Result of FASTA (omim) for pFN21AE1938
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1938, 480 aa
  1>>>pF1KE1938 480 - 480 aa - 480 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3318+/-0.000419; mu= 17.6834+/- 0.026
 mean_var=67.6180+/-13.851, 0's: 0 Z-trim(110.8): 29  B-trim: 21 in 1/52
 Lambda= 0.155971
 statistics sampled from 19225 (19253) to 19225 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.226), width:  16
 Scan time:  9.430

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_003356 (OMIM: 191328) cytochrome b-c1 complex s ( 480) 3190 727.2 2.4e-209
NP_004270 (OMIM: 603131) mitochondrial-processing  ( 489) 1811 416.9 6.3e-116
XP_006716244 (OMIM: 603131) PREDICTED: mitochondri ( 506) 1711 394.4 3.8e-109
XP_005250774 (OMIM: 603131) PREDICTED: mitochondri ( 508) 1711 394.4 3.8e-109
NP_055975 (OMIM: 213200,613036) mitochondrial-proc ( 525)  415 102.8 2.4e-21
XP_005266116 (OMIM: 213200,613036) PREDICTED: mito ( 563)  415 102.8 2.6e-21
NP_003357 (OMIM: 191329,615160) cytochrome b-c1 co ( 453)  370 92.7 2.4e-18
NP_001269875 (OMIM: 213200,613036) mitochondrial-p ( 425)  247 65.0 4.9e-10
NP_001269873 (OMIM: 213200,613036) mitochondrial-p ( 394)  180 49.9 1.6e-05
XP_016870032 (OMIM: 213200,613036) PREDICTED: mito ( 343)  165 46.5 0.00015
XP_011516719 (OMIM: 213200,613036) PREDICTED: mito ( 381)  165 46.5 0.00016
XP_016856864 (OMIM: 602651) PREDICTED: nardilysin  (1019)  157 44.9  0.0013
XP_011539825 (OMIM: 602651) PREDICTED: nardilysin  (1019)  157 44.9  0.0013
NP_001095132 (OMIM: 602651) nardilysin isoform b p (1151)  157 44.9  0.0014
XP_016871676 (OMIM: 146680) PREDICTED: insulin-deg ( 978)  153 44.0  0.0023
XP_016871678 (OMIM: 146680) PREDICTED: insulin-deg ( 978)  153 44.0  0.0023
XP_016871677 (OMIM: 146680) PREDICTED: insulin-deg ( 978)  153 44.0  0.0023
XP_016871679 (OMIM: 146680) PREDICTED: insulin-deg ( 978)  153 44.0  0.0023
NP_001309725 (OMIM: 146680) insulin-degrading enzy ( 978)  153 44.0  0.0023
NP_001309724 (OMIM: 146680) insulin-degrading enzy ( 978)  153 44.0  0.0023
NP_001309722 (OMIM: 146680) insulin-degrading enzy (1019)  153 44.0  0.0023
NP_004960 (OMIM: 146680) insulin-degrading enzyme  (1019)  153 44.0  0.0023
NP_001229290 (OMIM: 602651) nardilysin isoform c [ (1087)  151 43.6  0.0034
XP_011539824 (OMIM: 602651) PREDICTED: nardilysin  (1109)  151 43.6  0.0034
NP_002516 (OMIM: 602651) nardilysin isoform a [Hom (1219)  151 43.6  0.0037


>>NP_003356 (OMIM: 191328) cytochrome b-c1 complex subun  (480 aa)
 initn: 3190 init1: 3190 opt: 3190  Z-score: 3879.4  bits: 727.2 E(85289): 2.4e-209
Smith-Waterman score: 3190; 100.0% identity (100.0% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-480)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAASVVCRAATAGAQVLLRARRSPALLRTPALRSTATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MAASVVCRAATAGAQVLLRARRSPALLRTPALRSTATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 SEQSSQPTCTVGVWIDVGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVESMGAHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SEQSSQPTCTVGVWIDVGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVESMGAHL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 NAYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NAYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 DVVFNYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DVVFNYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 QLLDLAQKHLGGIPWTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIRHRDDALPFAHVAIAVEGPGWASPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QLLDLAQKHLGGIPWTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIRHRDDALPFAHVAIAVEGPGWASPD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 NVALQVANAIIGHYDCTYGGGVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSICYAETGLLGAHFVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NVALQVANAIIGHYDCTYGGGVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSICYAETGLLGAHFVC
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 DRMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DRMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 GRRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GRRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF
              430       440       450       460       470       480

