FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6480, 510 aa 1>>>pF1KE6480 510 - 510 aa - 510 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4578+/-0.000412; mu= 17.5540+/- 0.025 mean_var=77.5289+/-16.286, 0's: 0 Z-trim(111.1): 77 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.145661 statistics sampled from 19523 (19601) to 19523 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16 Scan time: 8.040 The best scores are: opt bits E(85289) XP_005271374 (OMIM: 603878) PREDICTED: monocarboxy ( 487) 698 156.8 1.4e-37 NP_004687 (OMIM: 603878) monocarboxylate transport ( 487) 698 156.8 1.4e-37 NP_001310910 (OMIM: 614242) monocarboxylate transp ( 509) 584 132.8 2.3e-30 XP_016871373 (OMIM: 614242) PREDICTED: monocarboxy ( 509) 584 132.8 2.3e-30 NP_919274 (OMIM: 614242) monocarboxylate transport ( 509) 584 132.8 2.3e-30 XP_016871372 (OMIM: 614242) PREDICTED: monocarboxy ( 551) 584 132.9 2.4e-30 XP_016871728 (OMIM: 611910,612018) PREDICTED: mono ( 516) 554 126.5 1.8e-28 XP_016871727 (OMIM: 611910,612018) PREDICTED: mono ( 516) 554 126.5 1.8e-28 XP_016871726 (OMIM: 611910,612018) PREDICTED: mono ( 516) 554 126.5 1.8e-28 NP_998771 (OMIM: 611910,612018) monocarboxylate tr ( 516) 554 126.5 1.8e-28 NP_001188476 (OMIM: 603878) monocarboxylate transp ( 425) 548 125.2 3.8e-28 NP_699188 (OMIM: 615765) monocarboxylate transport ( 471) 504 116.0 2.5e-25 XP_016879770 (OMIM: 615765) PREDICTED: monocarboxy ( 511) 492 113.5 1.5e-24 XP_011521909 (OMIM: 603877) PREDICTED: monocarboxy ( 465) 491 113.3 1.6e-24 NP_001193879 (OMIM: 603877) monocarboxylate transp ( 465) 491 113.3 1.6e-24 NP_001193880 (OMIM: 603877) monocarboxylate transp ( 465) 491 113.3 1.6e-24 NP_004198 (OMIM: 603877) monocarboxylate transport ( 465) 491 113.3 1.6e-24 NP_001035887 (OMIM: 603877) monocarboxylate transp ( 465) 491 113.3 1.6e-24 NP_001035888 (OMIM: 603877) monocarboxylate transp ( 465) 491 113.3 1.6e-24 NP_001193881 (OMIM: 603877) monocarboxylate transp ( 465) 491 113.3 1.6e-24 XP_005256545 (OMIM: 615765) PREDICTED: monocarboxy ( 566) 492 113.5 1.6e-24 XP_016884174 (OMIM: 610409) PREDICTED: monocarboxy ( 504) 472 109.3 2.8e-23 NP_037488 (OMIM: 610409) monocarboxylate transport ( 504) 472 109.3 2.8e-23 NP_004686 (OMIM: 603879) monocarboxylate transport ( 505) 468 108.4 5e-23 NP_001258694 (OMIM: 603879) monocarboxylate transp ( 505) 468 108.4 5e-23 XP_011523764 (OMIM: 603879) PREDICTED: monocarboxy ( 532) 468 108.5 5.2e-23 XP_005257847 (OMIM: 603879) PREDICTED: monocarboxy ( 545) 468 108.5 5.3e-23 NP_001257552 (OMIM: 603654) monocarboxylate transp ( 478) 462 107.2 1.1e-22 XP_005269288 (OMIM: 603654) PREDICTED: monocarboxy ( 478) 462 107.2 1.1e-22 NP_004722 (OMIM: 603654) monocarboxylate transport ( 478) 462 107.2 1.1e-22 NP_001257551 (OMIM: 603654) monocarboxylate transp ( 478) 462 107.2 1.1e-22 NP_001188475 (OMIM: 603878) monocarboxylate transp ( 439) 451 104.8 5.3e-22 XP_006711096 (OMIM: 603878) PREDICTED: monocarboxy ( 377) 446 103.7 9.7e-22 NP_001310906 (OMIM: 614242) monocarboxylate transp ( 422) 438 102.1 3.4e-21 NP_001310907 (OMIM: 614242) monocarboxylate transp ( 422) 438 102.1 3.4e-21 NP_001310908 (OMIM: 614242) monocarboxylate transp ( 422) 438 102.1 3.4e-21 NP_001310909 (OMIM: 614242) monocarboxylate transp ( 422) 438 102.1 3.4e-21 XP_011533724 (OMIM: 607550) PREDICTED: monocarboxy ( 321) 423 98.9 2.4e-20 XP_006715392 (OMIM: 607550) PREDICTED: monocarboxy ( 325) 423 98.9 2.5e-20 NP_003042 (OMIM: 245340,600682,610021,616095) mono ( 500) 424 99.2 3e-20 NP_001159968 (OMIM: 245340,600682,610021,616095) m ( 500) 424 99.2 3e-20 XP_011540329 (OMIM: 245340,600682,610021,616095) P ( 500) 424 99.2 3e-20 XP_011540328 (OMIM: 245340,600682,610021,616095) P ( 500) 424 99.2 3e-20 NP_061063 (OMIM: 607550) monocarboxylate transport ( 515) 423 99.0 3.5e-20 XP_011523763 (OMIM: 603880) PREDICTED: monocarboxy ( 523) 419 98.2 6.4e-20 XP_016880781 (OMIM: 603880) PREDICTED: monocarboxy ( 523) 419 98.2 6.4e-20 XP_016880780 (OMIM: 603880) PREDICTED: monocarboxy ( 523) 419 98.2 6.4e-20 NP_004685 (OMIM: 603880) monocarboxylate transport ( 523) 419 98.2 6.4e-20 NP_001167637 (OMIM: 603880) monocarboxylate transp ( 523) 419 98.2 6.4e-20 XP_005257846 (OMIM: 603880) PREDICTED: monocarboxy ( 527) 419 98.2 6.5e-20 >>XP_005271374 (OMIM: 603878) PREDICTED: monocarboxylate (487 aa) initn: 564 init1: 339 opt: 698 Z-score: 795.9 bits: 156.8 E(85289): 1.4e-37 Smith-Waterman score: 698; 29.6% identity (62.1% similar) in 494 aa overlap (17-492:3-477) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPN-IDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALGVLNV : . ..:. . .::::.::.:. :.:....:: ..... : XP_005 MLKREGKVQPYTKTLDGGWGWMIVIHFFLVNVFVMGMTKTFAIFFV 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 EWLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTCGCRQTAIIGGLVNSLGWVLSAY . :::. . .:..:. .. . .::..... . : . :.:.:..: . :...:.. 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