Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5974
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5974, 312 aa
1>>>pF1KE5974 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5282+/-0.00121; mu= 14.4404+/- 0.071
mean_var=126.4304+/-39.033, 0's: 0 Z-trim(102.9): 367 B-trim: 881 in 2/48
Lambda= 0.114064
statistics sampled from 6719 (7162) to 6719 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16
Scan time: 2.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 2044 348.3 4.3e-96
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 1933 330.1 1.4e-90
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 1183 206.7 2e-53
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 1166 203.9 1.4e-52
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 1164 203.5 1.7e-52
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 1139 199.4 3e-51
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1005 177.4 1.3e-44
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 967 171.1 9.7e-43
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 966 171.0 1.1e-42
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 964 170.6 1.4e-42
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 964 170.6 1.4e-42
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 962 170.3 1.7e-42
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 953 168.8 4.8e-42
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 945 167.5 1.2e-41
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 945 167.5 1.2e-41
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 939 166.5 2.4e-41
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 936 166.1 3.7e-41
CCDS34363.1 OR11A1 gene_id:26531|Hs108|chr6 ( 315) 935 165.9 3.8e-41
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 929 164.9 7.5e-41
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 929 164.9 7.5e-41
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 924 164.1 1.3e-40
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 923 163.9 1.5e-40
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 923 163.9 1.5e-40
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 921 163.5 1.9e-40
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 921 163.6 1.9e-40
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 919 163.2 2.3e-40
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 913 162.2 4.7e-40
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 911 161.9 5.8e-40
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 908 161.4 8.2e-40
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 903 160.6 1.5e-39
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 903 160.6 1.5e-39
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 902 160.4 1.6e-39
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 902 160.4 1.6e-39
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 901 160.3 1.8e-39
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 899 159.9 2.3e-39
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 898 159.8 2.6e-39
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 898 159.8 2.6e-39
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 897 159.6 2.9e-39
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 897 159.6 2.9e-39
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 895 159.3 3.6e-39
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 895 159.3 3.7e-39
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 894 159.1 4.1e-39
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 893 158.9 4.5e-39
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 892 158.8 5.1e-39
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 890 158.4 6.3e-39
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 890 158.5 6.6e-39
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 888 158.1 8e-39
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 888 158.1 8.2e-39
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 887 157.9 9e-39
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 887 158.0 9e-39
>>CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 (312 aa)
initn: 2044 init1: 2044 opt: 2044 Z-score: 1838.6 bits: 348.3 E(32554): 4.3e-96
Smith-Waterman score: 2044; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSGENVTKVSTFILVGLPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILIVWSSTSLHRPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MSGENVTKVSTFILVGLPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILIVWSSTSLHRPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATILSYWHITLAVLRIPSATGCWRAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATILSYWHITLAVLRIPSATGCWRAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSQSSNKLISAVYTVVTPIINPLIYCLRNKEFKDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSQSSNKLISAVYTVVTPIINPLIYCLRNKEFKDA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKKALGLGQTSH
::::::::::::
CCDS46 LKKALGLGQTSH
310
>>CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 (331 aa)
initn: 1933 init1: 1933 opt: 1933 Z-score: 1739.6 bits: 330.1 E(32554): 1.4e-90
Smith-Waterman score: 1933; 95.4% identity (99.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSGENVTKVSTFILVGLPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILIVWSSTSLHRPMY
:::::::.:.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS42 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATILSYWHITLAVLRIPSATGCWRAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::: :
CCDS42 ISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRAFFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSQSSNKLISAVYTVVTPIINPLIYCLRNKEFKDA
:::::::::::::::::::::::::::.:::::::..:::.:::.:::::::::::::.:
CCDS42 CASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFKNA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKKALGLGQTSH
::::.::
CCDS42 LKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
310 320 330
>>CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 (327 aa)
initn: 1183 init1: 896 opt: 1183 Z-score: 1072.6 bits: 206.7 E(32554): 2e-53
Smith-Waterman score: 1183; 57.2% identity (84.0% similar) in 306 aa overlap (8-309:9-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSGENVTKVSTFILVGLPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILIVWSSTSLHRPM
.:: :.:.:.:. :: ::: :.::.:..::.:: ::. . . ..::.::
CCDS77 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKR----ISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLL
:.::..:::::::::. :::: ::. ... ::: ::::::::: .: :::::::
CCDS77 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ASMAYDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLN
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CCDS77 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HFFCDISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATILSYWHITLAVLRIPSATGCW
:::::.::.:.:.:::.:::::.:::::..::. :: .: :: :: ::..::::.: .
