FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5080, 321 aa 1>>>pF1KE5080 321 - 321 aa - 321 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3013+/-0.000485; mu= 21.5869+/- 0.030 mean_var=117.7765+/-35.065, 0's: 0 Z-trim(108.1): 421 B-trim: 839 in 1/51 Lambda= 0.118180 statistics sampled from 15504 (16134) to 15504 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16 Scan time: 6.350 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 869 160.1 5.4e-39 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 830 153.5 5.4e-37 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 826 152.8 8.7e-37 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 820 151.8 1.8e-36 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 798 148.0 2.3e-35 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 772 143.6 5.1e-34 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 772 143.6 5.1e-34 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 772 143.6 5.2e-34 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 763 142.0 1.5e-33 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 757 141.0 3e-33 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 755 140.7 3.8e-33 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 752 140.2 5.5e-33 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 748 139.5 8.7e-33 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 742 138.5 1.8e-32 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 742 138.5 1.8e-32 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 742 138.5 1.8e-32 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 740 138.1 2.2e-32 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 733 136.9 5.1e-32 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 689 129.5 9.6e-30 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 688 129.2 1e-29 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 501 97.4 4.2e-20 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 480 93.8 5e-19 NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 239 52.9 1.3e-06 NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 236 52.5 2e-06 NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 235 52.3 2.3e-06 NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 227 50.9 5.9e-06 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 221 49.7 9.9e-06 NP_795345 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 1 ( 342) 220 49.5 1.2e-05 NP_073625 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 1 ( 342) 220 49.5 1.2e-05 XP_016862558 (OMIM: 600515,609821) PREDICTED: P2Y ( 342) 220 49.5 1.2e-05 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 215 48.7 2.1e-05 NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 216 49.0 2.1e-05 XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 216 49.1 2.3e-05 NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 204 46.8 7.4e-05 NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 203 46.9 0.0001 XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 200 46.0 0.00012 XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 200 46.1 0.00012 NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 201 46.4 0.00012 XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 200 46.1 0.00012 NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 200 46.1 0.00012 NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 200 46.2 0.00013 NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 200 46.2 0.00013 NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 200 46.2 0.00013 NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 200 46.2 0.00013 NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 200 46.2 0.00013 NP_001043 (OMIM: 182454) somatostatin receptor typ ( 388) 200 46.2 0.00013 NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 200 46.2 0.00013 NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 199 45.9 0.00013 NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 200 46.2 0.00013 NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 200 46.3 0.00014 >>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa) initn: 890 init1: 869 opt: 869 Z-score: 821.1 bits: 160.1 E(85289): 5.4e-39 Smith-Waterman score: 869; 40.3% identity (74.4% similar) in 305 aa overlap (2-306:7-311) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHS :: .: . :.:.:::. .:... .: :. ::..: :::.:: . .: .::. 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NP_036 KGALKKVVGRVVFSV 300 310 >>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa) initn: 772 init1: 751 opt: 772 Z-score: 731.7 bits: 143.6 E(85289): 5.1e-34 Smith-Waterman score: 772; 38.9% identity (70.6% similar) in 306 aa overlap (3-305:5-307) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMY : .:.: :::.:.: . . : : . :: :: .. :::::: ...: ::.::: XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFLKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSY .::..::..:.:: .:::. .:: .. . ::. :. :..: . ... . .:.::.: XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCD :...:.:.:::: . : . : : ..:....:. :.:. . . .:. .: .:::: XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 VPQMLKLACSYEFINEIAL---AAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKV : .:::.:: .::. . .:.. . :.:... ::..: :::..::..:: :. XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILA---SYMHITCTVLKVPSTKGRWKA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FSTCLPHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSM :::: :: :. .: :. .. :. :. : . .:.:::. : ::: :::::: . XP_011 FSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 KAALRKMLSKEELPQRKMCLKAMFKL :.::.:.... XP_011 KGALKKVVGRVVFSV 300 310 >>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa) initn: 772 init1: 751 opt: 772 Z-score: 731.6 bits: 143.6 E(85289): 5.2e-34 Smith-Waterman score: 772; 38.9% identity (70.6% similar) in 306 aa overlap (3-305:15-317) 10 20 30 40 pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIIT : .:.: :::.:.: . . : : . :: :: .. :::::: .. XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 VDRRLHSPMYYFLKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASS .: ::.:::.::..::..:.:: .:::. .:: .. . ::. :. :..: . ... XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 EVAILTVMSYDRYAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCG . .:.::.::...:.:.:::: . : . : : ..:....:. :.:. . . .:. XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 KRVIHQFFCDVPQMLKLACSYEFINEIAL---AAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLR .: .::::: .:::.:: .::. . .:.. . :.:... ::..: :::. XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILA---SYMHITCTVLK 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 IPSAEGRTKVFSTCLPHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNP .::..:: :.:::: :: :. .: :. .. :. :. : . .:.:::. : ::: XP_011 VPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNP 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 pF1KE5 VIYSLRNDSMKAALRKMLSKEELPQRKMCLKAMFKL :::::: .:.::.:.... XP_011 FIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 300 310 320 >>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa) initn: 717 init1: 629 opt: 763 Z-score: 723.4 bits: 142.0 E(85289): 1.5e-33 Smith-Waterman score: 763; 39.9% identity (69.3% similar) in 306 aa overlap (3-305:5-306) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMY : . : :::.:.:. . : . .:: ::....::.::: :. : :::.:.: NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFLKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSY .:: .::. :: :.. :.:. ..: : :: . :. :..:...:.. . ::.::.: NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCD :::.::: :::: : :.:. : . :. . : ::.:. . . .::.: :: .::. 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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYN-LNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 YDRYAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFC ::: .:::.:::: .::.:: :: : ..: : ..: . ... .: ::.. . .:. NP_001 YDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DVPQMLKLACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKVFS ..: ....:: : .. ........ :. :.::: : .::.: :: :: :.:. NP_001 EMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCLPHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSMKA :: :: :...: . . ... ..::. . . .::... : :::.::.::: .:. 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