FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9684, 838 aa 1>>>pF1KE9684 838 - 838 aa - 838 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7500+/-0.000973; mu= -2.2105+/- 0.059 mean_var=282.8600+/-57.640, 0's: 0 Z-trim(115.1): 30 B-trim: 285 in 2/50 Lambda= 0.076259 statistics sampled from 15680 (15704) to 15680 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.769), E-opt: 0.2 (0.482), width: 16 Scan time: 4.600 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3352.1 TACC3 gene_id:10460|Hs108|chr4 ( 838) 5514 620.2 4.5e-177 CCDS47845.1 TACC1 gene_id:6867|Hs108|chr8 ( 395) 686 88.9 1.9e-17 CCDS55224.1 TACC1 gene_id:6867|Hs108|chr8 ( 610) 689 89.3 2.2e-17 CCDS6109.1 TACC1 gene_id:6867|Hs108|chr8 ( 805) 689 89.4 2.7e-17 CCDS76352.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 ( 575) 684 88.7 3e-17 CCDS7628.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 ( 996) 689 89.4 3.2e-17 CCDS76351.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (1008) 684 88.9 4.8e-17 CCDS7627.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (1026) 684 88.9 4.9e-17 CCDS7625.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (1094) 684 88.9 5.1e-17 CCDS83284.1 TACC1 gene_id:6867|Hs108|chr8 ( 581) 677 88.0 5.2e-17 CCDS76348.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (2826) 685 89.3 1e-16 CCDS76349.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (2875) 685 89.3 1e-16 CCDS7626.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (2948) 684 89.2 1.2e-16 >>CCDS3352.1 TACC3 gene_id:10460|Hs108|chr4 (838 aa) initn: 5514 init1: 5514 opt: 5514 Z-score: 3292.5 bits: 620.2 E(32554): 4.5e-177 Smith-Waterman score: 5514; 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CCDS47 SPVQWAKWTWSAVRGGAAGEDEAGGPEGDPEEEDSQAETKSLSFRSGC----KVKKHETQ 10 20 30 40 50 60 520 530 540 550 560 pF1KE9 QPALELKEESFRDPAEVLGTGAEVDYLEQFGTSSFKESAL----RKQSLYLKFDPL--LR . ::. :: . :.. .... . .:. : .. .. . .: .: :. CCDS47 SLALD---ACSRDEGAVISQISDISNRDGHATDEEKLASTSCGQKSAGAEVKGEPEEDLE 70 80 90 100 110 120 570 580 590 600 610 620 pF1KE9 DSPGRPVPVATETSSMHGANETPSGRPREA-KLVEFD---FLGALDIPVPGPPPGVPAPG :::.: . :. . . .: .:. . .: : :: :. . : .: : CCDS47 YFECSNVPVSTIN---HAFSSSEAGIEKETCQKMEEDGSTVLGLLESSAEKAPVSVSCGG 130 140 150 160 170 630 640 650 660 670 pF1KE9 GPPLSTGPIVDLLQYSQKDLDAVVKATQEE-------NRELRSRCEELHGKNLELGKIMD :: : . :..: ::. .:: : ... :: . . ::. ::. CCDS47 ESPL------DGICLSESDKTAVLTLIREEIITKEIEANEWKKKYEETRQEVLEMRKIVA 180 190 200 210 220 230 680 690 700 710 720 730 pF1KE9 RFEEVVYQAMEEVQKQKELSKAEIQKVLKEKDQLTTDLNSMEKSFSDLFKRFEKQKEVIE ..:... : .:. :. . :. .:.. ::.: .::::.:.:.::::.:.:. : :.: CCDS47 EYEKTIAQMIEDEQRTSMTSQKSFQQLTMEKEQALADLNSVERSLSDLFRRYENLKGVLE 240 250 260 270 280 290 740 750 760 770 780 790 pF1KE9 GYRKNEESLKKCVEDYLARITQEGQRYQALKAHAEEKLQLANEEIAQVRSKAQAEALALQ :..::::.::::..:::::. :: ::::::: ::::::. :::::::::.::.::. ::. CCDS47 GFKKNEEALKKCAQDYLARVKQEEQRYQALKIHAEEKLDKANEEIAQVRTKAKAESAALH 