FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9289, 304 aa 1>>>pF1KE9289 304 - 304 aa - 304 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7317+/-0.00135; mu= 12.8923+/- 0.079 mean_var=133.7774+/-44.550, 0's: 0 Z-trim(100.6): 374 B-trim: 714 in 2/46 Lambda= 0.110888 statistics sampled from 5723 (6179) to 5723 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.514), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16 Scan time: 1.550 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1540 258.8 3.8e-69 CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1515 254.9 6.5e-68 CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1324 224.3 9.9e-59 CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1293 219.3 3e-57 CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1272 215.9 3.1e-56 CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1230 209.2 3.2e-54 CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1204 205.0 5.8e-53 CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1173 200.1 1.8e-51 CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1165 198.8 4.4e-51 CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1127 192.7 2.9e-49 CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1030 177.2 1.4e-44 CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1005 173.2 2.2e-43 CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1004 173.1 2.5e-43 CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 999 172.3 4.8e-43 CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 998 172.1 4.8e-43 CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 979 169.1 4e-42 CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 975 168.4 6.2e-42 CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 971 167.8 9.9e-42 CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 969 167.5 1.2e-41 CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 968 167.3 1.3e-41 CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 966 167.0 1.7e-41 CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 965 166.8 1.9e-41 CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 959 165.8 3.6e-41 CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 957 165.5 4.5e-41 CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 957 165.5 4.6e-41 CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 954 165.0 6.3e-41 CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 952 164.7 7.9e-41 CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 949 164.3 1.1e-40 CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 947 163.9 1.4e-40 CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 946 163.8 1.5e-40 CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 944 163.5 1.9e-40 CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 942 163.1 2.4e-40 CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 939 162.7 3.4e-40 CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 937 162.3 4.2e-40 CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 933 161.7 6.5e-40 CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 929 161.0 1e-39 CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 928 160.9 1.1e-39 CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 922 159.9 2.2e-39 CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 921 159.8 2.5e-39 CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 921 159.8 2.5e-39 CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 921 159.8 2.5e-39 CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 914 158.6 5.3e-39 CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 914 158.7 5.4e-39 CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 913 158.5 6e-39 CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 912 158.3 6.7e-39 CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 912 158.3 6.7e-39 CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 905 157.2 1.5e-38 CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 903 156.9 1.8e-38 CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 902 156.7 2e-38 CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 902 156.7 2.1e-38 >>CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 (311 aa) initn: 1540 init1: 1540 opt: 1540 Z-score: 1354.8 bits: 258.8 E(32554): 3.8e-69 Smith-Waterman score: 1540; 80.8% identity (94.1% similar) in 287 aa overlap (14-300:1-287) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MVFLSSVETDQRKMSAGNHSSVTEFILAGLSEQPELQLRLFLLFLGIYVVTVVGNLSMIT ::. :.::::::::::::::::::: :::::::::::::::::.: : CCDS73 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTT 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 LIGLSSHLHTPMYYFLSGLSFIDICHSTIITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLIF :: ::::::::::::::.:::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::.: CCDS73 LIWLSSHLHTPMYYFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 AIAECHMLAVTAYDRYVAICSPLLYNVIMSYHHCFWLTVGVYILGILGSTIHTGFMLRLF :::::::::. :::::.::::::::.::.: . :: : .::::.:.. ...::: :.:. 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