FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2022, 599 aa 1>>>pF1KE2022 599 - 599 aa - 599 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4681+/-0.000987; mu= 18.5263+/- 0.059 mean_var=77.9738+/-15.421, 0's: 0 Z-trim(104.3): 49 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.145245 statistics sampled from 7790 (7829) to 7790 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16 Scan time: 3.500 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2061.1 IL18RAP gene_id:8807|Hs108|chr2 ( 599) 4040 856.7 0 CCDS14517.1 IL1RAPL2 gene_id:26280|Hs108|chrX ( 686) 749 167.1 6.6e-41 CCDS14218.1 IL1RAPL1 gene_id:11141|Hs108|chrX ( 696) 687 154.1 5.4e-37 CCDS2060.1 IL18R1 gene_id:8809|Hs108|chr2 ( 541) 561 127.7 3.9e-29 CCDS3298.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 ( 570) 544 124.1 4.8e-28 CCDS2055.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 ( 569) 521 119.3 1.4e-26 CCDS54696.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 ( 687) 512 117.5 5.9e-26 CCDS2056.1 IL1RL2 gene_id:8808|Hs108|chr2 ( 575) 480 110.7 5.3e-24 CCDS2057.1 IL1RL1 gene_id:9173|Hs108|chr2 ( 556) 460 106.5 9.5e-23 >>CCDS2061.1 IL18RAP gene_id:8807|Hs108|chr2 (599 aa) initn: 4040 init1: 4040 opt: 4040 Z-score: 4575.7 bits: 856.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4040; 100.0% identity (100.0% similar) in 599 aa overlap (1-599:1-599) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MLCLGWIFLWLVAGERIKGFNISGCSTKKLLWTYSTRSEEEFVLFCDLPEPQKSHFCHRN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 MLCLGWIFLWLVAGERIKGFNISGCSTKKLLWTYSTRSEEEFVLFCDLPEPQKSHFCHRN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 RLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSYPHIIQDKCTLHFLTPGVNN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 RLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSYPHIIQDKCTLHFLTPGVNN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 SGSYICRPKMIKSPYDVACCVKMILEVKPQTNASCEYSASHKQDLLLGSTGSISCPSLSC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 SGSYICRPKMIKSPYDVACCVKMILEVKPQTNASCEYSASHKQDLLLGSTGSISCPSLSC 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 QSDAQSPAVTWYKNGKLLSVERSNRIVVDEVYDYHQGTYVCDYTQSDTVSSWTVRAVVQV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 QSDAQSPAVTWYKNGKLLSVERSNRIVVDEVYDYHQGTYVCDYTQSDTVSSWTVRAVVQV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 RTIVGDTKLKPDILDPVEDTLEVELGKPLTISCKARFGFERVFNPVIKWYIKDSDLEWEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 RTIVGDTKLKPDILDPVEDTLEVELGKPLTISCKARFGFERVFNPVIKWYIKDSDLEWEV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 SVPEAKSIKSTLKDEIIERNIILEKVTQRDLRRKFVCFVQNSIGNTTQSVQLKEKRGVVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 SVPEAKSIKSTLKDEIIERNIILEKVTQRDLRRKFVCFVQNSIGNTTQSVQLKEKRGVVL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 LYILLGTIGTLVAVLAASALLYRHWIEIVLLYRTYQSKDQTLGDKKDFDAFVSYAKWSSF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 LYILLGTIGTLVAVLAASALLYRHWIEIVLLYRTYQSKDQTLGDKKDFDAFVSYAKWSSF 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 PSEATSSLSEEHLALSLFPDVLENKYGYSLCLLERDVAPGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 