Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4237
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4237, 1047 aa
  1>>>pF1KE4237 1047 - 1047 aa - 1047 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5825+/-0.00118; mu= -1.9852+/- 0.071
 mean_var=304.0771+/-64.682, 0's: 0 Z-trim(110.9): 79  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.073550
 statistics sampled from 11885 (11952) to 11885 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.367), width:  16
 Scan time:  4.500

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34200.1 RASA1 gene_id:5921|Hs108|chr5          (1047) 6958 753.1 7.2e-217
CCDS47243.1 RASA1 gene_id:5921|Hs108|chr5          ( 870) 5769 626.8  6e-179
CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1          (1280)  649 83.7 2.8e-15
CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1          (1139)  642 82.9 4.3e-15
CCDS6832.1 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9        (1065)  635 82.1 6.9e-15
CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9        (1132)  635 82.1 7.2e-15
CCDS46006.1 RASAL3 gene_id:64926|Hs108|chr19       (1011)  559 74.0 1.8e-12


>>CCDS34200.1 RASA1 gene_id:5921|Hs108|chr5               (1047 aa)
 initn: 6958 init1: 6958 opt: 6958  Z-score: 4006.9  bits: 753.1 E(32554): 7.2e-217
Smith-Waterman score: 6958; 100.0% identity (100.0% similar) in 1047 aa overlap (1-1047:1-1047)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MMAAEAGSEEGGPVTAGAGGGGAAAGSSAYPAVCRVKIPAALPVAAAPYPGLVETGVAGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MMAAEAGSEEGGPVTAGAGGGGAAAGSSAYPAVCRVKIPAALPVAAAPYPGLVETGVAGT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 LGGGAALGSEFLGAGSVAGALGGAGLTGGGTAAGVAGAAAGVAGAAVAGPSGDMALTKLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGGGAALGSEFLGAGSVAGALGGAGLTGGGTAAGVAGAAAGVAGAAVAGPSGDMALTKLP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 TSLLAETLGPGGGFPPLPPPPYLPPLGAGLGTVDEGDSLDGPEYEEEEVAIPLTAPPTNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TSLLAETLGPGGGFPPLPPPPYLPPLGAGLGTVDEGDSLDGPEYEEEEVAIPLTAPPTNQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 WYHGKLDRTIAEERLRQAGKSGSYLIRESDRRPGSFVLSFLSQMNVVNHFRIIAMCGDYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 WYHGKLDRTIAEERLRQAGKSGSYLIRESDRRPGSFVLSFLSQMNVVNHFRIIAMCGDYY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 IGGRRFSSLSDLIGYYSHVSCLLKGEKLLYPVAPPEPVEDRRRVRAILPYTKVPDTDEIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IGGRRFSSLSDLIGYYSHVSCLLKGEKLLYPVAPPEPVEDRRRVRAILPYTKVPDTDEIS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 FLKGDMFIVHNELEDGWMWVTNLRTDEQGLIVEDLVEEVGREEDPHEGKIWFHGKISKQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FLKGDMFIVHNELEDGWMWVTNLRTDEQGLIVEDLVEEVGREEDPHEGKIWFHGKISKQE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 AYNLLMTVGQVCSFLVRPSDNTPGDYSLYFRTNENIQRFKICPTPNNQFMMGGRYYNSIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AYNLLMTVGQVCSFLVRPSDNTPGDYSLYFRTNENIQRFKICPTPNNQFMMGGRYYNSIG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 DIIDHYRKEQIVEGYYLKEPVPMQDQEQVLNDTVDGKEIYNTIRRKTKDAFYKNIVKKGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DIIDHYRKEQIVEGYYLKEPVPMQDQEQVLNDTVDGKEIYNTIRRKTKDAFYKNIVKKGY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 LLKKGKGKRWKNLYFILEGSDAQLIYFESEKRATKPKGLIDLSVCSVYVVHDSLFGRPNC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLKKGKGKRWKNLYFILEGSDAQLIYFESEKRATKPKGLIDLSVCSVYVVHDSLFGRPNC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 FQIVVQHFSEEHYIFYFAGETPEQAEDWMKGLQAFCNLRKSSPGTSNKRLRQVSSLVLHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FQIVVQHFSEEHYIFYFAGETPEQAEDWMKGLQAFCNLRKSSPGTSNKRLRQVSSLVLHI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 EEAHKLPVKHFTNPYCNIYLNSVQVAKTHAREGQNPVWSEEFVFDDLPPDINRFEITLSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EEAHKLPVKHFTNPYCNIYLNSVQVAKTHAREGQNPVWSEEFVFDDLPPDINRFEITLSN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 KTKKSKDPDILFMRCQLSRLQKGHATDEWFLLSSHIPLKGIEPGSLRVRARYSMEKIMPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KTKKSKDPDILFMRCQLSRLQKGHATDEWFLLSSHIPLKGIEPGSLRVRARYSMEKIMPE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE4 EEYSEFKELILQKELHVVYALSHVCGQDRTLLASILLRIFLHEKLESLLLCTLNDREISM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EEYSEFKELILQKELHVVYALSHVCGQDRTLLASILLRIFLHEKLESLLLCTLNDREISM
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE4 EDEATTLFRATTLASTLMEQYMKATATQFVHHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKNED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EDEATTLFRATTLASTLMEQYMKATATQFVHHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKNED
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE4 VNTNLTHLLNILSELVEKIFMASEILPPTLRYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVSGFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VNTNLTHLLNILSELVEKIFMASEILPPTLRYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVSGFV
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE4 FLRLICPAILNPRMFNIISDSPSPIAARTLILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEGVNPFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FLRLICPAILNPRMFNIISDSPSPIAARTLILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEGVNPFI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE4 KSNKHRMIMFLDELGNVPELPDTTEHSRTDLSRDLAALHEICVAHSDELRTLSNERGAQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KSNKHRMIMFLDELGNVPELPDTTEHSRTDLSRDLAALHEICVAHSDELRTLSNERGAQQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040       
pF1KE4 HVLKKLLAITELLQQKQNQYTKTNDVR
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HVLKKLLAITELLQQKQNQYTKTNDVR
             1030      1040       

