FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6780, 567 aa 1>>>pF1KE6780 567 - 567 aa - 567 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2457+/-0.000875; mu= 19.0097+/- 0.053 mean_var=64.6378+/-12.978, 0's: 0 Z-trim(106.6): 15 B-trim: 509 in 1/49 Lambda= 0.159526 statistics sampled from 9046 (9060) to 9046 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.278), width: 16 Scan time: 2.470 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46734.1 CPT1B gene_id:1375|Hs108|chr22 ( 738) 3824 889.1 0 CCDS14098.1 CPT1B gene_id:1375|Hs108|chr22 ( 772) 3824 889.1 0 CCDS8185.1 CPT1A gene_id:1374|Hs108|chr11 ( 773) 2634 615.2 9e-176 CCDS31624.1 CPT1A gene_id:1374|Hs108|chr11 ( 756) 2561 598.4 1e-170 CCDS12779.1 CPT1C gene_id:126129|Hs108|chr19 ( 803) 2179 510.5 3.1e-144 CCDS46147.1 CPT1C gene_id:126129|Hs108|chr19 ( 792) 1902 446.8 4.7e-125 CCDS6919.1 CRAT gene_id:1384|Hs108|chr9 ( 626) 787 190.1 6.9e-48 CCDS5604.1 CROT gene_id:54677|Hs108|chr7 ( 612) 692 168.2 2.6e-41 CCDS47634.1 CROT gene_id:54677|Hs108|chr7 ( 640) 692 168.2 2.7e-41 CCDS7233.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 ( 630) 644 157.2 5.6e-38 CCDS44389.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 ( 666) 644 157.2 5.9e-38 CCDS7232.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 ( 748) 644 157.2 6.5e-38 CCDS575.1 CPT2 gene_id:1376|Hs108|chr1 ( 658) 534 131.9 2.4e-30 CCDS81326.1 CPT2 gene_id:1376|Hs108|chr1 ( 635) 400 101.0 4.5e-21 >>CCDS46734.1 CPT1B gene_id:1375|Hs108|chr22 (738 aa) initn: 2210 init1: 2210 opt: 3824 Z-score: 4749.6 bits: 889.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3824; 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CCDS31 KPIRLLGSTIPLCSAQWERMFNTSRIPGEETDTIQHMRDSKHIVVYHRGRYFKVWLYHDG 300 310 320 330 340 350 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 RLLKPQDLEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGKNKAALEAI :::::...:.:.:::::. : ::::: .::::::: :: ::. :::.:. :::: .:.:. CCDS31 RLLKPREMEQQMQRILDNTSEPQPGEARLAALTAGDRVPWARCRQAYFGRGKNKQSLDAV 360 370 380 390 400 410 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 ERAAFFVALDEESYSYDPED-EASLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTLISFKNGQLGLNA :.:::::.::: .: :: ..:.. :.:.:::: ::.::::::::.. ::::..:::: CCDS31 EKAAFFVTLDETEEGYRSEDPDTSMDSYAKSLLHGRCYDRWFDKSFTFVVFKNGKMGLNA 420 430 440 450 460 470 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 EHAWADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPTRLQWDIPK--QAVIK ::.::::::..::::.:.. ::..:::.: ::: : :: . ::::::::: : ::. 