FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5762, 843 aa 1>>>pF1KE5762 843 - 843 aa - 843 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3471+/-0.000463; mu= 19.8855+/- 0.029 mean_var=66.0101+/-13.383, 0's: 0 Z-trim(108.0): 33 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.157859 statistics sampled from 16112 (16118) to 16112 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.546), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16 Scan time: 10.280 The best scores are: opt bits E(85289) NP_002853 (OMIM: 138550) glycogen phosphorylase, b ( 843) 5669 1301.0 0 NP_005600 (OMIM: 232600,608455) glycogen phosphory ( 842) 4919 1130.2 0 NP_002854 (OMIM: 232700,613741) glycogen phosphory ( 847) 4741 1089.7 0 NP_001157412 (OMIM: 232700,613741) glycogen phosph ( 813) 4059 934.3 0 NP_001158188 (OMIM: 232600,608455) glycogen phosph ( 754) 3878 893.1 0 >>NP_002853 (OMIM: 138550) glycogen phosphorylase, brain (843 aa) initn: 5669 init1: 5669 opt: 5669 Z-score: 6971.7 bits: 1301.0 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5669; 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