FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9461, 481 aa 1>>>pF1KE9461 481 - 481 aa - 481 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6888+/-0.000873; mu= 17.6629+/- 0.053 mean_var=116.5598+/-25.484, 0's: 0 Z-trim(111.0): 155 B-trim: 1960 in 3/48 Lambda= 0.118795 statistics sampled from 11823 (12049) to 11823 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.37), width: 16 Scan time: 3.520 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1420.1 GPR37L1 gene_id:9283|Hs108|chr1 ( 481) 3293 575.4 4.6e-164 CCDS5792.1 GPR37 gene_id:2861|Hs108|chr7 ( 613) 1420 254.5 2.3e-67 CCDS3769.1 EDNRA gene_id:1909|Hs108|chr4 ( 427) 465 90.7 3.4e-18 CCDS9461.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 442) 459 89.7 7.1e-18 CCDS55902.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 532) 459 89.8 8e-18 CCDS45059.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 436) 417 82.5 1e-15 CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 345 70.1 4.9e-12 CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX ( 399) 333 68.0 2.1e-11 >>CCDS1420.1 GPR37L1 gene_id:9283|Hs108|chr1 (481 aa) initn: 3293 init1: 3293 opt: 3293 Z-score: 3059.0 bits: 575.4 E(32554): 4.6e-164 Smith-Waterman score: 3293; 99.8% identity (99.8% similar) in 481 aa overlap (1-481:1-481) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MRWLWPLAVSLAVILAVGLSRVSGGAPLHLGRHRAETQEQQSRSKRGTEDEEAKGVQQYV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 MRWLWPLAVSLAVILAVGLSRVSGGAPLHLGRHRAETQEQQSRSKRGTEDEEAKGVQQYV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 PEEWAEYPRPIHPAGLQPTKPLVATSPNPDKDGGTPDSGQELRGNLTGAPGQRLQIQNPL ::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 PEEWAEYPRPIHPAGLQPTKPLVATSPNPGKDGGTPDSGQELRGNLTGAPGQRLQIQNPL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 YPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIVWHSYYLKSAWNSILASLALWDFLVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 YPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIVWHSYYLKSAWNSILASLALWDFLVL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 FFCLPIVIFNEITKQRLLGDVSCRAVPFMEVSSLGVTTFSLCALGIDRFHVATSTLPKVR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 FFCLPIVIFNEITKQRLLGDVSCRAVPFMEVSSLGVTTFSLCALGIDRFHVATSTLPKVR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 PIERCQSILAKLAVIWVGSMTLAVPELLLWQLAQEPAPTMGTLDSCIMKPSASLPESLYS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 PIERCQSILAKLAVIWVGSMTLAVPELLLWQLAQEPAPTMGTLDSCIMKPSASLPESLYS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 LVMTYQNARMWWYFGCYFCLPILFTVTCQLVTWRVRGPPGRKSECRASKHEQCESQLNST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 LVMTYQNARMWWYFGCYFCLPILFTVTCQLVTWRVRGPPGRKSECRASKHEQCESQLNST 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 VVGLTVVYAFCTLPENVCNIVVAYLSTELTRQTLDLLGLINQFSTFFKGAITPVLLLCIC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 