300 310 320 330 340 350 800 810 820 830 pF1KE9 ASLRKEQMRIQSLEKTVEQKTKENEELTRICDDLISKMEKI :.::::::...:::....::..: ::::.:::.::.:. : CCDS47 AGLRKEQMKVESLERALQQKNQEIEELTKICDELIAKLGKTD 360 370 380 390 >>CCDS55224.1 TACC1 gene_id:6867|Hs108|chr8 (610 aa) initn: 734 init1: 646 opt: 689 Z-score: 425.7 bits: 89.3 E(32554): 2.2e-17 Smith-Waterman score: 819; 32.3% identity (56.8% similar) in 644 aa overlap (232-837:14-608) 210 220 230 240 250 260 pF1KE9 LEDPCRTESQHKAETPHGAEEECKAETPHGAEEECRHGGVCAPAAVATSPPGAIPKEACG :: . . :. : . . :: . CCDS55 MTEGSMGVTLEASAEADLKAGNSCPELVPSRRSKLRKPKPV-- 10 20 30 40 270 280 290 300 310 pF1KE9 GAPL--QGLPGEALGYPAGV-GTPVPADSTQTLTCAHTSAPESTAPTNHLVAGRAMTLSP :: ... :: :.: :::.: : : : : :. :.. . :: CCDS55 --PLRKKAIGGEFSDTNAAVEGTPLPKASY------HFSPEELDENTSPLLGDARFQKSP 50 60 70 80 90 320 330 340 350 360 pF1KE9 QE-EVAAGQMASS-----------SRSGPVKLEFDVSD--GATSKRAPPPRRLGERSG-- . . . : ..:. :::.:.::::: .. : : ::.::.. : CCDS55 PDLKETPGTLSSDTNDSGVELGEESRSSPLKLEFDFTEDTGNIEARKALPRKLGRKLGST 100 110 120 130 140 150 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 LKPPLRKAAVRQQKAPQEVEEDDGRSGAGEDPPMPASRGSYHLDWDKMDDPNFIPFGGDT : : ..: .. .. . .. . .:.: : :. : . : .. ..:.: :::. . CCDS55 LTPKIQKDGISKSAGLEQPTDPVARDG-------PLSQTSSKPDPSQWESPSFNPFGSHS 160 170 180 190 200 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 KSGCSEAQPPESPETRLGQPAAEQLHAGPAT--EEPGPCLSQQLHSASAEDTPVVQLAAE . .:: : : :. : : . : : ..: .:. . . : CCDS55 ---VLQNSPPLSSE---GS-----YHFDPDNFDESMDPFKPTTTLTSSDFCSPTGNHVNE 210 220 230 240 250 490 500 510 520 530 540 pF1KE9 TPTAESKERALNSASTSLPTSCPGSEPVPTHQQEQPALELKEESFRDPAEVLGTGAEVDY :: ..: : . ..: : :. .. ::. :: . :.. .... CCDS55 I--LESPKKA---KSRLITSGCK----VKKHETQSLALD---ACSRDEGAVISQISDISN 260 270 280 290 300 550 560 570 580 590 pF1KE9 LEQFGTSSFKESAL----RKQSLYLKFDPL--LRDSPGRPVPVATETSSMHGANETPSGR . .:. : .. .. . .: .: :. :::.: . :. . . .: CCDS55 RDGHATDEEKLASTSCGQKSAGAEVKGEPEEDLEYFECSNVPVSTIN---HAFSSSEAGI 310 320 330 340 350 360 600 610 620 630 640 650 pF1KE9 PREA-KLVEFD---FLGALDIPVPGPPPGVPAPGGPPLSTGPIVDLLQYSQKDLDAVVKA .:. . .: : :: :. . : .: : :: : . :..: ::. CCDS55 EKETCQKMEEDGSTVLGLLESSAEKAPVSVSCGGESPL------DGICLSESDKTAVLTL 370 380 390 400 410 660 670 680 690 700 pF1KE9 TQEE-------NRELRSRCEELHGKNLELGKIMDRFEEVVYQAMEEVQKQKELSKAEIQK .:: : ... :: . . ::. ::. ..:... : .:. :. . :. .:. CCDS55 IREEIITKEIEANEWKKKYEETRQEVLEMRKIVAEYEKTIAQMIEDEQRTSMTSQKSFQQ 420 430 440 450 460 470 710 720 730 740 750 760 pF1KE9 VLKEKDQLTTDLNSMEKSFSDLFKRFEKQKEVIEGYRKNEESLKKCVEDYLARITQEGQR . ::.: .::::.:.:.::::.:.:. : :.::..::::.::::..:::::. :: :: CCDS55 LTMEKEQALADLNSVERSLSDLFRRYENLKGVLEGFKKNEEALKKCAQDYLARVKQEEQR 480 490 500 510 520 530 770 780 790 800 810 820 pF1KE9 YQALKAHAEEKLQLANEEIAQVRSKAQAEALALQASLRKEQMRIQSLEKTVEQKTKENEE ::::: ::::::. :::::::::.::.::. ::.:.::::::...:::....::..: :: CCDS55 YQALKIHAEEKLDKANEEIAQVRTKAKAESAALHAGLRKEQMKVESLERALQQKNQEIEE 540 550 560 570 580 590 830 pF1KE9 