTKMDIENLTISNAQMPHMLFPNYP 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 STFKFLNFTQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSW . :..:::..:..:: .:.. : .:.::::. : :. : :. .... : :: ::.: CCDS34 TKFQYLNFANNILTDELFKRTIQLPHLKTLILNGNKLETLSLVSCFANNTP-LEHLDLSQ 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 NSLESGRHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKL : :. .. :::.: :..: .::: : :.:::::::: :..:::..:.:..:::....: CCDS34 NLLQH-KNDENCSWPETVVNMNLSYNKLSDSVFRCLPKSIQILDLNNNQIQTVPKETIHL 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 EALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQ ::.:::.::: :::::::. :: :::: :. : . :: :: ::::......:: :::. CCDS34 MALRELNIAFNFLTDLPGCSHFSRLSVLNIEMNFILSPSLDFVQSCQEVKTLNAGRNPFR 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 CTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIG :::::..:.. .. : .. :: ::: :.:: . ::. ::: :. ::::: .:::::: CCDS34 CTCELKNFIQ-LETYSEVMMVGWSDSYTCEYPLNLRGTRLKDVHLHELSCNTALLIVTIV 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 ATMLVLAVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHD . ::::...:. :...::::::::. : ::: .:.:. :.:.::..::::::::::: CCDS34 VIMLVLGLAVAFCCLHFDLPWYLRMLGQCTQTWHRVRKTTQEQLKRNVRFHAFISYSEHD 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 SAWVKSELVPYLEKED--IQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSE : :::.::.: ::::: : :::.: : ::::: :::.. :::::::::::::::::.: CCDS34 SLWVKNELIPNLEKEDGSILICLYESYFDPGKSISENIVSFIEKSYKSIFVLSPNFVQNE 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 WCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKR :::::.::::::::::.:...::::::::: ::..:::::::. ...::.:::.. : CCDS34 WCHYEFYFAHHNLFHENSDHIILILLEPIPFYCIPTRYHKLKALLEKKAYLEWPKDRRKC 710 720 730 740 750 760 780 790 pF1KE3 GLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS ::::::.:::.:... . : .... CCDS34 GLFWANLRAAINVNVLATREMYELQTFTELNEESRGSTISLMRTDCL 770 780 790 800 810 >>CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 (784 aa) initn: 1018 init1: 462 opt: 1174 Z-score: 1055.7 bits: 206.2 E(32554): 1.8e-52 Smith-Waterman score: 1265; 31.5% identity (64.8% similar) in 793 aa overlap (17-780:11-781) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDK------SKRGLIHVPKDLPLKT : .:: .. . :. .. :. :. .: .:. : . CCDS37 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 KVLDMSQNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQK : ::.:.: :. .. ::.. .: .: :. : :. .. . :. .::.::::.: :.. CCDS37 KSLDLSNNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 ISC---HPIVSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAM----KLQKLDLLPIA .: .:. :. :.: : .:.: . :..:..:..: .. : :.:. :. .. CCDS37 LSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLT 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 HLH-LSYILLDLRNYYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLT :. : ::..: : .:.: .. ::. : :. : :... ... ::.: CCDS37 FLEELEIDASDLQSYEPK--SLKSIQNVSHLILHMKQH-ILLLEIFVDVT-SSVECLEL- 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 NIKLNDDNCQVFIKFLSELTRGPT---LLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFL-WPKPVEYLN : . ..: .:::. : : . .::. ... : . : .:...: . . :. CCDS37 ----RDTDLDTF--HFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELE 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 IYNLTI--IESIR--EEDFTYSKTTLKALTIE--HITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMML . . :. . ..: ..: . . ...:::. :: .... ..::.. ... . . CCDS37 FDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITV 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 TISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNFTQNVFTDSIFEK--C-STLVKLETLILQKNGLKDLF : . .. : . .....:....:.... ... : .. .:.::::..: : .: CCDS37 ENSKVFLVPCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLE 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 KVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIK :.: . .: .:.: ::..: :.: : :.. :::::. . :: :.: .. CCDS37 KTGETLLTLKNLTNIDISKNSFHS--MPETCQWPEKMKYLNLSSTRI-HSVTGCIPKTLE 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 VLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSAD .::. .:... ..: :.:: .. :.: :: . . : :: :..:... : . CCDS37 ILDVSNNNLNLFS---LNLPQLKELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKE 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 FFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLK ..: . .....:: : : :.::. :... .:. ..:: :: .: :: : ::. .. CCDS37 QLDSFHTLKTLEAGGNNFICSCEFLSFTQE-QQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQ 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 DFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPL : ..: :. : :. . ....: . . :: . ::..:. : :..:. :. : CCDS37 DVRLSVSECHRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAP- 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 EELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSELVPYLEKED--IQICLHERNFVPGKSIVENIINC .::. . ::.::::.:. ::.. .: ::. . ...:::.:.:.::: :..:::. CCDS37 ---SRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDS 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 IEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKL ::::.:..:::: :::.::::.::: :.: :: :... :::::::: ...::... :: CCDS37 IEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKL 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 KALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS . .:. .:::.:: ....: ::.:.::: CCDS37 RKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS 760 770 780 >>CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1041 aa) initn: 512 init1: 185 opt: 487 Z-score: 442.5 bits: 93.1 E(32554): 2.5e-18 Smith-Waterman score: 581; 24.9% identity (57.5% similar) in 772 aa overlap (65-778:274-1019) 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 AVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMSQNYIAELQVSDMSF--LSELTVLRLSHNRIQLLD : .... ..: :..: : :: . .. .. CCDS14 GLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINIDRFAFQNLTQLRYLNLSSTSLRKIN 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 pF1KE3 LSVFKFNQDLEYLDLSHNQL-QKISCHPIVS----FRHLDLSFNDFKA-----LPICKEF . :: :. ::: : : .:. ... .. :::::: .:. . : ..: CCDS14 AAWFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLPRLEILDLSFNYIKGSYPQHINISRNF 310 320 330 340 350 360 150 160 170 180 190 pF1KE3 GNLSQLNFLGLSAMKLQKL---DLLPIAHL-HLSYILLDLRNYYIKENETESLQIL-NAK ..: .: : : .. .:.: :. :. .: .:: : : . .::. . . .: . : . CCDS14 SKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINLGIN--FIKQIDFKLFQNFSNLE 370 380 390 400 410 420 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 TLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQ--LTNIKLND---DNCQVFIKFLSELTRGPTLL ..: . : .. .. : . . .: . . . .: : . : .: : . : CCDS14 IIYLSENRISPLVKDTRQSYANSSSFQRHIRKRRSTDFEFDPHSNFYHFTRPLIK-PQCA 430 440 450 460 470 480 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 NFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYL-NIYNLTIIESIREEDFTYSK-TTLKALTIE . . .. . : .: :. :. : : .: :.. . . .. .. ... . CCDS14 AYG-KALDLS---LNSIF-FIGPNQFENLPDIACLNLSANSNAQVLSGTEFSAIPHVKYL 490 500 510 520 530 320 330 340 350 360 pF1KE3 HITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFI------HMLCPHAPSTFKFLNFTQN- .::. . :.... : .:..... :. .. : :. . ...: ::...: CCDS14 DLTNNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHYFRIAGVTHHLEFIQNFTNLKVLNLSHNN 540 550 560 570 580 590 370 380 390 400 410 pF1KE3 --VFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLF-----KVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLE ..::. . ..::. :... : : :. . . : . .: ::.: : : CCDS14 IYTLTDKYNLESKSLVE---LVFSGNRLDILWNDDDNRYISIFKGLKNLTRLDLSLNRL- 600 610 620 630 640 650 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 SGRHKENCTWVE---SIVVLNLSSNMLTDSVFRCLP--PRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVK .: : .... :.. :....::: . : ::...:::..::. . .. CCDS14 --KHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWTLLQQFPRLELLDLRGNKLLFLTDSLSD 660 670 680 690 700 480 490 500 510 520 pF1KE3 LEA-LQELNVAFNSLTDLP-GCGS-FSSLSVLIIDHNSVS--HPSADFFQSCQKMRSIKA . . :. : .. : .. :: : : :::. : .. : .. . :: .. :. .. CCDS14 FTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNLLKTINKSALETKTTTKLSMLEL 710 720 730 740 750 760 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 GDNPFQCTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITL :::.:::.. .: . .:. . . : : : . ::. . ..... ..: CCDS14 HGNPFECTCDIGDFRRWMDEHLNVKIPRLVDVI-CASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTA 770 780 790 800 810 820 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 LIV---TIGATMLVLAVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFH .:. :. : .:. .... .: :. :.. :: :. . :. . :. CCDS14 