>>NP_004270 (OMIM: 603131) mitochondrial-processing pept  (489 aa)
 initn: 1816 init1: 922 opt: 1811  Z-score: 2202.3  bits: 416.9 E(85289): 6.3e-116
Smith-Waterman score: 1811; 57.6% identity (86.4% similar) in 448 aa overlap (32-479:42-488)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KE1 AASVVCRAATAGAQVLLRARRSPALLRTPALRSTATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVAS
                                     :::: . .:..  ::::.:. :..::::::
NP_004 SAARRRLWGFSESLLIRGAAGRSLYFGENRLRSTQAATQVVLNVPETRVTCLESGLRVAS
              20        30        40        50        60        70 

              70        80        90       100       110       120 
pF1KE1 EQSSQPTCTVGVWIDVGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVESMGAHLN
       :.:.  :::::.:::.:::.:.:::::...::::.::::::.:    :: :.:.::::::
NP_004 EDSGLSTCTVGLWIDAGSRYENEKNNGTAHFLEHMAFKGTKKRSQLDLELEIENMGAHLN
              80        90       100       110       120       130 

             130       140       150       160       170       180 
pF1KE1 AYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMRD
       ::..::.:.:: ::.:::::.:::.:.::.:: .: ...::.:: :::::::: ......
NP_004 AYTSREQTVYYAKAFSKDLPRAVEILADIIQNSTLGEAEIERERGVILREMQEVETNLQE
             140       150       160       170       180       190 

             190       200       210       220       230       240 
pF1KE1 VVFNYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQ
       :::.::::::.:.: :.... ::.::....:: ::..:..::::.::.:::::::: :..
NP_004 VVFDYLHATAYQNTALGRTILGPTENIKSISRKDLVDYITTHYKGPRIVLAAAGGVSHDE
             200       210       220       230       240       250 

             250       260       270       280       290       300 
pF1KE1 LLDLAQKHLGGIPWTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIRHRDDALPFAHVAIAVEGPGWASPDN
       :::::. :.:    :. .  .:.: ::.::::::: ::: .:.::.:::::. ::: ::.
NP_004 LLDLAKFHFGDSLCTH-KGEIPALPPCKFTGSEIRVRDDKMPLAHLAIAVEAVGWAHPDT
             260        270       280       290       300       310

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE1 VALQVANAIIGHYDCTYGGGVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSICYAETGLLGAHFVCD
       . :.:::..::..: ..:::..::: ::. .  ..::.:::.:.  :..::: : ..::.
NP_004 ICLMVANTLIGNWDRSFGGGMNLSSKLAQLTCHGNLCHSFQSFNTSYTDTGLWGLYMVCE
              320       330       340       350       360       370

             370       380       390       400       410       420 
pF1KE1 RMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTYG
          . ::. :.: .:::::::.:::::::..:.:.. .. .:::.::.::::::..: :.
NP_004 SSTVADMLHVVQKEWMRLCTSVTESEVARARNLLKTNMLLQLDGSTPICEDIGRQMLCYN
              380       390       400       410       420       430

             430       440       450       460       470       480
pF1KE1 RRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF
       ::::. : :.::  :.: ..::.:.::::.. ::.:. :::.::::...:::.: ::: 
NP_004 RRIPIPELEARIDAVNAETIREVCTKYIYNRSPAIAAVGPIKQLPDFKQIRSNMCWLRD
              440       450       460       470       480         

>>XP_006716244 (OMIM: 603131) PREDICTED: mitochondrial-p  (506 aa)
 initn: 1698 init1: 922 opt: 1711  Z-score: 2080.5  bits: 394.4 E(85289): 3.8e-109
Smith-Waterman score: 1711; 57.1% identity (86.0% similar) in 429 aa overlap (32-460:42-469)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KE1 AASVVCRAATAGAQVLLRARRSPALLRTPALRSTATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVAS
                                     :::: . .:..  ::::.:. :..::::::
XP_006 SAARRRLWGFSESLLIRGAAGRSLYFGENRLRSTQAATQVVLNVPETRVTCLESGLRVAS
              20        30        40        50        60        70 