>>CCDS47243.1 RASA1 gene_id:5921|Hs108|chr5               (870 aa)
 initn: 5769 init1: 5769 opt: 5769  Z-score: 3326.2  bits: 626.8 E(32554): 6e-179
Smith-Waterman score: 5769; 100.0% identity (100.0% similar) in 867 aa overlap (181-1047:4-870)

              160       170       180       190       200       210
pF1KE4 GTVDEGDSLDGPEYEEEEVAIPLTAPPTNQWYHGKLDRTIAEERLRQAGKSGSYLIRESD
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47                            MKGWYHGKLDRTIAEERLRQAGKSGSYLIRESD
                                          10        20        30   

              220       230       240       250       260       270
pF1KE4 RRPGSFVLSFLSQMNVVNHFRIIAMCGDYYIGGRRFSSLSDLIGYYSHVSCLLKGEKLLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RRPGSFVLSFLSQMNVVNHFRIIAMCGDYYIGGRRFSSLSDLIGYYSHVSCLLKGEKLLY
            40        50        60        70        80        90   

              280       290       300       310       320       330
pF1KE4 PVAPPEPVEDRRRVRAILPYTKVPDTDEISFLKGDMFIVHNELEDGWMWVTNLRTDEQGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PVAPPEPVEDRRRVRAILPYTKVPDTDEISFLKGDMFIVHNELEDGWMWVTNLRTDEQGL
           100       110       120       130       140       150   

              340       350       360       370       380       390
pF1KE4 IVEDLVEEVGREEDPHEGKIWFHGKISKQEAYNLLMTVGQVCSFLVRPSDNTPGDYSLYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IVEDLVEEVGREEDPHEGKIWFHGKISKQEAYNLLMTVGQVCSFLVRPSDNTPGDYSLYF
           160       170       180       190       200       210   

