FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2123, 914 aa 1>>>pF1KE2123 914 - 914 aa - 914 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.4617+/-0.00133; mu= -15.9298+/- 0.080 mean_var=463.4254+/-95.893, 0's: 0 Z-trim(112.5): 51 B-trim: 138 in 1/50 Lambda= 0.059578 statistics sampled from 13188 (13229) to 13188 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.714), E-opt: 0.2 (0.406), width: 16 Scan time: 4.510 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6959.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 914) 6057 535.9 1.3e-151 CCDS65173.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 913) 5641 500.1 7.5e-141 CCDS43897.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 859) 5624 498.7 2e-140 CCDS65174.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 885) 4891 435.7 1.9e-121 CCDS65172.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 902) 4891 435.7 1.9e-121 CCDS72992.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 ( 768) 1750 165.7 3.1e-40 CCDS1359.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 ( 803) 1750 165.7 3.2e-40 CCDS4774.1 RGL2 gene_id:5863|Hs108|chr6 ( 777) 1001 101.3 7.5e-21 CCDS54221.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 ( 716) 989 100.2 1.4e-20 CCDS32910.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 ( 710) 985 99.9 1.8e-20 CCDS13811.1 RGL4 gene_id:266747|Hs108|chr22 ( 473) 830 86.4 1.3e-16 >>CCDS6959.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 (914 aa) initn: 6057 init1: 6057 opt: 6057 Z-score: 2835.4 bits: 535.9 E(32554): 1.3e-151 Smith-Waterman score: 6057; 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45.0% identity (68.0% similar) in 871 aa overlap (62-906:10-757) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 AVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRPESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGN :: :. :::. .:..: ..:..::.....: CCDS72 MKLLWQAKMSSIQDWGEEVEEGAVYHVTLKRVQIQQAAN 10 20 30 100 110 120 130 140 pF1KE2 KGQRWLGYENES-----ALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCT :: :::: :... ... :::::.::.::::::::::.:. :: .:..:..::: : CCDS72 KGARWLGVEGDQLPPGHTVSQYETCKIRTIKAGTLEKLVENLLTAFGDNDFTYISIFLST 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 YRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCILPYSDEDGGPQDQ-----LKNAISSIL ::.:..:..::.::. ::: ::. : .:::. ... ..:::.::: CCDS72 YRGFASTKEVLELLLDRYGN---LTS--------PNCEEDGSQSSSESKMVIRNAIASIL 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 GTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEAL .:::: .::: .:: ::::..:. :. ::::: ::::. :: :....: .:.. CCDS72 RAWLDQCAEDFREPPHFPCLQKLLDYLTRMMPGSDPERRAQNLLEQFQKQE-VETDN--- 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 SPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEP CCDS72 ------------------------------------------------------------ 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 AVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPH :: .. . .:: : ::: .: : : CCDS72 --GLPNTISFSLEEEE------------ELE--------------------GGESAE--- 210 220 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 LLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVA . : ::::::.: :::.:::::::.:::: :::.:::: ..:::::::::..:::... CCDS72 FTCFSEDLVAEQLTYMDAQLFKKVVPHHCLGCIWSRRDKKENKHLAPTIRATISQFNTLT 230 240 250 260 270 280 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 NCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTW .::..: ::.. :. .::...:.::..:.:::.::::::: ::.::::::::.:::::: CCDS72 KCVVSTILGGKELKTQQRAKIIEKWINIAHECRLLKNFSSLRAIVSALQSNSIYRLKKTW 290 300 310 320 330 340 510 520 530 540 550 pF1KE2 EDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEM----NPKRAQKR---P : :: . .:..::.::::.::. :::::.::::::::.:. : ::.:.: CCDS72 AAVPRDRMLMFEELSDIFSDHNNHLTSRELLMKEGTSKFANLDSSVKENQKRTQRRLQLQ 350 360 370 380 390 400 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 KETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNN :. :..::::::::::::::.:::::..::. : ::::::::.::::::::::::::::. CCDS72 KDMGVMQGTVPYLGTFLTDLTMLDTALQDYIEGGLINFEKRRREFEVIAQIKLLQSACNS 410 420 430 440 450 460 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 YSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAP : ..::..: ::. . :.: ::: ::::.: ....... . .:. .::: : CCDS72 YCMTPDQKFIQWFQRQQLLTEEESYALSCEIEAAADASTTSPKPRKS--MVKRLSLLFLG 470 480 490 500 510 520 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 STELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQ : .. : . . .: . :::. :..:: : :. :..:: .:. . ..:: CCDS72 SDMIT----SPTPTKEQPKSTASGSSGESMDSVSVSSCESNHSEAEEGSITPM-DTPDEP 530 540 550 560 570 580 740 750 760 770 780 pF1KE2 EKKFWESASQSSP------ETSGISSASSSTSSS-SASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSS .::. ::.:. : ..::.:: . :: : ...: . :::::: .:. CCDS72 QKKLSESSSSCSSIHSMDTNSSGMSSLINPLSSPPSCNNNP----KIHKRSVSVTSITST 590 600 610 620 630 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 ALP-LYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDY .:: .:::: : ::::.:.. .::::::::..:::::.::::..:: ::::. . :.: CCDS72 VLPPVYNQQNEDTCIIRISVEDNNGNMYKSIMLTSQDKTPAVIQRAMLKHNLDSDPAEEY 640 650 660 670 680 690 850 860 870 880 890 900 pF1KE2 ELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR-TFTKGVKVKHGASSTLPRMKQK ::.:..:.:..: ::..::::::::: .:.::.:.:. .. . ::.. .: :::: .. CCDS72 ELVQVISEDKELVIPDSANVFYAMNSQVNFDFILRKKNSMEEQVKLRSRTSLTLPRTAKR 700 710 720 730 740 750 910 pF1KE2 GLKIAKGIF : CCDS72 GCWSNRHSKITL 760 >>CCDS1359.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 (803 aa) initn: 1749 init1: 751 opt: 1750 Z-score: 835.5 bits: 165.7 E(32554): 3.2e-40 Smith-Waterman score: 2161; 45.0% identity (67.8% similar) in 876 aa overlap (57-906:40-792) 30 40 50 60 70 80 pF1KE2 RSVWDAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRPESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQL : ::: :. :::. .:..: ..:..::. CCDS13 TQEVSKFKLSTKVESTGHWLVEDHVRIWEVLKTEESSIQDWGEEVEEGAVYHVTLKRVQI 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 HHGGNKGQRWLGYENES-----ALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVT ....::: :::: :... ... :::::.::.::::::::::.:. :: .:..:.. CCDS13 QQAANKGARWLGVEGDQLPPGHTVSQYETCKIRTIKAGTLEKLVENLLTAFGDNDFTYIS 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 pF1KE2 IFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCILPYSDEDGGPQDQ-----LKNA ::: :::.:..:..::.::. ::: ::. : .:::. ... ..:: CCDS13 IFLSTYRGFASTKEVLELLLDRYGN---LTS--------PNCEEDGSQSSSESKMVIRNA 130 140 150 160 170 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 ISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEA :.::: .:::: .::: .:: ::::..:. :. ::::: ::::. :: :....: .:. CCDS13 IASILRAWLDQCAEDFREPPHFPCLQKLLDYLTRMMPGSDPERRAQNLLEQFQKQE-VET 180 190 200 210 220 230 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 EPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQ . CCDS13 DN---------------------------------------------------------- 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 QAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLS :: .. . .:: : ::: .: : CCDS13 -------GLPNTISFSLEEEE------------ELE--------------------GGES 240 250 260 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 EEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQ : . : ::::::.: :::.:::::::.:::: :::.:::: ..:::::::::..: CCDS13 AE---FTCFSEDLVAEQLTYMDAQLFKKVVPHHCLGCIWSRRDKKENKHLAPTIRATISQ 270 280 290 300 310 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 FNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHR ::....::..: ::.. :. .::...:.::..:.:::.::::::: ::.::::::::.: CCDS13 FNTLTKCVVSTILGGKELKTQQRAKIIEKWINIAHECRLLKNFSSLRAIVSALQSNSIYR 320 330 340 350 360 370 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 LKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEM----NPKRAQK ::::: : :: . .:..::.::::.::. :::::.::::::::.:. : ::.:. CCDS13 LKKTWAAVPRDRMLMFEELSDIFSDHNNHLTSRELLMKEGTSKFANLDSSVKENQKRTQR 380 390 400 410 420 430 560 570 580 590 600 pF1KE2 R---PKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQ : :. :..::::::::::::::.:::::..::. : ::::::::.:::::::::::: CCDS13 RLQLQKDMGVMQGTVPYLGTFLTDLTMLDTALQDYIEGGLINFEKRRREFEVIAQIKLLQ 440 450 460 470 480 490 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 SACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWS ::::.: ..::..: ::. . :.: ::: ::::.: ....... . .: ..::: : CCDS13 SACNSYCMTPDQKFIQWFQRQQLLTEEESYALSCEIEAAADASTTSPKPRK--SMVKRLS 500 510 520 530 540 550 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 DRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPE : .. : . . .: . :::. :..:: : :. :..:: .:. . . CCDS13 LLFLGSDMIT----SPTPTKEQPKSTASGSSGESMDSVSVSSCESNHSEAEEGSITPM-D 560 570 580 590 600 610 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 SPDGQEKKFWESASQSSP------ETSGISSASSSTSSS-SASTTPVAATRTHKRSVSGL .:: .::. ::.:. : ..::.:: . :: : ...: . :::::: CCDS13 TPDEPQKKLSESSSSCSSIHSMDTNSSGMSSLINPLSSPPSCNNNP----KIHKRSVSVT 620 630 640 650 660 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 CNSSSALP-LYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEE .:..:: .:::: : ::::.:.. .::::::::..:::::.::::..:: ::::. . CCDS13 SITSTVLPPVYNQQNEDTCIIRISVEDNNGNMYKSIMLTSQDKTPAVIQRAMLKHNLDSD 670 680 690 700 710 720 850 860 870 880 890 900 pF1KE2 EPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR-TFTKGVKVKHGASSTLP :.:::.:..:.:..: ::..::::::::: .:.::.:.:. .. . ::.. .: ::: CCDS13 PAEEYELVQVISEDKELVIPDSANVFYAMNSQVNFDFILRKKNSMEEQVKLRSRTSLTLP 730 740 750 760 770 780 910 pF1KE2 RMKQKGLKIAKGIF : ..: CCDS13 RTAKRGCWSNRHSKITL 790 800 >>CCDS4774.1 RGL2 gene_id:5863|Hs108|chr6 (777 aa) initn: 1296 init1: 353 opt: 1001 Z-score: 487.8 bits: 101.3 E(32554): 7.5e-21 Smith-Waterman score: 1267; 39.0% identity (67.2% similar) in 589 aa overlap (363-914:220-777) 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 LELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAE :. :.:.. . . .::: : .:: CCDS47 LQTGYAAGKGVGGGSADLIRNLRSRVDPQAPDLPKPLALPGDPPADPTDVLVFLADHLAE 190 200 210 220 230 240 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 QFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNR :.::.::::: ...: .:::..:..::. :. :: :..::::::::.::. :... :: CCDS47 QLTLLDAELFLNLIPSQCLGGLWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGAVVSSVLGAT 250 260 270 280 290 300 460 470 480 490 500 pF1KE2 ST------------KAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKT :: . :.:::..:.::.::.:::.:.::::.::..:::::. ::::. . CCDS47 STGEGPGEVTIRPLRPPQRARLLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQSSPIHRLRAA 310 320 330 340 350 360 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 WEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGII : ...:::.:.:..: .:::.:.::: :::::..: . . :: . :.: . .. : CCDS47 WGEATRDSLRVFSSLCQIFSEEDNYSQSRELLVQEVKLQ-SPLEPHSKKAPRSGSRGG-- 370 380 390 400 410 420 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 QGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPD :.:::::::: ::::::.: :: : . :::.:::::: :..... ::. : .:.. :: CCDS47 -GVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDELENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPD 430 440 450 460 470 480 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 EQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELST ... :..... :.:..:. .:::.:::. : . :. . : ....:.. . :. CCDS47 HDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLG-----SV 490 500 510 520 530 540 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 SGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWE . . :::. : :: : . . .. .. ..: . . CCDS47 GVPTPLVSCDRPSTG-----GDEAPTTPAPLLTRLAQHMKWPSVSSL------------D 550 560 570 580 750 760 770 780 790 pF1KE2 SASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRS------VSGLCNSSSALPLYNQ :: .::: .. : .. . : ...: .: :.:: .:: . .:. :. CCDS47 SALESSP---SLHSPADPSHLSPPASSP-RPSRGHRRSASCGSPLSGGAEEASGGTGYGG 590 600 610 620 630 800 810 820 830 840 pF1KE2 Q-----VGDCCIIRVSLDV-DNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYEL . ..:: ::::.... ..:..:::::::::::::.:: ... :.: . .::: CCDS47 EGSGPGASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKKNNRDSAVASEYEL 640 650 660 670 680 690 850 860 870 880 890 pF1KE2 LQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR----TFTKGVKVKHGASST------ .:.: .:.: :: .:::::::.. :..::.:..: : : :: .::.: CCDS47 VQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDFLLRQRRRSSTATPGVTSGPSASGTPPSEGG 700 710 720 730 740 750 900 910 pF1KE2 ---LPRMKQKGLKIAKGIF .::.: : :::...: CCDS47 GGSFPRIKATGRKIARALF 760 770 >>CCDS54221.