Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2123
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2123, 914 aa
  1>>>pF1KE2123 914 - 914 aa - 914 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.4617+/-0.00133; mu= -15.9298+/- 0.080
 mean_var=463.4254+/-95.893, 0's: 0 Z-trim(112.5): 51  B-trim: 138 in 1/50
 Lambda= 0.059578
 statistics sampled from 13188 (13229) to 13188 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.714), E-opt: 0.2 (0.406), width:  16
 Scan time:  4.510

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6959.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9          ( 914) 6057 535.9 1.3e-151
CCDS65173.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9         ( 913) 5641 500.1 7.5e-141
CCDS43897.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9         ( 859) 5624 498.7  2e-140
CCDS65174.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9         ( 885) 4891 435.7 1.9e-121
CCDS65172.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9         ( 902) 4891 435.7 1.9e-121
CCDS72992.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1          ( 768) 1750 165.7 3.1e-40
CCDS1359.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1           ( 803) 1750 165.7 3.2e-40
CCDS4774.1 RGL2 gene_id:5863|Hs108|chr6            ( 777) 1001 101.3 7.5e-21
CCDS54221.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19         ( 716)  989 100.2 1.4e-20
CCDS32910.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19         ( 710)  985 99.9 1.8e-20
CCDS13811.1 RGL4 gene_id:266747|Hs108|chr22        ( 473)  830 86.4 1.3e-16


>>CCDS6959.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9               (914 aa)
 initn: 6057 init1: 6057 opt: 6057  Z-score: 2835.4  bits: 535.9 E(32554): 1.3e-151
Smith-Waterman score: 6057; 100.0% identity (100.0% similar) in 914 aa overlap (1-914:1-914)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MVQRMWAEAAGPAGGAEPLFPGSRRSRSVWDAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MVQRMWAEAAGPAGGAEPLFPGSRRSRSVWDAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 ESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 PYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 AHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 PGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 KGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 KGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 SLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 SLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 ATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 VIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 NTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 EINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 GLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 GLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 EEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLP
              850       860       870       880       890       900

              910    
pF1KE2 RMKQKGLKIAKGIF
       ::::::::::::::
CCDS69 RMKQKGLKIAKGIF
              910    

>>CCDS65173.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9              (913 aa)
 initn: 5628 init1: 5628 opt: 5641  Z-score: 2642.2  bits: 500.1 E(32554): 7.5e-141
Smith-Waterman score: 5641; 95.1% identity (96.6% similar) in 913 aa overlap (7-914:2-913)

               10        20        30        40          50        
pF1KE2 MVQRMWAEAAGPAGGAEPLFPGSRRSRSVWDAVRLEVGVPDSCP--VVLHSFTQLDPDLP
             :. :: .  :.:  : .:..   .  : . ..   .    ..:.: :     ::
CCDS65      MAREAGQVC-ARPAVPRGRKGSVFFACVSVVTARRRAVARRAALQSPTPWLAPLP
                     10        20        30        40        50    

       60           70        80        90       100       110     
pF1KE2 RP---ESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRT
        :   :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 APATTESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRT
           60        70        80        90       100       110    

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE2 VKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSR
          120       130       140       150       160       170    

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE2 YGCILPYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 YGCILPYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGS
          180       190       200       210       220       230    

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE2 DLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 DLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEP
          240       250       260       270       280       290    

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE2 APTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 APTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAP
          300       310       320       330       340       350    

         360       370       380       390       400       410     
pF1KE2 APVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 APVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIW
          360       370       380       390       400       410    

         420       430       440       450       460       470     
pF1KE2 SQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRI
          420       430       440       450       460       470    

         480       490       500       510       520       530     
pF1KE2 LKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKE
          480       490       500       510       520       530    

         540       550       560       570       580       590     
pF1KE2 GTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKR
          540       550       560       570       580       590    

         600       610       620       630       640       650     
pF1KE2 RKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 RKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNT
          600       610       620       630       640       650    

         660       670       680       690       700       710     
pF1KE2 LRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSS
          660       670       680       690       700       710    