LTRICDDLISKMEKI ::.:::.::.:. : CCDS55 LTKICDELIAKLGKTD 600 610 >>CCDS6109.1 TACC1 gene_id:6867|Hs108|chr8 (805 aa) initn: 767 init1: 646 opt: 689 Z-score: 423.9 bits: 89.4 E(32554): 2.7e-17 Smith-Waterman score: 856; 30.6% identity (55.4% similar) in 784 aa overlap (118-837:70-803) 90 100 110 120 130 140 pF1KE9 LGLENSHPVWTQKENQQLIKEVDAKTTHGILQKPVEADTD-LLGDASPAFGSGSSSESGP ...: . . : :: :.:. : :.:. CCDS61 EEEDSQAETKSLSFSSDSEGNFETPEAETPIRSPFKESCDPSLGLAGPGAKSQESQEADE 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE9 GALADL--DCSSSSQS-PGSSE--NQMVSPGKVSGSPEQAVEENLSSYSLDRRVTPASET .:.. :::.. : :. .: .: .. .:.. :. :...:. :. : . .. CCDS61 QLVAEVVEKCSSKTCSKPSENEVPQQAIDSHSVKNFREEP-EHDFSKISIVRPFSIETKD 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 pF1KE9 LED-----------PCRTESQHKA---ETPHGAEEECKAETPHG------AEEECRHGGV : : : . :: : . ..: .: : :: . . :. CCDS61 STDISAVLGTKAAHGCVTAVSGKALPSSPPDALQDEAMTEGSMGVTLEASAEADLKAGNS 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 pF1KE9 CAPAAVATSPPGAIPKEACGGAPL--QGLPGEALGYPAGV-GTPVPADSTQTLTCAHTSA : . . :: . :: ... :: :.: :::.: : : : CCDS61 CPELVPSRRSKLRKPKPV----PLRKKAIGGEFSDTNAAVEGTPLPKASY------HFSP 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 pF1KE9 PESTAPTNHLVAGRAMTLSPQE-EVAAGQMASS-----------SRSGPVKLEFDVSD-- : :. :.. . :: . . . : ..:. :::.:.::::: .. CCDS61 EELDENTSPLLGDARFQKSPPDLKETPGTLSSDTNDSGVELGEESRSSPLKLEFDFTEDT 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KE9 GATSKRAPPPRRLGERSG--LKPPLRKAAVRQQKAPQEVEEDDGRSGAGEDPPMPASRGS : : ::.::.. : : : ..: .. .. . .. . .:.: : :. : CCDS61 GNIEARKALPRKLGRKLGSTLTPKIQKDGISKSAGLEQPTDPVARDG-------PLSQTS 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 pF1KE9 YHLDWDKMDDPNFIPFGGDTKSGCSEAQPPESPETRLGQPAAEQLHAGPAT--EEPGPCL . : .. ..:.: :::. . . .:: : : :. : : . : : CCDS61 SKPDPSQWESPSFNPFGSHS---VLQNSPPLSSE---GS-----YHFDPDNFDESMDPFK 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 pF1KE9 SQQLHSASAEDTPVVQLAAETPTAESKERALNSASTSLPTSCPGSEPVPTHQQEQPALEL ..: .:. . . : :: ..: : . ..: : :. .. ::. CCDS61 PTTTLTSSDFCSPTGNHVNE--ILESPKKA---KSRLITSGCK----VKKHETQSLALD- 440 450 460 470 480 530 540 550 560 570 pF1KE9 KEESFRDPAEVLGTGAEVDYLEQFGTSSFKESAL----RKQSLYLKFDPL--LRDSPGRP :: . :.. .... . .:. : .. .. . .: .: :. CCDS61 --ACSRDEGAVISQISDISNRDGHATDEEKLASTSCGQKSAGAEVKGEPEEDLEYFECSN 490 500 510 520 530 580 590 600 610 620 630 pF1KE9 VPVATETSSMHGANETPSGRPREA-KLVEFD---FLGALDIPVPGPPPGVPAPGGPPLST :::.: . :. . . .: .:. . .: : :: :. . : .: : :: CCDS61 VPVSTIN---HAFSSSEAGIEKETCQKMEEDGSTVLGLLESSAEKAPVSVSCGGESPL-- 540 550 560 570 580 590 640 650 660 670 680 pF1KE9 GPIVDLLQYSQKDLDAVVKATQEE-------NRELRSRCEELHGKNLELGKIMDRFEEVV : . :..: ::. .:: : ... :: . . ::. ::. ..:... CCDS61 ----DGICLSESDKTAVLTLIREEIITKEIEANEWKKKYEETRQEVLEMRKIVAEYEKTI 600 610 620 630 640 690 700 710 720 730 740 pF1KE9 YQAMEEVQKQKELSKAEIQKVLKEKDQLTTDLNSMEKSFSDLFKRFEKQKEVIEGYRKNE : .:. :. . :. .:.. ::.: .::::.:.:.::::.:.:. : :.::..::: CCDS61 