FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9517, 574 aa 1>>>pF1KE9517 574 - 574 aa - 574 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7976+/-0.000336; mu= 12.8638+/- 0.021 mean_var=125.4519+/-25.277, 0's: 0 Z-trim(118.1): 33 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.114508 statistics sampled from 30652 (30685) to 30652 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.36), width: 16 Scan time: 9.730 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003498 (OMIM: 603410) frizzled-7 precursor [Hom ( 574) 4029 677.0 4.6e-194 NP_001457 (OMIM: 600667) frizzled-2 precursor [Hom ( 565) 3118 526.5 9.1e-149 NP_003496 (OMIM: 603408) frizzled-1 [Homo sapiens] ( 647) 3096 522.9 1.3e-147 NP_003459 (OMIM: 601723) frizzled-5 precursor [Hom ( 585) 1829 313.5 1.2e-84 XP_016869330 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 ( 599) 1333 231.6 5.6e-60 NP_059108 (OMIM: 606143) frizzled-3 precursor [Hom ( 666) 1333 231.6 6.1e-60 NP_665873 (OMIM: 606143) frizzled-3 precursor [Hom ( 666) 1333 231.6 6.1e-60 NP_009128 (OMIM: 606147) frizzled-10 precursor [Ho ( 581) 1244 216.9 1.5e-55 NP_001158088 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isof ( 674) 1239 216.1 2.9e-55 NP_001158087 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isof ( 706) 1239 216.1 3e-55 NP_003497 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isoform ( 706) 1239 216.1 3e-55 XP_016869332 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 ( 491) 1206 210.6 9.9e-54 XP_016869331 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 ( 502) 1206 210.6 1e-53 XP_016869333 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 ( 470) 1204 210.2 1.2e-53 NP_003499 (OMIM: 601766) frizzled-9 precursor [Hom ( 591) 1166 204.0 1.1e-51 NP_036325 (OMIM: 133780,604579) frizzled-4 precurs ( 537) 1054 185.5 3.8e-46 NP_114072 (OMIM: 606146) frizzled-8 precursor [Hom ( 694) 1036 182.6 3.7e-45 NP_001304725 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isof ( 401) 692 125.6 3.1e-28 XP_011514824 (OMIM: 601500,601707,605462) PREDICTE ( 657) 536 100.0 2.6e-20 NP_005622 (OMIM: 601500,601707,605462) smoothened ( 787) 536 100.0 3e-20 NP_001454 (OMIM: 165720,605083) secreted frizzled- ( 325) 454 86.2 1.8e-16 NP_003005 (OMIM: 265900,606570) secreted frizzled- ( 346) 415 79.8 1.6e-14 NP_003006 (OMIM: 604158) secreted frizzled-related ( 317) 392 75.9 2.1e-13 NP_003003 (OMIM: 604156) secreted frizzled-related ( 314) 374 73.0 1.7e-12 NP_003004 (OMIM: 604157) secreted frizzled-related ( 295) 365 71.5 4.4e-12 NP_001265515 (OMIM: 605236,614595) atrial natriure ( 734) 339 67.5 1.8e-10 NP_001265514 (OMIM: 605236,614595) atrial natriure ( 938) 339 67.5 2.1e-10 NP_006578 (OMIM: 605236,614595) atrial natriuretic (1042) 339 67.6 2.3e-10 NP_113621 (OMIM: 606227,609549,611040) membrane fr ( 579) 280 57.6 1.3e-07 NP_001014447 (OMIM: 603105) carboxypeptidase Z iso ( 652) 