         720       730       740       750       760       770     
pF1KE2 SSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTH
          720       730       740       750       760       770    

         780       790       800       810       820       830     
pF1KE2 KRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDK
          780       790       800       810       820       830    

         840       850       860       870       880       890     
pF1KE2 HNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 HNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGA
          840       850       860       870       880       890    

         900       910    
pF1KE2 SSTLPRMKQKGLKIAKGIF
       :::::::::::::::::::
CCDS65 SSTLPRMKQKGLKIAKGIF
          900       910   

>>CCDS43897.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9              (859 aa)
 initn: 5624 init1: 5624 opt: 5624  Z-score: 2634.7  bits: 498.7 E(32554): 2e-140
Smith-Waterman score: 5624; 99.9% identity (100.0% similar) in 854 aa overlap (61-914:6-859)

               40        50        60        70        80        90
pF1KE2 DAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRPESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGG
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43                          MMVDCQSSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGG
                                        10        20        30     

              100       110       120       130       140       150
pF1KE2 NKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAF
          40        50        60        70        80        90     

              160       170       180       190       200       210
pF1KE2 TTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCILPYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCILPYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSE
         100       110       120       130       140       150     

              220       230       240       250       260       270
pF1KE2 DFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPT
         160       170       180       190       200       210     

              280       290       300       310       320       330
pF1KE2 PELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPA
         220       230       240       250       260       270     

              340       350       360       370       380       390
pF1KE2 PALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLV
         280       290       300       310       320       330     

              400       410       420       430       440       450
pF1KE2 AEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLG
         340       350       360       370       380       390     

              460       470       480       490       500       510
pF1KE2 NRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFR
         400       410       420       430       440       450     

              520       530       540       550       560       570
pF1KE2 IFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTF
         460       470       480       490       500       510     

              580       590       600       610       620       630
pF1KE2 LTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAV
         520       530       540       550       560       570     

              640       650       660       670       680       690
pF1KE2 ERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCD
         580       590       600       610       620       630     

              700       710       720       730       740       750
pF1KE2 QLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETS
         640       650       660       670       680       690     

              760       770       780       790       800       810
pF1KE2 GISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDN
         700       710       720       730       740       750     

              820       830       840       850       860       870
pF1KE2 GNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAM
         760       770       780       790       800       810     

              880       890       900       910    
pF1KE2 NSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF
         820       830       840       850         

>>CCDS65174.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9              (885 aa)
 initn: 4891 init1: 4891 opt: 4891  Z-score: 2294.0  bits: 435.7 E(32554): 1.9e-121
Smith-Waterman score: 5521; 97.0% identity (97.6% similar) in 873 aa overlap (43-914:26-885)

             20        30        40        50         60        70 
pF1KE2 AGGAEPLFPGSRRSRSVWDAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDP-DLPRPESSTQEIGEEL
                                     : . :.  :   : ..:: .::::::::::
CCDS65      MCLWGHSTAPAHTLSSPPLLFCSLPCALHLQPGTGHPPGQVPR-KSSTQEIGEEL
                    10        20        30        40         50    

              80        90       100       110       120       130 
pF1KE2 INGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 INGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPA
           60        70        80        90       100       110    

             140       150       160       170       180       190 
pF1KE2 FQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCILPYSDEDGGPQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::            ::::::::::::::
CCDS65 FQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYG------------CILPYSDEDGGPQD
          120       130       140                   150       160  

             200       210       220       230       240       250 
pF1KE2 QLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHS
            170       180       190       200       210       220  

             260       270       280       290       300       310 
pF1KE2 EPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAP
            230       240       250       260       270       280  

             320       330       340       350       360       370 
pF1KE2 APELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 APELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVA
            290       300       310       320       330       340  

             380       390       400       410       420       430 
pF1KE2 ENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIR
            350       360       370       380       390       400  

             440       450       460       470       480       490 
pF1KE2 ATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQS
            410       420       430       440       450       460  

             500       510       520       530       540       550 
pF1KE2 NSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 NSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQ
            470       480       490       500       510       520  