AQMIEDEQRTSMTSQKSFQQLTMEKEQALADLNSVERSLSDLFRRYENLKGVLEGFKKNE 650 660 670 680 690 700 750 760 770 780 790 800 pF1KE9 ESLKKCVEDYLARITQEGQRYQALKAHAEEKLQLANEEIAQVRSKAQAEALALQASLRKE :.::::..:::::. :: ::::::: ::::::. :::::::::.::.::. ::.:.:::: CCDS61 EALKKCAQDYLARVKQEEQRYQALKIHAEEKLDKANEEIAQVRTKAKAESAALHAGLRKE 710 720 730 740 750 760 810 820 830 pF1KE9 QMRIQSLEKTVEQKTKENEELTRICDDLISKMEKI ::...:::....::..: ::::.:::.::.:. : CCDS61 QMKVESLERALQQKNQEIEELTKICDELIAKLGKTD 770 780 790 800 >>CCDS76352.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (575 aa) initn: 808 init1: 658 opt: 684 Z-score: 423.1 bits: 88.7 E(32554): 3e-17 Smith-Waterman score: 807; 32.9% identity (60.0% similar) in 578 aa overlap (366-837:2-574) 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 VKLEFDVSDGATSKRAPPPRRLGERSGLKPPLRKAAVRQQKAPQEVEEDDG---RSGAGE :::. ...:.:..... . :: : : CCDS76 MPLRRP--KMKKTPEKLDNTPASPPRSPA-E 10 20 400 410 420 430 pF1KE9 DPPMPASRGSYHLDWDKMDDPNFIPFGGDTK----------------SGCSEAQPP---- .: ..:.: .: :: ::::: ::.. .: . :.:. : CCDS76 PNDIPIAKGTYTFDIDKWDDPNFNPFSSTSKMQESPKLPQQSYNFDPDTCDESVDPFKTS 30 40 50 60 70 80 440 450 460 470 pF1KE9 -ESPETRLGQPAAEQLHAG--------------PATEEPGPCLSQQLH-SASAEDTPVVQ ..: . .::. .. :. :: .. : .. .. . : . .:. . CCDS76 SKTPSSPSKSPASFEIPASAMEANGVDGDGLNKPAKKKKTPLKTDTFRVKKSPKRSPLSD 90 100 110 120 130 140 480 490 500 510 pF1KE9 LAAETPT-AESKER-----ALNSAS-------TSLPTSCPGSEPVPTHQQEQP-----AL .. :: : . : :. :. :. .: . . . .:. : . 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CCDS76 SPV-KSSPVRMSESPTPCSGSSFEETEALVNTAAKNQHPVPRGLAPNQESHLQVPEKSSQ 640 650 660 670 680 690 610 620 630 pF1KE9 VEFDFLG------ALDIPVP--------------GPPPGV--------P--APGGPPLST :.. .: :..: .: . : .. : : .::: . CCDS76 KELEAMGLGTPSEAIEITAPEGSFASADALLSRLAHPVSLCGALDYLEPDLAEKNPPLFA 700 710 720 730 740 750 640 650 pF1KE9 GPI-------VDL---------------------LQYSQKDLDAVVKATQEE----NREL . .:. : ..: :::.... .. : .::. 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CCDS76 ELVDTFQTLEPRASDAKNQEGKVNTRRKSTDSVP-ISKSTLSRSLSLQASDFDGASSSGN 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 pF1KE9 PGSSE--NQMVSPGKVSGSPEQAVEENLSSYSLDRRVTPASETLEDPCRTESQHKAE--- : . . : :. :.: .. :: .. : . : : . .:. : CCDS76 PEAVALAPDAYSTGSSSASSTLKRTKKPRPPSLKKKQTTKKPTETPPVKETQQEPDEESL 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 TPHGAEEECKAETPHGAEEECRHGGVCAPAAVATSP--PGAIPKEACGGAPLQGLPGEAL .: : :. .:: : . : .:: . .: :.. :: :: ::.. .:.. CCDS76 VPSG--ENLASETK---TESAKTEGP-SPALLEETPLEPAVGPKAAC---PLDSESAEGV 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 GYPAGVGTPVPADSTQTLTCAHTSAPESTAPTNHLVAGRAMTLSPQEEVAAGQMASSSRS ::. : : . .. . : .::: ::. ..:.. ..:: : ... CCDS76 VPPASGGGRVQNSPP----VGRKTLPLTTAPE----AGE---VTPSD--SGGQEDSPAKG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 GPVKLEFDVSDGATS----KRAPPP-RRLGERSGLKPPLRKAAVRQQKAPQEVEEDDG-- :.:::: :. .: .. ::: ...:.. : :::. ...:.:..... . 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