FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9413, 372 aa 1>>>pF1KE9413 372 - 372 aa - 372 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7462+/-0.000462; mu= 19.8649+/- 0.029 mean_var=106.4453+/-28.166, 0's: 0 Z-trim(110.0): 558 B-trim: 2041 in 2/48 Lambda= 0.124311 statistics sampled from 17551 (18279) to 17551 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16 Scan time: 7.650 The best scores are: opt bits E(85289) NP_009158 (OMIM: 604838) probable G-protein couple ( 372) 2457 452.2 9e-127 XP_011534455 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G- ( 419) 1361 255.7 1.4e-67 XP_011534456 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G- ( 419) 1361 255.7 1.4e-67 NP_001137429 (OMIM: 606915) probable G-protein cou ( 419) 1361 255.7 1.4e-67 XP_006715633 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G- ( 419) 1361 255.7 1.4e-67 NP_110411 (OMIM: 606915) probable G-protein couple ( 419) 1361 255.7 1.4e-67 XP_011534459 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G- ( 419) 1361 255.7 1.4e-67 XP_016866823 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G- ( 419) 1361 255.7 1.4e-67 XP_011534461 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G- ( 419) 1361 255.7 1.4e-67 XP_011534457 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G- ( 419) 1361 255.7 1.4e-67 NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 400 83.3 1.1e-15 NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 353 74.8 3.4e-13 NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 353 74.9 3.5e-13 NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 353 74.9 3.6e-13 NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 353 74.9 3.6e-13 NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 353 74.9 3.7e-13 NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 353 74.9 3.8e-13 NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 336 71.9 3.1e-12 NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 336 71.9 3.1e-12 NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 336 71.9 3.1e-12 NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 336 71.9 3.1e-12 NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 336 71.9 3.1e-12 NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 335 71.6 3.1e-12 NP_115940 (OMIM: 176400,604161,614837) kiSS-1 rece ( 398) 330 70.8 6.3e-12 NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 329 70.7 7.9e-12 NP_057658 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 414) 324 69.7 1.4e-11 NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 320 69.0 2.3e-11 NP_473362 (OMIM: 300393,300943) probable G-protein ( 508) 319 68.9 2.9e-11 NP_000862 (OMIM: 601109) 5-hydroxytryptamine recep ( 440) 315 68.1 4.3e-11 NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 315 68.2 4.6e-11 XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 315 68.2 4.8e-11 NP_444264 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 420) 313 67.7 5.4e-11 NP_001138228 (OMIM: 607449) neuropeptide FF recept ( 423) 313 67.7 5.4e-11 NP_000786 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 443) 313 67.8 5.6e-11 XP_016872785 (OMIM: 126450,159900) PREDICTED: D(2) ( 443) 313 67.8 5.6e-11 NP_004876 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 522) 313 67.9 6.2e-11 NP_937822 (OMIM: 606925) pyroglutamylated RFamide ( 431) 311 67.4 7e-11 NP_722561 (OMIM: 612250) G-protein coupled recepto ( 529) 311 67.5 8e-11 XP_011507680 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11 XP_011507678 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11 XP_011507679 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11 XP_016856349 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11 XP_011507677 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11 NP_001254539 (OMIM: 612250) G-protein