PSEATSSLSEEHLALSLFPDVLENKYGYSLCLLERDVAPGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFI 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 LSPNYVNGPSIFELQAAVNLALDDQTLKLILIKFCYFQEPESLPHLVKKALRVLPTVTWR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 LSPNYVNGPSIFELQAAVNLALDDQTLKLILIKFCYFQEPESLPHLVKKALRVLPTVTWR 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 GLKSVPPNSRFWAKMRYHMPVKNSQGFTWNQLRITSRIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS20 GLKSVPPNSRFWAKMRYHMPVKNSQGFTWNQLRITSRIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW 550 560 570 580 590 >>CCDS14517.1 IL1RAPL2 gene_id:26280|Hs108|chrX (686 aa) initn: 469 init1: 205 opt: 749 Z-score: 847.9 bits: 167.1 E(32554): 6.6e-41 Smith-Waterman score: 749; 30.7% identity (62.4% similar) in 508 aa overlap (82-565:74-562) 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 QKSHFCHRNRLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSYPHIIQDKCTL ..::. ..:: : : : .. ... .. CCDS14 LAGEPVRVKCALFYSYIRTNYSTAQSTGLRLMWYK--NKGDLEEPIIFSEVRMSKEEDSI 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 pF1KE2 HFLTPGVNNSGSYICRPKMIKSPYDVACCVK--MILEVKPQTNASCEYS-ASHKQDLLLG : . ...:: : : . .: : :.: : : : . .. : : . . . CCDS14 WFHSAEAQDSGFYTCVLR--NSTY----CMKVSMSLTVAENESGLCYNSRIRYLEKSEVT 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 STGSISCPSLS-CQSDAQSPAVTWYKNGK-----LLSVERSNRIVVDEVYDYHQGTYVCD . ::::... ... : : :.:::. : . ....: ....:: . :.:.:. CCDS14 KRKEISCPDMDDFKKSDQEPDVVWYKECKPKMWRSIIIQKGNALLIQEVQEEDGGNYTCE 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 pF1KE2 YTQSDTVSSWTVRAVVQVRTIVGDTKLKPDILDPVED---TLEVELGKPLTISCKARFGF . :.. ..: ... : :: : :.:. ...:.:::::.: ::: ::: CCDS14 LKYEGKLVRRTTE--LKVTALLTDKPPKP--LFPMENQPSVIDVQLGKPLNIPCKAFFGF 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 ERVFNPVIKWYIKDS---DLEWEVSVPEAKSIKSTLKDEIIERNIILEKVTQRDLRRKFV .:.: :. .. .: .. : . .: : .. .: .:...:.. :: ... CCDS14 SGESGPMIYWMKGEKFIEELAGHIREGEIRLLKEHLGEKEVELALIFDSVVEADLA-NYT 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 CFVQNSIGNTTQSVQLKEKRGVVLLYILLGTIGTLVAVLAASALLYRHW-IEIVLLYRTY : :.: : :: :. :. .. : : .:.. .:. ...:. . ::..:.:: . CCDS14 CHVENRNGRKHASVLLR-KKDLIYKIELAGGLGAIFLLLVLLVVIYKCYNIELMLFYRQH 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 QSKDQTLGDKKDFDAFVSYAKWSSFPSEATSSLSEEHLALSLFPDVLENKYGYSLCLLER . :.: :.:..::..::.: .. . .. ::..:: ..:::::..:::.: . :: CCDS14 FGADETNDDNKEYDAYLSYTKVDQ-DTLDCDNPEEEQFALEVLPDVLEKHYGYKLFIPER 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 DVAPGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFILSPNYV--NGPSIFELQAAVNLALDDQTLKLILIK :. :.:.: ::.. ...::: :..:.:.:. : :::::.. .. : . .:.:::. CCDS14 DLIPSGTYMEDLTRYVEQSRRLIIVLTPDYILRRGWSIFELESRLHNMLVSGEIKVILIE 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 pF1KE2 FCYF------QEPESLPHLVKKALRVLPTVTWRGLKSVPPNSRFWAKMRYHMPVKNSQGF . :: ::: :.....: . :.: :: ::.:: .. :.::.:... CCDS14 CTELKGKVNCQEVESL----KRSIKLLSLIKWKGSKSSKLNSKFWKHLVYEMPIKKKEML 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 TWNQLRITSRIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW CCDS14 PRCHVLDSAEQGLFGELQPIPSIAMTSTSATLVSSQADLPEFHPSDSMQIRHCCRGYKHE 570 580 590 600 610 620 >>CCDS14218.1 IL1RAPL1 gene_id:11141|Hs108|chrX (696 aa) initn: 497 init1: 194 opt: 687 Z-score: 777.6 bits: 154.1 E(32554): 5.4e-37 Smith-Waterman score: 691; 29.4% identity (60.0% similar) in 527 aa overlap (76-571:69-571) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 CDLPEPQKSHFCHRNRLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSYPHII : :: ..::.. . :: : : . .. CCDS14 KKYQVLVGEPVRIKCALFYGYIRTNYSLAQSAGLS-LMWYKSSGPGDFEEPIAFDGSRMS 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 QDKCTLHFLTPGVNNSGSYICRPKMIKSPYDVACCVK--MILEVKPQTNASCEYSASHK- ... .. : ...:: : : . .: : :.: . : : . .. : :... : CCDS14 KEEDSIWFRPTLLQDSGLYACVIR--NSTY----CMKVSISLTVGENDTGLC-YNSKMKY 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 pF1KE2 -QDLLLGSTGSISCPSL-SCQSDAQSPAVTWYKNGKLLS-----VERSNRIVVDEVYDYH . :... ::: .. . .. : . :::. . . : . . ... :: . CCDS14 FEKAELSKSKEISCRDIEDFLLPTREPEILWYKECRTKTWRPSIVFKRDTLLIREVREDD 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 QGTYVCDYTQSDTVSSWTVRAVVQVRTIVGDTKLKPDILDPVEDTL---EVELGKPLTIS :.:.:. . : :: .... . . : : .: :.:. : :..:: ... CCDS14 IGNYTCELKYGGFV----VRRTTELTVTAPLTDKPPKLLYPMESKLTIQETQLGDSANLT 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 pF1KE2 CKARFGFERVFNPVIKW-----YIKDSDLE--WEVSVPEAKSIKSTLKDEIIERNIILEK :.: ::. .:.: : .:.: : . :: .. . .: : .. . ..:... CCDS14 CRAFFGYSGDVSPLIYWMKGEKFIEDLDENRVWESDI---RILKEHLGEQEVSISLIVDS 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 VTQRDLRRKFVCFVQNSIGNTTQSVQLKEKRGVVLLYILLGTIGTLVAVLAASALLYRHW : . :: .. :.:.:. : :: :. :: .. : : .:... .:. . .:. . CCDS14 VEEGDLG-NYSCYVENGNGRRHASVLLH-KRELMYTVELAGGLGAILLLLVCLVTIYKCY 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 -IEIVLLYRTYQSKDQTLGDKKDFDAFVSYAKWSSFPSEATSSLSEEH-LALSLFPDVLE :::.:.::.. . .. ::.::.::..::.: . :.. .. .::. .:: ..::.:: CCDS14 KIEIMLFYRNHFGAEELDGDNKDYDAYLSYTKVD--PDQWNQETGEEERFALEILPDMLE 390 400 410 420 430 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 NKYGYSLCLLERDVAPGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFILSPNYV--NGPSIFELQAAVNLA ..:::.: . .::. : :.: ::.. . .:.: :....:::: : :::::.. . CCDS14 KHYGYKLFIPDRDLIPTGTYIEDVARCVDQSKRLIIVMTPNYVVRRGWSIFELETRLRNM 440 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 pF1KE2 LDDQTLKLILIKFCY-------FQEPESLPHLVKKALRVLPTVTWRGLKSVPPNSRFWAK : .:.:::. : .:: :.: : .: .: .. :.: : ::.:: . CCDS14 LVTGEIKVILIE-CSELRGIMNYQEVEALKHTIK----LLTVIKWHGPKCNKLNSKFWKR 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 MRYHMPVKNSQGFTWNQLRITSRIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW ..:.:: : . .: .: CCDS14 LQYEMPFKRIEPITHEQALDVSEQGPFGELQTVSAISMAAATSTALATAHPDLRSTFHNT 560 570 580 590 600 610 >>CCDS2060.1 IL18R1 gene_id:8809|Hs108|chr2 (541 aa) initn: 399 init1: 233 opt: 561 Z-score: 636.5 bits: 127.7 E(32554): 3.9e-29 Smith-Waterman score: 605; 29.6% identity (59.7% similar) in 496 aa overlap (84-562:56-523) 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 SHFCHRNRLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSYPHIIQDKCTLHF ::.. .. . .: .: .: :.:.: CCDS20 PHITVVEGEPFYLKHCSCSLAHEIETTTKSWYKSSGSQEHVELNPRSSSRIALHDCVLEF 30 40 50 60 70 80 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LTPGVNNSGSYICRPKMIKSPYDVACCVKMILEVKPQTNASC--EYSASHKQDLLLGSTG .:..:::. . : . : :.: ... :: : ... : . . . CCDS20 WPVELNDTGSYFFQMKNYTQ--------KWKLNVIRRNKHSCFTERQVTSKI-VEVKKFF 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 SISCPSLSCQSDAQSPAVTWYKNGKLLSVERSNRIVVDEVYDYH-QGTYVCDYTQSDTVS .:.: . :. ..: .. ::: : : .: .. .. . ... :: : : . . . CCDS20 QITCENSYYQTLVNSTSL--YKNCKKLLLENNKNPTIKKNAEFEDQGYYSCVHFLHHNGK 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 pF1KE2 SWTVRAVVQVRTIVGD-TKLKPDILDPVEDTLEVELGKPLTISCKARFGFERVFNPVIKW ... . .. ::: : ... : .: : . . ::::: . ..:.: .. : :: : CCDS20 LFNITKTFNI-TIVEDRSNIVPVLLGPKLNHVAVELGKNVRLNCSALLNEE----DVIYW 200 210 220 230 240 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 YIKDSDLEWEVSVPEAKSIKSTLKDEIIERNIIL--EKVTQRDLRRKFVCFVQNSIGNTT .. . . . .. : : .. . . . .: :.. . .: . : : .. :. : CCDS20 MFGEENGS-DPNIHEEKEMRIMTPEGKWHASKVLRIENIGESNLNVLYNCTVASTGGTDT 250 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 pF1KE2 QSVQLKEKR------GVVLLYILLGTIGTLVAV--LAASALLYRHWIEIVLLYRTYQSKD .: : .: : :. .. .. :::: :.. ..:: ...::.:: .: CCDS20 KSFILVRKADMADIPGHVFTRGMIIAVLILVAVVCLVTVCVIYR--VDLVLFYRHLTRRD 310 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 QTLGDKKDFDAFVSYAKWSSFPSEATSSLSEEH-LALSLFPDVLENKYGYSLCLLERDVA .:: : : .:::::: : : .::: .:. ..: :::...::.::..::::. CCDS20 ETLTDGKTYDAFVSYLK------ECRPENGEEHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVV 370 380 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 PGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFILSPNYVNGPSIFELQAAVNLALDDQTLKLILIKFCYFQ :::. ...: :.:..::: :..:: .:... .::..... :: .. .:.:::.: CCDS20 PGGAVVDEIHSLIEKSRRLIIVLSKSYMSNEVRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVT 430 440 450 460 470 480 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 EPESLPHLVK--KALRVLPTVTWRGLKSVPPNSRFWAKMRYHMPVKNSQGFTWNQLRITS . ::. .: :. ::: :.. ::. ::::: .. : ::.: CCDS20 DFTFLPQSLKLLKSHRVLK---WKADKSLSYNSRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPV 490 500 510 520 530 580 590 pF1KE2 RIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW CCDS20 LSES 540 >>CCDS3298.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 (570 aa) initn: 456 init1: 297 opt: 544 Z-score: 616.9 bits: 124.1 E(32554): 4.8e-28 Smith-Waterman score: 670; 27.5% identity (57.9% similar) in 604 aa overlap (8-573:3-568) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MLCLGWIFLWLVAGERIKGFNISGCSTKKLLWTYSTRSEEEFVLFCDLPE----PQKSHF .:: :.. . :. : : . : .: ... .: : : : :: CCDS32 MTLLWCVVSLYFYGILQSDASERCDDWGLDTM--RQIQVFEDEPARIKCPLFEHF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 CHRNRLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSYPH--IIQDKCTLHFL . : . : : :. . :: .. : : : :. : ..: .: : CCDS32 LKFNYST-----AH-----SAGLTLI-WYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFR 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 TPGVNNSGSYICRPKMIKSPYDVACCVKMILEVKPQTNASCEYSAS----HKQDLLLGST .:..:.: : :.. ... : :. . .. . :: : :: . : CCDS32 PTLLNDTGNYTC---MLR---NTTYCSKVAFPLEVVQKDSCFNSPMKLPVHKLYIEYG-I 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 pF1KE2 GSISCPSLSCQSDAQ-SPAVTWYKNGKLLSVERSNRIVVDEV-YDY------HQGTYVCD :.::... .. .:..::: . ... : .. . . .. ..:.:.: CCDS32 QRITCPNVDGYFPSSVKPTITWYMG--CYKIQNFNNVIPEGMNLSFLIALISNNGNYTCV 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 pF1KE2 YTQSDTVSSWTVRAVVQVRTIVGDTK--LKPDILDPVEDTL-EVELGKPLTISCKARFGF : .. .. . .. :. .::. : . : : .: . .. : : :. : : : . :.: CCDS32 VTYPENGRTFHLTRTLTVK-VVGSPKNAVPPVIHSPNDHVVYEKEPGEELLIPCTVYFSF 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 ERVFNPVIKWYI---KDSDLEWEVSVPEAKSIKSTLKDEIIERNIILEKVTQRDLRRKFV . : : : .:. .:.. :. : .: .:: . . ..:::..::.:..: CCDS32 LMDSRNEVWWTIDGKKPDDITIDVTINESIS-HSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYV 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 CFVQNSIGNTTQSVQLKEK----RGVVLLYILLGTIGTLVAVLAASALLYRHWIEIVLLY : .... :........:.: : .: : .:. ::..: . .: :.:.::.: CCDS32 CHARSAKGEVAKAAKVKQKVPAPRYTVELACGFGATVLLVVILIVVYHVY--WLEMVLFY 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 RTYQSKDQTLGDKKDFDAFVSYAKWSSFPSEATSSLSEEHLALSLFPDVLENKYGYSLCL :.. . :.:. : :..: .::::. . ::...: . ::::..::.::. CCDS32 RAHFGTDETILDGKEYDIYVSYAR----------NAEEEEFVLLTLRGVLENEFGYKLCI 390 400 410 420 430 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 LERDVAPGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFILSPNYV-NGP-SIFELQAAVNLALDDQTLKLI ..:: :::. ... .:.:..::: . .:::::: .: ...::.:... . ....: CCDS32 FDRDSLPGGIVTDETLSFIQKSRRLLVVLSPNYVLQGTQALLELKAGLENMASRGNINVI 440 450 460 470 480 490 520 530 540 550 560 pF1KE2 LIKFCYFQEPESLPHLVKKALRVLPTVTWRGLKSVPPNSRFWAKMRYHMPVKNS------ :... .: . . .:.: :: .. :.: :: :..::: ... ::::.: CCDS32 LVQYKAVKETKV--KELKRAKTVLTVIKWKGEKSKYPQGRFWKQLQVAMPVKKSPRRSSS 500 510 520 530 540 550 570 580 590 pF1KE2 --QGFTWNQLRITSRIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW ::.....:. CCDS32 DEQGLSYSSLKNV 560 570 >>CCDS2055.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 (569 aa) initn: 249 init1: 97 opt: 521 Z-score: 590.9 bits: 119.3 E(32554): 1.4e-26 Smith-Waterman score: 523; 26.7% identity (55.6% similar) in 532 aa overlap (72-572:45-551) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 FVLFCDLPEPQKSHFCHRNRLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSY :. .. . . ::.. :. :. . : CCDS20 ISSLEADKCKEREEKIILVSSANEIDVRPCPLNPNEHKGTITWYKDDSK-TPVSTEQASR 20 30 40 50 60 70 110 120 130 140 150 pF1KE2 PHIIQDKCTLHFLTPGVNNSGSYICRPKMIKSPYDVACCVKMILEVKPQTNAS--CEYSA : : : : :. :..:: : : . .: : :... . .: : : :.: CCDS20 IH--QHKEKLWFVPAKVEDSGHYYCVVR--NSSY----CLRIKISAKFVENEPNLC-YNA 80 90 100 110 120 160 170 180 190 200 pF1KE2 S--HKQDLLLGSTGSISCPSLSC--QSDAQSPAVTWYKNGKLLSVER------SNRIVVD . :: : ... :.. :: . . . . : . :::. : : .. ..:..: CCDS20 QAIFKQKLPVAGDGGLVCPYMEFFKNENNELPKLQWYKDCKPLLLDNIHFSGVKDRLIVM 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 EVYDYHQGTYVCDYTQSDTVSSWTVRAVVQVRTIVGDTKLKPDILDPVEDTLEVELGKPL .: . :.:.:.: . . ... . :.. :. . .: :..:...:.::.::. . CCDS20 NVAEKHRGNYTCHASYTYLGKQYPITRVIEFITLEENKPTRPVIVSPANETMEVDLGSQI 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 TISCKARFGFERVFNPVIKWY--IKDSDLE------WEVSVPEAKSIKSTLKDEIIERNI . :.. . . :: . : : . : : : .::: : :: CCDS20 QLICNVTGQLSDI--AYWKWNGSVIDEDDPVLGEDYYSVENPANKR-RSTL---ITVLNI 250 260 270 280 290 