              400       410       420       430       440       450
pF1KE4 RTNENIQRFKICPTPNNQFMMGGRYYNSIGDIIDHYRKEQIVEGYYLKEPVPMQDQEQVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RTNENIQRFKICPTPNNQFMMGGRYYNSIGDIIDHYRKEQIVEGYYLKEPVPMQDQEQVL
           220       230       240       250       260       270   

              460       470       480       490       500       510
pF1KE4 NDTVDGKEIYNTIRRKTKDAFYKNIVKKGYLLKKGKGKRWKNLYFILEGSDAQLIYFESE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NDTVDGKEIYNTIRRKTKDAFYKNIVKKGYLLKKGKGKRWKNLYFILEGSDAQLIYFESE
           280       290       300       310       320       330   

              520       530       540       550       560       570
pF1KE4 KRATKPKGLIDLSVCSVYVVHDSLFGRPNCFQIVVQHFSEEHYIFYFAGETPEQAEDWMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KRATKPKGLIDLSVCSVYVVHDSLFGRPNCFQIVVQHFSEEHYIFYFAGETPEQAEDWMK
           340       350       360       370       380       390   

              580       590       600       610       620       630
pF1KE4 GLQAFCNLRKSSPGTSNKRLRQVSSLVLHIEEAHKLPVKHFTNPYCNIYLNSVQVAKTHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GLQAFCNLRKSSPGTSNKRLRQVSSLVLHIEEAHKLPVKHFTNPYCNIYLNSVQVAKTHA
           400       410       420       430       440       450   

              640       650       660       670       680       690
pF1KE4 REGQNPVWSEEFVFDDLPPDINRFEITLSNKTKKSKDPDILFMRCQLSRLQKGHATDEWF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 REGQNPVWSEEFVFDDLPPDINRFEITLSNKTKKSKDPDILFMRCQLSRLQKGHATDEWF
           460       470       480       490       500       510   

              700       710       720       730       740       750
pF1KE4 LLSSHIPLKGIEPGSLRVRARYSMEKIMPEEEYSEFKELILQKELHVVYALSHVCGQDRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLSSHIPLKGIEPGSLRVRARYSMEKIMPEEEYSEFKELILQKELHVVYALSHVCGQDRT
           520       530       540       550       560       570   

              760       770       780       790       800       810
pF1KE4 LLASILLRIFLHEKLESLLLCTLNDREISMEDEATTLFRATTLASTLMEQYMKATATQFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLASILLRIFLHEKLESLLLCTLNDREISMEDEATTLFRATTLASTLMEQYMKATATQFV
           580       590       600       610       620       630   

              820       830       840       850       860       870
pF1KE4 HHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKNEDVNTNLTHLLNILSELVEKIFMASEILPPTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKNEDVNTNLTHLLNILSELVEKIFMASEILPPTL
           640       650       660       670       680       690   

              880       890       900       910       920       930
pF1KE4 RYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVSGFVFLRLICPAILNPRMFNIISDSPSPIAARTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVSGFVFLRLICPAILNPRMFNIISDSPSPIAARTL
           700       710       720       730       740       750   

              940       950       960       970       980       990
pF1KE4 ILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEGVNPFIKSNKHRMIMFLDELGNVPELPDTTEHSRTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEGVNPFIKSNKHRMIMFLDELGNVPELPDTTEHSRTD
           760       770       780       790       800       810   

             1000      1010      1020      1030      1040       
pF1KE4 LSRDLAALHEICVAHSDELRTLSNERGAQQHVLKKLLAITELLQQKQNQYTKTNDVR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSRDLAALHEICVAHSDELRTLSNERGAQQHVLKKLLAITELLQQKQNQYTKTNDVR
           820       830       840       850       860       870

>>CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1               (1280 aa)
 initn: 366 init1: 239 opt: 649  Z-score: 387.7  bits: 83.7 E(32554): 2.8e-15
Smith-Waterman score: 669; 27.9% identity (60.5% similar) in 534 aa overlap (526-1044:260-774)