VVGLTVVYAFCTLPENVCNIVVAYLSTELTRQTLDLLGLINQFSTFFKGAITPVLLLCIC 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 RPLGQAFLDCCCCCCCEECGGASEASAANGSDNKLKTEVSSSIYFHKPRESPPLLPLGTP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 RPLGQAFLDCCCCCCCEECGGASEASAANGSDNKLKTEVSSSIYFHKPRESPPLLPLGTP 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 C : CCDS14 C >>CCDS5792.1 GPR37 gene_id:2861|Hs108|chr7 (613 aa) initn: 1557 init1: 686 opt: 1420 Z-score: 1322.8 bits: 254.5 E(32554): 2.3e-67 Smith-Waterman score: 1420; 51.1% identity (78.0% similar) in 405 aa overlap (81-481:215-613) 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 EEAKGVQQYVPEEWAEYPRPIHPAGLQPTKPLVATSPNPDKDGGTPDSGQELRGNLTGAP : : . : . : . : ::: :. CCDS57 RAGKLQGSHHKPLSKTANGLAGHEGWTIALPGRALAQNGSLGEGIHEPGGPRRGNSTN-- 190 200 210 220 230 240 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 GQRLQIQNPLYPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIVWHSYYLKSAWNSILA .:....::.::.:. ::.:::.: :..:.:..::.:::.::::: :.::..: ::.:: CCDS57 -RRVRLKNPFYPLTQESYGAYAVMCLSVVIFGTGIIGNLAVMCIVCHNYYMRSISNSLLA 250 260 270 280 290 300 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 SLALWDFLVLFFCLPIVIFNEITKQRLLGDVSCRAVPFMEVSSLGVTTFSLCALGIDRFH .::.::::..:::::.:::.:.::. :: : ::. ::..::.:::::::.:::: ::::. CCDS57 NLAFWDFLIIFFCLPLVIFHELTKKWLLEDFSCKIVPYIEVASLGVTTFTLCALCIDRFR 310 320 330 340 350 360 240 250 260 270 280 pF1KE9 VATSTLPKVRPIERCQSILAKLAVIWVGSMTLAVPELLLWQLAQEPAPTMGTL--DSCIM .::.. . :: :.: :::::::::.. ::.::..: ::..: : . ::. CCDS57 AATNVQMYYEMIENCSSTTAKLAVIWVGALLLALPEVVLRQLSKEDLGFSGRAPAERCII 370 380 390 400 410 420 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 KPSASLPESLYSLVMTYQNARMWWYFGCYFCLPILFTVTCQLVTWR-VRGPPGRKSECRA : : .::...: :..::..::.::::::::::: :::.::.::: : .: ..:. :. CCDS57 KISPDLPDTIYVLALTYDSARLWWYFGCYFCLPTLFTITCSLVTARKIR--KAEKACTRG 430 440 450 460 470 350 360 370 380 390 400 pF1KE9 SKHE-QCESQLNSTVVGLTVVYAFCTLPENVCNIVVAYLSTELTRQTLDLLGLINQFSTF .:.. : :::.: :::.::..:.:: .:::.::::.::..: ...::.:::..:.:: : CCDS57 NKRQIQLESQMNCTVVALTILYGFCIIPENICNIVTAYMATGVSQQTMDLLNIISQFLLF 480 490 500 510 520 530 410 420 430 440 450 460 pF1KE9 FKGAITPVLLLCICRPLGQAFLDCCCCCCCEECGGASEASAANGSDNKLKTEVSSSIYFH ::. .:::::.:.:.:...::..:::::: ::: : . ... .::. ::. : . CCDS57 FKSCVTPVLLFCLCKPFSRAFMECCCCCC-EECIQKSSTVTSDDNDNEYTTELELSPFST 540 550 560 570 580 590 470 480 pF1KE9 KPRESPPLLPLGTPC :: . .:: : CCDS57 IRREMSTFASVGTHC 600 610 >>CCDS3769.1 EDNRA gene_id:1909|Hs108|chr4 (427 aa) initn: 465 init1: 115 opt: 465 Z-score: 440.2 bits: 90.7 E(32554): 3.4e-18 Smith-Waterman score: 465; 26.2% identity (61.3% similar) in 328 aa overlap (126-435:76-388) 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 PDSGQELRGNLTGAPGQRLQIQNPLYPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIV .: : ... ..: ::.::: ... :. CCDS37 