             560       570       580       590       600       610 
pF1KE2 KRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSA
            530       540       550       560       570       580  

             620       630       640       650       660       670 
pF1KE2 CNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 CNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDR
            590       600       610       620       630       640  

             680       690       700       710       720       730 
pF1KE2 QAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESP
            650       660       670       680       690       700  

             740       750       760       770       780       790 
pF1KE2 DGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 DGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPL
            710       720       730       740       750       760  

             800       810       820       830       840       850 
pF1KE2 YNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 YNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQI
            770       780       790       800       810       820  

             860       870       880       890       900       910 
pF1KE2 LSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAK
            830       840       850       860       870       880  

          
pF1KE2 GIF
       :::
CCDS65 GIF
          

>>CCDS65172.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9              (902 aa)
 initn: 4891 init1: 4891 opt: 4891  Z-score: 2293.9  bits: 435.7 E(32554): 1.9e-121
Smith-Waterman score: 5942; 98.7% identity (98.7% similar) in 914 aa overlap (1-914:1-902)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MVQRMWAEAAGPAGGAEPLFPGSRRSRSVWDAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MVQRMWAEAAGPAGGAEPLFPGSRRSRSVWDAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 ESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCIL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::            :::
CCDS65 LEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYG------------CIL
              130       140       150       160                    

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 PYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERR
      170       180       190       200       210       220        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 AHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 AHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPA
      230       240       250       260       270       280        

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 PGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPS
      290       300       310       320       330       340        

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDK
      350       360       370       380       390       400        

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 KGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFS
      410       420       430       440       450       460        

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 SLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKF
      470       480       490       500       510       520        

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 ATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFE
      530       540       550       560       570       580        

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 VIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKK
      590       600       610       620       630       640        

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 NTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 NTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVE
      650       660       670       680       690       700        

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 EINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVS
      710       720       730       740       750       760        

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 GLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEE
      770       780       790       800       810       820        

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 EEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLP
      830       840       850       860       870       880        

              910    
pF1KE2 RMKQKGLKIAKGIF
       ::::::::::::::
CCDS65 RMKQKGLKIAKGIF
      890       900  

>>CCDS72992.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1               (768 aa)
 initn: 1881 init1: 751 opt: 1750  Z-score: 835.8  bits: 165.7 E(32554): 3.1e-40
Smith-Waterman score: 2153; 45.0% identity (68.0% similar) in 871 aa overlap (62-906:10-757)

              40        50        60        70        80        90 
pF1KE2 AVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRPESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGN
                                     :: :. :::. .:..: ..:..::.....:
CCDS72                      MKLLWQAKMSSIQDWGEEVEEGAVYHVTLKRVQIQQAAN
                                    10        20        30         

             100            110       120       130       140      
pF1KE2 KGQRWLGYENES-----ALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCT
       :: :::: :...     ... :::::.::.::::::::::.:. ::  .:..:..::: :
CCDS72 KGARWLGVEGDQLPPGHTVSQYETCKIRTIKAGTLEKLVENLLTAFGDNDFTYISIFLST
      40        50        60        70        80        90         

        150       160       170       180       190            200 
pF1KE2 YRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCILPYSDEDGGPQDQ-----LKNAISSIL
       ::.:..:..::.::. :::    ::.        :  .:::. ...     ..:::.:::
CCDS72 YRGFASTKEVLELLLDRYGN---LTS--------PNCEEDGSQSSSESKMVIRNAIASIL
     100       110          120               130       140        

             210       220       230       240       250       260 
pF1KE2 GTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEAL
        .:::: .::: .:: ::::..:. :.   ::::: ::::. :: :....: .:..    
CCDS72 RAWLDQCAEDFREPPHFPCLQKLLDYLTRMMPGSDPERRAQNLLEQFQKQE-VETDN---
      150       160       170       180       190        200       

             270       280       290       300       310       320 
pF1KE2 SPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEP
                                                                   
