FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6792, 790 aa 1>>>pF1KE6792 790 - 790 aa - 790 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8073+/-0.000511; mu= 13.9453+/- 0.032 mean_var=170.4271+/-32.652, 0's: 0 Z-trim(114.4): 205 B-trim: 123 in 1/50 Lambda= 0.098244 statistics sampled from 23972 (24207) to 23972 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.284), width: 16 Scan time: 11.410 The best scores are: opt bits E(85289) NP_068566 (OMIM: 604779) disintegrin and metallopr ( 790) 5505 793.7 0 NP_003804 (OMIM: 603713) disintegrin and metallopr ( 722) 1927 286.6 2.6e-76 NP_001265056 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1733 259.1 5.4e-68 NP_001265054 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1733 259.1 5.4e-68 XP_011529862 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1733 259.1 5.4e-68 NP_001124176 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1733 259.1 5.4e-68 XP_011529861 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1733 259.1 5.4e-68 NP_001124175 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1733 259.1 5.4e-68 XP_011529858 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1733 259.1 5.4e-68 XP_011529859 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1733 259.1 5.4e-68 NP_055084 (OMIM: 604778) disintegrin and metallopr ( 820) 1733 259.1 5.4e-68 NP_001265055 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1733 259.1 5.4e-68 NP_001124177 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1733 259.1 5.4e-68 XP_011529863 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1733 259.1 5.4e-68 NP_003805 (OMIM: 603712) disintegrin and metallopr ( 776) 1568 235.7 5.7e-61 XP_005268208 (OMIM: 603712) PREDICTED: disintegrin ( 776) 1568 235.7 5.7e-61 XP_011542984 (OMIM: 602713,612775) PREDICTED: disi ( 801) 1457 220.0 3.2e-56 NP_003807 (OMIM: 602713,612775) disintegrin and me ( 819) 1457 220.0 3.2e-56 XP_016869431 (OMIM: 602713,612775) PREDICTED: disi ( 821) 1457 220.0 3.3e-56 NP_001455 (OMIM: 601533) disintegrin and metallopr ( 735) 1189 182.0 8.2e-45 NP_003808 (OMIM: 607310) disintegrin and metallopr ( 754) 1132 173.9 2.3e-42 XP_016869432 (OMIM: 607310) PREDICTED: disintegrin ( 755) 1132 173.9 2.3e-42 XP_011532984 (OMIM: 603640) PREDICTED: disintegrin ( 651) 1029 159.2 5.1e-38 XP_016865498 (OMIM: 603640) PREDICTED: disintegrin ( 651) 1029 159.2 5.1e-38 NP_150377 (OMIM: 603640) disintegrin and metallopr ( 918) 1029 159.4 6.4e-38 XP_005266060 (OMIM: 603640) PREDICTED: disintegrin ( 955) 1029 159.4 6.6e-38 XP_016872195 (OMIM: 602714) PREDICTED: disintegrin ( 520) 993 154.0 1.5e-36 XP_016872194 (OMIM: 602714) PREDICTED: disintegrin ( 753) 993 154.2 1.9e-36 NP_001275902 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 906) 993 154.3 2.2e-36 NP_003465 (OMIM: 602714) disintegrin and metallopr ( 909) 993 154.3 2.2e-36 NP_001275904 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 735) 987 153.3 3.4e-36 NP_001275903 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 