coupled rece ( 529) 311 67.5 8e-11 XP_005245113 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11 XP_005245114 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11 XP_016856351 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11 XP_016856350 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11 NP_001254540 (OMIM: 612250) G-protein coupled rece ( 546) 311 67.5 8.1e-11 XP_005245112 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 549) 311 67.5 8.1e-11 >>NP_009158 (OMIM: 604838) probable G-protein coupled re (372 aa) initn: 2457 init1: 2457 opt: 2457 Z-score: 2397.0 bits: 452.2 E(85289): 9e-127 Smith-Waterman score: 2457; 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XP_011 QHNFFEISTWLLWLCYLKSALNPLIYYWRIKKFHDACLDMMPKSFKFLPQLPGHTKRRIR 350 360 370 380 390 400 360 370 pF1KE9 PSTVYVCNENQSAV ::.::::.:....: XP_011 PSAVYVCGEHRTVV 410 >>XP_011534456 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G-prot (419 aa) initn: 1382 init1: 1360 opt: 1361 Z-score: 1334.1 bits: 255.7 E(85289): 1.4e-67 Smith-Waterman score: 1361; 55.2% identity (83.4% similar) in 344 aa overlap (29-372:76-419) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCII : ::.:.:. .:... :.:::: :::.. 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XP_011 QHNFFEISTWLLWLCYLKSALNPLIYYWRIKKFHDACLDMMPKSFKFLPQLPGHTKRRIR 350 360 370 380 390 400 360 370 pF1KE9 PSTVYVCNENQSAV ::.::::.:....: XP_011 PSAVYVCGEHRTVV 410 >>NP_001137429 (OMIM: 606915) probable G-protein coupled (419 aa) initn: 1382 init1: 1360 opt: 1361 Z-score: 1334.1 bits: 255.7 E(85289): 1.4e-67 Smith-Waterman score: 1361; 55.2% identity (83.4% similar) in 344 aa overlap (29-372:76-419) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCII : ::.:.:. .:... :.:::: :::.. 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NP_001 QHNFFEISTWLLWLCYLKSALNPLIYYWRIKKFHDACLDMMPKSFKFLPQLPGHTKRRIR 350 360 370 380 390 400 360 370 pF1KE9 PSTVYVCNENQSAV ::.::::.:....: NP_001 PSAVYVCGEHRTVV 410 >>XP_006715633 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G-prot (419 aa) initn: 1382 init1: 1360 opt: 1361 Z-score: 1334.1 bits: 255.7 E(85289): 1.4e-67 Smith-Waterman score: 1361; 55.2% identity (83.4% similar) in 344 aa overlap (29-372:76-419) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCII : ::.:.:. .:... :.:::: :::.. 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XP_006 QHNFFEISTWLLWLCYLKSALNPLIYYWRIKKFHDACLDMMPKSFKFLPQLPGHTKRRIR 350 360 370 380 390 400 360 370 pF1KE9 PSTVYVCNENQSAV ::.::::.:....: XP_006 PSAVYVCGEHRTVV 410 >>NP_110411 (OMIM: 606915) probable G-protein coupled re (419 aa) initn: 1382 init1: 1360 opt: 1361 Z-score: 1334.1 bits: 255.7 E(85289): 1.4e-67 Smith-Waterman score: 1361; 55.2% identity (83.4% similar) in 344 aa overlap (29-372:76-419) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCII : ::.:.:. .:... :.:::: :::.. 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XP_016 QHNFFEISTWLLWLCYLKSALNPLIYYWRIKKFHDACLDMMPKSFKFLPQLPGHTKRRIR 350 360 370 380 390 400 360 370 pF1KE9 PSTVYVCNENQSAV ::.::::.:....: XP_016 PSAVYVCGEHRTVV 410 >>XP_011534461 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G-prot (419 aa) initn: 1382 init1: 1360 opt: 1361 Z-score: 1334.1 bits: 255.7 E(85289): 1.4e-67 Smith-Waterman score: 1361; 55.2% identity (83.4% similar) in 344 aa overlap (29-372:76-419) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCII : ::.:.:. .:... :.:::: :::.. 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XP_011 QHNFFEISTWLLWLCYLKSALNPLIYYWRIKKFHDACLDMMPKSFKFLPQLPGHTKRRIR 350 360 370 380 390 400 360 370 pF1KE9 PSTVYVCNENQSAV ::.::::.:....: XP_011 PSAVYVCGEHRTVV 410 372 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 18:20:44 2016 done: Sun Nov 6 18:20:45 2016 Total Scan time: 7.650 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]