CCDS72 ------------------------------------------------------------
                                                                   

             330       340       350       360       370       380 
pF1KE2 AVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPH
         :: .. . .:: :             :::                    .: : :   
CCDS72 --GLPNTISFSLEEEE------------ELE--------------------GGESAE---
            210                   220                              

             390       400       410       420       430       440 
pF1KE2 LLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVA
       .  :  ::::::.: :::.:::::::.:::: :::.:::: ..:::::::::..:::...
CCDS72 FTCFSEDLVAEQLTYMDAQLFKKVVPHHCLGCIWSRRDKKENKHLAPTIRATISQFNTLT
       230       240       250       260       270       280       

             450       460       470       480       490       500 
pF1KE2 NCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTW
       .::..: ::..  :. .::...:.::..:.:::.::::::: ::.::::::::.::::::
CCDS72 KCVVSTILGGKELKTQQRAKIIEKWINIAHECRLLKNFSSLRAIVSALQSNSIYRLKKTW
       290       300       310       320       330       340       

             510       520       530       540           550       
pF1KE2 EDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEM----NPKRAQKR---P
         : :: . .:..::.::::.::.  :::::.::::::::.:.     : ::.:.:    
CCDS72 AAVPRDRMLMFEELSDIFSDHNNHLTSRELLMKEGTSKFANLDSSVKENQKRTQRRLQLQ
       350       360       370       380       390       400       

          560       570       580       590       600       610    
pF1KE2 KETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNN
       :. :..::::::::::::::.:::::..::. : ::::::::.::::::::::::::::.
CCDS72 KDMGVMQGTVPYLGTFLTDLTMLDTALQDYIEGGLINFEKRRREFEVIAQIKLLQSACNS
       410       420       430       440       450       460       

          620       630       640       650       660       670    
pF1KE2 YSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAP
       : ..::..:  ::.  . :.: ::: ::::.:  ....... . .:.  .::: :     
CCDS72 YCMTPDQKFIQWFQRQQLLTEEESYALSCEIEAAADASTTSPKPRKS--MVKRLSLLFLG
       470       480       490       500       510         520     

          680       690       700       710       720       730    
pF1KE2 STELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQ
       :  ..    : . . .: .     :::.  :..:: :  :. :..:: .:. . ..::  
CCDS72 SDMIT----SPTPTKEQPKSTASGSSGESMDSVSVSSCESNHSEAEEGSITPM-DTPDEP
         530           540       550       560       570        580

          740             750       760        770       780       
pF1KE2 EKKFWESASQSSP------ETSGISSASSSTSSS-SASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSS
       .::. ::.:. :       ..::.::  .  ::  : ...:    . ::::::    .:.
CCDS72 QKKLSESSSSCSSIHSMDTNSSGMSSLINPLSSPPSCNNNP----KIHKRSVSVTSITST
              590       600       610       620           630      

       790        800       810       820       830       840      
pF1KE2 ALP-LYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDY
       .:: .::::  : ::::.:.. .::::::::..:::::.::::..:: ::::. .  :.:
CCDS72 VLPPVYNQQNEDTCIIRISVEDNNGNMYKSIMLTSQDKTPAVIQRAMLKHNLDSDPAEEY
        640       650       660       670       680       690      

        850       860       870       880        890       900     
pF1KE2 ELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR-TFTKGVKVKHGASSTLPRMKQK
       ::.:..:.:..: ::..::::::::: .:.::.:.:. .. . ::..  .: ::::  ..
CCDS72 ELVQVISEDKELVIPDSANVFYAMNSQVNFDFILRKKNSMEEQVKLRSRTSLTLPRTAKR
        700       710       720       730       740       750      

         910       
pF1KE2 GLKIAKGIF   
       :           
CCDS72 GCWSNRHSKITL
        760        

>>CCDS1359.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1                (803 aa)
 initn: 1749 init1: 751 opt: 1750  Z-score: 835.5  bits: 165.7 E(32554): 3.2e-40
Smith-Waterman score: 2161; 45.0% identity (67.8% similar) in 876 aa overlap (57-906:40-792)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KE2 RSVWDAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRPESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQL
                                     :   ::: :. :::. .:..: ..:..::.
CCDS13 TQEVSKFKLSTKVESTGHWLVEDHVRIWEVLKTEESSIQDWGEEVEEGAVYHVTLKRVQI
      10        20        30        40        50        60         

