Result of FASTA (ccds) for pFN21AE5762
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5762, 843 aa
  1>>>pF1KE5762 843 - 843 aa - 843 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6681+/-0.00111; mu= 17.8416+/- 0.066
 mean_var=61.6903+/-12.224, 0's: 0 Z-trim(101.5): 19  B-trim: 41 in 1/48
 Lambda= 0.163292
 statistics sampled from 6553 (6559) to 6553 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.201), width:  16
 Scan time:  3.180

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13171.1 PYGB gene_id:5834|Hs108|chr20          ( 843) 5669 1344.9       0
CCDS8079.1 PYGM gene_id:5837|Hs108|chr11           ( 842) 4919 1168.2       0
CCDS32080.1 PYGL gene_id:5836|Hs108|chr14          ( 847) 4741 1126.3       0
CCDS53894.1 PYGL gene_id:5836|Hs108|chr14          ( 813) 4059 965.6       0
CCDS53659.1 PYGM gene_id:5837|Hs108|chr11          ( 754) 3878 923.0       0


>>CCDS13171.1 PYGB gene_id:5834|Hs108|chr20               (843 aa)
 initn: 5669 init1: 5669 opt: 5669  Z-score: 7208.8  bits: 1344.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5669; 100.0% identity (100.0% similar) in 843 aa overlap (1-843:1-843)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MAKPLTDSEKRKQISVRGLAGLGDVAEVRKSFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MAKPLTDSEKRKQISVRGLAGLGDVAEVRKSFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYERDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLGLQNACDEAIYQLGLDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RDHLVGRWIRTQQHYYERDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLGLQNACDEAIYQLGLDL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKIVNGWQVEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKIVNGWQVEEA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 DDWLRYGNPWEKARPEYMLPVHFYGRVEHTPDGVKWLDTQVVLAMPYDTPVPGYKNNTVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DDWLRYGNPWEKARPEYMLPVHFYGRVEHTPDGVKWLDTQVVLAMPYDTPVPGYKNNTVN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 TMRLWSAKAPNDFKLQDFNVGDYIEAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TMRLWSAKAPNDFKLQDFNVGDYIEAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTCFETFPDKVAIQLNDTHPALSIPELMRILVDVEKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTCFETFPDKVAIQLNDTHPALSIPELMRILVDVEKV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 DWDKAWEITKKTCAYTNHTVLPEALERWPVSMFEKLLPRHLEIIYAINQRHLDHVAALFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DWDKAWEITKKTCAYTNHTVLPEALERWPVSMFEKLLPRHLEIIYAINQRHLDHVAALFP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 GDVDRLRRMSVIEEGDCKRINMAHLCVIGSHAVNGVARIHSEIVKQSVFKDFYELEPEKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GDVDRLRRMSVIEEGDCKRINMAHLCVIGSHAVNGVARIHSEIVKQSVFKDFYELEPEKF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLADTIVEKIGEEFLTDLSQLKKLLPLVSDEVFIRDVAKVKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLADTIVEKIGEEFLTDLSQLKKLLPLVSDEVFIRDVAKVKQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 ENKLKFSAFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVVTLYNRIKRDPAKAFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ENKLKFSAFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVVTLYNRIKRDPAKAFV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 PRTVMIGGKAAPGYHMAKLIIKLVTSIGDVVNHDPVVGDRLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PRTVMIGGKAAPGYHMAKLIIKLVTSIGDVVNHDPVVGDRLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 ADLSQQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGAENLFIFGLRVEDVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ADLSQQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGAENLFIFGLRVEDVE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE5 ALDRKGYNAREYYDHLPELKQAVDQISSGFFSPKEPDCFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ALDRKGYNAREYYDHLPELKQAVDQISSGFFSPKEPDCFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE5 YMQCQAQVDQLYRNPKEWTKKVIRNIACSGKFSSDRTITEYAREIWGVEPSDLQIPPPNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YMQCQAQVDQLYRNPKEWTKKVIRNIACSGKFSSDRTITEYAREIWGVEPSDLQIPPPNI
              790       800       810       820       830       840