737) 987 153.3 3.4e-36 NP_067673 (OMIM: 602714) disintegrin and metallopr ( 738) 987 153.3 3.4e-36 NP_001265042 (OMIM: 601533) disintegrin and metall ( 716) 938 146.4 4.1e-34 XP_011527675 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 492) 928 144.8 8.6e-34 NP_001269376 (OMIM: 607114) disintegrin and metall ( 812) 928 145.0 1.2e-33 XP_011527669 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 812) 928 145.0 1.2e-33 NP_079496 (OMIM: 607114) disintegrin and metallopr ( 813) 928 145.0 1.2e-33 XP_006723703 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 823) 928 145.0 1.2e-33 XP_011527668 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 825) 928 145.0 1.2e-33 XP_006723702 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 825) 928 145.0 1.2e-33 XP_005260900 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 826) 928 145.0 1.2e-33 XP_011542781 (OMIM: 601533) PREDICTED: disintegrin ( 609) 914 142.9 3.9e-33 NP_003803 (OMIM: 603710) disintegrin and metallopr ( 832) 840 132.6 6.9e-30 XP_005246989 (OMIM: 603710) PREDICTED: disintegrin ( 832) 838 132.3 8.4e-30 XP_011510388 (OMIM: 603710) PREDICTED: disintegrin ( 832) 838 132.3 8.4e-30 XP_005273439 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 621) 773 122.9 4.1e-27 XP_011542671 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 673) 773 123.0 4.3e-27 XP_016868465 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 715) 773 123.0 4.5e-27 XP_011542670 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 728) 773 123.0 4.6e-27 >>NP_068566 (OMIM: 604779) disintegrin and metalloprotei (790 aa) initn: 5505 init1: 5505 opt: 5505 Z-score: 4231.2 bits: 793.7 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5505; 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NP_003 MAVDGTLVYIRVTLLLLWLGVFLSISGYCQAGPSQHFTSPEVVIPLKVISRGRSAKAPG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 PVSYLLQLKGKKHVLHLWPKRLLLPRHLRVFSFTEHGELLEDHPYIPKDCNYMGSVKESL .:: :.. :.:::.:. :.::. ::: ::..:. ::::. .:: :: : : :. . NP_003 WLSYSLRFGGQKHVVHMRVKKLLVSRHLPVFTYTDDRALLEDQLFIPDDCYYHGYVEAAP 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE6 DSKATISTCMGGLRGVFNIDAKHYQIEPLKASPSFEHVVYLLKKE--QFGNQVCGLSDDE .: ...:.:.::.:::..:.. :.:::.. : .:::.:: .... :: . :::.. : NP_003 ESLVVFSACFGGFRGVLKISGLTYEIEPIRHSATFEHLVYKINSNETQFPAMRCGLTEKE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 IEWQMAPYENKARLRDFPGS----YKHPKYLELILLFDQSRYRFVNNNLSQVIHDAILLT . :. .:. : : . : .:::... ... . . ..:.:.: .:..:.. NP_003 VARQQLEFEEAENSALEPKSAGDWWTHAWFLELVVVVNHDFFIYSQSNISKVQEDVFLVV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 GIMDTYFQDVRMRIHLKALEVWTDFNKIRVGYPELAEVLGRFVIYKKSVLNARLSSDWAH .:.:...... : : ..:.:.. : . . . .::. : .:. :. .:. : :: NP_003 NIVDSMYKQLGTYIILIGIEIWNQGNVF--PMTSIEQVLNDFSQWKQISLS-QLQHDAAH 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 LYLQRKYNDALAWSF-GKVCSLEYAGSVSTLLDTNILAPATWSAHELGHAVGMSHDEQYC .... . . :. .. . .: .:... . :. ::::::..::.:::..: NP_003 MFIKNSLISILGLAYVAGICRPPIDCGVDNFQGDTWSLFANTVAHELGHTLGMQHDEEFC 