Result of FASTA (omim) for
pFN21AE9566
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9566, 353 aa
1>>>pF1KE9566 353 - 353 aa - 353 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1262+/-0.000458; mu= 17.4010+/- 0.028
mean_var=138.3963+/-39.555, 0's: 0 Z-trim(109.8): 408 B-trim: 1053 in 1/49
Lambda= 0.109021
statistics sampled from 17480 (18076) to 17480 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 7.310
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_036284 (OMIM: 605106) lysophosphatidic acid rec ( 353) 2349 382.0 1.1e-105
XP_016869893 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869890 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869889 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869883 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869888 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869895 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869896 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
NP_476500 (OMIM: 602282) lysophosphatidic acid rec ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869884 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869885 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
NP_001392 (OMIM: 602282) lysophosphatidic acid rec ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869894 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869873 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869874 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869887 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869875 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869886 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869880 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869876 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869878 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869882 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869879 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869881 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869877 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869891 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869892 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_005251838 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_005251839 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016869872 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 1242 207.9 2.9e-53
XP_016882957 (OMIM: 605110) PREDICTED: lysophospha ( 351) 1119 188.5 1.9e-47
NP_004711 (OMIM: 605110) lysophosphatidic acid rec ( 351) 1119 188.5 1.9e-47
XP_011526723 (OMIM: 605110) PREDICTED: lysophospha ( 351) 1119 188.5 1.9e-47
XP_016882958 (OMIM: 605110) PREDICTED: lysophospha ( 351) 1119 188.5 1.9e-47
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 724 126.4 9.8e-29
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 714 124.9 2.9e-28
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 714 124.9 2.9e-28
NP_001159687 (OMIM: 605146) sphingosine 1-phosphat ( 398) 613 109.0 1.8e-23
NP_110387 (OMIM: 605146) sphingosine 1-phosphate r ( 398) 613 109.0 1.8e-23
NP_003766 (OMIM: 603751) sphingosine 1-phosphate r ( 384) 552 99.4 1.4e-20
NP_004221 (OMIM: 605111,610419,610419) sphingosine ( 353) 535 96.7 8.4e-20
NP_005272 (OMIM: 600241) G-protein coupled recepto ( 330) 466 85.8 1.5e-16
NP_005279 (OMIM: 600752) G-protein coupled recepto ( 334) 437 81.2 3.5e-15
NP_005275 (OMIM: 600553) G-protein coupled recepto ( 362) 426 79.6 1.2e-14
NP_001273028 (OMIM: 600553) G-protein coupled rece ( 377) 426 79.6 1.3e-14
NP_001832 (OMIM: 605051) cannabinoid receptor 2 [H ( 360) 371 70.9 4.9e-12
XP_011538931 (OMIM: 605051) PREDICTED: cannabinoid ( 360) 371 70.9 4.9e-12
XP_016855750 (OMIM: 605051) PREDICTED: cannabinoid ( 360) 371 70.9 4.9e-12
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 367 70.2 7.2e-12
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 349 67.4 5.1e-11
>>NP_036284 (OMIM: 605106) lysophosphatidic acid recepto (353 aa)
initn: 2349 init1: 2349 opt: 2349 Z-score: 2018.5 bits: 382.0 E(85289): 1.1e-105
Smith-Waterman score: 2349; 100.0% identity (100.0% similar) in 353 aa overlap (1-353:1-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNECHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSLVIAAVIKNRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MNECHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSLVIAAVIKNRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 FHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTASLTNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 FHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTASLTNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISACSSLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISACSSLA
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190 200 210 220 230 240
pF1KE9 PIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNVLSPHTSGSISRRRTPMKLMKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 PIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNVLSPHTSGSISRRRTPMKLMKT
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250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 VMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFLLLALLNSVVNPIIYSYKDEDM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE9 YGTMKKMICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 YGTMKKMICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
310 320 330 340 350
>>XP_016869893 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophosphatidi (364 aa)
initn: 984 init1: 984 opt: 1242 Z-score: 1077.4 bits: 207.9 E(85289): 2.9e-53
Smith-Waterman score: 1242; 51.9% identity (80.8% similar) in 339 aa overlap (1-329:19-354)
10 20 30
pF1KE9 MNE--CHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDW-TGTKLVIVLCVGTF
::: : :.. . ::::::. . .: : .:::. : :
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40 50 60 70 80 90
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100 110 120 130 140 150
pF1KE9 NRWFLRQGLLDSSLTASLTNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFM
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160 170 180 190 200 210
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220 230 240 250 260 270
pF1KE9 LSPHTSGSISRRRTPMKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFL
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XP_016 MSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFL
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280 290 300 310 320 330
pF1KE9 LLALLNSVVNPIIYSYKDEDMYGTMKKMICCFSQENP-------ERRPSRIPSTVLSRSD
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XP_016 LLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVH
300 310 320 330 340 350
340 350
pF1KE9 TGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
XP_016 SNDHSVV
360
>>XP_016869890 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophosphatidi (364 aa)
initn: 984 init1: 984 opt: 1242 Z-score: 1077.4 bits: 207.9 E(85289): 2.9e-53
Smith-Waterman score: 1242; 51.9% identity (80.8% similar) in 339 aa overlap (1-329:19-354)
10 20 30
pF1KE9 MNE--CHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDW-TGTKLVIVLCVGTF
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:.::...: ::..:. ::.::::.:::.:::::::::::.:: .::::::: .. :::
XP_016 VCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTV
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pF1KE9 NRWFLRQGLLDSSLTASLTNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFM
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XP_016 STWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVM
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160 170 180 190 200 210
pF1KE9 GAVPTLGWNCLCNISACSSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNV
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pF1KE9 LSPHTSGSISRRRTPMKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFL
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XP_016 MSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFL
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280 290 300 310 320 330
pF1KE9 LLALLNSVVNPIIYSYKDEDMYGTMKKMICCFSQENP-------ERRPSRIPSTVLSRSD
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XP_016 LLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVH
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340 350
pF1KE9 TGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
XP_016 SNDHSVV
360
>>XP_016869889 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophosphatidi (364 aa)
initn: 984 init1: 984 opt: 1242 Z-score: 1077.4 bits: 207.9 E(85289): 2.9e-53
Smith-Waterman score: 1242; 51.9% identity (80.8% similar) in 339 aa overlap (1-329:19-354)
10 20 30
pF1KE9 MNE--CHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDW-TGTKLVIVLCVGTF
::: : :.. . ::::::. . .: : .:::. : :
XP_016 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGL--GIT
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pF1KE9 NRWFLRQGLLDSSLTASLTNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFM
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XP_016 STWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVM
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160 170 180 190 200 210
pF1KE9 GAVPTLGWNCLCNISACSSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNV
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pF1KE9 LSPHTSGSISRRRTPMKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFL
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XP_016 MSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFL
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280 290 300 310 320 330
pF1KE9 LLALLNSVVNPIIYSYKDEDMYGTMKKMICCFSQENP-------ERRPSRIPSTVLSRSD
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XP_016 LLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVH
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340 350
pF1KE9 TGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
XP_016 SNDHSVV
360
>>XP_016869883 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophosphatidi (364 aa)
initn: 984 init1: 984 opt: 1242 Z-score: 1077.4 bits: 207.9 E(85289): 2.9e-53
Smith-Waterman score: 1242; 51.9% identity (80.8% similar) in 339 aa overlap (1-329:19-354)
10 20 30
pF1KE9 MNE--CHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDW-TGTKLVIVLCVGTF
::: : :.. . ::::::. . .: : .:::. : :
XP_016 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGL--GIT
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pF1KE9 FCLFIFFSNSLVIAAVIKNRKFHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTV
:.::...: ::..:. ::.::::.:::.:::::::::::.:: .::::::: .. :::
XP_016 VCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTV
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XP_016 MSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFL
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XP_016 MSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFL
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280 290 300 310 320 330
pF1KE9 LLALLNSVVNPIIYSYKDEDMYGTMKKMICCFSQENP-------ERRPSRIPSTVLSRSD
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340 350
pF1KE9 TGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
XP_016 SNDHSVV
360
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10 20 30
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XP_016 STWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVM
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160 170 180 190 200 210
pF1KE9 GAVPTLGWNCLCNISACSSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNV
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XP_016 GAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMR
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pF1KE9 LSPHTSGSISRRRTPMKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFL
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XP_016 MSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 LLALLNSVVNPIIYSYKDEDMYGTMKKMICCFSQENP-------ERRPSRIPSTVLSRSD
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XP_016 LLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVH
300 310 320 330 340 350
340 350
pF1KE9 TGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
XP_016 SNDHSVV
360
>>NP_476500 (OMIM: 602282) lysophosphatidic acid recepto (364 aa)
initn: 984 init1: 984 opt: 1242 Z-score: 1077.4 bits: 207.9 E(85289): 2.9e-53
Smith-Waterman score: 1242; 51.9% identity (80.8% similar) in 339 aa overlap (1-329:19-354)
10 20 30
pF1KE9 MNE--CHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDW-TGTKLVIVLCVGTF
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pF1KE9 FCLFIFFSNSLVIAAVIKNRKFHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTV
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160 170 180 190 200 210
pF1KE9 GAVPTLGWNCLCNISACSSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNV
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NP_476 MSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFL
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NP_476 LLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVH
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pF1KE9 TGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
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360
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10 20 30
pF1KE9 MNE--CHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDW-TGTKLVIVLCVGTF
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40 50 60 70 80 90
pF1KE9 FCLFIFFSNSLVIAAVIKNRKFHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTV
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XP_016 VCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTV
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pF1KE9 NRWFLRQGLLDSSLTASLTNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFM
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pF1KE9 GAVPTLGWNCLCNISACSSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNV
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XP_016 GAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMR
180 190 200 210 220 230
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pF1KE9 LSPHTSGSISRRRTPMKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFL
.: :.:: : : :.:.:::. :::::..:::::::.:::: . : :: : ...::
XP_016 MSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 LLALLNSVVNPIIYSYKDEDMYGTMKKMICCFSQENP-------ERRPSRIPSTVLSRSD
::: .::..:::::::.:..: .:.....:: .::: .: : . :.:.
XP_016 LLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVH
300 310 320 330 340 350
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pF1KE9 TGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
XP_016 SNDHSVV
360
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]