          
pF1KE5 PRD
       :::
CCDS13 PRD
          

>>CCDS8079.1 PYGM gene_id:5837|Hs108|chr11                (842 aa)
 initn: 4908 init1: 4908 opt: 4919  Z-score: 6254.0  bits: 1168.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4919; 83.9% identity (96.4% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MAKPLTDSEKRKQISVRGLAGLGDVAEVRKSFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTV
       :..::.:.:::::::::::::. .:.:..:.:::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS80 MSRPLSDQEKRKQISVRGLAGVENVTELKKNFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYYFALAHTV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYERDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLGLQNACDEAIYQLGLDL
       :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:.:::::: ::::::.
CCDS80 RDHLVGRWIRTQQHYYEKDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLALENACDEATYQLGLDM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKIVNGWQVEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::.:::
CCDS80 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKISGGWQMEEA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 DDWLRYGNPWEKARPEYMLPVHFYGRVEHTPDGVKWLDTQVVLAMPYDTPVPGYKNNTVN
       ::::::::::::::::. :::::::.:::: .:.::.:::::::::::::::::.::.::
CCDS80 DDWLRYGNPWEKARPEFTLPVHFYGHVEHTSQGAKWVDTQVVLAMPYDTPVPGYRNNVVN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 TMRLWSAKAPNDFKLQDFNVGDYIEAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
       :::::::::::::.:.::::: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 TMRLWSAKAPNDFNLKDFNVGGYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTCFETFPDKVAIQLNDTHPALSIPELMRILVDVEKV
       ::::::::::::::::::::::::: :..::::::::::::::.:.::::::::::.:..
CCDS80 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTNFDAFPDKVAIQLNDTHPSLAIPELMRILVDLERM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 DWDKAWEITKKTCAYTNHTVLPEALERWPVSMFEKLLPRHLEIIYAINQRHLDHVAALFP
       ::::::..: .::::::::::::::::::: ..: ::::::.::: :::: :..::: ::
CCDS80 DWDKAWDVTVRTCAYTNHTVLPEALERWPVHLLETLLPRHLQIIYEINQRFLNRVAAAFP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 GDVDRLRRMSVIEEGDCKRINMAHLCVIGSHAVNGVARIHSEIVKQSVFKDFYELEPEKF
       ::::::::::..:::  :::::::::. :::::::::::::::.:...:::::::::.::
CCDS80 GDVDRLRRMSLVEEGAVKRINMAHLCIAGSHAVNGVARIHSEILKKTIFKDFYELEPHKF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLADTIVEKIGEEFLTDLSQLKKLLPLVSDEVFIRDVAKVKQ
       :::::::::::::.:::::::..:.:.:::.:..::.::.::: .:.::.::::::::::
CCDS80 QNKTNGITPRRWLVLCNPGLAEVIAERIGEDFISDLDQLRKLLSFVDDEAFIRDVAKVKQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 ENKLKFSAFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVVTLYNRIKRDPAKAFV
       ::::::.:.::.::::.:::.:.::..:::::::::::::::::.::::::::.: : ::
CCDS80 ENKLKFAAYLEREYKVHINPNSLFDIQVKRIHEYKRQLLNCLHVITLYNRIKREPNKFFV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 PRTVMIGGKAAPGYHMAKLIIKLVTSIGDVVNHDPVVGDRLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
       ::::::::::::::::::.::.:::.:::::::::.:::::.::::::::::::::::::
CCDS80 PRTVMIGGKAAPGYHMAKMIIRLVTAIGDVVNHDPAVGDRLRVIFLENYRVSLAEKVIPA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 ADLSQQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGAENLFIFGLRVEDVE
       ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::.:::::.
CCDS80 ADLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENFFIFGMRVEDVD
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE5 ALDRKGYNAREYYDHLPELKQAVDQISSGFFSPKEPDCFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEA
        ::..::::.::::..:::.:...:.::::::::.:: ::::::::::::::::::::: 
CCDS80 KLDQRGYNAQEYYDRIPELRQVIEQLSSGFFSPKQPDLFKDIVNMLMHHDRFKVFADYED
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE5 YMQCQAQVDQLYRNPKEWTKKVIRNIACSGKFSSDRTITEYAREIWGVEPSDLQIPPPNI
       :..:: .:. ::.::.:::. :::::: ::::::::::..:::::::::::  ..: :. 
CCDS80 YIKCQEKVSALYKNPREWTRMVIRNIATSGKFSSDRTIAQYAREIWGVEPSRQRLPAPDE
              790       800       810       820       830       840