240 51.1 1.4e-05 NP_003643 (OMIM: 603105) carboxypeptidase Z isofor ( 641) 235 50.2 2.4e-05 NP_569711 (OMIM: 120328,267750) collagen alpha-1(X (1751) 209 46.3 0.001 >>NP_003498 (OMIM: 603410) frizzled-7 precursor [Homo sa (574 aa) initn: 4029 init1: 4029 opt: 4029 Z-score: 3605.1 bits: 677.0 E(85289): 4.6e-194 Smith-Waterman score: 4029; 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NP_003 LCERARQGCEALMNKFGFQWPDTLKCEKFPVHGAGELCVGQNTSDKGTPTPSLLPEFWTS 190 200 210 220 230 240 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 APYLPDLPFTALPPGASDGRGRPAFPFSCPRQLKVPPYLGYRFLGERDCGAPCEPGRANG : . ::.. . : ::::: :::: ::.:.::::.:::::::: .. : NP_003 NPQHGGGGHRGGFPGGAGASERGK--FSCPRALKVPSYLNYHFLGEKDCGAPCEPTKVYG 250 260 270 280 290 300 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 LMYFKEEERRFARLWVGVWSVLCCASTLFTVLTYLVDMRRFSYPERPIIFLSGCYFMVAV :::: :: ::.: :.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: NP_003 LMYFGPEELRFSRTWIGIWSVLCCASTLFTVLTYLVDMRRFSYPERPIIFLSGCYTAVAV 310 320 330 340 350 360 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 AHVAGFLLEDRAVCVERFSDDGYRTVAQGTKKEGCTILFMVLYFFGMASSIWWVILSLTW :..::::::::.:: ..:..:: :::::::::::::::::.::::.:::::::::::::: NP_003 AYIAGFLLEDRVVCNDKFAEDGARTVAQGTKKEGCTILFMMLYFFSMASSIWWVILSLTW 370 380 390 400 410 420 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 FLAAGMKWGHEAIEANSQYFHLAAWAVPAVKTITILAMGQVDGDLLSGVCYVGLSSVDAL :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::.:::::.:::..:::: NP_003 FLAAGMKWGHEAIEANSQYFHLAAWAVPAIKTITILALGQVDGDVLSGVCFVGLNNVDAL 430 440 450 460 470 480 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 RGFVLAPLFVYLFIGTSFLLAGFVSLFRIRTIMKHDGTKTEKLEKLMVRIGVFSVLYTVP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_003 RGFVLAPLFVYLFIGTSFLLAGFVSLFRIRTIMKHDGTKTEKLEKLMVRIGVFSVLYTVP 490 500 510 520 530 540 490 500 510 520 530 pF1KE9 ATIVLACYFYEQAFREHWERTWLLQTCKSYAVPCP--------PGHFPPMSPDFTVFMIK ::::.::::::::::..:::.:. :.:::::.::: : : ::::::::::::: NP_003 ATIVIACYFYEQAFRDQWERSWVAQSCKSYAIPCPHLQAGGGAPPH-PPMSPDFTVFMIK 550 560 570 580 590 600 540 550 560 570 pF1KE9 YLMTMIVGITTGFWIWSGKTLQSWRRFYHRLSHSSKGETAV ::::.:::::.::::::::::.:::.:: ::..:..:::.: NP_003 YLMTLIVGITSGFWIWSGKTLNSWRKFYTRLTNSKQGETTV 610 620 630 640 >>NP_003459 (OMIM: 601723) frizzled-5 precursor [Homo sa (585 aa) initn: 1750 init1: 848 opt: 1829 Z-score: 1640.8 bits: 313.5 E(85289): 1.2e-84 Smith-Waterman score: 1866; 49.9% identity (71.4% similar) in 581 aa overlap (1-563:1-536) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MRDPGAAAPLSSLGLCALVLALLGALSAGAGAQPYHGEKGISVPDHGFCQPISIPLCTDI : : .:: : : :.:: : . .:.:. : :: :..:.: : NP_003 MARPDPSAPPS---LLLLLLAQLVGRAAAASKAPV-------------CQEITVPMCRGI 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE9 AYNQTILPNLLGHTNQEDAGLEVHQFYPLVKVQCSPELRFFLCSMYAPVCTV-LDQAIPP .:: : .:: ..: .:..::::::::.:::..::::.:::::::::.:.: . .:: NP_003 GYNLTHMPNQFNHDTQDEAGLEVHQFWPLVEIQCSPDLRFFLCSMYTPICLPDYHKPLPP 