VILFFFTFFITTMVMLAALAHHLFYWDV-WFIYNVCL-------AKVKGYRSLSTSQTFY 830 840 850 860 870 880 650 660 670 680 690 pF1KE3 -AFISYSEHDSA---WVKSELVPYLEK---EDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSY :.:::. .:.. :: .:: .::. ... .::.::.. :: .:..:... :..: CCDS14 DAYISYDTKDASVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSK 890 900 910 920 930 940 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 KSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMT :..:::. ....: . .:.: . :. :. . .:.:::::. :.: .: .:. . CCDS14 KTVFVLTKKYAKSWNFKTAFYLALQRLMDENMDVIIFILLEPVLQHS---QYLRLRQRIC 950 960 970 980 990 760 770 780 790 pF1KE3 QRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS . . :::: . . .:::: ..: CCDS14 KSSILQWPDNPKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDSIKQY 1000 1010 1020 1030 1040 >>CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1059 aa) initn: 512 init1: 185 opt: 487 Z-score: 442.4 bits: 93.1 E(32554): 2.5e-18 Smith-Waterman score: 581; 24.9% identity (57.5% similar) in 772 aa overlap (65-778:292-1037) 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 AVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMSQNYIAELQVSDMSF--LSELTVLRLSHNRIQLLD : .... ..: :..: : :: . .. .. CCDS14 GLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINIDRFAFQNLTQLRYLNLSSTSLRKIN 270 280 290 300 310 320 100 110 120 130 140 pF1KE3 LSVFKFNQDLEYLDLSHNQL-QKISCHPIVS----FRHLDLSFNDFKA-----LPICKEF . :: :. ::: : : .:. ... .. :::::: .:. . : ..: CCDS14 AAWFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLPRLEILDLSFNYIKGSYPQHINISRNF 330 340 350 360 370 380 150 160 170 180 190 pF1KE3 GNLSQLNFLGLSAMKLQKL---DLLPIAHL-HLSYILLDLRNYYIKENETESLQIL-NAK ..: .: : : .. .:.: :. :. .: .:: : : . .::. . . .: . : . CCDS14 SKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINLGIN--FIKQIDFKLFQNFSNLE 390 400 410 420 430 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 TLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQ--LTNIKLND---DNCQVFIKFLSELTRGPTLL ..: . : .. .. : . . .: . . . .: : . : .: : . : CCDS14 IIYLSENRISPLVKDTRQSYANSSSFQRHIRKRRSTDFEFDPHSNFYHFTRPLIK-PQCA 440 450 460 470 480 490 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 NFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYL-NIYNLTIIESIREEDFTYSK-TTLKALTIE . . .. . : .: :. :. : : .: :.. . . .. .. ... . CCDS14 AYG-KALDLS---LNSIF-FIGPNQFENLPDIACLNLSANSNAQVLSGTEFSAIPHVKYL 500 510 520 530 540 550 320 330 340 350 360 pF1KE3 HITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFI------HMLCPHAPSTFKFLNFTQN- .::. . :.... : .:..... :. .. : :. . ...: ::...: CCDS14 DLTNNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHYFRIAGVTHHLEFIQNFTNLKVLNLSHNN 560 570 580 590 600 610 370 380 390 400 410 pF1KE3 --VFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLF-----KVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLE ..::. . ..::. :... : : :. . . : . .: ::.: : : CCDS14 IYTLTDKYNLESKSLVE---LVFSGNRLDILWNDDDNRYISIFKGLKNLTRLDLSLNRL- 620 630 640 650 660 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 SGRHKENCTWVE---SIVVLNLSSNMLTDSVFRCLP--PRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVK .: : .... :.. :....::: . : ::...:::..::. . .. CCDS14 --KHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWTLLQQFPRLELLDLRGNKLLFLTDSLSD 670 680 690 700 710 720 480 490 500 510 520 pF1KE3 LEA-LQELNVAFNSLTDLP-GCGS-FSSLSVLIIDHNSVS--HPSADFFQSCQKMRSIKA . . :. : .. : .. :: : : :::. : .. : .. . :: .. :. .. CCDS14 FTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNLLKTINKSALETKTTTKLSMLEL 730 740 750 760 770 780 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 GDNPFQCTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITL :::.:::.. .: . .:. . . : : : . ::. . ..... ..: CCDS14 HGNPFECTCDIGDFRRWMDEHLNVKIPRLVDVI-CASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTA 790 800 810 820 830 840 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 LIV---TIGATMLVLAVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFH .:. :. : .:. .... .: :. :.. :: :. . :. . :. CCDS14 VILFFFTFFITTMVMLAALAHHLFYWDV-WFIYNVCL-------AKVKGYRSLSTSQTFY 850 860 870 880 890 650 660 670 680 690 pF1KE3 -AFISYSEHDSA---WVKSELVPYLEK---EDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSY :.:::. .:.. :: .:: .::. ... .::.::.. :: .:..:... :..: CCDS14 DAYISYDTKDASVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSK 900 910 920 930 940 950 