          
pF1KE5 PRD
          
CCDS80 AI 
          

>>CCDS32080.1 PYGL gene_id:5836|Hs108|chr14               (847 aa)
 initn: 4772 init1: 4740 opt: 4741  Z-score: 6027.3  bits: 1126.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4741; 81.9% identity (94.4% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MAKPLTDSEKRKQISVRGLAGLGDVAEVRKSFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTV
       :::::::.:::.:::.::..:. .:::..::::::::::::::::::: :::.:::::::
CCDS32 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYERDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLGLQNACDEAIYQLGLDL
       ::::::::::::::::.. :::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::.
CCDS32 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKIVNGWQVEEA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: .:::::::
CCDS32 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 DDWLRYGNPWEKARPEYMLPVHFYGRVEHTPDGVKWLDTQVVLAMPYDTPVPGYKNNTVN
       ::::::::::::.:::.::::::::.::::  :.::.:::::::.::::::::: :::::
CCDS32 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 TMRLWSAKAPNDFKLQDFNVGDYIEAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
       :::::::.:::::.:.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTCFETFPDKVAIQLNDTHPALSIPELMRILVDVEKV
       :::::::::::::.::::    . : :..:::.::::::::::::.:::::::.::.::.
CCDS32 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 DWDKAWEITKKTCAYTNHTVLPEALERWPVSMFEKLLPRHLEIIYAINQRHLDHVAALFP
        :.::::.:.:: :::::::::::::::::.. :::::::::::: :::.:::...::::
CCDS32 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 GDVDRLRRMSVIEEGDCKRINMAHLCVIGSHAVNGVARIHSEIVKQSVFKDFYELEPEKF
        :::::::::.:::   :::::::::..:::::::::.:::.::: .::::: ::::.::
CCDS32 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLADTIVEKIGEEFLTDLSQLKKLLPLVSDEVFIRDVAKVKQ
       :::::::::::::::::::::. :.:::::... ::::: ::  ...:.::.:..:::::
CCDS32 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 ENKLKFSAFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVVTLYNRIKRDPAKAFV
       ::::::: ::: ::::::::::::::.:::::::::::::::::.:.:::::.:: : ::
CCDS32 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 PRTVMIGGKAAPGYHMAKLIIKLVTSIGDVVNHDPVVGDRLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
       ::::.:::::::::::::.::::.::..::::.::.::..::::::::::::::::::::
CCDS32 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 ADLSQQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGAENLFIFGLRVEDVE
       .:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:..:: 
CCDS32 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE5 ALDRKGYNAREYYDHLPELKQAVDQISSGFFSPKEPDCFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEA
       :::.:::.:.:::. ::::: ..:::..::::::.:: ::::.:::..::::::::::::
CCDS32 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE5 YMQCQAQVDQLYRNPKEWTKKVIRNIACSGKFSSDRTITEYAREIWGVEPSDLQIPPPNI
       :..:: .:.::: ::: :.  :..::: :::::::::: :::..::.::::::.:   : 
CCDS32 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE
              790       800       810       820       830       840

              
pF1KE5 PRD    
              
CCDS32 SNKVNGN
              

>>CCDS53894.1 PYGL gene_id:5836|Hs108|chr14               (813 aa)
 initn: 4536 init1: 4052 opt: 4059  Z-score: 5159.3  bits: 965.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4441; 78.1% identity (90.3% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-805)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MAKPLTDSEKRKQISVRGLAGLGDVAEVRKSFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTV
       :::::::.:::.:::.::..:. .:::..::::::::::::::::::: :::.:::::::
CCDS53 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYERDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLGLQNACDEAIYQLGLDL
       ::::::::::::::::.. ::                                  ::::.
CCDS53 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPK----------------------------------LGLDI
               70        80                                        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKIVNGWQVEEA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: .:::::::
CCDS53 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
         90       100       110       120       130       140      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 DDWLRYGNPWEKARPEYMLPVHFYGRVEHTPDGVKWLDTQVVLAMPYDTPVPGYKNNTVN
       ::::::::::::.:::.::::::::.::::  :.::.:::::::.::::::::: :::::
CCDS53 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
        150       160       170       180       190       200      