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CCDS12 AFFVSLDAEPAGLTREDPAASLDAYAHALLAGRGHDRWFDKSFTLIVFSNGKLGLSVEHS 420 430 440 450 460 470 280 290 300 310 320 pF1KE6 WADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPTRLQWDIPKQ--AVIKSSY ::: :: ::.:::.:.:. :.:::. ::: :.:.:.: : :::::.: : . :. . CCDS12 WADCPISGHMWEFTLATECFQLGYSTDGHCKGHPDPTLPQPQRLQWDLPDQIHSSISLAL 480 490 500 510 520 530 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 QVAKALADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAHFRDRGKFCLTYEASMT . :: :...:. . : :::..:..:. : :.:.:::::::::::::.::::::..:: CCDS12 RGAKILSENVDCHVVPFSLFGKSFIRRCHLSSDSFIQIALQLAHFRDRGQFCLTYESAMT 540 550 560 570 580 590 390 400 410 420 430 440 pF1KE6 RMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQKAAKKHQNMYRLAMTGAGID :.: ::::::::::: :. ::.:: . .: . ::. :. ::: . . ::.: :.: CCDS12 RLFLEGRTETVRSCTREACNFVRAMEDKEKTDPQCLALFRVAVDKHQALLKAAMSGQGVD 600 610 620 630 640 650 450 460 470 480 490 500 pF1KE6 RHLFCLYLVSKYLGVSSPFLAEVLSEPWRLSTSQIPQSQIRMFDPEQHPNHLGAGGGFGP :::: ::.::..: ..::::..: :: :.::::::: .:...:: ...:.....:::::: CCDS12 RHLFALYIVSRFLHLQSPFLTQVHSEQWQLSTSQIPVQQMHLFDVHNYPDYVSSGGGFGP 660 670 680 690 700 710 510 520 530 540 550 560 pF1KE6 VADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIRKALLDIADLFQVPKAYS . : ::::::.. :.. : :::::: ::..:...:.:.::. ::::.:.:::. . . CCDS12 ADDHGYGVSYIFMGDGMITFHISSKKSSTKTDSHRLGQHIEDALLDVASLFQAGQHFKRR 720 730 740 750 760 770 CCDS12 FRGSGKENSRHRCGFLSRQTGASKASMTSTDF 780 790 800 >>CCDS46147.1 CPT1C gene_id:126129|Hs108|chr19 (792 aa) initn: 1891 init1: 891 opt: 1902 Z-score: 2358.5 bits: 446.8 E(32554): 4.7e-125 Smith-Waterman score: 2125; 55.0% identity (78.7% similar) in 567 aa overlap (3-566:204-757) 10 20 30 pF1KE6 MELLAKEFQDKTAPRLQKYLVLKSWWASNYVS .::.:: : :: :: ::::::::::: CCDS46 QPVPSVQDTVRKYLESVRPILSDEDFDWTAVLAQEFLRLQASLLQWYLRLKSWWASNYVS 180 190 200 210 220 230 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 DWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYVMDLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDREEIKP :::::..:::.:.:::::::::.: ::: :: .::...::..:.:.:: : CCDS46 DWWEEFVYLRSRNPLMVNSNYYMM-----------AARAGNAVHALLLYRHRLNRQEIPP 240 250 260 270 280 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 VMALGIVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHLSDSRHVAVYHKGRFFKLWLYEGARLL .. .:. :.:: :.:..:::::::: . : ..:: ::.::::.:.::::.. . :: CCDS46 TLLMGMRPLCSAQYEKIFNTTRIPGVQKDYIRHLHDSQHVAVFHRGRFFRMGTHSRNSLL 290 300 310 320 330 340 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 KPQDLEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGKNKAALEAIERA .:. ::.::::::::::: : ::.::::::. : :::.: .. . . ::::.: : CCDS46 SPRALEQQFQRILDDPSPACPHEEHLAALTAAPRGTWAQVRTSL--KTQAAEALEAVEGA 350 360 370 380 390 400 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 AFFVALDEESYSYDPEDEA-SLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTLISFKNGQLGLNAEHA ::::.:: : . :: : ::. :..::: : ..:::::::::: :.::.:::..::. CCDS46 AFFVSLDAEPAGLTREDPAASLDAYAHALLAGRGHDRWFDKSFTLIVFSNGKLGLSVEHS 410 420 430 440 450 460 280 290 300 310 320 pF1KE6 WADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPTRLQWDIPKQ--AVIKSSY ::: :: ::.:::.:.:. :.:::. ::: :.:.:.: : :::::.: : . :. . CCDS46 WADCPISGHMWEFTLATECFQLGYSTDGHCKGHPDPTLPQPQRLQWDLPDQIHSSISLAL 470 480 490 500 510 520 