         90       100            110       120       130       140 
pF1KE2 HHGGNKGQRWLGYENES-----ALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVT
       ....::: :::: :...     ... :::::.::.::::::::::.:. ::  .:..:..
CCDS13 QQAANKGARWLGVEGDQLPPGHTVSQYETCKIRTIKAGTLEKLVENLLTAFGDNDFTYIS
      70        80        90       100       110       120         

             150       160       170       180       190           
pF1KE2 IFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCILPYSDEDGGPQDQ-----LKNA
       ::: :::.:..:..::.::. :::    ::.        :  .:::. ...     ..::
CCDS13 IFLSTYRGFASTKEVLELLLDRYGN---LTS--------PNCEEDGSQSSSESKMVIRNA
     130       140       150                  160       170        

        200       210       220       230       240       250      
pF1KE2 ISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEA
       :.::: .:::: .::: .:: ::::..:. :.   ::::: ::::. :: :....: .:.
CCDS13 IASILRAWLDQCAEDFREPPHFPCLQKLLDYLTRMMPGSDPERRAQNLLEQFQKQE-VET
      180       190       200       210       220       230        

        260       270       280       290       300       310      
pF1KE2 EPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQ
       .                                                           
CCDS13 DN----------------------------------------------------------
                                                                   

        320       330       340       350       360       370      
pF1KE2 QAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLS
              :: .. . .:: :             :::                    .: :
CCDS13 -------GLPNTISFSLEEEE------------ELE--------------------GGES
            240       250                                       260

        380       390       400       410       420       430      
pF1KE2 EEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQ
        :   .  :  ::::::.: :::.:::::::.:::: :::.:::: ..:::::::::..:
CCDS13 AE---FTCFSEDLVAEQLTYMDAQLFKKVVPHHCLGCIWSRRDKKENKHLAPTIRATISQ
                 270       280       290       300       310       

        440       450       460       470       480       490      
pF1KE2 FNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHR
       ::....::..: ::..  :. .::...:.::..:.:::.::::::: ::.::::::::.:
CCDS13 FNTLTKCVVSTILGGKELKTQQRAKIIEKWINIAHECRLLKNFSSLRAIVSALQSNSIYR
       320       330       340       350       360       370       

        500       510       520       530       540           550  
pF1KE2 LKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEM----NPKRAQK
       :::::  : :: . .:..::.::::.::.  :::::.::::::::.:.     : ::.:.
CCDS13 LKKTWAAVPRDRMLMFEELSDIFSDHNNHLTSRELLMKEGTSKFANLDSSVKENQKRTQR
       380       390       400       410       420       430       

               560       570       580       590       600         
pF1KE2 R---PKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQ
       :    :. :..::::::::::::::.:::::..::. : ::::::::.::::::::::::
CCDS13 RLQLQKDMGVMQGTVPYLGTFLTDLTMLDTALQDYIEGGLINFEKRRREFEVIAQIKLLQ
       440       450       460       470       480       490       

     610       620       630       640       650       660         
pF1KE2 SACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWS
       ::::.: ..::..:  ::.  . :.: ::: ::::.:  ....... . .:  ..::: :
CCDS13 SACNSYCMTPDQKFIQWFQRQQLLTEEESYALSCEIEAAADASTTSPKPRK--SMVKRLS
       500       510       520       530       540         550     

     670       680       690       700       710       720         
pF1KE2 DRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPE
            :  ..    : . . .: .     :::.  :..:: :  :. :..:: .:. . .
CCDS13 LLFLGSDMIT----SPTPTKEQPKSTASGSSGESMDSVSVSSCESNHSEAEEGSITPM-D
         560           570       580       590       600        610

