Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5913
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5913, 310 aa
1>>>pF1KE5913 310 - 310 aa - 310 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3740+/-0.000433; mu= 21.3379+/- 0.027
mean_var=121.1706+/-34.735, 0's: 0 Z-trim(110.5): 343 B-trim: 1080 in 1/48
Lambda= 0.116513
statistics sampled from 18398 (18926) to 18398 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 5.560
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 983 177.0 4.3e-44
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 980 176.5 6.1e-44
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 975 175.7 1.1e-43
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 975 175.7 1.1e-43
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 975 175.7 1.1e-43
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 964 173.8 4e-43
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 942 170.1 5e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 936 169.1 1e-41
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 930 168.1 2.1e-41
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 930 168.1 2.1e-41
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 930 168.1 2.1e-41
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 926 167.4 3.3e-41
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 893 161.9 1.6e-39
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 869 157.8 2.5e-38
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 863 156.8 5.1e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 860 156.3 7.2e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 851 154.8 2.1e-37
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 846 154.0 3.7e-37
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 845 153.8 4.2e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 780 142.9 8.1e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 548 103.9 4.5e-22
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 527 100.4 5.2e-21
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 228 50.1 7e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 227 50.0 8.1e-06
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 224 49.6 1.3e-05
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 216 48.1 2.9e-05
NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 213 47.7 4.4e-05
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 211 47.4 5.5e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 210 47.1 5.7e-05
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 211 47.4 5.8e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 205 46.2 0.0001
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 203 46.0 0.00014
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 200 45.5 0.00019
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 197 45.1 0.0003
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 187 43.3 0.0009
XP_011535972 (OMIM: 605108) PREDICTED: neuromedin- ( 321) 186 43.0 0.00094
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 186 43.1 0.001
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 186 43.1 0.001
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 186 43.1 0.001
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 186 43.1 0.001
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 186 43.2 0.001
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 186 43.2 0.001
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 186 43.2 0.001
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 186 43.2 0.001
NP_064552 (OMIM: 605108) neuromedin-U receptor 2 [ ( 415) 186 43.2 0.0011
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 185 42.9 0.0011
NP_000698 (OMIM: 600264) vasopressin V1b receptor ( 424) 183 42.7 0.0015
XP_005260196 (OMIM: 602779) PREDICTED: proteinase- ( 273) 181 42.1 0.0015
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 182 42.5 0.0016
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 181 42.2 0.0017
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 983; 49.0% identity (75.3% similar) in 304 aa overlap (4-307:3-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
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310
pF1KE5 RRALGKESHS
:: ::::
NP_009 RRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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pF1KE5 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMY
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pF1KE5 ILSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSS--KQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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300 310
pF1KE5 LRRALGKESHS
::.
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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pF1KE5 MG-ENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMY
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pF1KE5 ILSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFST
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pF1KE5 LRRALGKESHS
.. : : :
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 MG-ENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FFLSHLAVVDIAYACNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCE
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pF1KE5 ILSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFST
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300 310
pF1KE5 LRRALGKESHS
.. : : :
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 975; 49.8% identity (76.7% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-309)
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pF1KE5 MG-ENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMY
:: .::: :.::.:::. .. :: :: ..:. :.::: :. :: ::::::::::
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pF1KE5 FFLSHLAVVDIAYACNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 ILSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFST
.:.:.::::.:: :.:.:... . .:. : :::.:: .:...::.::: :::.::: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300 310
pF1KE5 LRRALGKESHS
.. : : :
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 989 init1: 948 opt: 964 Z-score: 895.3 bits: 173.8 E(85289): 4e-43
Smith-Waterman score: 964; 46.5% identity (77.4% similar) in 297 aa overlap (11-307:15-311)
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pF1KE5 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHT
:.:.:: :......: . .::..::.:: :. : :::.:::
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE5 PMYFFLSHLAVVDIAYACNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVL
:::::::.:. .:. :. ...::.:.:: : : ::.:::: : .. :..: .::.:::.
NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MSYDRYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FCEILSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FSTCSSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KGALRRALGKESHS
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NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 1017 init1: 942 opt: 942 Z-score: 875.5 bits: 170.1 E(85289): 5e-42
Smith-Waterman score: 942; 48.3% identity (75.2% similar) in 294 aa overlap (4-297:3-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
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XP_011 FLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCEI
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XP_011 RYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
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XP_011 PALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTC
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
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XP_011 SSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRRG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 RRALGKESHS
XP_011 S
300
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 947 init1: 906 opt: 936 Z-score: 869.8 bits: 169.1 E(85289): 1e-41
Smith-Waterman score: 936; 46.2% identity (73.7% similar) in 312 aa overlap (2-307:3-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSHLAVVDIAYACNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSY
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCE
:: ::::.::.: :::. :.: :. ..: :: .:. . :::: :: ::..::. :
NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ILSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFST
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGA
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NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 L------RRALGKESHS
: .: ::::
NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 981 init1: 923 opt: 930 Z-score: 864.4 bits: 168.1 E(85289): 2.1e-41
Smith-Waterman score: 930; 44.9% identity (74.8% similar) in 305 aa overlap (2-306:3-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMY
: ::. :.::::::. :. : ::: .: .:. :.::: :. .:.:: ::::::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSHLAVVDIAYACNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSY
::::.:. ::: .. .:::.:::: . .. ::: ::.:: .. . : . .::..:.:
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCE
:..::.::::.:.. :: ..: :.. :. ..: .:.:..:. : ::. . :.::::.
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ILSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFST
. .:.:.:.:: ::.:.:.. .. .. : .:.:: :: ..:.. : .:: :::::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LRRALGKESHS
:....:.
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 981 init1: 923 opt: 930 Z-score: 864.4 bits: 168.1 E(85289): 2.1e-41
Smith-Waterman score: 930; 44.9% identity (74.8% similar) in 305 aa overlap (2-306:3-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMY
: ::. :.::::::. :. : ::: .: .:. :.::: :. .:.:: ::::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSHLAVVDIAYACNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSY
::::.:. ::: .. .:::.:::: . .. ::: ::.:: .. . : . .::..:.:
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCE
:..::.::::.:.. :: ..: :.. :. ..: .:.:..:. : ::. . :.::::.
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ILSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFST
. .:.:.:.:: ::.:.:.. .. .. : .:.:: :: ..:.. : .:: :::::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
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:....:.
NP_036 LKKVVGRVVFSV
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310 residues in 1 query sequences
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]