              70        80        90       100       110       120 
pF1KE1 EQSSQPTCTVGVWIDVGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVESMGAHLN
       :.:.  :::::.:::.:::.:.:::::...::::.::::::.:    :: :.:.::::::
XP_006 EDSGLSTCTVGLWIDAGSRYENEKNNGTAHFLEHMAFKGTKKRSQLDLELEIENMGAHLN
              80        90       100       110       120       130 

             130       140       150       160       170       180 
pF1KE1 AYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMRD
       ::..::.:.:: ::.:::::.:::.:.::.:: .: ...::.:: :::::::: ......
XP_006 AYTSREQTVYYAKAFSKDLPRAVEILADIIQNSTLGEAEIERERGVILREMQEVETNLQE
             140       150       160       170       180       190 

             190       200       210       220       230       240 
pF1KE1 VVFNYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQ
       :::.::::::.:.: :.... ::.::....:: ::..:..::::.::.:::::::: :..
XP_006 VVFDYLHATAYQNTALGRTILGPTENIKSISRKDLVDYITTHYKGPRIVLAAAGGVSHDE
             200       210       220       230       240       250 

             250       260       270       280       290       300 
pF1KE1 LLDLAQKHLGGIPWTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIRHRDDALPFAHVAIAVEGPGWASPDN
       :::::. :.:    :. .  .:.: ::.::::::: ::: .:.::.:::::. ::: ::.
XP_006 LLDLAKFHFGDSLCTH-KGEIPALPPCKFTGSEIRVRDDKMPLAHLAIAVEAVGWAHPDT
             260        270       280       290       300       310

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE1 VALQVANAIIGHYDCTYGGGVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSICYAETGLLGAHFVCD
       . :.:::..::..: ..:::..::: ::. .  ..::.:::.:.  :..::: : ..::.
XP_006 ICLMVANTLIGNWDRSFGGGMNLSSKLAQLTCHGNLCHSFQSFNTSYTDTGLWGLYMVCE
              320       330       340       350       360       370

             370       380       390       400       410       420 
pF1KE1 RMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTYG
          . ::. :.: .:::::::.:::::::..:.:.. .. .:::.::.::::::..: :.
XP_006 SSTVADMLHVVQKEWMRLCTSVTESEVARARNLLKTNMLLQLDGSTPICEDIGRQMLCYN
              380       390       400       410       420       430

             430       440       450       460       470       480 
pF1KE1 RRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF 
       ::::. : :.::  :.: ..::.:.::::.. ::.:. :                     
XP_006 RRIPIPELEARIDAVNAETIREVCTKYIYNRSPAIAAVGYNHRSELHEWKWNKLFSKRQT
              440       450       460       470       480       490

XP_006 ISYSYVNILLPQPQPQ
              500      

>>XP_005250774 (OMIM: 603131) PREDICTED: mitochondrial-p  (508 aa)
 initn: 1698 init1: 922 opt: 1711  Z-score: 2080.4  bits: 394.4 E(85289): 3.8e-109
Smith-Waterman score: 1711; 57.1% identity (86.0% similar) in 429 aa overlap (32-460:42-469)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KE1 AASVVCRAATAGAQVLLRARRSPALLRTPALRSTATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVAS
                                     :::: . .:..  ::::.:. :..::::::
XP_005 SAARRRLWGFSESLLIRGAAGRSLYFGENRLRSTQAATQVVLNVPETRVTCLESGLRVAS
              20        30        40        50        60        70 

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pF1KE1 EQSSQPTCTVGVWIDVGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVESMGAHLN
       :.:.  :::::.:::.:::.:.:::::...::::.::::::.:    :: :.:.::::::
XP_005 EDSGLSTCTVGLWIDAGSRYENEKNNGTAHFLEHMAFKGTKKRSQLDLELEIENMGAHLN
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pF1KE1 AYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMRD
       ::..::.:.:: ::.:::::.:::.:.::.:: .: ...::.:: :::::::: ......
XP_005 AYTSREQTVYYAKAFSKDLPRAVEILADIIQNSTLGEAEIERERGVILREMQEVETNLQE
             140       150       160       170       180       190 