     730       740             750       760        770       780  
pF1KE2 SPDGQEKKFWESASQSSP------ETSGISSASSSTSSS-SASTTPVAATRTHKRSVSGL
       .::  .::. ::.:. :       ..::.::  .  ::  : ...:    . ::::::  
CCDS13 TPDEPQKKLSESSSSCSSIHSMDTNSSGMSSLINPLSSPPSCNNNP----KIHKRSVSVT
              620       630       640       650           660      

            790        800       810       820       830       840 
pF1KE2 CNSSSALP-LYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEE
         .:..:: .::::  : ::::.:.. .::::::::..:::::.::::..:: ::::. .
CCDS13 SITSTVLPPVYNQQNEDTCIIRISVEDNNGNMYKSIMLTSQDKTPAVIQRAMLKHNLDSD
        670       680       690       700       710       720      

             850       860       870       880        890       900
pF1KE2 EPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR-TFTKGVKVKHGASSTLP
         :.:::.:..:.:..: ::..::::::::: .:.::.:.:. .. . ::..  .: :::
CCDS13 PAEEYELVQVISEDKELVIPDSANVFYAMNSQVNFDFILRKKNSMEEQVKLRSRTSLTLP
        730       740       750       760       770       780      

              910       
pF1KE2 RMKQKGLKIAKGIF   
       :  ..:           
CCDS13 RTAKRGCWSNRHSKITL
        790       800   

>>CCDS4774.1 RGL2 gene_id:5863|Hs108|chr6                 (777 aa)
 initn: 1296 init1: 353 opt: 1001  Z-score: 487.8  bits: 101.3 E(32554): 7.5e-21
Smith-Waterman score: 1267; 39.0% identity (67.2% similar) in 589 aa overlap (363-914:220-777)

            340       350       360       370       380       390  
pF1KE2 LELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAE
                                     :. :.:..  .    .   .:::  : .::
CCDS47 LQTGYAAGKGVGGGSADLIRNLRSRVDPQAPDLPKPLALPGDPPADPTDVLVFLADHLAE
     190       200       210       220       230       240         

            400       410       420       430       440       450  
pF1KE2 QFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNR
       :.::.::::: ...: .:::..:..::. :. :: :..::::::::.::. :... ::  
CCDS47 QLTLLDAELFLNLIPSQCLGGLWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGAVVSSVLGAT
     250       260       270       280       290       300         

                        460       470       480       490       500
pF1KE2 ST------------KAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKT
       ::            . :.:::..:.::.::.:::.:.::::.::..:::::. ::::. .
CCDS47 STGEGPGEVTIRPLRPPQRARLLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQSSPIHRLRAA
     310       320       330       340       350       360         

              510       520       530       540       550       560
pF1KE2 WEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGII
       : ...:::.:.:..: .:::.:.::: :::::..:   . . :: . :.: .  .. :  
CCDS47 WGEATRDSLRVFSSLCQIFSEEDNYSQSRELLVQEVKLQ-SPLEPHSKKAPRSGSRGG--
     370       380       390       400        410       420        

              570       580       590       600       610       620
pF1KE2 QGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPD
        :.:::::::: ::::::.: :: : .  :::.:::::: :..... ::. : .:.. ::
CCDS47 -GVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDELENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPD
         430       440       450       460       470       480     

              630       640       650       660       670       680
pF1KE2 EQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELST
       ...  :..... :.:..:. .:::.:::. :   . :. . : ....:..  .     :.
CCDS47 HDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLG-----SV
         490       500       510       520       530            540

              690       700       710       720       730       740
pF1KE2 SGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWE
       .  .   :::.   :     :: : .  .      .. ..  ..: .            .
CCDS47 GVPTPLVSCDRPSTG-----GDEAPTTPAPLLTRLAQHMKWPSVSSL------------D
              550            560       570       580               

              750       760       770             780       790    
pF1KE2 SASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRS------VSGLCNSSSALPLYNQ
       :: .:::   .. : .. .  :  ...:   .: :.::      .::  . .:.   :. 
CCDS47 SALESSP---SLHSPADPSHLSPPASSP-RPSRGHRRSASCGSPLSGGAEEASGGTGYGG
           590          600        610       620       630         

