FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9294, 299 aa 1>>>pF1KE9294 299 - 299 aa - 299 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5930+/-0.00121; mu= 13.6515+/- 0.071 mean_var=68.4801+/-15.537, 0's: 0 Z-trim(101.2): 48 B-trim: 17 in 1/46 Lambda= 0.154986 statistics sampled from 6361 (6402) to 6361 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.542), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16 Scan time: 1.970 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 1717 393.4 1.2e-109 CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 1699 389.3 1.9e-108 CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 1645 377.3 8.1e-105 CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 1600 367.2 8.9e-102 CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 1340 309.1 2.7e-84 CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 1339 308.8 3.1e-84 CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 1305 301.2 6e-82 CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 839 197.0 1.4e-50 CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 754 178.0 7.8e-45 CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 659 156.8 1.9e-38 CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 621 148.3 6.9e-36 CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 588 140.9 1.1e-33 CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 587 140.7 1.3e-33 CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 570 136.9 1.8e-32 CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 546 131.5 7.8e-31 CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 494 119.9 2.4e-27 CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 398 98.4 6.8e-21 CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 389 96.4 3e-20 CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 371 92.4 4.5e-19 CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 366 91.3 1e-18 CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 355 88.8 5.3e-18 CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 330 83.2 2.7e-16 CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 309 78.6 7.3e-15 CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 308 78.3 7.6e-15 >>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa) initn: 1717 init1: 1717 opt: 1717 Z-score: 2082.3 bits: 393.4 E(32554): 1.2e-109 Smith-Waterman score: 1717; 85.3% identity (95.7% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW ::::::::::::.::::::::::::::::::: :: :::::::::::.:::::::::::: CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR ::.::::.: ::::: :.:.: ::::.::: .::::: :::::::::::::::::::::. 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CCDS86 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 --TVTMLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFF :.::.. :.::::..::::::. :: :::.::::. :: .:: :::: ..:. ::::. 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CCDS86 LWMKWRIDRVISWILLGCVVL---SVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 AMYLSDTTVTMLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQT ... : ::.:.:: : :.::.::. :: .:...::: . : .::::..:...:.. CCDS86 TQHASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 VISFFLLRAIYFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTY ::::.:: :..: .:.. :. :.. . .: ..:.. :.: :::: ::.::... CCDS86 VISFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHAS 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 LSVLWQMRY :.:.:.. CCDS86 LKVIWKVMSILKGRKFQQHKQI 300 310 299 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 10:27:45 2016 done: Tue Nov 8 10:27:45 2016 Total Scan time: 1.970 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]