             190       200       210       220       230       240 
pF1KE1 VVFNYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQ
       :::.::::::.:.: :.... ::.::....:: ::..:..::::.::.:::::::: :..
XP_005 VVFDYLHATAYQNTALGRTILGPTENIKSISRKDLVDYITTHYKGPRIVLAAAGGVSHDE
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pF1KE1 LLDLAQKHLGGIPWTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIRHRDDALPFAHVAIAVEGPGWASPDN
       :::::. :.:    :. .  .:.: ::.::::::: ::: .:.::.:::::. ::: ::.
XP_005 LLDLAKFHFGDSLCTH-KGEIPALPPCKFTGSEIRVRDDKMPLAHLAIAVEAVGWAHPDT
             260        270       280       290       300       310

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pF1KE1 VALQVANAIIGHYDCTYGGGVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSICYAETGLLGAHFVCD
       . :.:::..::..: ..:::..::: ::. .  ..::.:::.:.  :..::: : ..::.
XP_005 ICLMVANTLIGNWDRSFGGGMNLSSKLAQLTCHGNLCHSFQSFNTSYTDTGLWGLYMVCE
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pF1KE1 RMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTYG
          . ::. :.: .:::::::.:::::::..:.:.. .. .:::.::.::::::..: :.
XP_005 SSTVADMLHVVQKEWMRLCTSVTESEVARARNLLKTNMLLQLDGSTPICEDIGRQMLCYN
              380       390       400       410       420       430

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pF1KE1 RRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF 
       ::::. : :.::  :.: ..::.:.::::.. ::.:. :                     
XP_005 RRIPIPELEARIDAVNAETIREVCTKYIYNRSPAIAAVGYNHRSELHEWKWNKLFSKRQT
              440       450       460       470       480       490

XP_005 ISYSYVNILLPQPQPQYV
              500        

>>NP_055975 (OMIM: 213200,613036) mitochondrial-processi  (525 aa)
 initn: 374 init1: 183 opt: 415  Z-score: 504.2  bits: 102.8 E(85289): 2.4e-21
Smith-Waterman score: 597; 31.0% identity (60.6% similar) in 452 aa overlap (47-475:66-510)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KE1 LLRARRSPALLRTPALRSTATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVASEQSSQPTCTVGVWID
                                     ::.:. :::::::::...    ::::. :.
NP_055 GGAYPNIPLSSPLPGVPKPVFATVDGQEKFETKVTTLDNGLRVASQNKFGQFCTVGILIN
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pF1KE1 VGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEK--EVESMGAHLNAYSTREHTAYYIK
        :::.:..  .: ..:::.:::..:  :  :  :    .:. :.  .  ..:. : : ..
NP_055 SGSRYEAKYLSGIAHFLEKLAFSSTA-RFDSKDEILLTLEKHGGICDCQTSRDTTMYAVS
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pF1KE1 ALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMRD----VVFNYLHAT
       : :: :  .: ::.:.: .  : : ..:  : ..  :..  : ..:     .. ...: .
NP_055 ADSKGLDTVVALLADVVLQPRLTDEEVEMTRMAVQFELE--DLNLRPDPEPLLTEMIHEA
          160       170       180       190         200       210  

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pF1KE1 AFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQLLDLAQKHL
       :.. . ..     :.::: :..:  :  :: ..:   :::::..: :::..:.: :.:.:
NP_055 AYRENTVGLHRFCPTENVAKINREVLHSYLRNYYTPDRMVLAGVG-VEHEHLVDCARKYL
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pF1KE1 GGI-P-WTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIR-HRD--------DALP-FAHVAIAVEGPGWAS
        :. : :  :: .    .  ..::.  . .::          .: ..:. ...:. ..  
NP_055 LGVQPAWGSAEAVDIDRSVAQYTGGIAKLERDMSNVSLGPTPIPELTHIMVGLESCSFLE
             280       290       300       310       320       330 