         500       510       520       530       540       550     
pF1KE4 ILEGSDAQLIYFESEKRATKPKGLIDLSVCSVYVVHDSLFGRPNCFQIVVQHFSEEHYIF
                                     ::  .:.:..:.  ::...    :.     
CCDS13 PKLKESRSHESLLSPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKC----
     230       240       250       260       270       280         

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pF1KE4 YFAGETPEQAEDWMKGLQAFCNLRKSSPGTSNKRLRQVSSLVLHIEEAHKL-PVKHFTNP
        :. ..  . . ::..:.     :  .:. .: : :  . : : : ::. : : :..   
CCDS13 -FSCNSASERDKWMENLR-----RTVQPNKDNCR-RAENVLRLWIIEAKDLAPKKKY---
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pF1KE4 YCNIYLNSVQVAKTHAR-EGQNPVWSEEFVFDDLPPDINRFEITL----SNKTKKSKDPD
       .:.. :...  :.: .. ...:  :.:.: : .::: .. . . .     .: ::.:.  
CCDS13 FCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGEHFEFFSLPP-LHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNY
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pF1KE4 ILFMRCQLSRLQKGHATDEWFLLSSHIPLKGIEPG-SLRVRARYSMEKIMPEEEYSEFKE
       . ..    . .   . ...:. .:.  : ::   : :.:...:..   :.: :.:.:: :
CCDS13 VGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPNKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAE
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pF1KE4 LILQKELHVVYALSHVCG-QDRTLLASILLRIFLHEKLESLLLCTLNDREISMEDEATTL
       .. ..   .  .:  : . ...  ::  :..:.      . .:  :   :..   :  .:
CCDS13 FVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACALVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVL
          460       470       480       490       500       510    

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pF1KE4 -FRATTLASTLMEQYMKATATQFVHHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKNEDVNTNLT
        :: .:.:.  .:.:.: .. :..: :: . :  ..:: ..::..:::  ..: .. . .
CCDS13 IFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSN
          520       530       540       550       560       570    

        850        860       870       880       890       900     
pF1KE4 HLLNILSELVE-KIFMASEILPPTLRYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVSGFVFLRLI
         :..  ::.  ::. .  ..:  :. ...  ...  ..   . .   :..:. .:::..
CCDS13 --LKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWKQQCLNRGKQDIS--ERLISASLFLRFL
            580       590       600       610         620       630

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pF1KE4 CPAILNPRMFNIISDSPSPIAARTLILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEGVNPFIKSNKH
       ::::..: .::.... :.  ..::: :.:: .:::::...:: :: ::  .: :.. .  
CCDS13 CPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWG
              640       650       660       670       680       690

         970       980        990      1000       1010      1020   
pF1KE4 RMIMFLDELGNVPELPDTTEHS-RTDLSRDLAALHEICVAHSDEL-RTLSNERGAQQHVL
        :  :: :..:   . .:   .   ::.:.:..:: .     ..: ..   . :   .::
CCDS13 GMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELSVLHSLLWEVVSQLDKATVAKLGPLPRVL
              700       710       720       730       740       750

             1030      1040                                        
pF1KE4 K---KLLAITELLQQKQNQYTKTNDVR                                 
           : :.    .::.  ..:. :                                    
CCDS13 ADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNVSGSLSSGLQKIFEDPTDSDLHKLKSPSQDNT
              760       770       780       790       800       810

>>CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1               (1139 aa)
 initn: 366 init1: 239 opt: 642  Z-score: 384.4  bits: 82.9 E(32554): 4.3e-15
Smith-Waterman score: 665; 27.9% identity (60.3% similar) in 541 aa overlap (526-1044:112-633)