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 QVAKALADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAHFRDRGKFCLTYEASMT . :: :...:. . : :::..:..:. : :.:.:::::::::::::.::::::..:: CCDS46 RGAKILSENVDCHVVPFSLFGKSFIRRCHLSSDSFIQIALQLAHFRDRGQFCLTYESAMT 530 540 550 560 570 580 390 400 410 420 430 440 pF1KE6 RMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQKAAKKHQNMYRLAMTGAGID :.: ::::::::::: :. ::.:: . .: . ::. :. ::: . . ::.: :.: CCDS46 RLFLEGRTETVRSCTREACNFVRAMEDKEKTDPQCLALFRVAVDKHQALLKAAMSGQGVD 590 600 610 620 630 640 450 460 470 480 490 500 pF1KE6 RHLFCLYLVSKYLGVSSPFLAEVLSEPWRLSTSQIPQSQIRMFDPEQHPNHLGAGGGFGP :::: ::.::..: ..::::..: :: :.::::::: .:...:: ...:.....:::::: CCDS46 RHLFALYIVSRFLHLQSPFLTQVHSEQWQLSTSQIPVQQMHLFDVHNYPDYVSSGGGFGP 650 660 670 680 690 700 510 520 530 540 550 560 pF1KE6 VADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIRKALLDIADLFQVPKAYS . : ::::::.. :.. : :::::: ::..:...:.:.::. ::::.:.:::. . . CCDS46 ADDHGYGVSYIFMGDGMITFHISSKKSSTKTDSHRLGQHIEDALLDVASLFQAGQHFKRR 710 720 730 740 750 760 CCDS46 FRGSGKENSRHRCGFLSRQTGASKASMTSTDF 770 780 790 >>CCDS6919.1 CRAT gene_id:1384|Hs108|chr9 (626 aa) initn: 672 init1: 309 opt: 787 Z-score: 973.2 bits: 190.1 E(32554): 6.9e-48 Smith-Waterman score: 897; 33.3% identity (62.3% similar) in 589 aa overlap (4-565:69-624) 10 20 30 pF1KE6 MELLAKEFQDK--TAPRLQKYLVLKSWWASNYV :. ::: . .. :::: : .. . :.. CCDS69 PVPPLQQSLDHYLKALQPIVSEEEWAHTKQLVDEFQASGGVGERLQKGLERRARKTENWL 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 pF1KE6 SDWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYVM----DLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDR :.:: . ::. :.:... :. :: :.: ... ::.: :.... .. .: CCDS69 SEWWLKTAYLQYRQPVVIYSSPGVMLPKQDFVDLQGQLRFAAKL---IEGVLDFKVMIDN 100 110 120 130 140 150 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 EEIKPVMALGIVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHLSDSR----HVAVYHKGRFFKL : . :: :: :.: :. ..... :.:: :.....: .. :..: :. .::.: CCDS69 ETL-PVEYLGGKPLCMNQYYQILSSCRVPGPKQDTVSNFSKTKKPPTHITVVHNYQFFEL 160 170 180 190 200 210 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 WLY--EGARLLKPQDLEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGK .: .:. : : . .:...: . : : ..: .. ::.. : ::.: ...... CCDS69 DVYHSDGTPLTADQ-IFVQLEKIWN--SSLQTNKEPVGILTSNHRNSWAKAYNTLIKDKV 220 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 pF1KE6 NKAALEAIERAAFFVALDEESYSYDPEDEASLSLYGKALLHG-----NCYNRWFDKSFTL :. ....:... : : :: .. :: . :. .::: : ::::::.. . CCDS69 NRDSVRSIQKSIFTVCLDA-TMPRVSEDVYRSHVAGQ-MLHGGGSRLNSGNRWFDKTLQF 280 290 300 310 320 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 ISFKNGQLGLNAEHAWADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPTRLQ : ..:. :: ::: :..: : : ..: . ::. . . .: : : .:. CCDS69 IVAEDGSCGLVYEHAAAEGPPIVTLLDYV-------IEYTKKPELVRSPLVPLPMPKKLR 330 340 350 360 370 380 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 