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pF1KE1 PDNVALQVANAIIGHYDC-TYGG-GVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSI--CYAETGLL
        : . . : : ..:     . :: :  . : :  . : :.    ... :    : .::::
NP_055 EDFIPFAVLNMMMGGGGSFSAGGPGKGMFSRLYLN-VLNRHHWMYNATSYHHSYEDTGLL
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pF1KE1 GAHFVCDRMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIG
         :   :  .. .:. ..  ... .  ..   :. :.:. : . :. .:..   . ::.:
NP_055 CIHASADPRQVREMVEIITKEFILMGGTVDTVELERAKTQLTSMLMMNLESRPVIFEDVG
              400       410       420       430       440       450

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pF1KE1 RSLL-TYGRRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRS
       :..: : .:..:  :  . : .:    :... ::..  . ::::. : . .:: :..:..
NP_055 RQVLATRSRKLP-HELCTLIRNVKPEDVKRVASKMLRGK-PAVAALGDLTDLPTYEHIQT
              460        470       480        490       500        

           480          
pF1KE1 GMFWLRF          
       ..               
NP_055 ALSSKDGRLPRTYRLFR
      510       520     

>>XP_005266116 (OMIM: 213200,613036) PREDICTED: mitochon  (563 aa)
 initn: 348 init1: 183 opt: 415  Z-score: 503.7  bits: 102.8 E(85289): 2.6e-21
Smith-Waterman score: 533; 31.1% identity (60.2% similar) in 402 aa overlap (47-425:66-462)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KE1 LLRARRSPALLRTPALRSTATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVASEQSSQPTCTVGVWID
                                     ::.:. :::::::::...    ::::. :.
XP_005 GGAYPNIPLSSPLPGVPKPVFATVDGQEKFETKVTTLDNGLRVASQNKFGQFCTVGILIN
          40        50        60        70        80        90     

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pF1KE1 VGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEK--EVESMGAHLNAYSTREHTAYYIK
        :::.:..  .: ..:::.:::..:  :  :  :    .:. :.  .  ..:. : : ..
XP_005 SGSRYEAKYLSGIAHFLEKLAFSSTA-RFDSKDEILLTLEKHGGICDCQTSRDTTMYAVS
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          140       150       160       170       180           190
pF1KE1 ALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMRD----VVFNYLHAT
       : :: :  .: ::.:.: .  : : ..:  : ..  :..  : ..:     .. ...: .
XP_005 ADSKGLDTVVALLADVVLQPRLTDEEVEMTRMAVQFELE--DLNLRPDPEPLLTEMIHEA
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              200       210       220       230       240       250
pF1KE1 AFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQLLDLAQKHL
       :.. . ..     :.::: :..:  :  :: ..:   :::::..: :::..:.: :.:.:
XP_005 AYRENTVGLHRFCPTENVAKINREVLHSYLRNYYTPDRMVLAGVG-VEHEHLVDCARKYL
            220       230       240       250        260       270 

                260       270                280        290        
pF1KE1 GGI-P-WTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIR-HRD--------DALP-FAHVAIAVEGPGWAS
        :. : :  :: .    .  ..::.  . .::          .: ..:. ...:. ..  
XP_005 LGVQPAWGSAEAVDIDRSVAQYTGGIAKLERDMSNVSLGPTPIPELTHIMVGLESCSFLE
             280       290       300       310       320       330 

      300       310        320        330       340         350    
pF1KE1 PDNVALQVANAIIGHYDC-TYGG-GVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSI--CYAETGLL
        : . . : : ..:     . :: :  . : :  . : :.    ... :    : .::::
XP_005 EDFIPFAVLNMMMGGGGSFSAGGPGKGMFSRLYLN-VLNRHHWMYNATSYHHSYEDTGLL
             340       350       360        370       380       390

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pF1KE1 GAHFVCDRMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIG
         :   :  .. .:. ..  ... .  ..   :. :.:. : . :. .:..   . ::.:
XP_005 CIHASADPRQVREMVEIITKEFILMGGTVDTVELERAKTQLTSMLMMNLESRPVIFEDVG
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pF1KE1 RSLL-TYGRRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRS
       :..: : .:..:                                                
XP_005 RQVLATRSRKLPHELCTLIREYRRGSEGLPQASARLRGGRLALPQAVVGLWYVHHTQNLG
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>>NP_003357 (OMIM: 191329,615160) cytochrome b-c1 comple  (453 aa)
 initn: 190 init1: 190 opt: 370  Z-score: 450.4  bits: 92.7 E(85289): 2.4e-18
Smith-Waterman score: 379; 23.5% identity (57.6% similar) in 469 aa overlap (15-466:2-448)