         500       510       520       530       540       550     
pF1KE4 ILEGSDAQLIYFESEKRATKPKGLIDLSVCSVYVVHDSLFGRPNCFQIVVQHFSEEHYIF
                                     ::  .:.:..:.  ::...    :.     
CCDS13 PKLKESRSHESLLSPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKC----
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pF1KE4 YFAGETPEQAEDWMKGLQAFCNLRKSSPGTSNKRLRQVSSLVLHIEEAHKL-PVKHFTNP
        :. ..  . . ::..:.     :  .:. .: : :  . : : : ::. : : :..   
CCDS13 -FSCNSASERDKWMENLR-----RTVQPNKDNCR-RAENVLRLWIIEAKDLAPKKKY---
        140       150            160        170       180          

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pF1KE4 YCNIYLNSVQVAKTHAR-EGQNPVWSEEFVFDDLPPDINRFEITL----SNKTKKSKDPD
       .:.. :...  :.: .. ...:  :.:.: : .::: .. . . .     .: ::.:.  
CCDS13 FCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGEHFEFFSLPP-LHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNY
       190       200       210       220        230       240      

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pF1KE4 ILFMRCQLSRLQKGHATDEWFLLSSHIPLKGIEPG-SLRVRARYSMEKIMPEEEYSEFKE
       . ..    . .   . ...:. .:.  : ::   : :.:...:..   :.: :.:.:: :
CCDS13 VGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPNKGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAE
        250       260       270       280       290       300      

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pF1KE4 LILQKELHVVYALSHVCG-QDRTLLASILLRIFLHEKLESLLLCTLNDREISMEDEATTL
       .. ..   .  .:  : . ...  ::  :..:.      . .:  :   :..   :  .:
CCDS13 FVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACALVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVL
        310       320       330       340       350       360      

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pF1KE4 -FRATTLASTLMEQYMKATATQFVHHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKNEDVNTNLT
        :: .:.:.  .:.:.: .. :..: :: . :  ..:: ..::..:::  ..: .. . .
CCDS13 IFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSN
        370       380       390       400       410       420      

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pF1KE4 HLLNILSELVE-KIFMASEILPPTLRYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVSGFVFLRLI
         :..  ::.  ::. .  ..:  :. ...  ...  ..   . .   :..:. .:::..
CCDS13 --LKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWKQQCLNRGKQDIS--ERLISASLFLRFL
          430       440       450       460         470       480  

         910       920       930       940       950       960     
pF1KE4 CPAILNPRMFNIISDSPSPIAARTLILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEGVNPFIKSNKH
       ::::..: .::.... :.  ..::: :.:: .:::::...:: :: ::  .: :.. .  
CCDS13 CPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWG
            490       500       510       520       530       540  

         970       980        990      1000              1010      
pF1KE4 RMIMFLDELGNVPELPDTTEHS-RTDLSRDLAALHEI---CVAHSDE-----LRTLSNER
        :  :: :..:   . .:   .   ::.:.:..:: .    :.. :.     :..   . 
CCDS13 GMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELSVLHSLLWEVVSQLDKGENSFLQATVAKL
            550       560       570       580       590       600  

       1020         1030      1040                                 
pF1KE4 GAQQHVLK---KLLAITELLQQKQNQYTKTNDVR                          
       :   .::    : :.    .::.  ..:. :                             
CCDS13 GPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNVSGSLSSGLQKIFEDPTDSDLHKLK
            610       620       630       640       650       660  

CCDS13 SPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEKDERESSLPNGRSVSLMDLQDTHAAQVEH
            670       680       690       700       710       720  

>>CCDS6832.1 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9             (1065 aa)
 initn: 379 init1: 264 opt: 635  Z-score: 380.8  bits: 82.1 E(32554): 6.9e-15
Smith-Waterman score: 671; 28.1% identity (60.3% similar) in 541 aa overlap (520-1046:23-543)

     490       500       510       520          530       540      
pF1KE4 WKNLYFILEGSDAQLIYFESEKRATKPKGLIDLSVCSVYV---VHDSLFGRPNCFQIVVQ
                                     .:::.    :   ::.:..:.  ::.....
CCDS68         MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEEVVIKPVHSSILGQDYCFEVTTS
                       10        20        30        40        50  