WDIPKQAVIKSSYQVAKA----LADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLA ..: . :::. . :: . .:... . : ::: . :. . :::::.:.::::: CCDS69 FNITPE--IKSDIEKAKQNLSIMIQDLDITVMVFHHFGKDFPKSEKLSPDAFIQMALQLA 390 400 410 420 430 440 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 HFRDRGKFCLTYEASMTRMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQKAA ..: :. : :::.. :::. :::.:.:: . .: .::.:: ..: :. . .:..::. CCDS69 YYRIYGQACATYESASLRMFHLGRTDTIRSASMDSLTFVKAMDDSSVTEHQKVELLRKAV 450 460 470 480 490 500 440 450 460 470 480 pF1KE6 KKHQNMYRLAMTGAGIDRHLFCLYLVSKYLGVSSP--FL--AEVLSEPWRLSTSQIP-QS . :... :. : ..::::. : : . :: : :. . ... ..:::::.: .. CCDS69 QAHRGYTDRAIRGEAFDRHLLGLKLQAIEDLVSMPDIFMDTSYAIAMHFHLSTSQVPAKT 510 520 530 540 550 560 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 QIRMFDPEQHPNHLGAGGGFGPVADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGN . :: ::::. ::::: : : : : .:. : .:::: :... CCDS69 DCVMF--------------FGPVVPDGYGVCYN-PMEAHINFSLSAYNSCAETNAARLAH 570 580 590 600 550 560 pF1KE6 HIRKALLDIADLFQV-PKAYS ...:::::. :.: :.: CCDS69 YLEKALLDMRALLQSHPRAKL 610 620 >>CCDS5604.1 CROT gene_id:54677|Hs108|chr7 (612 aa) initn: 504 init1: 292 opt: 692 Z-score: 855.2 bits: 168.2 E(32554): 2.6e-41 Smith-Waterman score: 692; 29.7% identity (57.7% similar) in 579 aa overlap (2-559:52-606) 10 20 30 pF1KE6 MELLAKEFQDKTAPRLQKYLVLKSWWASNYV : ....::. . .:.. :. .. :.. CCDS56 SLPVPSLEESLKKYLESVKPFANQEEYKKTEEIVQKFQSGIGEKLHQKLLERAKGKRNWL 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 pF1KE6 SDWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYV----MDLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDR .:: . :: : : ..: :. .. . .: : :.: . .: : CCDS56 EEWWLNVAYLDVRIPSQLNVNFAGPAAHFEHYWPPKEGTQLER-GSITLWHNLNYWQLLR 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 EEIKPVMALGIVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHL----SDSR---HVAVYHKGRF .: :: .: .:. :.. .:.: ..:: : ... :..: :..: .:: CCDS56 KEKVPVHKVGNTPLDMNQFRMLFSTCKVPGITRDSIMNYFRTESEGRSPNHIVVLCRGRA 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 pF1KE6 FKL-WLYEGARLLKPQDLEMQFQRILDD--PSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFF : . ..:: :. : .: :. : : :: .::::. :..::.::. .. CCDS56 FVFDVIHEGC-LVTPPELLRQLTYIHKKCHSEPDGPG---IAALTSEERTRWAKAREYLI 210 220 230 240 250 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 S-SGKNKAALEAIERAAFFVALDEESYSYDPEDEASLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTL . . .: : :: :. . . .... : ::: . . :.: :. :: :::..: CCDS56 GLDPENLALLEKIQSSLLVYSMEDSSPHVTPEDYSEII---AAILIGDPTVRWGDKSYNL 260 270 280 290 300 310 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 ISFKNGQLGLNAEHAWADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAP-PTRL :::.:: .: : .:: :: :. .. .: : . . . :. :. . : : .: CCDS56 ISFSNGVFGCNCDHAPFDAMIMVNISYYV---D--EKIFQNEGRWKGSEKVRDIPLPEEL 320 330 340 350 360 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 QWDIPKQAVIKSSYQVAKAL--ADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAH . . .... . :. : :.:... . : ::: : :. ::.:.:.:::::. CCDS56 IFIVDEKVLNDINQAKAQYLREASDLQIAAYAFTSFGKKLTKNKMLHPDTFIQLALQLAY 370 380 390 400 410 420 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 FRDRGKFCLTYEASMTRMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQK--- .: .:. ::..::: : .:::::.:::: :.. . :.:.. : ..::. :: CCDS56 YRLHGHPGCCYETAMTRHFYHGRTETMRSCTVEAVRWCQSMQDPS---VNLRERQQKMLQ 430 440 450 460 470 480 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 AAKKHQNMYRLAMTGAGIDRHLFCLYLVSKYLGVSSPFLAEVLSEPWRLSTSQIPQSQIR : ::..:.. .: :.::::. : :..: :. : :....: : ... ... CCDS56 AFAKHNKMMKDCSAGKGFDRHLLGLLLIAKEEGLPVP---ELFTDP--LFSKSGGGGNFV 490 500 510 520 530 540 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 MFDPEQHPNHLGAGGGFGPVADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIR . . ..: . : :.. .::: : : .. . :. : ::.:... . CCDS56 L--STSLVGYLRVQGVVVPMVHNGYGFFYHIR-DDRFVVACSAWKSCPETDAEKLVQLTF 550 560 570 580 590 560 pF1KE6 KALLDIADLFQVPKAYS :. :. .: CCDS56 CAFHDMIQLMNSTHL 600 610 >>CCDS47634.1 CROT gene_id:54677|Hs108|chr7 (640 aa) initn: 504 init1: 292 opt: 692 Z-score: 854.9 bits: 168.2 E(32554): 2.7e-41 Smith-Waterman score: 692; 29.7% identity (57.7% similar) in 579 aa overlap (2-559:80-634) 10 20 30 pF1KE6 MELLAKEFQDKTAPRLQKYLVLKSWWASNYV : ....::. . .:.. :. .. :.. CCDS47 DPDAKRGFLDLTREGIQVKPFANQEEYKKTEEIVQKFQSGIGEKLHQKLLERAKGKRNWL 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 pF1KE6 SDWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYV----MDLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDR .:: . :: : : ..: :. .. . .: : :.: . .: : CCDS47 EEWWLNVAYLDVRIPSQLNVNFAGPAAHFEHYWPPKEGTQLER-GSITLWHNLNYWQLLR 110 120 130 140 150 160 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 EEIKPVMALGIVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHL----SDSR---HVAVYHKGRF .: :: .: .:. :.. .:.: ..:: : ... :..: :..: .:: CCDS47 KEKVPVHKVGNTPLDMNQFRMLFSTCKVPGITRDSIMNYFRTESEGRSPNHIVVLCRGRA 170 180 190 200 210 220 150 160 170 180 190 pF1KE6 FKL-WLYEGARLLKPQDLEMQFQRILDD--PSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFF : . ..:: :. : .: :. : : :: .::::. :..::.::. .. CCDS47 FVFDVIHEGC-LVTPPELLRQLTYIHKKCHSEPDGPG---IAALTSEERTRWAKAREYLI 230 240 250 260 270 280 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 S-SGKNKAALEAIERAAFFVALDEESYSYDPEDEASLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTL . . .: : :: :. . . .... : ::: . . :.: :. :: :::..: CCDS47 GLDPENLALLEKIQSSLLVYSMEDSSPHVTPEDYSEII---AAILIGDPTVRWGDKSYNL 290 300 310 320 330 340 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 ISFKNGQLGLNAEHAWADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAP-PTRL :::.:: .: : .:: :: :. .. .: : . . . :. :. . : : .: CCDS47 ISFSNGVFGCNCDHAPFDAMIMVNISYYV---D--EKIFQNEGRWKGSEKVRDIPLPEEL 350 360 370 380 390 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 QWDIPKQAVIKSSYQVAKAL--ADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAH . . .... . :. : :.:... . : ::: : :. ::.:.:.:::::. CCDS47 IFIVDEKVLNDINQAKAQYLREASDLQIAAYAFTSFGKKLTKNKMLHPDTFIQLALQLAY 400 410 420 430 440 450 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 FRDRGKFCLTYEASMTRMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQK--- .: .:. ::..::: : .:::::.:::: :.. . :.:.. : ..::. :: CCDS47 YRLHGHPGCCYETAMTRHFYHGRTETMRSCTVEAVRWCQSMQDPS---VNLRERQQKMLQ 460 470 480 490 500 510 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 AAKKHQNMYRLAMTGAGIDRHLFCLYLVSKYLGVSSPFLAEVLSEPWRLSTSQIPQSQIR : ::..:.. .: :.::::. : :..: :. : :....: : ... ... CCDS47 AFAKHNKMMKDCSAGKGFDRHLLGLLLIAKEEGLPVP---ELFTDP--LFSKSGGGGNFV 520 530 540 550 560 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 MFDPEQHPNHLGAGGGFGPVADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIR . . ..: . : :.. .::: : : .. . :. : ::.:... . CCDS47 L--STSLVGYLRVQGVVVPMVHNGYGFFYHIR-DDRFVVACSAWKSCPETDAEKLVQLTF 570 580 590 600 610 620 560 pF1KE6 KALLDIADLFQVPKAYS :. :. .: CCDS47 CAFHDMIQLMNSTHL 630 640 >>CCDS7233.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 (630 aa) initn: 606 init1: 224 opt: 644 Z-score: 795.3 bits: 157.2 E(32554): 5.6e-38 Smith-Waterman score: 777; 31.9% identity (59.7% similar) in 568 aa overlap (16-559:61-603) 10 20 30 40 pF1KE6 MELLAKEFQDKTAPRLQKYLVLKSWWASNYVSDWWEEYIYLRGRS ::. :. .. ..:.::..: . .:: .: CCDS72 CMRHLVSEEQFRKSQAIVQQFGAPGGLGETLQQKLLERQEKTANWVSEYWLNDMYLNNRL 40 50 60 70 80 90 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 PLMVNSNYYVM-DLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDREEIKPVMALGIV---PM : :::. :. . .:: : ...: ... :. :: . : : : . :. CCDS72 ALPVNSSPAVIFARQHFPGTDDQLRFAASLISGVLSYKALLDSHSIPTDCAKGQLSGQPL 100 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 pF1KE6 CSYQMERMFNTTRIPG--KDTDVLQHLS---DSRHVAVYHKGRFFKLWLYEGARLLKPQD : :. .:.. :.:: .:: : :. : . .:: : ..:: : . . : :. : CCDS72 CMKQYYGLFSSYRLPGHTQDTLVAQNSSIMPEPEHVIVACCNQFFVLDVVINFRRLSEGD 160 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 LEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGKNKAALEAIERAAFFV : :...:. : . .. ::. :: :::.:: .. ... :. .:. ::: .: CCDS72 LFTQLRKIVKMASNEDERLPPIGLLTSDGRSEWAEARTVLVKDSTNRDSLDMIERCICLV 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 ALDEESYSYDPEDEASLSLYGKALLHGNCY-----NRWFDKSFTLISFKNGQLGLNAEHA :: . : : . . ::::. : :::.:::. .. ..: :. ::. CCDS72 CLDAPGGV-----ELSDTHRALQLLHGGGYSKNGANRWYDKSLQFVVGRDGTCGVVCEHS 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 pF1KE6 WADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPA--LAPPTRLQWDI-PK-QAVIKS :. .. . : .: :. :.... : . . . : : ::.: :. :. . : CCDS72 PFDGIVLVQCTEHLLK----HV--TQSSRKLIRADSVSELPAPRRLRWKCSPEIQGHLAS 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 SYQVAKALADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAHFRDRGKFCLTYEAS : . . .. .... ..: .:: .::: . :::::.:.::::: .: . .. :::.. 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