               10        20           30        40        50       
pF1KE1 MAASVVCRAATAGAQVLLRA---RRSPALLRTPALRSTATFAQALQFVPETQVSLLDNGL
                     ..: ::    :  .:  .: ...::. : :     . . . : :::
NP_003              MKLLTRAGSFSRFYSLKVAPKVKATAAPAGAPPQPQDLEFTKLPNGL
                            10        20        30        40       

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE1 RVASEQSSQPTCTVGVWIDVGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVESMG
        .:: .. .:.  .:..: .:::.:  .: :. ..:.  .   ::.  .  . . .:..:
NP_003 VIASLENYSPVSRIGLFIKAGSRYEDFSNLGTTHLLRLTSSLTTKGASSFKITRGIEAVG
        50        60        70        80        90       100       

       120       130       140       150              160       170
pF1KE1 AHLNAYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLE-------DSQIEKERDVILR
       ..:.. .:::. :: .. :  :.   .:.: ...    ..       . :.. .. : ..
NP_003 GKLSVTATRENMAYTVECLRGDVDILMEFLLNVTTAPEFRRWEVADLQPQLKIDKAVAFQ
       110       120       130       140       150       160       

              180       190       200       210       220       230
pF1KE1 EMQENDASMRDVVFNYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMV
       . : .       :.. :::.:.... ::. .  :.  . :..  .:  ....:. . ::.
NP_003 NPQTH-------VIENLHAAAYRNA-LANPLYCPDYRIGKVTSEELHYFVQNHFTSARMA
       170              180        190       200       210         

              240       250          260       270        280      
pF1KE1 LAAAGGVEHQQLLDLAQKHL---GGIPWTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIRHRD-DALPFAH
       : . : : :  : ..:.. :   ::.  . :.          . :.:::... :.:  .:
NP_003 LIGLG-VSHPVLKQVAEQFLNMRGGLGLSGAK--------ANYRGGEIREQNGDSL--VH
     220        230       240       250               260          

        290       300       310       320       330       340      
pF1KE1 VAIAVEGPGWASPDNVALQVANAIIGHYDCTYGGGVHLSSPLASGAVANKLCQSFQT--F
       .:...:.   .: .  :..: . ..:    .  :. . .: : . :::.   : :..  :
NP_003 AAFVAESAVAGSAEANAFSVLQHVLGAGPHVKRGS-NTTSHLHQ-AVAKATQQPFDVSAF
      270       280       290       300        310        320      

          350       360       370       380        390       400   
pF1KE1 SICYAETGLLGAHFVCDRMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSA-TESEVARGKNILRNALVSHL
       .  :...::.: . . .     :.. .  .:   .  .  ....:  .:: :. . .  .
NP_003 NASYSDSGLFGIYTISQATAAGDVIKAAYNQVKTIAQGNLSNTDVQAAKNKLKAGYLMSV
        330       340       350       360       370       380      

           410       420       430       440       450       460   
pF1KE1 DGTTPVCEDIGRSLLTYGRRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIE
       ...    :..: . :. :  .: .   ..:  :  . . .  .:..  :  ..:. : . 
NP_003 ESSECFLEEVGSQALVAGSYMPPSTVLQQIDSVANADIINAAKKFVSGQ-KSMAASGNLG
        390       400       410       420       430        440     

           470       480
pF1KE1 QLPDYNRIRSGMFWLRF
       . :              
NP_003 HTPFVDEL         
         450            

>>NP_001269875 (OMIM: 213200,613036) mitochondrial-proce  (425 aa)
 initn: 230 init1:  97 opt: 247  Z-score: 301.2  bits: 65.0 E(85289): 4.9e-10
Smith-Waterman score: 431; 28.5% identity (59.0% similar) in 383 aa overlap (114-475:35-410)