SFLVTTHQPTNLVLPSNGSMHNYCPQQTKITSAFKYINTVISCTIFIVGMVGNATLLRII 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 WHSYYLKSAWNSILASLALWDFLVLFFCLPIVIFNEIT-----KQRLLGDVSCRAVPFME ... .... :...::::: :.. . . ::: .:. .. . .: :. ::.. CCDS37 YQNKCMRNGPNALIASLALGDLIYVVIDLPINVFKLLAGRWPFDHNDFGVFLCKLFPFLQ 110 120 130 140 150 160 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 VSSLGVTTFSLCALGIDRFHVATSTLPKVRPIERCQSILAKLAVIWVGSMTLAVPELLLW ::.:.:...::::..::.. :... .:. : ... ::. :. ::.:: . . CCDS37 KSSVGITVLNLCALSVDRYR-AVASWSRVQGIGIPLVTAIEIVSIWILSFILAIPEAIGF 170 180 190 200 210 220 280 290 300 310 320 pF1KE9 QLAQEPAPTMGTLD-SCIMKPSASLPESLYSLVMTYQNARMWWYFGCYFCLPILFT---- .. : : .:... .... : ::... :: :: :::.:.. : CCDS37 VMV--PFEYRGEQHKTCMLNATSKFME-------FYQDVKDWWLFGFYFCMPLVCTAIFY 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 --VTCQLVTWRVRGPPGRKSECRASKHEQCESQLNSTVVGLTVVYAFCTLPENVCNIVVA .::.... : : . . :.: . . .. .:: :.:..:.: .: .. :. CCDS37 TLMTCEMLNRR-NG----SLRIALSEHLKQRREVAKTVFCLVVIFALCWFPLHLSRILKK 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 pF1KE9 YLSTELTRQTLDLLG---LINQFS---TFFKGAITPVLLLCICRPLGQAFLDCCCCCCCE . .:. .. .::. :.. .. . ... :.:. : . . . . : .: :::: CCDS37 TVYNEMDKNRCELLSFLLLMDYIGINLATMNSCINPIALYFVSKKFKNCFQSCLCCCCYQ 340 350 360 370 380 390 440 450 460 470 480 pF1KE9 ECGGASEASAANGSDNKLKTEVSSSIYFHKPRESPPLLPLGTPC CCDS37 SKSLMTSVPMNGTSIQWKNHDQNNHNTDRSSHKDSMN 400 410 420 >>CCDS9461.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 (442 aa) initn: 459 init1: 236 opt: 459 Z-score: 434.4 bits: 89.7 E(32554): 7.1e-18 Smith-Waterman score: 463; 25.6% identity (56.9% similar) in 445 aa overlap (11-435:13-405) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MRWLWPLAVSLAVILAVGLSRVSGGAPLHLGRHRAETQEQQSRSKRGTEDEEAKGVQQ .:..:: ::::. : .:: ..: . : CCDS94 MQPPPSLCGRALVALVLACGLSRIWG-------------------EERGFPPDRATPLLQ 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 ----YVPEEWAEYPRPIHPAGLQPTKPLVATSPNPDKDGGTPDSGQELRGNLTGAPGQRL ..: . .:. . . . : : :. :. .:.: ... : CCDS94 TAEIMTPPTKTLWPKGSNASLARSLAP--AEVPKGDRTAGSPPR------TISPPP---- 50 60 70 80 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 QIQNPLYPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIVWHSYYLKSAWNSILASLAL :.:. . :. : ... .::..::.:: ... :.... .... : ..::::: CCDS94 -CQGPI-EIKETF--KYINTVVSCLVFVLGIIGNSTLLRIIYKNKCMRNGPNILIASLAL 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 WDFLVLFFCLPIVIFNEITKQRLLGDVSCRAVPFMEVSSLGVTTFSLCALGIDRFHVATS :.: . . .:: ... .... .: :. :::.. .:.:.:..:::::.:::.. :.. CCDS94 GDLLHIVIDIPINVYKLLAEDWPFGAEMCKLVPFIQKASVGITVLSLCALSIDRYR-AVA 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 TLPKVRPIERCQSILAKLAVIWVGSMTLAVPELLLWQLAQEPAPTMGT-LDSCIMKPSAS . ... : . .....::: :..::::: . ... :. : :...: . CCDS94 SWSRIKGIGVPKWTAVEIVLIWVVSVVLAVPEAIGFDII--TMDYKGSYLRICLLHPVQK 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 