               800        810       820       830       840        
pF1KE2 Q-----VGDCCIIRVSLDV-DNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYEL
       .     ..:: ::::.... ..:..:::::::::::::.:: ... :.: .     .:::
CCDS47 EGSGPGASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKKNNRDSAVASEYEL
     640       650       660       670       680       690         

      850       860       870       880           890              
pF1KE2 LQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR----TFTKGVKVKHGASST------
       .:.:  .:.: :: .:::::::.. :..::.:..:    : : ::    .::.:      
CCDS47 VQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDFLLRQRRRSSTATPGVTSGPSASGTPPSEGG
     700       710       720        730       740       750        

         900       910    
pF1KE2 ---LPRMKQKGLKIAKGIF
          .::.:  : :::...:
CCDS47 GGSFPRIKATGRKIARALF
      760       770       

>>CCDS54221.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19              (716 aa)
 initn: 1551 init1: 617 opt: 989  Z-score: 482.7  bits: 100.2 E(32554): 1.4e-20
Smith-Waterman score: 1362; 36.6% identity (58.1% similar) in 829 aa overlap (65-887:15-708)

           40        50        60        70        80        90    
pF1KE2 LEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRPESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQ
                                     :. :::  .:..::.:::. :  .  . ..
CCDS54                 MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRR-QRSQRRSPAE
                               10        20        30         40   

          100           110       120       130       140       150
pF1KE2 RWLGYENESAL-NL---YETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAF
          : .  : . :    :.: :::...:. ::.:: .:: . . .: :..  :: :::.:
CCDS54 GPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQDPSFMPAFLATYRTF
            50        60        70        80        90       100   

              160       170        180       190       200         
pF1KE2 TTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGC-ILPYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYS
       . :  .: .:.        .      :  :   . .: . . .:. :. :.::.::... 
CCDS54 VPTACLLGFLLP------PMPPPPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLR-AVVSVLGSWLQDHP
           110             120       130       140        150      

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE2 EDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKP
       .:: . :    : .. ...    :::   ..:. :: .. .    ::: :          
CCDS54 QDFRDHPAHSDLGSVRTFLGWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLE----EAEREQ---------
        160       170       180       190           200            

     270       280       290       300       310       320         
pF1KE2 TPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAP
                             : ::                 :..  .: : :      
CCDS54 ----------------------EEEP-----------------PQVWTGP-PRV------
                                                  210              

     330       340       350       360       370       380         
pF1KE2 APALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDL
               :  .::  :..   :                   :.::  . :.:: :  : 
CCDS54 --------AQTSDPDSSEACAEE-------------------EEGLMPQGPQLLDFSVDE
               220       230                          240       250

     390       400       410       420       430       440         
pF1KE2 VAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCL
       ::::.::.: :::.::  :.::::.:::::. :    .::.::::.:::.:..::. . :
CCDS54 VAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGCVLGSVL
              260       270       280       290       300       310

     450       460       470       480       490       500         
pF1KE2 GNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSF
       :  .  ::.::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.:::..:  :::. .
CCDS54 GAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGAVSREPL
              320       330       340       350       360       370

     510       520       530       540        550       560        
pF1KE2 RIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMN-PKRAQKRPKETGIIQGTVPYLG
         :.:::.:::::::.  :::.:..: ... .  : : :    ..:       : :::::
CCDS54 STFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPP-----GPVPYLG
              380       390       400       410            420     

      570       580       590       600       610       620        
pF1KE2 TFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFR
       ::::::::::::. :.: : ::::::::::.:..:.:. ::  :..:...:   . : ..
CCDS54 TFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPILAALH
         430       440       450       460       470       480     

      630       640       650       660       670       680        
pF1KE2 AVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKS
       : ..:.: .:: ::  .:::. :  .. : ..  ...:: : . :     : :::     
CCDS54 AQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSPSGS-----
         490       500       510       520       530       540     