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 (716 aa) initn: 1551 init1: 617 opt: 989 Z-score: 482.7 bits: 100.2 E(32554): 1.4e-20 Smith-Waterman score: 1362; 36.6% identity (58.1% similar) in 829 aa overlap (65-887:15-708) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 LEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRPESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQ :. ::: .:..::.:::. : . . .. CCDS54 MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRR-QRSQRRSPAE 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 RWLGYENESAL-NL---YETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAF : . : . : :.: :::...:. ::.:: .:: . . .: :.. :: :::.: CCDS54 GPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQDPSFMPAFLATYRTF 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 pF1KE2 TTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGC-ILPYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYS . : .: .:. . : : . .: . . .:. :. :.::.::... CCDS54 VPTACLLGFLLP------PMPPPPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLR-AVVSVLGSWLQDHP 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 EDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKP .:: . : : .. ... ::: ..:. :: .. . ::: : CCDS54 QDFRDHPAHSDLGSVRTFLGWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLE----EAEREQ--------- 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 TPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAP : :: :.. .: : : CCDS54 ----------------------EEEP-----------------PQVWTGP-PRV------ 210 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 APALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDL : .:: :.. : :.:: . :.:: : : CCDS54 --------AQTSDPDSSEACAEE-------------------EEGLMPQGPQLLDFSVDE 220 230 240 250 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 VAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCL ::::.::.: :::.:: :.::::.:::::. : .::.::::.:::.:..::. . : CCDS54 VAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGCVLGSVL 260 270 280 290 300 310 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 GNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSF : . ::.::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.:::..: :::. . CCDS54 GAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGAVSREPL 320 330 340 350 360 370 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 RIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMN-PKRAQKRPKETGIIQGTVPYLG :.:::.:::::::. :::.:..: ... . : : : ..: : ::::: CCDS54 STFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPP-----GPVPYLG 380 390 400 410 420 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 TFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFR ::::::::::::. :.: : ::::::::::.:..:.:. :: :..:...: . : .. CCDS54 TFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPILAALH 430 440 450 460 470 480 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 AVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKS : ..:.: .:: :: .:::. : .. : .. ...:: : . : : ::: CCDS54 AQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSPSGS----- 490 500 510 520 530 540 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 CDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPE : :: :: .. :. : : :: .. . :...: CCDS54 -------P----GD----------PSSPTSSLCISPSVSPGSPPSSPR------SRDAP- 550 560 570 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 TSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDV .: :: . .. : . :.. : . : .: .:: :: .. .::::.: CCDS54 -AGSPPASPGPQGPS-TKLPLSLDLPSPRPFA-LPLGSPRIPLPAQQSSEARVIRVSIDN 580 590 600 610 620 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 DNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFY :.::.:.:::.:::::::.:.:.:..:::. . ::.:.:.: :: : ::.:::::: CCDS54 DHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFY 630 640 650 660 670 680 870 880 890 900 910 pF1KE2 AMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF ::. .: ::.:... :. CCDS54 AMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS 690 700 710 >>CCDS32910.