pF1KE9 LPESLYSLVMTYQNARMWWYFGCYFCLPILFT------VTCQLVTWRVRGPPGRKSECRA .... :..:. :: :. :::::. .: .::.. .: : . CCDS94 T-----AFMQFYKTAKDWWLFSFYFCLPLAITAFFYTLMTCEM----LRKKSGMQIAL-- 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 pF1KE9 SKHEQCESQLNSTVVGLTVVYAFCTLPENVCNIV--VAYLSTELTR-------QTLDLLG . : . . .. .:: :..:.:.: :: .. :. . : ... .: .:: .: CCDS94 NDHLKQRREVAKTVFCLVLVFALCWLPLHLSRILKLTLYNQNDPNRCELLSFLLVLDYIG 320 330 340 350 360 370 400 410 420 430 440 450 pF1KE9 LINQFSTFFKGAITPVLLLCICRPLGQAFLDCCCCCCCEECGGASEASAANGSDNKLKTE ::. : ... :.:. : . . . . : .: :: : CCDS94 -INMAS--LNSCINPIALYLVSKRFKNCFKSCLCCWCQSFEEKQSLEEKQSCLKFKANDH 380 390 400 410 420 460 470 480 pF1KE9 VSSSIYFHKPRESPPLLPLGTPC CCDS94 GYDNFRSSNKYSSS 430 440 >>CCDS55902.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 (532 aa) initn: 459 init1: 236 opt: 459 Z-score: 433.5 bits: 89.8 E(32554): 8e-18 Smith-Waterman score: 463; 25.6% identity (56.9% similar) in 445 aa overlap (11-435:103-495) 10 20 30 40 pF1KE9 MRWLWPLAVSLAVILAVGLSRVSGGAPLHLGRHRAETQEQ .:..:: ::::. : CCDS55 EALKLRSGHRTPSGAGSSMQPPPSLCGRALVALVLACGLSRIWG---------------- 80 90 100 110 50 60 70 80 90 pF1KE9 QSRSKRGTEDEEAKGVQQ----YVPEEWAEYPRPIHPAGLQPTKPLVATSPNPDKDGGTP .:: ..: . : ..: . .:. . . . : : :. :. .:.: CCDS55 ---EERGFPPDRATPLLQTAEIMTPPTKTLWPKGSNASLARSLAP--AEVPKGDRTAGSP 120 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 DSGQELRGNLTGAPGQRLQIQNPLYPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIVW ... : :.:. . :. : ... .::..::.:: ... :.. CCDS55 PR------TISPPP-----CQGPI-EIKETF--KYINTVVSCLVFVLGIIGNSTLLRIIY 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 HSYYLKSAWNSILASLALWDFLVLFFCLPIVIFNEITKQRLLGDVSCRAVPFMEVSSLGV .. .... : ..::::: :.: . . .:: ... .... .: :. :::.. .:.:. CCDS55 KNKCMRNGPNILIASLALGDLLHIVIDIPINVYKLLAEDWPFGAEMCKLVPFIQKASVGI 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 TTFSLCALGIDRFHVATSTLPKVRPIERCQSILAKLAVIWVGSMTLAVPELLLWQLAQEP :..:::::.:::.. :... ... : . .....::: :..::::: . ... CCDS55 TVLSLCALSIDRYR-AVASWSRIKGIGVPKWTAVEIVLIWVVSVVLAVPEAIGFDII--T 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 pF1KE9 APTMGT-LDSCIMKPSASLPESLYSLVMTYQNARMWWYFGCYFCLPILFT------VTCQ :. : :...: . .... :..:. :: :. :::::. .: .::. CCDS55 MDYKGSYLRICLLHPVQKT-----AFMQFYKTAKDWWLFSFYFCLPLAITAFFYTLMTCE 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 LVTWRVRGPPGRKSECRASKHEQCESQLNSTVVGLTVVYAFCTLPENVCNIV--VAYLST . .: : . . : . . .. .:: :..:.:.: :: .. :. . : .. CCDS55 M----LRKKSGMQIAL--NDHLKQRREVAKTVFCLVLVFALCWLPLHLSRILKLTLYNQN 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 pF1KE9 ELTR-------QTLDLLGLINQFSTFFKGAITPVLLLCICRPLGQAFLDCCCCCCCEECG . .: .:: .: ::. : ... :.:. : . . . . : .: :: : CCDS55 DPNRCELLSFLLVLDYIG-INMAS--LNSCINPIALYLVSKRFKNCFKSCLCCWCQSFEE 450 460 470 480 490 500 450 460 470 480 pF1KE9 GASEASAANGSDNKLKTEVSSSIYFHKPRESPPLLPLGTPC CCDS55 KQSLEEKQSCLKFKANDHGYDNFRSSNKYSSS 510 520 530 >>CCDS45059.