FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4169, 621 aa 1>>>pF1KE4169 621 - 621 aa - 621 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3109+/-0.000447; mu= 18.9506+/- 0.028 mean_var=79.5340+/-15.912, 0's: 0 Z-trim(111.3): 347 B-trim: 389 in 1/51 Lambda= 0.143813 statistics sampled from 19524 (19923) to 19524 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.234), width: 16 Scan time: 11.100 The best scores are: opt bits E(85289) NP_689606 (OMIM: 615340,615348) kelch-like protein ( 621) 4131 867.6 0 NP_006054 (OMIM: 607701,615731) kelch-like protein ( 606) 1328 286.0 2.6e-76 NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 626 140.3 1.8e-32 XP_016867928 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 564) 621 139.3 3.5e-32 NP_061334 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-like ( 538) 613 137.6 1.1e-31 NP_036421 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 552 125.0 7.8e-28 XP_005260230 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 552 125.0 7.8e-28 NP_987096 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 552 125.0 7.8e-28 XP_011526754 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 552 125.0 7.8e-28 XP_005260231 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 552 125.0 7.8e-28 NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 539 122.3 5.6e-27 NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 539 122.4 5.6e-27 NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 519 118.1 8.3e-26 NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 519 118.2 9.9e-26 NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 519 118.2 1e-25 XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 519 118.2 1.1e-25 XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 519 118.2 1.1e-25 XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 519 118.2 1.1e-25 XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 519 118.2 1.1e-25 XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 519 118.2 1.1e-25 XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 519 118.2 1.1e-25 XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 519 118.2 1.1e-25 XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 519 118.2 1.1e-25 XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 510 116.3 3.1e-25 NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 510 116.3 3.8e-25 NP_055666 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 iso ( 597) 499 114.0 1.5e-24 XP_005247609 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24 XP_005247611 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24 NP_060114 (OMIM: 611295) kelch-like protein 24 [Ho ( 600) 491 112.3 4.9e-24 XP_005247613 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24 XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24 XP_005247612 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24 XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24 XP_016862148 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24 XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24 NP_001273654 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 i ( 687) 470 108.0 1.1e-22 XP_016867929 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 325) 461 105.9 2.3e-22 NP_001311238 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 ( 500) 461 106.0 3.2e-22 XP_016876168 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 525) 460 105.9 3.8e-22 XP_016867930 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 303) 456 104.8 4.4e-22 NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 452 104.3 1.5e-21 NP_115894 (OMIM: 616607) kelch repeat and BTB doma ( 601) 444 102.6 4.2e-21 NP_001290038 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 467) 432 100.0 1.9e-20 XP_011508139 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 522) 432 100.0 2.1e-20 XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 426 98.7 4.2e-20 XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 426 98.8 5.3e-20 NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 426 98.8 5.5e-20 NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 426 98.8 5.6e-20 XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 425 98.7 6.7e-20 XP_011511576 (OMIM: 614214) PREDICTED: kelch-like ( 327) 418 97.0 1.1e-19 >>NP_689606 (OMIM: 615340,615348) kelch-like protein 40 (621 aa) initn: 4131 init1: 4131 opt: 4131 Z-score: 4633.9 bits: 867.6 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4131; 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51.1% identity (81.4% similar) in 618 aa overlap (6-621:6-606) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MALGLEQAEEQRLYQQTLLQDGLKDMLDHGKFLDCVVRAGEREFPCHRLVLAACSPYFRA : ::: ::::.:::::::::.::. ::.::...::.. .:::::.:.::::::: NP_006 MDSQRELAEELRLYQSTLLQDGLKDLLDEKKFIDCTLKAGDKSLPCHRLILSACSPYFRE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 RFLAEPERAG--ELHLEEVSPDVVAQVLHYLYTSEIALDEASVQDLFAAAHRFQIPSIFT ::.: ..: :. :..:.: .. ...:::.. : :....:::.:: : ::::::.:: NP_006 YFLSEIDEAKKKEVVLDNVDPAILDLIIKYLYSASIDLNDGNVQDIFALASRFQIPSVFT 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 ICVSFLQKRLCLSNCLAVFRLGLLLDCARLAVAARDFICAHFTLVARDADFLGLSADELI .:::.::::: .::::..:::::::: :::..::.:. .:. . .. ::. :: .::: NP_006 VCVSYLQKRLAPGNCLAILRLGLLLDCPRLAISAREFVSDRFVQICKEEDFMQLSPQELI 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 AIISSDGLNVEKEEAVFEAVMRWAGSGDAEAQAERQRALPTVFESVRCRLLPRAFLESRV ..::.:.::::::::::::::.:. . : : .: . : ::. .: ::. . .....: NP_006 SVISNDSLNVEKEEAVFEAVMKWVRT-DKE---NRVKNLSEVFDCIRFRLMTEKYFKDHV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ERHPLVRAQPELLRKVQMVKDAHEGRITTLRKKKKGKDGAGAKEADKGTSKAKAEEDEEA :. .....:.: .:....::: :.. .:. .: ::: ..: : .:: NP_006 EKDDIIKSNPDLQKKIKVLKDAFAGKLPE-PSKNAAKTGAGEVNGDVG------DED--- 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 ERILPGILNDTLRFGMFLQDLIFMISEEGAVAYDPAANECYCASLSNQVPKNHVSLVTKE .::: ::: : :::..:::..... .::::::. :::: ..:..:.:.:: :.::.. NP_006 --LLPGYLNDIPRHGMFVKDLILLVNDTAAVAYDPTENECYLTALAEQIPRNHSSIVTQQ 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 NQVFVAGGLFYNEDNKEDPMSAYFLQFDHLDSEWLGMPPLPSPRCLFGLGEALNSIYVVG ::..:.:::. .:.::..:...::.:.: . :::.:.::::: ::::::::. ..::::. NP_006 NQIYVVGGLYVDEENKDQPLQSYFFQLDSIASEWVGLPPLPSARCLFGLGEVDDKIYVVA 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 GREIKDGERCLDSVMCYDRLSFKWGESDPLPYVVYGHTVLSHMDLVYVIGGKGSDRKCLN :.... : ::::.::: .. ::.: :: ::::.:.:: ..: .::: .:.:: : NP_006 GKDLQT-EASLDSVLCYDPVAAKWNEVKKLPIKVYGHNVISHKGMIYCLGGKTDDKKCTN 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 KMCVYDPKKFEWKELAPMQTARSLFGATVHDGRIIVAAGVTDTGLTSSAEVYSITDNKWA .. ...::: .::.::::. ::.::..:: :.:..:.:::. ::..:.:....: ::: NP_006 RVFIFNPKKGDWKDLAPMKIPRSMFGVAVHKGKIVIAGGVTEDGLSASVEAFDLTTNKWD 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 PFEAFPQERSSLSLVSLVGTLYAIGGFATLETESGELVPTELNDIWRYNEEEKKWEGVLR . :::::::.:::::.:.:::::::: .. :: :..:::.::::.:....:.: :.:. NP_006 VMTEFPQERSSISLVSLAGSLYAIGGFAMIQLESKEFAPTEVNDIWKYEDDKKEWAGMLK 530 540 550 560 570 580 600 610 620 pF1KE4 EIAYAAGATFLPVRLNVLCLTKM :: ::.::. : .:::.. :.:. NP_006 EIRYASGASCLATRLNLFKLSKL 590 600 >>NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-like p (586 aa) initn: 704 init1: 326 opt: 626 Z-score: 704.1 bits: 140.3 E(85289): 1.8e-32 Smith-Waterman score: 638; 26.2% identity (55.2% similar) in 603 aa overlap (23-618:34-573) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MALGLEQAEEQRLYQQTLLQDGLKDMLDHGKFLDCVVRAGEREFPCHRLVLA ...: . . : .. . ::..: ::.::: NP_001 SGVEKSSKKKTEKKLAAREEAKLLAGFMGVMNNMRKQKTLCDVILMVQERKIPAHRVVLA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 ACSPYFRARFLAE--PERAGELHLEEVSPDVVAQVLHYLYTSEIALDEASVQDLFAAAHR : : .: : .. .. :..:... ::.. :.... ::..:... .::.:. ::.. NP_001 AASHFFNLMFTTNMLESKSFEVELKDAEPDIIEQLVEFAYTARISVNSNNVQSLLDAANQ 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 FQIPSIFTICVSFLQKRLCLSNCLAVFRLGLLLDCARLAVAARDFICAHFTLVARDADFL .:: . .::.::.... ::::.. :. ::: .: ..: ::: ::: : . .:: NP_001 YQIEPVKKMCVDFLKEQVDASNCLGISVLAECLDCPELKATADDFIHQHFTEVYKTDEFL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 GLSADELIAIISSDGLNVEKEEAVFEAVMRWAGSGDAEAQAERQRALPTVFESVRCRLLP :.. .. ....: :.:. :. :..:..:: . . :: . .. .:: :. NP_001 QLDVKRVTHLLNQDTLTVRAEDQVYDAAVRWLKYDEPN----RQPFMVDILAKVRFPLIS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 RAFLESRVERHPLVRAQPELLRKVQMVKDAHEGRITTLRKKKKGKDGAGAKEADKGTSKA . :: . :. .::.. .:: :. :: .. . .. . . ... :: .. NP_001 KNFLSKTVQAEPLIQDNPECLK---MVISGMRYHLLSPEDREELVDG----------TRP 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 KAEEDEEAERILPGILNDTLRFGMFLQDLIFMISEEGAVAYDPAANECYCASLSNQVPKN . .. . .. : .. :. : : . .. : . . NP_001 RRKKHDYRIALFGGSQPQSCRY--------FN-------PKDYSWTDIRCPFEK----RR 290 300 310 320 360 370 380 390 400 pF1KE4 HVSLVTKENQVFVAGG--LFYNEDNKEDPMSAYFLQFDHLDSEWLGMPPLPSPRCLFGLG .. : .: :.. :: :: . :. : . : :. :: : :.:: .. NP_001 DAACVFWDNVVYILGGSQLFPIKR-----MDCYNVVKDSWYSK-LG-P--PTPRDSLAAC 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 EALNSIYVVGGREIKDGERCLDSVMCYDRLSFKWGESDPLPYVVYGHTVLSHMDLVYVIG : ..::. :: :. :. : ::: . .: . . .: .. :.:: : NP_001 AAEGKIYTSGGSEV--GNSALYLFECYDTRTESWHTKPSMLTQRCSHGMVEANGLIYVCG 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 GK-GSDR--KCLNKMCVYDPKKFEWKELAPMQTARSLFGATVHDGRIIVAAGVTDTGLTS :. :.. . ::. :::: : :: :: ::. : . .:....: . : . NP_001 GSLGNNVSGRVLNSCEVYDPATETWTELCPMIEARKNHGLVFVKDKIFAVGGQNGLGGLD 440 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 SAEVYSITDNKWAPFEAFPQERSSLSLVSLVGTLYAIGGFATLETESGELVPTELNDIWR ..: :.: :.: .: . ... ... . .:...:: . :.: . : . NP_001 NVEYYDIKLNEWKMVSPMPWKGVTVKCAAVGSIVYVLAGFQGV----GRL-----GHILE 500 510 520 530 540 590 600 610 620 pF1KE4 YNEEEKKWEGVLREIAYAAGATFLPVRLNVLCLTKM :: : :: .: . .: :: ..:. NP_001 YNTETDKW------VANSKVRAF-PVTSCLICVVDTCGANEETLET 550 560 570 580 >>XP_016867928 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTED: k (564 