        550       560       570       580       590       600      
pF1KE4 HFSEEHYIFYFAGETPEQAEDWMKGLQAFCNLRKSSPGTSNKRLRQVSSLVLHIEEAHKL
         :.      :. ..  . . ::..:.     :   :. .:.: :    : : . ::. :
CCDS68 SGSKC-----FSCRSAAERDKWMENLR-----RAVHPNKDNSR-RVEHILKLWVIEAKDL
                  60        70             80         90       100 

        610       620       630        640           650       660 
pF1KE4 PVKHFTNPYCNIYLNSVQVAKTHAR-EGQNPVWSEEFVFDDLPP----DINRFEITLSNK
       :.:.  .  :.. :..:  :.: .. . .:  :.:.: : .:::     .. .. : ..:
CCDS68 PAKK--KYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRET-DKK
               110       120       130       140       150         

             670       680       690       700        710       720
pF1KE4 TKKSKDPDILFMRCQLSRLQKGHATDEWFLLSSHIPLKGIEPGSL-RVRARYSMEKIMPE
        :: ..  . ..    . .   . ...:. . .  :  :  :: . :..:::.   :.: 
CCDS68 KKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQTITILPM
      160       170       180       190       200       210        

              730       740        750       760        770        
pF1KE4 EEYSEFKELILQKELHVVYALSHV-CGQDRTLLASILLRIFLHE-KLESLLLCTLNDREI
       : :.:: : : .. : .  ::  .  .. .  .:: :..:.    :....:   . ..  
CCDS68 EMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVD
      220       230       240       250       260       270        

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pF1KE4 SMEDEATTLFRATTLASTLMEQYMKATATQFVHHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKN
          :.   .:: .:::.  .:.:.: .. .... :: . :  ..:: ..::..:::  . 
CCDS68 RCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKC-SA
      280       290       300       310       320       330        

      840       850        860       870       880       890       
pF1KE4 EDVNTNLTHLLNILSELVE-KIFMASEILPPTLRYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVS
        :.  .  .: ..  ::.  ::. .  ..:  :. ...  ..  . .      .  :..:
CCDS68 ADLPEHQGNL-KMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSR--GRPDISERLIS
       340        350       360       370       380         390    

       900       910       920       930       940       950       
pF1KE4 GFVFLRLICPAILNPRMFNIISDSPSPIAARTLILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEGVN
       . .:::..::::..: .::.... :.  .:::: :.:: .:::::...::.:: ::  .:
CCDS68 ASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMN
          400       410       420       430       440       450    

       960       970       980        990      1000       1010     
pF1KE4 PFIKSNKHRMIMFLDELGNVPELPDTTE-HSRTDLSRDLAALHEICVAHSDEL-RTLSNE
        :.. .   :  :: :..:   : .:.  ..  ::.:.:..:: .     ..: ... ..
CCDS68 QFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSK
          460       470       480       490       500       510    

        1020      1030      1040                                   
pF1KE4 RGAQQHVLKKLLAITELLQQKQNQYTKTNDVR                            
        :   ..:. .   : :    ..:   :::.                             
CCDS68 LGPLPRILRDVH--TALSTPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLSGLID
          520         530       540       550       560       570  

CCDS68 FTRLPSPTPENKDLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDART
            580       590       600       610       620       630  

>>CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9             (1132 aa)
 initn: 379 init1: 264 opt: 635  Z-score: 380.4  bits: 82.1 E(32554): 7.2e-15
Smith-Waterman score: 671; 28.1% identity (60.3% similar) in 541 aa overlap (520-1046:119-639)

     490       500       510       520          530       540      
pF1KE4 WKNLYFILEGSDAQLIYFESEKRATKPKGLIDLSVCSVYV---VHDSLFGRPNCFQIVVQ
                                     .:::.    :   ::.:..:.  ::.....
CCDS68 ADNERSHLMPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEEVVIKPVHSSILGQDYCFEVTTS
       90       100       110       120       130       140        