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 ILEKVTQRDLRRKFVCFVQNSIGNTTQSVQLKEKRGVVLLYILLGTIGTLVAVLAASALL .. .: .. :.::..:. : . .:: . ..: ::..... :... CCDS20 --SEIESRFYKHPFTCFAKNTHGIDAAYIQLIYPVTNFQKH-MIGICVTLTVIIVCSVFI 300 310 320 330 340 350 390 400 410 420 430 pF1KE2 YRHW-IEIVLLYRT--YQSKDQTLGDKKDFDAFVSYAKWSSFPSEATSSLSEEHLALSLF :. . :.::: :: :. .: : .::.. : : . :...: . . ...... CCDS20 YKIFKIDIVLWYRDSCYDFLPIKASDGKTYDAYILYPKTVG---EGSTS-DCDIFVFKVL 360 370 380 390 400 410 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 PDVLENKYGYSLCLLERDVAPGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFIL-----SPNYVNGPSIFE :.:::.. ::.: . :: : .: : .:.::: :.:: . ....: : : CCDS20 PEVLEKQCGYKLFIYGRDDYVGEDIVEVINENVKKSRRLIIILVRETSGFSWLGGSS--E 420 430 440 450 460 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 LQAAVNLALDDQTLKLILIKFCYFQEPESLPHLVKKALRVLPTVTWRGLKSVPPNS---R : :. :: .. .:..:... .:. :..:. .: . .. : : . :.: : CCDS20 EQIAMYNALVQDGIKVVLLELEKIQDYEKMPESIKFIKQKHGAIRWSGDFTQGPQSAKTR 470 480 490 500 510 520 560 570 580 590 pF1KE2 FWAKMRYHMPVKNSQGFTWNQLRITSRIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW :: ..::::::. . . .:: CCDS20 FWKNVRYHMPVQRRSPSSKHQLLSPATKEKLQREAHVPLG 530 540 550 560 >>CCDS54696.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 (687 aa) initn: 355 init1: 196 opt: 512 Z-score: 579.5 bits: 117.5 E(32554): 5.9e-26 Smith-Waterman score: 638; 27.3% identity (56.9% similar) in 594 aa overlap (8-571:3-557) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MLCLGWIFLWLVAGERIKGFNISGCSTKKLLWTYSTRSEEEFVLFCDLPE----PQKSHF .:: :.. . :. : : . : .: ... .: : : : :: CCDS54 MTLLWCVVSLYFYGILQSDASERCDDWGLDTM--RQIQVFEDEPARIKCPLFEHF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 CHRNRLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSYPH--IIQDKCTLHFL . : . : : :. . :: .. : : : :. : ..: .: : CCDS54 LKFNYST-----AH-----SAGLTLI-WYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFR 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 TPGVNNSGSYICRPKMIKSPYDVACCVKMILEVKPQTNASCEYSAS----HKQDLLLGST .:..:.: : :.. ... : :. . .. . :: : :: . : CCDS54 PTLLNDTGNYTC---MLR---NTTYCSKVAFPLEVVQKDSCFNSPMKLPVHKLYIEYG-I 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 pF1KE2 GSISCPSLSCQSDAQ-SPAVTWYKNGKLLSVERSNRIVVDEV-YDY------HQGTYVCD :.::... .. .:..::: . ... : .. . . .. ..:.:.: CCDS54 QRITCPNVDGYFPSSVKPTITWYMG--CYKIQNFNNVIPEGMNLSFLIALISNNGNYTCV 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 pF1KE2 YTQSDTVSSWTVRAVVQVRTIVGDTK--LKPDILDPVEDTL-EVELGKPLTISCKARFGF : .. .. . .. :. .::. : . : : .: . .. : : :. : : : . :.: CCDS54 VTYPENGRTFHLTRTLTVK-VVGSPKNAVPPVIHSPNDHVVYEKEPGEELLIPCTVYFSF 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 ERVFNPVIKWYI---KDSDLEWEVSVPEAKSIKSTLKDEIIERNIILEKVTQRDLRRKFV . : : : .:. .:.. :. : .: .:: . . ..:::..::.:..: CCDS54 LMDSRNEVWWTIDGKKPDDITIDVTINESIS-HSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYV 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 CFVQNSIGNTTQSVQLKEK----RGVVLLYILLGTIGTLVAVLAASALLYRHWIEIVLLY : .... :........:.: : .: : .:. ::..: . .: :.:.::.: CCDS54 CHARSAKGEVAKAAKVKQKVPAPRYTVELACGFGATVLLVVILIVVYHVY--WLEMVLFY 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 