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 (436 aa) initn: 433 init1: 236 opt: 417 Z-score: 395.6 bits: 82.5 E(32554): 1e-15 Smith-Waterman score: 421; 24.9% identity (56.1% similar) in 437 aa overlap (11-427:13-397) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MRWLWPLAVSLAVILAVGLSRVSGGAPLHLGRHRAETQEQQSRSKRGTEDEEAKGVQQ .:..:: ::::. : .:: ..: . : CCDS45 MQPPPSLCGRALVALVLACGLSRIWG-------------------EERGFPPDRATPLLQ 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 ----YVPEEWAEYPRPIHPAGLQPTKPLVATSPNPDKDGGTPDSGQELRGNLTGAPGQRL ..: . .:. . . . : : :. :. .:.: ... : : CCDS45 TAEIMTPPTKTLWPKGSNASLARSLAP--AEVPKGDRTAGSPPR------TISPPPCQG- 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 QIQNPLYPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIVWHSYYLKSAWNSILASLAL :. . : ... .::..::.:: ... :.... .... : ..::::: CCDS45 -------PIEIKETFKYINTVVSCLVFVLGIIGNSTLLRIIYKNKCMRNGPNILIASLAL 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 WDFLVLFFCLPIVIFNEITKQRLLGDVSCRAVPFMEVSSLGVTTFSLCALGIDRFHVATS :.: . . .:: ... .... .: :. :::.. .:.:.:..:::::.:::.. :.. CCDS45 GDLLHIVIDIPINVYKLLAEDWPFGAEMCKLVPFIQKASVGITVLSLCALSIDRYR-AVA 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 TLPKVRPIERCQSILAKLAVIWVGSMTLAVPELLLWQLAQEPAPTMGT-LDSCIMKPSAS . ... : . .....::: :..::::: . ... :. : :...: . CCDS45 SWSRIKGIGVPKWTAVEIVLIWVVSVVLAVPEAIGFDIIT--MDYKGSYLRICLLHPVQK 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 pF1KE9 LPESLYSLVMTYQNARMWWYFGCYFCLPILFT------VTCQLVTWRVRGPPGRKSECRA .... :..:. :: :. :::::. .: .::... : : . CCDS45 T-----AFMQFYKTAKDWWLFSFYFCLPLAITAFFYTLMTCEML----RKKSGMQIA--L 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 pF1KE9 SKHEQCESQLNSTVVGLTVVYAFCTLPENVCNIV--VAYLSTELTR-------QTLDLLG . : . . .. .:: :..:.:.: :: .. :. . : ... .: .:: .: CCDS45 NDHLKQRREVAKTVFCLVLVFALCWLPLHLSRILKLTLYNQNDPNRCELLSFLLVLDYIG 320 330 340 350 360 370 400 410 420 430 440 450 pF1KE9 LINQFSTFFKGAITPVLLLCICRPLGQAFLDCCCCCCCEECGGASEASAANGSDNKLKTE ::. : ... :.:. : . . . . : CCDS45 -INMAS--LNSCINPIALYLVSKRFKNCFKAGPHVGNKLVMLFSVNIECDGTVNQNPTMW 380 390 400 410 420 >>CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX (384 aa) initn: 321 init1: 215 opt: 345 Z-score: 329.6 bits: 70.1 E(32554): 4.9e-12 Smith-Waterman score: 348; 24.8% identity (58.2% similar) in 311 aa overlap (131-434:41-340) 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 ELRGNLTGAPGQRLQIQNPLYPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIVWHSYY :.: . :.. .:..::.... : CCDS14 LEVDHFMHCNISSHSADLPVNDDWSHPGILYVIPAVYGVIILIGLIGNITLIKIFCTVKS 20 30 40 50 60 70 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 LKSAWNSILASLALWDFLVLFFCLPIVIFNEITKQRLLGDVSCRAVPFMEVSSLGVTTFS .... : ...:::: :.:.:. : :. .. . :.: ..:. .::....:.::..:. 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