        550       560       570       580       590       600      
pF1KE4 HFSEEHYIFYFAGETPEQAEDWMKGLQAFCNLRKSSPGTSNKRLRQVSSLVLHIEEAHKL
         :.      :. ..  . . ::..:.     :   :. .:.: :    : : . ::. :
CCDS68 SGSKC-----FSCRSAAERDKWMENLR-----RAVHPNKDNSR-RVEHILKLWVIEAKDL
      150            160       170            180        190       

        610       620       630        640           650       660 
pF1KE4 PVKHFTNPYCNIYLNSVQVAKTHAR-EGQNPVWSEEFVFDDLPP----DINRFEITLSNK
       :.:.  .  :.. :..:  :.: .. . .:  :.:.: : .:::     .. .. : ..:
CCDS68 PAKK--KYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRET-DKK
       200         210       220       230       240       250     

             670       680       690       700        710       720
pF1KE4 TKKSKDPDILFMRCQLSRLQKGHATDEWFLLSSHIPLKGIEPGSL-RVRARYSMEKIMPE
        :: ..  . ..    . .   . ...:. . .  :  :  :: . :..:::.   :.: 
CCDS68 KKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQTITILPM
          260       270       280       290       300       310    

              730       740        750       760        770        
pF1KE4 EEYSEFKELILQKELHVVYALSHV-CGQDRTLLASILLRIFLHE-KLESLLLCTLNDREI
       : :.:: : : .. : .  ::  .  .. .  .:: :..:.    :....:   . ..  
CCDS68 EMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVD
          320       330       340       350       360       370    

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pF1KE4 SMEDEATTLFRATTLASTLMEQYMKATATQFVHHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKN
          :.   .:: .:::.  .:.:.: .. .... :: . :  ..:: ..::..:::  . 
CCDS68 RCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKC-SA
          380       390       400       410       420       430    

      840       850        860       870       880       890       
pF1KE4 EDVNTNLTHLLNILSELVE-KIFMASEILPPTLRYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVS
        :.  .  .: ..  ::.  ::. .  ..:  :. ...  ..  . .      .  :..:
CCDS68 ADLPEHQGNL-KMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSR--GRPDISERLIS
           440        450       460       470         480       490

       900       910       920       930       940       950       
pF1KE4 GFVFLRLICPAILNPRMFNIISDSPSPIAARTLILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEGVN
       . .:::..::::..: .::.... :.  .:::: :.:: .:::::...::.:: ::  .:
CCDS68 ASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMN
              500       510       520       530       540       550

       960       970       980        990      1000       1010     
pF1KE4 PFIKSNKHRMIMFLDELGNVPELPDTTE-HSRTDLSRDLAALHEICVAHSDEL-RTLSNE
        :.. .   :  :: :..:   : .:.  ..  ::.:.:..:: .     ..: ... ..
CCDS68 QFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSK
              560       570       580       590       600       610

        1020      1030      1040                                   
pF1KE4 RGAQQHVLKKLLAITELLQQKQNQYTKTNDVR                            
        :   ..:. .   : :    ..:   :::.                             
CCDS68 LGPLPRILRDVH--TALSTPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLSGLID
              620         630       640       650       660        

CCDS68 FTRLPSPTPENKDLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDART
      670       680       690       700       710       720        

>>CCDS46006.1 RASAL3 gene_id:64926|Hs108|chr19            (1011 aa)
 initn: 360 init1: 252 opt: 559  Z-score: 337.5  bits: 74.0 E(32554): 1.8e-12
Smith-Waterman score: 606; 27.8% identity (58.5% similar) in 492 aa overlap (527-1007:248-717)

        500       510       520       530       540       550      
pF1KE4 LEGSDAQLIYFESEKRATKPKGLIDLSVCSVYVVHDSLFGRPNCFQIVVQHFSEEHYIFY
                                     .. .: ::.:.:.:::..    :.      
CCDS46 PRDGPPSALGSRESLATLSELDLGAERDVRIWPLHPSLLGEPHCFQVTWTGGSRC-----
       220       230       240       250       260       270       

