FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4183, 655 aa 1>>>pF1KE4183 655 - 655 aa - 655 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5123+/-0.000952; mu= 9.9331+/- 0.057 mean_var=142.9875+/-28.330, 0's: 0 Z-trim(109.9): 85 B-trim: 104 in 1/50 Lambda= 0.107257 statistics sampled from 11099 (11189) to 11099 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16 Scan time: 3.100 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 4336 683.0 3.6e-196 CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 3248 514.6 1.7e-145 CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 2757 438.6 1.2e-122 CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 2487 396.8 4.8e-110 CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 769 130.9 4.1e-30 CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 741 126.8 1.3e-28 CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 715 122.7 2.1e-27 CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 666 115.0 2.9e-25 CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 654 113.1 9.5e-25 CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 652 112.8 1.1e-24 CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 647 112.0 2e-24 CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 636 110.3 6.4e-24 CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 568 99.8 9.1e-21 CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 540 95.5 1.9e-19 CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 519 92.2 1.8e-18 CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 506 90.3 9.1e-18 CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 504 89.9 9.5e-18 CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 505 90.1 9.6e-18 CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 490 87.8 4.3e-17 CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 457 82.6 1.2e-15 CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 428 78.1 3e-14 CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 398 73.5 8.1e-13 CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 393 72.7 1.2e-12 CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 384 71.4 3.6e-12 CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 368 68.9 2.1e-11 >>CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 (655 aa) initn: 4336 init1: 4336 opt: 4336 Z-score: 3635.4 bits: 683.0 E(32554): 3.6e-196 Smith-Waterman score: 4336; 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CCDS57 FKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPAA 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 FWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS57 FWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRAD 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 KRRAQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEALELTGTPEEEHMGKTTSLIESQHH ::::::::::::::.::.::.:::..:::::::.. :. .. :. ..:. : .:.::: CCDS57 KRRAQKKARLARIRAAKSGSANAYMQSKRNGLLSNQLQ-SSEDEQAFVSKSGSSFETQHH 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 HLLHCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIKNHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRSPSLS :::::::::: ::::.:::.::..::: . : ::..::::: CCDS57 HLLHCLEKTT-------------------NHEFVDEQVFEESCMEVATVNRPSSHSPSLS 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 SHPGLTTTCCSRRSKKTTHLPNSNLPATRLRSMQELSTIHIQGSEQPSLTTSRSSLNLKA :. :.:.:::::: ::: ..::.:. ... :.::::::.:. :. :..:::::: : CCDS57 SQQGVTSTCCSRRHKKTFRIPNANVSGSHQGSIQELSTIQIRCVERTPLSNSRSSLNAKM 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 DDGLRPNCKTSQITTAIISIPTPPALTPEGESRP--PPASPGPNTNIPSIASNVVKVSAL .. .. ::. .:::::::::::. ::::..:: : : : :.:.:::: CCDS57 EECVKLNCEQPYVTTAIISIPTPPVTTPEGDDRPESPEYSGG----------NIVRVSAL 590 600 610 620 630 >>CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX (647 aa) initn: 2673 init1: 1335 opt: 2487 Z-score: 2089.2 bits: 396.8 E(32554): 4.8e-110 Smith-Waterman score: 2711; 63.9% identity (81.4% similar) in 678 aa overlap (1-655:1-647) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKRQDELIVLNVSGRRFQTWRTTLER ::::.:.:::::::::.::.:.:. :.: ::. : .: ::..:.:::::::.::..::.: CCDS14 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPGVKASRGDEVLVVNVSGRRFETWKNTLDR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 YPDTLLGSTEKEFFFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPRYECISAYDDELAF ::::::::.:::::.. :. ::::::::..:: ::::::::.:: :: :::.:.:.:::: CCDS14 YPDTLLGSSEKEFFYDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPRQECIQAFDEELAF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 YGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDSENNQESMPSL----SFRQTMWRAFENP ::..::..:::: :::.:::.:::::: .:...:. .. :.: :.:: .::::::: CCDS14 YGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERLAEDEEAEQAGDG-PALPAGSSLRQRLWRAFENP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 HTSTLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPC-GTVP-GSKELPCGERYSVAFFCLDTACV :::: :::::::::::::::::.:::::.:: :.. .:.: :::::. ::::.::::: CCDS14 HTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSREQPCGERFPQAFFCMDTACV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 MIFTVEYLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNNEDVSGAFVTLRVFRV .::: :::::::::::: ::.:::::.::::::.::::::.. .:.:::::::::::::: CCDS14 LIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLLVPKNDDVSGAFVTLRVFRV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 FRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. ..:::: CCDS14 FRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGTNKTNFTSI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 PASFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQ ::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 PAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQ 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 RADKRRAQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEALELTGTPEEEHMG-KTTSLIE ::::::::.:.::::::.::.:..::.:. :.:: .:: .:. ::. . .. : .: CCDS14 RADKRRAQQKVRLARIRLAKSGTTNAFLQYKQNG----GLEDSGSGEEQALCVRNRSAFE 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 SQHHHLLHCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIKNHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRS .::::::::::::: ::: :: : . : . ..:: CCDS14 QQHHHLLHCLEKTT-------------------CHEFTDELTFSEALGAVSPGGR-TSRS 480 490 500 510 540 550 560 570 580 pF1KE4 PSLSSHP----GLTTTCCSRRSKKTT-HLPNSNLPATRLRSMQELSTIHIQGSEQPSLTT :.::.: .: ..:: ::.:. . .: ::. ..: :::::. . : .. CCDS14 TSVSSQPVGPGSLLSSCCPRRAKRRAIRLANSTASVSR-GSMQELDML--AGLRRSHAPQ 520 530 540 550 560 570 590 600 610 620 630 pF1KE4 SRSSLNLKADDGLRPNCKTSQITTAIISIPTPPALTPEGESRPPPASPGP---------N :::::: : :.: :: . ....:::::::::: ::. ::.: .::: : CCDS14 SRSSLNAKPHDSLDLNCDSRDFVAAIISIPTPPANTPD-ESQP--SSPGGGGRAGSTLRN 580 590 600 610 620 640 650 pF1KE4 TNI--PSIASNVVKVSAL ... : . ..::.:.: CCDS14 SSLGTPCLFPETVKISSL 630 640 >>CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 (494 aa) initn: 757 init1: 396 opt: 769 Z-score: 654.2 bits: 130.9 E(32554): 4.1e-30 Smith-Waterman score: 803; 32.3% identity (62.8% similar) in 486 aa overlap (27-478:9-486) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKRQDEL-IVLNVSGRRFQTWRTTLE .: .... .:.. ::.::.: : . : CCDS16 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLS 10 20 30 40 60 70 80 90 100 pF1KE4 RYPDT--------LLGSTEKEFFFNED----TKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPR .::.: : :. . : . .: .:..:::::..:.::.. : :..:. . CCDS16 QYPETRLAELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKK 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 YECISAYDDELAFYGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAE-----RLMDDNDSENNQESMPS : . .:. :. . ... ::: . .....: : .:. :. . . :. CCDS16 GICPICFKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWR 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 LSFRQTMWRAFENPHTSTLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPC-GTVPGSKELPC-GE .. .:. .:.:..: : : .. ..: :: . : : ::.: . : :. CCDS16 -RCQKCVWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSV------VMCMGTIPELQVLDAEGN 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 pF1KE4 RYS-VAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNN : .. ..:::. ::.:::::::..:.. .: : :.:.::.::.:.:..:..:. CCDS16 RVEHPTLENVETACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHL 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 -------EDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAI .:. : .::..:. ::::..:::.::. : :.:: .:::.::. :...: CCDS16 GARMMELTNVQQAVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGI 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 IIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPASFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGV ..:... . :.. . : ::: :::..:.::::.::::. ::: ::. ..: : :: CCDS16 FVFSALGYTMEQSHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGV 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 LVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKARLARIRVA-----KTGSSNAYLHS-KR ..::::. :..:: : :...::. . :... .: .. . :::.: . : . CCDS16 IAIALPIHPIINNFVR-YYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPP 400 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 NGLLNEALELTGTPEEEHMGKTTSLIESQHHHLLHCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIK . .:: .. . : :. ..:: CCDS16 EPAGKEAPSCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK 460 470 480 490 510 520 530 540 550 560 pF1KE4 NHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRSPSLSSHPGLTTTCCSRRSKKTTHLPNSNLPATR >>CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 (911 aa) initn: 855 init1: 496 opt: 741 Z-score: 626.9 bits: 126.8 E(32554): 1.3e-28 Smith-Waterman score: 964; 30.6% identity (63.2% similar) in 644 aa overlap (27-637:20-639) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPAD--KNKRQDELIVLNVSGRRFQT-WRTT .: :.: ..: .. . .::.: .. ::: CCDS62 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRT- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 LERYPDTLLG-----STEKEFF-----FNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPR :.: : : :: .:.. .. .: . .:::::: : .: .::::::::::. . CCDS62 LDRLPRTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMME 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 YECISAYDDELAFYGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDS--ENNQESMPSLSF : .. .:: ..:: . .:: .:...:.. :.: . .. : . : . . CCDS62 EMCALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCC 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 ---RQTMWRAFENPHTSTLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPCGTVPGSKEL-PCGER :. .: .:.:..:. : .. :. .::..:.:. ..:.: . . :. .. CCDS62 PDKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLP--ELQETDEFGQLNDN 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE4 YSVAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNN-- ..: ....:. ::.:::::....:....:... ...::..::.:::. . .:.. CCDS62 RQLAH--VEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNK 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 -----EDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIII ..: . .:..:..::.:..::: ::. ::.::. .:::.:.. :.:.:.: CCDS62 SVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMI 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 FATVMFYAEKGSSASKFTSIPASFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLV :....:.::: .:.::::::::::.. .::::.::::. :::. ::: :..: ..:::: CCDS62 FSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLV 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 IALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEAL ::::.:.::.:::..:....: .: ...: : : :: ..: . .. : . ... CCDS62 IALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREA-LER---AKRNGSIVSMNLKDA--FARSM 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 ELTGTPEEEHMGKTTSLIES-QHHHLLHCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIKNHEFIDE :: . :. :.... .: . .:: : . . :: .::. :. : . CCDS62 ELIDVAVEK-AGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKA-------LS-ETSSNKSFENKYQ 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 QMFEQNCMESSMQNYPSTRSPSLSSHPGLTTTCCSRRSKKTTHLPNSNLPATRLRSMQEL .. ... :. ..: :. ::.. ... .: :: . : CCDS62 EVSQKDSHEQ-LNNTSSSSPQHLSAQKLEMLYNEITKTQPHSH-PNPDCQEKPERPSAYE 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KE4 STIHIQ----GSEQPSLTTSRSSLNLKADDGLRP--NCKTSQITTAIISIPTPPALTPEG :... .:: ... .. ...:. ... .: :. : : :: . . CCDS62 EEIEMEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKSTSSIDSFTSCATDFTETE--RSPLPPPSASHL 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 ESRPPPASPGPNTNIPSIASNVVKVSAL . . : :: CCDS62 QMKFPTDLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGPAARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHS 630 640 650 660 670 680 >>CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 (858 aa) initn: 711 init1: 510 opt: 715 Z-score: 605.5 bits: 122.7 E(32554): 2.1e-27 Smith-Waterman score: 933; 31.8% identity (64.8% similar) in 563 aa overlap (26-564:18-567) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKRQDELIVLNVSGRRFQT-WRTTLE : :. . ..: .. . :::.: .. ::: :. CCDS13 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIV-RSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRT-LD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 RYPDTLLG-----STEKEFF-----FNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPRYE : : : :: .:. .. .. : .:::::: : .: .:::::::.::. . CCDS13 RLPRTRLGKLRDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEM 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 CISAYDDELAFYGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDS--ENNQESMPSLSF-- : ....:: ..:: . .:: .:...:.. :.: . .. : . : . . CCDS13 CALSFSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 -RQTMWRAFENPHTSTLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPCGTVPGSKEL-PCGERYS :. .: .:.:..:. : .. .. .::..:.:. ..:.: . . :. . . CCDS13 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLP--ELQSLDEFGQSTDNPQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 VAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNN---- .: ....:. ::.:::::....:....:... .. ::..::.:::. . .:.. CCDS13 LAH--VEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSV 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 ---EDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFA ..: . .:..:..::.:..::: ::. ::.::. .:::.:.. :.:.:.::. CCDS13 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 TVMFYAEKGSSASKFTSIPASFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIA ...:.::: . .:: :::::::.. .::::.::::. :::. ::: :..: ..:::::: CCDS13 SLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 LPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEALEL ::.:.::.:::..:....: .: : :. : : :. ..:: .. . . : ... CCDS13 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEK--AIKR-REALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDI 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 TGTPEEEHMGKTTSLIESQHHHLLHCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIKNHEFIDEQMF . . :.::: .. : .:: : : . . : .:. . : . CCDS13 VVEKNGENMGKKDKV---QDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSS 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 EQNCMESSMQNYPSTRSPSLSSHPGLTTTCCSRRSKKTTHLPNSNLPATRLRSMQELSTI :. ...... . . . .:.: :.: . .:: .: ..:. CCDS13 PQHLNVQQLEDMYN-KMAKTQSQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGV 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE4 HIQGSEQPSLTTSRSSLNLKADDGLRPNCKTSQITTAIISIPTPPALTPEGESRPPPASP CCDS13 IDMRSMSSIDSFISCATDFPEATRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGALGASGGRFVE 580 590 600 610 620 630 >>CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 (575 aa) initn: 803 init1: 503 opt: 666 Z-score: 567.1 bits: 115.0 E(32554): 2.9e-25 Smith-Waterman score: 884; 34.9% identity (64.7% similar) in 473 aa overlap (26-457:88-545) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMP--LAPADKNKRQDELIVLNVSGRRFQT :.: : : .. : .:.:.:: ::.: CCDS82 GDHLLEPEVADGGGAPPQGGCGGGGCDRYEPLPPSLPAAGEQDCCGERVVINISGLRFET 60 70 80 90 100 110 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 WRTTLERYPDTLLGSTEKEF-FFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTG-KLHYPRYECI :: ..:.::::. .... .:. .::::::. : .: .:..: ... : : CCDS82 QLKTLCQFPETLLGDPKRRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRIRRPVNVPI 120 130 140 150 160 170 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 SAYDDELAFYGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDSENNQESMPSLSFRQTMWR . ...:. :: . :. .:.... :.. ..... .: .:.. .: CCDS82 DIFSEEIRFYQL-----GEEAMEKFRE----------DEGFLREEERPLPRRDFQRQVWL 180 190 200 210 220 180 190 200 210 pF1KE4 AFENPHTSTLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVP---------CGTVPGSKELP----C :: :..: : . :. . : .:.. .::.: .: : : CCDS82 LFEYPESSGPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDEKDYPASTSQDSFEAAGNSTS 230 240 250 260 270 280 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 GER-----YSVAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIG : : .: :: ..: :.. :. : :.:.:: ::. : :..:..::.:::.::.: CCDS82 GSRAGASSFSDPFFVVETLCIIWFSFELLVRFFACPSKATFSRNIMNLIDIVAIIPYFIT 290 300 310 320 330 340 280 290 300 310 320 pF1KE4 LVM-------TNNEDVSGAFV-TLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLL : .... .: :.. ..:. :::::::.::::.::.::: :::. :::.:. CCDS82 LGTELAERQGNGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLI 350 360 370 380 390 400 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 FSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPASFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGS : : ...:.:......:: . .: :.::: .::...:::::.::::: : ::.::: :: CCDS82 FFLFIGVILFSSAVYFAEADDPTSGFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMHPVTIGGKIVGS 410 420 430 440 450 460 390 400 410 420 430 pF1KE4 ICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRR-----------AQKKARLARIRVAK .:...:::.::::::::::::. .::.. ..... ... .: . : . 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CCDS82 TEPSAQQNMSLAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGV 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 IIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPASFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGV :.:......:: :.:.::: .::...:::::.::::: : : .::: :..:...:: CCDS82 ILFSSAVYFAEVDEPESHFSSIPDGFWWAVVTMTTVGYGDMCPTTPGGKIVGTLCAIAGV 390 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 LVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRA--QKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLL :.::::::::::::. .::.. . .... . :. .. ::... .: :: CCDS82 LTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEKQNIPGEIERILNSVGSRMGSTDSL--NKTNGGC 450 460 470 480 490 500 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 NEALELTGTPEEEHMGKTTSLIESQHHHLLHCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIKNHEF CCDS82 STEKSRK 510 >>CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 (456 aa) initn: 822 init1: 505 opt: 652 Z-score: 556.8 bits: 112.8 E(32554): 1.1e-24 Smith-Waterman score: 894; 37.5% identity (64.6% similar) in 427 aa overlap (25-418:5-409) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKRQDELIVLNVSGRRFQTWRTTLER :: : . .. .::::.: ::.: :: : CCDS12 MEPRCPPPCGCCER-------LVLNVAGLRFETRARTLGR 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KE4 YPDTLLGSTEKE-FFFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTG-KLHYPRYECISAYDDEL .::::::. .. :... .:::::: : :: .:..: .:. : . .... .:. 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