CCDS77 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 RAFSTCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSQSSNKLISAVYTVVTPIINPLIYCLRNK
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CCDS77 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 EFKDALKKALGLGQTSH
: : :: .: : :
CCDS77 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 (311 aa)
initn: 1150 init1: 849 opt: 1166 Z-score: 1057.7 bits: 203.9 E(32554): 1.4e-52
Smith-Waterman score: 1166; 55.3% identity (82.6% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSGENVTKVSTFILVGLPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILIVWSSTSLHRPMY
: :: :.:. :::::.: . ... .::.::..:.....::. :::.: .. ::.:::
CCDS43 MELENQTRVTKFILVGFPGSLSMRAAMFLIFLVAYILTVAENVIIILLVLQNRPLHKPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMAY
.::...:::: ::.: .::.: .: .. :::. :: ::::: .:.::::::::.:::
CCDS43 FFLANLSFLETWYISVTVPKLLFSFWSVNNSISFTLCMIQLYFFIALMCTECVLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFCD
:::::::.::.: .... :::..:. :.. :: ::. :. ::: ..::: ::.::::::
CCDS43 DRYVAICRPLHYPTIMSHGLCFRLALGSWAIGFGISLAKIYFISCLSFCGPNVINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATILSYWHITLAVLRIPSATGCWRAFST
:::.:.:.:::.: .::::::::..:..:::. :.::: : ..: .: :: .::::
CCDS43 ISPVLNLSCTDMSITELVDFILALVIFLFPLFITVLSYGCILATILCMP--TGKQKAFST
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSQSSNKLISAVYTVVTPIINPLIYCLRNKEFKDA
:::::.:::.::.:..:::.::..: . . ::.:: :..::: .::.::::::.: :.:
CCDS43 CASHLVVVTIFYSAIIFMYARPRVIHAFNMNKIISIFYAIVTPSLNPFIYCLRNREVKEA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LKKALGLGQTSH
::: :. :.:
CCDS43 LKK-LAYCQASRSD
300 310
>>CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 1177 init1: 1149 opt: 1164 Z-score: 1055.9 bits: 203.5 E(32554): 1.7e-52
Smith-Waterman score: 1164; 54.5% identity (82.5% similar) in 297 aa overlap (9-305:9-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSGENVTKVSTFILVGLPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILIVWSSTSLHRPMY
: :.:::.::.: :: :::.::. ::..:.:: :.. .: . :::::::
CCDS53 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMAY
.::. .::::.::.. :..: .:: :. :.:.:::::::::: .:.:::::::: :::
CCDS53 FFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFCD
:::.::: :: : :. .: .:.. :. ::: ::.:. :::....:: :..::::::
CCDS53 DRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATILSYWHITLAVLRIPSATGCWRAFST
:::.:.:.:.: ::::::.::......::::.. :: : :.::::.. : .::::
CCDS53 ISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSQSSNKLISAVYTVVTPIINPLIYCLRNKEFKDA
::.::.::...:.. :: :.::.:. . . ::.::..::...:..:: :::::::: :.:
CCDS53 CAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKKALGLGQTSH
..:..
CCDS53 FRKTVMGRCHYPRDVQD
310
>>CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 (325 aa)
initn: 1178 init1: 1131 opt: 1139 Z-score: 1033.5 bits: 199.4 E(32554): 3e-51
Smith-Waterman score: 1139; 54.6% identity (80.8% similar) in 302 aa overlap (4-305:9-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSGENVTKVSTFILVGLPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILIVWSSTSL
.: : .. :::.:.:: :..: :.: .:: :::..:.::: ::: . :. .:
CCDS30 MTTIILEVDNHTVTTRFILLGFPTRPAFQLLFFSIFLATYLLTLLENLLIILAIHSDGQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 HRPMYYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLL
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CCDS30 AIMAFDRYVAICNPLRYPVIMTNQLCGTLAGGCWFCGLMTAMIKMVFIAQLHYCGMPQIN
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CCDS30 HYFCDISPLLNVSCEDASQAEMVDFFLALMVIAIPLCVVVASYAAILATILRIPSAQGRQ
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CCDS30 KAFSTCASHLTVVILFYSMTLFTYARPKLMYAYNSNKVVSVLYTVIVPLLNPIIYCLRNH
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300 310
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CCDS30 EVKAALRKTIHCRGSGPQGNGAFSS
310 320
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CCDS31 DLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRTKAFS
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CCDS31 TCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEIKN
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CCDS31 AMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
310 320
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CCDS31 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPMY
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pF1KE5 YFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMAY
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CCDS31 FFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMAY
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CCDS31 NRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDSSI-NHFFCD
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CCDS31 TTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFST
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CCDS31 CASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKNA
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310
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: ...
CCDS31 LLRVIHRKLFP
300 310
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pF1KE5 PMYYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLAS
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CCDS31 PMYFFLSNLSFIDICYSSAVAPNMLTDFFWEQKTISFVGCAAQFFFFVGMGLSECLLLTA
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CCDS31 FCDLPPVLALSCSDTFLSQVVNFLVVVTVGGTSFLQLLISYGYIVSAVLKIPSAEGRWKA
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CCDS31 CNTCASHLMVVTLLFGTALFVYLRPSSSYLLGRDKVVSVFYSLVIPMLNPLIYSLRNKEI
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310
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CCDS30 YGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQLFFFLGFACTNCLLIAVMG
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CCDS30 YDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVATNLICDMRFCGPNRVNHYFC
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CCDS30 DMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIPSAEGK-KAFV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]