        560       570       580       590       600       610      
pF1KE4 FAGETPEQAEDWMKGLQAFCNLRKSSPGTSNKRLRQVSSLVLHIEEAHKLPVKHFTNP--
       :. ..  . . :.. :.     :. .: :...  :. . : . ..::. ::      :  
CCDS46 FSCRSAAERDRWIEDLR-----RQFQP-TQDNVEREETWLSVWVHEAKGLPRAAAGAPGV
            280            290        300       310       320      

          620       630        640       650       660       670   
pF1KE4 YCNIYLNSVQVAKTHAREGQNPV-WSEEFVFDDLPPDINRFEITLSNKTKKSKDPDILFM
         ...:... .:.:  : : . . :.:.: :. :::   :. . : .    :     . .
CCDS46 RAELWLDGALLARTAPRAGPGQLFWAERFHFEALPP-ARRLSLRLRGLGPGSAVLGRVAL
        330       340       350       360        370       380     

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pF1KE4 RCQLSRLQKGHAT--DEWFLLSSHIPLKGIEPGS-LRVRARYSMEKIMPEEEYSEFKELI
         .     .. :.  ..::      :: :   :. ::.: :    ...: :.:.:. :..
CCDS46 ALEELDAPRAPAAGLERWF------PLLGAPAGAALRARIRARRLRVLPSERYKELAEFL
         390       400             410       420       430         

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pF1KE4 LQKELHVVYALSHVC-GQDRTLLASILLRIFLHEKLESLLLCTLNDREISMED-EATTLF
         .  ..  ::  .  .: .  ::. ..:..      . :.  :.  :..    . . ::
CCDS46 TFHYARLCGALEPALPAQAKEELAAAMVRVLRATGRAQALVTDLGTAELARCGGREALLF
     440       450       460       470       480       490         

      790       800       810       820       830       840        
pF1KE4 RATTLASTLMEQYMKATATQFVHHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKNEDVNTNLTHL
       : .:::.  ...::: .: ......: . . ..  : ..::..:::   .: .  . ..:
CCDS46 RENTLATKAIDEYMKLVAQDYLQETLGQVVRRLCASTEDCEVDPSKCPASE-LPEHQARL
     500       510       520       530       540       550         

      850       860       870       880       890       900        
pF1KE4 LNILSELVEKIFMASEILPPTLRYIYGCLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVSGFVFLRLICPA
        :   :. : :. . . .:  :  ...  ... ...   . ..  :.: . .::::.:::
CCDS46 RNSCEEVFETIIHSYDWFPAELGIVFSSWREACKER--GSEVLGPRLVCASLFLRLLCPA
      560       570       580       590         600       610      

      910       920       930       940       950       960        
pF1KE4 ILNPRMFNIISDSPSPIAARTLILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEGVNPFIKSNKHRMI
       :: : .:..  : :.:  :::: :.:: .::::: . :: :: ::  .: :.. .   : 
CCDS46 ILAPSLFGLAPDHPAPGPARTLTLIAKVIQNLANRAPFGEKEAYMGFMNSFLEEHGPAMQ
        620       630       640       650       660       670      

      970         980       990       1000      1010      1020     
pF1KE4 MFLDELG--NVPELPDTTEHSRTDLSRDLAALH-EICVAHSDELRTLSNERGAQQHVLKK
        :::...  .:   :.  . :  ::. .::.:: ..:.  ..                  
CCDS46 CFLDQVAMVDVDAAPSGYQGS-GDLALQLAVLHAQLCTIFAELDQTTRDTLEPLPTILRA
        680       690        700       710       720       730     

        1030      1040                                             
pF1KE4 LLAITELLQQKQNQYTKTNDVR                                      
                                                                   
CCDS46 IEEGQPVLVSVPMRLPLPPAQVHSSLSAGEKPGFLAPRDLPKHTPLISKSQSLRSVRRSE
         740       750       760       770       780       790     




1047 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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