            90       100       110       120       130       140   
pF1KE1 EKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVESMGAHLNAYSTREHTAYYIKALSKDLPKA
                                     .:::. ..:   .. : : ..: :: :  .
NP_001 TLVELLTFWKNWHFRLLLDLTAKMKFCLRWKSMGVSVTARH-QDTTMYAVSADSKGLDTV
           10        20        30        40         50        60   

           150       160       170       180           190         
pF1KE1 VELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMRD----VVFNYLHATAFQGTPLAQ
       : ::.:.: .  : : ..:  : ..  :..  : ..:     .. ...: .:.. . .. 
NP_001 VALLADVVLQPRLTDEEVEMTRMAVQFELE--DLNLRPDPEPLLTEMIHEAAYRENTVGL
            70        80        90         100       110       120 

     200       210       220       230       240       250         
pF1KE1 AVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQLLDLAQKHLGGI-P-WTY
           :.::: :..:  :  :: ..:   :::::..: :::..:.: :.:.: :. : :  
NP_001 HRFCPTENVAKINREVLHSYLRNYYTPDRMVLAGVG-VEHEHLVDCARKYLLGVQPAWGS
             130       140       150        160       170       180

       260       270                280        290       300       
pF1KE1 AEDAVPTLTPCRFTGSEIR-HRD--------DALP-FAHVAIAVEGPGWASPDNVALQVA
       :: .    .  ..::.  . .::          .: ..:. ...:. ..   : . . : 
NP_001 AEAVDIDRSVAQYTGGIAKLERDMSNVSLGPTPIPELTHIMVGLESCSFLEEDFIPFAVL
              190       200       210       220       230       240

       310        320        330       340         350       360   
pF1KE1 NAIIGHYDC-TYGG-GVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSI--CYAETGLLGAHFVCDRM
       : ..:     . :: :  . : :  . : :.    ... :    : .::::  :   :  
NP_001 NMMMGGGGSFSAGGPGKGMFSRLYLN-VLNRHHWMYNATSYHHSYEDTGLLCIHASADPR
              250       260        270       280       290         

           370       380       390       400       410        420  
pF1KE1 KIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLL-TYGR
       .. .:. ..  ... .  ..   :. :.:. : . :. .:..   . ::.::..: : .:
NP_001 QVREMVEIITKEFILMGGTVDTVELERAKTQLTSMLMMNLESRPVIFEDVGRQVLATRSR
     300       310       320       330       340       350         

            430       440       450       460       470       480  
pF1KE1 RIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF  
       ..:  :  . : .:    :... ::..  . ::::. : . .:: :..:....       
NP_001 KLP-HELCTLIRNVKPEDVKRVASKMLRGK-PAVAALGDLTDLPTYEHIQTALSSKDGRL
     360        370       380        390       400       410       

NP_001 PRTYRLFR
       420     

>>NP_001269873 (OMIM: 213200,613036) mitochondrial-proce  (394 aa)
 initn: 230 init1:  97 opt: 180  Z-score: 220.2  bits: 49.9 E(85289): 1.6e-05
Smith-Waterman score: 364; 27.4% identity (58.5% similar) in 340 aa overlap (157-475:46-379)

        130       140       150       160       170       180      
pF1KE1 EHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMRD----V
                                     .: ..:  : ..  :..  : ..:     .
NP_001 WHFRLLLDLTAKMKFCLRWKSMGVSVTARHQDEEVEMTRMAVQFELE--DLNLRPDPEPL
          20        30        40        50        60          70   

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE1 VFNYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQL
       . ...: .:.. . ..     :.::: :..:  :  :: ..:   :::::..: :::..:
NP_001 LTEMIHEAAYRENTVGLHRFCPTENVAKINREVLHSYLRNYYTPDRMVLAGVG-VEHEHL
            80        90       100       110       120        130  

            250         260       270                280        290
pF1KE1 LDLAQKHLGGI-P-WTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIR-HRD--------DALP-FAHVAIA
       .: :.:.: :. : :  :: .    .  ..::.  . .::          .: ..:. ..
NP_001 VDCARKYLLGVQPAWGSAEAVDIDRSVAQYTGGIAKLERDMSNVSLGPTPIPELTHIMVG
            140       150       160       170       180       190  