aa) initn: 704 init1: 326 opt: 621 Z-score: 698.7 bits: 139.3 E(85289): 3.5e-32 Smith-Waterman score: 633; 26.5% identity (55.6% similar) in 592 aa overlap (34-618:23-551) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 GLEQAEEQRLYQQTLLQDGLKDMLDHGKFLDCVVRAGEREFPCHRLVLAACSPYFRARFL : .. . ::..: ::.:::: : .: : XP_016 MLGGTDCRTFLTSHINLKKTLCDVILMVQERKIPAHRVVLAAASHFFNLMFT 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 AE--PERAGELHLEEVSPDVVAQVLHYLYTSEIALDEASVQDLFAAAHRFQIPSIFTICV .. .. :..:... ::.. :.... ::..:... .::.:. ::...:: . .:: XP_016 TNMLESKSFEVELKDAEPDIIEQLVEFAYTARISVNSNNVQSLLDAANQYQIEPVKKMCV 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 SFLQKRLCLSNCLAVFRLGLLLDCARLAVAARDFICAHFTLVARDADFLGLSADELIAII .::.... ::::.. :. ::: .: ..: ::: ::: : . .:: :.. .. .. XP_016 DFLKEQVDASNCLGISVLAECLDCPELKATADDFIHQHFTEVYKTDEFLQLDVKRVTHLL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 SSDGLNVEKEEAVFEAVMRWAGSGDAEAQAERQRALPTVFESVRCRLLPRAFLESRVERH ..: :.:. :. :..:..:: . .:: . .. .:: :. . :: . :. . XP_016 NQDTLTVRAEDQVYDAAVRWLKYDE----PNRQPFMVDILAKVRFPLISKNFLSKTVQAE 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 PLVRAQPELLRKVQMVKDAHEGRITTLRKKKKGKDGAGAKEADKGTSKAKAEEDEEAERI ::.. .:: :. :: .. . .. . . ... :: .. . .. . . 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NP_061 ECLK---MVISGMRYHLLSPEDREELVDG----------TRPRRKKHDYRIALFGGSQPQ 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 TLRFGMFLQDLIFMISEEGAVAYDPAANECYCASLSNQVPKNHVSLVTKENQVFVAGG-- . :. : : . .. : . . .. : .: :.. :: NP_061 SCRY--------FN-------PKDYSWTDIRCPFEK----RRDAACVFWDNVVYILGGSQ 260 270 280 290 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 LFYNEDNKEDPMSAYFLQFDHLDSEWLGMPPLPSPRCLFGLGEALNSIYVVGGREIKDGE :: . :. : . : :. :: : :.:: .. : ..::. :: :. :. NP_061 LFPIKR-----MDCYNVVKDSWYSK-LG-P--PTPRDSLAACAAEGKIYTSGGSEV--GN 300 310 320 330 340 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 RCLDSVMCYDRLSFKWGESDPLPYVVYGHTVLSHMDLVYVIGGK-GSDR--KCLNKMCVY : ::: . .: . . .: .. :.:: ::. :.. . ::. :: NP_061 SALYLFECYDTRTESWHTKPSMLTQRCSHGMVEANGLIYVCGGSLGNNVSGRVLNSCEVY 350 360 370 380 390 400 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 DPKKFEWKELAPMQTARSLFGATVHDGRIIVAAGVTDTGLTSSAEVYSITDNKWAPFEAF :: : :: :: ::. : . .:....: . : ...: :.: :.: . 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NP_036 YQD----APAAQFMAHKVVLASSSPVFKAMFTNGLREQGMEVVSIEGIHPKVMERLIEFA 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 YTSEIALDEASVQDLFAAAHRFQIPSIFTICVSFLQKRLCLSNCLAVFRLGLLLDCARLA ::. :.. : : .. .: .:: :. : .:: ..: :: ... .. . :..: NP_036 YTASISMGEKCVLHVMNGAVMYQIDSVVRACSDFLVQQLDPSNAIGIANFAEQIGCVELH 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 VAARDFICAHFTLVARDADFLGLSADELIAIISSDGLNVEKEEAVFEAVMRWAGSGDAEA ::..: :: ::.. .:..:: .:...:: : :::. : ::.: . :. . : : NP_036 QRAREYIYMHFGEVAKQEEFFNLSHCQLVTLISRDDLNVRCESEVFHACINWV-KYDCE- 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 QAERQRALPTVFESVRCRLLPRAFLESRVERHPLV----RAQPELLRKVQMVKDAHEGRI .:. . .....:::. : ::. .... .. : . :.. . . . .. NP_036 --QRRFYVQALLRAVRCHSLTPNFLQMQLQKCEILQSDSRCKDYLVKIFEELTLHKPTQV 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 TTLRKKKKGK---DGAGAKEADKGTSKAKAEEDEEAERILPGILNDTLRFGMFLQDLIFM : : :. ..: . . . .: : :. . . : . :.. 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