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 KSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMT :..:::. ....: . .:.: . :. :. . .:.:::::. :.: .: .:. . CCDS14 KTVFVLTKKYAKSWNFKTAFYLALQRLMDENMDVIIFILLEPVLQHS---QYLRLRQRIC 960 970 980 990 1000 1010 760 770 780 790 pF1KE3 QRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS . . :::: . . .:::: ..: CCDS14 KSSILQWPDNPKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDSIKQY 1020 1030 1040 1050 >>CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs108|chrX (1049 aa) initn: 551 init1: 170 opt: 443 Z-score: 403.3 bits: 85.9 E(32554): 3.8e-16 Smith-Waterman score: 527; 24.4% identity (54.8% similar) in 792 aa overlap (66-781:280-1033) 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 VDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMSQNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSV .. :. .. :.:: :::: : .: . CCDS14 QLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRLHSNSLQHVPPRW 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 pF1KE3 FKFNQDLEYLDLSHNQLQK-IS----CHPIVSFRHLDLSFN----DFKA-LPICKEFGNL :: . :. ::::.: : : :. : . :. .:::::: ..: . . . :..: CCDS14 FKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASMNLSQAFSSL 310 320 330 340 350 360 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 SQLNFL---GLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRNYYIK-ENETESLQILNAKTLHL ..:..: : .:....: :. .:. . .::: . .:: : . :. :.. : CCDS14 KSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQ-NLEVLDLGTNFIKIANLSMFKQFKRLKVIDL 370 380 390 400 410 420 210 220 230 240 pF1KE3 VFHPTSL--------FAIQVNISVNTLG---CLQLTNIKLND--DNCQVFIKFLSELTRG . : : .. ::.. :: .. . .:. : : .. . CCDS14 SVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCRFKNKEASFMSVN 430 440 450 460 470 480 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 PTLLNF--TLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYSKTTLKA . .. ::. ... .:. .: . .. ::. . : ... .: . :. CCDS14 ESCYKYGQTLDLSKNSI-FFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGSEFQ-PLAELRY 490 500 510 520 530 540 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 LTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIM-MLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNFTQNVF : . . :.. :. .:: : :.. . .: ::.. :.. .. . ..::::.: CCDS14 LDFSN--NRLDLLHSTA----FEELHKLEVLDISSNS--HYF--QSEGITHMLNFTKN-- 550 560 570 580 590 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 TDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEI----LDVSWNSLESGRHK : :. :... : ... . . .... .::. ::: : .. . CCDS14 ----------LKVLQKLMMNDNDISSSTSRTMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRYLQ 600 610 620 630 640 430 440 450 460 470 pF1KE3 --ENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVP-KQVVKLEALQEL .: .: . . . : ..: ..:: .:: .: :.: .: .:: :.. :. :. : CCDS14 LFKNLLKLEELDISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCLKNLETL 650 660 670 680 690 700 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 NVAFNSLTDLP----GCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQ-- ... :.:: .: .:. ::. ::. .:.. . :.:. ..: . ..: .: CCDS14 DLSHNQLTTVPERLSNCS--RSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMI 710 720 730 740 750 760 540 550 560 pF1KE3 ------------------------CTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYR :::. :: .... . : : : ... CCDS14 QKTSFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATD-VTCVGPGAHK 770 780 790 800 810 820 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 GSPLK--DFHMSELS-CNITLLIVTIGATMLVLAVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTR :. . :.. ::. :. :. ..:......... ..: . :. ::. :. .. . CCDS14 GQSVISLDLYTCELDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDV-WYIYHFCK-AKIK 830 840 850 860 870 630 640 650 660 670 pF1KE3 RRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSA---WVKSELVPYLE---KEDIQICLHERNFV : : . . . ::: :. .: : :: .::: :: .. ...::.::... CCDS14 GYQRLI-----SPDCCYDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWL 880 890 900 910 920 930 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 PGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPI ::. ..::. . :. : :..::.. .....: . .:..:. :. : . .:::.:: CCDS14 PGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKP 940 950 960 970 980 990 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 PQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS :.: :. .:. . . :.:: . . . :: .. :. CCDS14 FQKS---KFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV 1000 1010 1020 1030 1040 >>CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs108|chr9 (839 aa) initn: 523 init1: 126 opt: 425 Z-score: 388.6 bits: 82.8 E(32554): 2.5e-15 Smith-Waterman score: 599; 24.9% identity (57.0% similar) in 826 aa overlap (8-781:32-815) 10 20 30 pF1KE3 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIII--VGTRIQFSDGNEFA .: .. . :. . . . . :: : CCDS68 MSASRLAGTLIPAMAFLSCVRPESWEPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKN--- 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 VDKSKRGLIHVPK----DLPLKTKVLDMSQNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLL .: : : :. . ..: . .:::.:. : .. . .. ::.:..: :. : :: : CCDS68 LDLSFNPLRHLGSYSFFSFP-ELQVLDLSRCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSL 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 pF1KE3 DLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI---VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQL :..:. ..:. : ...: .. :: ....:... : .... . . :.::..: CCDS68 ALGAFSGLSSLQKLVAVETNLASLENFPIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNL 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 NFLGLSAMKLQKL---DLLPIAHLHLSYILLDLRNYYIKENETESLQILNAKTLHLVFHP . : ::. :.:.. :: . .. : . ::: .. . ... . . : : . CCDS68 EHLDLSSNKIQSIYCTDLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMNFIQPGAFKEIRLHKLTLRNNF 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 TSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKL----NDDNCQVFIKFLSELTRGPTLLNFTLNHIET :: .... :. :. :.. . : :. : . : : : . :. .: : ... CCDS68 DSLNVMKTCIQ--GLAGLEVHRLVLGEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDY 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 pF1KE3 TWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYSKTTLKAL--------TIEHIT .. .:. : : ... ..:: : ... ..... :. . :.. . CCDS68 YLDDIIDLFNCL--TNVSSFSLVSVTI-ERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKS 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 pF1KE3 NQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHM----LCPHAP---STFKFLNFTQN-VF . . :... ..:::... : . : . : .. ...:.:... : :. CCDS68 LKRLTFTSNKGGNAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVI 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 pF1KE3 TDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDL--FKVGLMTKDMPSLEI----LDVSWNSLESGR : : . : .:: : .:...::.. :.: : ... :.: :..:.. .: CCDS68 TMS--SNFLGLEQLEHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNG- 420 430 440 450 460 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 HKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDS----VFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSV-PKQVVKLEA . :. ::....: . .. .: : . ::: . ..... : .: . CCDS68 -------LSSLEVLKMAGNSFQENFLPDIFTELR-NLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSS 470 480 490 500 510 520 480 490 500 510 520 pF1KE3 LQELNVAFN---SLTDLP-GCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSC-QKMRSIKAGDN :: ::.. : :: .: : ..::.:: . : . . . .: ... .. .: CCDS68 LQVLNMSHNNFFSLDTFPYKC--LNSLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQN 530 540 550 560 570 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 PFQCTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIV : :::: . :.. : . . ..: . ..: : . .: :. .... .:... : CCDS68 DFACTCEHQSFLQWIKDQRQLLVE--VERMECATPSDKQGMPVLSLNI---TCQMNKTI- 580 590 600 610 620 630 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 TIGATML-VLAVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISY ::...: ::.:.:... .: . ..: :. :..:: . ::. : CCDS68 -IGVSVLSVLVVSVVAVLVY-KFYFHL-MLLAGCIKYGRGENI----------YDAFVIY 640 650 660 670 680 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 SEHDSAWVKSELVPYLEK--EDIQICLHERNFVPGKSIVENIINC-IEKSYKSIFVLSPN : .: ::..::: ::. .:.::: :.:.:: .:. :::. ..:: : : :.: . CCDS68 SSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYRDFIPGVAIAANIIHEGFHKSRKVIVVVSQH 690 700 710 720 730 740 710 720 730 740 750 760 pF1KE3 FVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPK :.::.:: .: .:. : . ..:.:.:. . .... . .: :... :::.: CCDS68 FIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVLQKV-EKTLLRQQVELYRLLSRNTYLEWED 750 760 770 780 790 770 780 790 pF1KE3 EKSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS : .:: .: :. CCDS68 SVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTGCNWQEATSI 800 810 820 830 >>CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs108|chr1 (858 aa) initn: 318 init1: 151 opt: 406 Z-score: 371.6 bits: 79.7 E(32554): 2.2e-14 Smith-Waterman score: 529; 23.6% identity (56.9% similar) in 768 aa overlap (48-773:92-828) 20 30 40 50 60 70 pF1KE3 MIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMSQNYIAELQVSDMSFLSE ..:: . ..::.... : :. . .. : . CCDS31 TASSFPFLEQLQLLELGSQYTPLTIDKEAFRNLP-NLRILDLGSSKIYFLHPDAFQGLFH 70 80 90 100 110 120 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 LTVLRLSHNRIQ--LLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHP----IVSFRHLDLSFN : ::: .. .: . :. . : ::::.::.... :: . :.. .:.: : CCDS31 LFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKNQIRSLYLHPSFGKLNSLKSIDFSSN 130 140 150 160 170 180 140 150 160 170 180 pF1KE3 DFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRNYYIK--ENETE . . .:.. .: :. :: ..: .: . . . . .::. .. . . CCDS31 --QIFLVCEH--ELEPLQGKTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMNPFRNMVLEILDVSGN 190 200 210 220 230 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 SLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIKFLSELTRGP . . . .. .. .. :.. . . : . . ::: :.: .. :.:. CCDS31 GWTVDITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIMGAG-FGFHNIKDPDQNT------FAGLARS- 240 250 260 270 280 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 TLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNI-YNLTIIESIREEDFTYSKTTLKALT .. .. :.: ... :::. : : .. ::. :: :..: .: : :. .:..:. CCDS31 SVRHLDLSH-GFVFSLNSRVFETL--KDLKVLNLAYN--KINKIADEAF-YGLDNLQVLN 290 300 310 320 330 340 310 320 330 340 350 pF1KE3 I------EHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCP-----HAPSTFKF . : ... . . ..: : ... .: .. . :.. : .: .:..: CCDS31 LSYNLLGELYSSNFYGLPKVA-YIDLQKNHIAIIQDQTFKFLEKLQTLDLRDNALTTIHF 350 360 370 380 390 400 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 LNFTQNVFTDSIFEKCSTLVKLE---TLI-LQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWN . ..: .. .: :: :.. .:: :..: :..: . .. . .: :.:: .. : CCDS31 IPSIPDIFLSG--NKLVTLPKINLTANLIHLSENRLENLDILYFLLR-VPHLQILILNQN 410 420 430 440 450 420 430 440 450 460 pF1KE3 SLESGRHKENCTWVESIVVLNLSSNML-----TD---SVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSV . : .. . :. : :. ::: :. .::. : ...:: :. : ..:. CCDS31 RFSSCSGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQLAWETELCWDVFEGLS-HLQVLYLNHNYLNSL 460 470 480 490 500 510 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 PKQVVK-LEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSI : : . : ::. :.. : :: : ..: .: :..:.. :. : : : . . CCDS31 PPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTVLSHNDLPANLEILDISRNQLLAPNPDVFVS---LSVL 520 530 540 550 560 570 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 KAGDNPFQCTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNI : : : ::: :.. ... .. .. : : . : ::.:. : : : .: .:. CCDS31 DITHNKFICECELSTFINWLNH-TNVTIAGPPADIYCVYPDSFSGVSL--FSLSTEGCDE 580 590 600 610 620 630 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 TLLIVTIGATMLVL-AVTVTSLCIYLDLPWYLR---MVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNL .. .. ..... .::.: . . . .: ..: : : .. : CCDS31 EEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFRGFCFICYKTAQRLVFKDHPQGTEPDMY 640 650 660 670 680 690 650 660 670 680 690 pF1KE3 QFHAFISYSEHDSAWVKSELVPYLE-----KEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKS .. :.. .: .: .::.. :. .:. .. ...:..::.::::.. . :: . : .: CCDS31 KYDAYLCFSSKDFTWVQNALLKHLDTQYSDQNRFNLCFEERDFVPGENRIANIQDAIWNS 700 710 720 730 740 750 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 YKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALM : . ..: .:... :: . .:. . . .. ::.... . : .. :........ CCDS31 RKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSALIMVVVGSLSQYQL-MKHQSIRGFV 760 770 780 790 800 810 760 770 780 790 pF1KE3 TQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS .. ::.::.. . : : CCDS31 QKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIPLQTVATIS 820 830 840 850 796 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 17:31:21 2016 done: Sun Nov 6 17:31:22 2016 Total Scan time: 3.610 Total Display time: 0.270 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]