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 CRSLCERARQGCEALMNKFGFQWPERLRCENFPVHG--AGEICVGQNTSDGSGGPGGGPT :::.::::. :: :: ..:: ::::. :. .:: : : .:. : :... .: : NP_003 CRSVCERAKAGCSPLMRQYGFAWPERMSCDRLPVLGRDAEVLCMDYNRSEATTAP---PR 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KE9 AYPTAPYLPDLPFTALPPGASDGRGR-PAF-PFSCP-RQLKVP------PYLGYRFLGER .:. : :: :::: . :. :: :: : :. :: : . :. NP_003 PFPAKPTLPG------PPGAPASGGECPAGGPFVCKCREPFVPILKESHPLYNKVRTGQV 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 -DCGAPC-EPGRANGLMYFKEEERRFARLWVGVWSVLCCASTLFTVLTYLVDMRRFSYPE .:..:: .:. :. .:: :: .:.:.::::: :: :: :.:.::.:: ::: NP_003 PNCAVPCYQPS-------FSADERTFATFWIGLWSVLCFISTSTTVATFLIDMERFRYPE 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 RPIIFLSGCYFMVAVAHVAGFLLEDRAV-CVERFSDDGYRTVAQGTKKEGCTILFMVLYF :::::::.::. :... .. ... .: : .. . :.:.. . :::.:...:: NP_003 RPIIFLSACYLCVSLGFLVRLVVGHASVACSREHNHIHYETTGPAL----CTIVFLLVYF 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KE9 FGMASSIWWVILSLTWFLAAGMKWGHEAIEANSQYFHLAAWAVPAVKTITILAMGQVDGD :::::::::::::::::::::::::.::: . .:::::::: .:.::.:: ::...:::: NP_003 FGMASSIWWVILSLTWFLAAGMKWGNEAIAGYAQYFHLAAWLIPSVKSITALALSSVDGD 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 pF1KE9 LLSGVCYVGLSSVDALRGFVLAPLFVYLFIGTSFLLAGFVSLFRIRTIMKHDGTKTEKLE ..:.:::: .....::::::.:: .::..:: :::::::::::::...:. ::::.::: NP_003 PVAGICYVGNQNLNSLRGFVLGPLVLYLLVGTLFLLAGFVSLFRIRSVIKQGGTKTDKLE 390 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 520 pF1KE9 KLMVRIGVFSVLYTVPATIVLACYFYEQAFREHWERTWLLQTCKSYAVPCPPGH---FPP :::.:::.:..::::::.::.:::.::: .:: :: . :: :: :: : NP_003 KLMIRIGIFTLLYTVPASIVVACYLYEQHYRESWEAAL---TCA-----CP-GHDTGQPR 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 pF1KE9 MSPDFTVFMIKYLMTMIVGITTGFWIWSGKTLQSWRRFYHRLSHSSKGETAV .:.. :.:.::.: ..::::.: :::::::..::::: : NP_003 AKPEYWVLMLKYFMCLVVGITSGVWIWSGKTVESWRRFTSRCCCRPRRGHKSGGAMAAGD 500 510 520 530 540 550 NP_003 YPEASAALTGRTGPPGPAATYHKQVSLSHV 560 570 580 >>XP_016869330 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 isof (599 aa) initn: 1261 init1: 897 opt: 1333 Z-score: 1197.8 bits: 231.6 E(85289): 5.6e-60 Smith-Waterman score: 1511; 47.5% identity (69.7% similar) in 478 aa overlap (89-562:1-445) 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 DIAYNQTILPNLLGHTNQEDAGLEVHQFYPLVKVQCSPELRFFLCSMYAPVCTVLDQAIP .:...:: ..: :::..:::.: .. XP_016 MVNLDCSRDFRPFLCALYAPICMEYGRVTL 10 20 30 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 PCRSLCERARQGCEALMNKFGFQWPERLRCENFPVHGAGEICVGQNTSDGSGGPGGGPTA ::: ::.:: . : ::. :: ::: ..: :: : XP_016 PCRRLCQRAYSECSKLMEMFGVPWPEDMECSRFPD------C---------------DEP 40 50 60 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 YPTAPYLPDLPFTALPP-GASDGRGRPAFPFSCPRQLKVPPYLGYRFLGERDCGAPCEPG :: : :: ... : :: . : . : :::.::. : ::: :: :::. :: :. XP_016 YP---RLVDLNLAGEPTEGAPVAVQRD-YGFWCPRELKIDPDLGYSFLHVRDCSPPC-PN 