Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5080
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5080, 321 aa
1>>>pF1KE5080 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2749+/-0.00124; mu= 16.1099+/- 0.073
mean_var=173.2293+/-58.029, 0's: 0 Z-trim(102.3): 454 B-trim: 370 in 1/47
Lambda= 0.097446
statistics sampled from 6346 (6910) to 6346 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 1.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34362.1 OR14J1 gene_id:442191|Hs108|chr6 ( 321) 2071 304.3 8.2e-83
CCDS31097.1 OR14A16 gene_id:284532|Hs108|chr1 ( 309) 1105 168.5 6.1e-42
CCDS31112.1 OR14C36 gene_id:127066|Hs108|chr1 ( 312) 992 152.6 3.7e-37
CCDS31125.1 OR14I1 gene_id:401994|Hs108|chr1 ( 311) 952 147.0 1.8e-35
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 869 135.3 6e-32
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 864 134.6 9.7e-32
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 861 134.2 1.3e-31
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 855 133.4 2.3e-31
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 844 131.8 7e-31
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 839 131.1 1.1e-30
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 837 130.8 1.4e-30
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 836 130.7 1.5e-30
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 830 129.8 2.7e-30
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 830 129.9 2.8e-30
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 828 129.6 3.3e-30
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 826 129.3 3.9e-30
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 826 129.3 3.9e-30
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 825 129.2 4.7e-30
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 820 128.4 7.1e-30
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 818 128.2 8.8e-30
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 817 128.1 1e-29
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 811 127.2 1.7e-29
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 810 127.0 1.9e-29
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 809 126.9 2.1e-29
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 809 126.9 2.1e-29
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 809 126.9 2.1e-29
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 808 126.7 2.3e-29
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 807 126.6 2.5e-29
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 806 126.5 2.8e-29
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 805 126.3 3.1e-29
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 804 126.2 3.3e-29
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 803 126.0 3.7e-29
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 803 126.1 3.7e-29
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 802 125.9 4.1e-29
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 800 125.6 5e-29
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 799 125.5 5.5e-29
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 798 125.4 6.1e-29
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 796 125.1 7.8e-29
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 795 124.9 7.9e-29
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 795 124.9 8.1e-29
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 795 124.9 8.2e-29
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 794 124.8 8.9e-29
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 793 124.6 9.8e-29
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 793 124.6 9.9e-29
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 793 124.7 1e-28
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 791 124.4 1.2e-28
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 791 124.4 1.2e-28
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 789 124.1 1.4e-28
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 788 123.9 1.6e-28
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 788 123.9 1.6e-28
>>CCDS34362.1 OR14J1 gene_id:442191|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 2071 init1: 2071 opt: 2071 Z-score: 1600.2 bits: 304.3 E(32554): 8.2e-83
Smith-Waterman score: 2071; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMYYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMYYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCDVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCDVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QMLKLACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKVFSTCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QMLKLACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKVFSTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 PHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSMKAALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSMKAALR
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE5 KMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
:::::::::::::::::::::
CCDS34 KMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
310 320
>>CCDS31097.1 OR14A16 gene_id:284532|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 946 init1: 926 opt: 1105 Z-score: 866.4 bits: 168.5 E(32554): 6.1e-42
Smith-Waterman score: 1105; 51.8% identity (83.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMYYF
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CCDS31 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSYDR
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CCDS31 LKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMSFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCDVP
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CCDS31 YTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFCDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QMLKLACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKVFSTCL
:.: ..:: ..: :::: ... : :.: :...:...:::: .:::.::..:..: ::
CCDS31 QLLAISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAYSICL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 PHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSMKAALR
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CCDS31 PHLLVV-LFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKVAL-
250 260 270 280 290
310 320
pF1KE5 KMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
:: : .: ..
CCDS31 GMLIKGKLTKK
300
>>CCDS31112.1 OR14C36 gene_id:127066|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1002 init1: 981 opt: 992 Z-score: 780.5 bits: 152.6 E(32554): 3.7e-37
Smith-Waterman score: 992; 46.9% identity (77.4% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMYYF
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CCDS31 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMYFF
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pF1KE5 LKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSYDR
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CCDS31 LRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAHDR
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pF1KE5 YAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCDVP
:.:.:::::: .:.. : : . ..: ..: . . ::.. .:..:.: . ::::::::.:
CCDS31 YVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCDIP
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pF1KE5 QMLKLACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKVFSTCL
..:::.:: : ::. ... . ... :.: :. :::.:::::: .: . :::.::::.
CCDS31 SLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAFSTCI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 PHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSMKAALR
::..:.. :::. . .:: :. ..: ::..: ::...:: .::.:::::: ..:.:..
CCDS31 PHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKVAIK
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310 320
pF1KE5 KMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
:....
CCDS31 KIMKRIFYSENV
310
>>CCDS31125.1 OR14I1 gene_id:401994|Hs108|chr1 (311 aa)
initn: 965 init1: 946 opt: 952 Z-score: 750.2 bits: 147.0 E(32554): 1.8e-35
Smith-Waterman score: 952; 48.1% identity (77.9% similar) in 312 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMYYF
: :::... :::: :: .::.::: .::. :: .:.::::::..::.:..::.:::.:
CCDS31 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAVLVGNLLIIAVITLDQHLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSYDR
::.::.::::.::::::.:: ::: . :: . :. ::.:: :.::.:.:.::::::::
CCDS31 LKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCDVP
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CCDS31 YVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSSVIHQFFRDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 QMLKL-ACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKVFSTC
..: : .: :.. ..:: ... .. :.: ...::..::::::::::...:.:.::::
CCDS31 HVLALVSCEVFFVEFLTLA-LSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFSTC
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LPHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSMKAAL
:.:.: .::... : : . . : :::... :::.:: :::.:::::: .:.:.
CCDS31 SPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTAM
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE5 RKMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
... : . :.
CCDS31 WRLFVKIYFLQK
300 310
>>CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 (311 aa)
initn: 890 init1: 869 opt: 869 Z-score: 687.1 bits: 135.3 E(32554): 6e-32
Smith-Waterman score: 869; 40.3% identity (74.4% similar) in 305 aa overlap (2-306:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHS
:: .: . :.:.:::. .:... .: :. ::..: :::.:: . .: .::.
CCDS43 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYYFLKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTV
:::.::..::.::::. . ..:: ..: . :: . :..:..: .::...: ..:.:
CCDS43 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MSYDRYAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQF
::::::::.:.:::: ..: :: :. ..: :..: .. .:....: .::::.: . .:
CCDS43 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FCDVPQMLKLACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKV
::.:: .:.:.: .::..: .. ..: :: :. :: : ..::. :. : ::
CCDS43 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FSTCLPHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSM
:.:: ::.....:. : .:. :: .:. ...::::. :.:::.::.::: .
CCDS43 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE5 KAALRKMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
..:...... :
CCDS43 RGAVKRLMGWE
310
>>CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 (313 aa)
initn: 888 init1: 864 opt: 864 Z-score: 683.3 bits: 134.6 E(32554): 9.7e-32
Smith-Waterman score: 864; 43.9% identity (72.4% similar) in 301 aa overlap (3-303:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMY
::::.: .:.:::.. . : :: ::....:::::: .: .: .::.:::
CCDS11 MEGKNLTSISECFLLGFSEQLEEQKPLFGSFLFMYLVTVAGNLLIILVIITDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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310
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CCDS46 YFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAAMAY
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CCDS43 AAKRLLGWEWGK
310
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CCDS31 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQDLQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQL
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CCDS31 STVIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVT
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CCDS31 PMLNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]