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 TMRLWSAKAPNDFKLQDFNVGDYIEAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
       :::::::.:::::.:.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
        210       220       230       240       250       260      

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTCFETFPDKVAIQLNDTHPALSIPELMRILVDVEKV
       :::::::::::::.::::    . : :..:::.::::::::::::.:::::::.::.::.
CCDS53 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
        270       280       290       300       310       320      

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 DWDKAWEITKKTCAYTNHTVLPEALERWPVSMFEKLLPRHLEIIYAINQRHLDHVAALFP
        :.::::.:.:: :::::::::::::::::.. :::::::::::: :::.:::...::::
CCDS53 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
        330       340       350       360       370       380      

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 GDVDRLRRMSVIEEGDCKRINMAHLCVIGSHAVNGVARIHSEIVKQSVFKDFYELEPEKF
        :::::::::.:::   :::::::::..:::::::::.:::.::: .::::: ::::.::
CCDS53 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
        390       400       410       420       430       440      

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLADTIVEKIGEEFLTDLSQLKKLLPLVSDEVFIRDVAKVKQ
       :::::::::::::::::::::. :.:::::... ::::: ::  ...:.::.:..:::::
CCDS53 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ
        450       460       470       480       490       500      

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 ENKLKFSAFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVVTLYNRIKRDPAKAFV
       ::::::: ::: ::::::::::::::.:::::::::::::::::.:.:::::.:: : ::
CCDS53 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
        510       520       530       540       550       560      

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 PRTVMIGGKAAPGYHMAKLIIKLVTSIGDVVNHDPVVGDRLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
       ::::.:::::::::::::.::::.::..::::.::.::..::::::::::::::::::::
CCDS53 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
        570       580       590       600       610       620      

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 ADLSQQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGAENLFIFGLRVEDVE
       .:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:..:: 
CCDS53 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
        630       640       650       660       670       680      

              730       740       750       760       770       780
pF1KE5 ALDRKGYNAREYYDHLPELKQAVDQISSGFFSPKEPDCFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEA
       :::.:::.:.:::. ::::: ..:::..::::::.:: ::::.:::..::::::::::::
CCDS53 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
        690       700       710       720       730       740      

              790       800       810       820       830       840
pF1KE5 YMQCQAQVDQLYRNPKEWTKKVIRNIACSGKFSSDRTITEYAREIWGVEPSDLQIPPPNI
       :..:: .:.::: ::: :.  :..::: :::::::::: :::..::.::::::.:   : 
CCDS53 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE
        750       760       770       780       790       800      

              
pF1KE5 PRD    
              
CCDS53 SNKVNGN
        810   

>>CCDS53659.1 PYGM gene_id:5837|Hs108|chr11               (754 aa)
 initn: 4356 init1: 3876 opt: 3878  Z-score: 4929.4  bits: 923.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4176; 73.9% identity (86.1% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-751)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MAKPLTDSEKRKQISVRGLAGLGDVAEVRKSFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTV
       :..::.:.:::::::::::::. .:.:..:.:::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS53 MSRPLSDQEKRKQISVRGLAGVENVTELKKNFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYYFALAHTV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYERDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLGLQNACDEAIYQLGLDL
       :::::::::::::::::.:::                                       
CCDS53 RDHLVGRWIRTQQHYYEKDPK---------------------------------------
               70        80                                        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKIVNGWQVEEA
                                                        :: .:::.:::
CCDS53 -------------------------------------------------KISGGWQMEEA
                                                               90  

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 DDWLRYGNPWEKARPEYMLPVHFYGRVEHTPDGVKWLDTQVVLAMPYDTPVPGYKNNTVN
       ::::::::::::::::. :::::::.:::: .:.::.:::::::::::::::::.::.::
CCDS53 DDWLRYGNPWEKARPEFTLPVHFYGHVEHTSQGAKWVDTQVVLAMPYDTPVPGYRNNVVN
            100       110       120       130       140       150  