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 (710 aa) initn: 1544 init1: 617 opt: 985 Z-score: 480.9 bits: 99.9 E(32554): 1.8e-20 Smith-Waterman score: 1358; 36.4% identity (57.7% similar) in 829 aa overlap (65-887:15-702) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 LEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRPESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQ :. ::: .:..::.:::. : . . .. CCDS32 MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRR-QRSQRRSPAE 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 RWLGYENESAL-NL---YETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAF : . : . : :.: :::...:. ::.:: .:: . . .: :.. :: :::.: CCDS32 GPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQDPSFMPAFLATYRTF 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 pF1KE2 TTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGC-ILPYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYS . : .: .:. . : : . .: . . .:. :. :.::.::... CCDS32 VPTACLLGFLLP------PMPPPPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLR-AVVSVLGSWLQDHP 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 EDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKP .:: . : : .. ... ::: ..:. :: .. . ::: : CCDS32 QDFRDHPAHSDLGSVRTFLGWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLE----EAEREQ--------- 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 TPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAP : :: :.. .: : : CCDS32 ----------------------EEEP-----------------PQVWTGP-PRV------ 210 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 APALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDL : .:: :.. : :.:: . :.:: : : CCDS32 --------AQTSDPDSSEACAEE-------------------EEGLMPQGPQLLDFSVDE 220 230 240 250 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 VAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCL ::::.::.: :::.:: :.::::.:::::. : .::.::::.:::.:..::. . : CCDS32 VAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGCVLGSVL 260 270 280 290 300 310 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 GNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSF : . ::.::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.:::..: :::. . CCDS32 GAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGAVSREPL 320 330 340 350 360 370 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 RIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMN-PKRAQKRPKETGIIQGTVPYLG :.:::.:::::::. :::.:..: ... . : : : ..: : ::::: CCDS32 STFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPP-----GPVPYLG 380 390 400 410 420 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 TFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFR ::::::::::::. :.: : ::::::::::.:..:.:. :: :..:...: . : .. CCDS32 TFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPILAALH 430 440 450 460 470 480 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 AVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKS : ..:.: .:: :: .:::. : .. : .. ...:: : . : : ::: CCDS32 AQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSPSGS----- 490 500 510 520 530 540 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 CDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPE : :: .. : : :: : :: ... . . : : CCDS32 -------P----GDPSSPTSSVSPGSP------------PSSPRSRD-----APAGSPPA 550 560 570 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 TSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDV . : .. :.. : .: : . : .: .:: :: .. .::::.: CCDS32 SPGPQGPSTKLPLSLDLPSP--------RPFA-LPLGSPRIPLPAQQSSEARVIRVSIDN 580 590 600 610 620 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 DNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFY :.::.:.:::.:::::::.:.:.:..:::. . ::.:.:.: :: : ::.:::::: CCDS32 DHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFY 630 640 650 660 670 680 870 880 890 900 910 pF1KE2 AMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF ::. .: ::.:... :. CCDS32 AMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS 690 700 710 914 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 10:57:39 2016 done: Tue Nov 8 10:57:40 2016 Total Scan time: 4.510 Total Display time: 0.250 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]