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 QCRGRLNCIMGSGRTG---FSNCSYISFFKHISSGATCLNNIPGLG--YVLKRCGNKIVE : :. .:::.. :. :.:::: .:.: . ..::.: : :: ..:::::: .:: NP_003 FC-GERGCIMNTFRVPAEKFTNCSYADFMKTTLNQGSCLHNPPRLGEIFMLKRCGNGVVE 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 DNEECDCGSTEECQKDRCCQSNCKLQPGANCSIGLCCHDCRFRPSGYVCRQEGNECDLAE .:.:::::...:..: :: :: :.::: :..::::.::.: ::: .:::: ::::: : NP_003 REEQCDCGSVQQCEQDACCLLNCTLRPGAACAFGLCCKDCKFMPSGELCRQEVNECDLPE 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 YCDGNSSSCPNDVYKQDGTPCKYEGRCFRKGCRSRYMQCQSIFGPDAMEAPSECYDAVNL .:.:.: .::.: : ::: ::. . :..: : .. ..:. ::: :: : ..:: .: NP_003 WCNGTSHQCPEDRYVQDGIPCSDSAYCYQKRCNNHDQHCREIFGKDAKSASQNCYKEINS 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 IGDQFGNCEITGIRNFKKCESANSICGRLQCINVETIPDLPEHTTIISTHLQAENLMCWG :..::.: :.: .. ::. .. .:::.:: ::. :: : .: :. ::.. .. ::: NP_003 QGNRFGHCGINGT-TYLKCHISDVFCGRVQCENVRDIPLLQDHFTLQHTHIN--GVTCWG 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KE6 TGYHLSMKPMGIPDLGMINDGTSCGEGRVCFKKNCVNSSVLQFDCLPEKCNTRGVCNNRK ::: :. : :.: ..::: :: :..:..:.::. :::. :::: :: .:.:::.. NP_003 IDYHLRMN---ISDIGEVKDGTVCGPGKICIHKKCVSLSVLSHVCLPETCNMKGICNNKH 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE6 NCHCMYGWAPPFCEEVGYGGSIDSGPPGLLRGAIPSSIWVVSIIMFRLILLILSVVFVFF .::: :::.::.:.. :::::::::: . ::.. : . :. . : .:. ..... NP_003 HCHCGYGWSPPYCQHRGYGGSIDSGPASAKRGVFLPLIVIPSLSV--LTFLFTVGLLMYL 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KE6 RQVIGNHLKPKQEKMPLSKAKTEQEESKTKTVQEESKTKTGQEESEAKTGQEESKAKTGQ :: : ::. : NP_003 RQCSG----PKETKAHSSG 710 720 >>NP_001265056 (OMIM: 604778) disintegrin and metallopro (820 aa) initn: 1497 init1: 638 opt: 1733 Z-score: 1341.6 bits: 259.1 E(85289): 5.4e-68 Smith-Waterman score: 1778; 34.1% identity (65.9% similar) in 795 aa overlap (13-790:4-778) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MRSVQIFLSQCRLLLLLVPTMLLKSLGEDVIFHPEGEFDSYEVTIPEKLSFRGEVQGVVS :::: ..:. :. ::. . .:.:: ... : ..:.. 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NP_001 LYRLCKK--SKPIKKQQDVQTPSAKEEEKIQRRPHELPPQSQPWVMPSQSQPPVTPSQSH 700 710 720 730 740 750 770 780 790 pF1KE6 AKTGQEESKANIESKRPKAKSVKKQKK .. .:. . .. . . . .:.. NP_001 PQVMPSQSQPPVTPSQSQPRVMPSQSQPPVMPSQSHPQLTPSQSQPPVTPSQRQPQLMPS 760 770 780 790 800 810 >>XP_011529861 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin and (820 aa) initn: 1497 init1: 638 opt: 1733 Z-score: 1341.6 bits: 259.1 E(85289): 5.4e-68 Smith-Waterman score: 1778; 34.1% identity (65.9% similar) in 795 aa overlap (13-790:4-778) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MRSVQIFLSQCRLLLLLVPTMLLKSLGEDVIFHPEGEFDSYEVTIPEKLSFRGEVQGVVS :::: ..:. :. ::. . .:.:: ... : ..:.. XP_011 MKMLLLLHCLGVFLSCSGHIQDEHPQ-YHSPPDVVIPVRIT--GTTRGMTP 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE6 P--VSYLLQLKGKKHVLHLWPKRLLLPRHLRVFSFTEHGELLEDHPYIPKDCNYMGSVKE : .::.: . :.::..:. :.::. .:: ::..:..: .:::.:.. ..: : : :. 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