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 TMRLWSAKAPNDFKLQDFNVGDYIEAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
       :::::::::::::.:.::::: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TMRLWSAKAPNDFNLKDFNVGGYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
            160       170       180       190       200       210  

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTCFETFPDKVAIQLNDTHPALSIPELMRILVDVEKV
       ::::::::::::::::::::::::: :..::::::::::::::.:.::::::::::.:..
CCDS53 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTNFDAFPDKVAIQLNDTHPSLAIPELMRILVDLERM
            220       230       240       250       260       270  

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 DWDKAWEITKKTCAYTNHTVLPEALERWPVSMFEKLLPRHLEIIYAINQRHLDHVAALFP
       ::::::..: .::::::::::::::::::: ..: ::::::.::: :::: :..::: ::
CCDS53 DWDKAWDVTVRTCAYTNHTVLPEALERWPVHLLETLLPRHLQIIYEINQRFLNRVAAAFP
            280       290       300       310       320       330  

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 GDVDRLRRMSVIEEGDCKRINMAHLCVIGSHAVNGVARIHSEIVKQSVFKDFYELEPEKF
       ::::::::::..:::  :::::::::. :::::::::::::::.:...:::::::::.::
CCDS53 GDVDRLRRMSLVEEGAVKRINMAHLCIAGSHAVNGVARIHSEILKKTIFKDFYELEPHKF
            340       350       360       370       380       390  

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLADTIVEKIGEEFLTDLSQLKKLLPLVSDEVFIRDVAKVKQ
       :::::::::::::.:::::::..:.:.:::.:..::.::.::: .:.::.::::::::::
CCDS53 QNKTNGITPRRWLVLCNPGLAEVIAERIGEDFISDLDQLRKLLSFVDDEAFIRDVAKVKQ
            400       410       420       430       440       450  

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 ENKLKFSAFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVVTLYNRIKRDPAKAFV
       ::::::.:.::.::::.:::.:.::..:::::::::::::::::.::::::::.: : ::
CCDS53 ENKLKFAAYLEREYKVHINPNSLFDIQVKRIHEYKRQLLNCLHVITLYNRIKREPNKFFV
            460       470       480       490       500       510  

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 PRTVMIGGKAAPGYHMAKLIIKLVTSIGDVVNHDPVVGDRLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
       ::::::::::::::::::.::.:::.:::::::::.:::::.::::::::::::::::::
CCDS53 PRTVMIGGKAAPGYHMAKMIIRLVTAIGDVVNHDPAVGDRLRVIFLENYRVSLAEKVIPA
            520       530       540       550       560       570  

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 ADLSQQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGAENLFIFGLRVEDVE
       ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::.:::::.
CCDS53 ADLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENFFIFGMRVEDVD
            580       590       600       610       620       630  

              730       740       750       760       770       780
pF1KE5 ALDRKGYNAREYYDHLPELKQAVDQISSGFFSPKEPDCFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEA
        ::..::::.::::..:::.:...:.::::::::.:: ::::::::::::::::::::: 
CCDS53 KLDQRGYNAQEYYDRIPELRQVIEQLSSGFFSPKQPDLFKDIVNMLMHHDRFKVFADYED
            640       650       660       670       680       690  

              790       800       810       820       830       840
pF1KE5 YMQCQAQVDQLYRNPKEWTKKVIRNIACSGKFSSDRTITEYAREIWGVEPSDLQIPPPNI
       :..:: .:. ::.::.:::. :::::: ::::::::::..:::::::::::  ..: :. 
CCDS53 YIKCQEKVSALYKNPREWTRMVIRNIATSGKFSSDRTIAQYAREIWGVEPSRQRLPAPDE
            700       710       720       730       740       750  

          
pF1KE5 PRD
          
CCDS53 AI 
          




843 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 04:58:13 2016 done: Tue Nov  8 04:58:14 2016
 Total Scan time:  3.180 Total Display time:  0.140

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com