      690       700       710       720       730       740        
pF1KE2 CDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPE
              :    ::           :: ..   :. :  : :: .. .      :...: 
CCDS54 -------P----GD----------PSSPTSSLCISPSVSPGSPPSSPR------SRDAP-
                                   550       560             570   

      750       760       770       780       790       800        
pF1KE2 TSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDV
        .:   :: . .. : .  :..      :  . :  .:  .::  :: ..  .::::.: 
CCDS54 -AGSPPASPGPQGPS-TKLPLSLDLPSPRPFA-LPLGSPRIPLPAQQSSEARVIRVSIDN
             580        590       600        610       620         

      810       820       830       840       850       860        
pF1KE2 DNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFY
       :.::.:.:::.:::::::.:.:.:..:::. .    ::.:.:.:  :: : ::.::::::
CCDS54 DHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFY
     630       640       650       660       670       680         

      870       880       890       900       910    
pF1KE2 AMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF
       ::. .:  ::.:...  :.                           
CCDS54 AMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS                   
     690       700       710                         

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           40        50        60        70        80        90    
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                                     :. :::  .:..::.:::. :  .  . ..
CCDS32                 MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRR-QRSQRRSPAE
                               10        20        30         40   

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pF1KE2 RWLGYENESAL-NL---YETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAF
          : .  : . :    :.: :::...:. ::.:: .:: . . .: :..  :: :::.:
CCDS32 GPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQDPSFMPAFLATYRTF
            50        60        70        80        90       100   

              160       170        180       190       200         
pF1KE2 TTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGC-ILPYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYS
       . :  .: .:.        .      :  :   . .: . . .:. :. :.::.::... 
CCDS32 VPTACLLGFLLP------PMPPPPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLR-AVVSVLGSWLQDHP
           110             120       130       140        150      

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE2 EDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKP
       .:: . :    : .. ...    :::   ..:. :: .. .    ::: :          
CCDS32 QDFRDHPAHSDLGSVRTFLGWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLE----EAEREQ---------
        160       170       180       190           200            

     270       280       290       300       310       320         
pF1KE2 TPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAP
                             : ::                 :..  .: : :      
CCDS32 ----------------------EEEP-----------------PQVWTGP-PRV------
                                                  210              

     330       340       350       360       370       380         
pF1KE2 APALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDL
               :  .::  :..   :                   :.::  . :.:: :  : 
CCDS32 --------AQTSDPDSSEACAEE-------------------EEGLMPQGPQLLDFSVDE
               220       230                          240       250

     390       400       410       420       430       440         
pF1KE2 VAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCL
       ::::.::.: :::.::  :.::::.:::::. :    .::.::::.:::.:..::. . :
CCDS32 VAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGCVLGSVL
              260       270       280       290       300       310

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pF1KE2 GNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSF
       :  .  ::.::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.:::..:  :::. .
CCDS32 GAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGAVSREPL
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pF1KE2 RIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMN-PKRAQKRPKETGIIQGTVPYLG
         :.:::.:::::::.  :::.:..: ... .  : : :    ..:       : :::::
CCDS32 STFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPP-----GPVPYLG
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pF1KE2 TFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFR
       ::::::::::::. :.: : ::::::::::.:..:.:. ::  :..:...:   . : ..
CCDS32 TFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPILAALH
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      630       640       650       660       670       680        
pF1KE2 AVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKS
       : ..:.: .:: ::  .:::. :  .. : ..  ...:: : . :     : :::     
CCDS32 AQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSPSGS-----
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      690       700       710       720       730       740        
pF1KE2 CDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPE
              :    :: ..  :  : ::             : :: ...     . . : : 
CCDS32 -------P----GDPSSPTSSVSPGSP------------PSSPRSRD-----APAGSPPA
                         550                   560            570  

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pF1KE2 TSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDV
       . : .. :..   :    .:        :  . :  .:  .::  :: ..  .::::.: 
CCDS32 SPGPQGPSTKLPLSLDLPSP--------RPFA-LPLGSPRIPLPAQQSSEARVIRVSIDN
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       :.::.:.:::.:::::::.:.:.:..:::. .    ::.:.:.:  :: : ::.::::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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