              300       310        320        330       340        
pF1KE1 VEGPGWASPDNVALQVANAIIGHYDC-TYGG-GVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSI--
       .:. ..   : . . : : ..:     . :: :  . : :  . : :.    ... :   
NP_001 LESCSFLEEDFIPFAVLNMMMGGGGSFSAGGPGKGMFSRLYLN-VLNRHHWMYNATSYHH
            200       210       220       230        240       250 

        350       360       370       380       390       400      
pF1KE1 CYAETGLLGAHFVCDRMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGT
        : .::::  :   :  .. .:. ..  ... .  ..   :. :.:. : . :. .:.. 
NP_001 SYEDTGLLCIHASADPRQVREMVEIITKEFILMGGTVDTVELERAKTQLTSMLMMNLESR
             260       270       280       290       300       310 

        410        420       430       440       450       460     
pF1KE1 TPVCEDIGRSLL-TYGRRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQL
         . ::.::..: : .:..:  :  . : .:    :... ::..  . ::::. : . .:
NP_001 PVIFEDVGRQVLATRSRKLP-HELCTLIRNVKPEDVKRVASKMLRGK-PAVAALGDLTDL
             320       330        340       350        360         

         470       480          
pF1KE1 PDYNRIRSGMFWLRF          
       : :..:....               
NP_001 PTYEHIQTALSSKDGRLPRTYRLFR
     370       380       390    

>>XP_016870032 (OMIM: 213200,613036) PREDICTED: mitochon  (343 aa)
 initn: 230 init1:  97 opt: 165  Z-score: 202.9  bits: 46.5 E(85289): 0.00015
Smith-Waterman score: 349; 28.4% identity (58.8% similar) in 306 aa overlap (187-475:27-328)

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE1 EDSQIEKERDVILREMQENDASMRDVVFNYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADL
                                     .: .:.. . ..     :.::: :..:  :
XP_016     MTRMAVQFELEDLNLRPDPEPLLTEMIHEAAYRENTVGLHRFCPTENVAKINREVL
                   10        20        30        40        50      

        220       230       240       250         260       270    
pF1KE1 TEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQLLDLAQKHLGGI-P-WTYAEDAVPTLTPCRFTGSE
         :: ..:   :::::..: :::..:.: :.:.: :. : :  :: .    .  ..::. 
XP_016 HSYLRNYYTPDRMVLAGVG-VEHEHLVDCARKYLLGVQPAWGSAEAVDIDRSVAQYTGGI
         60        70         80        90       100       110     

                   280        290       300       310        320   
pF1KE1 IR-HRD--------DALP-FAHVAIAVEGPGWASPDNVALQVANAIIGHYDC-TYGG-GV
        . .::          .: ..:. ...:. ..   : . . : : ..:     . :: : 
XP_016 AKLERDMSNVSLGPTPIPELTHIMVGLESCSFLEEDFIPFAVLNMMMGGGGSFSAGGPGK
         120       130       140       150       160       170     

            330       340         350       360       370       380
pF1KE1 HLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSI--CYAETGLLGAHFVCDRMKIDDMMFVLQGQWMRLC
        . : :  . : :.    ... :    : .::::  :   :  .. .:. ..  ... . 
XP_016 GMFSRLYLN-VLNRHHWMYNATSYHHSYEDTGLLCIHASADPRQVREMVEIITKEFILMG
         180        190       200       210       220       230    

              390       400       410        420       430         
pF1KE1 TSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLL-TYGRRIPLAEWESRIAEVDAS
        ..   :. :.:. : . :. .:..   . ::.::..: : .:..:  :  . : .:   
XP_016 GTVDTVELERAKTQLTSMLMMNLESRPVIFEDVGRQVLATRSRKLP-HELCTLIRNVKPE
          240       250       260       270       280        290   

     440       450       460       470       480          
pF1KE1 VVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF          
        :... ::..  . ::::. : . .:: :..:....               
XP_016 DVKRVASKMLRGK-PAVAALGDLTDLPTYEHIQTALSSKDGRLPRTYRLFR
           300        310       320       330       340   




480 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 17:48:17 2016 done: Sun Nov  6 17:48:19 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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