70 80 90 100 110 120 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 RANGLMYFKEEERRFARLWVGVWSVLCCASTLFTVLTYLVDMRRFSYPERPIIFLSGCYF :::..:: ::: ..:. :..: ..:::: ::.:.:. :: :::::::: . ::. XP_016 -----MYFRREELSFARYFIGLISIICLSATLFTFLTFLIDVTRFRYPERPIIFYAVCYM 130 140 150 160 170 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 MVAVAHVAGFLLEDRAVCVERFSDDGYR--TVAQGTKKEGCTILFMVLYFFGMASSIWWV ::.. :::::::..: . . :. ::.::.....::.:::.:::: ::.:.::: XP_016 MVSLIFFIGFLLEDRVACNASIPAQ-YKASTVTQGSHNKACTMLFMILYFFTMAGSVWWV 180 190 200 210 220 230 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 ILSLTWFLAAGMKWGHEAIEANSQYFHLAAWAVPAVKTITILAMGQVDGDLLSGVCYVGL ::..:::::: ::: :::: .. :: .::..:.. :: .:::....:: .::::.::: XP_016 ILTITWFLAAVPKWGSEAIEKKALLFHASAWGIPGTLTIILLAMNKIEGDNISGVCFVGL 240 250 260 270 280 290 420 430 440 450 460 470 pF1KE9 SSVDALRGFVLAPLFVYLFIGTSFLLAGFVSLFRIRTIMKHDGTKTEKLEKLMVRIGVFS .::::: :::::: .:. .:.:.::::..:: :.: . . . .:: :.:.:::::: XP_016 YDVDALRYFVLAPLCLYVVVGVSLLLAGIISLNRVRIEIPLEKENQDKLVKFMIRIGVFS 300 310 320 330 340 350 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 VLYTVPATIVLACYFYEQAFREHWERTWLLQTCKSYAVPCPPGHFPPMS-PDFTVFMIKY .:: :: .:..:::::::.: :: ::. . :. : .::: . :: ::. .:..:: XP_016 ILYLVPLLVVIGCYFYEQAYRGIWETTWIQERCREYHIPCPY-QVTQMSRPDLILFLMKY 360 370 380 390 400 410 540 550 560 570 pF1KE9 LMTMIVGITTGFWIWSGKTLQSWRRFYHRLSHSSKGETAV ::..:::: . ::. : :: : :.: XP_016 LMALIVGIPSVFWVGSKKTCFEWASFFHGRRKKEIVNESRQVLQEPDFAQSLLRDPNTPI 420 430 440 450 460 470 >>NP_059108 (OMIM: 606143) frizzled-3 precursor [Homo sa (666 aa) initn: 1412 init1: 897 opt: 1333 Z-score: 1197.2 bits: 231.6 E(85289): 6.1e-60 Smith-Waterman score: 1662; 47.3% identity (70.5% similar) in 518 aa overlap (49-562:28-512) 20 30 40 50 60 70 pF1KE9 VLALLGALSAGAGAQPYHGEKGISVPDHGFCQPISIPLCTDIAYNQTILPNLLGHTNQED :.::.. .: :. :: :..::::.: .:. 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NP_059 GVSLLLAGIISLNRVRIEIPLEKENQDKLVKFMIRIGVFSILYLVPLLVVIGCYFYEQAY 390 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 pF1KE9 REHWERTWLLQTCKSYAVPCPPGHFPPMS-PDFTVFMIKYLMTMIVGITTGFWIWSGKTL : :: ::. . :. : .::: . :: ::. .:..::::..:::: . ::. : :: NP_059 RGIWETTWIQERCREYHIPCPY-QVTQMSRPDLILFLMKYLMALIVGIPSVFWVGSKKTC 450 460 470 480 490 500 560 570 pF1KE9 QSWRRFYHRLSHSSKGETAV : :.: NP_059 FEWASFFHGRRKKEIVNESRQVLQEPDFAQSLLRDPNTPIIRKSRGTSTQGTSTHASSTQ 510 520 530 540 550 560 >>NP_665873 (OMIM: 606143) frizzled-3 precursor [Homo sa (666 aa) initn: 1412 init1: 897 opt: 1333 Z-score: 1197.2 bits: 231.6 E(85289): 6.1e-60 Smith-Waterman score: 1662; 47.3% identity (70.5% similar) in 518 aa overlap (49-562:28-512) 20 30 40 50 60 70 pF1KE9 VLALLGALSAGAGAQPYHGEKGISVPDHGFCQPISIPLCTDIAYNQTILPNLLGHTNQED :.::.. .: :. :: :..::::.: .:. NP_665 MAMTWIVFSLWPLTVFMGHIGGHSLFSCEPITLRMCQDLPYNTTFMPNLLNHYDQQT 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KE9 AGLEVHQFYPLVKVQCSPELRFFLCSMYAPVCTVLDQAIPPCRSLCERARQGCEALMNKF :.: .. :.:.:...:: ..: :::..:::.: .. ::: ::.:: . : ::. : NP_665 AALAMEPFHPMVNLDCSRDFRPFLCALYAPICMEYGRVTLPCRRLCQRAYSECSKLMEMF 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 pF1KE9 GFQWPERLRCENFPVHGAGEICVGQNTSDGSGGPGGGPTAYPTAPYLPDLPFTALPP-GA : ::: ..: :: : :: : :: ... : :: NP_665 GVPWPEDMECSRFPD------C---------------DEPYP---RLVDLNLAGEPTEGA 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KE9 SDGRGRPAFPFSCPRQLKVPPYLGYRFLGERDCGAPCEPGRANGLMYFKEEERRFARLWV . : . : :::.::. : ::: :: :::. :: :. :::..:: ::: .. NP_665 PVAVQRD-YGFWCPRELKIDPDLGYSFLHVRDCSPPC-PN-----MYFRREELSFARYFI 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 pF1KE9 GVWSVLCCASTLFTVLTYLVDMRRFSYPERPIIFLSGCYFMVAVAHVAGFLLEDRAVCVE :. :..: ..:::: ::.:.:. :: :::::::: . ::.::.. :::::::..: NP_665 GLISIICLSATLFTFLTFLIDVTRFRYPERPIIFYAVCYMMVSLIFFIGFLLEDRVACNA 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 RFSDDGYR--TVAQGTKKEGCTILFMVLYFFGMASSIWWVILSLTWFLAAGMKWGHEAIE . . :. ::.::.....::.:::.:::: ::.:.:::::..:::::: ::: :::: NP_665 SIPAQ-YKASTVTQGSHNKACTMLFMILYFFTMAGSVWWVILTITWFLAAVPKWGSEAIE 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KE9 ANSQYFHLAAWAVPAVKTITILAMGQVDGDLLSGVCYVGLSSVDALRGFVLAPLFVYLFI .. :: .::..:.. :: .:::....:: .::::.::: .::::: :::::: .:. . NP_665 KKALLFHASAWGIPGTLTIILLAMNKIEGDNISGVCFVGLYDVDALRYFVLAPLCLYVVV 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KE9 GTSFLLAGFVSLFRIRTIMKHDGTKTEKLEKLMVRIGVFSVLYTVPATIVLACYFYEQAF :.:.::::..:: :.: . . . .:: :.:.::::::.:: :: .:..:::::::. NP_665 GVSLLLAGIISLNRVRIEIPLEKENQDKLVKFMIRIGVFSILYLVPLLVVIGCYFYEQAY 390 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 pF1KE9 REHWERTWLLQTCKSYAVPCPPGHFPPMS-PDFTVFMIKYLMTMIVGITTGFWIWSGKTL : :: ::. . :. : .::: . :: ::. .:..::::..:::: . ::. : :: NP_665 RGIWETTWIQERCREYHIPCPY-QVTQMSRPDLILFLMKYLMALIVGIPSVFWVGSKKTC 450 460 470 480 490 500 560 570 pF1KE9 QSWRRFYHRLSHSSKGETAV : :.: NP_665 FEWASFFHGRRKKEIVNESRQVLQEPDFAQSLLRDPNTPIIRKSRGTSTQGTSTHASSTQ 510 520 530 540 550 560 >>NP_009128 (OMIM: 606147) frizzled-10 precursor [Homo s (581 aa) initn: 1310 init1: 844 opt: 1244 Z-score: 1118.5 bits: 216.9 E(85289): 1.5e-55 Smith-Waterman score: 1705; 46.5% identity (70.2% similar) in 563 aa overlap (18-573:10-548) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MRDPGAAAPLSSLGLCALVLALLGALSAGAGAQPYHGEKGISVPDHGFCQPISIPLCTDI ::: ..:. .: .. . . : : :::: ::.: :: NP_009 MQRPGPRLWLVLQVMGSCAAISSMD-------MERPGDGKCQPIEIPMCKDI 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE9 AYNQTILPNLLGHTNQEDAGLEVHQFYPLVKVQCSPELRFFLCSMYAPVCTV-LDQAIPP .::.: .:::.:: ::..:....:.: :::. : .:::::::.:::.:: .. :: NP_009 GYNMTRMPNLMGHENQREAAIQLHEFAPLVEYGCHGHLRFFLCSLYAPMCTEQVSTPIPA 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 CRSLCERARQGCEALMNKFGFQWPERLRCENFPVHGAGEICVGQNTSDGSGGPGGGPTAY :: .::.:: : .:..:.:.::. : :...: .. . . ..:: : : . 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