RTYQSKDQTLGDKKDFDAFVSYAKWSSFPSEATSSLSEEHLALSLFPDVLENKYGYSLCL :.. . :.:. : :..: .::::. . ::...: . ::::..::.::. CCDS54 RAHFGTDETILDGKEYDIYVSYAR----------NAEEEEFVLLTLRGVLENEFGYKLCI 390 400 410 420 430 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 LERDVAPGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFILSPNYVNGPSIFELQAAVNLALDDQ-TLKLIL ..:: ::: .: . ..:.:::: : .:::.::. :: :. ... ... . :::. CCDS54 FDRDSLPGGNTVEAVFDFIQRSRRMIVVLSPDYVTEKSISMLEFKLGVMCQNSIATKLIV 440 450 460 470 480 490 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 IKFCYFQEPESLPHLVKKALRVLPTVTWRGLKSVPPNSRFWAKMRYHMPVKN-SQGFTWN ... ...:. : ... : :.:.: :: .:.:: .: .:... : . :: CCDS54 VEYRPLEHPH--PGILQLKESV-SFVSWKGEKSKHSGSKFWKALRLALPLRSLSASSGWN 500 510 520 530 540 550 580 590 pF1KE2 QLRITSRIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW . CCDS54 ESCSSQSDISLDHVQRRRSRLKEPPELQSSERAAGSPPAPGTMSKHRGKSSATCRCCVTY 560 570 580 590 600 610 >>CCDS2056.1 IL1RL2 gene_id:8808|Hs108|chr2 (575 aa) initn: 247 init1: 89 opt: 480 Z-score: 544.4 bits: 110.7 E(32554): 5.3e-24 Smith-Waterman score: 480; 26.8% identity (54.8% similar) in 527 aa overlap (71-572:44-549) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 EFVLFCDLPEPQKSHFCHRNRLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKS .: . :...: : ::.. :. :. : .: CCDS20 PLSVTADGCKDIFMKNEILSASQPFAFNCTFPPITSGEVS-VTWYKN-SSKIPVSKIIQS 20 30 40 50 60 70 110 120 130 140 150 pF1KE2 YPHIIQDKCTLHFLTPGVNNSGSYICRPKMIKSPYDVACCVKMILEVKPQTNASC----E : ::. . :: ..:: : : : : . . :.. . : ..: . CCDS20 RIH--QDETWILFLPMEWGDSGVYQCVIKGRDSCHRIH--VNLTVFEKHWCDTSIGGLPN 80 90 100 110 120 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 YSASHKQDLLLGSTGSISCPSLSCQSDAQSPAVTWYKNGKLLSVER----SNRIVVDEVY : .:: : ::. :..: .: . .: . :::. . .. :: .:..:..: CCDS20 LSDEYKQILHLGKDDSLTCHLHFPKSCVLGP-IKWYKDCNEIKGERFTVLETRLLVSNVS 130 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 DYHQGTYVCDYTQSDTVSSWTVRA--VVQVRTIVGDTKLKPDILDPVEDTLEVELGKPLT .:.:.:. . . ... : .:.. .: : :. : . ..::.:: : CCDS20 AEDRGNYACQAILTHSGKQYEVLNGITVSITERAGYGGSVPKIIYPKNHSIEVQLGTTLI 190 200 210 220 230 240 280 290 300 310 320 pF1KE2 ISCKARFGFERVFNPVIK-WYIKDSDLEWEVSVPEAKSIKSTLKDEIIER-------NII ..:.. . : .. : .... .. . :.: :. .. .. : :: CCDS20 VDCNVT---DTKDNTNLRCWRVNNTLVDDYYD--ESKRIREGVETHVSFREHNLYTVNIT 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 LEKVTQRDLRRKFVCFVQNSIGNTTQSVQLKEKRGVVLLYILLGTIGTLVAVLAASALLY . .: ..: :.: . : .: . :. :.. : :. :::: .. . .: CCDS20 FLEVKMEDYGLPFMCHA----GVSTAYIILQLPAPDFRAYLIGGLIA-LVAVAVSVVYIY 310 320 330 340 350 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 RHW-IEIVLLYRTYQSKDQTLGDKKDFDAFVSYAKWSSFPSEATSSLSEEHLALSLFPDV . :.::: ::. . .:. : : .::.: : : : . .. . . :.:...:.: CCDS20 NIFKIDIVLWYRSAFHSTETIVDGKLYDAYVLYPK----PHKESQRHAVDALVLNILPEV 360 370 380 390 400 410 450 460 470 480 490 pF1KE2 LENKYGYSLCLLERDVAPGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFILSPNYVN-G--PSIFELQAAV :: . ::.: .. :: :: . :. : .: :: : :. :. .. : .. : : :: CCDS20 LERQCGYKLFIFGRDEFPGQAVANVIDENVKLCRRLIVIVVPESLGFGLLKNLSEEQIAV 420 430 440 450 460 470 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 NLALDDQTLKLILIKFCYFQEPESLPHLVKKALRVLPTVTWRG---LKSVPPNSRFWAKM :: .. .:.:::.. ... .:. .. . .. :.: .: ...:: . CCDS20 YSALIQDGMKVILIELEKIEDYTVMPESIQYIKQKHGAIRWHGDFTEQSQCMKTKFWKTV 480 490 500 510 520 530 560 570 580 590 pF1KE2 RYHMPVKNSQGFTWNQLRITSRIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW ::::: . . : :: CCDS20 RYHMPPRRCRPFPPVQLLQHTPCYRTAGPELGSRRKKCTLTTG 540 550 560 570 >>CCDS2057.1 IL1RL1 gene_id:9173|Hs108|chr2 (556 aa) initn: 359 init1: 179 opt: 460 Z-score: 521.9 bits: 106.5 E(32554): 9.5e-23 Smith-Waterman score: 570; 25.9% identity (58.7% similar) in 518 aa overlap (72-561:37-537) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 FVLFCDLPEPQKSHFCHRNRLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGD-PLEDIRKS : .:. . . :.:: . .: . : .. . CCDS20 AILTILMYSTAAKFSKQSWGLENEALIVRCPRQGKPSYT-VDWYYSQTNKSIPTQERNR- 10 20 30 40 50 60 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 YPHIIQDKCTLHFLTPGVNNSGSYICRPKMIKSPYDVACCVKMILEVKPQTNASCEYSAS .. . :.:: .: .:: : : ...:: . : :.. :. CCDS20 ---VFASGQLLKFLPAAVADSGIYTC---IVRSPTFNRTGYANVTIYKKQSD--CNVPDY 70 80 90 100 110 170 180 190 200 210 pF1KE2 HKQDLLLGS--TGSISCPSLSCQSDAQSPAVTWYKNGKLL--SVERSNR--IVVDEVYDY . . :: ...: ::... . . . :.:: . : : :... .:.:.:. CCDS20 LMYSTVSGSEKNSKIYCPTIDLYN--WTAPLEWFKNCQALQGSRYRAHKSFLVIDNVMTE 120 130 140 150 160 170 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 HQGTYVCDYTQSDTVSSWTVRAV--VQVRTIVGDTKLKPDILDPVEDTL-EVELGKPLTI : :.: . .... ....: :. :. : .: : : :... . :::.:: .. CCDS20 DAGDYTCKFIHNENGANYSVTATRSFTVKDEQG-FSLFPVIGAPAQNEIKEVEIGKNANL 180 190 200 210 220 230 280 290 300 310 320 pF1KE2 SCKARFGFERVFNPVIKWYIKDSDLE--WEVSVPEAKSIKSTLKDEIIERNIILE--KVT .:.: :: : .. : .. . . : . . .. ...... . ...:. : CCDS20 TCSACFGKGTQFLAAVLWQLNGTKITDFGEPRIQQEEGQNQSFSNGLACLDMVLRIADVK 240 250 260 270 280 290 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 QRDLRRKFVCFVQNSIGNTTQSVQLKEKRGVVL--LYILLGTIGTLVAVLAASALLYRH- ..:: .. :.. : : ..:.:..: . .: .... .... .. . ... . CCDS20 EEDLLLQYDCLALNLHGLRRHTVRLSRKNPIDHHSIYCIIAVCSVFLMLINVLVIILKMF 300 310 320 330 340 350 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 WIEIVLLYRTYQSKDQTLGDKKDFDAFVSYAKWSSFPSEATSSLSEEHLALSLFPDVLEN ::: .::.: . .: .: : .::.: : . .. : . .. ::.. ...:::::: CCDS20 WIEATLLWRDIAKPYKTRNDGKLYDAYVVYPR--NYKSSTDGASRVEHFVHQILPDVLEN 360 370 380 390 400 410 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 KYGYSLCLLERDVAPGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFILSPNYV-NGPSIFELQAAVNLALD : ::.::. ::. :: . . . :..::: ::::.:. . : .: ..:.. :: CCDS20 KCGYTLCIYGRDMLPGEDVVTAVETNIRKSRRHIFILTPQITHNKEFAYEQEVALHCALI 420 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 pF1KE2 DQTLKLILIKFCYFQE-----PESLPHLVKKALRVLPTVTWR-----GLKSVPPNSRFWA .. :.:::.. ..: :.: ... ..: :. :: . .:. ::.:: CCDS20 QNDAKVILIEMEALSELDMLQAEALQDSLQHLMKVQGTIKWREDHIANKRSL--NSKFWK 480 490 500 510 520 560 570 580 590 pF1KE2 KMRYHMPVKNSQGFTWNQLRITSRIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW ..::.::: CCDS20 HVRYQMPVPSKIPRKASSLTPLAAQKQ 530 540 550 599 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 18:22:01 2016 done: Sun Nov 6 18:22:02 2016 Total Scan time: 3.500 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]